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Facultad de Medicina
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Cátedra de Bioquímica



   TEMA 2. Aminoácidos
   Propiedades ácido base e
   ionización
                         Dra. Vanessa Miguel
                       vanessa.miguel@ucv.ve
                             @bioquitips

                                     Noviembre 2012
Fórmula General de los Aminoácidos


              H

   +H3N       Ca    COOH

               R
Fórmula General de los Aminoácidos

                            R
Ca (central)
Grupo amino
                            a CH
Grupo carboxilo
Átomo de Hidrógeno
                     NH3+          COOH
Cadena lateral R
¿Cuál de las siguientes moléculas es un α-
aminoácido?
Aminoácidos

1. Glicina                                      11. Treonina
2. Alanina                                      12. Tirosina
3. Valina                    Cadena             13. Cisteína
4. Leucina                   Lateral            14. Arginina
5. Isoleucina                   o               15. Lisina
6. Prolina                    Grupo             16. Histidina
7. Fenilalanina                 R               17. Acido Aspártico
8. Triptófano                                   18. Acido Glutámico
9. Metionina                                    19. Asparagina
10. Serina                                      20. Glutamina


•Se conocen otros 150 aminoácidos pero NO forman parte de las proteínas.
Ejemplos de algunos aminoácidos
Aminoácidos

    Dos propiedades importantes que los distinguen
    son:
   Polaridad. Si un aminoácido es polar o no
    polar influye como interactúa con el agua.
   Carga. Si tienen o no carga. Algunos
    aminoácidos pueden ionizarse para tener
    cargas positivas, otros se ionizan con cargas
    negativas.
Clasificación de los Aminoácidos
Esteroisomería de los aminoácidos

   Cuando cuatro grupos diferentes están
    unidos a un átomo de carbono, como el
    carbono α de los aminoácidos (excepto la
    glicina), resultan dos isómeros posibles, que
    son imágenes especulares no superponibles.
   Isómeros ópticos: en general, una molécula
    con n centros quirales tiene 2n
    estereoisómeros
   Esta característica es importante en los
    sistemas biológicos.
Dos moléculas son enantiómeros sino se sobreponen una
con otra, sin importar cuanto se roten en el espacio
Esteroisomería de los aa

   Todos los aminoácidos excepto la glicina poseen un
    carbono asimétrico.
    Esto hace que presenten esteroisomería, cada
    aminoácido posee dos esteroisómeros según
    como sea la colocación del grupo NH3+.
   Si el grupo NH3+ se sitúa a la derecha
    tendrá configuración D, si se sitúa a la izquierda
    tendrá configuración L (con base a la
    conformación del gliceraldehido).
    Los aminoácidos que forman las proteínas son
    todos de configuración L.
Esteroisomería de los aa
Isómeros alanina
Actividad óptica

   La presencia del carbono asimétrico, además
    les da a los aminoácidos actividad óptica, es
    decir en disolución son capaces de desviar el
    plano de polarización de la luz.
   Si lo desvían hacia la derecha (+) se
    llaman dextrógiros, si lo desvían hacia la
    izquierda (-) levógiros.
Propiedades ácido base de los aa




   Primero un repaso…
Ácidos y Bases (Bronsted-Lowry)

   un ácido es una sustancia capaz de donar
    un protón a otra sustancia.
   una base es una sustancia capaz de aceptar
    un protón
   las sustancias que pueden actuar como
    ácido y como base se conocen como
    sustancias anfóteras.
   El pH puede ser calculado en base a:
             pH = -log[H+]
Ácido Clorhídrico
Ácido Acético
Amoníaco
Ka

Considere la liberación de un protón por un
 ácido débil representado por HA:
                 HA ←→ H+ + A-
          Ácido débil   protón base conjugada
                                  ( sal )

La (sal ) o base conjugada, A- , es la forma
  ionizada de un ácido débil. La constante de
  disociación Ka es igual a
             Ka = [H+] [A-] / [HA]
Ecuación de Henderson-Hasselbalch
Ecuación de
Henderson-Hasselbalch
Curva de titulación


   Representación gráfica de la variación del pH
    de una solución debida al agregado de una
    base o un ácido
Amortiguador
Propiedades ácido-base aa

   Los grupos α-COOH y α-NH2 de los
    aminoácidos son capaces de ionizarse (al
    igual que los grupos-R ácidos y básicos de
    los aminoácidos).
   Las siguientes reacciones de equilibrio iónico
    pueden ser escritas:
    R-COOH <——> R-COO– + H+
    R-NH3+ <——> R-NH2 + H+
Propiedades ácido-base aa
Aminoácido      pKa1   pKa2    pKaR

