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• Dezetter C. (2015) : Impact de la dépression de
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sélection (+OSIRIS)  -26€/1% de consanguinité
• CLAMOR (2018) : coût des anomalies par individu né
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• OSIRIS : €uro par point d’index
• Dezetter C. (2015) : Impact de la dépression de
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sélection (+OSIRIS)  -26€/1% de consanguinité
• CLAMOR (2018) : coût des anomalies par individu né
atteint {75€ à 650€ / fœtus atteint}
 Opportunité de combiner index, consanguinité et
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Vers un conseil en accouplement profondément renouvelé
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Méthode - Un score économique
Objectif des plans d’accouplement :
Maximiser le score économique du descendant !
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Vers un conseil en accouplement profondément renouvelé
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Méthode - Un score économique
Objectif des plans d’accouplement :
Maximiser le score économique du descendant !
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Score économique
du descendant
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Vers un conseil en accouplement profondément renouvelé
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Méthode - Un score économique
Objectif des plans d’accouplement :
Maximiser le score économique du descendant !
49
Score économique
du descendant
=
Approche classique
Moyenne
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l’index (€)
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Coût de la
dépression de
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Coûts/gain selon
le génotype
attendu
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Vers un conseil en accouplement profondément renouvelé
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Résultats – plans d’accouplements
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Geno
€
Pedi
€
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Score économique moyen (€) 224 201 189,6
ISU moyen(€) 134,1 134,1 134,8
Apparentement moyen (%) 5 6,2 7,1
Apparentement maximal (%) 14,6 13,6 31,2
Prob. de foetus atteints (%) 0,15 0,37 0,58
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Résultats – plans d’accouplements
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Geno
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Geno
ISU
Score économique moyen (€) 224 201 189,6
ISU moyen(€) 134,1 134,1 134,8
Apparentement moyen (%) 5 6,2 7,1
Apparentement maximal (%) 14,6 13,6 31,2
Prob. de foetus atteints (%) 0,15 0,37 0,58
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Résultats – plans d’accouplements
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Geno
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€
Geno
ISU
Score économique moyen (€) 224 201 189,6
ISU moyen(€) 134,1 134,1 134,8
Apparentement moyen (%) 5 6,2 7,1
Apparentement maximal (%) 14,6 13,6 31,2
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Résultat
Génomique > Pedigree
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Geno
€
Pedi
€
Geno
ISU
Score économique moyen (€) 224 201 189,6
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Apparentement moyen (%) 5 6,2 7,1
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Méthode
Résultat
Score global > ISU
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Résultats – plans d’accouplements
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Geno
€
Pedi
€
Geno
ISU
Score économique moyen (€) 224 201 189,6
ISU moyen(€) 134,1 134,1 134,8
Apparentement moyen (%) 5 6,2 7,1
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- 2021
Application : « Ingrédient Génomique »
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dépression de
consanguinité
Coûts/gain selon
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à fournir pour chaque couple à tester
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Vers un conseil en accouplement profondément renouvelé
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Application : « Ingrédient Génomique »
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Approche classique
Moyenne
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l’index (€)
+
Coût de la
dépression de
consanguinité
Coûts/gain selon
le génotype
attendu
+
Ingrédient Génomique,
à fournir pour chaque couple à tester
Score € =
Calculé par les
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Vers un conseil en accouplement profondément renouvelé
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Application : exemple
• Pour chaque couple testé (caractéristiques
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Vers un conseil en accouplement profondément renouvelé
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Application : exemple
• Pour chaque couple testé (caractéristiques
de la descendante) :
60
Vers un conseil en accouplement profondément renouvelé
- 2021
Conclusions
• Utilité du génotypage des femelles
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Vers un conseil en accouplement profondément renouvelé

  • 1. Conférence Grand Angle Lait Appréhender les enjeux du secteur laitier pour préparer l’avenir 8e édition En collaboration avec : © Photoagriculture - AdobeStock #GALait Cycle de webinaires Les vendredis 19 & 26 mars, 02, 09 & 16 avril 2021 De 13h30 à 14h45
  • 2. 43 – 2021 Conférence Grand Angle Lait 8e édition Cycle de webinaires © Countrypixel - AdobeStock En collaboration avec : © Jez Timms - Unsplash © ALF photo - AdobeStock Vers un conseil en accouplement profondément renouvelé Bérodier M. (INRAE, MO3), Brochard M. (Umotest, MO3), Boichard D. (INRAE), Minery S.(GenEval) et Ducrocq V.(INRAE)
