L'EBE retraité est souvent utilisé pour évaluer la valorisation des entreprises, mais il risque d'ignorer des éléments essentiels comme les impôts et l'amortissement. Le lien direct entre l'EBE retraité et la valorisation peut conduire à des risques pour le financement futur de l'affaire, notamment parce qu'il ne prend pas en compte la rémunération du capital investi. Enfin, des montages financiers mal équilibrés peuvent engendrer des problèmes de trésorerie, rendant la viabilité de l'entreprise incertaine.