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![Java
package comptagealanines;
public class Main {
public static void main(String[] args) {
String sequence = "GWGAWILAGAGA";
int nombre_ala = 0 ;
for (int i = 0 ; i < sequence.length(); i++ ){
if (sequence.charAt( i ) == 'A'){
nombre_ala = nombre_ala + 1;
}
}
System.out.println(nombre_ala);
}
}](https://image.slidesharecdn.com/introductionprogrammation-100901104746-phpapp02/85/Introduction-a-la-programmation-22-320.jpg)
![Javascript
<script>
var sequence = "GWGAWILAGAGA";
var nombre_ala = 0;
for(i=0; i<sequence.length; i++) {
if(sequence[i].toUpperCase() == "A") {
nombre_ala = nombre_ala + 1;
}
}
window.alert("Nombre de A : " + nombre_ala);
</script>](https://image.slidesharecdn.com/introductionprogrammation-100901104746-phpapp02/85/Introduction-a-la-programmation-24-320.jpg)
![PHP
<?php
$sequence = "GWGAWILAGAGA";
$nombre_ala = 0;
for($i=0; $i<strlen($sequence); $i++) {
if(strtoupper($sequence[$i]) == "A") {
$nombre_ala = $nombre_ala + 1;
}
}
echo "Nombre de A : ".$nombre_ala;
?>](https://image.slidesharecdn.com/introductionprogrammation-100901104746-phpapp02/85/Introduction-a-la-programmation-25-320.jpg)
![C#
using System;
using System.Collections.Generic;
using System.Linq;
using System.Text;
namespace ConsoleApplication1
{
class Program
{
static void Main(string[] args)
{
string sequence = "GWGAWILAGAGA";
int nombre_ala = 0;
for (int i = 0; i < sequence.Length; i++)
{
if (sequence[i].ToString().ToUpper() == "A")
{
nombre_ala = nombre_ala + 1;
}
}
Console.WriteLine("Nombre de A : " + nombre_ala.ToString());
}
}
}](https://image.slidesharecdn.com/introductionprogrammation-100901104746-phpapp02/85/Introduction-a-la-programmation-26-320.jpg)
Introduction à la programmation
- 1. Introduction à la programmation Pierre Poulain pierre.poulain@univ-paris-diderot.fr 09/2011
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- 9. Combien y a-t-ild'alanines dans cette protéine ? GWGAWILAGAGA
- 10. Combien y a-t-ild'alanines dans cette protéine ? GWGAWILAGAGA 1 2 3 4
- 11. Et dans celle-ci? MRARPRPRPLWATVLALGALAGVGVGGPNICTTRGVSSCQQCLAVSPMCAWCSDEALPLG SPRCDLKENLLKDNCAPESIEFPVSEARVLEDRPLSDKGSGDSSQVTQVSPQRIALRLRP DDSKNFSIQVRQVEDYPVDIYYLMDLSYSMKDDLWSIQNLGTKLATQMRKLTSNLRIGFG AFVDKPVSPYMYISPPEALENPCYDMKTTCLPMFGYKHVLTLTDQVTRFNEEVKKQSVSR NRDAPEGGFDAIMQATVCDEKIGWRNDASHLLVFTTDAKTHIALDGRLAGIVQPNDGQCH VGSDNHYSASTTMDYPSLGLMTEKLSQKNINLIFAVTENVVNLYQNYSELIPGTTVGVLS MDSSNVLQLIVDAYGKIRSKVELEVRDLPEELSLSFNATCLNNEVIPGLKSCMGLKIGDT VSFSIEAKVRGCPQEKEKSFTIKPVGFKDSLIVQVTFDCDCACQAQAEPNSHRCNNGNGT FECGVCRCGPGWLGSQCECSEEDYRPSQQDECSPREGQPVCSQRGECLCGQCVCHSSDFG KITGKYCECDDFSCVRYKGEMCSGHGQCSCGDCLCDSDWTGYYCNCTTRTDTCMSSNGLL CSGRGKCECGSCVCIQPGSYGDTCEKCPTCPDACTFKKECVECKKFDRGALHDENTCNRY CRDEIESVKELKDTGKDAVNCTYKNEDDCVVRFQYYEDSSGKSILYVVEEPECPKGPDIL VVLLSVMGAILLIGLAALLIWKLLITIHDRKEFAKFEEERARAKWDTANNPLYKEATSTF TNITYRGT Glycoprotéine plaquettaire humaine ß3
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- 19. Algorithme humain GWGAWILAGAGA 1 2 3 4 Pour chaque acide aminé de la séquence, si l'acide aminé est A alors on compte une alanine de plus.
