SlideShare une entreprise Scribd logo
1  sur  25
Télécharger pour lire hors ligne
1
La gestion génétique des anomalies
dans les populations ou…
Webinaire UMT STAR - 19 Janvier 2023
I. Palhière , J.J. Colleau, J. Raoul, S. Rodriguez-Ramilo
2
Quelle gestion ?
À l’échelle de l’élevage
À l’échelle de la population
Quelle gestion ?
À l’échelle de l’élevage
À l’échelle de la population
Fréquences ?
Déterminisme génétique ?
Létalité ?
Période d’apparition des signes cliniques ?
Quelle gestion ?
« Elimination des
porteurs »
À l’échelle de la population
Allèle létal
Quelle gestion ?
« Elimination des
porteurs »
À l’échelle de la population
Allèle non létal
Quelle gestion ?
« Elimination des
porteurs »
À l’échelle de la population
Allèle non létal
Quelle gestion
?
« Elimination des porteurs »
À l’échelle de la population
Difficulté à mettre en œuvre :
« Fréquence élevée de porteurs »
• Fréquence élevée d’une anomalie
• Nombre élevé d’anomalies à gérer
Affecte les performances technico-
économiques de la sélection :
• Coût
• Progrès génétique sur les caractères
en sélection
• Consanguinité
D’autres méthodes de gestion existent
À l’échelle de la
population
Etape(s) de sélection Anomalies prises en compte pour estimer
la valeur génétique (Index )
Lait
Taux
Cellules
Morpho
Anomalie
Boichard et al.,2016
D’autres méthodes de gestion existent
À l’échelle de la
population
Etape(s) de sélection Anomalies prises en compte pour estimer
la valeur génétique (Index )
Lait
Taux
Cellules
Morpho
Anomalie
Boichard et al.,2016
Accouplements Gestion des accouplements à risque
X X
X
Cole et al.,2015
D’autres méthodes de gestion existent
À l’échelle de la
population
Spécificités PR
•Tailles de descendance
plus faibles qu’en bovin
•Peu d’accouplements
raisonnés à l’individu
•Peu ou pas de
génotypages femelles
Etape(s) de sélection Anomalies prises en compte pour estimer
la valeur génétique (Index )
Lait
Taux
Cellules
Morpho
Anomalie
Boichard et al.,2016
Accouplements Gestion des accouplements à risque
X X
X
Cole et al.,2015
Quelle efficacité de ces méthodes (combinaison)
en petits ruminants ?
À l’échelle de la
population
1ers résultats issus de simulations
Schéma de sélection caprin – 20 ans
5 anomalies
4 scénarios évalués
2 modalités d’accouplements : aléatoires ou optimisés
2 objectifs de sélection (anomalies incluses ou exclues)
Quelle efficacité de ces méthodes (combinaison)
en petits ruminants ?
À l’échelle de la
population
1ers résultats issus de simulations
Schéma de sélection caprin – 20 ans
5 anomalies
4 scénarios évalués
2 modalités d’accouplements : aléatoires ou optimisés
2 objectifs de sélection (anomalies incluses ou exclues)
Gain génétique ?
Évolution des fréquences des allèles favorables ?
Quelle efficacité de ces méthodes (combinaison)
en petits ruminants ?
À l’échelle de la
population
0
20
40
60
80
100
120
GEBV/AM GEBV/OFC ISp/AM ISp/OFC
ΔG Δf_k
Anomalies non
incluses
Anomalies
incluses
Acc_opt Acc_opt
Gain génétique
Anomalies létales
Hausse fréquences allèles favorables
Référence
Acc_aléa Acc_aléa
Quelle efficacité de ces méthodes (combinaison)
en petits ruminants ?
À l’échelle de la
population
0
20
40
60
80
100
120
GEBV/AM GEBV/OFC ISp/AM ISp/OFC
ΔG Δf_k
Anomalies non
incluses
Anomalies
incluses
Acc_opt Acc_opt
Gain génétique
Anomalies létales
Hausse fréquences allèles favorables
Référence
Inclure les anomalies dans l’objectif de sélection est une méthode efficace
Optimisation des accouplements : affecte uniquement le gain génétique
Anomalies létales : fréquence allèle favorable en baisse même en absence
de gestion
Acc_aléa Acc_aléa
Quelle efficacité de ces méthodes (combinaison)
en petits ruminants ?
À l’échelle de la
population
Gain génétique
Anomalies non létales
Anomalies non
incluses
Anomalies
incluses
Hausse fréquences allèles favorables
-20
0
20
40
60
80
100
120
GEBV/AM GEBV/OFC ISp/AM ISp/OFC
Acc_opt Acc_opt
Référence
Inclure les anomalies dans l’objectif de sélection est une méthode efficace
Optimisation des accouplements : affecte uniquement le gain génétique
Anomalies non létales : fréquence allèle favorable en moyenne stable en
absence de gestion
Acc_aléa Acc_aléa
17
Zoom sur un cas particulier de gestion des
anomalies :
la Sélection à Parenté Minimum en caprins
• On est toujours à l’échelle de la population
• Gestion des anomalies au moment d’une étape de sélection  le plus efficace
• Validation sur données réelles
• Possible en caprins car semence congelée
18
Principe de la Sélection à Parenté Minimum (SPM)
• Méthode de sélection qui optimise progrès génétique et variabilité génétique
• Développée par J.J. Colleau (INRAE) dans les années 2000
• Appliquée en races Alpine et Saanen depuis 2006
Progrès
génétique
Variabilité
génétique
Index
Coefficients
parenté
19
Méthode SPM
Principe de la Sélection à Parenté Minimum (SPM)
• Méthode de sélection qui optimise progrès génétique et variabilité génétique
• Développée par J.J. Colleau (INRAE) dans les années 2000
• Appliquée en races Alpine et Saanen depuis 2006
Mâles et femelles élites candidats à la sélection
Choix des meilleurs mâles et femelles élites
pour la procréation des futurs boucs IA
Palhière et al. INRAE Productions Animales, 2022, 35(3), 171-186
Progrès
génétique
Variabilité
génétique
Index
Coefficients
parenté
20
L’idée : introduire la gestion des anomalies
génétiques dans la Sélection à Parenté Minimum
NEW
Progrès
génétique
Variabilité
génétique
Fréquences
alléliques aux
gènes
Comment concilier progrès génétique, variabilité génétique et
fréquences aux allèles des différents gènes ?
• Test a posteriori sur les données 2022
21
Est-ce que ça marche ?
Données 2022
SANS optimisation
sur les gènes
Données 2022
AVEC optimisation
sur les gènes
Comparaison
-fréquences aux gènes
-parenté/consanguinité
Progrès génétique identique
• Exemple de la race Saanen : 6 gènes concernés par l’optimisation
Progrès
génétique
Variabilité
génétique
Fréquences
alléliques
aux gènes
Progrès
génétique
Variabilité
génétique
22
Quel impact sur les fréquences alléliques ?
Fréquence de l’allèle favorable chez les pères élites
+3,4 points
Exemple du gène PrP
(résistance à la tremblante)
 Permet d’améliorer les fréquences alléliques sur les 6 gènes considérés
(+5,2 points de fréquence en moyenne)
Anomalie non létale
23
Quel impact sur la variabilité génétique ?
Consanguinité et parenté moyennes des futurs boucs IA
+0,08 point
+0,19 point
 l’augmentation de la consanguinité et de la parenté sont très modérées
• Différentes méthodes de gestion des anomalies génétiques existent
• Les premiers travaux en petits ruminants montrent que :
• elles sont efficaces pour modifier les fréquences alléliques et donc, à terme,
éliminer les allèles défavorables
• sans impacter fortement le progrès génétique et la variabilité génétique
• étape primordiale = choix des reproducteurs et de leur contribution
• Prochaines étapes :
• Etudier l’efficacité de ces méthodes pour des cas particuliers (pléiotropie, favoriser
les hétérozygotes)
• Appliquer ces méthodes sur des cas concrets d’anomalies récemment détectées
24
Conclusion et perspectives
Merci pour votre attention

