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Biolgia molecular repaso

Etapas de l desarrollo de la biología :

 Biología antigua- clasificación de las especies
 Biología moderna- desarrollo tecnológico.
 Biología molecular- apoyada bioquímica se basa en el estudio de los ácidos nucleicos como
  están formadas sus estructuras y que función van a tener como proteínas.

Generalidades:

 Enlace covalente: compartición de electrones entre 2 atomos, se produce cuano la
  electronegatividad polarpero la diferencia de electronegatividades entre los átomos no es
  suficientemente grande como para que se efectúe transferencia de electrones.
 Fuerzas de Van der Waals: Las fuerzas de Van der Waals son fuerzas de estabilización
  molecular; forman un enlace químico no covalente en el que participan dos tipos de fuerzas o
  interacciones, las fuerzas de dispersión (que son fuerzas de atracción) y las fuerzas de
  repulsión entre las capas electrónicas de 2 átomos contiguos.
 Enlace peptídico :que es un enlace amido entre el grupo a-carboxilo de un aminoácido y el
  grupo a-amino del siguiente. Este enlace se forma por la deshidratación de los aminoácidos en
  cuestión. Enlace fuerte y resistente que se comporta como doble enlace no permite el giro.
 Enlace fosfodiester: es un tipo de enlace covalente que se produce entre un grupo hidroxilo
  (OH-) en el carbono 3' y un grupo fosfato en el carbono 5' del nucleótido entrante,
  formándose así un doble enlace éster da carga negativa al nucleótido.

Acomodos de las moléculas.

 Isómero dextrógiro:átomo cuya asimetría tric carbono gira plano de la luz polarizada hacia la
  derecha.
 Isómero levógiro: átomo que gira hacia la izquierda

Aminoácidos hidrofóbico:

   Alanina
   Valina i
   soleucina
   leucina
   triptófanos

Aminoácidos hidrofilico:

   lisina
   arginina
   histidina
   glutamina
estructura primaria de las proteínas

 aminoácidos

estructura secundaria:

 Es el plegamiento que la cadena polipeptídica adopta gracias a la formación de puentes de
  hidrógeno entre los átomos que forman el enlace peptídico.

Concepto y escala de pH

 pH es el logaritmo de la concentración de iones H+, con el signo invertido:Análogamente, se
  define pOH como el logaritmo de la concentración de iones OH-, con el signo cambiado.

Isómero:

 Es la misma molécula con diferentes arreglos tridimencionales

Dogma central de la biología molecular:

 ADN-replicación de a cadena nueva-transcribir-ARN-especialización y activación de genes
  útiles -traducir producto final- proteína

Antecedentes históricos

   Mendel 1865 postula existencia de entes llamado genes
   Ludwin 1679 identifica adenina , timina y citosina
   Friedrich 1889 describe la nucleina
   Atmanacuñan el termino acido nucleico
   LeveneEl DNA esta formado por 4 tipos distintos de nucleótidos. Cada nucleótido estaba
    formado por desoxirribosa, fosfato y una base nitrogenada (A, C, T o G).
   Chargaff 1950 propone reglas de complementariedad y la composición del ADN
   Kornberg1956 descubre la polimerasa tipo 1
   Kary Mullis. 1983 The Polymerase Chain Reaction (PCR)
   El banco de genes 1993
   Publicaron elgenomahumano 200

Ácidos nucleicos generalidades
 Acidos nucleicos: Los ácidos nucleicos son polímeros lineales con la función de almacenar,
  transducir y transmitir la información genética en los seres vivos.
 Nucleosido : base nitrogenada y azúcar unido en posición “1-9” enlace beta glucosidico.
 Nucleótido: grupo fosfato , base nitrogenada y azúcar (pentosa) “5-3” enlace fosfodiester-
 Desoxi: perdida de un grupo oxigeno

Tipos de ácidos nucleicos:

 ADN: cadena doble
 ARN: mono cadena que se une por atracción de unidad de base formando anillo
  intercatenario.
 Pentosa: azucares cadenas polihidrocarbonadas OH que se divide en aldhidos y en un anillo
  beta furamidico-

  Bases nitrogenadas:
  Estructuras aromáticas, planas, polares, con momentos dipolares
 Bases puricas: adenina y guanina y cuentan con un anillo doble.
 Bases pirimidicas: citosina , timina y uracilo cuentan con 1 solo anillo.

