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L’Intelligence Artificielle (I.A) au service des Laboratoires ?
#LaboratoireduFutur
Penser le Laboratoire du futur et usine du futur …
…c’est prendre la mesure de cette mutation induite par l’I.A
➢ La Mission du GT #LaboratoireduFutur de la Société des Experts Chimistes de France
▪ vous éclairer sur les arcanes de l’I.A
▪ vous sensibiliser à l’importance de l’exploitation et manipulation des données
▪ vous rendre compte de la conception et de l’utilité d’un éventail d’application de l’I.A
EXPERTSCIENCE
Réseaux de neurones …
Algorithmes d’apprentissage automatique ...
I.A. Générative …
I.A.et Laboratoire :
l’avènement de l’intelligence
Artificielle ( I.A.)
…au cœur d’une nouvelle révolution
pour le Laboratoire ?
EXPERTSCIENCE
L’Intelligence Artificielle (I.A) ?
L’intelligence artificielle ( I.A.)
« c’est l’ensemble des techniques permettant à des machines d’accomplir des tâches et
de résoudre des problèmes normalement réservés aux humains et à certains animaux »
L’I.A comprend 3 catégories :
- I.A. Symbolique : les algorithmes à base
de règles ( Systèmes Experts )
- I.A. Connexionniste : les les algorithmes
d’apprentissage avec réseau neurones
- I.A. Générative ( GPT ) réseaux de
neurones avec variante Transformer
EXPERTSCIENCE
L’I.A Symbolique : les Systèmes Expert …
Les systèmes Expert ( S.E) :
➢ Encapsulent les connaissances des experts
sous forme de règles ( si X alors Y)
➢Disposent d’un mécanisme d’inférence
➢ Utilisent ces connaissances pour résoudre des
problèmes et automatiser le traitement de
processus
➢ Ont évolué suivant différents modèles de
représentation
sémantique , graphe conceptuel , arbre de
décisions , langages informatique
(Exemples de S.E : prospector Mycin ,
Dendral)
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Le Système Expert Meta-Dendral énigmatique
pour les chimistes …depuis longtemps dans les
LABORATOIRES !
Permet de identifier des constituants
chimiques d’un matériau à partir de son
spectre de masse et de RMN.
Utilise la règle : « si le spectre de la molécule
présente 2 pics X1 et X2 tél que X1-X2= M+28
…alors la Molécule contient un groupe cétone ».
Ce S.E est le premier algorithme qui modélise la
connaissance d’un expert chimiste analyste.
EXPERTSCIENCE
I.A connexionniste : Machine Learning
réseau de neurones artificiels …
✓L’I.A connexionniste imite l’architecture de base du cerveau
✓Les réseaux neurones artificiels peuvent recevoir et transmettre de l’information
▪ Neurone artificiel est une fonction mathématique qui mime le neurone biologique avec son
hardware
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L’I.A connexionniste la machine apprend puis
résout
▪ Phase d’apprentissage nourrit l’algorithme de multiples exemples caractéristiques
▪ Phase de prédiction
▪ Phase de test de la qualité réponse/ prédiction
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Du machine learning au Deep learning
grâce au réseau neurones profonds multicouches
▪ Aptitudes à la résolution problèmes complexes « Deep learning » Yann Le Cun
▪ Exigences de :
• Capacités de calcul (processeurs graphiques)
• Disponibilité de grandes quantités de données pour entraînement de l’algorithme
▪ Optimisation réseau neurone ( poids synaptiques , seuils d’activation … rétropropagation de gradient)
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entrée et sortie.
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révolution AlphaFold
La connaissance acquise de la structure dans l’espace de ces molécules que sont les
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combinée associant :
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1- l’exemple de PhénoMatrix : I.A. embarquée dans système automatisé de
traitement échantillons en Microbiologie
2- un Algorithme de traitement d’images (Deep Learning ) travaille à partir d’un
panel 5000 images fournies par le laboratoire apprend et analyse les images
mettant en place les meilleures stratégies de détection des éléments pertinents pour
classer les images
3- Grâce à une intelligence artificielle (IA) avancée, le logiciel pré-évalue et pré-
trie automatiquement les plaques de culture permettant aux laboratoires de
microbiologie de lire, d'interpréter et de séparer les cultures bactériennes
Robotic Process Automation
1- I.A. Générative = exploite des techniques d’IA pour
générer du contenu ( textes , images , son et meme code )
2- 2000 Modèle de langue (LLM) concept clé est formulé
= modèle capable de prédire le prochain mot dans une phrase
= représentation vectorielle des mots avec cordonnées dans espace sémantique
3- 2022 arrivée de ChatGPT (GPT=Generative Pretained Transformer )
=Algorithme capable d’apprendre des représentations de mots contextualises
= Modèles statistiques probabilistes qui déterminent l’agencement, la
distribution des mots en s’appuyant sur des données massives ingérées lors de leur
entrainement
L’IA Générative dans les Laboratoires…
… une nouvelle donne pour le métier
>> Bing GPT4 – Bibliographie
-- solver d’equation
Microsoft openAI , Anthropic Amazon , Google
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« La puissance des Algorithmes de Machine – Learning
ouvre une nouvelle ère pour le laboratoire du futur ! »
Yvon Gervaise
L’intelligence Artificielle :
Une opportunité pour les LABORATOIRES !
