Presentation for a practical/theoretical session focused on OpenRefine as an easy tool to improve the quality of biodiversity datasets by using the default features, existing web services and regular expressions. --- Présentation pour une session pratique/théorique centrée sur OpenRefine, un outil facile à prendre en main pour améliorer la qualité des jeux de données sur la biodiversité en utilisant les fonctionnalités de base, les web services existants et les expressions régulières.

1. 24 AUGUST 2016
THE BID PROGRAMME IS FUNDED BY THE EUROPEAN UNION
OpenRefine
Nestor Beltran

2. DATA CURATION, FORMATTING &
TRANSFORMATION
Use of OpenRefine

3. MANIPULATION, FORMATAGE ET
TRANSFORMATION DE DONNÉES
Utilisation d’OpenRefine

4. Faceting
Clustering
Reconciling
What is?
A powerful tool for working with messy data

5. Facettes
Agglomération (“Clustering”)
Réconciliation
Qu'est-ce que c'est?
Un outil puissant pour manipuler des données “désordonnées”

6. What is not?
Database Excel-like
experience

7. Qu’est ce que ce n’est pas ?
Base de données Comme Excel

8. Features comparison
● Usually one cell edition
● Useful to document
data and perform
operations
● Data is not always
visible
● Deficient visualization
● Multiple cell edition
● Easy exploration and
transformation
● Interactive visualization
● Infrastructure and
programing skills to edit
● Absence of easy
visualization
Database OpenRefineExcel

9. Comparaison des fonctionnalités
● Édition “une cellule à la
fois”
● Utile pour documenter
les données et
effectuer des
opérations
● Les données ne sont
pas toujours visibles
● Visualisations limitées
● Edition de plusieurs
cellules simultanément
● Explorations et
transformations simples
● Visualisations
interactives
● Nécessite une
infrastructure et des
compétences en
programmation.
● Pas de visualisation
facile/automatique
Base de données OpenRefineExcel

10. Features comparison
● Multiple cell edition
● Easy exploration and
transformation
● Interactive visualization
OpenRefine
● Free
● Desktop app (offline)
● Infinite undo function
● Use of APIs
● Several type files to
export/import
● Faceting / Filters
● Use of regular
expressions
● Extensions
● Large community of
developers (extensions,
tutorials, etc)

11. Comparaison des fonctionnalités
● Edition de plusieurs
cellules simultanément
● Explorations et
transformations simples
● Visualisations
interactives
OpenRefine
● Gratuit et Open Source
● Application de bureau
(hors ligne)
● “Undo” illimité
● Utilisation d’APIs
● Plusieurs formats
d’import/export
● Facettes / filtres
● Utilise les expressions
régulières
● Extensions
● Grande communauté
(extensions, tutoriels,
etc)

12. DATA CURATION, FORMATTING &
TRANSFORMATION
Practical session

13. MANIPULATION, FORMATAGE ET
TRANSFORMATION DE DONNÉES
Session pratique

14. Cell.recon.match.id
Edit column
●Formulas (copy-paste)
●Commands in OpenRefine
●Column names
●Useful hyperlinks
●Column menu
Conventions
nameRecon
www.gbif.org

15. Cell.recon.match.id
Edit column
●Formules (copier-coller)
●Commandes OpenRefine
●Noms de colonnes
●Liens hypertextes
●Menu déroulant
Conventions
nameRecon
www.gbif.org

16. 24 AUGUST 2016
THE BID PROGRAMME IS FUNDED BY THE EUROPEAN UNION
OpenRefine
Nestor Beltran