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1  sur  4
PARÉ à
                        INNOVER
                          Lettre d’information de l’innovation en bretagne
                                                                                                              numéro spécial
                                                                                                              supplément au n°8
                                                                                                              janvier - février 2002




                                                      Génopole OUEST,
                                                    un nouveau levier
                                                     pour la recherche
                                                        et le transfert
                                                       de technologie

Editorial
Editorial
Génopole OUEST :
Chercheurs à l'unisson                                                                                        Sommaire
                                                                                                              Sommaire
Le long travail de structuration et de matura-      de nouvelles perspectives tant au niveau for-
tion du secteur de la biologie dans les secteurs    mation qu'au niveau de la valorisation pour         P.2     Le projet
de la mer, de l'agro alimentaire et de la santé a   accueillir de nouveaux chercheurs et favoriser
permis la création au 1er janvier 2002 d'une        le transfert de technologies et la création d'en-           Génopole OUEST
génopole interrégionale Bretagne - Pays de la       treprises de biotechnologies dans l'Ouest. Je
Loire. Actuellement 750 chercheurs et 47 uni-       profite de l'opportunité de cet éditorial pour
tés de recherche sont mobilisés autour de pro-      remercier tous les partenaires associés à la
grammes de génomique et post génomique à
grande échelle. A ce jour, les recherches sont
                                                    génopole et tout particulièrement les deux
                                                    Conseils Régionaux et les deux DRRT de
                                                                                                        P.3    Zoom sur la
orientées autour de 5 plates-formes : bio-          Bretagne et Pays de La Loire qui dès le départ             valorisation
informatique, séquençage-génotypage, explo-         nous ont soutenus, et pour vous offrir tous nos
ration fonctionnelle, bio puce et protéomique.      meilleurs vœux pour 2002 au nom du comité
Elles sont pour certaines déjà opérationnelles,     de pilotage de Génopole OUEST.
et pour d'autres, elles le seront dans leurs
formes optimales d'ici le printemps 2002. Un                                       Michel Renard
                                                                                                        P.4     Bio Informatique,
autre défi de la labellisation est d'ouvrir aussi                   Directeur de génopole OUEST.                Infos pratiques
                                                                                                                et petit lexique
PARÉ à                               Lettre d’information de l’innovation en bretagne
   INNOVER
                                         Génopole OUEST         Le projet…
 Les domaines de la génomique et de la post-génomique ouvrent des perspectives
 considérables dans les domaines de l’agrobiologie, de la mer et de la santé. La géno-
 mique consiste en l’étude du génome et, depuis quelques années, la révolution géno-
 mique bouleverse incontestablement l'approche technologique et la connaissance du
 vivant. En effet, grâce au séquençage massif et systématique de nombreux génomes,
 dont le génome humain, une formidable source d'informations est désormais dispo-
 nible. La post-génomique prend alors le relais car elle s’applique à l’étude de l’expres-
 sion de ces gènes et à l’identification de leurs fonctions biologiques.

 S’associer pour capitaliser                                                                              Volet scientifique
 les expériences                                                                                          Mettre en commun des
 Génopole OUEST est un projet stratégique              Enfin, Génopole OUEST s’appuiera sur le
                                                                                                          outils et des compétences
 pour la formation supérieure et la recherche          réseau des Technopoles et des Centres de           Quels que soient les espèces et les
 dans le domaine des sciences du vivant, de la         Transfert de Technologie pour promouvoir la        domaines, les questions fondamentales de la
 bio-informatique et pour le développement             valorisation des activités scientifiques vers le   génomique restent les mêmes ainsi que les
 économique dans les domaines de la mer, de            secteur privé et la création de nouvelles          outils méthodologiques à mettre en œuvre
 l’agroalimentaire et de la santé.                     entreprises.                                       pour y répondre. C’est sur ce constat que
                                                                                                          repose la conception de Génopole OUEST.
 L’objectif est ainsi de : participer col-                                                                D’autre part, il était primordial de construire
 lectivement à l’évolution tech-                                                                          ce dispositif de grande échelle en s’appuyant
 nologique, dynamiser et struc-                                                                           sur les forces régionales déjà existantes.
 turer la recherche, la forma-                                                                            La mise en commun des outils et des com-
 tion et le développement                                                                                 pétences (Mer, Agro, Santé, Bio-Info) doit
 économique, et enfin réaliser                                                                            permettre à l’Ouest de réaliser des pro-
 le changement d’échelle pour                                                                             grammes de Biologie d’envergure internatio-
 renforcer l’excellence scienti-                                                                          nale tout en tenant compte des secteurs
 fique du Grand Ouest.                                                                                    d’importance économique régionale :
 La Génopole OUEST est                                                                                    Application de la recherche scientifique dans
 constituée de 3 volets :                                                                                 les secteurs clés de la génomique…
 • le volet scientifique
 • le volet formation
 • le volet valorisation
 et de 5 plateaux techniques :
 • Puces à ADN
                                                                                                          Mer :
 • Génotypage/Séquençage                                                                                  • Explorer la diversité marine,
 • Protéomique                                                                                            • Mieux gérer les populations marines d’intérêt
 • Exploration Fonctionnelle                                                                                économique,
 • Bio-Informatique                                                                                       • Développer des recherches sur les modèles
                                                                                                            marins de biologie fondamentale
                                                                                                          • Exploiter les océans par l’utilisation de gènes
                                                                                                            d’intérêt.
