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Réunion d’information M1
23 Avril 2013
- Présentation des UEs Master 2 Semestre 3
- Les Neurosciences à Bordeaux
- Quelques outils pour choisir son stage
(Bibliométrie)
146 rue Léo Saignat
BP 64
33076 BORDEAUX
 3 UEs obligatoires (12 ECTS)
 Connaissance de l’entreprise : recherche, médicament (3 ECTS)
 Communication et conception d’un projet de recherche et/ou développement (9 ECTS)
 Anglais (3 ECTS)
 3 UEs optionnelles (au choix) parmi 7 (15ECTS)
 Neurobiologie cellulaire et moléculaire
 Neurosciences cognitives
 Physiopathologie et méthodes de recherche clinique
 Réseaux de neurones
 Addictologie
 Pharmacologie préclinique et clinique des psychotropes
 Techniques et expérimentations comportementales
5 ECTS/UEs
Présentation des UEs Master 2 – Semestre 3
Communication et conception d’un projet de recherche et/ou développement (9 ECTS)
Anglais (3 ECTS)
La première étape du stage de Master 2
- Aide à la conceptualisation du projet de recherche (TD/Cours)
- Mise en place du projet avec le laboratoire d’accueil et responsable de stage
Travail personnel avec l’aide du responsable de stage + aide à la conceptualisation & rédaction du rapport en TD
Commencer le plus tôt possible à travailler le projet avec le responsable de stage !
Projet écrit de stage + soutenance à l’oral (10 min présentation + 10 min question)
Présentation des UEs Master 2 – Semestre 3
Connaissance de l’entreprise : recherche, médicament (3 ECTS)
Neurobiologie cellulaire et moléculaire (Resp : C. Blanchet)
Réseaux de neurones (Resp : D. Combes)
Cours/conférences (≈ 30h)
Electrophysiologie de la transmission synaptique – Synaptogénèse et plasticité synaptique – Protéines de la synapse
glutamatergique – Récepteurs GABAA : du moléculaire au comportement – Neurobiologie des cellules gliales – Plasticité
structurale – Organisation présynaptique et cycle vésiculaire – Les récepteurs à l’ATP P2X – Intégration dendritique et plasticité
intrinsèque
Présentations d’articles en lien avec les cours/conf (≈15-20h)
TP « Micro-stage » (≈ 8h, 2-3 étudiants/groupes)
Examen final : Analyse d’articles
Cours (≈ 40h)
Architecture des réseaux neuronaux – Neuromodulation des réseaux neuronaux – Activité Spontanée et développement des
réseaux neuronaux – Réseaux moteurs chez les vertébrés – Coordination des réseaux neuronaux chez les mammifères –
Réseaux neuronaux respiratoires – Constructions de réseaux neuronaux opératoires – Interactions dynamiques sensorimotrices
durant la locomotion chez les vertébrés – Approche computationnelle
TD Machine (≈ 10h) : Étude d’un réseau de neurones (Neurosim) et élaboration d’un article « fictif » (écrit + soutenance orale)
Examen final : Analyse d’articles /Cours
Présentation des UEs Master 2 – Semestre 3
Physiopathologie et méthodes de recherche clinique (Resp : T. Michelet)
Pharmacologie préclinique et clinique des psychotropes (Resp : U. Spampinato)
Présentation des UEs Master 2 – Semestre 3
Cours (≈ 36h)
Le système endocannabinoïde – Pharmacologie comportementale (mécanismes d'action et cibles cérébrales, effets appétitifs et
aversifs, effets sur les processus cognitifs et émotionnels...) métabolisme/prise alimentaire – les opioïdes – Pharmacologie pré
clinique des médicaments psychotropes: classification, mécanisme d'action et Interactions neuronales (45% M1 / 55% Nouveau)
– Pharmacologie Clinique, effets secondaires/interactions
Examen final: 15/25 QCM uniquement en anglais ± 5 QCM par thème/encadrant
Cours (≈ 45h)
Physiopathologie de divers syndrômes : Parkinson , troubles du déficit de l’attention et hyperactivité (TDAH), autisme, sclérose
en plaques (déficits cognitifs), dépression, troubles obsessionnels compulsifs (TOC)
Cortex préfrontal : physiologie, fonctions principales
Inflammation : influence sur le fonctionnement du cerveau
Neuroimagerie dans les désordres neurologiques (principes de l’IRM, IRMf, EEG, DTI)
Examen final: 2 sujets au choix parmi 3 sujets (restitution de connaissance, analyse de documents)
Neurosciences cognitives (Resp : J. Micheau)
Addictologie (Resp : M. Auriacombe)
Présentation des UEs Master 2 – Semestre 3
Cours (variable…)
Epidémiologie – Outils de diagnostique de l’addiction – Vulnérabilité – Psychologie de l’addiction – Addict ou pas addict ? Suivi
médical – Pistes thérapeutiques - Discussion autour de la prise alimentaire pathologique (addiction/pas addiction) et de la
nouvelle définition de l’addiction dans le DSM-V
MAIS PAS aspects neurobiologiques/mécanismes cérébraux mis en œuvres.
