Estimation des paramètres génétiques de l'efficience alimentaire durant la lactation des brebis laitières

1. ASPECTS GÉNÉTIQUES DE
L’EFFICIENCE ALIMENTAIRE EN
PETITS RUMINANTS
Estimation des paramètres génétiques de
l’efficience alimentaire durant la période de
lactation chez les brebis laitières
Coralie MACHEFERT, Hélène LARROQUE, Christèle ROBERT-GRANIE
coralie.machefert@inrae.fr
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2. Nos travaux s’inscrivent dans les objectifs du WP1 SMARTER
WP1 SMARTER - Nouveaux caractères pour améliorer l’efficience de l’utilisation des ressources alimentaires
Trouver des phénotypes pertinents en lien avec l’efficience alimentaire
Réaliser une analyse génétique de ces critères : héritabilité et corrélations génétiques
avec les caractères de production (peu documenté en ovin laitier)
Les mesurer à grande échelle, en fermes commerciales, dans des milieux diversifiés
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3. Le protocole de phénotypage
✓ 2 campagnes laitières : 2020 + 2021
✓ 15 élevages commerciaux (4 races)
3
➢ Quantité moyenne de fourrages et concentrés distribués au lot
➢ Quantité individuelle de concentrées au DAC
➢ Analyses de fourrage

4. La base de données
4
Données brutes :
Données sélectionnées :
9 549 brebis
69 868 observations
4 586 brebis (48 %)
30 298 observations (43 %)
➢ Dont 1 744 brebis suivies sur les 2 campagnes laitières
✓ Race (Lacaune)
✓ Respect des stades
physiologiques cibles (NEC)
✓ Avoir au moins 2 NEC / 5
✓ Performances laitières
complètes (lait et taux)
Sélection sur :

5. Estimation de l’efficience alimentaire
=
𝑃𝑟𝑜𝑑𝑢𝑖𝑡𝑠
𝑅𝑒𝑠𝑠𝑜𝑢𝑟𝑐𝑒𝑠
Feed conversion ratio (FCR) =
𝑃𝑟𝑜𝑑𝑢𝑐𝑡𝑖𝑜𝑛 𝑙𝑎𝑖𝑡𝑖è𝑟𝑒
𝑄𝑢𝑎𝑛𝑡𝑖𝑡é𝑠 𝑖𝑛𝑔é𝑟é𝑒𝑠
Lactation feed conversion ratio (LFCR)
LFCR > 1 : EFFICIENTE
Méthode 1 : le ratio

6. Estimation de l’efficience alimentaire
Méthode 2 : le REI (residual energy intake)
REI = Consommation ingérée – Consommation prédite
REI
SELON SES PERFORMANCES ZOOTECHNIQUES
Aliments ingérés (UFL/j) = β0 + β1 poids vif + β2 PL + β3 TP + β4 TB + β5 NECΔ + Ɛ
REI < 0 : EFFICIENTE

7. Paramètres génétiques
• Héritabilités au cours de la lactation
7
LACAUNE
= LFCR

8. Paramètres génétiques
• Corrélations génétiques entre deux mois de lactation
8
Critère d’efficience : LFCR
Mois 2 Mois 3 Mois 4 Mois 5 Mois 6 Mois 7
Mois 2 _
Mois 3 0.90 ± 0.11 _
Mois 4 0.76 ± 0.13 1 ± 0.06 _
Mois 5 0.58 ± 0.15 0.91 ± 0.09 0.94 ± 0.06 _
Mois 6 0.10 ± 0.19 0.75 ± 0.12 0.66 ± 0.10 0.97 ± 0.07 _
Mois 7 0.46 ± 0.17 0.53 ± 0.14 0.54 ± 0.12 0.67 ± 0.13 0.91 ± 0.08 _
Corrélations élevées entre les mois de lactation successifs
LACAUNE

9. Paramètres génétiques
• Corrélations génétiques entre deux mois de lactation
9
Critère d’efficience : LFCR
Reclassification des animaux efficients entre le début et la fin de lactation
LACAUNE
Mois 2 Mois 3 Mois 4 Mois 5 Mois 6 Mois 7
Mois 2 _
Mois 3 0.90 ± 0.11 _
Mois 4 0.76 ± 0.13 1 ± 0.06 _
Mois 5 0.58 ± 0.15 0.91 ± 0.09 0.94 ± 0.06 _
Mois 6 0.10 ± 0.19 0.75 ± 0.12 0.66 ± 0.10 0.97 ± 0.07 _
Mois 7 0.46 ± 0.17 0.53 ± 0.14 0.54 ± 0.12 0.67 ± 0.13 0.91 ± 0.08 _

