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Amélioration de la surveillance
et la détection précoce
de la fièvre aphteuse
en Afrique du Nord
Tunis, 23 - 25 Septembre 2019
Introduction
• Bienvenue
• Objectifs de l’atelier
• Introduction des participants
Présentations des participants
• Situation de la fièvre aphteuse en Afrique du Nord
• au cours des 4 dernières années
• (20min /pays)
Surveillance
Angus Cameron
Objectifs de surveillance
• Activité
• Quelles sont vos activités de surveillance actuelles?
• Description ( < 20 mots)
• Exemple
• Bluetongue
• Troupeaux sentinelles
• Sérologie et détection d'antigène
• Périodique (tous les 6 mois)
• Quels sont les objectifs généraux de chaque activité?
• Exemple
• Définir la distribution géographique du virus
Objectifs de surveillance
• Maladies présentes
• Quantifier le taux de maladie
• Détection des cas
• Maladies absentes
• Détection précoce
• Démontrer l’absence
Quantification de qualité
• Exemples
• Taux de maladie (prévalence, incidence)
• Calcul de la taille de l’échantillon
• Selon la qualité désirée
• Précision
• Taille de l’intervalle de confiance
• Validité
• Absence de biais
• Absence d’infection
• Prévalence seuil = prévalence limite (design prevalence)
• Sensibilité de la surveillance
Détection précoce
• Définir l’objectif
• Quantification de qualité
Objectif de détection précoce
• Premier cas (Deuxième ?)
• Animal?Troupeau?Village? Commune?
• Quand?
• Dès que la maladie est introduite?
• Après 1 semaine? Un mois?
• Chez les humains
• Maladies endémiques (grippe saisonnière)
• Détection de foyers
• Analyse statistique pour détecter un taux supérieur au
niveau normal («détection de foyers»)
Sensibilité de la surveillance
• Définition générale
• Probabilité que le système de surveillance identifie
correctement la présence d’une maladie
• Analogue de sensibilité d’un test de laboratoire
Sensibilité (détection précoce)
• Probabilité que le 1ère unité malade soit sous
surveillance
• Couverture de la population (Cp)
• Probabilité que la détection soit dans le délai spécifié
• Couverture temporelle (Ct)
• Probabilité que l’unité malade surveillée soit détectée
• Sensibilité du système de détection (Se)
SSe = Cp × Ct × Se
Implications
• Maximiser les trois éléments
• Couverture de la population
• Comment?
• Couverture temporelle
• Comment?
• Sensibilité de détection
• Comment?
Sensibilité de détection
• Cascade de probabilités
• L’animal montre des signes cliniques
• L’éleveur observe les signes cliniques
• L’éleveur reconnaît que l’animal est malade
• L’éleveur contacte un vétérinaire
• Le vétérinaire fait une déclaration (suspicion de
maladie notifiable)
• Le service vétérinaire lance une enquête
• Le vétérinaire envoie des prélèvements au laboratoire
• Les prélèvements sont testés pour la maladie
• Le test diagnostique est positif
SSe = Cp × Ct × Se
• L’animal montre des signes cliniques
• L’éleveur observe les signes cliniques
• L’éleveur reconnaît que l’animal est malade
• L’éleveur contacte un vétérinaire
• Le vétérinaire fait une déclaration (suspicion de maladie notifiable)
• Le service vétérinaire lance une enquête
• Le vétérinaire envoie des prélèvements au laboratoire
• Les prélèvements sont testés pour la maladie
• Le test diagnostique est positif
Catriona
Anne
Angus
Surveillance basée sur le risque
Surveillance basée sur le risque
• Deux concepts différents
• Priorisation basée sur le risque
• Où mieux investir?
• Espèce, filière, région, saison
• Échantillonnage basé sur le risque
• Diviser la population en groupes avec des risques différents
• Privilégier l’échantillonnage du groupe avec le risque le plus
élevé
Détection basée sur le risque
• Analyse de la surveillance
• Basée sur la théorie de probabilité
• Il est possible de prédire le future
• S'il y a des évènements répétés
• Lancer une pièce: pile ou face?
• 1,000 répétitions
Mais…
• Détection précoce
• Objectif: détecter la première incursion de la maladie
• Un seul évènement
• Les règles de probabilité ne s'appliquent plus
• Un seul lancement de pièce
• Je sais qu'il y a une probabilité de 50%
• Mais je ne peux pas prédire le résultat avec certitude
Priorisation basée sur le risque
• Pays avec deux zones de risque
• Risque élevé
P(entrée sachant que la maladie va entrer) = 80%
• Risque faible
P = 20%
• Si on cible toutes les ressources de surveillance dans la
zone à risque élevé
• Probabilité de 20%+ de ne pas trouver le premier foyer
• Si on ne cible pas
• Relativement trop de surveillance dans la zone à faible
risque
Définition du risque
• Probabilité d’un évènement indésirable
• Risque relatif
• Probabilité et conséquences
• Analyse de risque
• Quelle définition pour la détection précoce?
• Comment quantifier les conséquences?