Centré clinique/psychologique
Examen final: Questions de cours courtes + analyse d’article
Cours/conférences (≈ 30h)
Représentation de la mémoire – Processus cognitifs impliqués dans le conditionnement classique (fear-conditioning) –
Planification de l’action – Mécanismes neuronaux des activités cognitives – Modèles de production de langage et de production
de mots – Imagerie cérébrale et alcoolisme
Travaux Dirigés et Travaux pratiques (≈ 24h)
Tests mnésiques, ERP, analyse d’articles en rapport avec le cours…
« Table ronde » (4h)
Préparation par groupes de 3-4 étudiants de présentations d’articles en rapport avec le cours et discussion suite aux présentations
en présence de chercheurs travaillant dans le domaine
Examen final: Analyse d’article(s) et/ou cours
Techniques et expérimentations comportementales (Resp : JL. Guillou)
Présentation des UEs Master 2 – Semestre 3
Cours/Travaux dirigés (≈ 30h)
Modèles animaux transgéniques des maladies d’Alzheimer et de Huntington – Historique et théorie des tests de la piscine de
Morris, du Radial Maze et des cages opérantes de Skinner – Statistiques – Analyse et discussion des résultats de travaux
pratiques
Travaux pratiques (≈ 90h)
Manipulation d’animaux (rats et souris) – Préparation de substances pharmacologiques – Administration de substances
pharmacologiques (par voies intra-péritonéale, sous-cutanée, per-œsophage) – Test de mémoire de travail en labyrinthe radial
après injection intra-péritonéale chez la souris – Test de mémoire de référence en labyrinthe aquatique de Morris après
injection intra-péritonéale chez le rat – Test d’apprentissage opérant en boîte de Skinner après privation alimentaire et
injection sous-cutanée chez la souris
Examen final : Contrôle continu lors des travaux pratiques (60%) – Examen écrit (40%) faisant appel aux
connaissances acquises lors des cours et travaux pratiques
Les Neurosciences à Bordeaux
Le Neurocampus
http://www.neurocentre-magendie.fr/
PV. Piazza - Physiopathologie de l’addiction
N. Abrous - Neurogénèse et physiopathologie
S . Oliet - Relation glie-neurone
G. Le Masson - Pathologies du système moteur
M. Montcouquiol - Polarité planaire et plasticité
G. Marsicano - Mécanismes moléculaires de l’adaptation comportementale
D. Cota - Physiopathologie de l’équilibre énergétique et obésité
A. Frick - Mécanismes de la plasticité corticale dans les conditions normales et pathologiques
A. Marighetto - Physiopathologie de la mémoire déclarative
C. Herry - Circuits neuronaux des apprentissages associatifs
- Addiction
- Neurogenèse
- Synaptogenèse
- Neuroendocrinologie
 10 équipes
E. Bézard - Physiopathologie des Syndromes Parkinsoniens
B. Bontempi - Dynamique des réseaux neuronaux et vasculaires dans les processus mnésiques
P. Burbaud - Planification de l’action en situation normale et pathologique
E. Boué-Grabot - Régulation moléculaire des récepteurs synaptiques
S. Ahmed - Addiction, compulsion et syndrome de dysrégulation
F. Alexandre - MNEMOSYNE
T. Boraud - Approche systémique de la boucle extrapyramidale
A. Benazzouz - Monoamines, stimulation cérébrale profonde et maladie de Parkinson
J. Baufreton - Dynamique synaptique et cellulaire des réseaux neuronaux
 9 équipes
http://www.imn-bordeaux.org/index.php
- Dégénérescence et mort neuronale
- Plasticité synaptique et pathologie
- Syndromes parkinsoniens
