Avec les interventions de Virginie Clément – IDELE et Mathieu Arnal – IDELE

1. Prise en compte de nouveaux
caractères dans l’objectif de
sélection : fertilité à l’Insémination
Artificielle (IA) et maturité
Virginie Clément, Mathieu Arnal
Institut de l’Elevage
Département Génétique et Sélection des populations animales
CAPR'INOV 2023
1

2. Les caractères en sélection
L’objectif de sélection
CAPR'INOV 2023
2

3. Les caractères en sélection
• Les caractères de production laitière
CAPR'INOV 2023
3
• Les cellules somatiques
Matière protéique (IMP)
Taux protéique
(ITP)
Taux butyreux (ITB)
Index de
Production Caprin
Matière grasse
IMG
IPC Alpin = 1 IMP + 0,4 ITP + 0,1 IMG + 0,2 ITB
IPC Saanen = 1 IMP + 0,4 ITP + 0,2 IMG + 0,1 ITB
Lait

4. CAPR'INOV 2023
4
• La morphologie
CAPR'INOV 2023
4
Les caractères en sélection
Index de
Morphologie Caprin
En Alpine et en Saanen :
IMC = AVP + PRM + PLA + ORT + AAR
AVP = Avant-pis
PRM = Profil mamelle
PLA = Hauteur plancher
ORT = Orientation trayons
AAT = Largeur attache-arrière

5. L’objectif de sélection :
un objectif économique
• + 1 point d’ICC = +12€/chèvre/an*
CAPR'INOV 2023
5
Production
IPC
Morphologie
IMC
Comptage de
Cellules Somatiques
• + 10 kg de lait
ou + 0,5 point de TP
= 950€/an pour un troupeau de 950 chèvres
Index Combiné
Caprin
ICC
ICC Alpin = 1 IPC + 0,4 IMC + 0,2 INDCEL
ICC Saanen = 1 IPC + 0,5 IMC + 0,3 INDCEL
*Source : résultats OSIRIS, 2015

6. L’évaluation génétique/génomique
CAPR'INOV 2023
6

7. Principe de l’évaluation génétique
• Prédiction/estimation du potentiel génétique d’un animal =>
index
• Informations prises en compte dans le modèle d’indexation :
-> les performances
-> les généalogies
=> importance des filiations !
-> depuis 2018, l’information génomique
• Avec la génomique, on progresse plus vite
=> on peut se permettre d’ajouter de nouveaux caractères
CAPR'INOV 2023
7

8. Le schéma de sélection
CAPR'INOV 2023
8
Progrès génétique :
+11,5 kg de lait/an

9. La fertilité à l’IA
CAPR'INOV 2023
9

10. La fertilité à l’IA - évolution au cours
du temps
CAPR'INOV 2023
10
Années
Pourcentage
de
réussite
Source : Capgènes
58,6% 53,8%
2022

11. La fertilité à l’IA
• La fertilité se dégrade au cours du temps dans les deux
races
• Il existe une variabilité génétique (écart type génétique de
9 points en Saanen, 11 points en Alpine)
• Ce caractère a été sélectionné en bovins laitiers, ce qui a
permis de l’améliorer
CAPR'INOV 2023
11
=> Mise en place d’une évaluation génomique et prise
en compte dans l’objectif de sélection

12. La fertilité à l’IA – Pourcentage de réussite
des filles par classe d’index des pères
CAPR'INOV 2023
12
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
≤92.5 ]92.5-95] ]95-97.5] ]97.5-100] ]100-102.5] >102,5
Index génomique des boucs (estimés sans les performances des filles)
Taux
moyen
de
réussite
des
filles

13. La fertilité à l’IA – Introduction dans
l’objectif de sélection
CAPR'INOV 2023
13
Poids dans l’objectif de sélection :
16% en race Alpine / 15% en race Saanen
Cellules somatiques
(INDCEL)
Morphologie
(IMC)
Production
(IPC)
Production
(IPC)
Cellules somatiques
(INDCEL)
Morphologie
(IMC)
Fertilité à l’IA
(INDFERT)
62%
25%
13%
53%
21%
10%
16%
ICC Alpin = 0,9 IPC + 0,5 IMC + 0,3 INDCEL + 0,3 INDFERT
ICC Saanen = 1 IPC + 0,4 IMC + 0,2 INDCEL + 0,3 INDFERT

