Le séminaire de restitution du programme Casdar Rustic a examiné la longévité fonctionnelle des ovins allaitants, en se concentrant sur des facteurs tels que la résistance aux maladies, la fertilité prolongée et les coûts d'élevage. L'étude a révélé que la durée de vie productive des brebis a diminué entre 1990 et 2004, et bien que des méthodes de sélection pour améliorer la longévité fonctionnelle soient envisagées, l'héritabilité de ce caractère reste faible. Des prédicteurs précoces, comme le nombre de mises-bas à 5 ans, ont été évalués pour leur pertinence dans la sélection des ovins allaitants.

1. Séminaire de restitution du programme CASDAR RUSTIC – Toulouse, les 3 et 4 octobre 2019
Analyse et modélisation
de la longévité fonctionnelle
des ovins allaitants

2. Estelle Talouarn
Stage de fin d’études
Soutenu le 19/09/2017
Maîtres de stage
Valérie LOYWYCK (Institut de l’Elevage)
FlavieTORTEREAU (INRA)

3. INTRODUCTION
La sélection en ovins allaitants
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 Résistance aux maladies
 Fertilité prolongée
 Longévité des brebis
 Dilution des coûts d’élevage
 Adaptation aux conditions d’élevage
 Actuellement dans les programmes de sélection des ovins allaitants :
 Prolificité
 Qualités maternelles
 Qualités bouchères
Productivité numérique
Croissance
 Besoin/Demande des éleveurs pour des animaux plus rustiques
Contexte :
 Réduction des intrants
 Augmentation des contraintes agro-environnementales

4. INTRODUCTION
Définition et mesure
Séminaire de restitution du programme CASDAR RUSTIC – Toulouse, les 3 et 4 octobre 2019
 Qu’est-ce que la longévité fonctionnelle?
Elle représente le temps de présence d’une femelle active dans le cheptel
→ capacité d’une femelle à repousser sa réforme involontaire
 Durée de vie productive (DURVIP)
Période de production
Temps entre la 1ère mise-bas et la mort de la femelle
Calcul :
Date de dernière mise-bas enregistrée – date de première mise-bas

5. Plan de l’étude de la longévité fonctionnelle
• Etude la durée de vie productive
• Filtrage des données disponibles
• Description de la durée de vie productive
• Peut-on sélectionner sur ce caractère?
• Mesure précoce de la longévité fonctionnelle
• Critères de mesure précoce
• Choix de la mesure
• Héritabilité
• Mise en place d’une sélection en ovins allaitants?
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6. Filtrage des données de la base d’indexation
Etablissement du fichier des carrières complètes
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 Utilisation des données de la base de données nationale
 Brebis:
 nées entre 1990 et 2004
 au moins une mise-bas (carrière productive) et la dernière mise-bas avant 2014
 un seul troupeau de mise-bas
 Cheptels:
 non-expérimentaux
 au moins 4 années consécutives au contrôle de performances
 en moyenne 50 brebis contrôlées/an + effectifs stables
 Elimination des aberrations et données extrêmes (moyenne + 3 σP de la race)
Brebis enregistrées
dans la base nationale
Brebis conservées Pourcentage de données écartées
97 982 62 410 36,3%
Données
fiabilisées
et
non-censurées

7. Première description de la vie productive
Evolution au cours du temps
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Evolution entre 1990 et 2004
DURVIP moyenne
(années)
DURVIP
(jours)
Nombre de mises-bas Nombre d’agneaux
3,12 +/- 2,28 - 293 - 0,7 - 1,4
Boxplot de DURVIP en fonction de l’année de naissance de la brebis
→ contre-sélection?
→ changements dans les pratiques d’élevage?
Diminution significative de la durée de vie
productive

8. Peut-on sélectionner sur ce caractère ?
Variabilité dans la population
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Moyenne Écart-type Minimum Maximum
Coefficient de
Variation
DURVIP (années) 3,12 2,28 0,25 10,99 0,73
Coefficient de variation = écart-type /moyenne
Valeur élevée  variabilité dans la population

9. Peut-on sélectionner sur ce caractère ?
Identifications des facteurs non génétiques
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• Taille de portée moyenne *
• PAT 30 moyen des agneaux *
• Intervalle moyen entre mises-bas *
• Taille moyenne *
• Evolution de la taille *
• Accélération/induction *
• Cheptelxannée de naissance (aléat.)
• Âge à la 1ère mise-bas *
• Taille de 1ère portée *
• Portée de naissance
• PAT 10 et 30 jours
• Méthode d’allaitement
Stade
agnelle
La 1ère
mise-bas
La carrière
Le
troupeau
Variables calculées par brebis
* Effet Significatif

10. Peut-on sélectionner sur ce caractère ?
Identifications des facteurs non génétiques
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Variable considérée Variance expliquée (%)
Variables de 1ères mise-bas 4,20
Variables de la carrière 12,01
Accélération/Induction 19,68
Dynamique du troupeau 19,97
Troupeau*année de naissance 21,71
Résidus 22,43
Conditions d’élevage et conduite du troupeau:
+ de 60% de la variabilité expliquée