- 20. Algorithme Python sequence ="GWGAWILAGAGA" nombre_ala = 0 for acide_amine in sequence: if acide_amine == "A": nombre_ala = nombre_ala + 1 print nombre_ala
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- 22. Java package comptagealanines; public classMain { public static void main(String[] args) { String sequence = "GWGAWILAGAGA"; int nombre_ala = 0 ; for (int i = 0 ; i < sequence.length(); i++ ){ if (sequence.charAt( i ) == 'A'){ nombre_ala = nombre_ala + 1; } } System.out.println(nombre_ala); } }
- 23. Perl my @sequence =split('','GWGAWILAGAGA'); my $nombre_ala = 0 ; foreach my $acide_amine (@sequence) { if ($acide_amine eq 'A') { $nombre_ala = $nombre_ala + 1; } } print "$nombre_alan";
- 24. Javascript <script> var sequence ="GWGAWILAGAGA"; var nombre_ala = 0; for(i=0; i<sequence.length; i++) { if(sequence[i].toUpperCase() == "A") { nombre_ala = nombre_ala + 1; } } window.alert("Nombre de A : " + nombre_ala); </script>
- 25. PHP <?php $sequence = "GWGAWILAGAGA"; $nombre_ala = 0; for($i=0; $i<strlen($sequence); $i++) { if(strtoupper($sequence[$i]) == "A") { $nombre_ala = $nombre_ala + 1; } } echo "Nombre de A : ".$nombre_ala; ?>
- 26. C# using System; using System.Collections.Generic; using System.Linq; using System.Text; namespace ConsoleApplication1 { class Program { static void Main(string[] args) { string sequence = "GWGAWILAGAGA"; int nombre_ala = 0; for (int i = 0; i < sequence.Length; i++) { if (sequence[i].ToString().ToUpper() == "A") { nombre_ala = nombre_ala + 1; } } Console.WriteLine("Nombre de A : " + nombre_ala.ToString()); } } }
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- 32. ; { }@ $ using public class static void
- 33. Compilation C, C++, C#,Fortran code langage programme source machine exécutable
- 34. Interprétation (bytecode) Java, Python, Perl code bytecode source (caché)
- 35. Interprétation Bash, Javascript, PHP code source (ligne par ligne)
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- 39. sHSP P. Poulain, J.-C.Gelly, and D. Flatters, Detection and Architecture of Small Heat Shock Protein Monomers, PLoS ONE 5: e9990 (2010).
- 40. Biologie Informatique @P7 Unix (bash), R, C L3 Python, C, (R) M1 Python, Java, C, (R) M2
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- 47. bio informatique
- 48. Crédits graphiques PPDIGITAL (Flickr) TurboMilk (Findicons) Katherine Donaldson (Flickr) Wilsoninc (Findicons) Ralphbijker (Flickr) fe2cruz (Flickr) Olivcris (Flickr) 713 Avenue (Flickr) Nicobunu (Openclipart.org) K Lee (Wikipedia) VisualPharm (Findicons) selva (Flickr)
- 49. Crédits graphiques (2) Nardino (Flickr) Ennor (Flickr) AlanHeitz (Flickr) Dahon (Flickr) Foxymoron (Flickr) Joe Rollerfan (Flickr) JoeShlabotnik (Flickr) Liz Marion (Flickr) doi:10.1371/ journal.pone.0009990.g001 beeeeeker (Flickr) JoshuaDavisPhotography (Flickr)