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La Vie
                                         sur Terre d’années
                                          13.7 miliards
Le « Big Bang »             La Chimie
                          commence ici

   European Event MARIBOR 2012
        PHYSIQUE          CHIMIE         BIOLOGIE

   1st Out of the Box Conference Pensée
                               La
          Université de Maribor
                  18 Mai 2012

     De la Matière à la Vie :
                   Chimie ?
                   Chimie !
ÉVOLUTION de l’ UNIVERS

Information
                                    ?
Complexité
                                       pensante

                                    vivante         Matière

                              organisée

                        condensée
              divisée
                                                  Temps

  ÉVOLUTION vers la MATIÈRE COMPLEXE
  ÉVOLUTION de la MATIÈRE
  sous la PRESSION de l’ INFORMATION
LA COMMENT LAPRIMORDIALE
          QUESTION MATIERE
           DEVIENT-ELLE COMPLEXE
    De la particule élémentaire à l’organisme pensant

                                    ?
- Comment la matière est-elle devenue complexe dans l’histoire de l’univers
  jusqu’à l’évolution du monde biologique et de la pensée ?
- Quelles formes plus élevées de la matière complexe reste-t-il à créer ?

                               CHIMIE
        PHYSIQUE                                     BIOLOGIE
        Les lois de                                 Les règles de
         l’Univers                                     La Vie

                   La CHIMIE établit le pont
L’ AUTO-ORGANISATION
       comme Impératif Cosmique




MATIÈRE DIVISÉE – CONDENSÉE – ORGANISÉE
        VIVANTE – PENSANTE !

  LE CHEMIN VERS LA COMPLEXITÉ
         La réponse à la question
AUTO-ORGANISATION COSMIQUE

ORIGINE de la
                                             GRAVITATION
STRUCTURE COSMIQUE


Structuration de l’univers par les forces gravitationnelles opérant
sur des inhomogénéités en densité ou en vitesse d’expansion
à une époque très précoce, juste après le « big bang »



   AUTO-ORGANISATION de l’UNIVERS
AUTO-ORGANISATION de la MATIÈRE
ORIGINE de la                        FORCES
MATIÈRE COMPLEXE               ÉLECTROMAGNÉTIQUES
       Structuration de la matière atomique et moléculaire
       par les forces électromagnétiques opérant sur des
              combinaisons structurales aléatoires


AUTO-ORGANISATION de la
                           MATIÈRE NON-VIVANTE
                                et VIVANTE
ÉVOLUTION CHIMIQUE PRÉBIOTIQUE
                 AUTO-ORGANISATION de la
             MATIÈRE MOLÉCULAIRE NON-VIVANTE

Les forces électromagnétiques opèrent une sélection sur la diversité structurale
         conduisant à une complexification progressive de la matière
   du monde non-vivant au monde vivant sous la pression de l’information.

 GÉNÉRALISATION DE L’ÉVOLUTION DARWINIENNE
    Évolution chimique sous l’action des forces intra- et intermoléculaires
                 mettant en œuvre l’information moléculaire.

                     CHIMIE PRÉ-BIOTIQUE
La CHIMIE

SCIENCE de la

STRUCTURE               de la MATIÈRE
                        NON-VIVANTE
   et de la
                               et
 TRANSFORMATION            VIVANTE
EMPÉDOCLE                FEU              DÉMOCRITE
  (-490, -435)                                (-460,-370)

   Les            sec          chaud
ÉLÉMENTS                                 Les ATOMES


TERRE                                   AIR


                 froid         humide




                         EAU
1718
Sur les Relations entre les Propriétés et les
      Poids Atomiques des Éléments
                   Dimitri
                 D. Mendelejeff,
           MENDELÉEV (1869)
     Zeitschrift für Chemie 12, 405-6

             TABLEAU
            (1834-1907)
           PÉRIODIQUE
          DES ÉLÉMENTS




                  1869
Les BRIQUES de la MATIÈRE

   TABLEAU PÉRIODIQUE
      des ÉLÉMENTS


Le Terrain de Jeu
      de la
     Chimie !
Alexandre BORODINE
                             (1833-1887)


                           chimiste
                         compositeur




Ami de Mendeleev - Congrès de Karlsruhe septembre 1860
     Réaction de Borodine - Hundsdiecker
                                                  Opéra Prince Igor
                                                   2 Symphonies
                                                     2 Quatuors
  1872 Condensation Aldolique Borodine et Wurtz
       O                           O OH
                                                     1 Quintette
                    O
                                                        etc...
                +
     R    CH3       H   R'       R         R'
Antoine Laurent
 LAVOISIER

  (1743-1794)




  L’ ÉQUATION
 de la RÉACTION
    CHIMIQUE
De la composition
  à la connectivité




   FORMULES
   CHIMIQUES



Essais de représentation
 des connexions (liaisons)
entre les briques de base,
   les éléments/atomes
  formant une molécule
Jacobus Henricus VAN’T HOFF    Joseph-Achille LE BEL
         (1852-1911)                (1847- 1930)




         STÉRÉOCHIMIE / CHIMIE DANS L’ESPACE
Louis PASTEUR
  (1822-1895)


  à Strasbourg
 de 1849 à 1854


 CHIRALITÉ
MOLÉCULAIRE
La CHIMIE MOLÉCULAIRE
   La Chimie de la Liaison Covalente




     De l’ATOME à la MOLÉCULE
Maîtrise de l’élaboration de la matière moléculaire
JALONS de la CHIMIE MOLÉCULAIRE



