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Pr Aicha MADKOUR ||Professeur Biologiste- FSR-UM5|| R&D
||email: a.madkour@um5s.net.ma
Workshop
01/02/2020- ENSET- Rabat
Introduction
Innovation
Plan &
Etat de l’art
Etat
Scientifique
Echantillon
Etat
Expérimental
Résultats &
Interprétation
Projet
Citation
Article pour
Journaux
Indexés
4 W for Write…
• You
• Your Boss
• Your Lab Tech
• Your Colab
• In the J of
your field
• In the J with
the right IF
• Before its too
late
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done
• Just the
essential
• Just the
responses
WHAT WHEN
WHOWHERE
Ce qui est important :
■ rédiger un article c'est avant tout faire passer une idée nouvelle, une
information originale ;
■ le titre, le résumé et la démonstration de l'article doivent être conçus dans ce
seul but : une idée, une information ;
■ la structuration suivant le schéma IMReD (Introduction, Matériel et
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recherche.
■ Parfois, Résultats et Discussion sont fusionnés en une seule partie
■ IMReD n’est pas valable pour les articles Review, IMReD et CR!!!
Le résumé est la partie la plus
importante à rédiger
➔ Laisser en DERNIER
• Etude quantitative
• Etude qualitative
Recherche
hypothético-
déductive
• Etude qualitative
Recherche
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phénomène
complexe
Hypothèses
confirmées
ou non
Formulation
des
propositions
concepts utiles au
traitement du sujet
modèles théoriques déjà
utilisés
approches et outils
méthodologiques déjà utilisés
❑ Objectif général:
Réaliser l’inventaire et l’examen critique de ce qui a été publié dans la
littérature scientifique sur le sujet étudié
➔ Objectifs spécifiques:
https://scinapse.io/
https://scinapse.io/
https://www.semanticscholar.org/
Question
Description
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Prospectives
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✓ L’information: claire et compréhensible
➔but de l’étude, méthodologie,
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✓ L’originalité: mais inspirée des autres!
✓ La spécificité des objectifs
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des Résultats et la clarté de présentation
Plus petit, mais
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Descriptive
Univariée (Moy,
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Continues (âge,
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• Vérifier la cohérence des données
➔ Contrôle des données
• Cas particuliers (en multivarié)
➔ Contrôle des données
• Etudier les corrélations entre p variables
➔ Formuler des hypothèses
• Existence de profils d’individus différents
(sur p variables = multivarié)
➔ Formuler des hypothèses
Méthodes
Régression
multiple
Critère
numérique
(variable à
expliquer)
Variables
explicatives
numériques
ou binaires
Analyse
discriminante
Critère
qualificatif
(VAE)
VEP
numériques
ou binaires
Régression logistique
Ajustement
ou
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de facteur
de risque
Critère
binaire
VEP
numériques
ou binaires
Mesures
répétés
(tps)
Analyse de
survie
(pronostique)
Reproduit à
un tps t
VEP
numériques
ou binaires
■ Être objectif
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■ Ce qui est représenté dans le tableau ou graphes, ne pas le répéter en texte
■ Ne pas tout mettre
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■ Se baser sur les interprétations des études précédentes pour se retrouver…
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■ Discuter les controverses
■ Être chronologique dans la discussion et pertinent
■ C’est comme vendre un produit
■ Indiquer les limites de l’étude intelligemment
■ Faire appel aux perspectives
https://journalfinder.elsevier.com/
https://journalsuggester.springer.com/#
https://journalfinder.wiley.com/search?type=match
https://www.enago.com/academy/journal-finder/
https://www.journalguide.com/
http://www.sjfinder.com/
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L’impact factor est publié et calculé annuellement sur
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doit néanmoins être
original
Ce n’est pas
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valable !!!
All persons designated as authors should qualify for authorship.
Each author should have participated sufficiently in the work to take public
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Authorship credit should be based solely on substantial contributions to (a)
conception and design, or analysis and interpretation of data; and to (b) drafting
the article or revising it critically for important intellectual content; and on final
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Conditions (a), (b) and © must be met.
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justify authorship. General supervision of the research group is not sufficient for
authorship. Any part of an article critical to its main conclusion must be the
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AUTHORSHIP
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logiciel Freeplane.org, Docear.org
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Style Numérique « Vancouver »
• classement par ordre d'apparition dans le texte
• La date est placée à la fin de la référence.
• Toujours utilisés par des revues prestigieuses! (Science / Nature)
Style Auteur-Date « Harvard »
• Style de tendance et plus pratique
• (Nom et al., Date) et si juste deux auteurs (Nom 1 and Nom 2, Date)
• Jamais mettre le prénom!!!