- Cognition et démence
D. Choquet - Dynamique de l’organisation et des fonctions synaptiques
L. Groc - Développement et adaptation des circuits neuronaux
Y. Humeau - Synapse en cognition
M. Landry - Mécanisme central de la sensibilisation à la douleur
C. Mulle - Physiologie des synapses glutamatergiques
V. Nagerl - Plasticité synaptique et microscopie à superrésolution
JB. Sibarita - Imagerie quantitative de la cellule
O. Thoumine - Biophysique de l’adhésion et du cytosquelette
 8 équipes
http://www.iins.u-bordeaux2.fr/
- Plasticité synaptique
- Neurobiologie du développement
- Douleur
- Imagerie cellulaire et superrésolution
M. Allard - Neuroimagerie et cognition humaine
D. Beracochea - Interactions entre émotions et système de mémoire
D. Cattaert - Comportement, développement et réseaux neuronaux
M. Cador - Neuropsychopharmacologie de l’addiction
W. Crusio - Neurogénétique comportementale
E. Coutureau - Neurobiologie des fonctions éxécutives
L. Demany - Perception auditive et développement
D. Morin - Coordination et plasticité des générateurs spinaux
J. Simmers - Organisation et adaptabilité des systèmes moteurs
G. Simonnet - Ihoméostasie-Allostasie-Pathologie-Réhabilitation
B. Yvert - Neurotechnologie et dynamique des réseaux
 11 équipes
http://www.incia.u-bordeaux1.fr/
- Motricité
- Cognition
- Vulnérabilité & addiction
- Neurobio. du développement
- Nutrition et cerveau
- Neuroinflammation
S. Layé - Nutrition, récepteurs nucléaires et vieillissement cérébral
V. Pallet - Psychoneuroimmunologie et Nutrition : approches expérimentales et cliniques
Unité Mixte Technologique - Nutrition lipidique et vieillissement cérébral
 3 équipes
http://www4.bordeaux-aquitaine.inra.fr/nutrineuro
P. Philip - Groupe d'étude Neuro-psychopharmacologique du sommeil, de la somnolence et de
l'attention (GENPPHAASS )
M. Auriacombe - Phénoménologie et déterminants des comportements appétitifs, addictologie
et psychiatrie
 2 équipes
- Sommeil
- Trouble du déficit de l’attention / Hyperactivité
- Vieillissement
- Addiction
http://www.sanpsy.univ-bordeauxsegalen.fr/fr/
Retrouvez toutes ces infos sur
http://www.neuroscience.univ-bordeauxsegalen.fr/fr/index.html
Éléments de bibliométrie
Plusieurs outils
• Pubmed  liste des publications
• Gopubmed  analyse thématique/collaboration/stratégie de
publication
• Web of Science  mesure bibliométrique (Accès par
bibliovie/biblioinserm)
• Publish or Perish (Accès gratuit - http://www.harzing.com/pop.htm)
Gopubmed
Analyse d’un domaine – collaboration - localisation
Réseau
Publication au cours du temps
Localisation des équipes
Journaux Top auteurs
Analyse bibliométrique – Citation report
Web of science : outil payant accessible par Bibliovie/Biblioinserm
Analyse bibliométrique – Citation report
Nombre moyen de citation par article
h-index : n articles cités au moins n fois
Ici 56 articles cités au moins 56 fois
Ne prends pas en compte la position !!
Existe aussi un outil gratuit : Publish or Perish mais moins précis
Attention !
La valeur bibliométrique n’est pas représentative de la qualité
intrinsèque d’un chercheur.
En fonction de l’implication dans l’enseignement par exemple le
nombre de publication peut diminuer (temps relatifs entre les 2
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N’hésitez pas à nous envoyer vos questions, remarques, idées
par mail !
