Présentation au Pôle Science de l’IRD , le 13 septembre 2018 du projet d'entrepôt de données ouvertes de l'IRD, du contexte de l'Open Science en France et en Europe et des avantages à disposer d'un entrepôt de données pour l'IRD et ses partenaires.
La Science Ouverte est à l’ordre du jour, en France et en Europe.
Après les publications, les données de la recherche sont sous le feu des projecteurs.
Ce gisement de connaissances, trop peu connu et exploité, est même souvent voué à l’oubli et à la destruction, faute de signalisation et de sauvegarde pérenne.
L’IRD, plus encore que les autres organismes de recherche, se doit de proposer une politique, des méthodologies et des outils de préservation et de partage des données recueillies dans, par et pour les pays du Sud par l’ensemble de ses équipes de recherche.
Lors de cette conférence, Pascal Aventurier, responsable du Service Information Scientifique et Technique (IST), et Jean-Christophe Desconnets, Directeur de la Mission Infrastructure et Données Numériques (MIDN), présenteront le projet d’entrepôt de données de l’IRD qui ouvrira mi 2019.
Pour les universités et instituts du Sud, les bouleversements de l'IST ouvrent des perspectives nouvelles : la littérature scientifique devient plus accessible et la production scientifique de l’organisme peut être diffusée plus facilement, grâce aux mouvements du Libre Accès et de la Science Ouverte, et aux développement de technologies de l’information basées sur des logiciels libres.
Marc Goovaerts met en application ce nouveau paradigme dans différents projets de coopération Nord-Sud-Sud, en portant une attention particulière à l’interopérabilité, aux métadonnées et aux identifiants uniques.
Marc Goovaerts, bibliothécaire à l’Université de Hasselt (Belgique), coordonne depuis 20 ans divers projets de coopération financés par le programme IODE de l’UNESCO (https://www.iode.org/) et VLIR-UOS (https://www.vliruos.be/en) avec des bibliothèques et instituts du Sud. Deux récents projets de coopération avec 5 universités cubaines serviront d’exemple.
Cette introduction au Module Doctoral Cap sur les Données Environnement 2020 réalisé pour l'Université de Montpellier par la Commission Information Scientifique et Technique Agropolis définit rapidement ce qui fait partie des données de la recherche publique et le cadre juridique qui leur est appliqué.
Présentaion des outils et services documentaires offerts par le Service IST de la Délégation Régionale Occitanie de l'IRD (Montpellier), en présentiel et à distance : sites web, adresses mails, publications et ressources sur abonnement, assistance, recommandations et formations,...
L'ouverture des données de la recherche en 2015 : définitions, enjeux, dynami...Lesticetlart Invisu
Intervention de Rémi Gaillard, responsable du pôle « Politique documentaire et valorisation des collections » de la bibliothèque de l'Université Pierre-et-Marie-Curie, aux Lundis numériques de l'INHA (14 septembre 2015).
Présentation au Pôle Science de l’IRD , le 13 septembre 2018 du projet d'entrepôt de données ouvertes de l'IRD, du contexte de l'Open Science en France et en Europe et des avantages à disposer d'un entrepôt de données pour l'IRD et ses partenaires.
La Science Ouverte est à l’ordre du jour, en France et en Europe.
Après les publications, les données de la recherche sont sous le feu des projecteurs.
Ce gisement de connaissances, trop peu connu et exploité, est même souvent voué à l’oubli et à la destruction, faute de signalisation et de sauvegarde pérenne.
L’IRD, plus encore que les autres organismes de recherche, se doit de proposer une politique, des méthodologies et des outils de préservation et de partage des données recueillies dans, par et pour les pays du Sud par l’ensemble de ses équipes de recherche.
Lors de cette conférence, Pascal Aventurier, responsable du Service Information Scientifique et Technique (IST), et Jean-Christophe Desconnets, Directeur de la Mission Infrastructure et Données Numériques (MIDN), présenteront le projet d’entrepôt de données de l’IRD qui ouvrira mi 2019.
Pour les universités et instituts du Sud, les bouleversements de l'IST ouvrent des perspectives nouvelles : la littérature scientifique devient plus accessible et la production scientifique de l’organisme peut être diffusée plus facilement, grâce aux mouvements du Libre Accès et de la Science Ouverte, et aux développement de technologies de l’information basées sur des logiciels libres.
Marc Goovaerts met en application ce nouveau paradigme dans différents projets de coopération Nord-Sud-Sud, en portant une attention particulière à l’interopérabilité, aux métadonnées et aux identifiants uniques.
Marc Goovaerts, bibliothécaire à l’Université de Hasselt (Belgique), coordonne depuis 20 ans divers projets de coopération financés par le programme IODE de l’UNESCO (https://www.iode.org/) et VLIR-UOS (https://www.vliruos.be/en) avec des bibliothèques et instituts du Sud. Deux récents projets de coopération avec 5 universités cubaines serviront d’exemple.
Cette introduction au Module Doctoral Cap sur les Données Environnement 2020 réalisé pour l'Université de Montpellier par la Commission Information Scientifique et Technique Agropolis définit rapidement ce qui fait partie des données de la recherche publique et le cadre juridique qui leur est appliqué.