• Ordre alphabétique et chronologique quand il y a plusieurs auteurs à citer et à la fin
• Le principe de base est constant : Auteur(s), + Date. + Titre. + Source.
Références
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Références
Fraude, Plagia, RETRACTED!!!
http://plagiarisma.net/
Accuracy in Word Choices
Word Definition Example
Affect (noun) To act upon or to influence The environment negatively
affected the wellbeing
Effect (verb) The result of a cause Failure to progress is an
effect of an epidural
Practice (verb) To do repeatedly in order to
gain a skill
The practice of ….
Practice (noun) The exercise of a profession Midwifery practice
Its (possessive
pronoun)
Its, like hers and his, does
not have an apostrophe
Nursing has its problems
It’s (contraction) It’s = it is It’s a lovely day today
Utilisation des phrases
scientifiques- CSD Rule
• Single Idea
• One Subject and One verb at leastClear
• Subject of Sentence comes first
• ShortSimple
• Avoid esthetic
• Be precisedDirect
For Example
Poor
• When tobacco smoke is inhaled it takes 10-20
seconds for nicotine to be delivered to the central
nervous system via the arterial circulation
Good
Nicotine takes 10—20 seconds to reach the brain
after inhalation.
For Example
Poor
• When tobacco smoke is inhaled it takes 10-20
seconds for nicotine to be delivered to the central
nervous system via the arterial circulation
Good
Nicotine takes 10—20 seconds to reach the brain
after inhalation.
Main
Subject Passive
verb
Main
Subject
Active
verb
Paragraphes- UCD rule
• Each sentence is on the topic of the paragraph
• Min of 3 sentencesUnity
• Clear & Logical links- Transition words
• Logical orderCoherence
• The main idea of the paragraph is well
supported with specific evidence, examples
and details.
Development
Simplicity in Word Choices
Poor Word Choices Better Word Choices
Utilised Used
Acquired Got
Ascertained Made sure
Subsequent Next
Voluminous Large, full, big
Remainder Rest
Criteria for Journal Acceptance
Main Reasons Articles Rejected
PROBLEM SOLUTION
Novelty not explained Show how your results are different from current knowledge
Results not explained Make the meaning of results clear
Too many results Focus on main results – remove others
Communicates only to a specialist
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Communicate to an audience including students and journalists
Misuse of abbreviations Do not use abbreviations
Does not conform to journal
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Poor scientific writing Follow guidelines for writing (Fahy, 2008 a & b) and this
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Poor English Use a professional English editor
Review Process
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Submissions: 3959
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Brief Reports 27%
How I Treat 33%
Review Papers 42%
Correspondence 42%
No. Pages published 8818
Time to First Decision=28.5d
BLOOD Manuscript
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Why not just to publish everything?
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Stolen ideas
Delaying of papers for personal reasons
Pressure from Department Chairs to work on other things
We all have a lot of things to do
Best reviewers are the busiest of all
Misconducts
Plagiarism
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  • 1. Pr Aicha MADKOUR ||Professeur Biologiste- FSR-UM5|| R&D ||email: a.madkour@um5s.net.ma Workshop 01/02/2020- ENSET- Rabat
  • 2. Introduction Innovation Plan & Etat de l’art Etat Scientifique Echantillon Etat Expérimental Résultats & Interprétation Projet Citation
  • 4. 4 W for Write… • You • Your Boss • Your Lab Tech • Your Colab • In the J of your field • In the J with the right IF • Before its too late • Before its done • Just the essential • Just the responses WHAT WHEN WHOWHERE
  • 5. Ce qui est important : ■ rédiger un article c'est avant tout faire passer une idée nouvelle, une information originale ; ■ le titre, le résumé et la démonstration de l'article doivent être conçus dans ce seul but : une idée, une information ; ■ la structuration suivant le schéma IMReD (Introduction, Matériel et méthodes, Résultats et Discussion) est incontournable pour un article de recherche. ■ Parfois, Résultats et Discussion sont fusionnés en une seule partie ■ IMReD n’est pas valable pour les articles Review, IMReD et CR!!! Le résumé est la partie la plus importante à rédiger ➔ Laisser en DERNIER
  • 6. • Etude quantitative • Etude qualitative Recherche hypothético- déductive • Etude qualitative Recherche abductive= phénomène complexe Hypothèses confirmées ou non Formulation des propositions
  • 7. concepts utiles au traitement du sujet modèles théoriques déjà utilisés approches et outils méthodologiques déjà utilisés ❑ Objectif général: Réaliser l’inventaire et l’examen critique de ce qui a été publié dans la littérature scientifique sur le sujet étudié ➔ Objectifs spécifiques:
  • 10.
