Présentation de Marie Bérodier - INRAE Cycle de webinaires Grand Angle Lait 2021

1. Conférence
Grand Angle Lait
Appréhender les enjeux du secteur
laitier pour préparer l’avenir
8e édition
En collaboration avec :
©
Photoagriculture
-
AdobeStock
#GALait
Cycle de webinaires
Les vendredis 19 & 26 mars, 02, 09 & 16 avril 2021
De 13h30 à 14h45

2. 43
– 2021
Conférence Grand Angle Lait
8e édition
Cycle de webinaires
© Countrypixel - AdobeStock
En collaboration avec :
© Jez Timms - Unsplash
© ALF photo - AdobeStock
Vers un conseil en accouplement
profondément renouvelé
Bérodier M. (INRAE, MO3),
Brochard M. (Umotest, MO3),
Boichard D. (INRAE),
Minery S.(GenEval) et Ducrocq V.(INRAE)

3. - 2021
Contexte – Génotypage en ferme
44
Camp. 2019-2020
• ≈ ¼ des femelles
génotypées
 Index
 Apparentement
 Génotypes pour chaque
gène majeur
Taux de femelles génotypées parmi
celles mises à la reproduction
Vers un conseil en accouplement profondément renouvelé

4. - 2021
Contexte – Poids économique
45
• OSIRIS : €uro par point d’index
• Dezetter C. (2015) : Impact de la dépression de
consanguinité sur les principaux caractères en
sélection (+OSIRIS)  -26€/1% de consanguinité
• CLAMOR (2018) : coût des anomalies par individu né
atteint {75€ à 650€ / fœtus atteint}
Vers un conseil en accouplement profondément renouvelé

5. - 2021
Contexte – Poids économique
46
• OSIRIS : €uro par point d’index
• Dezetter C. (2015) : Impact de la dépression de
consanguinité sur les principaux caractères en
sélection (+OSIRIS)  -26€/1% de consanguinité
• CLAMOR (2018) : coût des anomalies par individu né
atteint {75€ à 650€ / fœtus atteint}
 Opportunité de combiner index, consanguinité et
gènes majeurs (anomalies) dans un objectif
économique
Vers un conseil en accouplement profondément renouvelé

6. - 2021
Méthode - Un score économique
Objectif des plans d’accouplement :
Maximiser le score économique du descendant !
47
Vers un conseil en accouplement profondément renouvelé

7. - 2021
Méthode - Un score économique
Objectif des plans d’accouplement :
Maximiser le score économique du descendant !
48
Score économique
du descendant
=
Approche classique
Moyenne
parentale de
l’index (€)
Vers un conseil en accouplement profondément renouvelé

8. - 2021
Méthode - Un score économique
Objectif des plans d’accouplement :
Maximiser le score économique du descendant !
49
Score économique
du descendant
=
Approche classique
Moyenne
parentale de
l’index (€)
+
Coût de la
dépression de
consanguinité
Coûts/gain selon
le génotype
attendu
+
Vers un conseil en accouplement profondément renouvelé

9. - 2021
Résultats – plans d’accouplements
50
Geno
€
Pedi
€
Geno
ISU
Score économique moyen (€) 224 201 189,6
ISU moyen(€) 134,1 134,1 134,8
Apparentement moyen (%) 5 6,2 7,1
Apparentement maximal (%) 14,6 13,6 31,2
Prob. de foetus atteints (%) 0,15 0,37 0,58
-
+
0
Méthode
Vers un conseil en accouplement profondément renouvelé

10. - 2021
Résultats – plans d’accouplements
51
Geno
€
Pedi
€
Geno
ISU
Score économique moyen (€) 224 201 189,6
ISU moyen(€) 134,1 134,1 134,8
Apparentement moyen (%) 5 6,2 7,1
Apparentement maximal (%) 14,6 13,6 31,2
Prob. de foetus atteints (%) 0,15 0,37 0,58
-
+
0
Méthode
Résultat
Vers un conseil en accouplement profondément renouvelé