Définition du risque (détection précoce)
• Probabilité et conséquences
• Probabilité
• Que la maladie soit introduite dans la population
concernée
• Conséquences
• De l’introduction de la maladie dans cette population
• Par rapport aux autres populations
• Risque de dissémination rapide
• Risque d'impact sur la commerce
• Faiblesse de la surveillance (risque de ne pas détecter)
Optimisation de la surveillance
• Sensibilité globale basée sur le risque
• Calculer sensibilité de chaque groupe de risque
• Calculer la moyenne pondérée par le risque
• Optimisation
• Un investissement pour améliorer la surveillance est
plus rentable dans les zones
• À haut risque
• À faible couverture
• À faible sensibilité de détection
Exercices
• Calculer la sensibilité de la surveillance (détection
précoce):
• Définir les standards souhaités pour la détection
précoce de la fièvre aphteuse
• Unité de détection
• Délai de détection
• Sensibilité souhaitée
• Surveillance clinique par les éleveurs ciblant la fièvre
aphteuse
• situation actuelle
• après amélioration (sensibilisation des éleveurs)
• Surveillance sérologique
• Enquête annuelle

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AUSVET-REMESA Workshop - Amélioration de la surveillance et la détection précoce de la fièvre aphteuse en Afrique du Nord - AUSVET

  • 1. Amélioration de la surveillance et la détection précoce de la fièvre aphteuse en Afrique du Nord Tunis, 23 - 25 Septembre 2019
  • 2. Introduction • Bienvenue • Objectifs de l’atelier • Introduction des participants
  • 3. Présentations des participants • Situation de la fièvre aphteuse en Afrique du Nord • au cours des 4 dernières années • (20min /pays)
  • 5. Objectifs de surveillance • Activité • Quelles sont vos activités de surveillance actuelles? • Description ( < 20 mots) • Exemple • Bluetongue • Troupeaux sentinelles • Sérologie et détection d'antigène • Périodique (tous les 6 mois) • Quels sont les objectifs généraux de chaque activité? • Exemple • Définir la distribution géographique du virus
  • 6. Objectifs de surveillance • Maladies présentes • Quantifier le taux de maladie • Détection des cas • Maladies absentes • Détection précoce • Démontrer l’absence
  • 7. Quantification de qualité • Exemples • Taux de maladie (prévalence, incidence) • Calcul de la taille de l’échantillon • Selon la qualité désirée • Précision • Taille de l’intervalle de confiance • Validité • Absence de biais • Absence d’infection • Prévalence seuil = prévalence limite (design prevalence) • Sensibilité de la surveillance
  • 8. Détection précoce • Définir l’objectif • Quantification de qualité
  • 9. Objectif de détection précoce • Premier cas (Deuxième ?) • Animal?Troupeau?Village? Commune? • Quand? • Dès que la maladie est introduite? • Après 1 semaine? Un mois? • Chez les humains • Maladies endémiques (grippe saisonnière) • Détection de foyers • Analyse statistique pour détecter un taux supérieur au niveau normal («détection de foyers»)
  • 10. Sensibilité de la surveillance • Définition générale • Probabilité que le système de surveillance identifie correctement la présence d’une maladie • Analogue de sensibilité d’un test de laboratoire
  • 11. Sensibilité (détection précoce) • Probabilité que le 1ère unité malade soit sous surveillance • Couverture de la population (Cp) • Probabilité que la détection soit dans le délai spécifié • Couverture temporelle (Ct) • Probabilité que l’unité malade surveillée soit détectée • Sensibilité du système de détection (Se) SSe = Cp × Ct × Se
  • 12. Implications • Maximiser les trois éléments • Couverture de la population • Comment? • Couverture temporelle • Comment? • Sensibilité de détection • Comment?
  • 13. Sensibilité de détection • Cascade de probabilités • L’animal montre des signes cliniques • L’éleveur observe les signes cliniques • L’éleveur reconnaît que l’animal est malade • L’éleveur contacte un vétérinaire • Le vétérinaire fait une déclaration (suspicion de maladie notifiable) • Le service vétérinaire lance une enquête • Le vétérinaire envoie des prélèvements au laboratoire • Les prélèvements sont testés pour la maladie • Le test diagnostique est positif
  • 14. SSe = Cp × Ct × Se • L’animal montre des signes cliniques • L’éleveur observe les signes cliniques • L’éleveur reconnaît que l’animal est malade • L’éleveur contacte un vétérinaire • Le vétérinaire fait une déclaration (suspicion de maladie notifiable) • Le service vétérinaire lance une enquête • Le vétérinaire envoie des prélèvements au laboratoire • Les prélèvements sont testés pour la maladie • Le test diagnostique est positif Catriona Anne Angus
  • 16. Surveillance basée sur le risque • Deux concepts différents • Priorisation basée sur le risque • Où mieux investir? • Espèce, filière, région, saison • Échantillonnage basé sur le risque • Diviser la population en groupes avec des risques différents • Privilégier l’échantillonnage du groupe avec le risque le plus élevé
  • 17. Détection basée sur le risque • Analyse de la surveillance • Basée sur la théorie de probabilité • Il est possible de prédire le future • S'il y a des évènements répétés • Lancer une pièce: pile ou face? • 1,000 répétitions
  • 18.
  • 19.
  • 20. Mais… • Détection précoce • Objectif: détecter la première incursion de la maladie • Un seul évènement • Les règles de probabilité ne s'appliquent plus • Un seul lancement de pièce • Je sais qu'il y a une probabilité de 50% • Mais je ne peux pas prédire le résultat avec certitude
  • 21. Priorisation basée sur le risque • Pays avec deux zones de risque • Risque élevé P(entrée sachant que la maladie va entrer) = 80% • Risque faible P = 20% • Si on cible toutes les ressources de surveillance dans la zone à risque élevé • Probabilité de 20%+ de ne pas trouver le premier foyer • Si on ne cible pas • Relativement trop de surveillance dans la zone à faible risque
  • 22. Définition du risque • Probabilité d’un évènement indésirable • Risque relatif • Probabilité et conséquences • Analyse de risque • Quelle définition pour la détection précoce? • Comment quantifier les conséquences?
  • 23. Définition du risque (détection précoce) • Probabilité et conséquences • