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10 ans de sélection génomique: principes, résultats
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A retenir :
• Au niveau des élevages :
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La sélection génomique : les principaux résultats en races bovines laitières

  • 1. Conférence Grand Angle Lait Appréhender les enjeux du secteur laitier pour préparer l’avenir 8e édition En collaboration avec : © Photoagriculture - AdobeStock #GALait Cycle de webinaires Les vendredis 19 & 26 mars, 02, 09 & 16 avril 2021 De 13h30 à 14h45
  • 2.
  • 3. 27 – 2021 Conférence Grand Angle Lait 8e édition Cycle de webinaires © Countrypixel - AdobeStock En collaboration avec : © Jez Timms - Unsplash © ALF photo - AdobeStock La sélection génomique : Les principaux résultats en races bovines laitières Sophie Mattalia, Idele 27
  • 4. - 2021 En 10 ans, plus d’un million d’animaux génotypés Source: Valogène Un taux de pénétration moyen de 15% chez les génisses. Selon les races et les secteurs : > 60% 10 ans de sélection génomique: principes, résultats
  • 5. - 2021 Une évaluation précoce d’une très large gamme d’aptitudes Production Qté Lait, MG, MP, TB, TP Morphologie Mamelle, Aplombs, Format Races mixtes: Muscularité Fonctionnels Traite, tempérament Santé Cellules, Mammites Longévité Repro Facilité vêlage, naissance, mortinatalité Fertilité femelle 29 Caractères évalués dans les programmes nationaux (mutualisés) 10 ans de sélection génomique: principes, résultats
  • 6. - 2021 Une évaluation précoce d’une très large gamme d’aptitudes Production Qté Lait, MG, MP, TB, TP Morphologie Mamelle, Aplombs, Format Races mixtes: Muscularité Fonctionnels Traite, tempérament Santé Cellules, Mammites Longévité Repro Facilité vêlage, naissance, mortinatalité Fertilité femelle 30 Caractères évalués dans les programmes nationaux (mutualisés) Nombreux nouveaux caractères dans des programmes partenariaux déjà disponibles ou en cours de mise en œuvre (Génosanté, MO3Santé, From’Mir) : Acétonémie, Santé du pied, Fromageabilité du lait… 10 ans de sélection génomique: principes, résultats
  • 7. - 2021 Les index génomiques ont-ils été de bons prédicteurs des performances? • Etude : • Génisses < 1 an génotypées en 2016, primipares en 2019 o  Index génomiques en 2016 o  Productions (2018-2019) 31 15 400 Prim’Holstein 2 800 normandes 7 800 Montbéliardes 10 ans de sélection génomique: principes, résultats
  • 8. - 2021 Production laitière, cellules 32 200 000 cel/ml d’écart entre les classes extrêmes 10 ans de sélection génomique: principes, résultats
  • 9. - 2021 Fertilité (réussite à l’IA) 33 Index Fertilité Vache (Taux de conception) 11% d’écart entre les classes extrêmes 10 ans de sélection génomique: principes, résultats
  • 10. - 2021 Morphologie de la vache 34 Taille: 10 cm d’écart entre les classes extrêmes 10 ans de sélection génomique: principes, résultats
  • 11. - 2021 La variabilité des performances au sein d’une même classe d’index : exemple du Taux Protéique (TP) 35 Environ 10 g/kg 10 ans de sélection génomique: principes, résultats
  • 12. - 2021 36 Parmi les vaches ayant les index TP les plus bas (≤-2), Aucune vache à plus de 32,5 g Prot/kg Moyenne = 28,8 g/kg Parmi les vaches ayant les index TP les plus hauts (≥+3), Aucune vache à moins de 30 g Prot/kg Moyenne = 34,6 g/kg 10 ans de sélection génomique: principes, résultats La variabilité des performances au sein d’une même classe d’index : exemple du Taux Protéique (TP)
  • 13. - 2021 Autre exemple : Travaux Deffilait • 435 Vaches Holstein • 3 élevages expérimentaux : o UE INRAE Le Pin au Harras (Normandie) o UE INRAE Méjussaume (Bretagne) o Ferme Expé des Trinottières (Pays de la Loire) • Mesures de la Note d’Etat Corporel régulières (≈6500 mesures) • Classées selon leur index géno Etat Corporel (EC) 37 10 ans de sélection génomique: principes, résultats
  • 14. - 2021 L’index Etat Corporel reflète-t-il l’état corporel tout au long de la lactation? -0,5 -0,4 -0,3 -0,2 -0,1 0 0,1 0,2 0,3 0,4 0,5 1 16 31 46 61 76 91 106121136151166181196211226241 Stade de lactation (j) 38 EC -- EC - EC 0 EC + EC ++ => Points de NEC (en écart par rapport à la lignée EC 0) Source: R. Lefebvre, INRAE 10 ans de sélection génomique: principes, résultats
  • 15. - 2021 Et du côté des taureaux? 39 Evolution du niveau génétique moyen des taureaux Prim’Holstein / référence année 2004 Démarrage de la Sél. Géno pour les taureaux - Progrès génétique sur tous les caractères, yc les fonctionnels - Accélération du progrès génétique sur l’ISU (+37%) : essentiellement liée à + de progrès génétiques sur Production, Morphologie, Santé Mamelle Santé Mamelle Fertilité (Repro) Longévité Morpho Product° (INEL) Synthèse (ISU) Année de naissance 10 ans de sélection génomique: principes, résultats
  • 16. - 2021 Et la variabilité génétique? 40 Année de naissance Année de naissance Pas d’accélération Forte accélération Evolution de la consanguinité, mesurée grâce aux informations génomiques Source: A.C. Doublet, Allice 10 ans de sélection génomique: principes, résultats
  • 17. - 2021 A retenir : • Au niveau des élevages : • Les index génomiques des génisses prédisent les performances à venir  De très nombreuses applications (voir présentations Vincent Rétif et Marie Bérodier) • … Mais la génétique est un levier parmi tant d’autres (sanitaire, alimentation…) • Au niveau des schémas de sélection : • La sélection génomique a permis d’accélérer le progrès génétique o Il est possible de faire progresser des caractères jusqu’ici difficiles à sélectionner (ex : mammites) • La maîtrise de la variabilité est possible, Mais cela nécessite des changements de pratiques drastiques o Voir présentation Vincent Rétif 41 10 ans de sélection génomique: principes, résultats
  • 18. 42 #GALait Conférence Grand Angle Lait 8e édition Cycle de webinaires En collaboration avec : © Countrypixel - AdobeStock © ALF photo - AdobeStock © Jez Timms - Unsplash Partenaires de
  • 19. Conférence Grand Angle Lait Appréhender les enjeux du secteur laitier pour préparer l’avenir 8e édition En collaboration avec : © Photoagriculture - AdobeStock #GALait Prochains webinaires du cycle : Les vendredis 02, 09 & 16 avril 2021 De 13h30 à 14h45