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CLIMCOR: paleoCLIMatic CORing: High Resolution and Innovations 
Carottage paléoclimatique: Haute Résolution et Innovations 
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1 
ANR-11-EQPX-0009-CLIMCOR 
Dir. Denis-Didier Rousseau (denis.rousseau@lmd.ens.fr), Dir. Adj. Michel Calzas (michel.calzas@dt.insu.cnrs.fr) 
Portail national des carottages Français 
« Cyber-carothèque nationale » 
Quels enjeux pour la gestion conservatoire 
des carottes sédimentaires et de leurs méta-données ? 
(maquette démonstrative) 
**** 
Présenté par, Cécile Pignol , Coordinateur du projet (IE - Laboratoire EDYTEM – C2FN) 
Fabien ARNAUD (EDYTEM), Arnaud CAILLO, Xavier CROSTA (EPOC) 
Elodie GODINHO (DT INSU) 
Loic PETIT DE LA VILLEON, Vanessa TOSELLO (IFREMER) 
Eva Moreno (MNHN) 
**** 
Colloque RESOMAR, Bordeaux, 24-26 Novembre 2014 
Direction Denis-Didier Rousseau – Dir-Adj : Michel - ANR-11-EQPX-0009-CLIMCOR 
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ANR-11-EQPX-0009-CLIMCOR 
Dir. Denis-Didier Rousseau (denis.rousseau@lmd.ens.fr), Dir. Adj. Michel Calzas (michel.calzas@dt.insu.cnrs.fr) 
=> INITIATIVE TRANSVERSALE AUX 3 WP CLIMCOR 
« PORTAIL NATIONAL DES CAROTTAGES SCIENTIFIQUES » 
CAROTTAGES MARINS, CÔTIERS, LACUSTRES, FLUVIAUX, TERRESTRES 
ADOSSEE AU C2FN Centre national de forage national 
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Dir. Denis-Didier Rousseau (denis.rousseau@lmd.ens.fr), Dir. Adj. Michel Calzas (michel.calzas@dt.insu.cnrs.fr) 
Dans quel contexte s’inscrit ce projet de Cyber-carothèque ? 
Volet «Cyber-carothèque nationale» 
CONTEXTE NATIONAL 
Retard dans la gestion des prélèvements et échantillons en France Concept de la gestion conservatoire (curation) carottes sédimentaires peut abordé en France 
CONTEXTE DE LA MONTÉE EN PUISSANCE DE L’OPEN-DATA EN RECHERCHE 
Incitation à valoriser & pérenniser les (méta)-données de la recherche H2020 
CONTEXTE DE MOBILISATION INTERNATIONALE CROISSANTE 
Projet E-infrastructures innovantes, … au EU et UE BELMONT-FORUM « E-Infrastructures & data management » DESC / EARTHCUBE «Community-led cyberinfrastructure to promote data sharing for Geosciences» SEADATANET «Cyberinfrastructure of data … of the seas and oceans » 
Portails internationaux de diffusion de métadonnées NOAA/IMLGS - ICDP 
Diffusion de « bonnes pratiques » de procédures de curating Consortium International des curateurs (16ème meeting, avr 2015, Texas), LaCORE 
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Pourquoi est-ce le bon moment traiter de cette question ? 
Volet «Cyber-carothèque nationale» 
SCIENTIFIQUE 
Accroissement de la mutualisation des prélèvements, des plateformes (demande des chercheurs & des financeurs) 
Besoin d’accompagnement labos français, mise en oeuvre d’actions de curation 
INSTITUTIONNEL 
Cadre règlementaire français (Directive INSPIRE) obligatoire 2017 
Cadre incitatif (H2020) pour le Libre Accès aux données de la recherche Open Research Data, en préconisant la définition préalable de Plan Management Données 
TECHNIQUES 
Moyens technologiques (BDr, interopérabilité, webservice, Persitant ID) 
OPERATIONEL 
Nouveaux investissements 
-Moyens de forages (Equipex Climcor) 
-Saturation, agrandis. / modernisation ou transfert de carothèques physiques (EPOC, IFREMER, EDYTEM, CHRONO-ENVIRON.) 
 OUVRE DE NOUVELLES PERSPECTIVES ET APPROCHES DMP 6 concepts fondamentaux qui déterminent l’ organisation - de la collecte - du traitement - de l’analyse - de La Conservation - de L’ accès / Diffusion - de la réutilisation
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DONNÉES EN RECHERCHE 
=> Plus on descend vers la base de la pyramide, plus il est difficile d'établir un lien entre les articles, les données sous-jacentes 
Données publiées dans les articles scientifiques représentent seulement la « partie émergée de l'iceberg » du BIG DATA 
Rôle du scientifique : 
Dataset associées aux publis 
=> WDC : PANGAEA – NOAA 
Volet «Cyber-carothèque nationale» 
et les prélèvements 
VISIBILITE
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POURQUOI IL NE FAUT NEGLIGER CE PROJET ? 
PRELEVEMENTS – ECHANTILLONS (BD Cyber-carothèque) 
Rôle du scientifique : 
Dataset associées aux publis 
=> WDC : PANGAEA – NOAA 
PLAN MANAG. DATA 
(DMP) – H2020 
Données publiées dans les articles scientifiques représentent seulement la « partie émergée de l'iceberg » du BIG DATA 
Volet «Cyber-carothèque nationale» 
La curation des ech. = un des SOCLES d’un futur DMP en PALEOSCIENCES ? 
VISIBILITE
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COMMENT ABORDER LA GESTION CONSERVATOIRE (CURATION) DES CAROTTES SÉDIMENTAIRES ? 
Volet «Cyber-carothèque nationale» 
PRELEVEMENTS 
Rapport Mission carottage 
DONNEES 
METADONNEES 
EN N’OMETTANT AUCUN DES 3 FLUX RELIANT LES 3 POLES COMPOSANT LA CURATION (CAROTTES SEDIMENTAIRES) 
EN STRUCTURANT LES 3 POLES COMPOSANT LA CURATION (CAROTTES SEDIMENTAIRES)
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1. De portails internationaux existants 
IMLGS (NOAA) 
« Index to marine and 
lacustrine Geological 
Samples» 
ICDP / GESEP 
« Virtual core repository » 
IODP – D.I.S 
«Syst. d’information 
des données de carottages » 
EXPERIENCES & PROJETS INTERNATIONAUX 
2. Identifiants pérennes internationaux opérationnels (Persitant ID) - PID des publications ou jeux de données DOI, ARK - Le système international de référencement des échantillons DESC/SESAR-IGSN (International GeoSample Number) - PID des chercheurs ORCIDRESEARCH ID - PID institutions ISNI 
IGSN : 
EDY-LDB14P1 
Volet «Cyber-carothèque nationale» 
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Des projets historiques…. 