 Volet valorisation Volet formation                                                                       Contact : Catherine Boyen
                                                                                                          CNRS / Goëmar (Roscoff) • 02 98 29 23 30
 La Bretagne et les Pays de la Loire se situent au     Concourir à faire                                  boyen@sb-roscoff.fr
 2ème rang national pour le nombre d’entre-
 prises spécialisées en biotechnologie.                de l’Ouest un pôle
 L’interrégionalité de la Génopole OUEST pré-
                                                       d’excellence                                       Agronomie
 sente ainsi un terrain particulièrement favorable
 à la valorisation des résultats de recherche en                                                          Etudier les organismes vivants d’intérêt pour
                                                       Génopole OUEST regroupe 400 doctorants             l’agriculture et la transformation des produits
 génomique et post-génomique.                          en biologie. Un DEA de "Génomique et
 Les deux Régions présentent des structures            Informatique" a été créé en 2000. L’originalité    alimentaires. Un intérêt particulier sera porté
 professionnalisées performantes pour le trans-        de ce DEA réside dans le double recrutement        aux espèces d’importance économique pour le
 fert de technologies et la création d’entreprises     de biologistes et d’informaticiens.                Grand Ouest.
 en biotechnologie : CRITT Santé Bretagne et           Un DESS "Entrepreunariat" a été ouvert en          Contact : Madeleine Douaire
 Pays de la Loire Innovation, BBV et CBB               2001, couplé à un Diplôme Universitaire            INRA-ENSAR • 02 23 48 54 62
 Développement.                                        "Création d’Entreprises Technologiques"
 Au total, 10 Technopoles sur les deux Régions                                                            madeleine.douaire@roazhon.inra.fr
                                                       ouverts aux créateurs.
 vont participer à la création d’entreprises de        Enfin, Génopole OUEST a mis en place pour
 biotechnologie via deux incubateurs Atlanpole         les chercheurs, enseignants-chercheurs et
 en Pays de la Loire et Emergys en Bretagne.
 Enfin, l’ensemble des établissements et des
                                                       ingénieurs des formations spécifiques en
                                                       Protéomique, en Bio-Informatique et sur la
                                                                                                          Santé :
 grands organismes impliqués présentent des            préparation des Puces à ADN.                       Etendre les recherches concernant les patholo-
 structures de valorisation pour les aspects de                                                           gies humaines les plus répandues dans le Grand
 propriété industrielle, de formalisation des                                                             Ouest pour lesquelles les scientifiques de
 contrats et de suivi de dossiers. Ces struc-                                                             Bretagne et Pays de la Loire ont une expertise
 tures travaillent déjà en réseau.                     Contact :                                          reconnue internationalement.
 Il faut souligner, pour finir, les initiatives com-   Daniel Boujard • UMR CNRS Rennes
 munes pour proposer aux jeunes des "bourses                                                              Contact : Jean-François Bouhours
                                                       02 23 23 63 76                                     INSERM Nantes • 02 40 41 28 35
 à la création d’entreprise", et pour créer un
 fond d’amorçage commun.                               Daniel.Boujard@univ-rennes1.fr                     jfb@nantes.inserm.fr


                                     2    Paré à Innover • N°8 • janvier - février - 2002
PARÉ à
                                                                                                                                                              INNOVER
Zoom de la valorisation. valorisation
 Des acteurs
             sur la           Zoom sur la valorisation
                                                                                                                                                      CRITT Santé
Bretagne Biotechnologie                                                CBB Développement                                                              Bretagne
                                                                                                                                                      La concertation entre les cher-
Végétale (BBV) :                                                       Avec plus de 15 ans d’expérience dans le transfert des biotechnolo-
                                                                       gies, CBB Développement est l’un des partenaires de Génopole                   cheurs, les DRRT (Direction régio-
Le développement des outils de biologie moléculaire, comme le          OUEST pour la valorisation de la recherche dans le secteur de la               nale de la recherche et de la
séquençage de l’ADN a ouvert de nouveaux horizons aux applications     biotechnologie.                                                                technologie) et les conseils régio-
des biotechnologies pour le végétal. Pour BBV, les travaux de géno-    Les secteurs médicaux et agricoles étant confiés à BBV et au CRITT             naux des deux régions se concré-
mique sont déterminants.                                               Santé, CBB Développement couvre les autres thématiques horizon-                tisent par un soutien d’animation
"BBV est partenaire de Génopole OUEST au titre de la valorisation      tales : le diagnostic, la chimie ou l’environnement.                           et de coordination via le CRITT
des résultats de la recherche. Notre objectif est d’appliquer les      A terme, fin 2002, voire 2003, les travaux de recherches engagés               Santé Bretagne
résultats de la génomique et de profiter des transferts de connais-    aujourd’hui devront se traduire par des réalisations concrètes :
sance en la matière. Par exemple, nous allons pouvoir exploiter les    transferts de technologies et créations d’entreprises avec l’incuba-           Le CRITT Santé Bretagne (Centre
recherches qui sont faites sur des ‘plantes cousines’ du chou-fleur,   teur Emergys.                                                                  Régional d’Innovation et Transfert
comme le colza, pour accélérer nos propres travaux portant sur ce      "Plus concrètement, pour l’année 2002, notre rôle portera sur 3                de Technologies) est un centre
légume typique de notre région.                                        points :                                                                       d’interface dédié au secteur de la
La plate-forme Génotypage-Séquençage prévue par le projet sera         • la veille technologique, au sens économique (et non scientifique),           santé.
