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C
GENÓMICA Y PROTEÓMICA EN CÁNCER
González Martínez Victor S16003449
PROTEÓMICA
• Ciencia dedicada al estudio de la expresión de las
proteínas y de sus cambios en dependencia del
contexto biológico.
• Se basa en la separación y la identificación de muchas
proteínas (mil o más) simultáneamente.
• Se puede obtener un ordenamiento físico de mezclas
complejas de proteínas.
• Proteoma: Conjunto de proteínas expresadas por un
organismo o un tejido en un momento dado.
• Proteómica de expresión: Describir el proteoma total de un tejido, fluido, tipo celular u
organelo y las mediciones cuantitativas de los niveles de expresión proteínica.
• Proteómica funcional: Función de proteínas dentro de sistemas biológicos (relaciona cambios
de expresión con una función determinada) y la regulación de su expresión.
Proteómica vs Genómica
• Genómica: Colección de genes cuya naturaleza es estática
• Proteómica: Colección dinámica y cambiante de proteínas que difieren de un individuo a otro o
de una célula a otra.
• Principal Herramienta de investigación proteómica es la espectrometría de masas (EM).
• Es una técnica analítica que mide la relación masa/carga de una molécula y se utiliza para
detectar e identificar moléculas pequeñas como nucleótidos, carbohidratos, lípidos y proteínas.
Aplicaciones de la proteómica en la
salud pública
• La salud pública de nuestros días tiene como reto integrar las ciencias genómicas al derecho
fundamental de la salud de todos los seres humanos.
• De forma adicional, la salud pública a nivel mundial experimenta una transición
epidemiológica hacia el predominio de las enfermedades crónicas (cáncer, diabetes mellitus,
enfermedades cardiovasculares, etc.) sobre las infecciosas, aunque algunas de ellas subsisten
y se consideran emergentes (VIH/sida, dengue, malaria, etc.).
Áreas de gran impacto
1. Búsqueda de biomarcadores: moléculas que sirven como indicadores del estado fisiológico y
también de los cambios que se producen durante el proceso y que desembocan en el
desarrollo y establecimiento de un padecimiento, y cuyos requisitos fundamentales son una
elevada especificidad (Líquidos humanos).
2. Enfermedades crónicas: Trastornos metabólicos, resistencia a la insulina, mal plegamiento de
proteínas en el RE.
3. Enfermedades infecciosas: Con los avances de la tecnología proteómica es posible
caracterizar la interac-ción patógeno-hospedero en función de las alteraciones de la expresión
proteica (VIH, VPH, VHS, Candida, Streptococcus, Yersinia, Salmonella, etc.)
ESTUDIOS POBLACIONALES
MEDIANTE ESPECTROMETRÍA DE
MASAS
• Identificación de polimorfismos de una sola base: Se analiza el ADN, productos de PCR,
determinación de alelos e identificación de polimorfismos de una sola base.
• Detección y genotipificación de patógenos: Con la PCR multiplex se efectúa la amplificación
de dos o más fragmentos de ARN o ADN de diferentes patógenos, como virus, bacterias y
parásitos, de manera simultánea; con el aumento del número de amplicones existe el
inconveniente de no poder diferenciarlos en el plano electroforético y por ello su detección se
realiza por EM
PROTEÓMICA EN CÁNCER
Historia…
• El término proteómica fue acuñado en 1973​ como una analogía con
genómica, el estudio de los genes.
• La palabra "proteoma" es la fusión de "proteína" y "genoma", y fue
acuñada por Marc Wilkins en 1994, mientras trabajaba en ese
concepto como estudiante de doctorado.
CANCER
• Cáncer es el nombre común que recibe un conjunto de enfermedades
relacionadas en las que se observa un proceso descontrolado en la
división de las células del cuerpo.
Según la definición de Rupert Allan Willis…
Patólogo australiano, una neoplasia es una masa anormal de tejido
cuyo crecimiento excede del de los tejidos normales y no está
coordinado con estos, Puede comenzar de manera localizada y
diseminarse a otros tejidos circundantes.
​ En general conduce a la muerte del paciente si este no recibe
tratamiento adecuado.
HISTORIA…
• El cáncer se menciona en documentos históricos muy antiguos, entre
ellos papiros egipcios del año 1600 a. C. que hacen una descripción
de la enfermedad. Se cree que el médico Hipócrates fue el primero en
utilizar el término carcinos.
CANCER
• El cáncer es el resultado de dos procesos sucesivos, la proliferación de
un grupo de células, denominado tumor o neoplasia, y la capacidad
invasiva que les permite colonizar y proliferar en otros tejidos u
órganos, proceso conocido como metástasis.
CANCER
• La malignidad del cáncer es variable, según la agresividad de sus
células y demás características biológicas de cada tipo tumoral.