Carothèque nat. physique 
(anciens projets CALIFF, JURA) 
Depuis quelques années 
=> proto- cartothèques virtuelles 
CONTEXTE NATIONAL : 
Identification des labos gérant des carothèques 
Initiatives de BDr locales, inégales et toujours non- coordonnées 
-MNHN – BG GEOCORES (v2) 
-EPOC – BD GEOSCIENCES (v2) 
-IFREMER – BD BGMB (v2) 
-LGGE – BD EPICA (v2) 
-EDYTEM – BDD EDYTEM (v1) 
… ailleurs, des listes xls, +/- à jour 
Volet «Cyber-carothèque nationale» 
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Nice
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LES BESOINS IDENTIFIES 
A quelles questions le système d’information devrait répondre ? 
Niv 1 : (niveau d’information d’INSPIRE) 
- Historique de la prise de la carotte (mission) : qui, pour qui (PI), ou, comment (Logistique, techniques), pourquoi (objectifs scientifiques) => RAPPORT MISSION Carottage 
- Où se trouve l’objet physique ? => GESTION DE STOCKS 
Niv2 : 
- Puis-je échantillonner (reste-t-il du sédiment …), qui contacter ? 
- Suivi analytique : Qu’est-ce qui a déjà été fait sur ce prélèvement : Quels types de données existe-t-il ? (acquisition routines, analyses spécifiques) 
Niv3 : 
- Niveau de la donnée existante (brute, nettoyée ) 
et la qualité de la données (Protocoles, paramètres …) ? 
- Comment retrouver les données à long terme (accès, partage, embargo, …), 
- Comment la ré-utiliser (Charte d’utilisation, Licences d’utilisation) ? 
Volet «Cyber-carothèque nationale» 
Concept du « LIMS » 
Laboratory Information management system 
=> ENTREPOTS DATA 
=> LIMS
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LES BESOINS IDENTIFIES 
A quelles questions le système d’information devrait répondre ? 
Niv 1 : (niveau d’information d’INSPIRE) 
- Historique de la prise de la carotte (mission) : qui, pour qui (PI), ou, comment (Logistique, techniques), pourquoi (objectifs scientifiques) => RAPPORT MISSION Carottage 
- Où se trouve l’objet physique ? => GESTION DE STOCKS 
Niv2 : 
- Puis-je échantillonner (reste-t-il du sédiment …), qui contacter ? 
- Suivi analytique : Qu’est-ce qui a déjà été fait sur ce prélèvement : Quels types de données existe-t-il ? (acquisition routines, analyses spécifiques) 
Niv3 : 
- Niveau de la donnée existante (brute, nettoyée ) et la qualité de la données (Protocoles, paramètres …) ? 
- Comment retrouver les données à long terme (accès, partage, embargo, …), 
- Comment la ré-utiliser (Charte d’utilisation, Licences d’utilisation) ? 
Volet «Cyber-carothèque nationale» 
=> ENTREPOTS DATA 
=> LIMS 
Concept du « LIMS » 
Laboratory Information management system 
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ETAT ACTUEL : saturation (17km carottes) Dép. Géosciences Marines et Environ. Littoral 
Tech. ou chercheurs gèrent archivage (+/- libre-service)  BGMN  BGMB v1 
PROJET: stockage pour 20/30ans IFREMER+SHOM  lancement de la construction en Janv. 2015 - lithothèque roches (20°C) = 700 m2 - carothèque (4°C)=450m2  76.000étuisx1m= 38km  € : 50% Région Bretagne + 10% SHOM + 40% IFREMER PROJET GESTION / CURATION 
Inventaire précis pour le futur déménagement 
Accès contrôlé (Poste avec profil « curateur »)  Outils numérique 2014-2015 : - Particip. «Portail commun Cyber-carothèque» - Develop. Logiciels embarqués Casino+ & Sealog (méta(données) depuis la campagne à la mer) - Restructration BD BGMB v2 
Banque de Géologie Marine Nationale BD BGMB 
BD BGMN (2000) (ex Base BRGM) 
BD BGMB v1 (2006) - Métadonnées carottes + roches (prélèv. + échantillons) - Montée en base des fichiers d’analyses (DATA) (chimiques, granulo, stratigraph. litholog.) 
CAROTHEQUES PHYSIQUES 
(nouveaux projets) 
BD BGMB v2 (2014) 
-Interface consultation & visualisation 
-Interface saisie des mises à jour (LIMS) 
-Gestion de stocks 
-Diffusion : Dévelop. service web (2015)
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ETAT ACTUEL : saturation (8km carottes) « Plateforme d'analyses automatisées carottes» 
1 IE + 2 TECH. (tps partiel.) 
+/- libre-service (gestion tech. ou chercheur) 
 BD GEOSCIENCES (portail, métadonnées, suivi ) 
PROJET de nouvelle carothèque : 
 Construction en cours => fin2015 - Carothèque (4°C)=100m2 + échantillon sec = 200m²  11.000 étuis x 1,5m= 16km - € : Plan Campus Université de Bordeaux GESTION / CURATION  Inventaire précis pour le futur déménagement  Accès contrôlé via ITA de la Plateforme  Outils numérique (OASU + CLIMCOR/C2FN) 2014 : « Cyber-carothèque nationale » (nb : Cyber-Caroth. DEMO sur architecture «BD GEOSCIENCES » ) 2015? Outils de gestion plus fin (C2FN, OASU ?) BD GEOSCIENCES -Organiser, centraliser et pérenniser les DONNEES paléoclimat (MySQL) -Géolocalisation carottes (ArcGIS) > BD Carothèque Géosciences (Carottes) (PaléoClimat v2) 2013: - Portail géoloc. des carottes (GoogleMaps API) - Organiser, centraliser et pérenniser les métadonnées - Accès à les fichiers de données (personnels UMR) - Fichier de traçabilité analytique sur une carotte -Proto Gestion stock (localisation dans les caves) 
CAROTHEQUES PHYSIQUES 
(nouveaux projets) 
> BD PaléoClimat v0,v1 (DATA)
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Dir. Denis-Didier Rousseau (denis.rousseau@lmd.ens.fr), Dir. Adj. Michel Calzas 
(michel.calzas@dt.insu.cnrs.fr) 
En Paléosciences 
intra-labo, inter-labo, inter-instituts ou inter-organismes 
-Faible informations des prélèvements (à la source) 
-Difficulté gestion des stocks d’échantillons 
-Difficulté de suivi des actions analytiques et de synthèse 
-Faible gestion des données (plateformes et/ou projets) 
-Pas de partage d’informations (métadonnées) 
Question des prélèvements et échantillons (CURATION) 
N’a JAMAIS été TRAITÉE dans sa GLOBALITÉ parce qu'elle NE PEUT 
PAS ETRE TRAITEE à l’échelon d’un seul laboratoire 
CAROTTES MUTUALISEES + ACTIONS MULTI-PARTENAIRES 
Volet «Cyber-carothèque nationale» 
SYNTHESE DES CONSTATS en France 
A quel grain faudrait-il traiter cette question ? 
