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Modélisation de l’évolution des Pinsons
de l’île Daphne Major (Galapagos)
avec le logiciel Vensim PLE
L’île Daphne major (Galapagos)
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Les pinsons de l’île Daphne major en 1977
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Espèce Geospiza fortis
Individus à petits becs, majoritaires
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L’évènement de 1977
 En 1977, une très forte sécheresse frappe l’île
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Que va-t-il se passer pour la population de pinsons ?
Modélisation de l’évènement de sélection de 1977
Population de pinsons
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 Schématisation sous forme de réservoir et de flux entrants et sortants
 On peut donc utiliser le logiciel VensimPLE
Principe de fonctionnement de Vensim
réservoir
flux
Variables
(modifiables en cours de simulation)
rétroaction
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 Sortie sous forme de graphiques (évolution des effectifs au cours du temps)
Critères de construction des modèles
d’évolution des Pinsons
 effectifs de départ correspondants à ceux comptés sur l’île
 durée de la simulation conforme à la durée de l’évènement de sélection
observée sur le terrain (5 trimestres)
MAIS :
 conversion directe des graines en pinsons (1 graine devient 1 pinson)
 définition empirique des équations de production végétale :
• la production de petites graines est une fonction exponentielle de la quantité d’eau
• la production de grosses graines est une fonction linéaire de la quantité d’eau
• la quantité d’eau initiale est fixée à 100 ; sécheresse à 0
Il est important de noter qu’en raison de ces partis pris, les modèles ne sont pas
strictement scientifiques, mais sont plutôt à voir comme des outils à visée pédagogique.
Modélisation de l’évènement de sélection de 1977
Fichier : PinsonsGalapagos1977.mdl
Le modèle : version élèves
Fichier : PinsonsGalapagos1977b.mdl
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L’évènement de sélection de 1977
Les pinsons à gros becs ont relativement plus de nourriture, donc ils survivent mieux
 La taille du bec étant un caractère héréditaire, leur descendance a un gros bec
=> Il s’est donc produit une évolution de la population de pinsons,
par sélection liée aux conditions du milieu
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PETITES GRAINES
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GROSSES GRAINES
L’évènement de sélection de 1977
Nombre d’individus Abondance de graines
Dureté de graines Indice de taille du bec
La situation en 2004
 Installation de Geospiza magnirostris sur l’île au début des années 1980
 plus gros et plus puissant que G. fortis
 plus rapide et plus efficace pour ouvrir les graines de Tribulus cistoides
 exclusion physique de G. fortis des sites de nourrissage
 Survenue d’une sécheresse
Le modèle
Fichier : PinsonsGalapagos2004.mdl
Le modèle : version élèves (1)
Fichier : PinsonsGalapagos2004b.mdl
Le modèle : version élèves (2)
Fichier : PinsonsGalapagos2004-magnirostris.mdl
Modélisation versus données de terrain
Indice de taille du bec
1977 2004
Intérêt et limites
Intérêt du modèle des Pinsons des Galapagos
 exemple de sélection naturelle sur un caractère héréditaire
 liée aux conditions environnementales
 liée à la compétition entre espèces
 exemple actuel d’évolution
 lien avec l’histoire des sciences (Darwin)
Modélisation avec Vensim PLE
 Représentation dynamique d’un phénomène dynamique
 La construction du modèle doit permettre de mieux comprendre la
sélection naturelle
 Difficulté / complexité de la construction ; de la lecture de graphiques
 Ce n’est pas un modèle scientifique
 …
Références et ressources
Evolution of character displacement in Darwin’s finches.
Peter & Rosemary Grant, Science 313, 224-226 (2006)
Guide critique de l’évolution
Guillaume Lecointre (dir.)
Belin pp 312-330 (2009)
Site Planet-Terre
http://tinyurl.com/planet-terre
Site ACCES de l’INRP
http://acces.inrp.fr/acces/terre/CCCIC/outils/vensim/
Vensim PLE
téléchargeable gratuitement sur http://www.vensim.com
Modèles et modélisation en SVT
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  • 1. Modélisation de l’évolution des Pinsons de l’île Daphne Major (Galapagos) avec le logiciel Vensim PLE
  • 2. L’île Daphne major (Galapagos)
  • 3. L’île Daphne major (Galapagos)
  • 4. L’île Daphne major (Galapagos)
  • 5. Daphne major : une petite île de 37 ha à 10 km de l’île la plus proche végétation herbacée et arbustive L’île Daphne major (Galapagos)
  • 6. Les pinsons de l’île Daphne major en 1977 Populations de pinsons étudiées en continu depuis le début des années 1970 par Peter et Rosemary GRANT et leur équipe Espèce Geospiza fortis Individus à petits becs, majoritaires Se nourrissent des petites graines de plantes herbacées Individus à gros becs, minoritaires Se nourrissent des petites graines et des grosses graines de Tribulus cistoides
  • 7. L’évènement de 1977  En 1977, une très forte sécheresse frappe l’île  Il n’y a presque plus de petites graines mais il reste des grosses graines Que va-t-il se passer pour la population de pinsons ?