Présentaion des outils et services documentaires offerts par le Service IST de la Délégation Régionale Occitanie de l'IRD (Montpellier), en présentiel et à distance : sites web, adresses mails, publications et ressources sur abonnement, assistance, recommandations et formations,...
L'ouverture des données de la recherche en 2015 : définitions, enjeux, dynami...Lesticetlart Invisu
Intervention de Rémi Gaillard, responsable du pôle « Politique documentaire et valorisation des collections » de la bibliothèque de l'Université Pierre-et-Marie-Curie, aux Lundis numériques de l'INHA (14 septembre 2015).
Construire des outils pour la gestion des données de la recherche dans une co...Lesticetlart Invisu
Construire des outils pour la gestion des données de la recherche dans une communauté d’universités Aurore Cartier, Magalie Moysan et Nathalie Reymonet [Université Paris-Descartes, Université Paris-Diderot, Sorbonne Paris Cité]
Un plan de gestion de données (PGD ou DMP pour Data Management Plan) est un document qui spécifie quelles données sont collectées ou générées, et comment elles seront gérées, partagées et préservées pendant et après un projet. Le support de ce webinaire donne les clés pour pouvoir amorcer la rédaction d’un PGD en toute sérénité en présentant les enjeux et objectifs d’un PGD, son contenu et un outil d’aide à la rédaction : DMP OPIDOR.
Claire SOWINSKI est responsable du service formation-DoRANum de l’Inist-CNRS (Institut de l’Information Scientifique et Technique).
L'Open Access et les Données de la Recherche dans le cadre du Programme Horiz...Agropolis International
La politique de libre accès de l'UE
Le projet pilote de libre accès aux données de la recherche (Open Research Data)
Cécile Adamolle, Annabelle Filatre, Hanka Hensens, Isabelle Nault, Chantal Salson, Christine Silvy, Marie-Violaine Tatry
Date : 09/2015, révision octobre 2016
Fiche pratique IST Agropolis : L'Open Access et les données de la rechercheAgropolis International
Une fiche pratique dédiée aux données de la recherche dans le cadre de l'Open Access (créée en septembre 2015 et révisée en octobre 2016) :
• enjeux,
• typologie,
• cycle de vie de la donnée,
• les étapes de gestion des données de la recherche
• le plan de gestion (PGD ou Data Management Plan - DMP)
• exemples de modèles de plans de gestion de données
• la valorisation des données de la recherche
• la (ré)utilisation des données et le droit d'auteurs (licences).
Auteurs : Cécile Adamolle, Annabelle Filatre, Hanka Hensens, Isabelle Nault, Chantal Salson, Christine Silvy, Marie-Violaine Tatry
Date : 09/2015, révisée en octobre 2016
Open Mining Infratsructure for TExt & Data : une infrastructure text-mining a...Le_GFII
Intervention de Patricia Geretto, ingénierie de l'information - TAL à la DVIST INRA. Forum du GFII les 8 & 9 dec 2015.
OpenMinTeD, projet Horizon 2020, a pour objectif de créer une infrastructure facilitant l'usage des ressources et des outils de text-mining pour les communautés scientifiques. Cette plateforme ouverte et pérenne permettra aux chercheurs de découvrir, créer, partager et ré-utiliser la connaissance extraite d’un vaste éventail de sources de la littérature scientifique. Des cas d'usage sont identifiés et développés par des experts de différents domaines. L'Institut National de la Recherche Agronomique (INRA) participe pour sa part aux cas d'usage en agronomie.
Données de la recherche : quel positionnement et quels rôles pour les bibliot...Pierre Naegelen
Analyser les statistiques de consultation de la documentation en vue d'évaluer les besoins des chercheurs
Etre un acteur de l'indexation des données : "médiateur de la valorisation des données" (Catherine Morel-Pair)
Constituer une cellule d'appui pour la gestion des données de la recherche : l'élaboration d'un Digital Management Plan (DMP) ou Plan de Gestion des Données (PGD)
Let's talk about policy! Politiques publiques pour l’ouverture des données sc...Rayna Stamboliyska
Cette présentation était la keynote de fermeture pour l'édition 2015 de la conférence SOData! tenu le 26 mars 2015 (voir le programme ici http://sodata.org/?page_id=162). Pierre-Carl Langlais et moi-même avons parlé des défis et opportunités d'une politique publique visant l'ouverture des données de la recherche.
Accompagnement actif des chercheurs à la gestion et au partage des données de...Lesticetlart Invisu
Accompagnement actif des chercheurs à la gestion et au partage des données de la recherche
Thierry Beguiristain, OTELo
M-Christine Jacquemot-Perbal, Inist-CNRS
Réaliser un plan de gestion de données: guide de rédaction, 2015.
Ce document a été conçu afin d’accompagner les chercheurs et chargés de projets lors de la rédaction de plans de gestion de données (Data Management Plans, DMP). Sa structure s’appuie sur le modèle proposé par la Commission européenne dans le cadre d’Horizon 2020 et divers modèles de plans de gestion de données existants tels que celui de la National Science Foundation (NSF) ou de l’Interuniversity Consortium for Political and Social Research (ICPSR). Les champs requis par la Commission européenne sont signalés par un astérisque. Les exemples mentionnés dans ce document sont issus de guides existants.