  URÉE

       O


H2N          NH2
                   Friedrich
      1828         WÖHLER
                   (1800-1882)
VITAMINE B12




                   Robert           Albert
                  WOODWARD      ESCHENMOSER
                  (1917-1979)      (1925- )
    1972 (1976)
Alban BERG

                                     Opéra WOZZECK
                                                       Op. 7



Docteur

                                  Il y a une révolution dans la science      albumine




           graisses      hydrates de carbone       et notamment
                                                                          oxyaldéhyde anhydride
                                                                                    !!
          Acte I – Scène 4
GLOBULE BLANC et des
DEUX CELLULES TUEUSES et   PARTICULES du VIRUS VIH
UNE CELLULE CANCÉREUSE
La Chimie de la Liaison Non-covalente
 Mise en œuvre des interactions entre molécules
  CHIMIE PAR-DELÀ LA MOLÉCULE
CHIMIE SUPRAMOLÉCULAIRE
                     Á LA




     CHIMIE MOLÉCULAIRE
                    DE LA
De la Complexation sélective de cations à la notion de

    RECONNAISSANCE MOLÉCULAIRE

Requiert des     INTERACTIONS       pour LIER
         de l’   INFORMATION         pour SÉLECTIONNER

                                    géométrique
        COMPLÉMENTARITÉ
                                    interactionelle

                      PRÉORGANISATION
                    “SCHLOSS und SCHLÜSSEL”
                         SERRURE et CLÉ
                                         Emil FISCHER 1894
Emil
     FISCHER
      (1852-1919)




       CLÉ ET
      SERRURE
         (1894)



Doctorat, Strasbourg 1874
Habilitation, München 1878
La DOUBLE HÉLICE
    des ACIDES NUCLÉIQUES
                                                          PROGRAMME
                                                          GÉNÉTIQUE
                          H
                              N
                                  H                       écrit avec
    O                 N C C N             A               QUATRE LETTRES
O
                 HC
                      N
                          C       C
                                      H
                                                          MOLÉCULAIRES
    P    O                    N

    OH           O


             O                    N
                                              O

                                                  N
                                                      H   G
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                                          O                       N       C
                                  O       P O                 N       O
                                                          O
                                          O
                                                      O
                                              O       P O

                                                      O
Formation prébiotique
Auto-Organisation Prébiotique
                                               des composants des
 de la Matière Moléculaire                      Molécules de la Vie


    5 HCN ……….                                ……….         ACIDES
                                                         NUCLÉIQUES

                           Adénine
                         une des quatre
                         bases de l’ADN

     O                                    R       O
R    CH + HC   N + H2O   …….    H2N       C   C
                                                       ……. PROTÉINES
                                                  OH
                                          H

                                 AMINO ACIDES
LECTURE DU PROGRAMME GÉNÉTIQUE
   par FORMATION de PAIRES de NUCLÉOBASES par
            ADÉNINE     URACILE / THYMINE




 DEUX

                                            RECONNAISSANCE
 LIAISONS                                     MOLÉCULAIRE
HYDROGÈNE     GUANINE       CYTOSINE        par INTERACTION
                                            (LIAISONS HYDROGÈNE)
                                           entre SITES
 TROIS                                  COMPLÉMENTAIRES
La CHIMIE :   une SCIENCE de l’INFORMATION


  SCIENCE de la MATIÈRE INFORMÉE


STOCKAGE MOLÉCULAIRE
TRAITEMENT SUPRAMOLÉCULAIRE
                      de l’INFORMATION
RECONNAISSANCE MOLÉCULAIRE




                                         Association

             +                           Sélection


                 Récepteur Moléculaire                 Entité Supramoléculaire




Substrats



Trois CLÉS et la SERRURE
Les CATIONS des MÉTAUX ALCALINS
                  Substrats Sphériques




                 Na+          K+          Rb+           Cs+
  Li+
               Sodium     Potassium     Rubidium      Césium
Lithium




    Une série d’espèces sphériques de taille croissante

  RECONNAISSANCE MOLÉCULAIRE SPHÉRIQUE
CRYPTANTS et CRYPTATES




           RECONNAISSANCE SPHÉRIQUE




Complémentarité de forme et de taille entre Cavité et Cation
Béla VÍZI (1936- )   Université de Veszprém
APPLICATIONS en SCIENCES de la VIE


  Découverte de substances biologiquement actives / MÉDICAMENTS
  Reconnaissance moléculaire entre une molécule synthétique
  et une cible biologique


 Dévelopement de marqueurs optiques pour le DIAGNOSTIC MÉDICAL


 TRANSFERT de GÈNES
Technologie Optique pour le DIAGNOSTIC MÉDICAL

 Cryptate d’Europium MARQUEUR pour le DIAGNOSTIC MÉDICAL
Une « Nano-Ampoule »
pour le Diagnostic Médical Système d’ Immuno-analyse




   LUMINESCENCE                                           KRYPTOR®
   ROUGE FORTE                                               Cézanne Co.
                             Dr. Gérard Mathis CisBio International
TRANSFERT de GÈNES à travers la Membrane Cellulaire
 par des VECTEURS SYNTHÉTIQUES



              Cytoplasme                  ARN
                           Noyau

                                                    Protéine



                              Mise au point d’agents artificiels de
                                   transfert de gènes pour
Gène    ADN                la biotechnologie et la thérapie génique
                   Transfert de Gènes dans une Cellule Eukaryote
     Vecteur       Une molécule polyanionique (ADN) est transportée à travers
    synthétique      la membrane cytoplasmique et la membrane nucléaire
                    et est finalement exprimée en la protéine correspondante .
CELLULES GÉNÉTIQUEMENT MODIFIÉES par
TRANSFERT de GÈNE à l’aide de VECTEURS ARTIFICIELS