= 
RUPTURES FLUX D’INFORMATION 
DANS LES WORK & DATAFLOW 
 LE WORK & DATAFLOW est GLOBAL & NATIONAL
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La Cyber-carothèque 
Nationale = 
Projet inter-organismes ? 
 via des procédures de curation et un outil adapté 
CO-PILOTAGE 
Coordination de projet 
Cécile PIGNOL- Resp. plateau tech. sédimentologie , Géomaticienne EDYTEM – Université de Savoie Mont-Blanc 
Chefs projet Informatique 
Arnaud CAILLO- Resp. Sys. Informations – OASU – EPOC 
Karim BERNARDET- Resp. Sys Informations –DT INSU (soutien C2FN) 
EQUIPE PROJET « Curation » créée en mars 2014 
COORDINATION SCIENTIFIQUE 
MARIN Xavier CROSTA - CNRS INSU 
Participation - Bernard DENNIELOU, Gilbert MAUDUIRE - IFREMER 
- Eva MORENO (Muséum / Collection ) - MNHN 
GLACE Jérôme CHAPPELLAZ - CNRS INSU (+ Curateur LGGE, G TESTE) 
CONTINENT Fabien ARNAUD - CNRS INEE + Co-Pil « WP Climcor-Continent » 
Développement Informatique 
Elodie GODINHO- Dev. Informatique, DT INSU 
Arnaud CAILLO- Dev. Informatique - OASU – EPOC 
Extraction inventaire BD existantes 
Lola Johannes (MNHN) - Vanessa TOSELLO (SISMER – IFREMER), C PIGNOL (EDYTEM) 
Direction Denis-Didier Rousseau – Dir-Adj : Michel Calzas 
Volet «Cyber-carothèque nationale» 
COMMENT organiser le circuit de collecte & diffusion des métadonnées ? 
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HISTORIQUE 
Portail national Inter-organismes 
CNRS – IFREMER – MNHN – INRA 
La cyber-carothèque nationale 
Une BD modulaire en plusieurs phases 
PHASE 3 : Système de gestion d’info. de laboratoire (LIMS) 
Métadonnées d’analyse 
(quels échantillons, quelles analyses, dispo. du matériel etc.) 
PHASE 2 : Rapport de mission «carottage» en ligne 
Métadonnées de sondage 
(détails des opérations, localisation, noms des carottes etc.) 
Outils à développer 
PHASE 1 
INVENTAIRES (LEGACY) 
LABOS 
LABOS 
LABOS 
Volet «Cyber-carothèque nationale» 
Outil important à développer 
qu’attendent 
les labos 
GESTION STOCK 
Inter-labo 
AVENIR
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http://www.climcor-cyber.fr/cores/ 
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PHASE 1 2014 : Maquette du PORTAIL NATIONAL COMMUN 
en cours depuis mai 2014 
1- GESTION DU LEGACY : Récolte/import des inventaires - recommandée si BD existante dans un labo, - appuis sur le réseau Zones Ateliers INEE «Projet Inter-ZA Archives Sed.»2014 - sinon, du cas par cas 
2- CONSULTATION des metadonnées via la maquette Cyber-carothèque (livr. Nov2015) - Consultation des missions, points de carottage, sections, analyses - Requête simples sur métadonnées 
1er Trim2015 : Validation de la démarche INTER-ORGANISMES 
(CNRS – MNHN – IFREMER – IPEV – INRA – IRD) 
Carotte (Métadonnées mini) 
Nom mission 
Nom carotte 
Chef de mission 
Site - Lac 
Année 
Nb sections 
LATITUDE 
LONGITUDE 
Profondeur bathy 
Longueur totale 
Localisation_archive 
Localisation_travail 
Pi 1 – PI 2 
…/… 
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Qualité 
-Vérification de la qualité des inventaires existants 
-Aider les laboratoires à mettre en oeuvre leur inventaire => protocole (ex : prochainement assistance à ISEM Montpellier M-P LEDRU) 
PHASE 1 : LIMITES ACTUELLES (-> Consolidation 2015) 
Volet «Cyber-carothèque nationale» 
Homogénéisation des vocabulaires  Thésaurus 
un travail collectif d’harmonistation Engins de forage (en cours), Campagne ou Mission, Analyses, … 
COMMENT ? 
Réunir les communautés en groupe de travail Com. Continent = support Co-Pil Climcor, Com. Marines => ?  Table ronde ? Journées Paléocéano, Brest au printemps , Fev2014  Proposer Atelier / Session « Open-data », ASF 2015 (Nov.) à Chambéry 
Mise en oeuvre des ID existants  SESAR, ORCID, ISNI
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PHASE 2 : OBJECTIF 2015 
1- Dévelop. des modules «Rapport de mission carottage»  TRACABILITE histoire du prélèvement : - Applications synchronisables, type « carnet terrain électronique » - Archivage métadonnées de carottage & données brutes (Photos, données in-situ,….) - Intérop. INSPIRE, Publication annuelle des RM (DOI) à minima pour missions C2FN - Codification syst. des carottes SESAR–IGSN + Localisation du répository d’accueil - Visibilité internationale 
CONTINENT 
MARIN 
GLACE 
RM sur le modèle actuel EDYTEM 
=> 2015 
UMS FLOTTES 
IPEV / IFREMER ? 
En cours 
LGGE 
LSCE-CEREGE 
A préciser ! 
AVANTAGES 
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DT INSU 
RAPPORT MISSION 
CAROTTAGE 
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MARIN 
« Rapport de campagne » (UMS FLOTTE / IFREMER) 
Rapport de « mission de carottage » (Métadonnées) MARION-DUF. IPEV FLOTTE IFREMER FLOTTE INSU 
MAIS la démarche reste inhérente à : 
- VALIDATION DEMARCHE PORTAIL COMMUN INTER-ORGANISMES 
- REUNION DES ACTEURS OPERATIONNELS 
X 
METHODE CAPTATION METADONEES 
En cours à l’IPEV (DT INSU-IPEV) 
En cours de dev. Suite logiciel IFREMER 
PHASE 2 (2015) Rapport de mission en ligne (info à la source) 
Versement des métadonnées récoltées dans portail commun Cyber-carothèque 
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Carottage paléoclimatique: Haute Résolution et Innovations 
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Un exemple d’un workflow opérationnel en 2015 
=> Rapport mission OPERATIONS 
(Futur flux de données FLOTTE IFREMER) 
- Récupère les évènements de CASINO+ 
-Permet de gérer les opérations et les échantillons 
CASINO+ 
(cahier de quart électronique) 
SEALOG 
(ex Alamer) 
BDD à terre 
- BGMB v1 
- Autres … 
Connecté aux capteurs du navire 
Permet d’enregistrer, dater et géoréférencer automatiquement les évènements d’une campagne 
Cyber- carothèque nationale
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PHASE 2 & 3 : Nouveaux objectifs 2015 ? 
1-PHASE 2 : Développement des modules «Rapports de mission carottage» 
Cyber-carothèque 
2-PHASE 2 : Développement d’un module «Gestion de stocks» national » 
CONSOLIDATION des inventaires EN COURS => outil de mise à jour des FLUX de carottes 
PREPARATION des MODALITES DE GESTION DE NOUVELLES carothèques (EPOC) … et des autres ? 
 INTERACTION MÉTHODOLOGIQUE ENTRE EPOC&OASU – IFREMER – MNHN – C2FN ? 
3-PHASE 3 : Préparation du PROJET NATIONNAL «E-Infrastructure …» ? 
Dépôt en Octobre 2015 
 Quelles interactions avec les autres réflexions initiées en 2014 ? 
Prospective INSU 2014, 
« Réflexion sur les carothèques marines et la gestion des prélèvements » Frank BASSINOT, Jean-Pierre VALET 
Pôle thématiques / Pole de donnée « Terre Solide » Macia MAIA, Chargée de mission INSU Géosc. marines 
« Démarche concernant l’inventaire des données d’échantillons géologiques et échantillons de roches marines» 
Belmont-Forum "E-Infrastructures and Data Management Collaborative Research Action » 
Jean-Pierre Vilotte, IPGP (SC Co-Lead, Steering Committee) 
22 / 23 
Les carothèques sont pleines, 
les communautés sont au pied du mur, mais elles semblent mures ! 
 Aidons-les à se mobiliser pour l’avenir !
CLIMCOR: paleoCLIMatic CORing: High Resolution and Innovations 
Carottage paléoclimatique: Haute Résolution et Innovations 
http://climcor-equipex.dt.insu.cnrs.fr 
23 
ANR-11-EQPX-0009-CLIMCOR 
Dir. Denis-Didier Rousseau (denis.rousseau@lmd.ens.fr), Dir. Adj. Michel Calzas (michel.calzas@dt.insu.cnrs.fr) 
Volet «Cyber-carothèque nationale» 
Maquette développée et hébergée par EPOC OASU 2014 
=> Transfert pour pérennisation au C2FN via DT INSU (2015) 
2.878 carottes issues de 299 missions 
http://www.climcor-cyber.fr/cores/
CLIMCOR: paleoCLIMatic CORing: High Resolution and Innovations 
Carottage paléoclimatique: Haute Résolution et Innovations 
http://climcor-equipex.dt.insu.cnrs.fr 
24 
ANR-11-EQPX-0009-CLIMCOR 
Dir. Denis-Didier Rousseau (denis.rousseau@lmd.ens.fr), Dir. Adj. Michel Calzas (michel.calzas@dt.insu.cnrs.fr) 
Une architecture semi-distribuée : Interopérabilité 
IHM Usage Privé 
+ Base de Données 
Carothèque Marine 
(EPOC) 
Données 
IHM Usage Privé 
+ Base de Données 
Carothèque Marine 
(MNHM) 
Données 
Métadonnées 
IHM Usage Privé 
+ Base de Données 
Carothèque continentale 
(EDYTEM) 
Données 
IHM Usage Privé 
+ Base de Données 
Carothèque 
AUTRE LABOS 
LGGE 
LSCE, CEREGE, 
CHRONO-ENV… 
IHM Usage Public 
(DT INSU) 
Cyber 
Carothèque 
IHM CNRS 
À développer 
Méta 
Données 
Centralisées 
(INSPIRE) 
Outil centralisé interroge des bases de méta-données délocalisées => données restent dans les labos 
PORTAIL 
en projet 
IHM + Base de Données 
Carothèque Marine 
et/ou terrestre 
(IFREMER) 
Méta 
Données 
Centralisées 
(INSPIRE) 
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  • 1. CLIMCOR: paleoCLIMatic CORing: High Resolution and Innovations Carottage paléoclimatique: Haute Résolution et Innovations http://climcor-equipex.dt.insu.cnrs.fr 1 ANR-11-EQPX-0009-CLIMCOR Dir. Denis-Didier Rousseau (denis.rousseau@lmd.ens.fr), Dir. Adj. Michel Calzas (michel.calzas@dt.insu.cnrs.fr) Portail national des carottages Français « Cyber-carothèque nationale » Quels enjeux pour la gestion conservatoire des carottes sédimentaires et de leurs méta-données ? (maquette démonstrative) **** Présenté par, Cécile Pignol , Coordinateur du projet (IE - Laboratoire EDYTEM – C2FN) Fabien ARNAUD (EDYTEM), Arnaud CAILLO, Xavier CROSTA (EPOC) Elodie GODINHO (DT INSU) Loic PETIT DE LA VILLEON, Vanessa TOSELLO (IFREMER) Eva Moreno (MNHN) **** Colloque RESOMAR, Bordeaux, 24-26 Novembre 2014 Direction Denis-Didier Rousseau – Dir-Adj : Michel - ANR-11-EQPX-0009-CLIMCOR 1 / 23
  • 2. CLIMCOR: paleoCLIMatic CORing: High Resolution and Innovations Carottage paléoclimatique: Haute Résolution et Innovations http://climcor-equipex.dt.insu.cnrs.fr 2 ANR-11-EQPX-0009-CLIMCOR Dir. Denis-Didier Rousseau (denis.rousseau@lmd.ens.fr), Dir. Adj. Michel Calzas (michel.calzas@dt.insu.cnrs.fr) => INITIATIVE TRANSVERSALE AUX 3 WP CLIMCOR « PORTAIL NATIONAL DES CAROTTAGES SCIENTIFIQUES » CAROTTAGES MARINS, CÔTIERS, LACUSTRES, FLUVIAUX, TERRESTRES ADOSSEE AU C2FN Centre national de forage national 2 / 23
  • 3. CLIMCOR: paleoCLIMatic CORing: High Resolution and Innovations Carottage paléoclimatique: Haute Résolution et Innovations http://climcor-equipex.dt.insu.cnrs.fr 3 ANR-11-EQPX-0009-CLIMCOR Dir. Denis-Didier Rousseau (denis.rousseau@lmd.ens.fr), Dir. Adj. Michel Calzas (michel.calzas@dt.insu.cnrs.fr) Dans quel contexte s’inscrit ce projet de Cyber-carothèque ? Volet «Cyber-carothèque nationale» CONTEXTE NATIONAL Retard dans la gestion des prélèvements et échantillons en France Concept de la gestion conservatoire (curation) carottes sédimentaires peut abordé en France CONTEXTE DE LA MONTÉE EN PUISSANCE DE L’OPEN-DATA EN RECHERCHE Incitation à valoriser & pérenniser les (méta)-données de la recherche H2020 CONTEXTE DE MOBILISATION INTERNATIONALE CROISSANTE Projet E-infrastructures innovantes, … au EU et UE BELMONT-FORUM « E-Infrastructures & data management » DESC / EARTHCUBE «Community-led cyberinfrastructure to promote data sharing for Geosciences» SEADATANET «Cyberinfrastructure of data … of the seas and oceans » Portails internationaux de diffusion de métadonnées NOAA/IMLGS - ICDP Diffusion de « bonnes pratiques » de procédures de curating Consortium International des curateurs (16ème meeting, avr 2015, Texas), LaCORE 3 / 23