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Et surtout, n’oubliez pas
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  • 1. asso.nba@gmail.com Réunion d’information M1 23 Avril 2013 - Présentation des UEs Master 2 Semestre 3 - Les Neurosciences à Bordeaux - Quelques outils pour choisir son stage (Bibliométrie) 146 rue Léo Saignat BP 64 33076 BORDEAUX
  • 2.  3 UEs obligatoires (12 ECTS)  Connaissance de l’entreprise : recherche, médicament (3 ECTS)  Communication et conception d’un projet de recherche et/ou développement (9 ECTS)  Anglais (3 ECTS)  3 UEs optionnelles (au choix) parmi 7 (15ECTS)  Neurobiologie cellulaire et moléculaire  Neurosciences cognitives  Physiopathologie et méthodes de recherche clinique  Réseaux de neurones  Addictologie  Pharmacologie préclinique et clinique des psychotropes  Techniques et expérimentations comportementales 5 ECTS/UEs Présentation des UEs Master 2 – Semestre 3
  • 3. Communication et conception d’un projet de recherche et/ou développement (9 ECTS) Anglais (3 ECTS) La première étape du stage de Master 2 - Aide à la conceptualisation du projet de recherche (TD/Cours) - Mise en place du projet avec le laboratoire d’accueil et responsable de stage Travail personnel avec l’aide du responsable de stage + aide à la conceptualisation & rédaction du rapport en TD Commencer le plus tôt possible à travailler le projet avec le responsable de stage ! Projet écrit de stage + soutenance à l’oral (10 min présentation + 10 min question) Présentation des UEs Master 2 – Semestre 3 Connaissance de l’entreprise : recherche, médicament (3 ECTS)
  • 4. Neurobiologie cellulaire et moléculaire (Resp : C. Blanchet) Réseaux de neurones (Resp : D. Combes) Cours/conférences (≈ 30h) Electrophysiologie de la transmission synaptique – Synaptogénèse et plasticité synaptique – Protéines de la synapse glutamatergique – Récepteurs GABAA : du moléculaire au comportement – Neurobiologie des cellules gliales – Plasticité structurale – Organisation présynaptique et cycle vésiculaire – Les récepteurs à l’ATP P2X – Intégration dendritique et plasticité intrinsèque Présentations d’articles en lien avec les cours/conf (≈15-20h) TP « Micro-stage » (≈ 8h, 2-3 étudiants/groupes) Examen final : Analyse d’articles Cours (≈ 40h) Architecture des réseaux neuronaux – Neuromodulation des réseaux neuronaux – Activité Spontanée et développement des réseaux neuronaux – Réseaux moteurs chez les vertébrés – Coordination des réseaux neuronaux chez les mammifères – Réseaux neuronaux respiratoires – Constructions de réseaux neuronaux opératoires – Interactions dynamiques sensorimotrices durant la locomotion chez les vertébrés – Approche computationnelle TD Machine (≈ 10h) : Étude d’un réseau de neurones (Neurosim) et élaboration d’un article « fictif » (écrit + soutenance orale) Examen final : Analyse d’articles /Cours Présentation des UEs Master 2 – Semestre 3
  • 5. Physiopathologie et méthodes de recherche clinique (Resp : T. Michelet) Pharmacologie préclinique et clinique des psychotropes (Resp : U. Spampinato) Présentation des UEs Master 2 – Semestre 3 Cours (≈ 36h) Le système endocannabinoïde – Pharmacologie comportementale (mécanismes d'action et cibles cérébrales, effets appétitifs et aversifs, effets sur les processus cognitifs et émotionnels...) métabolisme/prise alimentaire – les opioïdes – Pharmacologie pré clinique des médicaments psychotropes: classification, mécanisme d'action et Interactions neuronales (45% M1 / 55% Nouveau) – Pharmacologie Clinique, effets secondaires/interactions Examen final: 15/25 QCM uniquement en anglais ± 5 QCM par thème/encadrant Cours (≈ 45h) Physiopathologie de divers syndrômes : Parkinson , troubles du déficit de l’attention et hyperactivité (TDAH), autisme, sclérose en plaques (déficits cognitifs), dépression, troubles obsessionnels compulsifs (TOC) Cortex préfrontal : physiologie, fonctions principales Inflammation : influence sur le fonctionnement du cerveau Neuroimagerie dans les désordres neurologiques (principes de l’IRM, IRMf, EEG, DTI) Examen final: 2 sujets au choix parmi 3 sujets (restitution de connaissance, analyse de documents)