10. Paramètres génétiques
• Corrélations génétiques entre deux mois de lactation
10
Critère d’efficience : LFCR
Changement alimentaire = mise à l’herbe
Mois 2 Mois 3 Mois 4 Mois 5 Mois 6 Mois 7
Mois 2 _
Mois 3 0.90 ± 0.11 _
Mois 4 0.76 ± 0.13 1 ± 0.06 _
Mois 5 0.58 ± 0.15 0.91 ± 0.09 0.94 ± 0.06 _
Mois 6 0.10 ± 0.19 0.75 ± 0.12 0.66 ± 0.10 0.97 ± 0.07 _
Mois 7 0.46 ± 0.17 0.53 ± 0.14 0.54 ± 0.12 0.67 ± 0.13 0.91 ± 0.08 _
LACAUNE

11. Paramètres génétiques
• Corrélations génétiques entre deux mois de lactation
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Mêmes observations pour les deux critères d’efficience alimentaire
Mois 2 Mois 3 Mois 4 Mois 5 Mois 6 Mois 7
Mois 2 _
Mois 3 0,9 _
Mois 4 0,76 1 _
Mois 5 0,58 0,91 0,94 _
Mois 6 0,1 0,75 0,66 0,97 _
Mois 7 0,46 0,53 0,54 0,67 0,91 _
Mois 2 Mois 3 Mois 4 Mois 5 Mois 6 Mois 7
Mois 2 _
Mois 3 0,83 _
Mois 4 0,42 0,82 _
Mois 5 0,36 0,61 0,86 _
Mois 6 0,24 0,73 0,59 0,96 _
Mois 7 0,59 0,6 0,67 0,52 0,95 _
Critère d’efficience : LFCR Critère d’efficience : REI
LACAUNE

12. Paramètres génétiques
• Héritabilités sur toute la lactation
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LACAUNE
Lait TB TP LFCR REI
Lait 0.16 ± 0.02
TB -0.50 ± 0.05 0.36 ± 0.02
TP -0.62 ± 0.05 0.65 ± 0.03 0.43 ± 0.02
LFCR 0.74 ± 0.04 0.11 ± 0.07 -0.18 ± 0.07 0.10 ± 0.01
REI -0.79 ± 0.04 0.46 ± 0.06 0.75 ± 0.04 -0.63 ± 0.06 0.11 ± 0.01
h² type LFCR : 0.16 ± 0.01 (Hurley et al., 2018)
0.20 (Parke et al., 1999)
0.25 ± 0.03 (Manafiazar et al., 2016)
de 0.09 ± 0.03 à 0.11 ± 0.04 (Kock et al., 2018) → Fermes commerciales autrichiennes
h² REI : 0.07 ± 0.02 (Hurley et al., 2018) → Alimentation basée sur le pâturage
h² RFI : de 0.01 ± 0.05 à 0.27 ± 0.12 (Brito et al. 2020)

13. Paramètres génétiques
• Corrélations génétiques entre caractères sur toute la lactation
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Lait TB TP LFCR REI
Lait 0.16 ± 0.02
TB -0.50 ± 0.05 0.36 ± 0.02
TP -0.62 ± 0.05 0.65 ± 0.03 0.43 ± 0.02
LFCR 0.74 ± 0.04 0.11 ± 0.07 -0.18 ± 0.07 0.10 ± 0.01
REI -0.79 ± 0.04 0.46 ± 0.06 0.75 ± 0.04 -0.63 ± 0.06 0.11 ± 0.01
LACAUNE
Rg lait – type LFCR :
-0.77 ± 0.11 (Manafiazar et al., 2015)
Rg 2 critères d’efficience proches :
-0.69 ± 0.86 (Vallimont et al., 2011)
-0.57 ± 0.22 (Manafiazar et al., 2015)
Rg lait – RFI :
De −0.11 à 0.07 (Veerkamp et al., 1994)
0.07 ± 0.08 (Gonzalez-Recio et al., 2014)

14. Conclusions
• Relation génétique entre l’efficience alimentaire et les spectres moyen infrarouge du lait
• Catégoriser l’efficience alimentaire des animaux au cours de la lactation
• Discriminer les groupes d’animaux efficients par le biais des spectres moyen infrarouge du lait
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Perspectives
• Estimation d’une efficience alimentaire approchée à partir d’un
contexte d’alimentation collective et diversifiée
• Cibler sur les données individuelles d’alimentation et de production
pour étudier des critères fiables
• Forte influence des effets d’environnement
• Héritabilité faible mais non nulle

15. This project has received funding from the European Union’s Horizon 2020 research and innovation programme under the Grant Agreement n°772787
www.smarterproject.eu
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Remerciements