Ác. Aspártico   1,88    9,60   3,65
Ác. Glutámico   2,19    9,67   4,25
    Alanina     2,34    9,69
   Arginina     1,17    9,04   12,48   pKa1: pKa del grupo carboxilo
 Asparagina     2,02    8,80              COOH  COO- + H+
   Cisteína     1,96   10,28   8,18
 Fenilalanina   1,83    9,13
    Glicina     2,34    9,60            pKa2: pKa del grupo amino
  Glutamina     2,17    9,13                NH2 + H+  NH3+
   Histidina    1,82    9,17    6,0
  Isoleucina    2,36    9,68
    Leucina     2,36    9,60                pKaR: pKa del grupo R
     Lisina     2,18    8,95   10,53    Podrá tener características de
  Metionina     2,28    9,21           ácido o base débil según el caso
    Prolina     1,99   10,96
     Serina     2,21    9,15
   Tirosina     2,20    9,11   10,07
   Treonina     2,11    9,62
  Triptófano    2,38    9,39
     Valina     2,32    9,62
Propiedades ácido-base aa
   Para aa monoamino y monocarboxilos,
    son posibles dos ionizaciones: carboxilo
    (pKa) y amino (pKb).
   A pH 1 el 100% de las moléculas de aa
    están como ión positivo (todos sus grupos
    protonados) R-COOH, R-NH3+
   Al aumentar el pH se disocia el grupo
    carboxilo y luego el grupo amino (cambia
    carga eléctrica)
Propiedades ácido-base aa

   A pH 14 el 100% del aminoácido estará
    como ión negativo R-COO– R-NH2
Propiedades ácido-base aa

   La carga neta es la suma algebraica de todos
    los grupos con carga presentes de cualquier
    aminoácido, péptido o proteína.
   La carga neta dependerá del pH del ambiente
    acuoso circundante.
   Cuando la carga neta de un aminoácido o de
    una proteína es cero el pH será equivalente
    al punto isoeléctrico (pI).
Propiedades ácido-base aa
Ejemplo: Alanina
pKa1 = 2,34
pKa2 = 9,69
                           Zwitterion

       +1                       0                       -1

                    H+                        H+




        50 %                    50 %                     50 %


  A pH = 2,34 el 50 % de los           A pH = 9,69 el 50 % de los
grupos carboxilo se encuentra          grupos amino se encuentra
 protonado (COOH) y el 50 %            protonado (NH3+) y el 50 %
    restante se encuentra                 restante se encuentra
     desprotonado (COO-)                   desprotonado (NH2)
Curva de titulación alanina
Curva de titulación alanina
Titulación de la alanina
     14


     12


     10
                                                                     pKa2= 9,6
                                      pKa2
      8                                                               H+

pH
      6                          pI

                                                                     pKa1= 2,4
      4                                Amortiguador                   H+
                                         (Buffer)

      2
                    pKa1
      0
                           [OH-] →           Modificado de: Juang RH (2004) BCbasics
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   NH3+




 Ácido Aspártico (pH1)      Histidina (pH 13)
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Histidina                Aspártico




                          “Bioquímica” Mathews, van Holde
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Tema 2 Aminoácidos. Estructura y propiedades ácido bases