Bases raras:

Metilación: cambio de función y acomodo.

Metilcitidiana: sentido 3 -5 un metil

Metiladenocina:grupo amino posición 6 tiene un metil.

DNA desoxyribonucleotidos:

 Desoxy-nombre de la unio sin un oxigeno
 Desoxyguanilato 5 monofosfato

Asi se nombran

Base Nitrogenada                        Nucleósido                            Nucleótido

Adenina                                 Adenosina                             Ácido Adenílico
Guanina                                 Guanosina                             Ácido Guanílico
Citosina                                Citidina                              Ácido Citidílico
Timina                                  Timidina                              Ácido Timidílico

Uracilo                                 Uridina                               Ácido Uridílico
Propiedades físico químicas de las bases:
    Capacidad de mantener la luz
    Luz No visibles rayos uV ,infrarojos ,28 nanometros
    Espectro fotometría: cantidad de moléculas
    tautomeria: método saltarín grupo R comportamiento intrones.
    Dadores y receptores: de puente de hidrogeno capas de donar y recibir hidrógenos.
    Protonacion: capacidad dentro de las bases para recibir hidrones o intrones
    Ataques neutrófilos: por medio del grupo fosfato.

     RNA de transferencia: tiene algunas características como lo son
      La rotación al enlace glucosidico
      El apareamiento de la bases a y g y c y t o u

     Reglas de chargaff
      La relación purinas/pirimidinas es igual a 1 Es decir, A+G = C+T .
      En todos los DNA estudiados, la proporción molar de A es igual a la de T, y la de G igual a la
         de C. Es decir, A = T y G = C

Formas alternativas de la doble hélice

 dependiendo de: grado de deshidratación, el medio salino y la secuencia de bases
  nitrogenadas

Cristalografía de rayos X del DNAEstudiada por: L.Pauling,M.Wilkins y R.E.Franklin ,J.D.Watson
yF.H.C.Crick

Formas cristalinas:

 A-DNA: baja hidratación, peso molecular relativamente bajo, reflexiones claras
 B-DNA: alta hidratación, peso molecular alto, reflexiones difusas

