Accompagnement actif des
chercheurs à la gestion et au partage
des données de la recherche
Thierry Beguiristain, OTELo
M-Christine Jacquemot-Perbal, Inist-CNRS
Journée d’étude ADBS : La gestion des données de la recherche – 16 janvier 2015
Un partenariat Inist-OTELo dans un contexte de
science ouverte
• Inist
– Evolution des activités
– Adaptation aux besoins des
chercheurs
– Accompagnement
– Gestion et valorisation des
données de recherche
• OTELo
– Fédération d’UMRs
– Interdisciplinarité
– Anticipation
– Gestion et réutilisation des
données de recherche
16/01/2015T Beguiristain et MC Jacquemot - Journée d'étude ADBS
CHERCHEURS
16/01/2015
Plan de gestion des données
(DMP)
Entrepôts
Identifiants pérennes
Licences
Ethique
Outils de collecte
de métadonnées
Curation des données
Standards de
métadonnées
Création des
données
Traitement des
données
Analyse des
données
Conservation
des données
Donner
l’accès aux
données
Réutiliser les
données
Entrepôts
Data journals
Source : traduit de UK Data Archive
Bonnes pratiques
Quels rôles pour les documentalistes scientifiques ?
Sensibilisation
T Beguiristain et MC Jacquemot- Journée d'étude ADBS
« Data librarians »
Connaissances
 Culture sur les données
 Compréhension des processus de
recherche
 Standards de métadonnées
spécifiques des disciplines
 Identifiants uniques et pérennes
 Aspects éthiques et juridiques –
Données
Compétences
 Communication
 Pédagogie
 Curation des métadonnées
 Ontologies
Documentalistes scientifiques
Connaissances
 Culture informationnelle
 Discipline scientifique
 Standards de métadonnées
bibliographiques
 Aspects éthiques et juridiques –
Publications
Compétences
 Indexation
 Terminologie
 Métadonnées
Des connaissances et des compétences à construire
16/01/2015T Beguiristain et MC Jacquemot - Journée d'étude ADBS
T Beguiristain et MC Jacquemot - Journée d'étude ADBS
http://www.donneesdelarecherche.fr/
Coordinateur
ChercheursDocumentalistes
dialogueguide
immersion
Interactions
Situations
Environnement
Conférences
workshops
Projets Recherches
guidées
Formations
ESCOLA
http://www.donneesdelarecherche.fr/
Formation Inist
Métadonnées
Infrastructures
Standards de
métadonnées
Réseaux
Groupes de travail
Ressources documentaires
Des méthodes actives de formation
16/01/2015
Formation
Sensibilisation
Documentalistes
Chercheurs
Documentalistes et chercheurs :
des évolutions parallèles catalysées par les
interactions
16/01/2015T Beguiristain et MC Jacquemot - Journée d'étude ADBS
Stratégie d’OTELo
Sensibilisation
Evaluation
Pilote
GISFI
Réplication
ZAM
Déploiement OSUSensibilisation
SIM4RDM
Nov-Mars
Phase
actuelle
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SENSIBILISATION
16/01/2015T Beguiristain et MC Jacquemot - Journée d'étude ADBS
Sensibilisation : évaluation
CHERCHEURS
Questionnaire
Niveau de maturité
« Institution »
OTELo
« Infrastructure de soutien »
Inist-CNRS
(documentalistes
scientifiques motivés)
http://www/sim4rdm.eu
16/01/2015T Beguiristain et MC Jacquemot - Journée d'étude ADBS
Evaluation : bilan
Niveau de maturité par discipline et par catégorie
Discipline (effectif)
Conclusions :
Peu de différences entre les disciplines
Niveau basique
Recommandations du « cookbook » : sensibilisation
http://www/sim4rdm.eu
16/01/2015T Beguiristain et MC Jacquemot - Journée d'étude ADBS
Actions de sensibilisation
CHERCHEURS
Questionnaire
Niveau de maturité
« Institution »
OTELo
« Infrastructure de soutien »
Inist-CNRS
(Documentalistes scientifiques)
http://www/sim4rdm.eu
Approches en
présentielle et à
distance
16/01/2015T Beguiristain et MC Jacquemot - Journée d'étude ADBS
Sensibilisation : bilan
Directeurs de l’OSU, des
UMRs
Chercheurs
Acquis Conscients des enjeux d’une bonne
gestion des données :
 conserver un patrimoine,
 faciliter la transdisciplinarité,
 entrer dans l’ère de l’e-science.