  • 3. - 2021 Contexte – Génotypage en ferme 44 Camp. 2019-2020 • ≈ ¼ des femelles génotypées  Index  Apparentement  Génotypes pour chaque gène majeur Taux de femelles génotypées parmi celles mises à la reproduction Vers un conseil en accouplement profondément renouvelé
  • 4. - 2021 Contexte – Poids économique 45 • OSIRIS : €uro par point d’index • Dezetter C. (2015) : Impact de la dépression de consanguinité sur les principaux caractères en sélection (+OSIRIS)  -26€/1% de consanguinité • CLAMOR (2018) : coût des anomalies par individu né atteint {75€ à 650€ / fœtus atteint} Vers un conseil en accouplement profondément renouvelé
  • 5. - 2021 Contexte – Poids économique 46 • OSIRIS : €uro par point d’index • Dezetter C. (2015) : Impact de la dépression de consanguinité sur les principaux caractères en sélection (+OSIRIS)  -26€/1% de consanguinité • CLAMOR (2018) : coût des anomalies par individu né atteint {75€ à 650€ / fœtus atteint}  Opportunité de combiner index, consanguinité et gènes majeurs (anomalies) dans un objectif économique Vers un conseil en accouplement profondément renouvelé
  • 6. - 2021 Méthode - Un score économique Objectif des plans d’accouplement : Maximiser le score économique du descendant ! 47 Vers un conseil en accouplement profondément renouvelé
  • 7. - 2021 Méthode - Un score économique Objectif des plans d’accouplement : Maximiser le score économique du descendant ! 48 Score économique du descendant = Approche classique Moyenne parentale de l’index (€) Vers un conseil en accouplement profondément renouvelé
  • 8. - 2021 Méthode - Un score économique Objectif des plans d’accouplement : Maximiser le score économique du descendant ! 49 Score économique du descendant = Approche classique Moyenne parentale de l’index (€) + Coût de la dépression de consanguinité Coûts/gain selon le génotype attendu + Vers un conseil en accouplement profondément renouvelé
  • 9. - 2021 Résultats – plans d’accouplements 50 Geno € Pedi € Geno ISU Score économique moyen (€) 224 201 189,6 ISU moyen(€) 134,1 134,1 134,8 Apparentement moyen (%) 5 6,2 7,1 Apparentement maximal (%) 14,6 13,6 31,2 Prob. de foetus atteints (%) 0,15 0,37 0,58 - + 0 Méthode Vers un conseil en accouplement profondément renouvelé
  • 10. - 2021 Résultats – plans d’accouplements 51 Geno € Pedi € Geno ISU Score économique moyen (€) 224 201 189,6 ISU moyen(€) 134,1 134,1 134,8 Apparentement moyen (%) 5 6,2 7,1 Apparentement maximal (%) 14,6 13,6 31,2 Prob. de foetus atteints (%) 0,15 0,37 0,58 - + 0 Méthode Résultat Vers un conseil en accouplement profondément renouvelé
  • 11. - 2021 Résultats – plans d’accouplements 52 Geno € Pedi € Geno ISU Score économique moyen (€) 224 201 189,6 ISU moyen(€) 134,1 134,1 134,8 Apparentement moyen (%) 5 6,2 7,1 Apparentement maximal (%) 14,6 13,6 31,2 Prob. de foetus atteints (%) 0,15 0,37 0,58 - + 0 Méthode Résultat Génomique > Pedigree Vers un conseil en accouplement profondément renouvelé
  • 12. - 2021 Résultats – plans d’accouplements 53 Geno € Pedi € Geno ISU Score économique moyen (€) 224 201 189,6 ISU moyen(€) 134,1 134,1 134,8 Apparentement moyen (%) 5 6,2 7,1 Apparentement maximal (%) 14,6 13,6 31,2 Prob. de foetus atteints (%) 0,15 0,37 0,58 - + 0 Méthode Résultat Score global > ISU Vers un conseil en accouplement profondément renouvelé
  • 13. - 2021 Résultats – plans d’accouplements 54 Geno € Pedi € Geno ISU Score économique moyen (€) 224 201 189,6 ISU moyen(€) 134,1 134,1 134,8 Apparentement moyen (%) 5 6,2 7,1 Apparentement maximal (%) 14,6 13,6 31,2 Prob. de foetus atteints (%) 0,15 0,37 0,58 - + Le meilleur plan : Utilisation maximale des informations génomiques ! Méthode Résultat Vers un conseil en accouplement profondément renouvelé
  • 14. - 2021 Application : « Ingrédient Génomique » 55 Approche classique Moyenne parentale de l’index (€) Score € = Vers un conseil en accouplement profondément renouvelé
  • 15. - 2021 Application : « Ingrédient Génomique » 56 Approche classique Moyenne parentale de l’index (€) Score € = Calculé par les outils d’accouplements Vers un conseil en accouplement profondément renouvelé
  • 16. - 2021 Application : « Ingrédient Génomique » 57 Approche classique Moyenne parentale de l’index (€) + Coût de la dépression de consanguinité Coûts/gain selon le génotype attendu + Ingrédient Génomique, à fournir pour chaque couple à tester Score € = Calculé par les outils d’accouplements Vers un conseil en accouplement profondément renouvelé
  • 17. - 2021 Application : « Ingrédient Génomique » 58 Approche classique Moyenne parentale de l’index (€) + Coût de la dépression de consanguinité Coûts/gain selon le génotype attendu + Ingrédient Génomique, à fournir pour chaque couple à tester Score € = Calculé par les outils d’accouplements Calcul mutualisé, résultats exposés 24h/7j/365j Vers un conseil en accouplement profondément renouvelé
  • 18. - 2021 Application : exemple • Pour chaque couple testé (caractéristiques de la descendante) : 59 Vers un conseil en accouplement profondément renouvelé
  • 19. - 2021 Application : exemple • Pour chaque couple testé (caractéristiques de la descendante) : 60 Vers un conseil en accouplement profondément renouvelé
  • 20. - 2021 Conclusions • Utilité du génotypage des femelles • Importance de l’utilisation complète des informations génomiques dans les plans d’accouplements • Gestion de la parenté & consanguinité future • Gestion des gènes majeurs & anomalies • Score économique  équilibre 61 Vers un conseil en accouplement profondément renouvelé
  • 21. 62 #GALait Conférence Grand Angle Lait 8e édition Cycle de webinaires En collaboration avec : © Countrypixel - AdobeStock © ALF photo - AdobeStock © Jez Timms - Unsplash
  • 22. Conférence Grand Angle Lait Appréhender les enjeux du secteur laitier pour préparer l’avenir 8e édition En collaboration avec : © Photoagriculture - AdobeStock #GALait Prochains webinaires du cycle : Les vendredis 02, 09 & 16 avril 2021 De 13h30 à 14h45