établie au CNRS de Roscoff, ce qui est un atout en terme de proxi-       c’est à dire réaliser un état de l’art sur les marchés, sur la concur-       Ses missions concernent la diffu-
mité. Ses équipements ultra-modernes, parfois tout juste sortis du       rence, sur les choix qui sont faits dans le monde, et les paris tech-        sion de technologies, l’interface
stade prototype, donc souvent trop coûteux pour BBV, seront éga-         nologiques à faire ;
lement à notre disposition pour nos recherches."                       • la communication, créer des espaces de rencontres entre les cher-            entre la recherche et l’industrie, le
                                                                         cheurs et les applicateurs, qui se traduira par une aide logistique          conseil technologique, l’ingénierie
Contact :                                                                pour participer à des événements tels que Génom’Expo, Bio 2002               de projets et l’accompagnement
Serge Mabeau / Stéphane Boury • BBV                                      ou le Carrefour des Biotechnologies.                                         de projets innovants.
                                                                       • une réflexion sur l’expertise économique que les centres de trans-           Les missions spécifiques dans le
02 98 29 06 44                                                                                                                                        cadre de Génopole OUEST sont
                                                                         fert peuvent apporter aux plates-formes technologiques afin de
boury@bbv.fr                                                             mieux analyser les développements industriels possibles."                    destinées à accompagner et
                                                                                                                                                      conseiller les promoteurs de la
                                                                       Contact :                                                                      génopole OUEST , à mettre en
                                                                       Gilbert Blanchard • CBB Développement                                          place une animation en concerta-
                                                                       02 99 38 33 30                                                                 tion avec le comité de pilotage, à
                                                                       info@cbb-developpement.com                                                     soutenir la mise en place des
                                                                                                                                                      plate-formes et à accompagner

Une illustration du principe de valorisation                                                                                                          les programmes qui reposent sur
                                                                                                                                                      une complémentarité de compé-
                                                                                                                                                      tences, de thématiques et de
après la recherche fondamentale : les tests,                                                                                                          moyens à l’échelle des deux
                                                                                                                                                      régions.
puis les applications                                                                                                                                 Nouvelle recrue au CRITT Santé
Biotrial teste pour le CNRS                                            Biopredic : Efficacité et                                                      pour la Génopole Ouest

un possible substitut sanguin                                          Sécurité des produits                                                          Depuis le 7 janvier 2002,
                                                                                                                                                      Jocelyne Le Seyec a rejoint
Biotrial, laboratoire de recherche en pharmacologie s’est vu
récemment confié par le CNRS de la station Biologique de
                                                                       cosmétiques, pharmaceutiques                                                   l’équipe du CRITT Santé Bretagne
                                                                                                                                                      au poste d’animateur/coordina-
Roscoff les tests sur l’arénicole, un petit ver marin utilisé
comme appât par les pêcheurs.
                                                                       et compléments santé                                                           teur pour la Génopole OUEST.
L’arénicole est notre ‘cousin’ sanguin. Une molécule extra-            Biopredic a été créée en 1987 par Christophe Chesné, l’actuel                  Docteur en Biologie Moléculaire et
cellulaire de ce ver présente des propriétés similaires aux            Directeur Général de la société.                                               Cellulaire de l’Université de Rennes 1,
nôtres. Son sang pourrait donc se révéler être un substitut            A l’origine de cette PME rennaise : un transfert de technologie que            suivi d’un post-doctorat de 2 ans
sanguin efficace et                                                    Christophe Chesné a entrepris avec l’INSERM - l’Institut National              en Finlande, elle occupait un poste
pourrait ainsi pallier à                                               de la Santé et de la Recherche Médicale. Ce transfert portait sur la           de chef de projet dans la société
la pénurie des dons.                                                   culture de cellules du foie, une technique qu’il a ensuite exploitée           de biotechnologie ValiGen à Paris.
La recherche fonda-                                                    pour développer toute une série de tests in vitro.
mentale a été effec-                                                   Biopredic compte aujourd’hui 25 salariés et propose aux entreprises de :       Contact :
tuée par le docteur                                                    • tester in vitro les interactions médicamenteuses, établir le profil          Jocelyne Le seyec
Franck Zal du CNRS.                                     Arénicole        métabolique des médicaments
Des premiers tests                                                                                                                                    CRITT Santé Bretagne
ont d’ores et déjà été effectués sur des souris et se sont             • réaliser les études consommateurs pour évaluer l’efficacité des              02 23 23 45 81
révélés encourageants. Biotrial gère aujourd’hui les tests pré-          compléments alimentaires et produits cosmétiques                             crittgbm.bretagne@univ-rennes1.fr
cliniques sur d’autres animaux.                                        • réaliser les essais nécessaires pour assurer la sécurité des produits
Ces tests doivent déterminer si l’hémoglobine d’arénicole                cosmétiques
remplit tous les critères d’efficacité et de sécurité pour pou-        En 1993, Christophe Chesné a également lancé Biopredic
voir être transfusés à l’homme. Le cas échéant, une synthèse           International. Cette société permet à ses clients de réaliser leurs
par génie génétique ou bien l’élevage de ces arénicoles                propres tests produits grâce à l’utilisation de kits diagnostics déve-
(aquaculture) pourrait être envisagé dans la région.                   loppés par Biopredic International.