  • 12. ✓ L’information: claire et compréhensible ➔but de l’étude, méthodologie, durée de la recherche, contraintes etc.…. ✓ L’originalité: mais inspirée des autres! ✓ La spécificité des objectifs ✓ La sélectivité de la pertinence des Résultats et la clarté de présentation
  • 13. Plus petit, mais plus sélectif et pertinent avec moins de biais Echantillon du départ
  • 14. Est-ce que les différences sont significatives? P<0.05 (s) Calculer moyenne, pourcentage (%), écarts- types SD… Est-ce que l’étude est puissante? OR, RR, Intervalle de confiance…
  • 15. STAT Descriptive Univariée (Moy, DS, …) Multivariée (ACP, …) Inférentielle Univariée (tests, …) Multivariée (modèles, …)
  • 16. Variables Quantitatifs Continues (âge, poids, taille…) Discrètes (nb limité) Qualitatifs Binaires (H/F) Nominales (Couleurs…) Ordinales (Appréciation…)
  • 17. Variables Quantitatifs Continues (âge, poids, taille…) Discrètes (nb limité) Qualitatifs Binaires (H/F) Nominales (Couleurs…) Ordinales (Appréciation…) • Vérifier la cohérence des données ➔ Contrôle des données • Cas particuliers (en multivarié) ➔ Contrôle des données • Etudier les corrélations entre p variables ➔ Formuler des hypothèses • Existence de profils d’individus différents (sur p variables = multivarié) ➔ Formuler des hypothèses
  • 18. Méthodes Régression multiple Critère numérique (variable à expliquer) Variables explicatives numériques ou binaires Analyse discriminante Critère qualificatif (VAE) VEP numériques ou binaires Régression logistique Ajustement ou recherche de facteur de risque Critère binaire VEP numériques ou binaires Mesures répétés (tps) Analyse de survie (pronostique) Reproduit à un tps t VEP numériques ou binaires
  • 19. ■ Être objectif ■ Clair et direct ■ Ce qui est représenté dans le tableau ou graphes, ne pas le répéter en texte ■ Ne pas tout mettre ■ Choisir les résultats les plus pertinents qui vont faciliter l’interprétation ■ Se baser sur les interprétations des études précédentes pour se retrouver… ■ Comparer avec autres études (pas forcément comme la tienne) ■ Discuter les controverses ■ Être chronologique dans la discussion et pertinent ■ C’est comme vendre un produit ■ Indiquer les limites de l’étude intelligemment ■ Faire appel aux perspectives
  • 20.
  • 27. https://www.findmyjournal.com/ Le seul site de recherche du journal avant la rédaction!!!
  • 28.
  • 29.
  • 30.
  • 31. Choose the Journal • basic scientific or clinical information Goal: Rapid dissemination of interesting How often does target population read that particular journal? How often does the readership of the target journal read your topic? What is the impact of the journal?
  • 32. • Contrat • Open Access Gestion des droits • IF • Présente dans la biblio du domaine Reconnaissanc e international • Revue spécifique ou générale • Anglais ou bilingue Audience • Large, tirage élevé, Sur Net • Fréquence • Rapide (3-6 mois) – Peer Review Type de diffusion • Mise en page Pro • Pages Nb not limited • Couleur ou N&B • Illustration Ql Type d’édition Une bonne revue
  • 34. Impact factor= la fréquence de citation d’un article en moyenne dans un journal
  • 35. Impact factor= la fréquence de citation d’un article en moyenne dans un journal
  • 36. L’impact factor est publié et calculé annuellement sur le « Journal Citation Reports » JCR de Thomson Ruters
  • 37.
  • 38.
  • 39.