Gestion des données scientifiques en imagerie in vivo – Journée scientifique organisée par PIV le 7 décembre 2017 au PARCC-HEGP
Marie-Christine Jacquemot
OPIDOR
Un PGD, qu'est-ce que c'est ? Pour quoi faire ? Comment ?
Un PGD sert surtout à se poser les bonnes questions et à adopter des méthodes rigoureuses de gestion pour documenter, stocker, responsabiliser, archiver, informer, et finalement partager les données scientifiques.
Le PGD est de plus en plus souvent recommandé ou même exigé par les financeurs, les éditeurs, les organismes scientifiques.
L’exposé présente les grands principes et principales étapes d’un PGD et les aides à la rédaction.
Cette intervention d'Hanka Hensens a eu lieu le 20 septembre 2018, dans le cadre des JeudIST de l'IRD Occitanie.
Hanka Hensens, responsable du Centre de Documentation IRD Occitanie, a animé depuis 2017 plusieurs ateliers sur les Plans de Gestion de Données en direction des scientifiques d’Agropolis. Elle forme étudiants et chercheurs depuis près de 20 ans à la recherche et à la gestion de l’information scientifique.
Documation 2011 : de la recherche fédérée à l'accès unifiéAntidot
Toute organisation subit les limites de son système d’information : entrepôts de données cloisonnés, données hétérogènes, documents non structurés, thésaurus incomplets, taxonomies incohérentes…
Les utilisateurs en souffrent et attendent un véritable « accès unifié à l’information » : trouver l’information par les concepts plutôt que la chercher par les mots, naviguer aisément dans l’information, mieux l’exploiter en collaborant. L’entreprise doit évoluer vers un « espace informationnel enrichi », servant différents usages selon le profil ou la mission de chaque collaborateur.
La vision innovante d'Antidot permet d’aller bien au-delà de ce que permettent les approchent traditionnelles comme la « recherche fédérée » ou encore les « search based applications » car Antidot Information Factory et Antidot Finder Suite permettent de modéliser l’information, de capter, normaliser, décrire et agréger des données puis d’en inférer des informations nouvelles, facilement accessibles.
Intégrant nativement les technologies du web sémantique, Antidot apporte les solutions les plus en pointe dans le domaine et démontre à travers une réalisation emblématique - le projet ISIDORE du CNRS TGE Adonis - comment remodeler et diffuser une information à forte valeur ajoutée.
High-level Meeting & Workshop on Environmental and Scientific Open Data for Sustainable Development Goals in Developing Countries. Madagascar, 4-6 December 2017
Construire des outils pour la gestion des données de la recherche dans une co...Lesticetlart Invisu
Construire des outils pour la gestion des données de la recherche dans une communauté d’universités Aurore Cartier, Magalie Moysan et Nathalie Reymonet [Université Paris-Descartes, Université Paris-Diderot, Sorbonne Paris Cité]
Un plan de gestion de données (PGD ou DMP pour Data Management Plan) est un document qui spécifie quelles données sont collectées ou générées, et comment elles seront gérées, partagées et préservées pendant et après un projet. Le support de ce webinaire donne les clés pour pouvoir amorcer la rédaction d’un PGD en toute sérénité en présentant les enjeux et objectifs d’un PGD, son contenu et un outil d’aide à la rédaction : DMP OPIDOR.
Claire SOWINSKI est responsable du service formation-DoRANum de l’Inist-CNRS (Institut de l’Information Scientifique et Technique).
L'Open Access et les Données de la Recherche dans le cadre du Programme Horiz...Agropolis International
La politique de libre accès de l'UE
Le projet pilote de libre accès aux données de la recherche (Open Research Data)
Cécile Adamolle, Annabelle Filatre, Hanka Hensens, Isabelle Nault, Chantal Salson, Christine Silvy, Marie-Violaine Tatry
Date : 09/2015, révision octobre 2016
Fiche pratique IST Agropolis : L'Open Access et les données de la rechercheAgropolis International
Une fiche pratique dédiée aux données de la recherche dans le cadre de l'Open Access (créée en septembre 2015 et révisée en octobre 2016) :
• enjeux,
• typologie,
• cycle de vie de la donnée,
• les étapes de gestion des données de la recherche
• le plan de gestion (PGD ou Data Management Plan - DMP)
• exemples de modèles de plans de gestion de données
• la valorisation des données de la recherche
• la (ré)utilisation des données et le droit d'auteurs (licences).
Auteurs : Cécile Adamolle, Annabelle Filatre, Hanka Hensens, Isabelle Nault, Chantal Salson, Christine Silvy, Marie-Violaine Tatry
Date : 09/2015, révisée en octobre 2016
Open Mining Infratsructure for TExt & Data : une infrastructure text-mining a...Le_GFII
Intervention de Patricia Geretto, ingénierie de l'information - TAL à la DVIST INRA. Forum du GFII les 8 & 9 dec 2015.
OpenMinTeD, projet Horizon 2020, a pour objectif de créer une infrastructure facilitant l'usage des ressources et des outils de text-mining pour les communautés scientifiques. Cette plateforme ouverte et pérenne permettra aux chercheurs de découvrir, créer, partager et ré-utiliser la connaissance extraite d’un vaste éventail de sources de la littérature scientifique. Des cas d'usage sont identifiés et développés par des experts de différents domaines. L'Institut National de la Recherche Agronomique (INRA) participe pour sa part aux cas d'usage en agronomie.
