4. - 2021
En 10 ans,
plus d’un million d’animaux génotypés
Source: Valogène
Un taux de pénétration moyen de 15% chez les génisses.
Selon les races et les secteurs : > 60%
10 ans de sélection génomique: principes, résultats
5. - 2021
Une évaluation précoce d’une très
large gamme d’aptitudes
Production Qté Lait, MG, MP, TB, TP
Morphologie Mamelle, Aplombs, Format
Races mixtes: Muscularité
Fonctionnels Traite, tempérament
Santé Cellules, Mammites
Longévité
Repro Facilité vêlage, naissance,
mortinatalité
Fertilité femelle
29
Caractères évalués dans les programmes nationaux (mutualisés)
10 ans de sélection génomique: principes, résultats
6. - 2021
Une évaluation précoce d’une très
large gamme d’aptitudes
Production Qté Lait, MG, MP, TB, TP
Morphologie Mamelle, Aplombs, Format
Races mixtes: Muscularité
Fonctionnels Traite, tempérament
Santé Cellules, Mammites
Longévité
Repro Facilité vêlage, naissance,
mortinatalité
Fertilité femelle
30
Caractères évalués dans les programmes nationaux (mutualisés)
Nombreux nouveaux caractères dans des programmes partenariaux déjà
disponibles ou en cours de mise en œuvre (Génosanté, MO3Santé, From’Mir) :
Acétonémie, Santé du pied, Fromageabilité du lait…
10 ans de sélection génomique: principes, résultats
7. - 2021
Les index génomiques ont-ils été de
bons prédicteurs des performances?
• Etude :
• Génisses < 1 an génotypées en 2016,
primipares en 2019
o Index génomiques en 2016
o Productions (2018-2019)
31
15 400 Prim’Holstein 2 800 normandes
7 800 Montbéliardes
10 ans de sélection génomique: principes, résultats
8. - 2021
Production laitière, cellules
32
200 000 cel/ml d’écart entre les classes extrêmes
10 ans de sélection génomique: principes, résultats
9. - 2021
Fertilité (réussite à l’IA)
33
Index Fertilité Vache (Taux de conception)
11% d’écart entre les classes extrêmes
10 ans de sélection génomique: principes, résultats
10. - 2021
Morphologie de la vache
34
Taille: 10 cm d’écart entre les classes extrêmes
10 ans de sélection génomique: principes, résultats
11. - 2021
La variabilité des performances au sein d’une même
classe d’index : exemple du Taux Protéique (TP)
35
Environ 10 g/kg
10 ans de sélection génomique: principes, résultats
12. - 2021
36
Parmi les vaches ayant les index TP les plus bas (≤-2),
Aucune vache à plus de 32,5 g Prot/kg
Moyenne = 28,8 g/kg
Parmi les vaches ayant les index TP les plus hauts (≥+3),
Aucune vache à moins de 30 g Prot/kg
Moyenne = 34,6 g/kg
10 ans de sélection génomique: principes, résultats
La variabilité des performances au sein d’une même
classe d’index : exemple du Taux Protéique (TP)
13. - 2021
Autre exemple : Travaux Deffilait
• 435 Vaches Holstein
• 3 élevages expérimentaux :
o UE INRAE Le Pin au Harras (Normandie)
o UE INRAE Méjussaume (Bretagne)
o Ferme Expé des Trinottières (Pays de la Loire)
• Mesures de la Note d’Etat Corporel régulières
(≈6500 mesures)
• Classées selon leur index géno Etat Corporel
(EC)
37
10 ans de sélection génomique: principes, résultats
14. - 2021
L’index Etat Corporel reflète-t-il l’état
corporel tout au long de la lactation?
-0,5
-0,4
-0,3
-0,2
-0,1
0
0,1
0,2
0,3
0,4
0,5
1 16 31 46 61 76 91 106121136151166181196211226241
Stade de lactation (j)
38
EC --
EC -
EC 0
EC +
EC ++
=>
Points
de
NEC
(en
écart
par
rapport
à
la
lignée
EC
0)
Source: R. Lefebvre, INRAE
10 ans de sélection génomique: principes, résultats
15. - 2021
Et du côté des taureaux?
39
Evolution du niveau génétique moyen des taureaux Prim’Holstein
/ référence année 2004
Démarrage de la Sél. Géno pour les taureaux
- Progrès génétique sur tous les caractères, yc les fonctionnels
- Accélération du progrès génétique sur l’ISU (+37%) : essentiellement liée
à + de progrès génétiques sur Production, Morphologie, Santé Mamelle
Santé Mamelle
Fertilité (Repro)
Longévité
Morpho
Product° (INEL)
Synthèse (ISU)
Année de naissance
10 ans de sélection génomique: principes, résultats
16. - 2021
Et la variabilité génétique?
40
Année de naissance Année de naissance
Pas d’accélération Forte accélération
Evolution de la consanguinité, mesurée grâce aux informations génomiques
Source: A.C. Doublet, Allice
10 ans de sélection génomique: principes, résultats
17. - 2021
A retenir :
• Au niveau des élevages :
• Les index génomiques des génisses prédisent les performances
à venir
De très nombreuses applications
(voir présentations Vincent Rétif et Marie Bérodier)
• … Mais la génétique est un levier parmi tant d’autres (sanitaire,
alimentation…)
• Au niveau des schémas de sélection :
• La sélection génomique a permis d’accélérer le progrès génétique
o Il est possible de faire progresser des caractères jusqu’ici difficiles à
sélectionner (ex : mammites)
• La maîtrise de la variabilité est possible,
Mais cela nécessite des changements de pratiques drastiques
o Voir présentation Vincent Rétif
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10 ans de sélection génomique: principes, résultats