JDCHE 20-21 - Antilope : Vers un système bon marché de mesure des polluants ...
Camille dekuijper -
1. AVEC LE SOUTIEN DU FONDS EUROPÉEN DE DÉVELOPPEMENT RÉGIONAL
FINANCEMENT FEDER : 1 480 190,32 € COUT TOTAL : 2 691 255,17 €
1 µm
- Un suivi en champ de l’activité des biopesticides.
BIOSENS est une association transfrontalière de physiciens spécialistes des micro‐technologies, de
biologistes, de microbiologistes et d’agronomes afin d’intégrer :
- Un capteur à très haute sensibilité utilisant la résonance plasmonique de surface,
- Une reconnaissance fondée sur les méthodes moléculaires utilisant l'ADN ou les marqueurs protéiques,
- Une instrumentation complète sous forme de biopuce facile à utiliser et portable.
La zone INTERREG FWVl étant une région fortement agricole, autant les habitants que les professionnels de
l’agriculture bénéficieront des retombées de ce projet.
BioSens
Camille Dekuijper
AVEC LE SOUTIEN DU FONDS EUROPÉEN DE DÉVELOPPEMENT RÉGIONAL
1
coordinateur de projet :
Déborah Lanterbecq (laboratoire biotechnologie)
2. 2
SMARTBIOCONTROL
OUTIEN DU FONDS EUROPÉEN DE DÉVELOPPEMENT RÉGIONAL
MENT FEDER : 1 480 190,32 € COUT TOTAL : 2 691 255,17 €
1 µm
NTERREG FWVl étant une région fortement agricole, autant les habitants que les professionnels de
re bénéficieront des retombées de ce projet.
Plateforme transfrontalière de
recherche et de formation pour
la promotion du biocontrôle
des agents phytopathogènes
4. SMARTBIOCONTROL
OUTIEN DU FONDS EUROPÉEN DE DÉVELOPPEMENT RÉGIONAL
MENT FEDER : 1 480 190,32 € COUT TOTAL : 2 691 255,17 €
1 µm
NTERREG FWVl étant une région fortement agricole, autant les habitants que les professionnels de
re bénéficieront des retombées de ce projet.
coordination et
communication de
l’ensemble du
portefeuille
tester les produits
disponibles ou en
développement sur des
pathosystèmes en serre
et aux champs, étudier
l’efficacité des
biopesticides
4
5. SMARTBIOCONTROL
OUTIEN DU FONDS EUROPÉEN DE DÉVELOPPEMENT RÉGIONAL
MENT FEDER : 1 480 190,32 € COUT TOTAL : 2 691 255,17 €
1 µm
NTERREG FWVl étant une région fortement agricole, autant les habitants que les professionnels de
re bénéficieront des retombées de ce projet.
coordination et
communication de
l’ensemble du
portefeuille
tester les produits
disponibles ou en
développement sur des
pathosystèmes en serre et
aux champs, étudier la
perception des
biopesticides
optimiser les procédés
de production,
développer la
formulation et étudier
la biodégradabilité des
composés actifs
5
6. SMARTBIOCONTROL
OUTIEN DU FONDS EUROPÉEN DE DÉVELOPPEMENT RÉGIONAL
MENT FEDER : 1 480 190,32 € COUT TOTAL : 2 691 255,17 €
1 µm
NTERREG FWVl étant une région fortement agricole, autant les habitants que les professionnels de
re bénéficieront des retombées de ce projet.
coordination et
communication de
l’ensemble du
portefeuille
tester les produits
disponibles ou en
développement sur des
pathosystèmes en serre et
aux champs, étudier la
perception des
biopesticides
optimiser les procédés
de production,
développer la
formulation et étudier
la biodégradabilité des
composés actifs
développer une
plateforme de
screening à haut débit
de nouveaux produits
de biocontrôle
6
7. SMARTBIOCONTROL
OUTIEN DU FONDS EUROPÉEN DE DÉVELOPPEMENT RÉGIONAL
MENT FEDER : 1 480 190,32 € COUT TOTAL : 2 691 255,17 €
1 µm
NTERREG FWVl étant une région fortement agricole, autant les habitants que les professionnels de
re bénéficieront des retombées de ce projet.