Données de la recherche : quel positionnement et quels rôles pour les bibliot...Pierre Naegelen
Analyser les statistiques de consultation de la documentation en vue d'évaluer les besoins des chercheurs
Etre un acteur de l'indexation des données : "médiateur de la valorisation des données" (Catherine Morel-Pair)
Constituer une cellule d'appui pour la gestion des données de la recherche : l'élaboration d'un Digital Management Plan (DMP) ou Plan de Gestion des Données (PGD)
Let's talk about policy! Politiques publiques pour l’ouverture des données sc...Rayna Stamboliyska
Cette présentation était la keynote de fermeture pour l'édition 2015 de la conférence SOData! tenu le 26 mars 2015 (voir le programme ici http://sodata.org/?page_id=162). Pierre-Carl Langlais et moi-même avons parlé des défis et opportunités d'une politique publique visant l'ouverture des données de la recherche.
Accompagnement actif des chercheurs à la gestion et au partage des données de...Lesticetlart Invisu
Accompagnement actif des chercheurs à la gestion et au partage des données de la recherche
Thierry Beguiristain, OTELo
M-Christine Jacquemot-Perbal, Inist-CNRS
Réaliser un plan de gestion de données: guide de rédaction, 2015.
Ce document a été conçu afin d’accompagner les chercheurs et chargés de projets lors de la rédaction de plans de gestion de données (Data Management Plans, DMP). Sa structure s’appuie sur le modèle proposé par la Commission européenne dans le cadre d’Horizon 2020 et divers modèles de plans de gestion de données existants tels que celui de la National Science Foundation (NSF) ou de l’Interuniversity Consortium for Political and Social Research (ICPSR). Les champs requis par la Commission européenne sont signalés par un astérisque. Les exemples mentionnés dans ce document sont issus de guides existants.
Gestion des données scientifiques en imagerie in vivo – Journée scientifique organisée par PIV le 7 décembre 2017 au PARCC-HEGP
Marie-Christine Jacquemot
OPIDOR
Un PGD, qu'est-ce que c'est ? Pour quoi faire ? Comment ?
Un PGD sert surtout à se poser les bonnes questions et à adopter des méthodes rigoureuses de gestion pour documenter, stocker, responsabiliser, archiver, informer, et finalement partager les données scientifiques.
Le PGD est de plus en plus souvent recommandé ou même exigé par les financeurs, les éditeurs, les organismes scientifiques.
L’exposé présente les grands principes et principales étapes d’un PGD et les aides à la rédaction.
Cette intervention d'Hanka Hensens a eu lieu le 20 septembre 2018, dans le cadre des JeudIST de l'IRD Occitanie.
Hanka Hensens, responsable du Centre de Documentation IRD Occitanie, a animé depuis 2017 plusieurs ateliers sur les Plans de Gestion de Données en direction des scientifiques d’Agropolis. Elle forme étudiants et chercheurs depuis près de 20 ans à la recherche et à la gestion de l’information scientifique.
Documation 2011 : de la recherche fédérée à l'accès unifiéAntidot
Toute organisation subit les limites de son système d’information : entrepôts de données cloisonnés, données hétérogènes, documents non structurés, thésaurus incomplets, taxonomies incohérentes…
Les utilisateurs en souffrent et attendent un véritable « accès unifié à l’information » : trouver l’information par les concepts plutôt que la chercher par les mots, naviguer aisément dans l’information, mieux l’exploiter en collaborant. L’entreprise doit évoluer vers un « espace informationnel enrichi », servant différents usages selon le profil ou la mission de chaque collaborateur.
La vision innovante d'Antidot permet d’aller bien au-delà de ce que permettent les approchent traditionnelles comme la « recherche fédérée » ou encore les « search based applications » car Antidot Information Factory et Antidot Finder Suite permettent de modéliser l’information, de capter, normaliser, décrire et agréger des données puis d’en inférer des informations nouvelles, facilement accessibles.
Intégrant nativement les technologies du web sémantique, Antidot apporte les solutions les plus en pointe dans le domaine et démontre à travers une réalisation emblématique - le projet ISIDORE du CNRS TGE Adonis - comment remodeler et diffuser une information à forte valeur ajoutée.
High-level Meeting & Workshop on Environmental and Scientific Open Data for Sustainable Development Goals in Developing Countries. Madagascar, 4-6 December 2017
Mettre en pratique les recommandations sur les archives ouvertes de nouvelle ...pascal aventurier
un récent rapport de COAR (Confederation of Open Access
Repositories) sur les archives ouvertes de nouvelle génération explique que celles-ci n’ont pas développé pleinement leur potentiel et ne sont pas assez connectées. Ce travail
analyse comment les principales recommandations du rapport COAR pourraient être appliquées à l’archive ouverte institutionnelle Horizon Plein textes de l’IRD.
OpenData : au-delà des publications, le partage des données de la recherche e...Thierry Chanier
Le monde universitaire est producteur de données de différentes natures. L'ouverture et le partage de chaque type de données introduit des problématiques spécifiques. Cette variété s'explique en premier lieu par les situations particulières qui ont gouverné leur création. Mais les enjeux d'utilisation, par les communautés universitaires, les communautés de chercheurs ou la société en général, diffèrent aussi suivant chaque type de données.