  • 1. Universidad Central de Venezuela Facultad de Medicina Escuela de Medicina Luis Razetti Cátedra de Bioquímica TEMA 2. Aminoácidos Propiedades ácido base e ionización Dra. Vanessa Miguel vanessa.miguel@ucv.ve @bioquitips Noviembre 2012
  • 2. Fórmula General de los Aminoácidos H +H3N Ca COOH R
  • 3. Fórmula General de los Aminoácidos R Ca (central) Grupo amino a CH Grupo carboxilo Átomo de Hidrógeno NH3+ COOH Cadena lateral R
  • 4. ¿Cuál de las siguientes moléculas es un α- aminoácido?
  • 5. Aminoácidos 1. Glicina 11. Treonina 2. Alanina 12. Tirosina 3. Valina Cadena 13. Cisteína 4. Leucina Lateral 14. Arginina 5. Isoleucina o 15. Lisina 6. Prolina Grupo 16. Histidina 7. Fenilalanina R 17. Acido Aspártico 8. Triptófano 18. Acido Glutámico 9. Metionina 19. Asparagina 10. Serina 20. Glutamina •Se conocen otros 150 aminoácidos pero NO forman parte de las proteínas.
  • 6.
  • 7. Ejemplos de algunos aminoácidos
  • 8. Aminoácidos Dos propiedades importantes que los distinguen son:  Polaridad. Si un aminoácido es polar o no polar influye como interactúa con el agua.  Carga. Si tienen o no carga. Algunos aminoácidos pueden ionizarse para tener cargas positivas, otros se ionizan con cargas negativas.
  • 9. Clasificación de los Aminoácidos
  • 10. Esteroisomería de los aminoácidos  Cuando cuatro grupos diferentes están unidos a un átomo de carbono, como el carbono α de los aminoácidos (excepto la glicina), resultan dos isómeros posibles, que son imágenes especulares no superponibles.  Isómeros ópticos: en general, una molécula con n centros quirales tiene 2n estereoisómeros  Esta característica es importante en los sistemas biológicos.
  • 11.
  • 12. Dos moléculas son enantiómeros sino se sobreponen una con otra, sin importar cuanto se roten en el espacio
  • 13. Esteroisomería de los aa  Todos los aminoácidos excepto la glicina poseen un carbono asimétrico.  Esto hace que presenten esteroisomería, cada aminoácido posee dos esteroisómeros según como sea la colocación del grupo NH3+.  Si el grupo NH3+ se sitúa a la derecha tendrá configuración D, si se sitúa a la izquierda tendrá configuración L (con base a la conformación del gliceraldehido).  Los aminoácidos que forman las proteínas son todos de configuración L.
  • 16.
  • 17. Actividad óptica  La presencia del carbono asimétrico, además les da a los aminoácidos actividad óptica, es decir en disolución son capaces de desviar el plano de polarización de la luz.  Si lo desvían hacia la derecha (+) se llaman dextrógiros, si lo desvían hacia la izquierda (-) levógiros.
  • 18. Propiedades ácido base de los aa  Primero un repaso…
  • 19. Ácidos y Bases (Bronsted-Lowry)  un ácido es una sustancia capaz de donar un protón a otra sustancia.  una base es una sustancia capaz de aceptar un protón  las sustancias que pueden actuar como ácido y como base se conocen como sustancias anfóteras.  El pH puede ser calculado en base a: pH = -log[H+]
  • 23. Ka Considere la liberación de un protón por un ácido débil representado por HA: HA ←→ H+ + A- Ácido débil protón base conjugada ( sal ) La (sal ) o base conjugada, A- , es la forma ionizada de un ácido débil. La constante de disociación Ka es igual a Ka = [H+] [A-] / [HA]
  • 26.
  • 27. Curva de titulación  Representación gráfica de la variación del pH de una solución debida al agregado de una base o un ácido
  • 28.
  • 30. Propiedades ácido-base aa  Los grupos α-COOH y α-NH2 de los aminoácidos son capaces de ionizarse (al igual que los grupos-R ácidos y básicos de los aminoácidos).  Las siguientes reacciones de equilibrio iónico pueden ser escritas: R-COOH <——> R-COO– + H+ R-NH3+ <——> R-NH2 + H+
  • 31. Propiedades ácido-base aa Aminoácido pKa1 pKa2 pKaR Ác. Aspártico 1,88 9,60 3,65 Ác. Glutámico 2,19 9,67 4,25 Alanina 2,34 9,69 Arginina 1,17 9,04 12,48 pKa1: pKa del grupo carboxilo Asparagina 2,02 8,80 COOH  COO- + H+ Cisteína 1,96 10,28 8,18 Fenilalanina 1,83 9,13 Glicina 2,34 9,60 pKa2: pKa del grupo amino Glutamina 2,17 9,13 NH2 + H+  NH3+ Histidina 1,82 9,17 6,0 Isoleucina 2,36 9,68 Leucina 2,36 9,60 pKaR: pKa del grupo R Lisina 2,18 8,95 10,53 Podrá tener características de Metionina 2,28 9,21 ácido o base débil según el caso Prolina 1,99 10,96 Serina 2,21 9,15 Tirosina 2,20 9,11 10,07 Treonina 2,11 9,62 Triptófano 2,38 9,39 Valina 2,32 9,62
  • 32. Propiedades ácido-base aa  Para aa monoamino y monocarboxilos, son posibles dos ionizaciones: carboxilo (pKa) y amino (pKb).  A pH 1 el 100% de las moléculas de aa están como ión positivo (todos sus grupos protonados) R-COOH, R-NH3+  Al aumentar el pH se disocia el grupo carboxilo y luego el grupo amino (cambia carga eléctrica)
  • 33.
  • 34. Propiedades ácido-base aa  A pH 14 el 100% del aminoácido estará como ión negativo R-COO– R-NH2
  • 35. Propiedades ácido-base aa  La carga neta es la suma algebraica de todos los grupos con carga presentes de cualquier aminoácido, péptido o proteína.  La carga neta dependerá del pH del ambiente acuoso circundante.  Cuando la carga neta de un aminoácido o de una proteína es cero el pH será equivalente al punto isoeléctrico (pI).
  • 36. Propiedades ácido-base aa Ejemplo: Alanina pKa1 = 2,34 pKa2 = 9,69 Zwitterion +1 0 -1 H+ H+ 50 % 50 % 50 % A pH = 2,34 el 50 % de los A pH = 9,69 el 50 % de los grupos carboxilo se encuentra grupos amino se encuentra protonado (COOH) y el 50 % protonado (NH3+) y el 50 % restante se encuentra restante se encuentra desprotonado (COO-) desprotonado (NH2)
  • 38. Curva de titulación alanina Titulación de la alanina 14 12 10 pKa2= 9,6 pKa2 8 H+ pH 6 pI pKa1= 2,4 4 Amortiguador H+ (Buffer) 2 pKa1 0 [OH-] → Modificado de: Juang RH (2004) BCbasics
  • 39. Propiedades ácido-base de los aa NH3+ Ácido Aspártico (pH1) Histidina (pH 13)
  • 40. CURVAS DE TITULACIÓN Histidina Aspártico “Bioquímica” Mathews, van Holde y Ahern. Addison Wesley 2002