 Curiosité éveillée
 Acquisition des concepts de base,
terminologie
 Réflexion autour des identifiants
chercheurs
 Addition d’un paragraphe sur la gestion
des données dans les propositions de
projet
 Quelques « champions »
A développer  Politique de gestion des données
 Poursuivre les actions de
sensibilisation
 Attribuer les ressources humaines
et financières
 Outils
 Formation/sensibilisation des futurs
chercheurs dès le Master
 Conviction des bénéfices d’une bonne
gestion et partage des données (pour eux
et puis pour les autres, visibilité,
transparence, confiance, …)
 Appropriation de bonnes pratiques (mais
pas de toutes les compétences IST!)
+ Bénéficier d’une reconnaissance
16/01/2015T Beguiristain et MC Jacquemot - Journée d'étude ADBS
PHASE PILOTE
16/01/2015T Beguiristain et MC Jacquemot - Journée d'étude ADBS
Pilote : les piliers
• Evolution vers une culture du partage
• Définition d’une politique des données
• Développement d’une infrastructure technique et
humaine
Objectifs
• Engagement des chercheurs
• S’appuyer sur les usages pour faire évoluer les
pratiques
Principes de
base
• Chercheur : contexte, intelligibilité,
• Informaticien : stockage, sauvegarde, accessibilité
• Documentaliste scientifique : documentation,
standards, interopérabilité
Acteurs Réutilisabilité
16/01/2015T Beguiristain et MC Jacquemot - Journée d'étude ADBS
Pilote : projet MultipolSite (ANR CESA 2008)
• Essais d’atténuation naturelle assistée par des plantes sur des terres
de cokeries multipolluées
• Site expérimental du GISFI (Homécourt , 54)
• Suivi d’un réseau de parcelles et de lysimètres
16/01/2015T Beguiristain et MC Jacquemot - Journée d'étude ADBS
• 2 prélèvements/an de 2005 à 2013
• Paramètres mesurés:
– terres et percolats,
– végétaux (plantés ou spontanés),
– microorganismes (bactéries-champignons),
– faune (macro et méso),
– tests d’écotoxicité.
• Mise en place d’une base de données en cours de projet par un ingénieur
en CDD (stockage et suivi des données, analyse interdisciplinaire et
intégration d’autres projets)
• État de la base:
– Peu alimentée (problème de timing: base disponible en fin de projet, départ de l’ingénieur en CDD),
– Ergonomie de la base
– Manque de vision collective
Pilote : projet MultipolSite (ANR CESA 2008)
16/01/2015T Beguiristain et MC Jacquemot - Journée d'étude ADBS
Diagnostic des pratiques et recommandations
• Diagnostic
– Fichiers excel sur ordinateurs personnels, intranet
– Nomenclature hétérogène, peu d’informations
– Manque d’adéquation entre les pratiques et les fonctionnalités de la BDD
• Recommandations:
– Structuration des données
– Documentation du contexte de production des données : créateur, méthodes,
date, explicitation de paramètres, …
– Normalisation/standardisation des métadonnées
– Convention de nommage des fichiers
– Formats de fichiers
– Redéfinition collective des fonctionnalités attendues
• Réflexion autour du DMP
16/01/2015T Beguiristain et MC Jacquemot - Journée d'étude ADBS
Réflexions du chercheur
• Prise de conscience de l’importance de la base: il faut que le
chercheur y trouve une plus-value :
− qualité des données stockées
− analyse multidisciplinaire des données
Ex : Cébron et al. 2011. Biological functioning of PAH-polluted and thermal
desorption-treated soils assessed by fauna and microbial bioindicators,
RESEARCH IN MICROBIOLOGY
− valorisation de la base : publication… mais avec les craintes quant à la
perte du contrôle des données
• Mise en place de la base dès l’écriture du projet
• La mise en place fait appel à des compétences que les
chercheurs dans leur majorité ne possèdent pas :
− Informaticiens
− Documentalistes scientifiques
16/01/2015T Beguiristain et MC Jacquemot - Journée d'étude ADBS
Remerciements
• OTELo
– Frédéric Villiéras
– Corinne Leyval
– Fabien Thomas
– Pierre-Yves Arnould
– Membres du GISFI
– Membres du LIEC
• Inist
– Alain Collignon
– Françoise Cosserat
– Documentalistes
scientifiques de la cellule
Données de recherche
16/01/2015T Beguiristain et MC Jacquemot - Journée d'étude ADBS

Accompagnement actif des chercheurs à la gestion et au partage des données de la recherche

  • 1.
