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Veille stratégique : Le référentiel terminologique "Maladies animales"
- 1. Le référentiel terminologique"Maladies animales" et sa mise en œuvre dans le cadre de CERISA - Le portail en santé animale et santé publique vétérinaire Marie-Colette Fauré INRA - Département Santé Animale 7 avril 2009 Marie-Colette.Faure@toulouse.inra.fr
- 2. Quelques éléments decontexte… q
- 3. L'Inra : l'InstitutNational de la Recherche Agronomique A i Créé en 1946 Établissement public à caractère scientifique et technologique, placé sous la double tutelle des ministères en charge de l’agriculture et de la recherche 2e organisme de recherche publique français avec près de 9000 g collaborateurs et un budget de 680 millions d’euros 1er organisme européen de recherche agronomique Marie-Colette Fauré – Journée ADBS-EBD : Quel web demain ? – 7 avril 2009
- 4. Organisation de l'Inra l Inra Une présidente et un collège de direction 21 centres de recherche régionaux 14 départements de recherche scientifique 468 unités • 257 unités de recherche (dont 145 unités mixtes) • 80 unités expérimentales • 131 unités d’appui et de service pp Marie-Colette Fauré – Journée ADBS-EBD : Quel web demain ? – 7 avril 2009
- 5. Le département SantéAnimale Direction scientifique Animal et produits animaux Département Santé Animale 4 unités de recherche 14 unités mixtes de recherche 3 unités expérimentales p 1 unité de gestion 700 agents dont environ 240 agents appartenant à d’autres organismes
- 6. Dispositif de veillestratégique du département SA Contexte : maladies émergentes, crises sanitaires, zoonoses, mondialisation…. g , , , Veille Veille socio- Veille Veille Veille Emergence industrielle professionelle événementielle réglementaire Expérimentation R&D, Vaccin et Filières et Appels d’offres, d offres, animale, diagnostic, di ti Groupements G t Maladies M l di experts, bourses, biosécurité, Médicament vétérinaires - émergentes, zoonose colloques… éthique, vétérinaire Expertise DSA bien-être animal Besoins des Démarches Élargir Identifier les filières, filières Opportunité de qualité, qualité partenariat problèmes è expertise et financement, plates-formes Connaissance des émergents ou positionnement formation… IBiSA, stratégies de R&D récurrents du département collaboration … CeriSA VISA New@Diseases @genda VERSA VeliSA
- 7. Référentiel, de quoiparle-t-on ? parle t on Terminologie : vocabulaire, ensemble des termes propres à un domaine, à une technique, à une science... Référentiel : ensemble structuré d'informations utilisé pour l'exécution d'un logiciel et constituant un cadre commun à plusieurs applications Liste d'autorité : liste de termes normalisés et approuvés permettant un enregistrement contrôlé de l'information pour faciliter les opérations de saisie et d recherche. L li t peut êt ouverte ou f i i t de h h La liste t être t fermée. é Référentiel terminologique gq Sources : Dictionnaire de la langue française et Glossaire des techniques de l'information (Ministère de la Culture) Marie-Colette Fauré – Journée ADBS-EBD : Quel web demain ? – 7 avril 2009
- 8. Réflexions préalables àla construction du référentiel
- 9. Une première expérience: le projet VeliSA VeliSA : dépouillement des revues francophones de transfert/ vulgarisation en santé animale (ressources non identifiées par ailleurs) Identification des problèmes sanitaires dans les élevages Premières réponses pour les professionnels de l'élevage Identification de la contribution du département SA f S Environ 3700 références au 30 mars 2009 Indexation libre : maladie (s), agent pathogène (s), mots clés Problèmes liés à l'absence de référentiel : P blè lié l' b d éfé ti l hétérogénéité des descripteurs, doublons, pas de gestion des synonymes… http://www.toulouse.inra.fr/velisa Marie-Colette Fauré – Journée ADBS-EBD : Quel web demain ? – 7 avril 2009
- 10. Pourquoi la créationd'un référentiel ? d un Ressources francophones de ce type inexistantes Nombre important de maladies animales : noms scientifiques, noms vernaculaires, synonymes, acronymes… , y y , y Thésaurus MESH (base Medline) et CAB (base CAB Abstracts) pas suffisamment spécialisés et en langue anglaise Plus d'une centaine de maladies des bovins d une bovins… 15 maladies dans le MESH 5 dans le thésaurus CAB Marie-Colette Fauré – Journée ADBS-EBD : Quel web demain ? – 7 avril 2009