  • 40. ➔ Résultats originaux (a priori ou a posteriori) d'une recherche. ➔ Faire le point sur l'état des connaissances scientifiques dans un domaine bien précis ➔ Dégager les directions particulières prises dans ce domaine. doit néanmoins être original
  • 42. All persons designated as authors should qualify for authorship. Each author should have participated sufficiently in the work to take public responsibility for its content. Authorship credit should be based solely on substantial contributions to (a) conception and design, or analysis and interpretation of data; and to (b) drafting the article or revising it critically for important intellectual content; and on final approval of the version to be published. Conditions (a), (b) and © must be met. Participation solely in the acquisition of funding or the collection of data does not justify authorship. General supervision of the research group is not sufficient for authorship. Any part of an article critical to its main conclusion must be the responsibility of at least one author. Editors may ask authors to describe what each contributed; this information may be published. AUTHORSHIP
  • 43. exemple de carte mentale réalisée avec le logiciel Freeplane.org, Docear.org Gestion des références par jabref.org, Zotero, Mendeley, Endnote
  • 44. Style Numérique « Vancouver » • classement par ordre d'apparition dans le texte • La date est placée à la fin de la référence. • Toujours utilisés par des revues prestigieuses! (Science / Nature) Style Auteur-Date « Harvard » • Style de tendance et plus pratique • (Nom et al., Date) et si juste deux auteurs (Nom 1 and Nom 2, Date) • Jamais mettre le prénom!!! • Ordre alphabétique et chronologique quand il y a plusieurs auteurs à citer et à la fin • Le principe de base est constant : Auteur(s), + Date. + Titre. + Source. Références
  • 45. Style Numérique « Vancouver » • classement par ordre d'apparition dans le texte • La date est placée à la fin de la référence. • Toujours utilisés par des revues prestigieuses! (Science / Nature) Style Auteur-Date « Harvard » • Style de tendance et plus pratique • (Nom et al., Date) et si juste deux auteurs (Nom 1 and Nom 2, Date) • Jamais mettre le prénom!!! • Ordre alphabétique et chronologique quand il y a plusieurs auteurs à citer et à la fin • Le principe de base est constant : Auteur(s), + Date. + Titre. + Source. Références
  • 47.
  • 48. Accuracy in Word Choices Word Definition Example Affect (noun) To act upon or to influence The environment negatively affected the wellbeing Effect (verb) The result of a cause Failure to progress is an effect of an epidural Practice (verb) To do repeatedly in order to gain a skill The practice of …. Practice (noun) The exercise of a profession Midwifery practice Its (possessive pronoun) Its, like hers and his, does not have an apostrophe Nursing has its problems It’s (contraction) It’s = it is It’s a lovely day today
  • 49. Utilisation des phrases scientifiques- CSD Rule • Single Idea • One Subject and One verb at leastClear • Subject of Sentence comes first • ShortSimple • Avoid esthetic • Be precisedDirect
  • 50. For Example Poor • When tobacco smoke is inhaled it takes 10-20 seconds for nicotine to be delivered to the central nervous system via the arterial circulation Good Nicotine takes 10—20 seconds to reach the brain after inhalation.
  • 51. For Example Poor • When tobacco smoke is inhaled it takes 10-20 seconds for nicotine to be delivered to the central nervous system via the arterial circulation Good Nicotine takes 10—20 seconds to reach the brain after inhalation. Main Subject Passive verb Main Subject Active verb
  • 52. Paragraphes- UCD rule • Each sentence is on the topic of the paragraph • Min of 3 sentencesUnity • Clear & Logical links- Transition words • Logical orderCoherence • The main idea of the paragraph is well supported with specific evidence, examples and details. Development
  • 53. Simplicity in Word Choices Poor Word Choices Better Word Choices Utilised Used Acquired Got Ascertained Made sure Subsequent Next Voluminous Large, full, big Remainder Rest
  • 54. Criteria for Journal Acceptance
  • 55. Main Reasons Articles Rejected PROBLEM SOLUTION Novelty not explained Show how your results are different from current knowledge Results not explained Make the meaning of results clear Too many results Focus on main results – remove others Communicates only to a specialist audience Communicate to an audience including students and journalists Misuse of abbreviations Do not use abbreviations Does not conform to journal requirements Follow the guide for authors to the letter Outside the scope of the journal Select the correct journal by reading Aims and Scope Poor scientific writing Follow guidelines for writing (Fahy, 2008 a & b) and this PowerPoint and/or my references Poor English Use a professional English editor
  • 56.
  • 57.
  • 58.
  • 59.
  • 60.
  • 62. Example Submissions: 3959 No. M/S published 1176 Regular Papers 36% Brief Reports 27% How I Treat 33% Review Papers 42% Correspondence 42% No. Pages published 8818 Time to First Decision=28.5d BLOOD Manuscript Statistics, 2002
  • 63. Why not just to publish everything? Biased reviewers Stolen ideas Delaying of papers for personal reasons Pressure from Department Chairs to work on other things We all have a lot of things to do Best reviewers are the busiest of all
  • 64. Misconducts Plagiarism • Sentences • Whole sections of text • Readers • Reviewers Unattributed Figures Fraudulent Data • Photoshop data • Inverted figures • Gel splicing Duplicate Publication
  • 66.