11. - 2021
Résultats – plans d’accouplements
52
Geno
€
Pedi
€
Geno
ISU
Score économique moyen (€) 224 201 189,6
ISU moyen(€) 134,1 134,1 134,8
Apparentement moyen (%) 5 6,2 7,1
Apparentement maximal (%) 14,6 13,6 31,2
Prob. de foetus atteints (%) 0,15 0,37 0,58
-
+
0
Méthode
Résultat
Génomique > Pedigree
Vers un conseil en accouplement profondément renouvelé

12. - 2021
Résultats – plans d’accouplements
53
Geno
€
Pedi
€
Geno
ISU
Score économique moyen (€) 224 201 189,6
ISU moyen(€) 134,1 134,1 134,8
Apparentement moyen (%) 5 6,2 7,1
Apparentement maximal (%) 14,6 13,6 31,2
Prob. de foetus atteints (%) 0,15 0,37 0,58
-
+
0
Méthode
Résultat
Score global > ISU
Vers un conseil en accouplement profondément renouvelé

13. - 2021
Résultats – plans d’accouplements
54
Geno
€
Pedi
€
Geno
ISU
Score économique moyen (€) 224 201 189,6
ISU moyen(€) 134,1 134,1 134,8
Apparentement moyen (%) 5 6,2 7,1
Apparentement maximal (%) 14,6 13,6 31,2
Prob. de foetus atteints (%) 0,15 0,37 0,58
-
+
Le meilleur plan :
Utilisation maximale des informations génomiques !
Méthode
Résultat
Vers un conseil en accouplement profondément renouvelé

14. - 2021
Application : « Ingrédient Génomique »
55
Approche classique
Moyenne
parentale de
l’index (€)
Score € =
Vers un conseil en accouplement profondément renouvelé

15. - 2021
Application : « Ingrédient Génomique »
56
Approche classique
Moyenne
parentale de
l’index (€)
Score € =
Calculé par les
outils
d’accouplements
Vers un conseil en accouplement profondément renouvelé

16. - 2021
Application : « Ingrédient Génomique »
57
Approche classique
Moyenne
parentale de
l’index (€)
+
Coût de la
dépression de
consanguinité
Coûts/gain selon
le génotype
attendu
+
Ingrédient Génomique,
à fournir pour chaque couple à tester
Score € =
Calculé par les
outils
d’accouplements
Vers un conseil en accouplement profondément renouvelé

17. - 2021
Application : « Ingrédient Génomique »
58
Approche classique
Moyenne
parentale de
l’index (€)
+
Coût de la
dépression de
consanguinité
Coûts/gain selon
le génotype
attendu
+
Ingrédient Génomique,
à fournir pour chaque couple à tester
Score € =
Calculé par les
outils
d’accouplements
Calcul mutualisé,
résultats exposés
24h/7j/365j
Vers un conseil en accouplement profondément renouvelé

18. - 2021
Application : exemple
• Pour chaque couple testé (caractéristiques
de la descendante) :
59
Vers un conseil en accouplement profondément renouvelé

19. - 2021
Application : exemple
• Pour chaque couple testé (caractéristiques
de la descendante) :
60
Vers un conseil en accouplement profondément renouvelé

20. - 2021
Conclusions
• Utilité du génotypage des femelles
• Importance de l’utilisation complète des
informations génomiques dans les plans
d’accouplements
• Gestion de la parenté & consanguinité future
• Gestion des gènes majeurs & anomalies
• Score économique  équilibre
61
Vers un conseil en accouplement profondément renouvelé

21. 62
#GALait
Conférence Grand Angle Lait
8e édition
Cycle de webinaires
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22. Conférence
Grand Angle Lait
Appréhender les enjeux du secteur
laitier pour préparer l’avenir
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#GALait
Prochains webinaires du cycle :
Les vendredis 02, 09 & 16 avril 2021
De 13h30 à 14h45