 TRANSFERT de GÈNE in vitro                  TRANSFERT de GÈNE In vivo
CELLULES PRIMAIRES HUMAINES                  CELLULES ÉPITHÉLIALES des
        (de polypes du nez)                  VOIES AÉRIENNES de SOURIS
                                                (par instillation intratrachéale)




             Expression de la -galactosidase (cellules bleues)
                                                               Pierre LEHN et al.
Génération d’architectures supramoléculaires
spontanée mais contrôlée par l’information moléculaire
 mise en œuvre dans la reconnaissance moléculaire

   L’   AUTO-ORGANISATION



         Par delà la Pré-organisation
    CHIMIE SUPRAMOLÉCULAIRE
AUTO-ASSEMBLAGE du VIRUS de la MOSAÏQUE du TABAC




    à partir de 2130 sous-unités protéiques + 1 molécule d’ARN viral
AUTO-ORGANISATION
      SYSTÈMES CHIMIQUES PROGRAMMÉS

Le PROGRAMME est MOLÉCULAIRE

             Sa MISE en OEUVRE est SUPRAMOLÉCULAIRE

L‘INFORMATION est stockée
dans les COMPOSANTS
                       Son TRAITEMENT s’effectue via un ensemble
                       d’interactions et suivant un ALGORITHME de
                       RECONNAISSANCE MOLÉCULAIRE

               Étapes d'opération :   Reconnaissance
                                      Croissance
                                      Terminaison
AUTO-ORGANISATION
         d’ ARCHITECTURES
     MÉTALLOSUPRAMOLÉCULAIRES


ÉLÉMENTS / BRIQUES MOLÉCULAIRES

CONNECTIONS / CIMENT : CATIONS MÉTALLIQUES

        Génération spontanée mais contrôlée
         d’architectures supramoléculaires
DOUBLE
         HÉLICATES         TRIPLE


          Architectures
          Hélicoïdales
         Auto-organisées
AUTO-ORGANISATION
 d’ Architectures de type GRILLE


               Molécules
                                 Ions
                              métalliques




  STRUCTURE d’une
    GRILLE [3x3]
  AUTOORGANISÉE
6 MOLÉCULES ORGANIQUES +
9 CATIONS MÉTALLIQUES Ag(I)
NANOCYLINDRE

 AUTOORGANISÉ
en une seule opération
     à partir de

3 MOLÉCULES
  LINEAIRES
4 MOLÉCULES
  PLANES
12 CATIONS
   MÉTALLIQUES
   Cu(I)

19 composants
 de trois types !
NANOSCIENCE et NANOTECHNOLOGIE

  AUTO-ORGANISATION PROGRAMMÉE


génération spontanée et contrôlée      bien définies
                                       de grande taille
d’architectures supramoléculaires      complexes
                                       organisées
                                       fonctionnelles

une puissante alternative ou un complément à la
NANOFABRICATION et à la NANOMANIPULATION

 De la FABRICATION à l’AUTO-FABRICATION
                               L’Ultime Fabrication !
La CHIMIE SUPRAMOLÉCULAIRE s’ouvre sur une
 CHIMIE CONSTITUTIONNELLE DYNAMIQUE
        capable de modifier la CONSTITUTION de ses objets
                   par échange de composants
 du fait de la RÉVERSIBILITÉ des connections entre composants

permettant une ADAPTATION par VARIATION CONSTITUTIONELLE




    recherche de SUBSTANCES BIOLOGIQUEMENT ACTIVES
    auto-organisation de NANOSTRUCTURES DYNAMIQUES
    développement de MATÉRIAUX DYNAMIQUES
Recherche Dynamique de SUBSTANCES à ACTIVITÉ BIOLOGIQUE
     Sélection Dynamique par Reconnaissance Moléculaire
 BIBLIOTHÈQUE                Constituants                   EXPRESSION
 COMBINATOIRE                                              SÉLECTION d’un
  DYNAMIQUE                                                CONSTITUANT

         Génération
         de Diversité                                      Sélection par le Récepteur
                                                           du constituant le mieux lié
Composants                Ensemble de constituants
                            en interconversion

                                                     Clé/Serrure

Fragments
  initiaux                                                         La Serrure
                                                                   assemble
                                                                    Sa Clé

  Sélection par le récepteur/serrure du constituant/clé optimal parmi tous les
  constituants/combinaisons/clés possibles formant la bibliothèque dynamique
AUTO-ORGANISATION



par DESSEIN      avec SÉLECTION
 INFORMATION         DIVERSITÉ
PROGRAMMATION        DYNAMIQUE



                   ADAPTATION
                CHIMIE ADAPTATIVE
AUTO-ORGANISATION

  CONCEPTION       DYNAMIQUE           SÉLECTION

     CHIMIE        GÉNÉRATION
SUPRAMOLÉCULAIRE   de DIVERSITÉ
                     CHIMIE
                   ADAPTATIVE
                                     une CHIMIE
                                      ADAPTATIVE
     CHIMIE
  MOLÉCULAIRE                         ÉVOLUTIVE

                                  DARWINIENNE !
AUTO-ORGANISATION
Étapes vers la MATIÈRE COMPLEXE

                     LES PROCESSUS QUI
DÉCRIRE
                     ONT CONDUIT À
COMPRENDRE
                     ONT LIEU DANS


CRÉER DE NOUVELLES         la MATIÈRE
FORMES / EXPRESSIONS de     COMPLEXE
 ORGANISÉE – VIVANTE – PENSANTE !
« Là dove natura finisce di produrre le
sue spezie, quivi l'uomo comincia con le
 cose naturali, con l'auditorio di essa
  natura, a creare infinite spezie. »
                       Leonardo da Vinci


