JTC 2022 - Jour 2

1. 8èmes Journées Techniques Caprines
29 au 31 mars 2022
©F-X
Emery
/
MRE
Quels caractères en sélection pour
demain (fertilité, persistance,
longévité, maturité) ?
Marjorie Chassier, Virginie Clément, Isabelle Palhière, Mathieu Arnal

2. 8èmes Journées Techniques Caprines
29 au 31 mars 2022
©F-X
Emery
/
MRE
Quels caractères en sélection pour
demain?
Fertilité
Marjorie Chassier

3. Contexte
Un des objectifs du projet CAPFERT (action innovante financée
par FGE) était de mettre en place une évaluation génomique
pour le caractère « fertilité femelle à l’IA ».
L’ensemble des données disponibles dans la base de données
nationale SIECL ont été utilisées pour mener à bien ce travail.
Journées Techniques Caprines 2022 – 8ème édition 3
29 au 31 mars 2022

4. Evolution du taux de réussite à l’IA des chèvres adultes
(sans retour sur IA)
L’insémination sur chevrettes est moins fréquente et le taux de réussite est plus
faible et très variable d’une année à l’autre.
Journées Techniques Caprines 2022 – 8ème édition 4
29 au 31 mars 2022
SAA ALP
% réussite IA global 60,8% 66,7%
61.77
59.75
60.70 61.7 61.1 60.6 59.8
72.9
59.3
56.29 55.39
67.57 64.87 65.04 65.3 65.4 65.9
67.7
75.2
66.9 65.31
61.55
0.00
10.00
20.00
30.00
40.00
50.00
60.00
70.00
80.00
90.00
100.00
2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016 2017 2018 2019 2020
%
de
réussite
à
l'IA
SAA ALP

5. Plusieurs facteurs ont un impact sur le taux de
réussite à l’IA des chèvres :
• La période à laquelle est réalisée l’IA, les périodes les plus
favorables étant du 1er mars au 15 juin et du 1er août au 30
septembre
• L’âge de la chèvre, avec une fertilité maximale à l’âge de 2
ou 3 ans
• L’intervalle de temps avec la mise bas précédente, une
meilleure fertilité étant obtenue lorsque l’IA a lieu entre 180
et 240 jours après la mise bas
Journées Techniques Caprines 2022 – 8ème édition 5
29 au 31 mars 2022

6. Une variabilité génétique importante
Journées Techniques Caprines 2022 – 8ème édition 6
29 au 31 mars 2022
Saanen Alpine
Héritabilité (Fertilité) 0,043 0,038
Ecart-type génétique (Fertilité) 0,09 0,08
Bovins: h²(fertilité)=0,02 Ecart-type génétique= 0,07
• Héritabilités faibles
• Ecart-types génétiques de 9 points (SAA) et 8 points (ALP)
Un écart génétique entre 2 boucs SAA ou ALP, correspond à une
différence espérée de 9% et 8%, respectivement,
de réussite pour leurs filles
Sélection possible sur la fertilité à l’IA

7. Corrélation index fertilité et caractères de
production
Il existe une légère corrélation défavorable entre l’index lait et l’index
fertilité à l’IA en race Saanen et une corrélation positive entre les
index taux et l’index fertilité en race Alpine.
Journées Techniques Caprines 2022 – 8ème édition 7
29 au 31 mars 2022
Saanen Alpine
Index Quantité de Lait -0,12 0,01
Index Matière Protéique -0,09 0,06
Index Matière Grasse -0,09 0,08
Index Taux Protéique 0,08 0,14
Index Taux Butyreux 0,04 0,14
Index Cellules 0,11 0,12

8. Journées Techniques Caprines 2022 – 8ème édition 8
29 au 31 mars 2022
45.7
52.9
58.4
63.1
67.7
73.1
44.2
50.6
56.6
61.4
66.2
0
10
20
30
40
50
60
70
80
90
100
<-2 [-2;-1[ [-1;0[ [0;1[ [1;2[ ≥2
%
de
réussite
à
l'IA
Classe d'index
% de réussite à l'IA moyen des filles de boucs d’IA par classe d'index
génomique
% reussite_ALP %reussite-SAA
Corrélation index génomique et taux de réussite IA
Saanen Alpine
0,88 0,87

