cours de faunistique

2. UNIVERSITÉ HASSAN II
DE CASABLANCA
Faculté des Sciences
Aïn Chock
‫بالدار‬ ‫الثاني‬ ‫الحسن‬ ‫جامعة‬
‫البيضاء‬
‫الشق‬ ‫عين‬ ‫العلوم‬ ‫كلية‬
Cours 1 de faunistique( partie Invertébrés)
K.MOUNAJI
FSAC

3. Introduction à la classification
Protistes Protozoaires
Embranchement des Cnidaires
tarvt
’lilanuli'
K. MOUNAJ!

4. CLASSIFICATION
Classification = Systématique =TAXINOMIE ou TAXONOMIE
Nomenclature :
➢ Décrire
Morphologie externe, anatomie interne, embryologie
➢Classer : nomenclature binomiale (Linné):
Les espèces sont nommées selon le système binomial mis
en place par Linné:
Un nom d'espèce est composé d'un nom de genre, suivi
d'un qualificatif d'espèce, en latin, suivi (en toute rigueur)
de la mention d'origine (auteur et date de la détermination)
CLASSIFICATION
K. MOUNAJI

5. Nomenclature binomiale
(en italique)
La Systematique
La Nomenclature binomiale
Espece
Genre
/
v
(Homo) (sapiens) (
(Linne, 1758p
/
Auteur et date de
la premiere description
K.MOUNAJI

6. • Le classement repose sur une hiérarchie fixe de catégories de
taxon :
• (vivant) → règne → embranchement→ classe → ordre → famille
→ genre → espèce
• Par exemple, la classification de l'espèce humaine est la
suivante:
Règne: Animal
Embranchement: Chordés
Classe: Mammifères
Ordre: Primates
Famille: Hominidés
Genre: Homo
Espèce: sapiens
CLASSIFICATION
CLASSIFICATION
K. MOUNAJI

7. Identifier n'est pas toujours aisé car le nombre d'espèces est très élevé (De
plus, l'être vivant le plus souvent change de morphologie en fonction de la
saison )
La ressemblance (les caractères communs) ne suffit plus, d'autres critères
s'avèrent nécessaires
▪ Interfécondité : Une espèce regroupe des êtres vivants qui se reproduisent
entre eux et dont les descendants se reproduisent aussi entre eux
Ex: Le lion et la lionne donnent naissance à un lionceau qui à son tour va
procréer avec une femelle,
Par contre : le lion et le tigre sont des espèces très proches : le tigron= hybride stérile
 Étudier l’évolution des espèces : Phylogénie; chercher les liens de parenté
entre les différents taxons
Notion d'espèce
K. MOUNAJI

8. La classification actuelle se base sur plusieurs disciplines:
• Anatomie comparée
• Embryologie
• Biochimie (propriétés des protéines )
• Paléontologie (anatomie, biologie moléculaire et datation)
• Biologie moléculaire (séquences en acides aminés ou acides nucléiques et
actuellement DNA Barcoding …)
Notion d'espèce
K. MOUNAJ!

9. • Le DNA Barcoding est une approche moléculaire publiée par
Paul Hebert et son équipe (Hebert et al., 2003) qui repose sur
le séquençage d’un fragment d’ADN bien particulier commun
à la plupart des organismes : le gène mitochondrial (648 pb)
codant pour la sous-unité 1 de la protéine Cytochrome
Oxydase (COI)
• En comparant cet ADN à une base de données de référence
(banque de données), il est possible de savoir à quelle espèce
il appartient
DNA BARCODING
K. MOUNAJ!

10. • L’usage du DNA-Barcoding s'est renforcé par le concept de la taxonomie
intégrative (Dayrat, 2005; Rubinoff, 2006; Mutanen et al., 2012). C’est une
technique qui vise à mieux décrypter et délimiter les frontières entre les
espèces. Elle implique trois principaux critères : moléculaire (le gène COI,
mais parfois d'autres marqueurs), écologique et morphologique propres à
chaque espèce
DNA BARCODING
K. MOUNAJI

11. Domaine des
Eubacteria
Domaine des
Archaebacteria
Domaine des
Eucaryotes
TROIS DOMAINES
Classification
K. MOUNAJI

12. DOMAINE DES EUCARYOTES
► EUCARYOTES divisés en 4 Règnes:
• Protistes
• Champignons
• Plantes
• Animaux
K. MOUNAJI

13. Règne des PROTISTES
• Dans l'ensemble des Protistes :
Étudier ceux qui ont des affinités animales et que l'on
regroupe dans l'ensemble des Protozoaires.
des PROTISTES