   « Là où la nature cesse de produire
 ses propres espèces, l'homme, en se
  servant des choses naturelles, en accord
avec cette nature même, commence à
    créer une infinité d'espèces. »
                      Léonard de Vinci
L’ESSENCE de la CHIMIE
     n’est pas juste de découvrir mais de
                     CRÉER
           La CHIMIE a la capacité de
CRÉER de NOUVELLES EXPRESSIONS de la MATIÈRE



   Le LIVRE de la CHIMIE n’est pas juste à lire,
                  il est à ÉCRIRE

La PARTITION de la CHIMIE n’est pas juste à jouer,
           elle est à COMPOSER
LA CHIMIE

Auguste
RODIN

(1840-1917)




              ART de la MATIÈRE
PROMÉTHÉE
      A CONQUIS LE FEU ;
  nous ne pouvons pas le rendre .

    Notre chemin nous mène de
 l’ARBRE DE LA CONNAISSANCE
               au
CONTRÔLE DE NOTRE DESTINÉE !
Lucas CRANACH
          L’Ancien

           (1472-1553)




               Ève
   a osé cueillir le fruit défendu
  de l’Arbre de la Connaissance :

La Naissance de la Science           !
Futur.....?




Présent.....




Passé.......
13.7 billion years
                                HOMO
                     SAPIENS            BIONICUS



                                       Et après


                                           ?
                                   vers la tenue d’Ève ??

                      Auguste
                      RODIN
David HILBERT
  (1862-1943)
WIR MÜSSEN WISSEN
WIR WERDEN WISSEN

 NOUS DEVONS SAVOIR
  NOUS SAURONS

           David HILBERT
Ludwig van Beethoven : Symphonie Nr. 9 D-Moll Op. 125
               Ode an die Freude
La CHIMIE SUPRAMOLÉCULAIRE
               est une CHIMIE DYNAMIQUE, capable de
 modifier la CONSTITUTION de ses objets par échange de composants
du fait de la RÉVERSIBILITÉ des INTERACTIONS NON-COVALENTES
permettant une ADAPTATION par VARIATION CONSTITUTIONELLE

     IMPORTER cette DYNAMIQUE dans la CHIMIE MOLÉCULAIRE
        par introduction de LIAISONS COVALENTES RÉVERSIBLES




  CHIMIE DYNAMIQUE CONSTITUTIONELLE
        MOLÉCULAIRE / COVALENTE autant que
        SUPRAMOLÉCULAIRE / NON-COVALENTE
Iheronimus
        BRÜSCHWICK
             (1424?-1534)


 Liber de arte distillandi, de simplicibus.
Das buch der rechten kunst zu distilieren
           die eintzigen ding.
               Strassburg:
     Johann (Reinhard) Grüninger,
               8 May 1500.


       Liber de arte Distillandi
             de Compositis
     Das buch der waren kunst
    zu distillieren die Compositis
      Imprimé par Johann Grüninger
           à Strasbourg en 1512
PARACELSE

         Aureolus
         Philippus
       Theophrastus
       Bombastus
     Von HOHENHEIM
(Einsiedeln 1493- Salzbourg 1541)


     Citoyen de Strasbourg
           1527-1528
PARACELSE

         Aureolus
         Philippus
       Theophrastus
       Bombastus
     Von HOHENHEIM
(Einsiedeln 1493- Salzbourg 1541)


     Citoyen de Strasbourg
           1527-1528


                                    Cimetière St. Sebastian Salzbourg
Emil VOTOČEK

           (1872–1950)

    Chimiste et Compositeur
Études à l’École de Chimie de Mulhouse
      Professeur à l’Université de
   Technologie Chimique de Prague
       Chimie des sucres
 Introduction du Concept d’épimérie




                                         69
Emil VOTOČEK

          (1872–1950)

    Chimiste et Compositeur




Études à l’École de Chimie de Mulhouse
     Professeur à l’Université de
   Technologie Chimique de Prague


          Chimie des sucres
 Introduction du concept d’épimérie

            29 Lieder
      26 autres compositions

                                         70
CHIMIE DYNAMIQUE CONSTITUTIONNELLE

                                 SUPRAMOLÉCULAIRE
génère de la DIVERSITÉ DYNAMIQUE et MOLÉCULAIRE

rend possible la SÉLECTION
permet l’ ADAPTATION

 recherche de SUBSTANCES BIOLOGIQUEMENT ACTIVES

 auto-organisation de NANOSTRUCTURES DYNAMIQUES

 développement de MATÉRIAUX DYNAMIQUES / Dynamères

                SYSTÈMES ADAPTATIFS
   Matériaux Adaptatifs / Technologies Adaptatives
De l’ATOME à la MOLÉCULE

      La CHIMIE MOLÉCULAIRE




Maîtrise de l’élaboration de la matière moléculaire
Mise en œuvre des interactions entre molécules
 CHIMIE PAR-DELÀ LA MOLÉCULE
CHIMIE SUPRAMOLÉCULAIRE
                    Á LA