  • 4. CLIMCOR: paleoCLIMatic CORing: High Resolution and Innovations Carottage paléoclimatique: Haute Résolution et Innovations http://climcor-equipex.dt.insu.cnrs.fr 4 ANR-11-EQPX-0009-CLIMCOR Dir. Denis-Didier Rousseau (denis.rousseau@lmd.ens.fr), Dir. Adj. Michel Calzas (michel.calzas@dt.insu.cnrs.fr) Pourquoi est-ce le bon moment traiter de cette question ? Volet «Cyber-carothèque nationale» SCIENTIFIQUE Accroissement de la mutualisation des prélèvements, des plateformes (demande des chercheurs & des financeurs) Besoin d’accompagnement labos français, mise en oeuvre d’actions de curation INSTITUTIONNEL Cadre règlementaire français (Directive INSPIRE) obligatoire 2017 Cadre incitatif (H2020) pour le Libre Accès aux données de la recherche Open Research Data, en préconisant la définition préalable de Plan Management Données TECHNIQUES Moyens technologiques (BDr, interopérabilité, webservice, Persitant ID) OPERATIONEL Nouveaux investissements -Moyens de forages (Equipex Climcor) -Saturation, agrandis. / modernisation ou transfert de carothèques physiques (EPOC, IFREMER, EDYTEM, CHRONO-ENVIRON.)  OUVRE DE NOUVELLES PERSPECTIVES ET APPROCHES DMP 6 concepts fondamentaux qui déterminent l’ organisation - de la collecte - du traitement - de l’analyse - de La Conservation - de L’ accès / Diffusion - de la réutilisation
  • 5. CLIMCOR: paleoCLIMatic CORing: High Resolution and Innovations Carottage paléoclimatique: Haute Résolution et Innovations http://climcor-equipex.dt.insu.cnrs.fr 5 ANR-11-EQPX-0009-CLIMCOR Dir. Denis-Didier Rousseau (denis.rousseau@lmd.ens.fr), Dir. Adj. Michel Calzas (michel.calzas@dt.insu.cnrs.fr) DONNÉES EN RECHERCHE => Plus on descend vers la base de la pyramide, plus il est difficile d'établir un lien entre les articles, les données sous-jacentes Données publiées dans les articles scientifiques représentent seulement la « partie émergée de l'iceberg » du BIG DATA Rôle du scientifique : Dataset associées aux publis => WDC : PANGAEA – NOAA Volet «Cyber-carothèque nationale» et les prélèvements VISIBILITE
  • 6. CLIMCOR: paleoCLIMatic CORing: High Resolution and Innovations Carottage paléoclimatique: Haute Résolution et Innovations http://climcor-equipex.dt.insu.cnrs.fr 6 ANR-11-EQPX-0009-CLIMCOR Dir. Denis-Didier Rousseau (denis.rousseau@lmd.ens.fr), Dir. Adj. Michel Calzas (michel.calzas@dt.insu.cnrs.fr) POURQUOI IL NE FAUT NEGLIGER CE PROJET ? PRELEVEMENTS – ECHANTILLONS (BD Cyber-carothèque) Rôle du scientifique : Dataset associées aux publis => WDC : PANGAEA – NOAA PLAN MANAG. DATA (DMP) – H2020 Données publiées dans les articles scientifiques représentent seulement la « partie émergée de l'iceberg » du BIG DATA Volet «Cyber-carothèque nationale» La curation des ech. = un des SOCLES d’un futur DMP en PALEOSCIENCES ? VISIBILITE
  • 7. CLIMCOR: paleoCLIMatic CORing: High Resolution and Innovations Carottage paléoclimatique: Haute Résolution et Innovations http://climcor-equipex.dt.insu.cnrs.fr 7 ANR-11-EQPX-0009-CLIMCOR Dir. Denis-Didier Rousseau (denis.rousseau@lmd.ens.fr), Dir. Adj. Michel Calzas (michel.calzas@dt.insu.cnrs.fr) 7 / 23 COMMENT ABORDER LA GESTION CONSERVATOIRE (CURATION) DES CAROTTES SÉDIMENTAIRES ? Volet «Cyber-carothèque nationale» PRELEVEMENTS Rapport Mission carottage DONNEES METADONNEES EN N’OMETTANT AUCUN DES 3 FLUX RELIANT LES 3 POLES COMPOSANT LA CURATION (CAROTTES SEDIMENTAIRES) EN STRUCTURANT LES 3 POLES COMPOSANT LA CURATION (CAROTTES SEDIMENTAIRES)
  • 8. CLIMCOR: paleoCLIMatic CORing: High Resolution and Innovations Carottage paléoclimatique: Haute Résolution et Innovations http://climcor-equipex.dt.insu.cnrs.fr 8 ANR-11-EQPX-0009-CLIMCOR Dir. Denis-Didier Rousseau (denis.rousseau@lmd.ens.fr), Dir. Adj. Michel Calzas (michel.calzas@dt.insu.cnrs.fr) 1. De portails internationaux existants IMLGS (NOAA) « Index to marine and lacustrine Geological Samples» ICDP / GESEP « Virtual core repository » IODP – D.I.S «Syst. d’information des données de carottages » EXPERIENCES & PROJETS INTERNATIONAUX 2. Identifiants pérennes internationaux opérationnels (Persitant ID) - PID des publications ou jeux de données DOI, ARK - Le système international de référencement des échantillons DESC/SESAR-IGSN (International GeoSample Number) - PID des chercheurs ORCIDRESEARCH ID - PID institutions ISNI IGSN : EDY-LDB14P1 Volet «Cyber-carothèque nationale» 8 / 23
  • 9. CLIMCOR: paleoCLIMatic CORing: High Resolution and Innovations Carottage paléoclimatique: Haute Résolution et Innovations http://climcor-equipex.dt.insu.cnrs.fr 9 ANR-11-EQPX-0009-CLIMCOR Dir. Denis-Didier Rousseau (denis.rousseau@lmd.ens.fr), Dir. Adj. Michel Calzas (michel.calzas@dt.insu.cnrs.fr) Des projets historiques…. Carothèque nat. physique (anciens projets CALIFF, JURA) Depuis quelques années => proto- cartothèques virtuelles CONTEXTE NATIONAL : Identification des labos gérant des carothèques Initiatives de BDr locales, inégales et toujours non- coordonnées -MNHN – BG GEOCORES (v2) -EPOC – BD GEOSCIENCES (v2) -IFREMER – BD BGMB (v2) -LGGE – BD EPICA (v2) -EDYTEM – BDD EDYTEM (v1) … ailleurs, des listes xls, +/- à jour Volet «Cyber-carothèque nationale» 9 / 23 Nice