Contenu connexe

Similaire à Gestion_anomalies-webinaire-UMT_STAR_03-JRaoul-IPalhiere.pdf

UMTeBIS_conf - 20221013 - 6_Population_7_Croisement vf.pptx
UMTeBIS_conf - 20221013 - 6_Population_7_Croisement vf.pptxUMTeBIS_conf - 20221013 - 6_Population_7_Croisement vf.pptx
UMTeBIS_conf - 20221013 - 6_Population_7_Croisement vf.pptxInstitut de l'Elevage - Idele
 
[Grand Angle Viande 2017] Les caractères d'intérêt une autre utilisation des ...
[Grand Angle Viande 2017] Les caractères d'intérêt une autre utilisation des ...[Grand Angle Viande 2017] Les caractères d'intérêt une autre utilisation des ...
[Grand Angle Viande 2017] Les caractères d'intérêt une autre utilisation des ...Institut de l'Elevage - Idele
 
La persistance de la lactation : approche contrôles élémentaires en caprins.
La persistance de la lactation : approche contrôles élémentaires en caprins.La persistance de la lactation : approche contrôles élémentaires en caprins.
La persistance de la lactation : approche contrôles élémentaires en caprins.Institut de l'Elevage - Idele
 
Caprinov2023 Prise en compte de nouveaux caractères dans les objectifs de sél...
Caprinov2023 Prise en compte de nouveaux caractères dans les objectifs de sél...Caprinov2023 Prise en compte de nouveaux caractères dans les objectifs de sél...
Caprinov2023 Prise en compte de nouveaux caractères dans les objectifs de sél...Institut de l'Elevage - Idele
 
Avis des éleveurs et conseillers sur de nouveaux outils pour la gestion de la...
Avis des éleveurs et conseillers sur de nouveaux outils pour la gestion de la...Avis des éleveurs et conseillers sur de nouveaux outils pour la gestion de la...
Avis des éleveurs et conseillers sur de nouveaux outils pour la gestion de la...Institut de l'Elevage - Idele
 
La sélection génomique : principe et mise en oeuvre
La sélection génomique : principe et mise en oeuvreLa sélection génomique : principe et mise en oeuvre
La sélection génomique : principe et mise en oeuvreInstitut de l'Elevage - Idele
 
UMT_GPR_01_presentation_UMT_GLagriffoul_DFrançois INRAE.pptx
UMT_GPR_01_presentation_UMT_GLagriffoul_DFrançois INRAE.pptxUMT_GPR_01_presentation_UMT_GLagriffoul_DFrançois INRAE.pptx
UMT_GPR_01_presentation_UMT_GLagriffoul_DFrançois INRAE.pptxInstitut de l'Elevage - Idele
 
La génétique, un levier pour mieux maîtriser les mammites chez les vaches lai...
La génétique, un levier pour mieux maîtriser les mammites chez les vaches lai...La génétique, un levier pour mieux maîtriser les mammites chez les vaches lai...
La génétique, un levier pour mieux maîtriser les mammites chez les vaches lai...Institut de l'Elevage - Idele
 
2. Utiliser les indicateurs pour agir: exemple des caprins
2. Utiliser les indicateurs pour agir: exemple des caprins2. Utiliser les indicateurs pour agir: exemple des caprins
2. Utiliser les indicateurs pour agir: exemple des caprinsInstitut de l'Elevage - Idele
 
Les anomalies génétiques : Les détecter, les comprendre, les éradiquer
Les anomalies génétiques : Les détecter, les comprendre, les éradiquerLes anomalies génétiques : Les détecter, les comprendre, les éradiquer
Les anomalies génétiques : Les détecter, les comprendre, les éradiquerInstitut de l'Elevage - Idele
 
Incidental findings throughout multigene panel testing in cancer genetics
Incidental findings throughout multigene panel testing in cancer geneticsIncidental findings throughout multigene panel testing in cancer genetics
Incidental findings throughout multigene panel testing in cancer geneticsPasteur_Tunis
 