- 11. CeriSA – leportail en santé animale et santé publique vétérinaire bli été i i Objectifs du portail • Apporter des éléments réponses aux questions Ressources des professionnels (éleveurs, vétérinaires…) • L orienter vers lles b Les i t bons acteurs t Acteurs • Partager les savoir-faire et les expertises du g p département SA Expertise Marie-Colette Fauré – Journée ADBS-EBD : Quel web demain ? – 7 avril 2009
- 12. Les informations proposéespar CeriSA Des ressources pertinentes (informations accessibles librement sur internet) sur les maladies des animaux de production Des informations sur les acteurs majeurs en santé animale et j santé publique vétérinaire : coordonnées, compétences, spécialisation… spécialisation Un espace d'échange avec les professionnels d échange Marie-Colette Fauré – Journée ADBS-EBD : Quel web demain ? – 7 avril 2009
- 13. Les problèmes identifiésau démarrage du projet Collecte des ressources : difficulté d'une couverture exhaustive et homogène par maladie et espèce animale Indexation : même problème q VeliSA p que Utilisateurs du portail d'origine et d'horizon différents avec des d origine d horizon compétences scientifiques et technologiques très hétérogènes Marie-Colette Fauré – Journée ADBS-EBD : Quel web demain ? – 7 avril 2009
- 14. Un référentiel pourquoi? Pour qui ? Pourquoi ? Structurer la phase de recherche d'informations Faciliter l'indexation Proposer des systèmes de recherche et de navigation adaptés Pour qui ? Pour les professionnels de l'information (recherche et indexation de l'information) Pour les utilisateurs du portail Le référentiel sort du cadre strictement "documentaire" Marie-Colette Fauré – Journée ADBS-EBD : Quel web demain ? – 7 avril 2009
- 15. La construction duréférentiel
- 16. Processus de construction Elaboration du cadre théorique Elaboration du cadre général Inventaire des termes • Maladies par espèces animales • Agent(s) pathogènes (s) Enrichissement • Notes • Réglementation • Type de maladie Validation V lid ti • Validation scientifique • Terme principal retenu
- 17. Cadre théorique Espèce animale è l Maladie Agent(s) pathogène(s) Type de maladie 1 terme retenu Synonyme ou abréviation, terme Zoonose ? vernaculaire… Note complémentaire Statut réglementaire
- 18. Inventaire des termes Ressources utilisées Connaissances académiques : ouvrages et traités de p q g pathologie g animale Liste des maladies animales réglementées : Organisation Mondiale de la Santé Animale (OIE) Maladies à Déclaration Obligatoires (MDO) Maladies Réputées Contagieuses (MRC) Taxonomies et nomenclatures exemple : J. Euzeby – Dictionnaire de bactériologie vétérinaire Recherche complémentaires sur internet à l'aide des moteurs de recherche Marie-Colette Fauré – Journée ADBS-EBD : Quel web demain ? – 7 avril 2009
- 19. Validation Validation scientifique par des experts vétérinaires du département SA • Vérification de l'information • Choix du terme retenu • Notes complémentaires • … Marie-Colette Fauré – Journée ADBS-EBD : Quel web demain ? – 7 avril 2009
- 20.
- 21. Exemple Lapin Tularémie Francisella tularensis Francisella tularensis Bactérie Fièvre du lièvre Maladie de Francis Fièvre de la mouche du cerf Fièvre de Ohara, Yato-Byo Zoonose : oui Fièvre de la vallée de Pahvant … Note complémentaire : Forme clinique rare chez le lapin (Oryctolagus cuniculus), mais plus fréquente chez le lièvre (Lepus europeaus ou timidus) ti id ) Statut réglementaire Maladie notifiable à l'OIE Maladie à déclaration obligatoire
- 22. En back office back-office
- 23. Une fois constitué constitué, par la somme des connaissance agrégées, le référentiel "maladies animales" constitue en soi une base de connaissances unique Maladies des bovins : 82 Maladies des caprins : 102 Maladie des équins : 46 Maladie des lapins : 46 Maladie des ovins : 102 Maladie des poissons : p 102 Maladie des porcins : 80 Maladie des volailles: 78 Marie-Colette Fauré – Journée ADBS-EBD : Quel web demain ? – 7 avril 2009
- 24. Une maladie duréférentiel
- 25. Les différents usagesdu référentiel g
- 26. Du référentiel auportail Référentiel Usage Portail Espèce animale Sélection d'informations d informations Maladie Ressources Agent pathogène A t th è Indexation Métadonnées Type de maladie complémentaires Acteurs Statut réglementaire Navigation / recherche Zoonose Base de Outil métier connaissances