  • 6. Neurosciences cognitives (Resp : J. Micheau) Addictologie (Resp : M. Auriacombe) Présentation des UEs Master 2 – Semestre 3 Cours (variable…) Epidémiologie – Outils de diagnostique de l’addiction – Vulnérabilité – Psychologie de l’addiction – Addict ou pas addict ? Suivi médical – Pistes thérapeutiques - Discussion autour de la prise alimentaire pathologique (addiction/pas addiction) et de la nouvelle définition de l’addiction dans le DSM-V MAIS PAS aspects neurobiologiques/mécanismes cérébraux mis en œuvres. Centré clinique/psychologique Examen final: Questions de cours courtes + analyse d’article Cours/conférences (≈ 30h) Représentation de la mémoire – Processus cognitifs impliqués dans le conditionnement classique (fear-conditioning) – Planification de l’action – Mécanismes neuronaux des activités cognitives – Modèles de production de langage et de production de mots – Imagerie cérébrale et alcoolisme Travaux Dirigés et Travaux pratiques (≈ 24h) Tests mnésiques, ERP, analyse d’articles en rapport avec le cours… « Table ronde » (4h) Préparation par groupes de 3-4 étudiants de présentations d’articles en rapport avec le cours et discussion suite aux présentations en présence de chercheurs travaillant dans le domaine Examen final: Analyse d’article(s) et/ou cours
  • 7. Techniques et expérimentations comportementales (Resp : JL. Guillou) Présentation des UEs Master 2 – Semestre 3 Cours/Travaux dirigés (≈ 30h) Modèles animaux transgéniques des maladies d’Alzheimer et de Huntington – Historique et théorie des tests de la piscine de Morris, du Radial Maze et des cages opérantes de Skinner – Statistiques – Analyse et discussion des résultats de travaux pratiques Travaux pratiques (≈ 90h) Manipulation d’animaux (rats et souris) – Préparation de substances pharmacologiques – Administration de substances pharmacologiques (par voies intra-péritonéale, sous-cutanée, per-œsophage) – Test de mémoire de travail en labyrinthe radial après injection intra-péritonéale chez la souris – Test de mémoire de référence en labyrinthe aquatique de Morris après injection intra-péritonéale chez le rat – Test d’apprentissage opérant en boîte de Skinner après privation alimentaire et injection sous-cutanée chez la souris Examen final : Contrôle continu lors des travaux pratiques (60%) – Examen écrit (40%) faisant appel aux connaissances acquises lors des cours et travaux pratiques
  • 10. http://www.neurocentre-magendie.fr/ PV. Piazza - Physiopathologie de l’addiction N. Abrous - Neurogénèse et physiopathologie S . Oliet - Relation glie-neurone G. Le Masson - Pathologies du système moteur M. Montcouquiol - Polarité planaire et plasticité G. Marsicano - Mécanismes moléculaires de l’adaptation comportementale D. Cota - Physiopathologie de l’équilibre énergétique et obésité A. Frick - Mécanismes de la plasticité corticale dans les conditions normales et pathologiques A. Marighetto - Physiopathologie de la mémoire déclarative C. Herry - Circuits neuronaux des apprentissages associatifs - Addiction - Neurogenèse - Synaptogenèse - Neuroendocrinologie  10 équipes