CANCER
• El comportamiento de las células cancerosas se caracteriza por
carecer del control reproductivo que requiere su función original,
perdiendo sus características primitivas y adquiriendo otras que no
les corresponden como:
• la capacidad de invadir de forma progresiva
• y las vías a órganos próximos (metástasis) con crecimiento y división
más allá de los límites normales del órgano diseminándose por el
organismo fundamentalmente a través del sistema linfático o el
sistema circulatorio, y ocasionando el crecimiento de nuevos tumores
en otras partes del cuerpo alejadas de la localización original.
• Los estudios realizados hasta hoy con estas metodologías han
permitido identificar y proponer una serie de genes, proteínas,
biomarcadores y vías de señalización que han contribuido a la
comprensión de los mecanismos moleculares que dirigen la
capacidad de las células para iniciar el tumor.
• Dichas metodologías han demostrado tener la capacidad de
revolucionar la práctica clínica, el diagnóstico y el descubrimiento de
nuevos fármacos para mejorar el tratamiento de los pacientes con
cáncer.
los biomarcadores que se utilizan para la detección temprana
de cáncer:
• En la actualidad se han correlacionado muchos de estos trabajos con
el objetivo de crear listas consenso tanto de genes, proteínas y
biomarcadores que puedan ser aplicados en la práctica clínica.
• Como ya es conocido el diagnóstico temprano del cáncer es difícil de
establecerse debido a la ausencia de síntomas específicos durante las
primeras etapas.
• Los distintos tipos de cáncer se caracterizan por presentar
alteraciones en vías de señalización específicas
• por lo que otra contribución de la proteómica ha sido la
identificación de blancos terapéuticos que permiten la terapia
dirigida.
Aplicaciones de la proteómica en la
salud pública
• La salud pública a nivel mundial experimenta una transición
epidemiológica hacia el predominio de las enfermedades crónicas
(cáncer, diabetes mellitus, enfermedades cardiovasculares, etc.)
• sobre las infecciosas, aunque algunas de ellas subsisten y se
consideran emergentes (VIH/sida, dengue, malaria, etc.).
• la genómica en salud pública es un campo emergente de investigación, que
evalúa el impacto de los genes y su interacción con el comportamiento, la
dieta y el ambiente sobre la salud de la población.
• Asimismo, hará posible la identificación de nuevos blancos
terapéuticos para un mejor diseño de fármacos y la vigilancia de los
efectos de una sustancia en el tratamiento de un paciente.
• Debido a su elevada sensibilidad y la capacidad de realizar estudios a
escala masiva, la espectrometría de masas es una técnica que se ha
utilizado ahora para realizar estudios poblacionales de
genotipificación y detectar de manera simultánea y a bajo costo
múltiples patógenos.
áreas en las que la proteómica tiene grandes
impactos
• 1. Búsqueda de biomarcadores
• 2. Enfermedades crónicas
• 3. Enfermedades infecciosas
• El estudio de un sistema biológico en forma integrada, en los planos
genómico, proteómico y metabolómico, en conjunción con los datos
clínicos y epidemiológicos, hará posible caracterizar el sistema en su
conjunto y de esta forma incrementar exponencialmente la
posibilidad de entender diferentes procesos celulares, la
fisiopatologia de una enfermedad o encontrar un nuevo biomarcador.
Bibliografía
• Pando-Robles Rosa Victoria, Lanz-Mendoza Humberto, RV Pando-Robles, H Lanz-Mendoza. Revisión:
La importancia de la proteómica en la salud pública. Salud pública Méx [revista en la Internet].
2014 Ene [citado 2019 Abr 08] ; 51( Suppl 3 ): s386-s394. Disponible en:
http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0036 36342009000900004&lng=es.
• Robles V, Ferreira C. Proteómica: hacia el entendimiento del lenguaje de las proteínas. Biotecnología
UNAM. México: 2016. p 97-109.
• Castellanos L, González J, Padrón G. Proteómica. Rev Gen y Biotec La Habana. Cuba:
Elfosscientiae.2016; p 367-400.
• Velásquez D. Genómica y Proteómica: Impacto Clínico en cáncer. Medigraphic. Chile; 2011 33(1). P 1-3.