  • 10. CLIMCOR: paleoCLIMatic CORing: High Resolution and Innovations Carottage paléoclimatique: Haute Résolution et Innovations http://climcor-equipex.dt.insu.cnrs.fr 10 ANR-11-EQPX-0009-CLIMCOR Dir. Denis-Didier Rousseau (denis.rousseau@lmd.ens.fr), Dir. Adj. Michel Calzas (michel.calzas@dt.insu.cnrs.fr) 10 / 23 LES BESOINS IDENTIFIES A quelles questions le système d’information devrait répondre ? Niv 1 : (niveau d’information d’INSPIRE) - Historique de la prise de la carotte (mission) : qui, pour qui (PI), ou, comment (Logistique, techniques), pourquoi (objectifs scientifiques) => RAPPORT MISSION Carottage - Où se trouve l’objet physique ? => GESTION DE STOCKS Niv2 : - Puis-je échantillonner (reste-t-il du sédiment …), qui contacter ? - Suivi analytique : Qu’est-ce qui a déjà été fait sur ce prélèvement : Quels types de données existe-t-il ? (acquisition routines, analyses spécifiques) Niv3 : - Niveau de la donnée existante (brute, nettoyée ) et la qualité de la données (Protocoles, paramètres …) ? - Comment retrouver les données à long terme (accès, partage, embargo, …), - Comment la ré-utiliser (Charte d’utilisation, Licences d’utilisation) ? Volet «Cyber-carothèque nationale» Concept du « LIMS » Laboratory Information management system => ENTREPOTS DATA => LIMS
  • 11. CLIMCOR: paleoCLIMatic CORing: High Resolution and Innovations Carottage paléoclimatique: Haute Résolution et Innovations http://climcor-equipex.dt.insu.cnrs.fr 11 ANR-11-EQPX-0009-CLIMCOR Dir. Denis-Didier Rousseau (denis.rousseau@lmd.ens.fr), Dir. Adj. Michel Calzas (michel.calzas@dt.insu.cnrs.fr) LES BESOINS IDENTIFIES A quelles questions le système d’information devrait répondre ? Niv 1 : (niveau d’information d’INSPIRE) - Historique de la prise de la carotte (mission) : qui, pour qui (PI), ou, comment (Logistique, techniques), pourquoi (objectifs scientifiques) => RAPPORT MISSION Carottage - Où se trouve l’objet physique ? => GESTION DE STOCKS Niv2 : - Puis-je échantillonner (reste-t-il du sédiment …), qui contacter ? - Suivi analytique : Qu’est-ce qui a déjà été fait sur ce prélèvement : Quels types de données existe-t-il ? (acquisition routines, analyses spécifiques) Niv3 : - Niveau de la donnée existante (brute, nettoyée ) et la qualité de la données (Protocoles, paramètres …) ? - Comment retrouver les données à long terme (accès, partage, embargo, …), - Comment la ré-utiliser (Charte d’utilisation, Licences d’utilisation) ? Volet «Cyber-carothèque nationale» => ENTREPOTS DATA => LIMS Concept du « LIMS » Laboratory Information management system 10 / 23
  • 12. CLIMCOR: paleoCLIMatic CORing: High Resolution and Innovations Carottage paléoclimatique: Haute Résolution et Innovations http://climcor-equipex.dt.insu.cnrs.fr 12 ANR-11-EQPX-0009-CLIMCOR Dir. Denis-Didier Rousseau (denis.rousseau@lmd.ens.fr), Dir. Adj. Michel Calzas (michel.calzas@dt.insu.cnrs.fr) ETAT ACTUEL : saturation (17km carottes) Dép. Géosciences Marines et Environ. Littoral Tech. ou chercheurs gèrent archivage (+/- libre-service)  BGMN  BGMB v1 PROJET: stockage pour 20/30ans IFREMER+SHOM  lancement de la construction en Janv. 2015 - lithothèque roches (20°C) = 700 m2 - carothèque (4°C)=450m2  76.000étuisx1m= 38km  € : 50% Région Bretagne + 10% SHOM + 40% IFREMER PROJET GESTION / CURATION Inventaire précis pour le futur déménagement Accès contrôlé (Poste avec profil « curateur »)  Outils numérique 2014-2015 : - Particip. «Portail commun Cyber-carothèque» - Develop. Logiciels embarqués Casino+ & Sealog (méta(données) depuis la campagne à la mer) - Restructration BD BGMB v2 Banque de Géologie Marine Nationale BD BGMB BD BGMN (2000) (ex Base BRGM) BD BGMB v1 (2006) - Métadonnées carottes + roches (prélèv. + échantillons) - Montée en base des fichiers d’analyses (DATA) (chimiques, granulo, stratigraph. litholog.) CAROTHEQUES PHYSIQUES (nouveaux projets) BD BGMB v2 (2014) -Interface consultation & visualisation -Interface saisie des mises à jour (LIMS) -Gestion de stocks -Diffusion : Dévelop. service web (2015)
  • 13. CLIMCOR: paleoCLIMatic CORing: High Resolution and Innovations Carottage paléoclimatique: Haute Résolution et Innovations http://climcor-equipex.dt.insu.cnrs.fr 13 ANR-11-EQPX-0009-CLIMCOR Dir. Denis-Didier Rousseau (denis.rousseau@lmd.ens.fr), Dir. Adj. Michel Calzas (michel.calzas@dt.insu.cnrs.fr) ETAT ACTUEL : saturation (8km carottes) « Plateforme d'analyses automatisées carottes» 1 IE + 2 TECH. (tps partiel.) +/- libre-service (gestion tech. ou chercheur)  BD GEOSCIENCES (portail, métadonnées, suivi ) PROJET de nouvelle carothèque :  Construction en cours => fin2015 - Carothèque (4°C)=100m2 + échantillon sec = 200m²  11.000 étuis x 1,5m= 16km - € : Plan Campus Université de Bordeaux GESTION / CURATION  Inventaire précis pour le futur déménagement  Accès contrôlé via ITA de la Plateforme  Outils numérique (OASU + CLIMCOR/C2FN) 2014 : « Cyber-carothèque nationale » (nb : Cyber-Caroth. DEMO sur architecture «BD GEOSCIENCES » ) 2015? Outils de gestion plus fin (C2FN, OASU ?) BD GEOSCIENCES -Organiser, centraliser et pérenniser les DONNEES paléoclimat (MySQL) -Géolocalisation carottes (ArcGIS) > BD Carothèque Géosciences (Carottes) (PaléoClimat v2) 2013: - Portail géoloc. des carottes (GoogleMaps API) - Organiser, centraliser et pérenniser les métadonnées - Accès à les fichiers de données (personnels UMR) - Fichier de traçabilité analytique sur une carotte -Proto Gestion stock (localisation dans les caves) CAROTHEQUES PHYSIQUES (nouveaux projets) > BD PaléoClimat v0,v1 (DATA)