  • 11. E. Bézard - Physiopathologie des Syndromes Parkinsoniens B. Bontempi - Dynamique des réseaux neuronaux et vasculaires dans les processus mnésiques P. Burbaud - Planification de l’action en situation normale et pathologique E. Boué-Grabot - Régulation moléculaire des récepteurs synaptiques S. Ahmed - Addiction, compulsion et syndrome de dysrégulation F. Alexandre - MNEMOSYNE T. Boraud - Approche systémique de la boucle extrapyramidale A. Benazzouz - Monoamines, stimulation cérébrale profonde et maladie de Parkinson J. Baufreton - Dynamique synaptique et cellulaire des réseaux neuronaux  9 équipes http://www.imn-bordeaux.org/index.php - Dégénérescence et mort neuronale - Plasticité synaptique et pathologie - Syndromes parkinsoniens - Cognition et démence
  • 12. D. Choquet - Dynamique de l’organisation et des fonctions synaptiques L. Groc - Développement et adaptation des circuits neuronaux Y. Humeau - Synapse en cognition M. Landry - Mécanisme central de la sensibilisation à la douleur C. Mulle - Physiologie des synapses glutamatergiques V. Nagerl - Plasticité synaptique et microscopie à superrésolution JB. Sibarita - Imagerie quantitative de la cellule O. Thoumine - Biophysique de l’adhésion et du cytosquelette  8 équipes http://www.iins.u-bordeaux2.fr/ - Plasticité synaptique - Neurobiologie du développement - Douleur - Imagerie cellulaire et superrésolution
  • 13. M. Allard - Neuroimagerie et cognition humaine D. Beracochea - Interactions entre émotions et système de mémoire D. Cattaert - Comportement, développement et réseaux neuronaux M. Cador - Neuropsychopharmacologie de l’addiction W. Crusio - Neurogénétique comportementale E. Coutureau - Neurobiologie des fonctions éxécutives L. Demany - Perception auditive et développement D. Morin - Coordination et plasticité des générateurs spinaux J. Simmers - Organisation et adaptabilité des systèmes moteurs G. Simonnet - Ihoméostasie-Allostasie-Pathologie-Réhabilitation B. Yvert - Neurotechnologie et dynamique des réseaux  11 équipes http://www.incia.u-bordeaux1.fr/ - Motricité - Cognition - Vulnérabilité & addiction - Neurobio. du développement
  • 14. - Nutrition et cerveau - Neuroinflammation S. Layé - Nutrition, récepteurs nucléaires et vieillissement cérébral V. Pallet - Psychoneuroimmunologie et Nutrition : approches expérimentales et cliniques Unité Mixte Technologique - Nutrition lipidique et vieillissement cérébral  3 équipes http://www4.bordeaux-aquitaine.inra.fr/nutrineuro
  • 15. P. Philip - Groupe d'étude Neuro-psychopharmacologique du sommeil, de la somnolence et de l'attention (GENPPHAASS ) M. Auriacombe - Phénoménologie et déterminants des comportements appétitifs, addictologie et psychiatrie  2 équipes - Sommeil - Trouble du déficit de l’attention / Hyperactivité - Vieillissement - Addiction http://www.sanpsy.univ-bordeauxsegalen.fr/fr/
  • 16. Retrouvez toutes ces infos sur http://www.neuroscience.univ-bordeauxsegalen.fr/fr/index.html
  • 17. Éléments de bibliométrie Plusieurs outils • Pubmed  liste des publications • Gopubmed  analyse thématique/collaboration/stratégie de publication • Web of Science  mesure bibliométrique (Accès par bibliovie/biblioinserm) • Publish or Perish (Accès gratuit - http://www.harzing.com/pop.htm)
  • 18. Gopubmed Analyse d’un domaine – collaboration - localisation Réseau Publication au cours du temps
  • 20. Analyse bibliométrique – Citation report Web of science : outil payant accessible par Bibliovie/Biblioinserm
  • 21. Analyse bibliométrique – Citation report Nombre moyen de citation par article h-index : n articles cités au moins n fois Ici 56 articles cités au moins 56 fois Ne prends pas en compte la position !!
  • 22. Existe aussi un outil gratuit : Publish or Perish mais moins précis Attention ! La valeur bibliométrique n’est pas représentative de la qualité intrinsèque d’un chercheur. En fonction de l’implication dans l’enseignement par exemple le nombre de publication peut diminuer (temps relatifs entre les 2 tâches)
  • 23. N’hésitez pas à nous envoyer vos questions, remarques, idées par mail ! asso.nba@gmail Et surtout, n’oubliez pas de la page facebook de l’asso !