    CHIMIE MOLÉCULAIRE
                   DE LA
AUTO-ORGANISATION
dirigée par RECONNAISSANCE MOLÉCULAIRE




        par delà la Pré-organisation
    CHIMIE SUPRAMOLÉCULAIRE
CHIMIE SUPRAMOLÉCULAIRE



        CHIMIE PAR DELÀ LA MOLÉCULE

CHIMIE des INTERACTION MOLÉCULAIRES
                        et de la LIAISON INTERMOLÉCULAIRE

CHIMIE des SYSTÈMES basés sur la
                   CHIMIE des ESPÈCES et des INTERACTIONS


   RECONNAISSANCE, RÉACTIVITÉ et TRANSPORT
                   (CATALYSE)
SYSTÈMES CHIMIQUES PROGRAMMÉS

Le PROGRAMME est MOLÉCULAIRE

                    Sa MISE en OEUVRE est SUPRAMOLÉCULAIRE

L‘INFORMATION est stockée
dans les COMPOSANTS
                       Son TRAITEMENT s’effectue via un ensemble
                       d’interactions et suivant un ALGORITHME de
                       RECONNAISSANCE MOLÉCULAIRE

               Étapes d'opération :   Reconnaissance
                                      Croissance
                                      Terminaison
WIR MÜSSEN WISSEN
WIR WERDEN WISSEN

 NOUS DEVONS SAVOIR
  NOUS SAURONS

           David HILBERT
OBC | From matter to life: Chemistry? Chemistry!

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OBC | From matter to life: Chemistry? Chemistry!