    Accompagnement actif des chercheursà la gestion et au partage des données de la recherche Thierry Beguiristain, OTELo M-Christine Jacquemot-Perbal, Inist-CNRS Journée d’étude ADBS : La gestion des données de la recherche – 16 janvier 2015
  • 2.
    Un partenariat Inist-OTELodans un contexte de science ouverte • Inist – Evolution des activités – Adaptation aux besoins des chercheurs – Accompagnement – Gestion et valorisation des données de recherche • OTELo – Fédération d’UMRs – Interdisciplinarité – Anticipation – Gestion et réutilisation des données de recherche 16/01/2015T Beguiristain et MC Jacquemot - Journée d'étude ADBS
  • 3.
    CHERCHEURS 16/01/2015 Plan de gestiondes données (DMP) Entrepôts Identifiants pérennes Licences Ethique Outils de collecte de métadonnées Curation des données Standards de métadonnées Création des données Traitement des données Analyse des données Conservation des données Donner l’accès aux données Réutiliser les données Entrepôts Data journals Source : traduit de UK Data Archive Bonnes pratiques Quels rôles pour les documentalistes scientifiques ? Sensibilisation T Beguiristain et MC Jacquemot- Journée d'étude ADBS
  • 4.
    « Data librarians» Connaissances  Culture sur les données  Compréhension des processus de recherche  Standards de métadonnées spécifiques des disciplines  Identifiants uniques et pérennes  Aspects éthiques et juridiques – Données Compétences  Communication  Pédagogie  Curation des métadonnées  Ontologies Documentalistes scientifiques Connaissances  Culture informationnelle  Discipline scientifique  Standards de métadonnées bibliographiques  Aspects éthiques et juridiques – Publications Compétences  Indexation  Terminologie  Métadonnées Des connaissances et des compétences à construire 16/01/2015T Beguiristain et MC Jacquemot - Journée d'étude ADBS
  • 5.
    T Beguiristain etMC Jacquemot - Journée d'étude ADBS http://www.donneesdelarecherche.fr/ Coordinateur ChercheursDocumentalistes dialogueguide immersion Interactions Situations Environnement Conférences workshops Projets Recherches guidées Formations ESCOLA http://www.donneesdelarecherche.fr/ Formation Inist Métadonnées Infrastructures Standards de métadonnées Réseaux Groupes de travail Ressources documentaires Des méthodes actives de formation 16/01/2015
  • 6.
    Formation Sensibilisation Documentalistes Chercheurs Documentalistes et chercheurs: des évolutions parallèles catalysées par les interactions 16/01/2015T Beguiristain et MC Jacquemot - Journée d'étude ADBS
  • 7.
  • 8.
    SENSIBILISATION 16/01/2015T Beguiristain etMC Jacquemot - Journée d'étude ADBS
  • 9.
    Sensibilisation : évaluation CHERCHEURS Questionnaire Niveaude maturité « Institution » OTELo « Infrastructure de soutien » Inist-CNRS (documentalistes scientifiques motivés) http://www/sim4rdm.eu 16/01/2015T Beguiristain et MC Jacquemot - Journée d'étude ADBS
  • 10.
    Evaluation : bilan Niveaude maturité par discipline et par catégorie Discipline (effectif) Conclusions : Peu de différences entre les disciplines Niveau basique Recommandations du « cookbook » : sensibilisation http://www/sim4rdm.eu 16/01/2015T Beguiristain et MC Jacquemot - Journée d'étude ADBS
  • 11.
    Actions de sensibilisation CHERCHEURS Questionnaire Niveaude maturité « Institution » OTELo « Infrastructure de soutien » Inist-CNRS (Documentalistes scientifiques) http://www/sim4rdm.eu Approches en présentielle et à distance 16/01/2015T Beguiristain et MC Jacquemot - Journée d'étude ADBS
  • 12.