Contact :                                                              Contact :
Jean-Marc Gandon / Christophe Drieu La Rochelle                        Christophe Chesné • Biopredic
Biotrial • 02 99 59 91 91                                              02 99 14 36 14
christophe.drieu@biotrial.com                                          christophe.chesne@biopredic.com

                                                                                                                                                  3
PARÉ à                                         Lettre d’information de l’innovation en bretagne
       INNOVER
            Petit lexique …
         Si comme certains
                                                   Bio-informatique
                                                   Bio-informatique
              d’entre nous,
            vous n’êtes pas
                                                   Relever le défi du décryptage des
           des "pros" de la                        génomes : la Bio-informatique
              génomique…                           Dans le projet de la Génopole OUEST, la bio-infor-        nées massives de la génomique et leur analyse au
                                L’ADN              matique prend naturellement une place stratégique.        quotidien Celle-ci repose sur des moyens de cal-
 C’est une macromolécule servant de                Il s’agit de mettre à disposition des biologistes une     culs puissants, coordonnés par l’Irisa de Rennes, et
    support à l'information génétique              infrastructure performante pour la gestion des don-       articulés au sein du réseau régional haut débit
     chez la plupart des êtres vivants.
                                                                                                             Mégalis. Il s’agit ensuite de relever le formidable
                               Le gène              Radiographie ADN                                         défi du décryptage des génomes nouvellement
C’est une portion d’ADN contenue dans                                                                        séquencés, c’est à dire de développer des
le chromosome qui va conditionner la                                                                         recherches en collaboration étroite entre biolo-
  transmission et la manifestation d’un                                                                      gistes et informaticiens, nécessaires au passage de
           caractère héréditaire donné.                                                                      données expérimentales brutes à de véritables
                            Le génome
                                                                                                             connaissances sur le fonctionnement du vivant.
 C’est la carte d’identité de l’individu                                                                     Contact :
c’est à dire l’ensemble des gènes qu’il                                                                      Jacques Nicolas • IRISA Rennes
           transmet à sa descendance.
                                                                                                             02 99 84 73 12
                           Le génotype                                                                       Jacques.Nicolas@irisa.fr
C’est l'ensemble des caractères hérédi-
taires propres à un individu et contenu
                       dans le génome.
                          La génétique
                                                   Infos pratiques
                                                   Infos pratiques
C’est l’étude de la structure des gènes.           Les chiffres clés
                         La génomique
    C’est l’étude de la structure et des           Secteur mer :                                             Secteur agronomique :
                fonctions des génomes.
                                                   Economiquement, le secteur de la mer dans                 L’activité agronomique en Bretagne et Pays de
                        La protéomique             l’Ouest c’est :                                           la Loire est très importante puisque ces deux
      C’est l’étude de la structure et des                                                                   régions produisent par rapport à la produc-
fonctions des protéines codées par les             • Pour la pêche :                                         tion nationale :
    gênes pour transmettre les informa-              50 % de la production nationale de poisson
   tions relatives aux caractères hérédi-            (350 000 tonnes) et 100 % de la production               • 70 % de choux-fleurs,      • 42 % de viande de volaille,
      taires. Déceler parmi les protéines            d’algues (50 000 tonnes) sont réalisées dans l’ouest.    • 33 % de pommes de terre,   • 31 % de veau,
  celles qui sont responsables de mala-                                                                       • 36 % de primeurs,          • 20 % de lait,
 dies peut permettre à l’industrie phar-           • Pour l’aquaculture :
     maceutique de mettre au point de                30% de la production nationale provient                  • 30 % de pommes,            • 47 % d’œuf,
 nouveaux traitements thérapeutiques.                de l’ouest.                                              • 56 % de porc,              • 45 % d’aliment pour le bétail.

      Les puces à ADN (ou biopuces)                • Pour la conserverie :                                   Sans compter les industries agroalimentaires
Les puces à ADN sont des supports (sili-             80 % des conserves nationales de poissons,              qui réalisent à elles seules (produits finis, salai-
  cium, plastique, verre, etc.) d'une taille         sardines, maquereaux, thons sont issues de la           sons…) le plus gros chiffre d’affaires de l’indus-
 d'environ 1 cm2 sur lesquels sont greffés           production de l’ouest.                                  trie régionale dans l’Ouest.
 des sondes d’ADN qui vont reconnaître
  une séquence d’ADN donnée. Les bio-
puces sont appelées à devenir des outils
    de choix pour les chercheurs qui tra-
              vaillent dans la génomique.
