1. US-LTER Information Management
El manejo de la información en los sitios LTER de
EEUU
http://nbii.gov
http://lternet.edu
isangil@lternet.edu
1
2. Metadatos o el valor de los datos
Devaluación de datos
(Michener et al., 1997)
William K. Michener, James W. Brunt, John J. Helly, Thomas B. Kirchner, Susan G. Stafford (1997)
NONGEOSPATIAL METADATA FOR THE ECOLOGICAL SCIENCES. 2
Ecological Applications: Vol. 7, No. 1, pp. 330-342.
3. Orden del día (menú de la charla)
Historia
LTER, NBII y la trama socio-científica en Ecología Geografía
Apoyo Económico
Gestión de Información
Cooperación → Estandarización, Interoperabilidad, Alianzas
Cambio Climático
Biodiversidad y Sequía
Objetivos → Integración, síntesis, homogeneidad
EcoTrends
DataONE
Gestión de la información en LTER
perspectiva de LTER lecciones aprendidas y por aprender
El valor de tus datos
Algunos Detalles del tramado informático
EML lo bueno, lo malo y lo feo
Prácticas en común
Roles, Comités, talleres, etc
3
5. Red Internacional de Investigación Ecológica
a Largo Plazo
http://ilternet.edu/
5
6. Red Americana de Investigaciones
Ecológicas a Largo Plazo
26 sitios (nodos)
autónomos
1800 científicos
Más de 20 años de
datos continuos
Establecido en 1980
Por la Fundación Nacional de Ciencia (NSF)
http://intranet.lternet.edu/archives/documents/Publications/Vignettes.pdf
http://lternet.edu/sites/
6
7. Historia de LTER
John Brooks
Director Tom Callahan
Division Ciencias Medioambientales, NSF Primer Director LTER
1980 1980
7
8. Historia de LTER
Número de 106$
nodos LTER cada 6 años
25 100
20 80
15 60
10 40
5 20
1980 1990 2000 2010
http://lternet.edu/about/history.html
http://nsf.gov
8
10. Algunas cifras y estimaciones
• 6,000 estudios estandarizados y centralizados
• 10% más en otros servidores (SIGs, Teledetección )
• Al menos un 20% de todos los estudios que son de larga
duración se mantienen activos desde su comienzo
– Climatología y estudios con firma de la casa
• Cinco áreas de estudio prioritarias
1) Producción Primaria.
2) Estudios de Poblaciones Biológicas.
3) Movimiento de Materia Orgánica.
4) Movimiento de Materia Inorgánica.
5) Patrones de Perturbaciones
10
11. Qué es el NBII?
El NBII es un programa amplio
¿Qué es el NBII?
de colaboración para fomentar
el acceso a datos e información
sobre recursos biológicos
11
20. Orden del día (menú de la charla)
Historia
LTER, NBII y la trama socio-científica en Ecología Geografía
Apoyo Económico
Gestión de Información
Cooperación → Estandarización, Interoperabilidad, Alianzas
Gestión de la información en LTER
perspectiva de LTER lecciones aprendidas y por aprender
20
21. Colaboración NBII LTER
Número de metadatos (documentos) en el
banco de metadatos de NBII, divididos por
proveedor
Evolución temporal de la adopción
del EML como estándar para
intercambiar metadatos
21
22. Cooperación NBII LTER
Interoperabilidad : Correspondencias entre Estándares de
Metadatos
Completados EML → Biological Data Profile
BDP → EML
EML → ESRI EML
ESRI → EML BDP a
Incompleto a BDP
EML → Darwin & Dublin Core EML
EML → KML (google mapas)
NDIF → EML
22
23. Orden del día (menú de la charla)
Historia
LTER, NBII y la trama socio-científica en Ecología Geografía
Apoyo Económico
Gestión de Información
Cooperación → Estandarización, Interoperabilidad, Alianzas
Cambio Climático
Biodiversidad y Sequía
Objetivos → Integración, síntesis, homogeneidad
EcoTrends
DataONE
Gestión de la información en LTER
perspectiva de LTER lecciones aprendidas y por aprender
El valor de tus datos
Algunos Detalles del tramado informático
EML lo bueno, lo malo y lo feo
Prácticas en común
Roles, Comités, talleres, etc
23
27. Enfriamiento del Clima en Antártida
Temp. (°C)
La gráfica (abajo,
derecha) es una réplica
de los resultados
mostrados en la figura
original (arriba)
Medimos la temperature
del aire, y su evolución
temporal, usando
herramientas de síntesis.
