ecoQuery : <br />a Semantic Module to Query Biodiversity Data on the Web<br />Authors : Julie Chabalier, Olivier Coullet, ...
ecoQuery : <br />a Semantic Module to Query Biodiversity Data on the Web<br />Problématique<br />Solution technique<br />R...
Contexte<br />Millenium assessment<br />UN Secretary-General 2000:  Kofi Annan<br />Key Factors of Successful Responses to...
DATA<br />
Données de biodiversitédisponibles & exploitables<br />DATA<br />http://imgs.xkcd.com/comics/desert_island.png<br />
DATA<br /><ul><li>Grande Diversité (Biologie, Climatologie, Pédologie)
Différentes échelles (temps, espace)
Volume important </li></ul>+ Cout d'acquisition important<br />
ecoQuery<br />Offrir un outil qui permette d’extraire et d’exploiter des données hétérogènes<br />Comment ?<br /><ul><li>T...
IHM riche et conviviale</li></li></ul><li>Web sémantique<br />« The Semantic Web is an extension of the current web in whi...
Link Open Data<br /><ul><li>Identification des éléments par un URI
Utilisation d'URI HTTP déréférençables
Mise à disposition des informations en RDF
Ajouter des liens RDF vers les autres URIs</li></li></ul><li>
ecoQuery: Assistant<br /><ul><li>Temps
Espace
Ressource (Observateur)
Taxon</li></ul>ecoQuery<br />REST<br />SPARQL<br />SQL<br />
EcoQuery : Requête<br />ecoQuery<br />PREFIXdwc:<http://rs.tdwg/org/dwc/terms/#><br />PREFIXrdf:<http://www.w3.org/1999/02...
Interface Riche<br />Outils<br />Carte<br />Données<br />
Mashup<br />
Mise en oeuvre<br />Resultat<br />
Cas d'utilisation<br />Crue <br />Dispositifs de protection contre les crues (Sénas, Cheval Blanc)<br />Impact sur l'avifa...
Cas d'utilisation<br /><ul><li>Objectif : déterminer les conséquences de ce projet sur l'environnement
Démarche :
Collecte de données (bibliographie, terrain)
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ecoQuery a Linked data connector for biodiversty studies