  • 14. CLIMCOR: paleoCLIMatic CORing: High Resolution and Innovations Carottage paléoclimatique: Haute Résolution et Innovations http://climcor-equipex.dt.insu.cnrs.fr 14 ANR-11-EQPX-0009-CLIMCOR Dir. Denis-Didier Rousseau (denis.rousseau@lmd.ens.fr), Dir. Adj. Michel Calzas (michel.calzas@dt.insu.cnrs.fr) En Paléosciences intra-labo, inter-labo, inter-instituts ou inter-organismes -Faible informations des prélèvements (à la source) -Difficulté gestion des stocks d’échantillons -Difficulté de suivi des actions analytiques et de synthèse -Faible gestion des données (plateformes et/ou projets) -Pas de partage d’informations (métadonnées) Question des prélèvements et échantillons (CURATION) N’a JAMAIS été TRAITÉE dans sa GLOBALITÉ parce qu'elle NE PEUT PAS ETRE TRAITEE à l’échelon d’un seul laboratoire CAROTTES MUTUALISEES + ACTIONS MULTI-PARTENAIRES Volet «Cyber-carothèque nationale» SYNTHESE DES CONSTATS en France A quel grain faudrait-il traiter cette question ? = RUPTURES FLUX D’INFORMATION DANS LES WORK & DATAFLOW  LE WORK & DATAFLOW est GLOBAL & NATIONAL
  • 15. CLIMCOR: paleoCLIMatic CORing: High Resolution and Innovations Carottage paléoclimatique: Haute Résolution et Innovations http://climcor-equipex.dt.insu.cnrs.fr 15 ANR-11-EQPX-0009-CLIMCOR Dir. Denis-Didier Rousseau (denis.rousseau@lmd.ens.fr), Dir. Adj. Michel Calzas (michel.calzas@dt.insu.cnrs.fr) La Cyber-carothèque Nationale = Projet inter-organismes ?  via des procédures de curation et un outil adapté CO-PILOTAGE Coordination de projet Cécile PIGNOL- Resp. plateau tech. sédimentologie , Géomaticienne EDYTEM – Université de Savoie Mont-Blanc Chefs projet Informatique Arnaud CAILLO- Resp. Sys. Informations – OASU – EPOC Karim BERNARDET- Resp. Sys Informations –DT INSU (soutien C2FN) EQUIPE PROJET « Curation » créée en mars 2014 COORDINATION SCIENTIFIQUE MARIN Xavier CROSTA - CNRS INSU Participation - Bernard DENNIELOU, Gilbert MAUDUIRE - IFREMER - Eva MORENO (Muséum / Collection ) - MNHN GLACE Jérôme CHAPPELLAZ - CNRS INSU (+ Curateur LGGE, G TESTE) CONTINENT Fabien ARNAUD - CNRS INEE + Co-Pil « WP Climcor-Continent » Développement Informatique Elodie GODINHO- Dev. Informatique, DT INSU Arnaud CAILLO- Dev. Informatique - OASU – EPOC Extraction inventaire BD existantes Lola Johannes (MNHN) - Vanessa TOSELLO (SISMER – IFREMER), C PIGNOL (EDYTEM) Direction Denis-Didier Rousseau – Dir-Adj : Michel Calzas Volet «Cyber-carothèque nationale» COMMENT organiser le circuit de collecte & diffusion des métadonnées ? 15 / 23
  • 16. CLIMCOR: paleoCLIMatic CORing: High Resolution and Innovations Carottage paléoclimatique: Haute Résolution et Innovations http://climcor-equipex.dt.insu.cnrs.fr 16 ANR-11-EQPX-0009-CLIMCOR Dir. Denis-Didier Rousseau (denis.rousseau@lmd.ens.fr), Dir. Adj. Michel Calzas (michel.calzas@dt.insu.cnrs.fr) HISTORIQUE Portail national Inter-organismes CNRS – IFREMER – MNHN – INRA La cyber-carothèque nationale Une BD modulaire en plusieurs phases PHASE 3 : Système de gestion d’info. de laboratoire (LIMS) Métadonnées d’analyse (quels échantillons, quelles analyses, dispo. du matériel etc.) PHASE 2 : Rapport de mission «carottage» en ligne Métadonnées de sondage (détails des opérations, localisation, noms des carottes etc.) Outils à développer PHASE 1 INVENTAIRES (LEGACY) LABOS LABOS LABOS Volet «Cyber-carothèque nationale» Outil important à développer qu’attendent les labos GESTION STOCK Inter-labo AVENIR
  • 17. CLIMCOR: paleoCLIMatic CORing: High Resolution and Innovations Carottage paléoclimatique: Haute Résolution et Innovations http://climcor-equipex.dt.insu.cnrs.fr 17 ANR-11-EQPX-0009-CLIMCOR Dir. Denis-Didier Rousseau (denis.rousseau@lmd.ens.fr), Dir. Adj. Michel Calzas (michel.calzas@dt.insu.cnrs.fr) http://www.climcor-cyber.fr/cores/ /28 PHASE 1 2014 : Maquette du PORTAIL NATIONAL COMMUN en cours depuis mai 2014 1- GESTION DU LEGACY : Récolte/import des inventaires - recommandée si BD existante dans un labo, - appuis sur le réseau Zones Ateliers INEE «Projet Inter-ZA Archives Sed.»2014 - sinon, du cas par cas 2- CONSULTATION des metadonnées via la maquette Cyber-carothèque (livr. Nov2015) - Consultation des missions, points de carottage, sections, analyses - Requête simples sur métadonnées 1er Trim2015 : Validation de la démarche INTER-ORGANISMES (CNRS – MNHN – IFREMER – IPEV – INRA – IRD) Carotte (Métadonnées mini) Nom mission Nom carotte Chef de mission Site - Lac Année Nb sections LATITUDE LONGITUDE Profondeur bathy Longueur totale Localisation_archive Localisation_travail Pi 1 – PI 2 …/… Volet «Cyber-carothèque nationale»
  • 18. CLIMCOR: paleoCLIMatic CORing: High Resolution and Innovations Carottage paléoclimatique: Haute Résolution et Innovations http://climcor-equipex.dt.insu.cnrs.fr 18 ANR-11-EQPX-0009-CLIMCOR Dir. Denis-Didier Rousseau (denis.rousseau@lmd.ens.fr), Dir. Adj. Michel Calzas (michel.calzas@dt.insu.cnrs.fr) Qualité -Vérification de la qualité des inventaires existants -Aider les laboratoires à mettre en oeuvre leur inventaire => protocole (ex : prochainement assistance à ISEM Montpellier M-P LEDRU) PHASE 1 : LIMITES ACTUELLES (-> Consolidation 2015) Volet «Cyber-carothèque nationale» Homogénéisation des vocabulaires  Thésaurus un travail collectif d’harmonistation Engins de forage (en cours), Campagne ou Mission, Analyses, … COMMENT ? Réunir les communautés en groupe de travail Com. Continent = support Co-Pil Climcor, Com. Marines => ?  Table ronde ? Journées Paléocéano, Brest au printemps , Fev2014  Proposer Atelier / Session « Open-data », ASF 2015 (Nov.) à Chambéry Mise en oeuvre des ID existants  SESAR, ORCID, ISNI