14. Règne des ANIMAUX Pluricellulaires
Se divise en une trentaine d’embranchements
On peut dire aussi « phylum » (pluriel « phyla »)
• Spongiaires (porifères)
• Cnidaires (hydres, méduses)
• Plathelminthes (vers plats)
• Rotifères
• Némathelminthes (vers ronds)
• Annélides
• Mollusques
• Arthropodes
• Échinodermes
• Chordés
11iI!i! ] 11! i j i
S
S
1
o
I
<J
£
o a
t
UJ
E
Lophotroohozoa Ecdysozoa
Protostomia Deuterostomia
Radiata Bilateria
Parazoa Eumetazoa
Ancestral colonial
choanoflagellate
K. MOUNAJI
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15. PROTOZOAIRES
(prôtos, premier zôon, animal)
K. MOUNAJ!

16. PROTOZOAIRES
Eucaryotes
unicellulaires
Cellule d’un Protozoaire
=
Organisme à part entière
Ce sont les organelles de cette cellule qui
remplissent le rôle des tissus et organes des
animaux plus complexes.
=
Cellule totipotente
K. MOUNAJ!

17. Sept phyla
ou
Embranchements
Trois Embranchements
PROTOZOAIRES
Étudier
K. MOUNAJI

18. PROTOZOAIRES
I. Embt SARCOMASTIGOPHORES
II. Embt APICOMPLEXES
III. Embt CILIOPHORES (ou INFUSOIRES)
K. MOUNAJI

19. Trois sous-embranchements:
SE/ MASTIGOPHORES ou FLAGELLÉS
SE/ OPALINES
SE/ SARCODINES
Flagelles ou Pseudopodes
sarcos = chair, mastix =fouet, phorein = porter
Embt. SARCOMASTIGOPHORES
Embt.SARCOMASTIGOPHORES
K, MQUNAJ!

20. • Classe des ZOOMASTIGOPHORES
➢ un ou plusieurs flagelles locomoteurs
pendant au moins une partie de leur cycle
➢ libres, parasites ou symbiotes.
Un ou plusieurs flagelles
Embt. MASTIGOPHORES= FLAGELLES
Embt. MASTIGOPHORES= FLAGELLES
Un ou plusieurs flagelles
K.MQUNAJ!

21. Classe des ZOOMASTIGOPHORES
Exemple: Trypanosoma sp. : Agent de la maladie du sommeil
Parasite du sang transmis par
la mouche tse-tse
K.MOUNAJI

22. Trypanosoma
Globule rouge (hématie)
Trypanosomes très mobiles : sang, ganglions, Liquide
céphalorachidien (LCR)
I—Flagelle
Li!
Membrane
ondulante
, r
.i
0K3
Trypanosome
w -
X <0
^ dE^
o K. MOUNAJI

23. Vecteurs de trypanosomes
Triatoma sp = Punaise hématophage
Trypanosoma cruzi
Maladie de CHAGAS (fièvre et oedème
oculaire)
Amérique du sud (Argentine, Bolivie,
Brésil, Mexique…)  50 000 morts/an
Glossina sp= mouche Tsé-tsé
Trypanosoma brucei gambiense
Trypanosoma brucei rhodesiense
Trypanosomose Humaine Africaine =
Maladie du sommeil (AFRIQUE (Ouest,
Centrale et Est)
/
fievre et oedeme
oculaire)
K. MOUNAJI

24. Exemple : Trichomonas
flagelles
membrane
ondulante
noyau
i /
«
axostyle
Trophozoite
Trichomonas vaginalis -> Trichomonose
K. MOUNAJI

25. SE/ OPALINES
Flagelles nombreux et courts
forme de petite feuille, plusieurs noyaux
Opalina ranarum
Opalina ranarum
K. MOUNAJI

26. S/E SARCODINES
Pseudopodes ou lobopodes
• Super-classe des RHIZOPODES
Libres ou parasites
AMIBES, FORAMINIFERES
K. MOUNAJI