UMT_STAR_webinaire_20231201_01_selection_OL_JMAstruc.pdf
UMT_STAR_webinaire_20231201_01_selection_OL_JMAstruc.pdfUMT_STAR_webinaire_20231201_01_selection_OL_JMAstruc.pdf
UMT_STAR_webinaire_20231201_01_selection_OL_JMAstruc.pdfInstitut de l'Elevage - Idele
 
déploiement du single-step pour les évaluations génétiques des bovins lait - ...
déploiement du single-step pour les évaluations génétiques des bovins lait - ...déploiement du single-step pour les évaluations génétiques des bovins lait - ...
déploiement du single-step pour les évaluations génétiques des bovins lait - ...Institut de l'Elevage - Idele
 
Gestion intégrée des SGI des petits ruminants - Etat avancement recherche app...
Gestion intégrée des SGI des petits ruminants - Etat avancement recherche app...Gestion intégrée des SGI des petits ruminants - Etat avancement recherche app...
Gestion intégrée des SGI des petits ruminants - Etat avancement recherche app...Institut de l'Elevage - Idele
 
AVORTEMENTS des PETITS RUMINANTS : une nouvelle PCR digitale multiplex pour...
AVORTEMENTS des PETITS RUMINANTS :  une nouvelle PCR digitale multiplex  pour...AVORTEMENTS des PETITS RUMINANTS :  une nouvelle PCR digitale multiplex  pour...
AVORTEMENTS des PETITS RUMINANTS : une nouvelle PCR digitale multiplex pour...Institut de l'Elevage - Idele
 

Similaire à Gestion_anomalies-webinaire-UMT_STAR_03-JRaoul-IPalhiere.pdf (20)

UMTeBIS_conf - 20221013 - 6_Population_7_Croisement vf.pptx
UMTeBIS_conf - 20221013 - 6_Population_7_Croisement vf.pptxUMTeBIS_conf - 20221013 - 6_Population_7_Croisement vf.pptx
UMTeBIS_conf - 20221013 - 6_Population_7_Croisement vf.pptx
 
4 org-cows
4 org-cows4 org-cows
4 org-cows
 
[Grand Angle Viande 2017] Les caractères d'intérêt une autre utilisation des ...
[Grand Angle Viande 2017] Les caractères d'intérêt une autre utilisation des ...[Grand Angle Viande 2017] Les caractères d'intérêt une autre utilisation des ...
[Grand Angle Viande 2017] Les caractères d'intérêt une autre utilisation des ...
 
TECH-OVIN 2023 : Smarter
TECH-OVIN 2023 : SmarterTECH-OVIN 2023 : Smarter
TECH-OVIN 2023 : Smarter
 
La persistance de la lactation : approche contrôles élémentaires en caprins.
La persistance de la lactation : approche contrôles élémentaires en caprins.La persistance de la lactation : approche contrôles élémentaires en caprins.
La persistance de la lactation : approche contrôles élémentaires en caprins.
 
Caprinov2023 Prise en compte de nouveaux caractères dans les objectifs de sél...
Caprinov2023 Prise en compte de nouveaux caractères dans les objectifs de sél...Caprinov2023 Prise en compte de nouveaux caractères dans les objectifs de sél...
Caprinov2023 Prise en compte de nouveaux caractères dans les objectifs de sél...
 
Avis des éleveurs et conseillers sur de nouveaux outils pour la gestion de la...
Avis des éleveurs et conseillers sur de nouveaux outils pour la gestion de la...Avis des éleveurs et conseillers sur de nouveaux outils pour la gestion de la...
Avis des éleveurs et conseillers sur de nouveaux outils pour la gestion de la...
 
La sélection génomique : principe et mise en oeuvre
La sélection génomique : principe et mise en oeuvreLa sélection génomique : principe et mise en oeuvre
La sélection génomique : principe et mise en oeuvre
 
UMT_GPR_01_presentation_UMT_GLagriffoul_DFrançois INRAE.pptx
UMT_GPR_01_presentation_UMT_GLagriffoul_DFrançois INRAE.pptxUMT_GPR_01_presentation_UMT_GLagriffoul_DFrançois INRAE.pptx
UMT_GPR_01_presentation_UMT_GLagriffoul_DFrançois INRAE.pptx
 
La génétique, un levier pour mieux maîtriser les mammites chez les vaches lai...
La génétique, un levier pour mieux maîtriser les mammites chez les vaches lai...La génétique, un levier pour mieux maîtriser les mammites chez les vaches lai...
La génétique, un levier pour mieux maîtriser les mammites chez les vaches lai...
 
2. Utiliser les indicateurs pour agir: exemple des caprins
2. Utiliser les indicateurs pour agir: exemple des caprins2. Utiliser les indicateurs pour agir: exemple des caprins
2. Utiliser les indicateurs pour agir: exemple des caprins
 
UMT GPR_01 UMT-GLagriffoul
UMT GPR_01 UMT-GLagriffoulUMT GPR_01 UMT-GLagriffoul
UMT GPR_01 UMT-GLagriffoul
 
Les anomalies génétiques : Les détecter, les comprendre, les éradiquer
Les anomalies génétiques : Les détecter, les comprendre, les éradiquerLes anomalies génétiques : Les détecter, les comprendre, les éradiquer
Les anomalies génétiques : Les détecter, les comprendre, les éradiquer
 
Incidental findings throughout multigene panel testing in cancer genetics
Incidental findings throughout multigene panel testing in cancer geneticsIncidental findings throughout multigene panel testing in cancer genetics
Incidental findings throughout multigene panel testing in cancer genetics
 
UMT_STAR_webinaire_20231201_01_selection_OL_JMAstruc.pdf
UMT_STAR_webinaire_20231201_01_selection_OL_JMAstruc.pdfUMT_STAR_webinaire_20231201_01_selection_OL_JMAstruc.pdf
UMT_STAR_webinaire_20231201_01_selection_OL_JMAstruc.pdf
 
déploiement du single-step pour les évaluations génétiques des bovins lait - ...
déploiement du single-step pour les évaluations génétiques des bovins lait - ...déploiement du single-step pour les évaluations génétiques des bovins lait - ...
déploiement du single-step pour les évaluations génétiques des bovins lait - ...
 