Bibliografía
• http://Genetica_clinica_-_Victoria_del_Castillo//cancer.pdf
• https://www.scielosp.org/article/ssm/content/raw/?resource_ssm_path=/media/assets/spm/v51s
3/a04v51s3.pdf
• http://www.ibt.unam.mx//pdfs/libro_25_aniv/capitulo_09.pdf
• http://www.biocancer.com/journal/286/4-proteomica
• http://www.medigraphic.com/pdfs/cirgen/cg-2011/cgs111l.pdf

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Proteomica

  • 1. C GENÓMICA Y PROTEÓMICA EN CÁNCER González Martínez Victor S16003449
  • 2. PROTEÓMICA • Ciencia dedicada al estudio de la expresión de las proteínas y de sus cambios en dependencia del contexto biológico. • Se basa en la separación y la identificación de muchas proteínas (mil o más) simultáneamente. • Se puede obtener un ordenamiento físico de mezclas complejas de proteínas. • Proteoma: Conjunto de proteínas expresadas por un organismo o un tejido en un momento dado.
  • 3. • Proteómica de expresión: Describir el proteoma total de un tejido, fluido, tipo celular u organelo y las mediciones cuantitativas de los niveles de expresión proteínica. • Proteómica funcional: Función de proteínas dentro de sistemas biológicos (relaciona cambios de expresión con una función determinada) y la regulación de su expresión.
  • 4. Proteómica vs Genómica • Genómica: Colección de genes cuya naturaleza es estática • Proteómica: Colección dinámica y cambiante de proteínas que difieren de un individuo a otro o de una célula a otra.
  • 5. • Principal Herramienta de investigación proteómica es la espectrometría de masas (EM). • Es una técnica analítica que mide la relación masa/carga de una molécula y se utiliza para detectar e identificar moléculas pequeñas como nucleótidos, carbohidratos, lípidos y proteínas.
  • 6. Aplicaciones de la proteómica en la salud pública • La salud pública de nuestros días tiene como reto integrar las ciencias genómicas al derecho fundamental de la salud de todos los seres humanos. • De forma adicional, la salud pública a nivel mundial experimenta una transición epidemiológica hacia el predominio de las enfermedades crónicas (cáncer, diabetes mellitus, enfermedades cardiovasculares, etc.) sobre las infecciosas, aunque algunas de ellas subsisten y se consideran emergentes (VIH/sida, dengue, malaria, etc.).
  • 7. Áreas de gran impacto 1. Búsqueda de biomarcadores: moléculas que sirven como indicadores del estado fisiológico y también de los cambios que se producen durante el proceso y que desembocan en el desarrollo y establecimiento de un padecimiento, y cuyos requisitos fundamentales son una elevada especificidad (Líquidos humanos). 2. Enfermedades crónicas: Trastornos metabólicos, resistencia a la insulina, mal plegamiento de proteínas en el RE. 3. Enfermedades infecciosas: Con los avances de la tecnología proteómica es posible caracterizar la interac-ción patógeno-hospedero en función de las alteraciones de la expresión proteica (VIH, VPH, VHS, Candida, Streptococcus, Yersinia, Salmonella, etc.)
  • 8. ESTUDIOS POBLACIONALES MEDIANTE ESPECTROMETRÍA DE MASAS • Identificación de polimorfismos de una sola base: Se analiza el ADN, productos de PCR, determinación de alelos e identificación de polimorfismos de una sola base. • Detección y genotipificación de patógenos: Con la PCR multiplex se efectúa la amplificación de dos o más fragmentos de ARN o ADN de diferentes patógenos, como virus, bacterias y parásitos, de manera simultánea; con el aumento del número de amplicones existe el inconveniente de no poder diferenciarlos en el plano electroforético y por ello su detección se realiza por EM
  • 10. Historia… • El término proteómica fue acuñado en 1973​ como una analogía con genómica, el estudio de los genes. • La palabra "proteoma" es la fusión de "proteína" y "genoma", y fue acuñada por Marc Wilkins en 1994, mientras trabajaba en ese concepto como estudiante de doctorado.
  • 11. CANCER • Cáncer es el nombre común que recibe un conjunto de enfermedades relacionadas en las que se observa un proceso descontrolado en la división de las células del cuerpo.
  • 12. Según la definición de Rupert Allan Willis… Patólogo australiano, una neoplasia es una masa anormal de tejido cuyo crecimiento excede del de los tejidos normales y no está coordinado con estos, Puede comenzar de manera localizada y diseminarse a otros tejidos circundantes. ​ En general conduce a la muerte del paciente si este no recibe tratamiento adecuado.
  • 13. HISTORIA… • El cáncer se menciona en documentos históricos muy antiguos, entre ellos papiros egipcios del año 1600 a. C. que hacen una descripción de la enfermedad. Se cree que el médico Hipócrates fue el primero en utilizar el término carcinos.
  • 14. CANCER • El cáncer es el resultado de dos procesos sucesivos, la proliferación de un grupo de células, denominado tumor o neoplasia, y la capacidad invasiva que les permite colonizar y proliferar en otros tejidos u órganos, proceso conocido como metástasis.
  • 15. CANCER • La malignidad del cáncer es variable, según la agresividad de sus células y demás características biológicas de cada tipo tumoral.
