En 2011, Mercator Océan a réussi à améliorer la surveillance des océans avec un nouveau système d'analyse à haute résolution et a montré son efficacité lors de la catastrophe de Fukushima. L'année a également été marquée par la création d'un centre européen pour le suivi des océans et par un travail continu vers l'excellence scientifique. Enfin, la disponibilité des services a atteint 100% pour les systèmes hebdomadaires, démontrant la solidité opérationnelle de l'organisation.