9. Index génomiques – Boucs d’IA (nb filles >60)
Journées Techniques Caprines 2022 – 8ème édition 9
29 au 31 mars 2022
Evolution de l’index génomique des boucs d’IA en fonction de leur année de naissance
-1.2
-1
-0.8
-0.6
-0.4
-0.2
0
0.2
0.4
0.6
2000 2001 2002 2003 2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010 2011 2012
Index
génomique
index ALP index SAA

10. Une prise en compte de la fertilité à l’IA au niveau du
schéma de sélection
 Indexation génomique depuis 2020
 Utilisation des index fertilité élémentaires des pères et des mères à boucs dans
les accouplements programmés pour produire les futurs boucs améliorateurs
 Introduction de l’index fertilité dans l’ICC en 2022
 Des index génomiques précoces seront produits pour les jeunes boucs afin de
pouvoir les sélectionner avant leur entrée en centre de production de semence.
Journées Techniques Caprines 2022 – 8ème édition 10
29 au 31 mars 2022

11. 8èmes Journées Techniques Caprines
29 au 31 mars 2022
©F-X
Emery
/
MRE
Quels caractères en sélection pour
demain ?
Persistance, Longévité, Maturité

12. La production laitière au cours de la lactation
12

13. L’évaluation génétique actuelle
13
• Actuellement, sélection sur la quantité totale de lait produite par lactation sans prise en compte de la forme
de la courbe de lactation
• Evaluation unicaractère multiraciale : Modèle à la lactation (LM)

14. 14
Importance de la forme de la courbe de lactation
Forme de la courbe de lactation
Pic: Balance
énergétique négative
Strucken et al. (2015)
Répartition de la production au
cours de l’année
Chemineau et al. (1996)

15. Evaluation génétique de la forme de la courbe de lactation
• Un modèle qui permet de sélectionner sur la forme de courbe de lactation basé sur
chaque contrôle élémentaire
 modèle de régression aléatoire (RRM)
• Un modèle très étudié internationalement mais couteux en temps de calculs
15

16. Illustration d’index persistance laitière extrêmes
16
+ Production
moyenne
Pour un même niveau de production à la lactation, des formes de courbes différentes
+2 écart type d’index
-2 écart type d’index
Stade de lactation (jours)
Stade de lactation (jours)

17. Héritabilités de la persistance en Saanen pour le lait
17
Héritabilité
• Héritabilité de la persistance modeste

18. Corrélations entre index de boucs pour la persistance et la fertilité à l’IA
18
• Index fertilité à l’insémination artificielle (IA) corrélés négativement Persistance pour la quantité de lait
-0.3
-0.2
-0.1
0
Primipare Multipare
saa alp

19. 19
• Index longévité corrélés positivement avec la persistance pour la quantité de lait
Corrélations entre index de boucs pour la persistance et la longévité en Alpine
-0.2
-0.15
-0.1
-0.05
0
0.05
0.1
0.15
0.2
Primipare Multipare

20. Une durée de vie productive qui décroit
Magazine Capgènes n°7 (I.Palhière)
Vie
productive
en
jours
Année de naissance
Entre 1991 et 2011
-346j en Saanen
-326j en Alpine

21. Une évaluation génomique de la longévité
fonctionnelle est en cours
• Longévité fonctionnelle : longévité corrigée pour la production laitière
• Modèle développé par Isabelle Palhière (INRAE)
• Index disponibles en 2022 (dans le cadre de MALO), pour les mâles
d’IA uniquement
• Des index dont la précision est modérée :
• Héritabilité faible
• Il faut attendre qu’un grand nombre de filles aient fini leur carrière pour avoir
un index précis du bouc ( ± 6 ans)