27
28. Enfriamiento del Clima en Antártida
Temp. (°C)
Añadimos datos de otras 12
estaciones meteorológicas
situadas en los Valles Secos de
McMurdo, Antártica (McMurdo
Dry Valleys, nodo LTER)
Análisis de
datos extendido
al 2001- 2005
28
30. Cedar Creek Natural Area LTER
Fundado en el 1940; parte de LTER desde el 1982
Foco de investigación:
–Deposición de Nitrógeno
–Dióxido de Carbono y Calentamiento Global
–Importancia de la biodiversidad
30
31. Long-Term Nitrogen Deposition: Effects on Plant
Diversity, Composition, Productivity and Stability
Empezó en 1982 (D. Tilman)
3 campos viejos y 1 sabana
7 concentrationes diferentes de
nitrógeno
Foto aérea del campo
(fertilizante), 2 controles
Cada año:
–Cosecha de tiras de 3 x 10 m
–Ordena la biomasa por especie
–Pesa
31
32. Datos y Metadatos para el experimento
en el banco (servidor) central
32
34. Biodiversidad en la Pradera
Evolución temporal del número de especies (plantas) diferentes (Tilman 1992
Evolución de plantas –aumento del periodo de tiempo
34
47. El Ciclo de los Datos
Replicas de las infrastructuras de archivo
Interoperabilidad entre los centros de datos
47
48. Ejemplos de Archivos
Estándares
Centros de Datos Tipos de datos gestionados
Metadatos
National Biological Information Biodiversidad, taxonomía, ecología BDP, Dar, Dub,
Infrastructure OGIS
Laboratorio Nacional Oak Ridge – Dinámica Biogeoquímica, terrestrial DIF, BDP, ECHO
(Distributed Active Archive Center) ecological Earth observation imagery
Long Term Ecological Research Ecología, biodiversidad, biofísica, social, EML
Network genética y taxonomía
Avian Knowledge Network Avian populations y biología molecular Dub
Atlas of Living Australia (ALA) Biología y taxonomía Subconjunto
Dub
South African Environmental Biofísica, biodiversidad, perturbaciones, and EML
Observatory Network (SAEON) Earth observation imagery
Taiwan Ecological Research Network Biodiversidad, estructura biótica, EML
(TERN) función/procesos, biogeoquímica, clima, e
hidrología
48
48
49. …a wide range of partnering
organizations
• Bibliotecas
• Archivos Digitales
• Instituciones Académicas
• Redes Investigación
• Fundación Nacional Ciencia
• Centros de supercomputación
• Organizaciones
Internacionales
• Data and metadata archives
• Sociedades Profesionales
• ONGs
• Sector Comercial (iniciativa
privada)
49
49
50. Orden del día (menú de la charla)
Historia
LTER, NBII y la trama socio-científica en Ecología Geografía
Apoyo Económico
Gestión de Información
Cooperación → Estandarización, Interoperabilidad, Alianzas
Cambio Climático
Biodiversidad y Sequía
Objetivos → Integración, síntesis, homogeneidad
EcoTrends
DataONE
Gestión de la información en LTER
perspectiva de LTER lecciones aprendidas y por aprender
El valor de tus datos
Algunos Detalles del tramado informático
EML lo bueno, lo malo y lo feo
Prácticas en común
Roles, Comités, talleres, etc
50
51. Dispersión de los Datos
– Estaciones Ecológicas y centros de investigación ~100’s
– Museos de historia natural, colecciones ~100’s
– Agencias de colección de datos ~1000’s
– Científicos (Individuos) ~10,000s
51
52. Niveles de Información sobre datos
Básico
Título Personal
Abstract Contacto
Keywords
Básico
Localizador URL Personal
Dueño-Creador
Proveedor Metadatos
Métodologías Personas Asociadas
Refs. Geo-temporales
Detalles
Hojas de Cálculo
Detalles Datos
Magnitudes / Detalles de Variables
52
53. Contrato: Protocolo de curación de
datos, entrega con metadatos tan
exhaustivos como sea posible.