  • 1. La Vie sur Terre d’années 13.7 miliards Le « Big Bang » La Chimie commence ici European Event MARIBOR 2012 PHYSIQUE CHIMIE BIOLOGIE 1st Out of the Box Conference Pensée La Université de Maribor 18 Mai 2012 De la Matière à la Vie : Chimie ? Chimie !
  • 2. ÉVOLUTION de l’ UNIVERS Information ? Complexité pensante vivante Matière organisée condensée divisée Temps ÉVOLUTION vers la MATIÈRE COMPLEXE ÉVOLUTION de la MATIÈRE sous la PRESSION de l’ INFORMATION
  • 3. LA COMMENT LAPRIMORDIALE QUESTION MATIERE DEVIENT-ELLE COMPLEXE De la particule élémentaire à l’organisme pensant ? - Comment la matière est-elle devenue complexe dans l’histoire de l’univers jusqu’à l’évolution du monde biologique et de la pensée ? - Quelles formes plus élevées de la matière complexe reste-t-il à créer ? CHIMIE PHYSIQUE BIOLOGIE Les lois de Les règles de l’Univers La Vie La CHIMIE établit le pont
  • 4. L’ AUTO-ORGANISATION comme Impératif Cosmique MATIÈRE DIVISÉE – CONDENSÉE – ORGANISÉE VIVANTE – PENSANTE ! LE CHEMIN VERS LA COMPLEXITÉ La réponse à la question
  • 5. AUTO-ORGANISATION COSMIQUE ORIGINE de la GRAVITATION STRUCTURE COSMIQUE Structuration de l’univers par les forces gravitationnelles opérant sur des inhomogénéités en densité ou en vitesse d’expansion à une époque très précoce, juste après le « big bang » AUTO-ORGANISATION de l’UNIVERS
  • 6. AUTO-ORGANISATION de la MATIÈRE ORIGINE de la FORCES MATIÈRE COMPLEXE ÉLECTROMAGNÉTIQUES Structuration de la matière atomique et moléculaire par les forces électromagnétiques opérant sur des combinaisons structurales aléatoires AUTO-ORGANISATION de la MATIÈRE NON-VIVANTE et VIVANTE
  • 7. ÉVOLUTION CHIMIQUE PRÉBIOTIQUE AUTO-ORGANISATION de la MATIÈRE MOLÉCULAIRE NON-VIVANTE Les forces électromagnétiques opèrent une sélection sur la diversité structurale conduisant à une complexification progressive de la matière du monde non-vivant au monde vivant sous la pression de l’information. GÉNÉRALISATION DE L’ÉVOLUTION DARWINIENNE Évolution chimique sous l’action des forces intra- et intermoléculaires mettant en œuvre l’information moléculaire. CHIMIE PRÉ-BIOTIQUE
  • 8. La CHIMIE SCIENCE de la STRUCTURE de la MATIÈRE NON-VIVANTE et de la et TRANSFORMATION VIVANTE
  • 9. EMPÉDOCLE FEU DÉMOCRITE (-490, -435) (-460,-370) Les sec chaud ÉLÉMENTS Les ATOMES TERRE AIR froid humide EAU
  • 10. 1718
  • 11. Sur les Relations entre les Propriétés et les Poids Atomiques des Éléments Dimitri D. Mendelejeff, MENDELÉEV (1869) Zeitschrift für Chemie 12, 405-6 TABLEAU (1834-1907) PÉRIODIQUE DES ÉLÉMENTS 1869
  • 12. Les BRIQUES de la MATIÈRE TABLEAU PÉRIODIQUE des ÉLÉMENTS Le Terrain de Jeu de la Chimie !
  • 13. Alexandre BORODINE (1833-1887) chimiste compositeur Ami de Mendeleev - Congrès de Karlsruhe septembre 1860 Réaction de Borodine - Hundsdiecker Opéra Prince Igor 2 Symphonies 2 Quatuors 1872 Condensation Aldolique Borodine et Wurtz O O OH 1 Quintette O etc... + R CH3 H R' R R'
  • 14. Antoine Laurent LAVOISIER (1743-1794) L’ ÉQUATION de la RÉACTION CHIMIQUE
  • 15. De la composition à la connectivité FORMULES CHIMIQUES Essais de représentation des connexions (liaisons) entre les briques de base, les éléments/atomes formant une molécule
  • 16. Jacobus Henricus VAN’T HOFF Joseph-Achille LE BEL (1852-1911) (1847- 1930) STÉRÉOCHIMIE / CHIMIE DANS L’ESPACE
  • 17. Louis PASTEUR (1822-1895) à Strasbourg de 1849 à 1854 CHIRALITÉ MOLÉCULAIRE
  • 18. La CHIMIE MOLÉCULAIRE La Chimie de la Liaison Covalente De l’ATOME à la MOLÉCULE Maîtrise de l’élaboration de la matière moléculaire
  • 19. JALONS de la CHIMIE MOLÉCULAIRE URÉE O H2N NH2 Friedrich 1828 WÖHLER (1800-1882)
  • 20. VITAMINE B12 Robert Albert WOODWARD ESCHENMOSER (1917-1979) (1925- ) 1972 (1976)
  • 21. Alban BERG Opéra WOZZECK Op. 7 Docteur Il y a une révolution dans la science albumine graisses hydrates de carbone et notamment oxyaldéhyde anhydride !! Acte I – Scène 4
  • 22. GLOBULE BLANC et des DEUX CELLULES TUEUSES et PARTICULES du VIRUS VIH UNE CELLULE CANCÉREUSE
  • 23. La Chimie de la Liaison Non-covalente Mise en œuvre des interactions entre molécules CHIMIE PAR-DELÀ LA MOLÉCULE CHIMIE SUPRAMOLÉCULAIRE Á LA CHIMIE MOLÉCULAIRE DE LA
  • 24. De la Complexation sélective de cations à la notion de RECONNAISSANCE MOLÉCULAIRE Requiert des INTERACTIONS pour LIER de l’ INFORMATION pour SÉLECTIONNER géométrique COMPLÉMENTARITÉ interactionelle PRÉORGANISATION “SCHLOSS und SCHLÜSSEL” SERRURE et CLÉ Emil FISCHER 1894
  • 25. Emil FISCHER (1852-1919) CLÉ ET SERRURE (1894) Doctorat, Strasbourg 1874 Habilitation, München 1878
  • 26. La DOUBLE HÉLICE des ACIDES NUCLÉIQUES PROGRAMME GÉNÉTIQUE H N H écrit avec O N C C N A QUATRE LETTRES O HC N C C H MOLÉCULAIRES P O N OH O O N O N H G N H O P O N N O H O O O N H T O P O N O O O H H N O N C O P O N O O O O O P O O