une Collaboration …Entre les Laborantins et
les SPECIALISTES de l’IA
Avènement des Laborantins augmentés ?
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L’I.A Matrice du Laboratoire du Futur ?
#LaboratoireduFutur Pour aller plus loin ..
les Replay vidéos de l’intégralités des #conférences de 2 colloques >
et un lien ci-dessous >
TESTEZ Vous- même !!! LIEN ci-dessous )
https://webtv.insa-rouen.fr/videos/laboratoire-du-futur-2-le-defi-de-lintelligence-artificielle/
https://www.mediachimie.org/ressource/chimie-et-intelligence-artificielle-colloque-
f%C3%A9vrier-2023
EXPERTSCIENCE
IA et Laboratoire ? = La Réponse de L’IA !!!
Voici une réponse que j’ai obtenue à l’aide du nouveau Bing- GPT4 (Copilot)
.
LIEN : https://sl.bing.net/kEK4X1Fu6zA
EXPERTSCIENCE
Merci !
Yvon Gervaise https://www.linkedin.com/in/yvon-gervaise-22a1b035/
https://twitter.com/expertscience
Mail : expertscience.ygervaise@protonmail.com
Web: http://www.expertscience.fr
Tél : 06 60 67 91 50

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LE DÉFI DE L'EXPERT ET DE L'INGÉNIEUR CHIMISTE
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L'Intelligence Artificielle I.A. au service des Laboratoires

  • 1. L’Intelligence Artificielle (I.A) au service des Laboratoires ? #LaboratoireduFutur
  • 2. Penser le Laboratoire du futur et usine du futur … …c’est prendre la mesure de cette mutation induite par l’I.A ➢ La Mission du GT #LaboratoireduFutur de la Société des Experts Chimistes de France ▪ vous éclairer sur les arcanes de l’I.A ▪ vous sensibiliser à l’importance de l’exploitation et manipulation des données ▪ vous rendre compte de la conception et de l’utilité d’un éventail d’application de l’I.A EXPERTSCIENCE
  • 3. Réseaux de neurones … Algorithmes d’apprentissage automatique ... I.A. Générative … I.A.et Laboratoire : l’avènement de l’intelligence Artificielle ( I.A.) …au cœur d’une nouvelle révolution pour le Laboratoire ?
  • 4. EXPERTSCIENCE L’Intelligence Artificielle (I.A) ? L’intelligence artificielle ( I.A.) « c’est l’ensemble des techniques permettant à des machines d’accomplir des tâches et de résoudre des problèmes normalement réservés aux humains et à certains animaux » L’I.A comprend 3 catégories : - I.A. Symbolique : les algorithmes à base de règles ( Systèmes Experts ) - I.A. Connexionniste : les les algorithmes d’apprentissage avec réseau neurones - I.A. Générative ( GPT ) réseaux de neurones avec variante Transformer
  • 5. EXPERTSCIENCE L’I.A Symbolique : les Systèmes Expert … Les systèmes Expert ( S.E) : ➢ Encapsulent les connaissances des experts sous forme de règles ( si X alors Y) ➢Disposent d’un mécanisme d’inférence ➢ Utilisent ces connaissances pour résoudre des problèmes et automatiser le traitement de processus ➢ Ont évolué suivant différents modèles de représentation sémantique , graphe conceptuel , arbre de décisions , langages informatique (Exemples de S.E : prospector Mycin , Dendral)
  • 6. EXPERTSCIENCE Le Système Expert Meta-Dendral énigmatique pour les chimistes …depuis longtemps dans les LABORATOIRES ! Permet de identifier des constituants chimiques d’un matériau à partir de son spectre de masse et de RMN. Utilise la règle : « si le spectre de la molécule présente 2 pics X1 et X2 tél que X1-X2= M+28 …alors la Molécule contient un groupe cétone ». Ce S.E est le premier algorithme qui modélise la connaissance d’un expert chimiste analyste.