          Le séquençage (des gènes)
                                                   Agenda                                                    Kiosque
   C’est le décryptage des séquences               Quelques dates à retenir pour 2002                        Tout comprendre de la génomique
moléculaires composant un gène, une
                             protéine              6ème congrès annuel de la Société Française
                                                                                                             en trois clics
                                                   de Pharmacologie                                          Si vous souhaitez en savoir plus, le site
                                                   Rennes du 8 au 10 avril.                                  www.sciences-en-ligne.com vous propose des
                                                   http://www.pharmacol-fr.org/rennes2002                    modules animés pour comprendre le génome et la
                                                                                                             génétique, une sélection d’ouvrages, des infos scienti-
                                                   BIO 2002 à Toronto                                        fiques, techniques et industrielles sur la génomique.
                                                   (Canada) du 9 au 13 juin
                                                   http://www.bio.org
                                                   JOBIM (Journées Ouvertes Biologie Informatique
                                                   Mathématique)
Directeur de Publication :                         St Malo du 10 au 12 juin.
Michel Kervoas
Rédaction : équipe de Bretagne Innovation          http://www.irisa.fr/JOBIM
et correspondants
Création et réalisation :                          1er Carrefour européen des biotechnologies et
Agence de création autrement Loïc Bohuon           6ème Carrefour Français
Impression : Imprimerie CPS                        Lille les 15-16 octobre.
ISSN : 1624-8589 • Tirage 5500 ex                  http://www.biotech-lille.com
Avec le soutien du
Conseil Régional de Bretagne
Bretagne Innovation • 18 place de la gare
CS 26927 - 35069 Rennes cedex                  4   Paré à Innover • N°8 • janvier - février - 2002
contact@bretagne-innovation.tm.fr

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Cahier PAI 2002 : Génopole Ouest

  • 1. PARÉ à INNOVER Lettre d’information de l’innovation en bretagne numéro spécial supplément au n°8 janvier - février 2002 Génopole OUEST, un nouveau levier pour la recherche et le transfert de technologie Editorial Editorial Génopole OUEST : Chercheurs à l'unisson Sommaire Sommaire Le long travail de structuration et de matura- de nouvelles perspectives tant au niveau for- tion du secteur de la biologie dans les secteurs mation qu'au niveau de la valorisation pour P.2 Le projet de la mer, de l'agro alimentaire et de la santé a accueillir de nouveaux chercheurs et favoriser permis la création au 1er janvier 2002 d'une le transfert de technologies et la création d'en- Génopole OUEST génopole interrégionale Bretagne - Pays de la treprises de biotechnologies dans l'Ouest. Je Loire. Actuellement 750 chercheurs et 47 uni- profite de l'opportunité de cet éditorial pour tés de recherche sont mobilisés autour de pro- remercier tous les partenaires associés à la grammes de génomique et post génomique à grande échelle. A ce jour, les recherches sont génopole et tout particulièrement les deux Conseils Régionaux et les deux DRRT de P.3 Zoom sur la orientées autour de 5 plates-formes : bio- Bretagne et Pays de La Loire qui dès le départ valorisation informatique, séquençage-génotypage, explo- nous ont soutenus, et pour vous offrir tous nos ration fonctionnelle, bio puce et protéomique. meilleurs vœux pour 2002 au nom du comité Elles sont pour certaines déjà opérationnelles, de pilotage de Génopole OUEST. et pour d'autres, elles le seront dans leurs formes optimales d'ici le printemps 2002. Un Michel Renard P.4 Bio Informatique, autre défi de la labellisation est d'ouvrir aussi Directeur de génopole OUEST. Infos pratiques et petit lexique
  • 2. PARÉ à Lettre d’information de l’innovation en bretagne INNOVER Génopole OUEST Le projet… Les domaines de la génomique et de la post-génomique ouvrent des perspectives considérables dans les domaines de l’agrobiologie, de la mer et de la santé. La géno- mique consiste en l’étude du génome et, depuis quelques années, la révolution géno- mique bouleverse incontestablement l'approche technologique et la connaissance du vivant. En effet, grâce au séquençage massif et systématique de nombreux génomes, dont le génome humain, une formidable source d'informations est désormais dispo- nible. La post-génomique prend alors le relais car elle s’applique à l’étude de l’expres- sion de ces gènes et à l’identification de leurs fonctions biologiques. S’associer pour capitaliser Volet scientifique les expériences Mettre en commun des Génopole OUEST est un projet stratégique Enfin, Génopole OUEST s’appuiera sur le outils et des compétences pour la formation supérieure et la recherche réseau des Technopoles et des Centres de Quels