  • 27. Formation prébiotique Auto-Organisation Prébiotique des composants des de la Matière Moléculaire Molécules de la Vie 5 HCN ………. ………. ACIDES NUCLÉIQUES Adénine une des quatre bases de l’ADN O R O R CH + HC N + H2O ……. H2N C C ……. PROTÉINES OH H AMINO ACIDES
  • 28. LECTURE DU PROGRAMME GÉNÉTIQUE par FORMATION de PAIRES de NUCLÉOBASES par ADÉNINE URACILE / THYMINE DEUX RECONNAISSANCE LIAISONS MOLÉCULAIRE HYDROGÈNE GUANINE CYTOSINE par INTERACTION (LIAISONS HYDROGÈNE) entre SITES TROIS COMPLÉMENTAIRES
  • 29. La CHIMIE : une SCIENCE de l’INFORMATION SCIENCE de la MATIÈRE INFORMÉE STOCKAGE MOLÉCULAIRE TRAITEMENT SUPRAMOLÉCULAIRE de l’INFORMATION
  • 30. RECONNAISSANCE MOLÉCULAIRE Association + Sélection Récepteur Moléculaire Entité Supramoléculaire Substrats Trois CLÉS et la SERRURE
  • 31. Les CATIONS des MÉTAUX ALCALINS Substrats Sphériques Na+ K+ Rb+ Cs+ Li+ Sodium Potassium Rubidium Césium Lithium Une série d’espèces sphériques de taille croissante RECONNAISSANCE MOLÉCULAIRE SPHÉRIQUE
  • 32. CRYPTANTS et CRYPTATES RECONNAISSANCE SPHÉRIQUE Complémentarité de forme et de taille entre Cavité et Cation
  • 33. Béla VÍZI (1936- ) Université de Veszprém
  • 34. APPLICATIONS en SCIENCES de la VIE Découverte de substances biologiquement actives / MÉDICAMENTS Reconnaissance moléculaire entre une molécule synthétique et une cible biologique Dévelopement de marqueurs optiques pour le DIAGNOSTIC MÉDICAL TRANSFERT de GÈNES
  • 35. Technologie Optique pour le DIAGNOSTIC MÉDICAL Cryptate d’Europium MARQUEUR pour le DIAGNOSTIC MÉDICAL Une « Nano-Ampoule » pour le Diagnostic Médical Système d’ Immuno-analyse LUMINESCENCE KRYPTOR® ROUGE FORTE Cézanne Co. Dr. Gérard Mathis CisBio International
  • 36. TRANSFERT de GÈNES à travers la Membrane Cellulaire par des VECTEURS SYNTHÉTIQUES Cytoplasme ARN Noyau Protéine Mise au point d’agents artificiels de transfert de gènes pour Gène ADN la biotechnologie et la thérapie génique Transfert de Gènes dans une Cellule Eukaryote Vecteur Une molécule polyanionique (ADN) est transportée à travers synthétique la membrane cytoplasmique et la membrane nucléaire et est finalement exprimée en la protéine correspondante .
  • 37. CELLULES GÉNÉTIQUEMENT MODIFIÉES par TRANSFERT de GÈNE à l’aide de VECTEURS ARTIFICIELS TRANSFERT de GÈNE in vitro TRANSFERT de GÈNE In vivo CELLULES PRIMAIRES HUMAINES CELLULES ÉPITHÉLIALES des (de polypes du nez) VOIES AÉRIENNES de SOURIS (par instillation intratrachéale) Expression de la -galactosidase (cellules bleues) Pierre LEHN et al.
  • 38. Génération d’architectures supramoléculaires spontanée mais contrôlée par l’information moléculaire mise en œuvre dans la reconnaissance moléculaire L’ AUTO-ORGANISATION Par delà la Pré-organisation CHIMIE SUPRAMOLÉCULAIRE
  • 39. AUTO-ASSEMBLAGE du VIRUS de la MOSAÏQUE du TABAC à partir de 2130 sous-unités protéiques + 1 molécule d’ARN viral
  • 40. AUTO-ORGANISATION SYSTÈMES CHIMIQUES PROGRAMMÉS Le PROGRAMME est MOLÉCULAIRE Sa MISE en OEUVRE est SUPRAMOLÉCULAIRE L‘INFORMATION est stockée dans les COMPOSANTS Son TRAITEMENT s’effectue via un ensemble d’interactions et suivant un ALGORITHME de RECONNAISSANCE MOLÉCULAIRE Étapes d'opération : Reconnaissance Croissance Terminaison
  • 41. AUTO-ORGANISATION d’ ARCHITECTURES MÉTALLOSUPRAMOLÉCULAIRES ÉLÉMENTS / BRIQUES MOLÉCULAIRES CONNECTIONS / CIMENT : CATIONS MÉTALLIQUES Génération spontanée mais contrôlée d’architectures supramoléculaires
  • 42. DOUBLE HÉLICATES TRIPLE Architectures Hélicoïdales Auto-organisées
  • 43. AUTO-ORGANISATION d’ Architectures de type GRILLE Molécules Ions métalliques STRUCTURE d’une GRILLE [3x3] AUTOORGANISÉE 6 MOLÉCULES ORGANIQUES + 9 CATIONS MÉTALLIQUES Ag(I)
  • 44. NANOCYLINDRE AUTOORGANISÉ en une seule opération à partir de 3 MOLÉCULES LINEAIRES 4 MOLÉCULES PLANES 12 CATIONS MÉTALLIQUES Cu(I) 19 composants de trois types !
  • 45. NANOSCIENCE et NANOTECHNOLOGIE AUTO-ORGANISATION PROGRAMMÉE génération spontanée et contrôlée bien définies de grande taille d’architectures supramoléculaires complexes organisées fonctionnelles une puissante alternative ou un complément à la NANOFABRICATION et à la NANOMANIPULATION De la FABRICATION à l’AUTO-FABRICATION L’Ultime Fabrication !
  • 46. La CHIMIE SUPRAMOLÉCULAIRE s’ouvre sur une CHIMIE CONSTITUTIONNELLE DYNAMIQUE capable de modifier la CONSTITUTION de ses objets par échange de composants du fait de la RÉVERSIBILITÉ des connections entre composants permettant une ADAPTATION par VARIATION CONSTITUTIONELLE recherche de SUBSTANCES BIOLOGIQUEMENT ACTIVES auto-organisation de NANOSTRUCTURES DYNAMIQUES développement de MATÉRIAUX DYNAMIQUES
  • 47. Recherche Dynamique de SUBSTANCES à ACTIVITÉ BIOLOGIQUE Sélection Dynamique par Reconnaissance Moléculaire BIBLIOTHÈQUE Constituants EXPRESSION COMBINATOIRE SÉLECTION d’un DYNAMIQUE CONSTITUANT Génération de Diversité Sélection par le Récepteur du constituant le mieux lié Composants Ensemble de constituants en interconversion Clé/Serrure Fragments initiaux La Serrure assemble Sa Clé Sélection par le récepteur/serrure du constituant/clé optimal parmi tous les constituants/combinaisons/clés possibles formant la bibliothèque dynamique