Nous évoquerons brièvement un premier type de données, celles pédagogiques, en lien avec le mouvement en accès libre intitulé Open Educational Ressources (OER). Le second type de données, cette fois faisant partie du résultat de la recherche, concerne les publications. Notre communication rappellera brièvement, afin de mieux les distinguer du dernier type de données, les contraintes particulières qui ont motivé le développement de l'accès libre (open access) aux publications, les différentes voies suivies, l'état actuel après plus de 10 ans d'existence. L'essentiel de notre propos sera consacré au partage des données de la recherche, qui peuvent ou non être reliées aux publications. Nous décrirons les motivations de ce mouvement OpenData, les enjeux pour les chercheurs, les conditions particulières de mise à disposition que devront avoir ces données pour être réellement OpenData. Nous évoquerons enfin les transformations profondes du métier de chercheur qui peuvent en résulter, en nous appuyant sur des exemples provenant principalement des sciences humaines.
Kristell MICHEL : Une IDG au service des Observatoires sur l’eau: retour d'ex...kmichel69
Ces dernières années ont vu se multiplier des plateformes d’échanges et de gestion d’information géolocalisées, prenant des formes diverses, qu’il s’agisse de catalogues de données géoréferencées ou de plateformes web SIG, souvent enrichies d’applications métiers. Beaucoup d’inventivité, d’innovation et donc d’énergie ont été mises au service de développements.
Ce séminaire se propose à partir de différentes expériences de revenir sur les usages de ces plateformes, en mettant en perspective l’ensemble du dispositif (les caractéristiques de la solution et les besoins initialement affichés, les usagers ciblés), et les utilisations effectives a posteriori, mais aussi en revenant sur les éventuelles conséquences de ces plateformes sur les pratiques professionnelles, sur les évolutions envisagées et à envisager tant pour les usages de type « consultation » que pour les usages de type « contribution ».
Contribution des Archives Ouvertes dans les grandes réformes de l'Enseignemen...Adou Jean Constant ATTA
Communication prononcée lors de l'atelier "Contribution des Centres de Documentation aux Archives Ouvertes" organisé par la Direction de l'Information Scientifique et Technologique (DIST) du Ministère de l'Enseignement Supérieur et de la Recherche Scientifique de Côte d'Ivoire
"Une politique à l'écoute des chercheurs : entre mandat de dépôt sur mesure et accompagnement sur mesure" (retour d'expérience de l'Université Toulouse - Jean Jaurès), journée d'étude « Services aux chercheurs : quelle politique pour les archives ouvertes institutionnelles ? »
URFIST Bordeaux, SCD Pau, 21 avril 2015
Fiche pratique IST Agropolis : Les Données de la Recherche : Questions-RéponsesAgropolis International
Foire aux questions - FAQ sur les donnnées de la recherche
Fiche créée en septembre 2015 et révisée en octobre 2016
Qu'est-ce que l'ouverture des données (Open Data) ?
Quelles données préserver ?
Où déposer mes données ?
Comment définir les conditions de réutilisation de mes données ?
Et si mes données sont déjà déposées dans les réseaux sociaux (ResearchGate, Academia...) ?
Qu'est-ce qu'un jeu de données ?
Où rechercher des jeux de données ?
Qu'est-ce qu'un DOI ?
Comment citer un jeu de données ?
Qu'est-ce qu'un PGD ?
A quelles questions répond un PGD ?
De quels outils je dispose pour rédiger un PGD ?
Avec qui interagir pour élaborer un PGD ?
L'éthique du partage et moi ?
Auteurs : Cécile Adamolle, Annabelle Filatre, Hanka Hensens, Isabelle Nault, Chantal Salson, Christine Silvy, Marie-Violaine Tatry
Fiche créée en septembre 2015 et révisée en octobre 2016
Présentation de Stéphane Pouyllau (TGE Adonis, CNRS) lors du colloque infoclio.ch 2011 à Berne le 30 septembre 2011.
Ecouter la conférence:
http://soundcloud.com/infoclio-ch/isidore
ISIDORE : plateforme d’accès unifié aux données de la recherche en sciences humaines et sociales
ISIDORE est un plate-forme informatique d'accès unifié, de valorisation et d'enrichissement des données numériques de la recherche en sciences humaines et sociales. Créé et animée par le très grand équipement ADONIS du Centre national de la recherche scientifique (Paris, France), ISIDORE est accessible à tous depuis décembre 2010 sur le site web http://rechercheisidore.fr. Ce nouvel outil s'appuie sur des principales méthodes d'interopérabilité des données en vigueur depuis plus de 10 ans tout en ouvrant sur les méthodes du web de données, aussi nommé web 3.0, actuellement en plein développement (RDF, etc.).
ISIDORE collecte les métadonnées et les données, les enrichies en les reliant aux termes issus de référentiels scientifiques (thesaurus, vocabulaires, etc.), les places dans le web de données et les rend accessibles au travers d'un triple accès (moteur de recherche sur le web, api et "sparql endpoint" pour pour construire des applications d'aide à la recherche). ISIDORE est le plus gros projet d'open data scientifique opérationnel en France.