Gestion intégrée des SGI des petits ruminants - Etat avancement recherche app...
Gestion intégrée des SGI des petits ruminants - Etat avancement recherche app...Gestion intégrée des SGI des petits ruminants - Etat avancement recherche app...
Gestion intégrée des SGI des petits ruminants - Etat avancement recherche app...
 
AVORTEMENTS des PETITS RUMINANTS : une nouvelle PCR digitale multiplex pour...
AVORTEMENTS des PETITS RUMINANTS :  une nouvelle PCR digitale multiplex  pour...AVORTEMENTS des PETITS RUMINANTS :  une nouvelle PCR digitale multiplex  pour...
AVORTEMENTS des PETITS RUMINANTS : une nouvelle PCR digitale multiplex pour...
 
eBIS_conf - 20230323 - part1 -lésions podales.pptx
eBIS_conf - 20230323 - part1 -lésions podales.pptxeBIS_conf - 20230323 - part1 -lésions podales.pptx
eBIS_conf - 20230323 - part1 -lésions podales.pptx
 
Provinlait pgmselection - GLagriffoul
Provinlait pgmselection - GLagriffoulProvinlait pgmselection - GLagriffoul
Provinlait pgmselection - GLagriffoul
 

Plus de Institut de l'Elevage - Idele

MaxForGoat aux JTCs : l'impact des modalités de distribution des fourrages en...
MaxForGoat aux JTCs : l'impact des modalités de distribution des fourrages en...MaxForGoat aux JTCs : l'impact des modalités de distribution des fourrages en...
MaxForGoat aux JTCs : l'impact des modalités de distribution des fourrages en...Institut de l'Elevage - Idele
 
#Pause travail 8 Dubreuil femmes 9 avril 2024 (1).pdf
#Pause travail 8 Dubreuil femmes 9 avril 2024 (1).pdf#Pause travail 8 Dubreuil femmes 9 avril 2024 (1).pdf
#Pause travail 8 Dubreuil femmes 9 avril 2024 (1).pdfInstitut de l'Elevage - Idele
 
2 5 MOREL Dimensionnement logettes Vaches laitières.pdf
2 5 MOREL Dimensionnement logettes Vaches laitières.pdf2 5 MOREL Dimensionnement logettes Vaches laitières.pdf
2 5 MOREL Dimensionnement logettes Vaches laitières.pdfInstitut de l'Elevage - Idele
 
2 10 GUIOCHEAU Aires dexercices Vaches laitières.pdf
2 10 GUIOCHEAU Aires dexercices Vaches laitières.pdf2 10 GUIOCHEAU Aires dexercices Vaches laitières.pdf
2 10 GUIOCHEAU Aires dexercices Vaches laitières.pdfInstitut de l'Elevage - Idele
 
P 15 MARTIN Robotisation déplacement remplacement.pdf
P 15 MARTIN Robotisation déplacement remplacement.pdfP 15 MARTIN Robotisation déplacement remplacement.pdf
P 15 MARTIN Robotisation déplacement remplacement.pdfInstitut de l'Elevage - Idele
 
P 14 DEPERSIN Réglementation BEA actualités et perspectives
P 14 DEPERSIN Réglementation BEA actualités et perspectivesP 14 DEPERSIN Réglementation BEA actualités et perspectives
P 14 DEPERSIN Réglementation BEA actualités et perspectivesInstitut de l'Elevage - Idele
 
P 13 ROGUET démarches bien-être et impact sur les bâtiments porcins Allemagne
P 13 ROGUET démarches bien-être et impact sur les bâtiments porcins AllemagneP 13 ROGUET démarches bien-être et impact sur les bâtiments porcins Allemagne
P 13 ROGUET démarches bien-être et impact sur les bâtiments porcins AllemagneInstitut de l'Elevage - Idele
 
P 11 GALLAY vision 2030 pour des Constructions durables
P 11 GALLAY vision 2030 pour des Constructions durablesP 11 GALLAY vision 2030 pour des Constructions durables
P 11 GALLAY vision 2030 pour des Constructions durablesInstitut de l'Elevage - Idele
 
P 9 GRESSET bea et constructions agricoles en suisse
P 9 GRESSET bea et constructions agricoles en suisseP 9 GRESSET bea et constructions agricoles en suisse
P 9 GRESSET bea et constructions agricoles en suisseInstitut de l'Elevage - Idele
 

Plus de Institut de l'Elevage - Idele (20)

Note agro-climatique n°2 - 17 Avril 2024
Note agro-climatique n°2 - 17 Avril 2024Note agro-climatique n°2 - 17 Avril 2024
Note agro-climatique n°2 - 17 Avril 2024
 
MaxForGoat aux JTCs : l'impact des modalités de distribution des fourrages en...
MaxForGoat aux JTCs : l'impact des modalités de distribution des fourrages en...MaxForGoat aux JTCs : l'impact des modalités de distribution des fourrages en...
MaxForGoat aux JTCs : l'impact des modalités de distribution des fourrages en...
 
Webinaire lésions podales_04.04.2024.pptx
Webinaire lésions podales_04.04.2024.pptxWebinaire lésions podales_04.04.2024.pptx
Webinaire lésions podales_04.04.2024.pptx
 
#Pause travail 8 Dubreuil femmes 9 avril 2024 (1).pdf
#Pause travail 8 Dubreuil femmes 9 avril 2024 (1).pdf#Pause travail 8 Dubreuil femmes 9 avril 2024 (1).pdf
#Pause travail 8 Dubreuil femmes 9 avril 2024 (1).pdf
 
Replay du Webinaire CARE 4 DAIRY - 25 mars 2024
Replay du Webinaire CARE 4 DAIRY - 25 mars 2024Replay du Webinaire CARE 4 DAIRY - 25 mars 2024
Replay du Webinaire CARE 4 DAIRY - 25 mars 2024
 