14. Réponse génétique attendue
CAPR'INOV 2023
14
-0,2 0 0,2 0,4 0,6 0,8 1 1,2 1,4 1,6
LAIT
MP
TP
MG
TB
IMC
CCS
FERTI
ICC old ICC new
Caractères
Réponse génétique (en écart type génétique)
Mères -> Boucs IA (accouplements programmés)
Ancien ICC ICC 2023

15. Une durée de vie productive qui
décroit
Magazine Capgènes n°7 (I.Palhière)
Vie
productive
en
jours
Année de naissance
Entre 1991 et 2011
-346j en Saanen
-326j en Alpine
• Enjeux :
• environnementaux (dilution de la phase improductive du jeune (gaz à effet de serre, ressources, …))
• bien-être animal (longévité associée à des animaux sains par des ONG)
• économiques (dilution des coûts de la phase improductive du jeune)

16. Une évaluation génomique de la
longévité fonctionnelle est en cours
• Longévité fonctionnelle : longévité corrigée pour la production
laitière*
• Index disponibles depuis 2022, pour les mâles d’IA uniquement
(accouplements programmés)
• Des index dont la précision est modérée :
• Héritabilité (part génétique du caractère) faible (10%)
• Il faut attendre que les filles aient fini leur carrière pour avoir un index
précis du bouc ( ± 6 ans)
Génétique Environnement: conduite des chevrettes, alimentation, conditions sanitaires, …
*Palhière (INRAE)

17. Des caractères liés à la longévité en
cours d’étude
• Résistance aux strongles (parasites gastro-intestinaux) (projet TEPACAP)
• Collecte de données sur des caractères de santé- bien-être à l’échelle individuelle (projet
SMARTER)
• Enregistrement des causes de réforme dans quelques élevages, afin de mieux comprendre la
longévité (projet SMARTER)
• Etude du déterminisme génétique des kystes et déséquilibres mammaires
• Etudes des anomalies génétiques (projet PRESAGE)
• Indexation de la fertilité à l’IA

18. La maturité un caractère en lien avec la
longévité fonctionnelle
• Projet Malo (APIS GENE) de juillet 2021 à décembre 2022
• Indexation actuelle lait: un index lait pour toutes les lactations
• Maturité : différence de production L1/L3
• Un index Maturité corrélé négativement avec la longévité : les
chèvres qui produisent moins en L1 qu’en L3 ont une meilleure
longévité

19. Illustration de la maturité
• Sélection de 10 000 chèvres (nées entre 2007 et 2010, de la région Nord-Ouest, avec un index lait entre 100 et 200)
dans chaque classe d’index maturité : Index maturité moyen de la classe faible=0 , moyenne=40 et élevé=100
• Observation :
• Âge moyen à la réforme : 4.5 ans, 3.7 ans et 3.7 ans
• Nombre moyen de lactation à la réforme : 3.8, 3 et 3
• Production moyenne de lait à la carrière : 3000 kg, 2200 kg et 2200 kg
Production
laitière
(kg)
Rang de lactation
Index maturité moyen
Index maturité élevé
Index maturité faible

20. En Saanen, la production et l’index en première lactation
augmentent plus vite que la troisième lactation
• La maturité augmente phénotypiquement (mesuré) mais surtout génétiquement en Saanen
• Nous observons l’inverse en Alpine phénotypiquement mais comme la Saanen génétiquement
CAPR'INOV 2023
20
Index
lait
(kg)
Production
laitière
en
250j(kg)
1ière lactation 3ième lactation
Production mesurée Génétique
Année de naissance Année de naissance
1ière lactation 3ième lactation