22. Des caractères liés à la longévité en cours
d’étude
• Résistance aux strongles (programme APIS GENE TEPACAP)
• Collecte de données sur des caractères de santé- bien-être à l’échelle
individuelle (projet Smarter)
• Enregistrement des causes de réforme dans quelques élevages, afin de
mieux comprendre la longévité (projet Smarter)
• Etude du déterminisme génétique des kystes et déséquilibres mammaires

23. La maturité un caractère en lien avec la
longévité fonctionnelle
• Projet financé par Apis gène : Projet Malo (juillet 2021-décembre 2022)
• Indexation actuelle lait (LACT) : un index lait pour toutes les lactations
• Possibilité d’obtenir un index lait par rang de lactation (MULTI)
• Maturité : différence de production L1/L3 : -0.83*L1+0*L2+0.55*L3 (à
partir des index L1, L2, L3 pour la production laitière)
• Un index Maturité corrélé positivement avec la longévité : les chèvres qui
produisent moins en L1 qu’en L3 ont une meilleure longévité

24. 1ière Lactation 2ième Lactation 3ième Lactation
Index maturité opposés: -8 pour la verte, +5 pour la rouge
Index longévité opposés: -96 pour la verte, +49 pour la rouge
Longévités phénotypiques différentes : 3 Lactations pour la verte (3585kg), 6 lactations pour la rouge (7114kg)
2 chèvres Saanen : une courbe verte, l’autre courbe rouge
Index lait à la lactation actuels similaires : -99 pour la verte, -105 pour la rouge
Index lait L1 différents :
( +4 pour la verte, -5 pour la rouge)
Production:
(2255 kg pour la verte, 913 kg pour la rouge)
Index lait L2 proches
( -2.7 pour la verte, -1.2 pour la rouge)
Production:
(848 kg pour la verte, 1127 kg pour la rouge)
Index lait L3 différents:
( -7 pour la verte, +1 pour la rouge)
Production:
(481 kg pour la verte, 1403kg pour la rouge)
Maturité : différence de production L1/L3 : -0.83*L1+0*L2+0.55*L3 (à partir des index L1, L2, L3 pour la production laitière)

25. Corrélations entre index pour des boucs ayant au
moins 21 filles (n=371)
• La longévité est moins négativement corrélée à la L3 qu’à la L1 ou les index carrière
• La maturité est corrélée positivement à la longévité
• La corrélation entre la maturité et la fertilité à l’IA est de +0.13
-0.24
-0.3
-0.16
-0.09
-0.18
0.37
-0.4
-0.3
-0.2
-0.1
0
0.1
0.2
0.3
0.4
0.5
Corrélations entre la longévité et les index laitiers

26. Stage en lien avec le département d’économie
de l’institut de l’élevage
• Étude économique afin d’évaluer l’importance de la longévité
• Stage co encadré par Bertrand Bluet et Nicole Bossis
• Suite d’une étude sur la longévité réalisée en 2013 qui s’intéressait à
tous les systèmes de production
• Focus dans Malo sur les élevages livreurs de l’Ouest et de l’Aveyron
• Questions posées:
• Coût de la chevrette?
• Combien de lactations pour payer le coût de l’élevage de la chevrette ?
• Taux de renouvellement optimal ?

27. Conclusions
• La persistance peut être indexée
• La persistance est corrélée légèrement positivement avec la longévité et
légèrement négativement avec la fertilité
• La longévité en élevage qui se dégrade
• Différentes actions pour améliorer la longévité:
• Indexation de la longévité
• Indexation de la fertilité à l’IA
• Réflexions autour de la maturité (MALO)
• Compréhension de la longévité (SMARTER)
• Etudes des anomalies génétiques (PRESAGE)
• Etude du déterminisme génétique des kystes et déséquilibres
mammaires
• Etude de la résistance au parasitisme (TEPACAP)

28. 8èmes Journées Techniques Caprines
29 au 31 mars 2022
©F-X
Emery
/
MRE
Merci de votre
attention