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Ns jo bim2011 fr

  1. 1. ecoQuery : <br />a Semantic Module to Query Biodiversity Data on the Web<br />Authors : Julie Chabalier, Olivier Coullet, Amandine Sahl and Olivier Rovellotti<br />
  2. 2. ecoQuery : <br />a Semantic Module to Query Biodiversity Data on the Web<br />Problématique<br />Solution technique<br />Résultat<br />Perspective<br />
  3. 3. Contexte<br />Millenium assessment<br />UN Secretary-General 2000: Kofi Annan<br />Key Factors of Successful Responses to Biodiversity Loss:<br />Mobilize knowledge. Ensure that the available<br />knowledge is presented in ways that can be used by decision-makers.<br />Politique <br />Development and<br />decisionmaking<br />DATA<br />Scientifique<br />monitoring of status<br />and trends of<br />biodiversity<br />Gestionnaire<br />Conservation and<br />sustainable use of<br />biodiversity<br />
  4. 4. DATA<br />
  5. 5. Données de biodiversitédisponibles & exploitables<br />DATA<br />http://imgs.xkcd.com/comics/desert_island.png<br />
  6. 6. DATA<br /><ul><li>Grande Diversité (Biologie, Climatologie, Pédologie)
  7. 7. Différentes échelles (temps, espace)
  8. 8. Volume important </li></ul>+ Cout d'acquisition important<br />
  9. 9. ecoQuery<br />Offrir un outil qui permette d’extraire et d’exploiter des données hétérogènes<br />Comment ?<br /><ul><li>Technologie web sémantique
  10. 10. IHM riche et conviviale</li></li></ul><li>Web sémantique<br />« The Semantic Web is an extension of the current web in which information isgivenwell-definedmeaning, betterenabling computers and people to work in cooperation. »<br />Tim Berners-Lee, James Hendler, OraLassila, The Semantic Web, Scientific American, Mai 2001. <br />
  11. 11. Link Open Data<br /><ul><li>Identification des éléments par un URI
  12. 12. Utilisation d'URI HTTP déréférençables
  13. 13. Mise à disposition des informations en RDF
  14. 14. Ajouter des liens RDF vers les autres URIs</li></li></ul><li>
  15. 15. ecoQuery: Assistant<br /><ul><li>Temps
  16. 16. Espace
  17. 17. Ressource (Observateur)
  18. 18. Taxon</li></ul>ecoQuery<br />REST<br />SPARQL<br />SQL<br />
  19. 19. EcoQuery : Requête<br />ecoQuery<br />PREFIXdwc:<http://rs.tdwg/org/dwc/terms/#><br />PREFIXrdf:<http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#><br />PREFIXgeo:<http://www.w3.org/2003/01/geo/wgs84_pos#><br />PREFIXdcterms:<http://purl.org/dc/terms/><br />SELECT distinct ?scientificName?lat?long?date<br />FROM <urn:rdf.Occurences.AvianKnowledgeNetwork<br />WHERE {<br /> ?occurencerdf:typedwc:Occurence ;<br />dwc:Identification ?id ;<br />geo:lat ?lat;<br />geo:long ?long;<br />dcterms:date?date.<br /> ?id dwc:scientificName?scientificName<br />}<br />SparQL<br />
  20. 20. Interface Riche<br />Outils<br />Carte<br />Données<br />
  21. 21. Mashup<br />
  22. 22. Mise en oeuvre<br />Resultat<br />
  23. 23. Cas d'utilisation<br />Crue <br />Dispositifs de protection contre les crues (Sénas, Cheval Blanc)<br />Impact sur l'avifaune<br />
  24. 24. Cas d'utilisation<br /><ul><li>Objectif : déterminer les conséquences de ce projet sur l'environnement
  25. 25. Démarche :
  26. 26. Collecte de données (bibliographie, terrain)
  27. 27. Occurrence des taxons
  28. 28. Statuts de protection
  29. 29. Détermination de l'importance du site pour l'avifaune</li></li></ul><li>Récolte de données (Terrain)<br />Récolte de données (LOD)<br />
  30. 30. Récolte de données (LOD)<br /><ul><li>Source : AKN (AvianKnowledge Network)
  31. 31. Format : TaxonConcept (Peters De Vries)
  32. 32. Résultat :
  33. 33. 2 Stations
  34. 34. 6 Taxons</li></ul>=> Effort de prospection trop faible <br />=> Réalisation d'une étude de terrain complémentaire<br />
  35. 35. Récolte de données (Terrain)<br /><ul><li> Réalisation d'une série de relevé de terrain
  36. 36. Prise de données Pocket-eRelevé
  37. 37. 17 taxons
  38. 38. Import ecoRelevé Data</li></li></ul><li>Acrocephalusarundinaceus(Linnaeus, 1758)<br />Rousserolle turdoïde (Français)<br />Article 3 // Oiseaux protégés Arrêté du 29 octobre 2009 fixant la liste des oiseaux protégés<br />Sont interdites sur les parties du territoire métropolitain où l'espèce est présente ainsi que dans l'aire de déplacement naturel des noyaux de populations existants la destruction, l'altération ou la dégradation des sites de reproduction et des aires de repos des animaux.<br />
  39. 39. Résultat<br /><ul><li>Mise en commun de données hétérogènes
  40. 40. Technologie web sémantique
  41. 41. Pour les acteurs de la biodiversité
  42. 42. Interface graphique « conviviale »</li></li></ul><li>Bémol<br />Faible volume d’observations disponibles<br /><ul><li>Les données sont porter par NS sur le LOD
  43. 43. Les données ne sont pas libre</li></ul>Faible expressivité de l’ontologie<br /><ul><li>Filtre simple</li></li></ul><li>Perspective<br /><ul><li>Plus d’observation: Gbif : 293 485 946 records
  44. 44. Plus d’expressivité</li></ul>= ecoOnto (NS)<br />= DWC Ontology<br />= TDWG Ontology<br />
  45. 45. Demain: Limite optimum du Parc des Calanques ?<br />Olivier Rovellotti<br />www.natural-solutions.eu<br />
  46. 46. Merci<br />IFHC<br />International Fund for Houbara Conservation<br />

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