21. Corrélations avec l’index longévité
• Nous observons une corrélation négative entre longévité et index L1 qui s’inverse en L3 (corrélations
modestes)
• Corrélation entre maturité et longévité assez importante et négative
• Ce n’est pas l’index L1 ou L3 qui est le plus lié à la longévité mais bien le rapport entre les deux
Pour les boucs avec au moins 15 filles indexées
-0,13
0,05
0,15
0,04
-0,41
-0,5
-0,4
-0,3
-0,2
-0,1
0
0,1
0,2
L1 L2 L3 lait maturité
corrélation longévité (alpine (n=1170))

22. Une étude technico économique de la
longévité
• Stage réalisé par Priscilia Crouzet de avril à septembre 2022
• Co encadrée avec Bertrand Bluet, appui de Nicole Bossis (département
économie de l’Institut de l’élevage)
• Première partie: analyse des de la base de données du contrôle laitier +
réseau INOSYS (une ligne par troupeau, campagne étudiée 2020)
• Deuxième partie: enquête auprès de éleveurs sur leur perception de la
longévité
• Troisième partie: Intérêt économique de la longévité
CAPR'INOV 2023
22

23. 23
ANALYSE TECHNICO-ÉCONOMIQUE DE LA
LONGÉVITÉ DES CHÈVRES
129
151
64
0
50
100
150
200
longévité
basse
longévité
moyenne
longévité
forte
Nombre d’élevages par
classes de longévité
36
30 26
0
10
20
30
40
longévité
basse
longévité
moyenne
longévité
forte
Taux de renouvellement
moyen (%)
2,9 3,4
4,1
0
2
4
6
longévité
basse
longévité
moyenne
longévité
forte
Rang de lactation moyen à
la réforme
• Indicateur longévité : âge au dernier contrôle laitier de la carrière de la chèvre
• 3 classes de longévité:
• Longévité basse : 33 - 49 mois
• Longévité moyenne : 50 - 59 mois
• Longévité forte : 60 - 81 mois

24. Principaux enseignements de l’analyse de
données
• La modalité « herbe fraîche » liée avec une longévité plus importante (+ 5
mois) et la modalité « paille et concentrés » liée avec une longévité moins
importante (- 4 mois)
• Une tendance pour les quantités de concentrés :la modalité avec une
quantité de concentré limitée (330-468 kg/chèvre/an) liée à une
meilleure longévité
• Pas de différence significative pour la variable production laitière

25. 25
• Hypothèse 1 : gain de marge sans baisse du niveau de
production
• Hypothèse 2 : pourcentage baisse du niveau de production
acceptable
→Si -5 % taux renouvellement
1% niveau de production = 8 L/an/chèvre (très faible)
→Si -5 % taux renouvellement
13€/chèvre= 16 €/1000 L
• Variable qui a le plus d’impact : coût élevage chevrette
• Variables qui ont le moins d’impact : prix de vente des chèvres de réforme et des
chevreaux
Variable Hypothèse
Taux de
renouvellement H0
35 %
Coût élevage
chevrette
165 €/chevrette
Niveau de
production l1
738 L/an/chèvre
Niveau de
production l2+
885 L/an/chèvre
Prix du lait 784 €/1000L
Prix d’une chèvre
de réforme
21 €/tête
Prix d’un chevreau 10 €/tête
QUANTIFICATION DE L’INTERET ECONOMIQUE DE LA LONGEVITE DES
CHEVRES : Un intérêt économique limité

26. Le projet LOCO (2023-2025)
• Une indexation génomique de la maturité en routine
• L'index maturité introduit dans l’Index combiné caprin (ICC)
• Une évaluation de la longévité poursuivie en incluant des
prédicteurs de la longévité afin d’améliorer sa précision
CAPR'INOV 2023
26

27. Conclusion
• Un index fertilité à l’IA indexé en routine et inclus dans l’objectif
de sélection combiné caprin
• Une indexation longévité fonctionnelle en cours
• Un prédicteur de la longévité (la maturité) bientôt indexé en
routine et inclus dans l’ICC
• De nombreux projets en cours autour de la génétique de la
résilience et de la robustesse des chèvres laitières françaises
CAPR'INOV 2023
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28. Merci de votre attention
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