  • 8. Modélisation de l’évènement de sélection de 1977 Population de pinsons mort émigration (négligeable) reproduction immigration (négligeable)  Schématisation sous forme de réservoir et de flux entrants et sortants  On peut donc utiliser le logiciel VensimPLE
  • 9. Principe de fonctionnement de Vensim réservoir flux Variables (modifiables en cours de simulation) rétroaction flux  Sortie sous forme de graphiques (évolution des effectifs au cours du temps)
  • 10. Critères de construction des modèles d’évolution des Pinsons  effectifs de départ correspondants à ceux comptés sur l’île  durée de la simulation conforme à la durée de l’évènement de sélection observée sur le terrain (5 trimestres) MAIS :  conversion directe des graines en pinsons (1 graine devient 1 pinson)  définition empirique des équations de production végétale : • la production de petites graines est une fonction exponentielle de la quantité d’eau • la production de grosses graines est une fonction linéaire de la quantité d’eau • la quantité d’eau initiale est fixée à 100 ; sécheresse à 0 Il est important de noter qu’en raison de ces partis pris, les modèles ne sont pas strictement scientifiques, mais sont plutôt à voir comme des outils à visée pédagogique.
  • 11. Modélisation de l’évènement de sélection de 1977 Fichier : PinsonsGalapagos1977.mdl
  • 12. Le modèle : version élèves Fichier : PinsonsGalapagos1977b.mdl
  • 13. Le modèle : version élèves
  • 14. L’évènement de sélection de 1977 Les pinsons à gros becs ont relativement plus de nourriture, donc ils survivent mieux  La taille du bec étant un caractère héréditaire, leur descendance a un gros bec => Il s’est donc produit une évolution de la population de pinsons, par sélection liée aux conditions du milieu sécheresse PETITES GRAINES grosses graines petites graines GROSSES GRAINES
  • 15. L’évènement de sélection de 1977 Nombre d’individus Abondance de graines Dureté de graines Indice de taille du bec
  • 16. La situation en 2004  Installation de Geospiza magnirostris sur l’île au début des années 1980  plus gros et plus puissant que G. fortis  plus rapide et plus efficace pour ouvrir les graines de Tribulus cistoides  exclusion physique de G. fortis des sites de nourrissage  Survenue d’une sécheresse
  • 17. Le modèle Fichier : PinsonsGalapagos2004.mdl
  • 18. Le modèle : version élèves (1) Fichier : PinsonsGalapagos2004b.mdl
  • 19. Le modèle : version élèves (2) Fichier : PinsonsGalapagos2004-magnirostris.mdl
  • 20. Modélisation versus données de terrain Indice de taille du bec 1977 2004
  • 21. Intérêt et limites Intérêt du modèle des Pinsons des Galapagos  exemple de sélection naturelle sur un caractère héréditaire  liée aux conditions environnementales  liée à la compétition entre espèces  exemple actuel d’évolution  lien avec l’histoire des sciences (Darwin) Modélisation avec Vensim PLE  Représentation dynamique d’un phénomène dynamique  La construction du modèle doit permettre de mieux comprendre la sélection naturelle  Difficulté / complexité de la construction ; de la lecture de graphiques  Ce n’est pas un modèle scientifique  …
  • 22. Références et ressources Evolution of character displacement in Darwin’s finches. Peter & Rosemary Grant, Science 313, 224-226 (2006) Guide critique de l’évolution Guillaume Lecointre (dir.) Belin pp 312-330 (2009) Site Planet-Terre http://tinyurl.com/planet-terre Site ACCES de l’INRP http://acces.inrp.fr/acces/terre/CCCIC/outils/vensim/ Vensim PLE téléchargeable gratuitement sur http://www.vensim.com Modèles et modélisation en SVT Groupe Recherche-Formation (Académie de Toulouse) http://modelisationsvt.free.fr