que soient les espèces et les dans le domaine des sciences du vivant, de la Transfert de Technologie pour promouvoir la domaines, les questions fondamentales de la bio-informatique et pour le développement valorisation des activités scientifiques vers le génomique restent les mêmes ainsi que les économique dans les domaines de la mer, de secteur privé et la création de nouvelles outils méthodologiques à mettre en œuvre l’agroalimentaire et de la santé. entreprises. pour y répondre. C’est sur ce constat que repose la conception de Génopole OUEST. L’objectif est ainsi de : participer col- D’autre part, il était primordial de construire lectivement à l’évolution tech- ce dispositif de grande échelle en s’appuyant nologique, dynamiser et struc- sur les forces régionales déjà existantes. turer la recherche, la forma- La mise en commun des outils et des com- tion et le développement pétences (Mer, Agro, Santé, Bio-Info) doit économique, et enfin réaliser permettre à l’Ouest de réaliser des pro- le changement d’échelle pour grammes de Biologie d’envergure internatio- renforcer l’excellence scienti- nale tout en tenant compte des secteurs fique du Grand Ouest. d’importance économique régionale : La Génopole OUEST est Application de la recherche scientifique dans constituée de 3 volets : les secteurs clés de la génomique… • le volet scientifique • le volet formation • le volet valorisation et de 5 plateaux techniques : • Puces à ADN Mer : • Génotypage/Séquençage • Explorer la diversité marine, • Protéomique • Mieux gérer les populations marines d’intérêt • Exploration Fonctionnelle économique, • Bio-Informatique • Développer des recherches sur les modèles marins de biologie fondamentale • Exploiter les océans par l’utilisation de gènes d’intérêt. Volet valorisation Volet formation Contact : Catherine Boyen CNRS / Goëmar (Roscoff) • 02 98 29 23 30 La Bretagne et les Pays de la Loire se situent au Concourir à faire boyen@sb-roscoff.fr 2ème rang national pour le nombre d’entre- prises spécialisées en biotechnologie. de l’Ouest un pôle L’interrégionalité de la Génopole OUEST pré- d’excellence Agronomie sente ainsi un terrain particulièrement favorable à la valorisation des résultats de recherche en Etudier les organismes vivants d’intérêt pour Génopole OUEST regroupe 400 doctorants l’agriculture et la transformation des produits génomique et post-génomique. en biologie. Un DEA de "Génomique et Les deux Régions présentent des structures Informatique" a été créé en 2000. L’originalité alimentaires. Un intérêt particulier sera porté professionnalisées performantes pour le trans- de ce DEA réside dans le double recrutement aux espèces d’importance économique pour le fert de technologies et la création d’entreprises de biologistes et d’informaticiens. Grand Ouest. en biotechnologie : CRITT Santé Bretagne et Un DESS "Entrepreunariat" a été ouvert en Contact : Madeleine Douaire Pays de la Loire Innovation, BBV et CBB 2001, couplé à un Diplôme Universitaire INRA-ENSAR • 02 23 48 54 62 Développement. "Création d’Entreprises Technologiques" Au total, 10 Technopoles sur les deux Régions madeleine.douaire@roazhon.inra.fr ouverts aux créateurs. vont participer à la création d’entreprises de Enfin, Génopole OUEST a mis en place pour biotechnologie via deux incubateurs Atlanpole les chercheurs, enseignants-chercheurs et en Pays de la Loire et Emergys en Bretagne. Enfin, l’ensemble des établissements et des ingénieurs des formations spécifiques en Protéomique, en Bio-Informatique et sur la Santé : grands organismes impliqués présentent des préparation des Puces à ADN. Etendre les recherches concernant les patholo- structures de valorisation pour les aspects de gies humaines les plus répandues dans le Grand propriété industrielle, de formalisation des Ouest pour lesquelles les scientifiques de contrats et de suivi de dossiers. Ces struc- Bretagne et Pays de la Loire ont une expertise tures travaillent déjà en réseau. Contact : reconnue internationalement. Il faut souligner, pour finir, les initiatives com- Daniel Boujard • UMR CNRS Rennes munes pour proposer aux jeunes des "bourses Contact : Jean-François Bouhours 02 23 23 63 76 INSERM Nantes • 02 40 41 28 35 à la création d’entreprise", et pour créer un fond d’amorçage commun. Daniel.Boujard@univ-rennes1.fr jfb@nantes.inserm.fr 2 Paré à Innover • N°8 • janvier - février - 2002
  • 3. PARÉ à INNOVER Zoom de la valorisation. valorisation Des acteurs sur la Zoom sur la valorisation CRITT Santé Bretagne Biotechnologie CBB Développement Bretagne La concertation entre les cher- Végétale (BBV) : Avec plus de 15 ans d’expérience dans le transfert des biotechnolo- gies, CBB Développement est l’un des partenaires de Génopole cheurs, les DRRT (Direction régio- Le développement des outils de biologie moléculaire, comme le OUEST pour la valorisation de la recherche dans le secteur de la nale de la recherche et de la séquençage de l’ADN a ouvert de nouveaux horizons aux applications biotechnologie. technologie) et les conseils régio- des biotechnologies pour le végétal. Pour BBV, les travaux de géno- Les secteurs médicaux et agricoles étant confiés à BBV et au CRITT naux des deux régions se concré- mique sont déterminants. Santé, CBB Développement couvre les autres