2 1 FUSELIER Prise en compte OW Société.pdf
2 1 FUSELIER Prise en compte OW Société.pdf2 1 FUSELIER Prise en compte OW Société.pdf
2 1 FUSELIER Prise en compte OW Société.pdf
 
2 2 VILLAIN Truies libres en maternité.pdf
2 2 VILLAIN Truies libres en maternité.pdf2 2 VILLAIN Truies libres en maternité.pdf
2 2 VILLAIN Truies libres en maternité.pdf
 
2 3 MESSAGER Enrichissements poulets.pdf
2 3 MESSAGER Enrichissements poulets.pdf2 3 MESSAGER Enrichissements poulets.pdf
2 3 MESSAGER Enrichissements poulets.pdf
 
2 4 COUTANT Litiere malaxée Vaches laitières.pdf
2 4 COUTANT Litiere malaxée Vaches laitières.pdf2 4 COUTANT Litiere malaxée Vaches laitières.pdf
2 4 COUTANT Litiere malaxée Vaches laitières.pdf
 
2 5 MOREL Dimensionnement logettes Vaches laitières.pdf
2 5 MOREL Dimensionnement logettes Vaches laitières.pdf2 5 MOREL Dimensionnement logettes Vaches laitières.pdf
2 5 MOREL Dimensionnement logettes Vaches laitières.pdf
 
2 7 GERARD conduite des truies en liberté.pdf
2 7 GERARD conduite des truies en liberté.pdf2 7 GERARD conduite des truies en liberté.pdf
2 7 GERARD conduite des truies en liberté.pdf
 
2 8 LERUSTE loger les veaux laitiers par deux
2 8 LERUSTE loger les veaux laitiers par deux2 8 LERUSTE loger les veaux laitiers par deux
2 8 LERUSTE loger les veaux laitiers par deux
 
2 9 LEFOUL Logement veaux de boucherie.pdf
2 9 LEFOUL Logement veaux de boucherie.pdf2 9 LEFOUL Logement veaux de boucherie.pdf
2 9 LEFOUL Logement veaux de boucherie.pdf
 
2 10 GUIOCHEAU Aires dexercices Vaches laitières.pdf
2 10 GUIOCHEAU Aires dexercices Vaches laitières.pdf2 10 GUIOCHEAU Aires dexercices Vaches laitières.pdf
2 10 GUIOCHEAU Aires dexercices Vaches laitières.pdf
 
P 16 TALLET etat émotionnel des animaux.pdf
P 16 TALLET etat émotionnel des animaux.pdfP 16 TALLET etat émotionnel des animaux.pdf
P 16 TALLET etat émotionnel des animaux.pdf
 
P 15 MARTIN Robotisation déplacement remplacement.pdf
P 15 MARTIN Robotisation déplacement remplacement.pdfP 15 MARTIN Robotisation déplacement remplacement.pdf
P 15 MARTIN Robotisation déplacement remplacement.pdf
 
P 14 DEPERSIN Réglementation BEA actualités et perspectives
P 14 DEPERSIN Réglementation BEA actualités et perspectivesP 14 DEPERSIN Réglementation BEA actualités et perspectives
P 14 DEPERSIN Réglementation BEA actualités et perspectives
 
P 13 ROGUET démarches bien-être et impact sur les bâtiments porcins Allemagne
P 13 ROGUET démarches bien-être et impact sur les bâtiments porcins AllemagneP 13 ROGUET démarches bien-être et impact sur les bâtiments porcins Allemagne
P 13 ROGUET démarches bien-être et impact sur les bâtiments porcins Allemagne
 
P 11 GALLAY vision 2030 pour des Constructions durables
P 11 GALLAY vision 2030 pour des Constructions durablesP 11 GALLAY vision 2030 pour des Constructions durables
P 11 GALLAY vision 2030 pour des Constructions durables
 
P 9 GRESSET bea et constructions agricoles en suisse
P 9 GRESSET bea et constructions agricoles en suisseP 9 GRESSET bea et constructions agricoles en suisse
P 9 GRESSET bea et constructions agricoles en suisse
 

Dernier

BOW 24 - De la réflexion de groupe à l'immersion dans des bâtiments porcins
BOW 24 - De la réflexion de groupe à l'immersion dans des bâtiments porcinsBOW 24 - De la réflexion de groupe à l'immersion dans des bâtiments porcins
BOW 24 - De la réflexion de groupe à l'immersion dans des bâtiments porcinsidelewebmestre
 
Cadre réglementaire et développement de l'agrivoltaïsme en France
Cadre réglementaire et développement de l'agrivoltaïsme en FranceCadre réglementaire et développement de l'agrivoltaïsme en France
Cadre réglementaire et développement de l'agrivoltaïsme en Franceidelewebmestre
 
BOW 2024 - Jardins d'hiver en poulets de chair
BOW 2024 - Jardins d'hiver en poulets de chairBOW 2024 - Jardins d'hiver en poulets de chair
BOW 2024 - Jardins d'hiver en poulets de chairidelewebmestre
 
BOW 2024 - Le bâtiment multicritère porcin
BOW 2024 - Le bâtiment multicritère porcinBOW 2024 - Le bâtiment multicritère porcin
BOW 2024 - Le bâtiment multicritère porcinidelewebmestre
 
Support de cours La technologie WDM.pptx
Support de cours La technologie WDM.pptxSupport de cours La technologie WDM.pptx
Support de cours La technologie WDM.pptxdocteurgyneco1
 
Chapitre 2 : fondations et analyses de données géotechniques
Chapitre 2 : fondations et analyses de données géotechniquesChapitre 2 : fondations et analyses de données géotechniques
Chapitre 2 : fondations et analyses de données géotechniquesangevaleryn
 
Actions du vent sur les bâtiments selon lEurocode 1 – Partie 1-4.pdf
Actions du vent sur les bâtiments selon lEurocode 1 – Partie 1-4.pdfActions du vent sur les bâtiments selon lEurocode 1 – Partie 1-4.pdf
Actions du vent sur les bâtiments selon lEurocode 1 – Partie 1-4.pdfalainfahed961
 