27. Exemple: Entamoeba histolytica (parasite de l’homme)
Selles glairo-sanguinolantes
Super-classe des RHIZOPODES
0
' cfb
A.WBE
Noyau
a
/ &
*.'
•
•
« V *
*
x
;
v
WL
;
Hematie
phagocytes
Amibiase - Dysenterie
Entamoeba histolytica
K. MOUNAJI

28. Tests de Foraminifères
Super-classe des RHIZOPODES
Exemples: Foraminiferes
rhizopodes
(fins pseydopodes)
&
>
(i
'V«w4 &MV
NS
^ ^ 5 %
.
nombreux foramens
(pores)
#•
- .. ;
Test calcaire
plusieurs loges
a
Predateurs
marins, benthiques en general
planctoniques
sa»
Excellents marqueurs stratigraphiques
K. MOUNAJI

29. S/E SARCODINES
Pseudopodes ou lobopodes
* Super-classe des ACTINOPODES
- Pseudopodes rayonnants (3 classes)
Exemple: la classe des Radiolaires
Pseudopodes
fins et reticules
Coque
siliceuse
.
Capsule
centrale
K. MOUNAJI

30. Embt. APICOMPLEXES
Classe des SPOROZOAIRES
- Spores
- Pas d'appareil locomoteur donc localisation endocellulaire
obligatoire: Locomotion à l’état adulte par:
flexions, glissements, ondulations
- Tous parasites d’animaux
- Ils possèdent un Complexe apical (ensemble d’organites)
permettant la pénétration dans la cellule hôte
Deux sous classes
Embt. APICOMPLEXES
l K. MOUNAJI

31. * Sous-cl. GREGARINES
- Parasites monoxènes de grande taille
- Mobiles à l’état végétatif
- Parasites d’Invertébrés
uniquement
Stylocephalus longicollis
Parasite d’insectes coléoptères
Classe des SPOROZOAIRES
K. MOUNAJI

32. • Sous-cl. COCCIDIES
• Taille petite ou moyenne
• Immobiles à l’état végétatif
• Parasites de Vertébrés et d’Invertébrés
Plasmodioum falciparum Paludisme ou Malaria
(injection de sporozoïtes à l’homme par piqûre de l’anophèle
femelle infestée)
Classe des SPOROZOAIRES
K. MOUNAJI

33. Embt. CILIOPHORES (Ciliés)
Cils, deux noyaux (macro et micronucleus)
libres ou parasites
Embt. CILIOPHORES (Cili<§s)
Paramecie
'•
":
l
3
Ciliature orale-
r
.,;
i
&
Ciliature
somatique
K.MOUNAJI

34. Embranchement des CNIDAIRES
• Animaux pluricellulaires: Métazoaires (fonctions assurées par des
tissus ou organes)
• Sac à double paroi (diploblastique),
K. MOUNAJI

35. Animal à symétrie rayonnée Animal à symétrie bilatérale (Dr et G)
Cnidaires
Symétrie radiale, un seul orifice : Bouche/Anus, Cnidoblastes (ectoderme)
Symetrie radiale, un seul orifice
K. MOUNAJI

36. ▪Cycle de développement : alternance une phase fixée : forme polype et une phase
nageuse, forme méduse
Les Cnidaires Ectoderme
Mesoglee
Endoderme
bouche
tentacules p
r
I I
i e- -.'-a
I . -S
fe
^
cavite
" gastro-
vasculaire
• j
i
k * M
tentacules
Hi
k
bouche
Meduse LIBRE
Polype FIXE
K. MOUNAJI

37. Larve
Embranchement des CNIDAIRES
Gonades
Tentacules
Meduse
I
Borgeons
medusaires
Oeuf
fz
Ectoderme
cilie
sE
i1
Tentacules Portion de la colonie
Planula
1er polype
Cycle de developpement
de Cnidaire
K. MOUNAJI

38. CLASSIFICATION
CNIDAIRES
HYDROZOAIRES ANTHOZOAIRES
SCYPHOZOAIRES
Embranchement
Super-classes
K. MOUNAJI

39. CLASSIFICATION
• Super-classe des HYDROZOAIRES
➢ Classe des HYDRAIRES
➢ Classe des HYDROCORALLIAIRES
➢ Classe des SIPHONOPHORES
• Superclasse des SCYPHOZOAIRES
• Superclasse des ANTHOZOAIRES
➢Classe des OCTOCORALLIAIRES
➢Classe des HEXACORALLIAIRES
K. MOUNAJI