11. Peut-on sélectionner sur ce caractère ?
Héritabilité: estimation de la part de la génétique
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DURVIP = X1 α + X2 β + W γ + Z u + Ԑ
X1 X2 W Z = matrices d’incidence
α = effets fixes (âge à la 1ère mise-bas, taille de 1ère portée)
β = covariables (portée moyenne, intervalle moyen entre mises-bas)
γ = cheptel*année de naissance (aléatoire)
u = effets génétiques additifs
Ԑ = résidus
Héritabilité estimée
pour DURVIP
Longévité fonctionnelle (OA)
dans la littérature
Projet RUSTIC / autres filières
h² = 0,0456 +/- 0,0066 0,00 à 0,15
Ovins laitiers : h²=0,01 à 0,034
Caprins laitiers : h²= 0,102
Facteurs non génétiques
identifiés

12. Plan de l’étude de la longévité fonctionnelle
• Etude la durée de vie productive
• Filtrage des données disponibles
• Description de la durée de vie productive
• Peut-on sélectionner sur ce caractère?
• Mesure précoce de la longévité fonctionnelle
• Critères de mesure précoce
• Choix de la mesure
• Héritabilité
• Mise en place d’une sélection en ovins allaitants?
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13. Prédire la longévité des brebis
Définition des variables pour une mesure anticipée
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 Variables de prédiction utilisées dans d’autres filières
• En caprins et ovins laitiers:
Nombre de jours en lactation à âge fixé
• En bovins allaitants:
Nombre de vêlages 8 ans après le 1er vêlage
 Variables envisagées pour les ovins allaitants
Nombre de mises bas à âge fixé
Nombre d’agneaux produits à âge fixé ?
entre 3 et 5 ans
entre 3 et 5 ans
But : donner une
valeur génétique
fiable le + tôt
possible

14. Prédire la longévité des brebis
Choix du prédicteur
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Moyenne Écart-type Minimum Maximum
Coefficient
de Variation
Nb Mbas - 3ans 1,61 0,77 0 4 0,48
Nb Mbas - 4ans 2,36 0,95 1 6 0,40
Nb Mbas - 5ans 2,95 1,25 1 6 0,42
Corrélations avec DURVIP:
Nb Mbas - 3ans Nb Mbas - 4ans Nb Mbas - 5ans
phénotypique 0,12 0,41 0,67
génétique 0,28 0,45 0,73
CV similaires et meilleures corrélations avec DURVIP
 Prédicteur = nb de mises-bas à 5 ans

15. Prédire la longévité des brebis
Héritabilités du prédicteur
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DURVIP NB Mbas - 5ans
h² 0,0456 +/- 0,0066 0,0352 +/- 0,0061
 Qualités bouchères ~ 0,30 à 0,40 Qualités maternelles ~ 0,20
A titre de comparaison : héritabilités des autres caractères en ovins allaitants
 Prolificité ~ 0,10

16. Plan de l’étude de la longévité fonctionnelle
Séminaire de restitution du programme CASDAR RUSTIC – Toulouse, les 3 et 4 octobre 2019
• Etude la durée de vie productive
• Filtrage des données disponibles
• Description de la durée de vie productive
• Peut-on sélectionner sur ce caractère?
• Mesure précoce de la longévité fonctionnelle
• Critères de mesure précoce
• Choix de la mesure
• Héritabilité
• Mise en place d’une sélection en ovins allaitants?
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17. En pratique?
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Corrélation desVGE DURVIP et index actuels:
VGE béliers VGE brebis
Index Prolificité (brut) -0,08 -0,09
Index Qualités
maternelles (brut)
0,14 0,11
→ pas de corrélation forte qui puisse
expliquer la dégradation de la
longévité
VGE: valeur génétique estimée
Prédicteur retenu Durée de vie moyenne (années)
Nb mises-bas à 5ans 4,85
Pertinence du prédicteur précoce ?...

18. Conclusions
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• Sur la durée de vie productive d‘une brebis:
• La première mise-bas joue un rôle-clé sur la longueur de la carrière
• Les paramètres de carrières également (portée moyenne, intervalles moyens et PAT 30 moyen des agneaux)
• La majorité de la variabilité est liée au troupeau et à son mode de conduite
• Sur le caractère de longévité fonctionnelle:
• Héritabilité faible (résultat confirmé par une analyse complémentaire avec le Kit de Survie)
• Précocité d’un prédicteur discutable

19. La longévité fonctionnelle
dans les autres filières de ruminants françaises
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 Bovins laitiers:
 Longévité fonctionnelle dans les index (Lgf) – races: Prim’Holstein, Normande et Montbéliarde
Vosgienne,Abondance,Tarentaise
 5% dans le calcul de l’objectif de sélection en race Prim’Holstein, ainsi que d’autres critères fonctionnels
 Recours au Kit de Survie en routine
 Bovins allaitants:
 Longévité fonctionnelle indexée via une efficacité de carrière (nombre de vêlages à 6,5 ans)
 Modèles linéaires en routine (mesure observée ou prédite)
 Caprins et ovins laitiers: projet RUSTIC

20. Perspectives
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• Validation des résultats/estimation des paramètres sur d’autres races
• Méthode la plus appropriée pour une évaluation en routine?
• Kit de Survie malgré les contraintes
 Paternités déclarées (modèle père)
 Connexion entre les troupeaux
• Modèles linéaires avec prédiction du nombre de mises-bas à 5 ans? (cf. démarche en bovins allaitants)
• Sélection « indirecte » par la sélection d’autres caractères de rusticité?
 Résistance aux maladies? Comportement? Aplombs?
 Valorisation des causes zootechniques de sortie enregistrées (projet RUSTIC – Action 1)
• Etude économique autour de l’intérêt de la longévité dans les filières ovines allaitantes
françaises
 projet Osiris : estimer les poids économiques des caractères en sélection

21. Merci de votre attention