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  • 1. Biolgia molecular repaso Etapas de l desarrollo de la biología :  Biología antigua- clasificación de las especies  Biología moderna- desarrollo tecnológico.  Biología molecular- apoyada bioquímica se basa en el estudio de los ácidos nucleicos como están formadas sus estructuras y que función van a tener como proteínas. Generalidades:  Enlace covalente: compartición de electrones entre 2 atomos, se produce cuano la electronegatividad polarpero la diferencia de electronegatividades entre los átomos no es suficientemente grande como para que se efectúe transferencia de electrones.  Fuerzas de Van der Waals: Las fuerzas de Van der Waals son fuerzas de estabilización molecular; forman un enlace químico no covalente en el que participan dos tipos de fuerzas o interacciones, las fuerzas de dispersión (que son fuerzas de atracción) y las fuerzas de repulsión entre las capas electrónicas de 2 átomos contiguos.  Enlace peptídico :que es un enlace amido entre el grupo a-carboxilo de un aminoácido y el grupo a-amino del siguiente. Este enlace se forma por la deshidratación de los aminoácidos en cuestión. Enlace fuerte y resistente que se comporta como doble enlace no permite el giro.  Enlace fosfodiester: es un tipo de enlace covalente que se produce entre un grupo hidroxilo (OH-) en el carbono 3' y un grupo fosfato en el carbono 5' del nucleótido entrante, formándose así un doble enlace éster da carga negativa al nucleótido. Acomodos de las moléculas.  Isómero dextrógiro:átomo cuya asimetría tric carbono gira plano de la luz polarizada hacia la derecha.  Isómero levógiro: átomo que gira hacia la izquierda Aminoácidos hidrofóbico:  Alanina  Valina i  soleucina  leucina  triptófanos Aminoácidos hidrofilico:  lisina  arginina  histidina  glutamina
  • 2. estructura primaria de las proteínas  aminoácidos estructura secundaria:  Es el plegamiento que la cadena polipeptídica adopta gracias a la formación de puentes de hidrógeno entre los átomos que forman el enlace peptídico. Concepto y escala de pH  pH es el logaritmo de la concentración de iones H+, con el signo invertido:Análogamente, se define pOH como el logaritmo de la concentración de iones OH-, con el signo cambiado. Isómero:  Es la misma molécula con diferentes arreglos tridimencionales Dogma central de la biología molecular:  ADN-replicación de a cadena nueva-transcribir-ARN-especialización y activación de genes útiles -traducir producto final- proteína Antecedentes históricos  Mendel 1865 postula existencia de entes llamado genes  Ludwin 1679 identifica adenina , timina y citosina  Friedrich 1889 describe la nucleina  Atmanacuñan el termino acido nucleico  LeveneEl DNA esta formado por 4 tipos distintos de nucleótidos. Cada nucleótido estaba formado por desoxirribosa, fosfato y una base nitrogenada (A, C, T o G).  Chargaff 1950 propone reglas de complementariedad y la composición del ADN  Kornberg1956 descubre la polimerasa tipo 1  Kary Mullis. 1983 The Polymerase Chain Reaction (PCR)  El banco de genes 1993  Publicaron elgenomahumano 200 Ácidos nucleicos generalidades
  • 3.  Acidos nucleicos: Los ácidos nucleicos son polímeros lineales con la función de almacenar, transducir y transmitir la información genética en los seres vivos.  Nucleosido : base nitrogenada y azúcar unido en posición “1-9” enlace beta glucosidico.  Nucleótido: grupo fosfato , base nitrogenada y azúcar (pentosa) “5-3” enlace fosfodiester-  Desoxi: perdida de un grupo oxigeno Tipos de ácidos nucleicos:  ADN: cadena doble  ARN: mono cadena que se une por atracción de unidad de base formando anillo intercatenario.  Pentosa: azucares cadenas polihidrocarbonadas OH que se divide en aldhidos y en un anillo beta furamidico- Bases nitrogenadas: Estructuras aromáticas, planas, polares, con momentos dipolares  Bases puricas: adenina y guanina y cuentan con un anillo doble.  Bases pirimidicas: citosina , timina y uracilo cuentan con 1 solo anillo. Bases raras: Metilación: cambio de función y acomodo. Metilcitidiana: sentido 3 -5 un metil Metiladenocina:grupo amino posición 6 tiene un metil. DNA desoxyribonucleotidos:  Desoxy-nombre de la unio sin un oxigeno  Desoxyguanilato 5 monofosfato Asi se nombran Base Nitrogenada Nucleósido Nucleótido Adenina Adenosina Ácido Adenílico Guanina Guanosina Ácido Guanílico Citosina Citidina Ácido Citidílico Timina Timidina Ácido Timidílico Uracilo Uridina Ácido Uridílico
  • 4. Propiedades físico químicas de las bases:  Capacidad de mantener la luz  Luz No visibles rayos uV ,infrarojos ,28 nanometros  Espectro fotometría: cantidad de moléculas  tautomeria: método saltarín grupo R comportamiento intrones.  Dadores y receptores: de puente de hidrogeno capas de donar y recibir hidrógenos.  Protonacion: capacidad dentro de las bases para recibir hidrones o intrones  Ataques neutrófilos: por medio del grupo fosfato. RNA de transferencia: tiene algunas características como lo son  La rotación al enlace glucosidico  El apareamiento de la bases a y g y c y t o u Reglas de chargaff  La relación purinas/pirimidinas es igual a 1 Es decir, A+G = C+T .  En todos los DNA estudiados, la proporción molar de A es igual a la de T, y la de G igual a la de C. Es decir, A = T y G = C Formas alternativas de la doble hélice  dependiendo de: grado de deshidratación, el medio salino y la secuencia de bases nitrogenadas Cristalografía de rayos X del DNAEstudiada por: L.Pauling,M.Wilkins y R.E.Franklin ,J.D.Watson yF.H.C.Crick Formas cristalinas:  A-DNA: baja hidratación, peso molecular relativamente bajo, reflexiones claras  B-DNA: alta hidratación, peso molecular alto, reflexiones difusas 83