  • 19. CLIMCOR: paleoCLIMatic CORing: High Resolution and Innovations Carottage paléoclimatique: Haute Résolution et Innovations http://climcor-equipex.dt.insu.cnrs.fr 19 ANR-11-EQPX-0009-CLIMCOR Dir. Denis-Didier Rousseau (denis.rousseau@lmd.ens.fr), Dir. Adj. Michel Calzas (michel.calzas@dt.insu.cnrs.fr) PHASE 2 : OBJECTIF 2015 1- Dévelop. des modules «Rapport de mission carottage»  TRACABILITE histoire du prélèvement : - Applications synchronisables, type « carnet terrain électronique » - Archivage métadonnées de carottage & données brutes (Photos, données in-situ,….) - Intérop. INSPIRE, Publication annuelle des RM (DOI) à minima pour missions C2FN - Codification syst. des carottes SESAR–IGSN + Localisation du répository d’accueil - Visibilité internationale CONTINENT MARIN GLACE RM sur le modèle actuel EDYTEM => 2015 UMS FLOTTES IPEV / IFREMER ? En cours LGGE LSCE-CEREGE A préciser ! AVANTAGES Volet «Cyber-carothèque nationale» DT INSU RAPPORT MISSION CAROTTAGE 19 / 23
  • 20. CLIMCOR: paleoCLIMatic CORing: High Resolution and Innovations Carottage paléoclimatique: Haute Résolution et Innovations http://climcor-equipex.dt.insu.cnrs.fr 20 ANR-11-EQPX-0009-CLIMCOR Dir. Denis-Didier Rousseau (denis.rousseau@lmd.ens.fr), Dir. Adj. Michel Calzas (michel.calzas@dt.insu.cnrs.fr) MARIN « Rapport de campagne » (UMS FLOTTE / IFREMER) Rapport de « mission de carottage » (Métadonnées) MARION-DUF. IPEV FLOTTE IFREMER FLOTTE INSU MAIS la démarche reste inhérente à : - VALIDATION DEMARCHE PORTAIL COMMUN INTER-ORGANISMES - REUNION DES ACTEURS OPERATIONNELS X METHODE CAPTATION METADONEES En cours à l’IPEV (DT INSU-IPEV) En cours de dev. Suite logiciel IFREMER PHASE 2 (2015) Rapport de mission en ligne (info à la source) Versement des métadonnées récoltées dans portail commun Cyber-carothèque 20 / 23
  • 21. CLIMCOR: paleoCLIMatic CORing: High Resolution and Innovations Carottage paléoclimatique: Haute Résolution et Innovations http://climcor-equipex.dt.insu.cnrs.fr 21 ANR-11-EQPX-0009-CLIMCOR Dir. Denis-Didier Rousseau (denis.rousseau@lmd.ens.fr), Dir. Adj. Michel Calzas (michel.calzas@dt.insu.cnrs.fr) 21 / 23 Un exemple d’un workflow opérationnel en 2015 => Rapport mission OPERATIONS (Futur flux de données FLOTTE IFREMER) - Récupère les évènements de CASINO+ -Permet de gérer les opérations et les échantillons CASINO+ (cahier de quart électronique) SEALOG (ex Alamer) BDD à terre - BGMB v1 - Autres … Connecté aux capteurs du navire Permet d’enregistrer, dater et géoréférencer automatiquement les évènements d’une campagne Cyber- carothèque nationale
  • 22. CLIMCOR: paleoCLIMatic CORing: High Resolution and Innovations Carottage paléoclimatique: Haute Résolution et Innovations http://climcor-equipex.dt.insu.cnrs.fr 22 ANR-11-EQPX-0009-CLIMCOR Dir. Denis-Didier Rousseau (denis.rousseau@lmd.ens.fr), Dir. Adj. Michel Calzas (michel.calzas@dt.insu.cnrs.fr) PHASE 2 & 3 : Nouveaux objectifs 2015 ? 1-PHASE 2 : Développement des modules «Rapports de mission carottage» Cyber-carothèque 2-PHASE 2 : Développement d’un module «Gestion de stocks» national » CONSOLIDATION des inventaires EN COURS => outil de mise à jour des FLUX de carottes PREPARATION des MODALITES DE GESTION DE NOUVELLES carothèques (EPOC) … et des autres ?  INTERACTION MÉTHODOLOGIQUE ENTRE EPOC&OASU – IFREMER – MNHN – C2FN ? 3-PHASE 3 : Préparation du PROJET NATIONNAL «E-Infrastructure …» ? Dépôt en Octobre 2015  Quelles interactions avec les autres réflexions initiées en 2014 ? Prospective INSU 2014, « Réflexion sur les carothèques marines et la gestion des prélèvements » Frank BASSINOT, Jean-Pierre VALET Pôle thématiques / Pole de donnée « Terre Solide » Macia MAIA, Chargée de mission INSU Géosc. marines « Démarche concernant l’inventaire des données d’échantillons géologiques et échantillons de roches marines» Belmont-Forum "E-Infrastructures and Data Management Collaborative Research Action » Jean-Pierre Vilotte, IPGP (SC Co-Lead, Steering Committee) 22 / 23 Les carothèques sont pleines, les communautés sont au pied du mur, mais elles semblent mures !  Aidons-les à se mobiliser pour l’avenir !
  • 23. CLIMCOR: paleoCLIMatic CORing: High Resolution and Innovations Carottage paléoclimatique: Haute Résolution et Innovations http://climcor-equipex.dt.insu.cnrs.fr 23 ANR-11-EQPX-0009-CLIMCOR Dir. Denis-Didier Rousseau (denis.rousseau@lmd.ens.fr), Dir. Adj. Michel Calzas (michel.calzas@dt.insu.cnrs.fr) Volet «Cyber-carothèque nationale» Maquette développée et hébergée par EPOC OASU 2014 => Transfert pour pérennisation au C2FN via DT INSU (2015) 2.878 carottes issues de 299 missions http://www.climcor-cyber.fr/cores/
  • 24. CLIMCOR: paleoCLIMatic CORing: High Resolution and Innovations Carottage paléoclimatique: Haute Résolution et Innovations http://climcor-equipex.dt.insu.cnrs.fr 24 ANR-11-EQPX-0009-CLIMCOR Dir. Denis-Didier Rousseau (denis.rousseau@lmd.ens.fr), Dir. Adj. Michel Calzas (michel.calzas@dt.insu.cnrs.fr) Une architecture semi-distribuée : Interopérabilité IHM Usage Privé + Base de Données Carothèque Marine (EPOC) Données IHM Usage Privé + Base de Données Carothèque Marine (MNHM) Données Métadonnées IHM Usage Privé + Base de Données Carothèque continentale (EDYTEM) Données IHM Usage Privé + Base de Données Carothèque AUTRE LABOS LGGE LSCE, CEREGE, CHRONO-ENV… IHM Usage Public (DT INSU) Cyber Carothèque IHM CNRS À développer Méta Données Centralisées (INSPIRE) Outil centralisé interroge des bases de méta-données délocalisées => données restent dans les labos PORTAIL en projet IHM + Base de Données Carothèque Marine et/ou terrestre (IFREMER) Méta Données Centralisées (INSPIRE) Données BGMB (IFREMER) BDSS1 (SHOM) SHOM Volet «Cyber-carothèque nationale» Portail Nationaux Pause-café RESOMAR 26/11/2014 : Démonstration de la MAQUETTE + Schéma « Architecture »