  • 7. EXPERTSCIENCE I.A connexionniste : Machine Learning réseau de neurones artificiels … ✓L’I.A connexionniste imite l’architecture de base du cerveau ✓Les réseaux neurones artificiels peuvent recevoir et transmettre de l’information ▪ Neurone artificiel est une fonction mathématique qui mime le neurone biologique avec son hardware
  • 8. EXPERTSCIENCE L’I.A connexionniste la machine apprend puis résout ▪ Phase d’apprentissage nourrit l’algorithme de multiples exemples caractéristiques ▪ Phase de prédiction ▪ Phase de test de la qualité réponse/ prédiction
  • 9. EXPERTSCIENCE Du machine learning au Deep learning grâce au réseau neurones profonds multicouches ▪ Aptitudes à la résolution problèmes complexes « Deep learning » Yann Le Cun ▪ Exigences de : • Capacités de calcul (processeurs graphiques) • Disponibilité de grandes quantités de données pour entraînement de l’algorithme ▪ Optimisation réseau neurone ( poids synaptiques , seuils d’activation … rétropropagation de gradient) La machine découvre elle même les caractéristiques et est ensuite apte à capturer la relation entre entrée et sortie.
  • 10. EXPERTSCIENCE Le deep learning au cœur d’une disruption pour les Laboratoires en biochimie et biologie moléculaire et structurale o Le problème : Impossible de lire dans une séquence d’acides aminés la structure 3D après repliement d’une protéine o La solution : AlphaFold algorithme de Deep Learning remporte en 2021 avec succès le CASP ( Critical Assessment Proteins structure Prediction ) avec GDT ( Global Distant Test ) > 92
  • 11. EXPERTSCIENCE L’I.A. un nouveau challenge pour les Laboratoires : la révolution AlphaFold Google Deep-Mind en partenariat avec EMBL ( Laboratoire Européen de Biologie Moléculaire ) a mis au point AlphaFold De juillet 2021 à juillet 2022 la base de données AlphaFold de structures 3D de protéines a été multipliée par X 200 DeepMind and EMBL release the most complete database of predicted 3D structures of human proteins
  • 12. EXPERTSCIENCE Nouvelle approche & Performances de l’I.A : la révolution AlphaFold La connaissance acquise de la structure dans l’espace de ces molécules que sont les protéines renseigne sur leur fonction dans les organismes vivants ° Ce résultat s’apprécie comme approche combinée associant : - les données d’entrainement : un corpus de données issus du séquençage des acides aminés et et de quelques structures 3D établies par les techniques de Cristallographie X et Cryo-microscopie électronique - la capacité de l’IA ( AlphaFold ) : à décrypter le lien unissant structure primaire / tertiaire
  • 13. EXPERTSCIENCE L’INTELLIGENCE ARTIFICIELLE CHALLENGE POUR LES LABORATOIRES DANS LES PROCHAINES ANNEES ? Son intégration en tant que solution pour optimiser le fonctionnement d’un nombre croissant de processus industriels et R&D Les technologies I.A vont s’installer de manière discrète dans les interstices où elles créent réellement de la valeur courbe de Gartner ( hype cycle )
  • 14. L’IA Matrice du laboratoire du futur: Les Ingredients…et le principe : EXPERTSCIENCE Jeux de données – Modèle – Fonction de de Coût ▪ Modèles Paramétriques : - arbre de décision - régression - réseau de neurones
  • 15. Sens Traduction Texte Reseau de neurones Viscosité Propriété Structure Moleculaire Réseau de Neurones : IA et Prédiction Propriété Chimique Detournement analyse du langage naturel EXPERTSCIENCE @ Emmanuel Frenod See-D
  • 16. Chimie , Biochimie et Intelligence Artificielle ? EXPERTSCIENCE 1- La Chimie et la Biochimie sont des disciplines scientifiques qui étudient : la composition , la structure , les propriétés des matériaux ainsi que les réactions chimiques qui ont lieu entre eux 2- Il existe différents types de données couramment utilisées en chimie , biochimie 3- L’IA avec les méthodes de ML ( Machine – Learning ) permet de nouvelles exploration de ces données pour les valoriser >>> L’Intelligence Artificielle (IA) peut être utilisée pour : -> Classer des molécules -> Prédire Propriétés Physiques , Biochimiques - > Découvrir nouvelles Molécules , Matériaux
  • 17. IA et exploitation des données de Laboratoire … Clé du Fonctionnement de Alpha Fold EXPERTSCIENCE Protéine Réseau Neurones Données GDT SCORE Structure 3D @fxcoudert E.N.S. Valorisation et exploitation des données