53
54. Técnico: Codificando la información en XML
EML es un contenedor de información bioecológica
basado en XML
– Virtudes del XML
• Portátil
• Extensible
• Ideal para el intercambio de la información
• Estándar
– Peligro del XML
• No es HTML – no es adecuado para consumo humano
• XML es algo deficiente como base de datos (si bien portátil)
• Percepción de que es el “mejor” almacén y gestor de
metadatos (es un vehiculo de intercambio de información)
54
56. Matriz de Herramientas para generar y
editar Metadatos
Open Source Online Plataforma
Proprietary Desktop
Edición Personal - $0 Desktop
XML Spy Profesional ~ $1000
Corporación ~ $3000
Free Desktop Todas
Morpho
Online*
Académica $0-$50 Desktop Todas
oXygen
Profesional $200
Notepad++ (free) Free Desktop
MSWord ? Desktop-Online
GoogleDocs Free Online Todas (Internet Browser)
Editores NBII Free Stand Alone Mezcla
Online
56
57. Herramientas - VaporWare
En Desarrollo
SchemaWalker (Schema → XForms)
MetadataEditor (Editor basado en XForms)
Sistema integral basado en el gestor de contenidos Drupa
URLs: http://intranet.lternet.edu/im/project/
Contáctanos!
57
62. Guía de EML y Uso Común
La guía del Lenguaje de Metadatos Ecológicos
http://knb.ecoinformatics.org/software/eml/eml-2.0.1/index.html
El documento de “Prácticas Recomendables” de EML
http://cvs.lternet.edu/cgibin/viewcvs.cgi/*checkout*/emlbestpractices/emlbestpracti
ces-1.0/emlbestpractices_oct2004.doc?rev=1.2&content-type=text/plain
(Los enlaces con frecuencia vencen, usa el buscador)
62
63. Ejemplo de Práctica Recomendable
Identificador de EML
(PackageID)
AMBITO . IDENTIFICADOR NUMERICO . VERSION/REVISION
Ámbito → knb-lter-SIGLASDELNODO.
ID numérico → Un número que sea significativo
Versión → Puede ser una fecha convertida a un entero
63
64. Prácticas Comunes de EML
Tipos de medidas (observables):
De Stevens*: Nominal, Intervalo, Ordinal, Ratio
EML añadió una categoria: Fecha-Tiempo
*On the Theory of Scales of Measurement
S. S. Stevens (7 June 1946)
Science 103 (2684), 677. 64
65. Prácticas Comunes de EML
Tipos de medidas (observables):
Tras Stevens*: Nominal, Interval, Ordinal, Ratio
Sentido Común
EML añade una categoría más: Fecha-Tiempo
*Two examples of ecological data synthesis driven by quality EML,
and the practical guides to use EML to this end.
I. San Gil & K. Vanderbilt. Submitted to Ecoinformatics
65
66. Deberes
Colaboración
Datos, Metadatos e Indicadores
Dimensión humana
Este Viernes taller práctico!
66
67. Agradecimiento - Alicia San Gil
LTER Information managers
Bill Michener
Curro Bonet - Regino
67