  • 48. AUTO-ORGANISATION par DESSEIN avec SÉLECTION INFORMATION DIVERSITÉ PROGRAMMATION DYNAMIQUE ADAPTATION CHIMIE ADAPTATIVE
  • 49. AUTO-ORGANISATION CONCEPTION DYNAMIQUE SÉLECTION CHIMIE GÉNÉRATION SUPRAMOLÉCULAIRE de DIVERSITÉ CHIMIE ADAPTATIVE une CHIMIE ADAPTATIVE CHIMIE MOLÉCULAIRE ÉVOLUTIVE DARWINIENNE !
  • 50. AUTO-ORGANISATION Étapes vers la MATIÈRE COMPLEXE LES PROCESSUS QUI DÉCRIRE ONT CONDUIT À COMPRENDRE ONT LIEU DANS CRÉER DE NOUVELLES la MATIÈRE FORMES / EXPRESSIONS de COMPLEXE ORGANISÉE – VIVANTE – PENSANTE !
  • 51. « Là dove natura finisce di produrre le sue spezie, quivi l'uomo comincia con le cose naturali, con l'auditorio di essa natura, a creare infinite spezie. » Leonardo da Vinci « Là où la nature cesse de produire ses propres espèces, l'homme, en se servant des choses naturelles, en accord avec cette nature même, commence à créer une infinité d'espèces. » Léonard de Vinci
  • 52. L’ESSENCE de la CHIMIE n’est pas juste de découvrir mais de CRÉER La CHIMIE a la capacité de CRÉER de NOUVELLES EXPRESSIONS de la MATIÈRE Le LIVRE de la CHIMIE n’est pas juste à lire, il est à ÉCRIRE La PARTITION de la CHIMIE n’est pas juste à jouer, elle est à COMPOSER
  • 54. PROMÉTHÉE A CONQUIS LE FEU ; nous ne pouvons pas le rendre . Notre chemin nous mène de l’ARBRE DE LA CONNAISSANCE au CONTRÔLE DE NOTRE DESTINÉE !
  • 55. Lucas CRANACH L’Ancien (1472-1553) Ève a osé cueillir le fruit défendu de l’Arbre de la Connaissance : La Naissance de la Science !
  • 57. 13.7 billion years HOMO SAPIENS BIONICUS Et après ? vers la tenue d’Ève ?? Auguste RODIN
  • 58. David HILBERT (1862-1943)
  • 59. WIR MÜSSEN WISSEN WIR WERDEN WISSEN NOUS DEVONS SAVOIR NOUS SAURONS David HILBERT
  • 60.
  • 61.
  • 62. Ludwig van Beethoven : Symphonie Nr. 9 D-Moll Op. 125 Ode an die Freude
  • 63.
  • 64.
  • 65. La CHIMIE SUPRAMOLÉCULAIRE est une CHIMIE DYNAMIQUE, capable de modifier la CONSTITUTION de ses objets par échange de composants du fait de la RÉVERSIBILITÉ des INTERACTIONS NON-COVALENTES permettant une ADAPTATION par VARIATION CONSTITUTIONELLE IMPORTER cette DYNAMIQUE dans la CHIMIE MOLÉCULAIRE par introduction de LIAISONS COVALENTES RÉVERSIBLES CHIMIE DYNAMIQUE CONSTITUTIONELLE MOLÉCULAIRE / COVALENTE autant que SUPRAMOLÉCULAIRE / NON-COVALENTE
  • 66. Iheronimus BRÜSCHWICK (1424?-1534) Liber de arte distillandi, de simplicibus. Das buch der rechten kunst zu distilieren die eintzigen ding. Strassburg: Johann (Reinhard) Grüninger, 8 May 1500. Liber de arte Distillandi de Compositis Das buch der waren kunst zu distillieren die Compositis Imprimé par Johann Grüninger à Strasbourg en 1512
  • 67. PARACELSE Aureolus Philippus Theophrastus Bombastus Von HOHENHEIM (Einsiedeln 1493- Salzbourg 1541) Citoyen de Strasbourg 1527-1528
  • 68. PARACELSE Aureolus Philippus Theophrastus Bombastus Von HOHENHEIM (Einsiedeln 1493- Salzbourg 1541) Citoyen de Strasbourg 1527-1528 Cimetière St. Sebastian Salzbourg
  • 69. Emil VOTOČEK (1872–1950) Chimiste et Compositeur Études à l’École de Chimie de Mulhouse Professeur à l’Université de Technologie Chimique de Prague Chimie des sucres Introduction du Concept d’épimérie 69
  • 70. Emil VOTOČEK (1872–1950) Chimiste et Compositeur Études à l’École de Chimie de Mulhouse Professeur à l’Université de Technologie Chimique de Prague Chimie des sucres Introduction du concept d’épimérie 29 Lieder 26 autres compositions 70
  • 71. CHIMIE DYNAMIQUE CONSTITUTIONNELLE SUPRAMOLÉCULAIRE génère de la DIVERSITÉ DYNAMIQUE et MOLÉCULAIRE rend possible la SÉLECTION permet l’ ADAPTATION recherche de SUBSTANCES BIOLOGIQUEMENT ACTIVES auto-organisation de NANOSTRUCTURES DYNAMIQUES développement de MATÉRIAUX DYNAMIQUES / Dynamères SYSTÈMES ADAPTATIFS Matériaux Adaptatifs / Technologies Adaptatives
  • 72. De l’ATOME à la MOLÉCULE La CHIMIE MOLÉCULAIRE Maîtrise de l’élaboration de la matière moléculaire
  • 73. Mise en œuvre des interactions entre molécules CHIMIE PAR-DELÀ LA MOLÉCULE CHIMIE SUPRAMOLÉCULAIRE Á LA CHIMIE MOLÉCULAIRE DE LA
  • 74. AUTO-ORGANISATION dirigée par RECONNAISSANCE MOLÉCULAIRE par delà la Pré-organisation CHIMIE SUPRAMOLÉCULAIRE
  • 75. CHIMIE SUPRAMOLÉCULAIRE CHIMIE PAR DELÀ LA MOLÉCULE CHIMIE des INTERACTION MOLÉCULAIRES et de la LIAISON INTERMOLÉCULAIRE CHIMIE des SYSTÈMES basés sur la CHIMIE des ESPÈCES et des INTERACTIONS RECONNAISSANCE, RÉACTIVITÉ et TRANSPORT (CATALYSE)
  • 76. SYSTÈMES CHIMIQUES PROGRAMMÉS Le PROGRAMME est MOLÉCULAIRE Sa MISE en OEUVRE est SUPRAMOLÉCULAIRE L‘INFORMATION est stockée dans les COMPOSANTS Son TRAITEMENT s’effectue via un ensemble d’interactions et suivant un ALGORITHME de RECONNAISSANCE MOLÉCULAIRE Étapes d'opération : Reconnaissance Croissance Terminaison
  • 77. WIR MÜSSEN WISSEN WIR WERDEN WISSEN NOUS DEVONS SAVOIR NOUS SAURONS David HILBERT