thématiques horizon- tisent par un soutien d’animation "BBV est partenaire de Génopole OUEST au titre de la valorisation tales : le diagnostic, la chimie ou l’environnement. et de coordination via le CRITT des résultats de la recherche. Notre objectif est d’appliquer les A terme, fin 2002, voire 2003, les travaux de recherches engagés Santé Bretagne résultats de la génomique et de profiter des transferts de connais- aujourd’hui devront se traduire par des réalisations concrètes : sance en la matière. Par exemple, nous allons pouvoir exploiter les transferts de technologies et créations d’entreprises avec l’incuba- Le CRITT Santé Bretagne (Centre recherches qui sont faites sur des ‘plantes cousines’ du chou-fleur, teur Emergys. Régional d’Innovation et Transfert comme le colza, pour accélérer nos propres travaux portant sur ce "Plus concrètement, pour l’année 2002, notre rôle portera sur 3 de Technologies) est un centre légume typique de notre région. points : d’interface dédié au secteur de la La plate-forme Génotypage-Séquençage prévue par le projet sera • la veille technologique, au sens économique (et non scientifique), santé. établie au CNRS de Roscoff, ce qui est un atout en terme de proxi- c’est à dire réaliser un état de l’art sur les marchés, sur la concur- Ses missions concernent la diffu- mité. Ses équipements ultra-modernes, parfois tout juste sortis du rence, sur les choix qui sont faits dans le monde, et les paris tech- sion de technologies, l’interface stade prototype, donc souvent trop coûteux pour BBV, seront éga- nologiques à faire ; lement à notre disposition pour nos recherches." • la communication, créer des espaces de rencontres entre les cher- entre la recherche et l’industrie, le cheurs et les applicateurs, qui se traduira par une aide logistique conseil technologique, l’ingénierie Contact : pour participer à des événements tels que Génom’Expo, Bio 2002 de projets et l’accompagnement Serge Mabeau / Stéphane Boury • BBV ou le Carrefour des Biotechnologies. de projets innovants. • une réflexion sur l’expertise économique que les centres de trans- Les missions spécifiques dans le 02 98 29 06 44 cadre de Génopole OUEST sont fert peuvent apporter aux plates-formes technologiques afin de boury@bbv.fr mieux analyser les développements industriels possibles." destinées à accompagner et conseiller les promoteurs de la Contact : génopole OUEST , à mettre en Gilbert Blanchard • CBB Développement place une animation en concerta- 02 99 38 33 30 tion avec le comité de pilotage, à info@cbb-developpement.com soutenir la mise en place des plate-formes et à accompagner Une illustration du principe de valorisation les programmes qui reposent sur une complémentarité de compé- tences, de thématiques et de après la recherche fondamentale : les tests, moyens à l’échelle des deux régions. puis les applications Nouvelle recrue au CRITT Santé Biotrial teste pour le CNRS Biopredic : Efficacité et pour la Génopole Ouest un possible substitut sanguin Sécurité des produits Depuis le 7 janvier 2002, Jocelyne Le Seyec a rejoint Biotrial, laboratoire de recherche en pharmacologie s’est vu récemment confié par le CNRS de la station Biologique de cosmétiques, pharmaceutiques l’équipe du CRITT Santé Bretagne au poste d’animateur/coordina- Roscoff les tests sur l’arénicole, un petit ver marin utilisé comme appât par les pêcheurs. et compléments santé teur pour la Génopole OUEST. L’arénicole est notre ‘cousin’ sanguin. Une molécule extra- Biopredic a été créée en 1987 par Christophe Chesné, l’actuel Docteur en Biologie Moléculaire et cellulaire de ce ver présente des propriétés similaires aux Directeur Général de la société. Cellulaire de l’Université de Rennes 1, nôtres. Son sang pourrait donc se révéler être un substitut A l’origine de cette PME rennaise : un transfert de technologie que suivi d’un post-doctorat de 2 ans sanguin efficace et Christophe Chesné a entrepris avec l’INSERM - l’Institut National en Finlande, elle occupait un poste pourrait ainsi pallier à de la Santé et de la Recherche Médicale. Ce transfert portait sur la de chef de projet dans la société la pénurie des dons. culture de cellules du foie, une technique qu’il a ensuite exploitée de biotechnologie ValiGen à Paris. La recherche fonda- pour développer toute une série de tests in vitro. mentale a été effec- Biopredic compte aujourd’hui 25 salariés et propose aux entreprises de : Contact : tuée par le docteur • tester in vitro les interactions médicamenteuses, établir le profil Jocelyne Le seyec Franck Zal du CNRS. Arénicole métabolique des médicaments Des premiers tests CRITT Santé Bretagne ont d’ores et déjà été effectués sur des souris et se sont • réaliser les études consommateurs pour évaluer l’efficacité des 02 23 23 45 81 révélés encourageants. Biotrial gère aujourd’hui les tests pré- compléments alimentaires et produits cosmétiques crittgbm.bretagne@univ-rennes1.fr cliniques sur d’autres animaux. • réaliser les essais nécessaires pour assurer la sécurité des produits Ces tests doivent déterminer si l’hémoglobine d’arénicole cosmétiques remplit tous les critères d’efficacité et de sécurité pour pou- En 1993, Christophe Chesné a également lancé Biopredic voir être transfusés à l’homme. Le cas échéant, une synthèse International. Cette société permet à ses clients de réaliser leurs par génie génétique ou bien l’élevage de ces arénicoles propres tests produits grâce à l’utilisation de kits diagnostics déve- (aquaculture) pourrait être envisagé dans la région. loppés par Biopredic International. Contact : Contact : Jean-Marc Gandon / Christophe Drieu La Rochelle Christophe Chesné • Biopredic Biotrial • 02 99 59 91 91 02 99 14 36 14 christophe.drieu@biotrial.com christophe.chesne@biopredic.com 3