SciencesPo_Aix_InnovationPédagogique_Atelier_APC.pdf
SciencesPo_Aix_InnovationPédagogique_Atelier_APC.pdfSciencesPo_Aix_InnovationPédagogique_Atelier_APC.pdf
SciencesPo_Aix_InnovationPédagogique_Atelier_APC.pdfSKennel
 
Agrivoltaïsme et filière ovine en Dordogne
Agrivoltaïsme et filière ovine en DordogneAgrivoltaïsme et filière ovine en Dordogne
Agrivoltaïsme et filière ovine en Dordogneidelewebmestre
 
BOW 2024 - 3-6 - Adaptation climat chaud Porcs
BOW 2024 - 3-6 - Adaptation climat chaud PorcsBOW 2024 - 3-6 - Adaptation climat chaud Porcs
BOW 2024 - 3-6 - Adaptation climat chaud Porcsidelewebmestre
 
Compersseur d'air a vis atlas copco avec huile
Compersseur d'air a vis atlas copco avec huileCompersseur d'air a vis atlas copco avec huile
Compersseur d'air a vis atlas copco avec huileMBouderbala
 
BOW 2024 - 3 1 - Les infrastructures équestres et le changement climatique
BOW 2024 - 3 1 - Les infrastructures équestres et le changement climatiqueBOW 2024 - 3 1 - Les infrastructures équestres et le changement climatique
BOW 2024 - 3 1 - Les infrastructures équestres et le changement climatiqueidelewebmestre
 
BOW 2024 - 3-8 - Adaptation des bâtiments d'élevages de volailles au changeme...
BOW 2024 - 3-8 - Adaptation des bâtiments d'élevages de volailles au changeme...BOW 2024 - 3-8 - Adaptation des bâtiments d'élevages de volailles au changeme...
BOW 2024 - 3-8 - Adaptation des bâtiments d'élevages de volailles au changeme...idelewebmestre
 
BOW 2024 - 3-3 - Adaptation des bâtiments pour ruminants au changement clima...
BOW 2024 - 3-3 -  Adaptation des bâtiments pour ruminants au changement clima...BOW 2024 - 3-3 -  Adaptation des bâtiments pour ruminants au changement clima...
BOW 2024 - 3-3 - Adaptation des bâtiments pour ruminants au changement clima...idelewebmestre
 
BOW 2024 -3-9 - Matelas de logettes à eau refroidie VL
BOW 2024 -3-9 - Matelas de logettes à eau refroidie VLBOW 2024 -3-9 - Matelas de logettes à eau refroidie VL
BOW 2024 -3-9 - Matelas de logettes à eau refroidie VLidelewebmestre
 
CHAPITRE 2 VARIABLE ALEATOIRE probabilité.ppt
CHAPITRE 2 VARIABLE ALEATOIRE probabilité.pptCHAPITRE 2 VARIABLE ALEATOIRE probabilité.ppt
CHAPITRE 2 VARIABLE ALEATOIRE probabilité.pptbentaha1011
 
BOW 2024 - L'enrichissement du milieu des chèvres laitières
BOW 2024 - L'enrichissement du milieu des chèvres laitièresBOW 2024 - L'enrichissement du milieu des chèvres laitières
BOW 2024 - L'enrichissement du milieu des chèvres laitièresidelewebmestre
 
Bow 2024 - Plein air à l'intérieur des bâtiments d'élevage de ruminants
Bow 2024 - Plein air à l'intérieur des bâtiments d'élevage de ruminantsBow 2024 - Plein air à l'intérieur des bâtiments d'élevage de ruminants
Bow 2024 - Plein air à l'intérieur des bâtiments d'élevage de ruminantsidelewebmestre
 
BOW 2024 - L'écurie ouverte : un concept inspirant pour la filière équine
BOW 2024 - L'écurie ouverte : un concept inspirant pour la filière équineBOW 2024 - L'écurie ouverte : un concept inspirant pour la filière équine
BOW 2024 - L'écurie ouverte : un concept inspirant pour la filière équineidelewebmestre
 
Accompagnement de l'agrivoltaïsme dans le département de la Nièvre
Accompagnement de l'agrivoltaïsme dans le département de la NièvreAccompagnement de l'agrivoltaïsme dans le département de la Nièvre
Accompagnement de l'agrivoltaïsme dans le département de la Nièvreidelewebmestre
 

Dernier (20)

BOW 24 - De la réflexion de groupe à l'immersion dans des bâtiments porcins
BOW 24 - De la réflexion de groupe à l'immersion dans des bâtiments porcinsBOW 24 - De la réflexion de groupe à l'immersion dans des bâtiments porcins
BOW 24 - De la réflexion de groupe à l'immersion dans des bâtiments porcins
 
Cadre réglementaire et développement de l'agrivoltaïsme en France
Cadre réglementaire et développement de l'agrivoltaïsme en FranceCadre réglementaire et développement de l'agrivoltaïsme en France
Cadre réglementaire et développement de l'agrivoltaïsme en France
 
BOW 2024 - Jardins d'hiver en poulets de chair
BOW 2024 - Jardins d'hiver en poulets de chairBOW 2024 - Jardins d'hiver en poulets de chair
BOW 2024 - Jardins d'hiver en poulets de chair
 
BOW 2024 - Le bâtiment multicritère porcin
BOW 2024 - Le bâtiment multicritère porcinBOW 2024 - Le bâtiment multicritère porcin
BOW 2024 - Le bâtiment multicritère porcin
 
Support de cours La technologie WDM.pptx
Support de cours La technologie WDM.pptxSupport de cours La technologie WDM.pptx
Support de cours La technologie WDM.pptx
 
Chapitre 2 : fondations et analyses de données géotechniques
Chapitre 2 : fondations et analyses de données géotechniquesChapitre 2 : fondations et analyses de données géotechniques
Chapitre 2 : fondations et analyses de données géotechniques
 
Actions du vent sur les bâtiments selon lEurocode 1 – Partie 1-4.pdf
Actions du vent sur les bâtiments selon lEurocode 1 – Partie 1-4.pdfActions du vent sur les bâtiments selon lEurocode 1 – Partie 1-4.pdf
Actions du vent sur les bâtiments selon lEurocode 1 – Partie 1-4.pdf
 