L'intervention proposée permettra de découvrir la rapidement la plate-forme et ces spécificités, d'en comprendre le fonctionnement et d'en présenter les premiers retours.
Raymond Werlen (CRUS) - Les enjeux de l’information scientifique. Le point de...infoclio.ch
Présentation de Raymond Werlen (Conférence des recteurs des universités suisses CRUS) lors du colloque infoclio.ch 2011 le 30 septembre 2011 à Berne.
Ecouter la conférence:
http://soundcloud.com/infoclio-ch/raymond-werlen
Les enjeux de l’information scientifique. Le point de vue de la CRUS
Un accès sans encombre et généralisé des hautes écoles suisses aux informations scientifiques disponibles à l’échelle internationale représente un enjeux majeur pour la compétitivité de la place scientifique suisse. Grâce à un réseau de bibliothèques universitaires qui fonctionne bien, la Suisse se trouve actuellement dans une position plutôt confortable en comparaison internationale. Mais le déplacement rapide de l’acquisition, du traitement, de l’échange, de l’archivage et de la diffusion de l’information de la forme papier vers les médias électroniques (internet) et vers des plateformes de données toujours plus importantes qui s’établissent en dehors du domaine de compétence traditionnel des bibliothèques représente un changement de paradigme qui concerne l’ensemble des chercheurs, des enseignants et des étudiants. Les conséquences de ce changement de paradigme sur le travail scientifique ainsi que les efforts de monopolisation des entreprises qui fournissent des informations scientifiques rendent nécessaire une mise en réseau plus étroite des hautes écoles suisses. Pour répondre aux défis qui en découlent, la CRUS prépare, sur mandat de la CUS, un Programme CUS 2013-2016 sur l'accès, le traitement et la sauvegarde de l'information scientifique. La présentation donnera un aperçu de l'état des réflexions au sein de la CRUS.
Evolution de la bibliothèque scientifique: La nouvelle stratégie LIBER 2018-2022Jeannette Frey
LIBER, Ligue Européenne des Bibliothèques de Recherche, a lancé sa nouvelle stratégie 2018-2022 en novembre 2017. Cette présentation donne une vue d'ensemble du contexte, de la vision, des axes stratégiques de LIBER, ainsi que des comités de pilotage et les groupes de travail existants et à créer dans les années à venir.
De la recherche d'information aux pratiques scientifiques : vers de nouveaux ...olivier
L'émergence du phénomène du web 2.0, des nouveaux outils d'accès à l'information qu'il propose, des nouveaux types de contenus qu'il met en ligne, et des nouveaux protocoles de filtrage et de validation qu'il abolit ou transcende, interroge les pratiques actuelles de formation à l'IST. Parmi d'autres, le phénomène des blogs d'experts gagne le domaine de l'enseignement en général et de l'université en particulier. Des institutions, des composantes, des formations, des services, des communautés scientifiques, mais aussi des enseignants-chercheurs ouvrent de nouveaux espaces de paroles, mettant en œuvre de nouvelles dynamique de collaboration. Ces nouveaux collaboratoires, sous l'angle des rapports entre science et société, permettent d'articuler différemment un grand nombre de pratiques scientifiques en terme de diffusion, de collecte, de recherche, de publication et d'enseignement. Le domaine de la culture informationnelle et de la maîtrise de l'information en particulier, et celui des sciences de l'information et de la communication en général est à la fois un terrain et un révélateur particulièrement pertinent pour analyser les problématiques sous-jacentes de ces nouveaux collaboratoires, au rang desquelles la construction d'une culture du préprint, la mise à disposition d'indicateurs adaptés, la facilitation du déploiement rapide d'expertises dispersées et la reconfiguration des champs.
L’équipe du projet BeBoP a proposé un webinaire le 30 mai 2024 pour découvrir comment la technologie vidéo, combinée à l’intelligence artificielle, se met au service de l’analyse du comportement des taurillons.
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3. Qu'est-ce que la science ouverte ?
La science ouverte, c’est la diffusion sans entrave des publications et des
données de la recherche. Elle s’appuie sur l’opportunité que représente la
mutation numérique pour développer l’accès ouvert aux publications et – autant
que possible – aux données de la recherche.
Son objectif : faire sortir la recherche financée sur fonds publics du cadre confiné
des bases de données fermées. Elle réduit les efforts dupliqués dans la collecte, la
création, le transfert et la réutilisation du matériel scientifique. Elle augmente
ainsi l’efficacité de la recherche.
La science ouverte vise à construire un écosystème dans lequel la science est
plus cumulative, plus fortement étayée par des données, plus transparente,
plus rapide et d’accès plus universel. Elle induit une démocratisation de l’accès
aux savoirs, utile à la recherche, à la formation, à l’économie, à la société.
Elle favorise les avancées scientifiques ainsi que l’innovation, les progrès
économiques et sociaux, en France, dans les pays développés et dans les pays en
développement.
Elle constitue un levier pour l’intégrité scientifique et favorise la confiance des
citoyens dans la science. Elle constitue un progrès scientifique et un progrès de
société.