coordination et
communication de
l’ensemble du
portefeuille
développement de capteurs
pour détecter les agents de
biocontrôle et les agents
pathogènes aux champs
tester les produits
disponibles ou en
développement sur des
pathosystèmes en serre et
aux champs, étudier la
perception des
biopesticides
optimiser les procédés
de production,
développer la
formulation et étudier
la biodégradabilité des
composés actifs
développer une
plateforme de
screening à haut débit
de nouveaux produits
de biocontrôle
7
9. BIOPROTECT BIOSCREEN BIOPROD
BIOCOMGEST
Fournir des informations
sur les pathogènes
spécifiques à détecter et
le seuil de détection
Fournir des informations sur les
séquences spécifiques d’ADN
et/ou la structure chimique des
composés à considérer
Fournir la quantité de
biomolécules
nécessaires à incorporer
dans les biocapteurs
Feed-back,
stratégie
concertée pour
l’amélioration
Coordination,
transfert
d’information
BIOSENS
Association transfrontalière de physiciens, biologistes et
immunologistes
pour développer une nouvelle génération de biopuces permettant :
- Détection précoce et spécifique des pathogènes
- Suivi de l’activité des biopuces en champs
Intégrer des technologies physiques
et biochimiques récentes
Intégrer des technologies physiques
et biochimiques récentes
Conception de capteurs spécifiques,
sensibles et faciles à utiliser
Conception de capteurs spécifiques,
sensibles et faciles à utiliser
MATERIA NOVA
CARAH – Haute Ecole Concorcet
CNRS
Centre Spatial de Liège
CHRU Lille
Multitel
MATERIA NOVA
CARAH – Haute Ecole Concorcet
CNRS
Centre Spatial de Liège
CHRU Lille
Multitel
FREDON
Université Lille 1
Université Gent
PCG (Provinciaal Proefcentrum voor de Groenteteelt vzw)
Gembloux AgroBiotech, Université de Liège
partenaires associés
9
10. Principe de la détectionPrincipe de la détection
pathogène
10
11. Partie physique de la pucePartie physique de la puce
11
Support
(lame verre)
Film métallique (nm)
(Au)
Principe : Résonance Plasmonique de Surface (SPR)Principe : Résonance Plasmonique de Surface (SPR)
technique optique permettant la détection d’un ligand se fixant à un récepteur
immobilisé sur une surface ----------- permet une détection en temps réel quantitative
propagatifs
localisés
plasmons
12. 12
Partie physique de la pucePartie physique de la puce
propagatifspropagatifs localiséslocalisés
∅ Billes : 0,76 µm – triangles ≈200 nm
13. 13
Partie physique de la pucePartie physique de la puce système de lecturesystème de lecture
Interrogation optique du capteur à plasmons grâce à un spectromètre
Source lumineuse
ex: LED
Sonde optique
(illumination)
Sonde optique
(collection) Spectromètre
~40 cm
~20 cm détecteur à sonde
biologique
Spectres
plasmoniques
14. Partie biologique de la pucePartie biologique de la puce
14
sonde d’accrochesonde d’accroche
nucléique (ADN/ ARN)protéique (anticorps/antigène)
pathosystème de référencepathosystème de référence
(Orton et al. (2011))
Culture:
Blé (Triticum aestivum)
Pathogène:
Septoriose du blé (Zymoseptoria tritici)
15. Démarche expérimentale en pratiqueDémarche expérimentale en pratique
15
sondes – choix / spécificité
en laboratoire
bio-informatique
standardisation échantillons
extraction d’air
extraction de feuille
validation en laboratoire
des sondes
de la puce designée
comparaison système laboratoire / puce
extrapolation du système de détection
à d’autres pathogènes – pathosystèmes
au domaine industriel et médical
16. 16
Un tout grand merci
pour
votre attention !
Un tout grand merci
pour
votre attention !
Notes de l'éditeur
Dans un métal, un plasmon est une oscillation de plasma quantifiée, ou un quantum d'oscillation de plasma.