SciencesPo_Aix_InnovationPédagogique_Atelier_APC.pdf
SciencesPo_Aix_InnovationPédagogique_Atelier_APC.pdfSciencesPo_Aix_InnovationPédagogique_Atelier_APC.pdf
SciencesPo_Aix_InnovationPédagogique_Atelier_APC.pdf
 
Agrivoltaïsme et filière ovine en Dordogne
Agrivoltaïsme et filière ovine en DordogneAgrivoltaïsme et filière ovine en Dordogne
Agrivoltaïsme et filière ovine en Dordogne
 
BOW 2024 - 3-6 - Adaptation climat chaud Porcs
BOW 2024 - 3-6 - Adaptation climat chaud PorcsBOW 2024 - 3-6 - Adaptation climat chaud Porcs
BOW 2024 - 3-6 - Adaptation climat chaud Porcs
 
Compersseur d'air a vis atlas copco avec huile
Compersseur d'air a vis atlas copco avec huileCompersseur d'air a vis atlas copco avec huile
Compersseur d'air a vis atlas copco avec huile
 
BOW 2024 - 3 1 - Les infrastructures équestres et le changement climatique
BOW 2024 - 3 1 - Les infrastructures équestres et le changement climatiqueBOW 2024 - 3 1 - Les infrastructures équestres et le changement climatique
BOW 2024 - 3 1 - Les infrastructures équestres et le changement climatique
 
BOW 2024 - 3-8 - Adaptation des bâtiments d'élevages de volailles au changeme...
BOW 2024 - 3-8 - Adaptation des bâtiments d'élevages de volailles au changeme...BOW 2024 - 3-8 - Adaptation des bâtiments d'élevages de volailles au changeme...
BOW 2024 - 3-8 - Adaptation des bâtiments d'élevages de volailles au changeme...
 
BOW 2024 - 3-3 - Adaptation des bâtiments pour ruminants au changement clima...
BOW 2024 - 3-3 -  Adaptation des bâtiments pour ruminants au changement clima...BOW 2024 - 3-3 -  Adaptation des bâtiments pour ruminants au changement clima...
BOW 2024 - 3-3 - Adaptation des bâtiments pour ruminants au changement clima...
 
BOW 2024 -3-9 - Matelas de logettes à eau refroidie VL
BOW 2024 -3-9 - Matelas de logettes à eau refroidie VLBOW 2024 -3-9 - Matelas de logettes à eau refroidie VL
BOW 2024 -3-9 - Matelas de logettes à eau refroidie VL
 
CHAPITRE 2 VARIABLE ALEATOIRE probabilité.ppt
CHAPITRE 2 VARIABLE ALEATOIRE probabilité.pptCHAPITRE 2 VARIABLE ALEATOIRE probabilité.ppt
CHAPITRE 2 VARIABLE ALEATOIRE probabilité.ppt
 
BOW 2024 - L'enrichissement du milieu des chèvres laitières
BOW 2024 - L'enrichissement du milieu des chèvres laitièresBOW 2024 - L'enrichissement du milieu des chèvres laitières
BOW 2024 - L'enrichissement du milieu des chèvres laitières
 
Bow 2024 - Plein air à l'intérieur des bâtiments d'élevage de ruminants
Bow 2024 - Plein air à l'intérieur des bâtiments d'élevage de ruminantsBow 2024 - Plein air à l'intérieur des bâtiments d'élevage de ruminants
Bow 2024 - Plein air à l'intérieur des bâtiments d'élevage de ruminants
 
BOW 2024 - L'écurie ouverte : un concept inspirant pour la filière équine
BOW 2024 - L'écurie ouverte : un concept inspirant pour la filière équineBOW 2024 - L'écurie ouverte : un concept inspirant pour la filière équine
BOW 2024 - L'écurie ouverte : un concept inspirant pour la filière équine
 
Accompagnement de l'agrivoltaïsme dans le département de la Nièvre
Accompagnement de l'agrivoltaïsme dans le département de la NièvreAccompagnement de l'agrivoltaïsme dans le département de la Nièvre
Accompagnement de l'agrivoltaïsme dans le département de la Nièvre
 