  • 16. CANCER • El comportamiento de las células cancerosas se caracteriza por carecer del control reproductivo que requiere su función original, perdiendo sus características primitivas y adquiriendo otras que no les corresponden como: • la capacidad de invadir de forma progresiva • y las vías a órganos próximos (metástasis) con crecimiento y división más allá de los límites normales del órgano diseminándose por el organismo fundamentalmente a través del sistema linfático o el sistema circulatorio, y ocasionando el crecimiento de nuevos tumores en otras partes del cuerpo alejadas de la localización original.
  • 17. • Los estudios realizados hasta hoy con estas metodologías han permitido identificar y proponer una serie de genes, proteínas, biomarcadores y vías de señalización que han contribuido a la comprensión de los mecanismos moleculares que dirigen la capacidad de las células para iniciar el tumor.
  • 18. • Dichas metodologías han demostrado tener la capacidad de revolucionar la práctica clínica, el diagnóstico y el descubrimiento de nuevos fármacos para mejorar el tratamiento de los pacientes con cáncer.
  • 19. los biomarcadores que se utilizan para la detección temprana de cáncer:
  • 20. • En la actualidad se han correlacionado muchos de estos trabajos con el objetivo de crear listas consenso tanto de genes, proteínas y biomarcadores que puedan ser aplicados en la práctica clínica. • Como ya es conocido el diagnóstico temprano del cáncer es difícil de establecerse debido a la ausencia de síntomas específicos durante las primeras etapas.
  • 21. • Los distintos tipos de cáncer se caracterizan por presentar alteraciones en vías de señalización específicas • por lo que otra contribución de la proteómica ha sido la identificación de blancos terapéuticos que permiten la terapia dirigida.
  • 22. Aplicaciones de la proteómica en la salud pública • La salud pública a nivel mundial experimenta una transición epidemiológica hacia el predominio de las enfermedades crónicas (cáncer, diabetes mellitus, enfermedades cardiovasculares, etc.) • sobre las infecciosas, aunque algunas de ellas subsisten y se consideran emergentes (VIH/sida, dengue, malaria, etc.).
  • 23. • la genómica en salud pública es un campo emergente de investigación, que evalúa el impacto de los genes y su interacción con el comportamiento, la dieta y el ambiente sobre la salud de la población.
  • 24. • Asimismo, hará posible la identificación de nuevos blancos terapéuticos para un mejor diseño de fármacos y la vigilancia de los efectos de una sustancia en el tratamiento de un paciente.
  • 25. • Debido a su elevada sensibilidad y la capacidad de realizar estudios a escala masiva, la espectrometría de masas es una técnica que se ha utilizado ahora para realizar estudios poblacionales de genotipificación y detectar de manera simultánea y a bajo costo múltiples patógenos.
  • 26. áreas en las que la proteómica tiene grandes impactos • 1. Búsqueda de biomarcadores • 2. Enfermedades crónicas • 3. Enfermedades infecciosas
  • 27. • El estudio de un sistema biológico en forma integrada, en los planos genómico, proteómico y metabolómico, en conjunción con los datos clínicos y epidemiológicos, hará posible caracterizar el sistema en su conjunto y de esta forma incrementar exponencialmente la posibilidad de entender diferentes procesos celulares, la fisiopatologia de una enfermedad o encontrar un nuevo biomarcador.
  • 28. Bibliografía • Pando-Robles Rosa Victoria, Lanz-Mendoza Humberto, RV Pando-Robles, H Lanz-Mendoza. Revisión: La importancia de la proteómica en la salud pública. Salud pública Méx [revista en la Internet]. 2014 Ene [citado 2019 Abr 08] ; 51( Suppl 3 ): s386-s394. Disponible en: http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0036 36342009000900004&lng=es. • Robles V, Ferreira C. Proteómica: hacia el entendimiento del lenguaje de las proteínas. Biotecnología UNAM. México: 2016. p 97-109. • Castellanos L, González J, Padrón G. Proteómica. Rev Gen y Biotec La Habana. Cuba: Elfosscientiae.2016; p 367-400. • Velásquez D. Genómica y Proteómica: Impacto Clínico en cáncer. Medigraphic. Chile; 2011 33(1). P 1-3.
  • 29. Bibliografía • http://Genetica_clinica_-_Victoria_del_Castillo//cancer.pdf • https://www.scielosp.org/article/ssm/content/raw/?resource_ssm_path=/media/assets/spm/v51s 3/a04v51s3.pdf • http://www.ibt.unam.mx//pdfs/libro_25_aniv/capitulo_09.pdf • http://www.biocancer.com/journal/286/4-proteomica • http://www.medigraphic.com/pdfs/cirgen/cg-2011/cgs111l.pdf