- 27. LE CONTENU DUPORTAIL : RESSOURCES ET ACTEURS
- 28. Le référentiel pourla recherche des ressources Structuration de la phase de recherche Limiter le risque de dispersion et de non exhaustivité dû au nombre important de maladies (675 agents pathogènes et 412 maladies au 30 mars 2009) Prioriser les maladies, et par conséquent la recherche de ressources, selon certains critères : zoonose, contagion, pertes économiques… Support à l'élaboration des requêtes de recherche • Utilisation de toutes les formes d'un nom de maladie • Recherche par agent pathogène si nécessaire Marie-Colette Fauré – Journée ADBS-EBD : Quel web demain ? – 7 avril 2009
- 29. Sélection des ressources Les itè L critères retenus : t • Informations en français • Accessible pour un public non scientifique mais averti (professionnels de l'élevage, vétérinaires) • Q lité d l'i f Qualité de l'information (auteur(s) identifié(s), crédibilité d site, ti ( t ( ) id tifié( ) édibilité du it date de l'information…) • Informations non commerciales • … Marie-Colette Fauré – Journée ADBS-EBD : Quel web demain ? – 7 avril 2009
- 30. Recherche et sélectiondes acteurs Recherche à partir : • Des sites publics (ministère de l'agriculture, organismes de recherche…) • Sites professionnels • D moteurs de recherche spécialisés et généralistes Des t d h h é i li é t é é li t • … Sélection selon les critères suivants : • Rôle majeur en santé animale et santé p j publique vétérinaire q • Spécialisation • Compétences • … Marie-Colette Fauré – Journée ADBS-EBD : Quel web demain ? – 7 avril 2009
- 31.
- 32. L indexation L'indexation des ressources Référentiel Aide à l'indexation • Proposition d'une liste contrôlée de termes "maladies" ou "agents p pathogènes" g Autres meta-données • Espèce animale • Mots-clés • Description Liens possibles entre ressources et avec des entités Marie-Colette Fauré – Journée ADBS-EBD : Quel web demain ? – 7 avril 2009
- 33. Ressources : Back-office Back office Gestion contrôlée des maladies et des agents pathogènes grâce au référentiel Marie-Colette Fauré – Journée ADBS-EBD : Quel web demain ? – 7 avril 2009
- 34. Indexation d'un acteur d un Back-office du portail CeriSA Géré l' id du Gé é à l'aide d référentiel
- 35. Un acteur enfront-office front office Caractérisé par les attributs suivants Libellé Type d'entité Domaine de compétence Mission-description Spécialité(s) : maladie, agent pathogène, espèce Mots-clés Coordonnées
- 36. RECHERCHE ET NAVIGATIONDANS LE PORTAIL
- 37. Les fonctionnalités de d recherche et d navigation d h h t de i ti dans l portail le t il Accès directe, plus simple aux informations grâce au référentiel : • Recherche par maladie et espèce animale (Maladies de A à Z) • Gestion des synonymes, des acronymes… • Navigation croisée au sein des ressources et des acteurs Autres possibilités offertes par des technologies comme AJAX, Google map… : • Géolocalisation • A t Auto-complétion (résultats proposés en fonction de la chaîne de léti ( é lt t é f ti d l h î d caractère saisie par l'utilisateur) • … Marie-Colette Fauré – Journée ADBS-EBD : Quel web demain ? – 7 avril 2009
- 38. Par moteur derecherche interne Espèce animale Menus Maladie ou agent pathogène Maladies réglementées Par acteur Par géolocalisation Marie-Colette Fauré – Journée ADBS-EBD : Quel web demain ? – 7 avril 2009
- 39. Les maladies deA à Z Possibilités de recherche et de navigation plus performantes grâce à la création d'un index des maladies
- 40. Navigation au seindes ressources Navigation croisée au sein des ressources via les maladies, les agents pathogènes et les mots clés
- 41.
- 42. Les apports duréférentiel Le référentiel "maladies animales" : un outil structurant pour la construction du portail CeriSA Sert les autres projets du département SA : p j p • Visa – veille industrielle • Amélioration de l'indexation de VeliSA Un outil "métier" utilisable pour de nombreux p j p projets Marie-Colette Fauré – Journée ADBS-EBD : Quel web demain ? – 7 avril 2009
- 43. En perspective… Du référentiel terminologique à l'ontologie, un (petit) pas à franchir relations entre les termes, écriture XML (RDF…) • Autonomie de l'outil • Maintenance plus efficace du référentiel • Echange et partage des métadonnées • … Marie-Colette Fauré – Journée ADBS-EBD : Quel web demain ? – 7 avril 2009
- 44. MERCI DE VOTREATTENTION