Gestion_anomalies-webinaire-UMT_STAR_03-JRaoul-IPalhiere.pdf

  • 1. 1 La gestion génétique des anomalies dans les populations ou… Webinaire UMT STAR - 19 Janvier 2023 I. Palhière , J.J. Colleau, J. Raoul, S. Rodriguez-Ramilo
  • 2. 2
  • 3. Quelle gestion ? À l’échelle de l’élevage À l’échelle de la population
  • 4. Quelle gestion ? À l’échelle de l’élevage À l’échelle de la population Fréquences ? Déterminisme génétique ? Létalité ? Période d’apparition des signes cliniques ?
  • 5. Quelle gestion ? « Elimination des porteurs » À l’échelle de la population Allèle létal
  • 6. Quelle gestion ? « Elimination des porteurs » À l’échelle de la population Allèle non létal
  • 7. Quelle gestion ? « Elimination des porteurs » À l’échelle de la population Allèle non létal
  • 8. Quelle gestion ? « Elimination des porteurs » À l’échelle de la population Difficulté à mettre en œuvre : « Fréquence élevée de porteurs » • Fréquence élevée d’une anomalie • Nombre élevé d’anomalies à gérer Affecte les performances technico- économiques de la sélection : • Coût • Progrès génétique sur les caractères en sélection • Consanguinité
  • 9. D’autres méthodes de gestion existent À l’échelle de la population Etape(s) de sélection Anomalies prises en compte pour estimer la valeur génétique (Index ) Lait Taux Cellules Morpho Anomalie Boichard et al.,2016
  • 10. D’autres méthodes de gestion existent À l’échelle de la population Etape(s) de sélection Anomalies prises en compte pour estimer la valeur génétique (Index ) Lait Taux Cellules Morpho Anomalie Boichard et al.,2016 Accouplements Gestion des accouplements à risque X X X Cole et al.,2015
  • 11. D’autres méthodes de gestion existent À l’échelle de la population Spécificités PR •Tailles de descendance plus faibles qu’en bovin •Peu d’accouplements raisonnés à l’individu •Peu ou pas de génotypages femelles Etape(s) de sélection Anomalies prises en compte pour estimer la valeur génétique (Index ) Lait Taux Cellules Morpho Anomalie Boichard et al.,2016 Accouplements Gestion des accouplements à risque X X X Cole et al.,2015
  • 12. Quelle efficacité de ces méthodes (combinaison) en petits ruminants ? À l’échelle de la population 1ers résultats issus de simulations Schéma de sélection caprin – 20 ans 5 anomalies 4 scénarios évalués 2 modalités d’accouplements : aléatoires ou optimisés 2 objectifs de sélection (anomalies incluses ou exclues)
  • 13. Quelle efficacité de ces méthodes (combinaison) en petits ruminants ? À l’échelle de la population 1ers résultats issus de simulations Schéma de sélection caprin – 20 ans 5 anomalies 4 scénarios évalués 2 modalités d’accouplements : aléatoires ou optimisés 2 objectifs de sélection (anomalies incluses ou exclues) Gain génétique ? Évolution des fréquences des allèles favorables ?
  • 14. Quelle efficacité de ces méthodes (combinaison) en petits ruminants ? À l’échelle de la population 0 20 40 60 80 100 120 GEBV/AM GEBV/OFC ISp/AM ISp/OFC ΔG Δf_k Anomalies non incluses Anomalies incluses Acc_opt Acc_opt Gain génétique Anomalies létales Hausse fréquences allèles favorables Référence Acc_aléa Acc_aléa
  • 15. Quelle efficacité de ces méthodes (combinaison) en petits ruminants ? À l’échelle de la population 0 20 40 60 80 100 120 GEBV/AM GEBV/OFC ISp/AM ISp/OFC ΔG Δf_k Anomalies non incluses Anomalies incluses Acc_opt Acc_opt Gain génétique Anomalies létales Hausse fréquences allèles favorables Référence Inclure les anomalies dans l’objectif de sélection est une méthode efficace Optimisation des accouplements : affecte uniquement le gain génétique Anomalies létales : fréquence allèle favorable en baisse même en absence de gestion Acc_aléa Acc_aléa
  • 16. Quelle efficacité de ces méthodes (combinaison) en petits ruminants ? À l’échelle de la population Gain génétique Anomalies non létales Anomalies non incluses Anomalies incluses Hausse fréquences allèles favorables -20 0 20 40 60 80 100 120 GEBV/AM GEBV/OFC ISp/AM ISp/OFC Acc_opt Acc_opt Référence Inclure les anomalies dans l’objectif de sélection est une méthode efficace Optimisation des accouplements : affecte uniquement le gain génétique Anomalies non létales : fréquence allèle favorable en moyenne stable en absence de gestion Acc_aléa Acc_aléa
  • 17. 17 Zoom sur un cas particulier de gestion des anomalies : la Sélection à Parenté Minimum en caprins • On est toujours à l’échelle de la population • Gestion des anomalies au moment d’une étape de sélection  le plus efficace • Validation sur données réelles • Possible en caprins car semence congelée
  • 18. 18 Principe de la Sélection à Parenté Minimum (SPM) • Méthode de sélection qui optimise progrès génétique et variabilité génétique • Développée par J.J. Colleau (INRAE) dans les années 2000 • Appliquée en races Alpine et Saanen depuis 2006 Progrès génétique Variabilité génétique Index Coefficients parenté
  • 19. 19 Méthode SPM Principe de la Sélection à Parenté Minimum (SPM) • Méthode de sélection qui optimise progrès génétique et variabilité génétique • Développée par J.J. Colleau (INRAE) dans les années 2000 • Appliquée en races Alpine et Saanen depuis 2006 Mâles et femelles élites candidats à la sélection Choix des meilleurs mâles et femelles élites pour la procréation des futurs boucs IA Palhière et al. INRAE Productions Animales, 2022, 35(3), 171-186 Progrès génétique Variabilité génétique Index Coefficients parenté
  • 20. 20 L’idée : introduire la gestion des anomalies génétiques dans la Sélection à Parenté Minimum NEW Progrès génétique Variabilité génétique Fréquences alléliques aux gènes Comment concilier progrès génétique, variabilité génétique et fréquences aux allèles des différents gènes ?
  • 21. • Test a posteriori sur les données 2022 21 Est-ce que ça marche ? Données 2022 SANS optimisation sur les gènes Données 2022 AVEC optimisation sur les gènes Comparaison -fréquences aux gènes -parenté/consanguinité Progrès génétique identique • Exemple de la race Saanen : 6 gènes concernés par l’optimisation Progrès génétique Variabilité génétique Fréquences alléliques aux gènes Progrès génétique Variabilité génétique
  • 22. 22 Quel impact sur les fréquences alléliques ? Fréquence de l’allèle favorable chez les pères élites +3,4 points Exemple du gène PrP (résistance à la tremblante)  Permet d’améliorer les fréquences alléliques sur les 6 gènes considérés (+5,2 points de fréquence en moyenne) Anomalie non létale
  • 23. 23 Quel impact sur la variabilité génétique ? Consanguinité et parenté moyennes des futurs boucs IA +0,08 point +0,19 point  l’augmentation de la consanguinité et de la parenté sont très modérées
  • 24. • Différentes méthodes de gestion des anomalies génétiques existent • Les premiers travaux en petits ruminants montrent que : • elles sont efficaces pour modifier les fréquences alléliques et donc, à terme, éliminer les allèles défavorables • sans impacter fortement le progrès génétique et la variabilité génétique • étape primordiale = choix des reproducteurs et de leur contribution • Prochaines étapes : • Etudier l’efficacité de ces méthodes pour des cas particuliers (pléiotropie, favoriser les hétérozygotes) • Appliquer ces méthodes sur des cas concrets d’anomalies récemment détectées 24 Conclusion et perspectives
  • 25. Merci pour votre attention