Construction automatique d’ontologies à partir d’une base de données relationnelles : application au médicament dans le domaine de la pharmacovigilance
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Présentation de Sonia Krivine, Jérôme Nobécourt, Lina Soualmia, Farid Cerbah et Catherine Duclos à IC 2009
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- 1. Construction automatique d’ontologie à partir de bases de données relationnelles : application au médicament dans le domaine de la pharmacovigilance S.Krivine 1 , J.Nobécourt 1 , L.Soualmia 1 , F.Cerbah 2 , Catherine Duclos 1 1 Laboratoire d’informatique médicale & Bioinformatique, Université Paris 13 2 Dassault Aviation, Département des Etudes Scientifiques Conférence IC’2009 – Plateforme AFIA - Hammamet – 25-29 Mai
- 4. Améliorer la détection du signal 10 Rhabdomyolyse Lipanthyl 4 Rhabdomyolyse Zocor Nb d’occurrences Effet Indésirable Médicament 14 Rhabdomyolyse Hypolipémiants Nb d’occurrences Effet Indésirable Médicament Zocor Lipanthyl Hypolipémiant Statine Simvastatine Fénofibrate
- 8. Substance active Classe Pharmacologique Classe Chimique A pour Ctx Expo A pour Ctx d’adm A Pour CC A pour CP A pour Ctx dose A pour SA A pour SAux A Pour Ctx Patient Effet Indésirable A pour Prop Pcin Contexte patient Spécialité Substance auxiliaire Contexte de dose Contexte d’exposition Contexte d’administration Propriété Pharmacocinétique Propriété Pharmacodynamique A pour Prop Pdyn A pour EI Classe d’interaction Cas connu de pharmacovigilance A pour Spécialité prescrite A Pour CI Substance active Ayant CPH Substance active Ayant CCH
- 16. <Declaration> <Class URI="&Vigitermes;C01A-GLUCOSIDES_CARDIOTONIQUES"/> </Declaration> <SubClassOf> <Class URI="&Vigitermes;C01A-GLUCOSIDES_CARDIOTONIQUES"/> <Class URI="&Vigitermes;C01-MEDICAMENTS_EN_CARDIOLOGIE"/> </SubClassOf> <Declaration> <Class URI="&Vigitermes;C01AA-GLUCOSIDES_DE_LA_DIGITALE"/> </Declaration> <SubClassOf> <Class URI="&Vigitermes;C01AA-GLUCOSIDES_DE_LA_DIGITALE"/> <Class URI="&Vigitermes;C01A-GLUCOSIDES_CARDIOTONIQUES"/> </SubClassOf> Génération du fichier owl Visualisation dans Protégé 4
- 18. <SubClassOf> <Class URI="&VGT;c_1_Naphthylamine"/> <Class URI="&VGT;Naphthalenes"/> </SubClassOf> <SubClassOf> <Class URI="&VGT;Naphthalenes"/> <Class URI="&VGT;Polycyclic_Hydrocarbons_Aromatic"/> </SubClassOf> <SubClassOf> <Class URI="&VGT; Polycyclic_Hydrocarbons_Aromatic "/> <Class URI="&VGT; Hydrocarbons_Aromatic "/> </SubClassOf> <SubClassOf> <Class URI="&VGT; Polycyclic_Hydrocarbons_Aromatic "/> <Class URI="&VGT; Polycyclic_Compounds "/> </SubClassOf> Génération du fichier owl Visualisation dans Protégé 4
- 20. Visualisation dans Protégé 4 dans la hiérarchie inférée par le raisonneur Fact ++ <SubClassOf> <Class URI="&Vigitermes;2106_DIGOXINE"/> <ObjectSomeValuesFrom> <ObjectProperty URI="&Vigitermes;has_ATC_Classe"/> <Class URI="&Vigitermes;C01AA05-DIGOXINE"/> </ObjectSomeValuesFrom> </SubClassOf> <EquivalentClasses> <Class URI="&Vigitermes; C01AA05-DIGOXINE_GroupinfOfSubstances"/> <ObjectSomeValuesFrom> <ObjectProperty URI="&Vigitermes;has_ATC_Classe"/> <Class URI="&Vigitermes;C01AA05-DIGOXINE"/> </ObjectSomeValuesFrom> </EquivalentClasses> Génération du fichier OWL