  • 4. PARÉ à Lettre d’information de l’innovation en bretagne INNOVER Petit lexique … Si comme certains Bio-informatique Bio-informatique d’entre nous, vous n’êtes pas Relever le défi du décryptage des des "pros" de la génomes : la Bio-informatique génomique… Dans le projet de la Génopole OUEST, la bio-infor- nées massives de la génomique et leur analyse au L’ADN matique prend naturellement une place stratégique. quotidien Celle-ci repose sur des moyens de cal- C’est une macromolécule servant de Il s’agit de mettre à disposition des biologistes une culs puissants, coordonnés par l’Irisa de Rennes, et support à l'information génétique infrastructure performante pour la gestion des don- articulés au sein du réseau régional haut débit chez la plupart des êtres vivants. Mégalis. Il s’agit ensuite de relever le formidable Le gène Radiographie ADN défi du décryptage des génomes nouvellement C’est une portion d’ADN contenue dans séquencés, c’est à dire de développer des le chromosome qui va conditionner la recherches en collaboration étroite entre biolo- transmission et la manifestation d’un gistes et informaticiens, nécessaires au passage de caractère héréditaire donné. données expérimentales brutes à de véritables Le génome connaissances sur le fonctionnement du vivant. C’est la carte d’identité de l’individu Contact : c’est à dire l’ensemble des gènes qu’il Jacques Nicolas • IRISA Rennes transmet à sa descendance. 02 99 84 73 12 Le génotype Jacques.Nicolas@irisa.fr C’est l'ensemble des caractères hérédi- taires propres à un individu et contenu dans le génome. La génétique Infos pratiques Infos pratiques C’est l’étude de la structure des gènes. Les chiffres clés La génomique C’est l’étude de la structure et des Secteur mer : Secteur agronomique : fonctions des génomes. Economiquement, le secteur de la mer dans L’activité agronomique en Bretagne et Pays de La protéomique l’Ouest c’est : la Loire est très importante puisque ces deux C’est l’étude de la structure et des régions produisent par rapport à la produc- fonctions des protéines codées par les • Pour la pêche : tion nationale : gênes pour transmettre les informa- 50 % de la production nationale de poisson tions relatives aux caractères hérédi- (350 000 tonnes) et 100 % de la production • 70 % de choux-fleurs, • 42 % de viande de volaille, taires. Déceler parmi les protéines d’algues (50 000 tonnes) sont réalisées dans l’ouest. • 33 % de pommes de terre, • 31 % de veau, celles qui sont responsables de mala- • 36 % de primeurs, • 20 % de lait, dies peut permettre à l’industrie phar- • Pour l’aquaculture : maceutique de mettre au point de 30% de la production nationale provient • 30 % de pommes, • 47 % d’œuf, nouveaux traitements thérapeutiques. de l’ouest. • 56 % de porc, • 45 % d’aliment pour le bétail. Les puces à ADN (ou biopuces) • Pour la conserverie : Sans compter les industries agroalimentaires Les puces à ADN sont des supports (sili- 80 % des conserves nationales de poissons, qui réalisent à elles seules (produits finis, salai- cium, plastique, verre, etc.) d'une taille sardines, maquereaux, thons sont issues de la sons…) le plus gros chiffre d’affaires de l’indus- d'environ 1 cm2 sur lesquels sont greffés production de l’ouest. trie régionale dans l’Ouest. des sondes d’ADN qui vont reconnaître une séquence d’ADN donnée. Les bio- puces sont appelées à devenir des outils de choix pour les chercheurs qui tra- vaillent dans la génomique. Le séquençage (des gènes) Agenda Kiosque C’est le décryptage des séquences Quelques dates à retenir pour 2002 Tout comprendre de la génomique moléculaires composant un gène, une protéine 6ème congrès annuel de la Société Française en trois clics de Pharmacologie Si vous souhaitez en savoir plus, le site Rennes du 8 au 10 avril. www.sciences-en-ligne.com vous propose des http://www.pharmacol-fr.org/rennes2002 modules animés pour comprendre le génome et la génétique, une sélection d’ouvrages, des infos scienti- BIO 2002 à Toronto fiques, techniques et industrielles sur la génomique. (Canada) du 9 au 13 juin http://www.bio.org JOBIM (Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématique) Directeur de Publication : St Malo du 10 au 12 juin. Michel Kervoas Rédaction : équipe de Bretagne Innovation http://www.irisa.fr/JOBIM et correspondants Création et réalisation : 1er Carrefour européen des biotechnologies et Agence de création autrement Loïc Bohuon 6ème Carrefour Français Impression : Imprimerie CPS Lille les 15-16 octobre. ISSN : 1624-8589 • Tirage 5500 ex http://www.biotech-lille.com Avec le soutien du Conseil Régional de Bretagne Bretagne Innovation • 18 place de la gare CS 26927 - 35069 Rennes cedex 4 Paré à Innover • N°8 • janvier - février - 2002 contact@bretagne-innovation.tm.fr