    Sensibilisation : bilan Directeursde l’OSU, des UMRs Chercheurs Acquis Conscients des enjeux d’une bonne gestion des données :  conserver un patrimoine,  faciliter la transdisciplinarité,  entrer dans l’ère de l’e-science.  Curiosité éveillée  Acquisition des concepts de base, terminologie  Réflexion autour des identifiants chercheurs  Addition d’un paragraphe sur la gestion des données dans les propositions de projet  Quelques « champions » A développer  Politique de gestion des données  Poursuivre les actions de sensibilisation  Attribuer les ressources humaines et financières  Outils  Formation/sensibilisation des futurs chercheurs dès le Master  Conviction des bénéfices d’une bonne gestion et partage des données (pour eux et puis pour les autres, visibilité, transparence, confiance, …)  Appropriation de bonnes pratiques (mais pas de toutes les compétences IST!) + Bénéficier d’une reconnaissance 16/01/2015T Beguiristain et MC Jacquemot - Journée d'étude ADBS
  • 13.
    PHASE PILOTE 16/01/2015T Beguiristainet MC Jacquemot - Journée d'étude ADBS
  • 14.
    Pilote : lespiliers • Evolution vers une culture du partage • Définition d’une politique des données • Développement d’une infrastructure technique et humaine Objectifs • Engagement des chercheurs • S’appuyer sur les usages pour faire évoluer les pratiques Principes de base • Chercheur : contexte, intelligibilité, • Informaticien : stockage, sauvegarde, accessibilité • Documentaliste scientifique : documentation, standards, interopérabilité Acteurs Réutilisabilité 16/01/2015T Beguiristain et MC Jacquemot - Journée d'étude ADBS
  • 15.
    Pilote : projetMultipolSite (ANR CESA 2008) • Essais d’atténuation naturelle assistée par des plantes sur des terres de cokeries multipolluées • Site expérimental du GISFI (Homécourt , 54) • Suivi d’un réseau de parcelles et de lysimètres 16/01/2015T Beguiristain et MC Jacquemot - Journée d'étude ADBS
  • 16.
    • 2 prélèvements/ande 2005 à 2013 • Paramètres mesurés: – terres et percolats, – végétaux (plantés ou spontanés), – microorganismes (bactéries-champignons), – faune (macro et méso), – tests d’écotoxicité. • Mise en place d’une base de données en cours de projet par un ingénieur en CDD (stockage et suivi des données, analyse interdisciplinaire et intégration d’autres projets) • État de la base: – Peu alimentée (problème de timing: base disponible en fin de projet, départ de l’ingénieur en CDD), – Ergonomie de la base – Manque de vision collective Pilote : projet MultipolSite (ANR CESA 2008) 16/01/2015T Beguiristain et MC Jacquemot - Journée d'étude ADBS
  • 17.
    Diagnostic des pratiqueset recommandations • Diagnostic – Fichiers excel sur ordinateurs personnels, intranet – Nomenclature hétérogène, peu d’informations – Manque d’adéquation entre les pratiques et les fonctionnalités de la BDD • Recommandations: – Structuration des données – Documentation du contexte de production des données : créateur, méthodes, date, explicitation de paramètres, … – Normalisation/standardisation des métadonnées – Convention de nommage des fichiers – Formats de fichiers – Redéfinition collective des fonctionnalités attendues • Réflexion autour du DMP 16/01/2015T Beguiristain et MC Jacquemot - Journée d'étude ADBS
  • 18.
    Réflexions du chercheur •Prise de conscience de l’importance de la base: il faut que le chercheur y trouve une plus-value : − qualité des données stockées − analyse multidisciplinaire des données Ex : Cébron et al. 2011. Biological functioning of PAH-polluted and thermal desorption-treated soils assessed by fauna and microbial bioindicators, RESEARCH IN MICROBIOLOGY − valorisation de la base : publication… mais avec les craintes quant à la perte du contrôle des données • Mise en place de la base dès l’écriture du projet • La mise en place fait appel à des compétences que les chercheurs dans leur majorité ne possèdent pas : − Informaticiens − Documentalistes scientifiques 16/01/2015T Beguiristain et MC Jacquemot - Journée d'étude ADBS
  • 19.
    Remerciements • OTELo – FrédéricVilliéras – Corinne Leyval – Fabien Thomas – Pierre-Yves Arnould – Membres du GISFI – Membres du LIEC • Inist – Alain Collignon – Françoise Cosserat – Documentalistes scientifiques de la cellule Données de recherche 16/01/2015T Beguiristain et MC Jacquemot - Journée d'étude ADBS