4
« La science ouverte n’est pas une mode, ce n’est pas une discipline,
c’est un nouveau paradigme. Elle comporte donc ses nouvelles
pratiques et ses nouvelles compétences ». FrédériqueVidal. 4 juillet 2018.
http://m.enseignementsup-recherche.gouv.fr/cid132529/le-plan-national-pour-la-science-ouverte-les-resultats-de-la-recherche-scientifique-ouverts-a-tous-sans-
entrave-sans-delai-sans-paiement.html
4. Pourquoi partager les données ?
Entre injonctions et bénéfices Augmenter ces citations
Le partage des données
augmente l’attractivité
de l’article jusqu’à 69%
Étendre son réseau
nouvelle opportunité
pour
échanger/collaborer
Attirer sur son profil
chercheur
La demande pour réutiliser
les données est en forte
hausse
Renforcer ses possibilités
de recevoir des
financements
Compatibilité avec les
exigences des financeurs
Reproductibilité
Preuve
Résultats accessibles à tous public
Préservation
Description et visibilité
Pilote données ouvertes par défaut
Wiley
Incitation
ou
obligation
de partage
Protocole de
Nagoya
7. Questions soulevées par l’ouverture des données
•1. C’est compliqué C’est la raison pour laquelle les infrastructures de données et
les plans de gestion des données existent (DMP).
•2. C’est cher C’est la raison pour laquelle les frais de structuration et d’ouverture
sont éligibles dans les appels à projets.
•3. C’est risqué pour les données sensibles (personnelle, secret défense, sécurité
publique, secret professionnel, secret industriel et commercial, risque pour la
protection du potentiel scientifique…) Données présentant des risques pour la
protection du potentiel scientifique et technique de la nation.
Dans tous ces cas, il ne faut pas ouvrir les données, mais on peut les Fairiser.
Marin Dacos, 27/03/2018 : Ouverture des données de la recherche DGESIP - DGRI Journée sur le doctorat
Aussi ouvert que possible, aussi fermé que nécessaire
8. Principes FAIR : Augmenter le potentiel des données
9
• Licence d’utilisation
appropriée
• Utiliser des formats
ouverts
• Utiliser une vocabulaire
partagé
• Standards de
métadonnées communs
• Gérer de façon pérenne
de l’accès aux données
• Obtenir l’accord des
producteurs
• Attribuer un
Identifiant pérenne
• Décrire les données
décrites au sein d’un
entrepôt
Facile à
trouver
Accessible
RéutilisableInteropérable
10. Plan national pour la science ouverte
3 axes pour sa concrétisation
Axe 1 Généraliser l’accès ouvert aux publications
Axe 2 : Structurer et ouvrir les données de la recherche
4 – obligation de la diffusion ouverte des données
5 - Créer la fonction d’administrateur des données par établissement
6 – Données ouvertes associées aux articles scientifiques
Axe 3 : s’inscrire dans une dynamique durable, européenne et
internationale
7 - Développer les compétences dans les écoles doctorales.
8 – Politique de science ouverte pour les opérateurs de la recherche
9 - Contribuer à la structuration européenne (EOSC,GO FAIR)
11
11. 12
INRA
Un site web et entrepôt de données
Annuaire développé dans l’entrepôt de données
Formations : Plan de gestion de données
Liens entre données et documents (Prodinra)
CNRS
Lié au TGIR HUMA-NUM : exemple Nakala (entrepôt de données), Isodore (moteur de recherche)
Ifremer
entrepôt de données SEANOE
Liens forts avec l’entrepôt de documents Archimer
CIRAD
Entrepôt de données dataverse
Un annuaire développé en dehors de l’entrepôt de données
Des formations : Plan de gestion de données
Science Po
Entrepôt de données dataverse du CDSP
INRIA
Software héritage pour le dépôt des codes sources
CEA, IRSTEA
Des préconisations
Ecosystème pour la science ouverte en France
Niveau d’avancement de nos partenaires
12. Notions autour des entrepôts de données
1313/02/2019 Présentation GT Données - IST - 27 mars 2018
13. Service en ligne permettant le dépôt, la description, la
conservation, la recherche et la diffusion des jeux de données.
Entrepôt disciplinaire / institutionnel / ouvert à toutes disciplines / Infrastructure nationale,
internationale
D’après Sylvie Cocaud. Cocaud et Aventurier 2017
Entrepôt de données de recherche
Définition
14. Déposer ses données dans un entrepôt facilite la découverte
et la réutilisation des données
Les entrepôts sont scannés par des outils de recherche spécifiques
Data Cite search
Data Citation Index (Thomson Reuters)
Google Dataset Search
Data Search (Elsevier)
Peuvent diffuser leurs données via le protocole d’échange standard
OAI-PMH
D’aprèsCocaud et Aventurier 2017
et moissonnés par des catalogues, intégrateurs, infrastructures européennes
de données… de plus en plus nombreux
Plus value des entrepôts pour les scientifiques
Augmentation de la visibilité des travaux
16. 17
Positionnement
Données cibles 1/2
Données non structurées, non
numérisées, enfouies dans les PC,
historiques non rattachées à des BD
accessibles en interne ou externe
Observatoires, pôles
de données, base de
données accessibles
sur le web
Distribution des données de la recherche
(Ferguson et al., 2014)
18. Identificationdescriptiondécouverte
stockage
dépôt
Motivations
Changer les pratiques de gestion des données
19
oubli
destruction
Conception projet
de recherche
démarrage
projet
acquisition de
données
Analyse de
données
publication
résultats
fin projet
cycle de vie au cours du projet
cycle de vie dans l’entrepôt
bornes du projet
valorisation
partage
nouvelles
publications
citations
réutilisation
Conception projet
de recherche
démarrage
projet
acquisition de
données
Analyse de
données
publication
résultats
fin projet
Plan de
gestion de
données
19. 20
Objectifs de l’entrepôt
Première pièce de l’écosystème « gestion des données pour la
science ouverte »
À court terme
Fournir un service (plateforme + accompagnement + curation) aux
chercheurs pour maitriser la diffusion de leur données et leur
préservation
À moyen terme
Assurer la découverte des ressources IRD déposées dans d’autres
entrepôts, pôles de données, infrastructures de recherche (fonction
d’annuaire)
20. 21
Sur la visibilité des produits de leur recherche
Augmentation de la visibilité de leurs travaux
Indexation par les moteurs de recherche internationaux (DataCite,
Google, R3data.org…)
Objectifs
Au service des chercheurs
Sur la préservation et la réutilisation des données
Préservation des données pour les projets hors observatoires, IR ;
Récupération des données en danger
Apprendre les bonnes pratiques de gestion des données
21. 22
En interne
Répondre au plan national de la science ouverte
Améliorer la connaissance et la gestion de notre patrimoine de données
Un premier élément « concret » vers une politique de science ouverte à
l’IRD
Objectifs
Au service de l’institut
Pour nos partenaires Sud et internationaux
Améliorer l’accessibilité de nos données aux partenaires du sud
Être un support pour des initiatives de science ouverte au sud
(réplication de l’entrepôt, mise à disposition, renforcement de
capacités)
Europe et international
Répondre aux exigences des programmes européens
S ’intégrer dans des infrastructures européennes EOSC (European
Open Science Cloud)
22. 23
Adhérence avec l’existant
l’entrepôt interconnecté
Lab
Entrepôts
ESR Français
Observatoires
Pôle de
données
PNDB
Système Terre
Moteur de
recherche
Entrepôt
23. 24
Méthodologie
Réunion d’informations
Recueils des besoins sur un large panel disciplinaire
Tests d’une application de dépôts et de partage
Quelques exemples
Génomique
SHS
Milieu marin
Ecologie - biodiversité
Santé
Environnement
Méthodologie
Nombreux besoins identifiés au sein des UMR…
3 séminaires d’informations et d’échanges organisés :
> 10 UMR, DDUNI, DAJ, IST, MIDN
25. • Logiciel open source, créé en 2006 par Harvard
• Installer une instance locale de Dataverse et participer au réseau de
Dataverse (Cirad, INRA, Science Po…)
• Intégrer un « écosystème » d’entrepôts interopérables
26
Plateforme logicielle pour l’entrepôt IRD
Outil open source Dataverse
https://dataverse.org/
26. Une collection
Un jeu de données
Recherche générale
Recherche ciblée
Dataverse
Interface web – découverte des données
27. La citation du jeu de
données
Dataverse
Interface web – Citation et accès aux données
Les
données
associées
28. Fonctionnement type de l’entrepôt
29
Appui DAJ / Supports
d’accompagnement/
Hotline pour répondre
aux questions
• Création d’un espace et formation d’une personne référente
• Unités, projets peuvent créer un espace de dépôt personnalisable « Dataverse », ….)
Description et
dépôt de
données
Validation du
dépôt par
IST/personne
désignée
Publication du
jeu de données
Référencement
dans les
moteurs et les
outils de
recherche
Données FAIR
• Les chercheurs déposent, en accord,
avec le plan de gestion de données, un
jeu de données dans cet espace dans
des formats standardisés, et décrivent
leurs données
• (ouvert /
fermée/embargo/métadonnée
s seules)
30. Organisation en interne
Articulation entre pôle Science et pôle Appui
MCST – Service
IST
MIDN
D-DUNI –
Service Etudes
et
Développement
DRH – Service
Développement
des
compétences
DAJ – Service
juridique
31. 32
Calendrier prévisionnel
Phases et première cible
1
• Recueils des besoins pour orienter le périmètre du projet et les choix techniques
2
• Tests et études techniques
3
• Mise en place de la plateforme Dataverse à l’IRD (septembre – janvier 19)
• Configuration, développements annexes (fédération authentification, interopérabilité, visualisation)
5
• Phase d’utilisation pilote de Dataverse (janvier – mars 19)
• Configuration, développements annexes (fédération authentification, interopérabilité,
visualisation)
6
• Ouverture de l’entrepôt de données – version 1 (printemps 19)
32. 33
Entrepôt pour accueillir les données que les chercheurs de l’IRD souhaitent
déposer, partager
Rendre les données: Facile à trouver, Accessible, Interopérable, Réutilisable
Complémentarité avec les plateformes existantes : descriptions associés à la
création d’un DOI et aux fonctions de découverte sur les données
Des objectifs raisonnables
Nombreuses attentes des scientifiques pour des contextes variés
Et des besoins différents (valorisation , préservation, attribution de
DOI, partage)
Pour répondre aux besoins des chercheurs
Conclusion
Améliorer la connaissance et la gestion de notre patrimoine de données
Un premier élément « concret » vers une politique de science ouverte à
l’IRD
Et au service de l’institut