Presentation supporting a demo session focused on digitization tools and software, including a short demonstration of one example tool and discussions about other options available (e.g. citizen science transcription projects, sampling event data) --- Présentation pour une session de démonstration et d’échanges centrée sur les outils et logiciels de numérisation, comprenant une courte démonstration d’un des outils et des discussions sur les autres options disponibles (par exemple les projets de transcription d’étiquettes grâce aux sciences participatives, les données d’échantillonnage…)

1. 23 AUGUST 2016
THE BID PROGRAMME IS FUNDED BY THE EUROPEAN UNION
Digitizing data: example of
the BIOTA software
Sophie Pamerlon

2. 23 AOÛT 2016
THE BID PROGRAMME IS FUNDED BY THE EUROPEAN UNION
Numérisation de données :
exemple du logiciel BIOTA
Sophie Pamerlon

3. List of softwares by the BID communityPre-workshopactivityresults
Trainers Students
Spreadsheets, MS excel DIVA GIS
Spreadsheets, Google sheets Xper2
Spreadsheets, Calc Maxent
Specify SPSS for windows
BIOTA World coordinate converter
Brahms GBIF ECAT Name Parser
Elysia MANIS groreferencing calculator
QGIS Distance Sample
OpenRefine GEOLocate
Programming language: Python GBIF spreadsheet processor
Programming language: R ArcView/ArcGIS for Destop
EMu SMART
Symbiota ArcGIS
Link to detailed list

4. Logiciels listés par la communauté BID
Activitépréparatoire:résultats
Trainers Students
Spreadsheets, MS excel DIVA GIS
Spreadsheets, Google sheets Xper2
Spreadsheets, Calc Maxent
Specify SPSS for windows
BIOTA World coordinate converter
Brahms GBIF ECAT Name Parser
Elysia MANIS groreferencing calculator
QGIS Distance Sample
OpenRefine GEOLocate
Programming language: Python GBIF spreadsheet processor
Programming language: R ArcView/ArcGIS for Destop
EMu SMART
Symbiota ArcGIS
Link to detailed list

5. List of softwares by the BID communityPre-workshopactivityresults
Link to detailed list

6. Logiciels listés par la communauté BID
Activitépréparatoire:résultats
Lien vers la liste détaillée

7. Where to find it?
InstallingBIOTA
http://viceroy.eeb.uconn.edu/Biota/

8. Où trouver le logiciel ?
InstallerBIOTA
http://viceroy.eeb.uconn.edu/Biota/

9. Download
InstallingBIOTA
http://viceroy.eeb.uconn.edu/Biota/Biota2Pages/biota2_download.html

10. Téléchargement
InstallerBIOTA
http://viceroy.eeb.uconn.edu/Biota/Biota2Pages/biota2_download.html

11. Set-up and User Guide
InstallingBIOTA
● Unzip the archive you downloaded
● Extract the contents on your computer
● Click the “BiotaAPPWin300.exe” file
→ BIOTA launches
NOTE: if an error message appears, check the regional settings of your
computer. The date format must be dd/mm/yyyy
User guide:
http://viceroy.eeb.uconn.edu/Biota/Biota2Pages/Biota2Download/Biota_
2_User's_Manual.pdf

12. Installation et Guide d’utilisation
InstallerBIOTA
● Dézipper l’archive que vous avez téléchargée
● En extraire le contenu sur votre ordinateur
● Cliquer sur l’application “BiotaAPPWin300.exe”
→ lancement de BIOTA
NOTE: si un message d’erreur apparaît, vérifier les paramètres
régionaux (date et heure) de l’ordinateur. Le format de date doit être
jj/mm/aaaa
Guide d’utilisation :
http://viceroy.eeb.uconn.edu/Biota/Biota2Pages/Biota2Download/Biota_
2_User's_Manual.pdf

13. Main page
Managingdata

14. Page d’accueil
Gestiondesdonnées

15. Add a specimen
Addingdata

16. Ajouter un spécimen
Ajouterdesdonnées

17. Assign a catalog number
SpecimenManagement

18. Attribuer un numéro de catalogue
Gestiond’unspécimen

19. Catalog number assigned!
SpecimenManagement

20. Numéro de catalogue attribué !
Gestiondespécimen

21. Assign a taxon
SpecimenManagement

22. Attribuer un taxon
Gestiond’unspécimen

23. Assign a taxon
SpecimenManagement

24. Attribuer un taxon
Gestiond’unspécimen

25. Determination history
SpecimenManagement

26. Historique de détermination
Gestiondespécimen

27. Preparation technique
SpecimenManagement

28. Technique de préparation
Gestiondespécimen

29. Auxiliary fields
SpecimenManagement

30. Champs annexes
Gestiondespécimen

31. Notes
SpecimenManagement

32. Notes
Gestiondespécimen

33. References
SpecimenManagement

34. Références
Gestiondespécimen

35. Main page
Managingdata

36. Page d’accueil
Gestiondesdonnées

37. Add a new collection
CollectionManagement

38. Ajouter une nouvelle collection
Gestiondecollection

39. Georeferencing the collection
CollectionManagement

40. Géoréférencer la collection
Gestiondecollection

41. Main page
Managingdata

42. Page d’accueil
Gestiondesdonnées

43. Add a locality
LocalityManagement

44. Ajouter une localité
Gestiondeslieux

45. Main page
Managingdata

46. Page d’accueil
Gestiondesdonnées

47. Add a reference
ReferencesManagement

48. Ajouter une référence
Gestiondesréférences

49. Main page
Managingdata

50. Page d’accueil
Gestiondesdonnées

51. Add personel
PersonelManagement

52. Ajouter une personne
Gestiondespersonnes

53. 23 AUGUST 2016
THE BID PROGRAMME IS FUNDED BY THE EUROPEAN UNION
Digitizing data: example of
the BIOTA software
Sophie Pamerlon

54. 23 AOÛT 2016
THE BID PROGRAMME IS FUNDED BY THE EUROPEAN UNION
Numérisation de données :
exemple du logiciel BIOTA
Sophie Pamerlon