  • 18. Laboratoire et IA : données d’entrainement , apprentissage et exploitation Modèle de Machine Learning … Bases de données Laboratoires Apprentisage Entrainement du Modèle Exploitation du Modèle : prédiction solubilité ,enthalpie etc … EXPERTSCIENCE
  • 19. Chimie & IA (ML apprentissage supervisé) … Performances dans la prédiction des relations structures/ propriétés … 3 possibilités : - Expérience Labo - Chimie Théorique - Machine Learning La 3ème voie si vous avez assez des données pour entrainer un Modèle accélère la prédiction structure / propriété Performances = Semaines / Heures/+ Secondes EXPERTSCIENCE
  • 20. IA et Nouvelles Approches Méthodologiques pour la maitrise du Risque Chimique : méthodes alternatives QSAR / QSPR ) usages reseaux de Neurones , IA Machine Learning supervisé et non supervisé Usage reseaux de Neurones , IA Machine Learning @Guillaume Fayet INERIS EXPERTSCIENCE
  • 21. IDENTIFICATION des Contaminants … des milliers d’entités ! de la boucle humaine … à l’application de IA & Machine Learning > REX de l’ INERIS @Guillaume Fayet INERIS EXPERTSCIENCE
  • 22. APPROCHE IA et Analyse HRMS des Contaminants … … construction d’un MODELE à partir identification caracteristiques particulières dans les spectres GAINS : +> base de données étendue +> travail + exhaustif & + rapide EXPERTSCIENCE @Guillaume Fayet INERIS
  • 23. IA & Intensification des Procédés par Microfluidique… Laboratoire orchestré : synthèse, caractérisation , modélisation , bases de données et IA EXPERTSCIENCE
  • 24. L’ Intégration de L’IA dans les Laboratoires… …Revolutionne le traitement des échantillons EXPERTSCIENCE 1- l’exemple de PhénoMatrix : I.A. embarquée dans système automatisé de traitement échantillons en Microbiologie 2- un Algorithme de traitement d’images (Deep Learning ) travaille à partir d’un panel 5000 images fournies par le laboratoire apprend et analyse les images mettant en place les meilleures stratégies de détection des éléments pertinents pour classer les images 3- Grâce à une intelligence artificielle (IA) avancée, le logiciel pré-évalue et pré- trie automatiquement les plaques de culture permettant aux laboratoires de microbiologie de lire, d'interpréter et de séparer les cultures bactériennes Robotic Process Automation
  • 25. 1- I.A. Générative = exploite des techniques d’IA pour générer du contenu ( textes , images , son et meme code ) 2- 2000 Modèle de langue (LLM) concept clé est formulé = modèle capable de prédire le prochain mot dans une phrase = représentation vectorielle des mots avec cordonnées dans espace sémantique 3- 2022 arrivée de ChatGPT (GPT=Generative Pretained Transformer ) =Algorithme capable d’apprendre des représentations de mots contextualises = Modèles statistiques probabilistes qui déterminent l’agencement, la distribution des mots en s’appuyant sur des données massives ingérées lors de leur entrainement L’IA Générative dans les Laboratoires… … une nouvelle donne pour le métier >> Bing GPT4 – Bibliographie -- solver d’equation Microsoft openAI , Anthropic Amazon , Google EXPERTSCIENCE
  • 26. « La puissance des Algorithmes de Machine – Learning ouvre une nouvelle ère pour le laboratoire du futur ! » Yvon Gervaise L’intelligence Artificielle : Une opportunité pour les LABORATOIRES ! une Collaboration …Entre les Laborantins et les SPECIALISTES de l’IA Avènement des Laborantins augmentés ? EXPERTSCIENCE L’I.A Matrice du Laboratoire du Futur ?
  • 27. #LaboratoireduFutur Pour aller plus loin .. les Replay vidéos de l’intégralités des #conférences de 2 colloques > et un lien ci-dessous > TESTEZ Vous- même !!! LIEN ci-dessous ) https://webtv.insa-rouen.fr/videos/laboratoire-du-futur-2-le-defi-de-lintelligence-artificielle/ https://www.mediachimie.org/ressource/chimie-et-intelligence-artificielle-colloque- f%C3%A9vrier-2023 EXPERTSCIENCE IA et Laboratoire ? = La Réponse de L’IA !!! Voici une réponse que j’ai obtenue à l’aide du nouveau Bing- GPT4 (Copilot) . LIEN : https://sl.bing.net/kEK4X1Fu6zA
  • 28. EXPERTSCIENCE Merci ! Yvon Gervaise https://www.linkedin.com/in/yvon-gervaise-22a1b035/ https://twitter.com/expertscience Mail : expertscience.ygervaise@protonmail.com Web: http://www.expertscience.fr Tél : 06 60 67 91 50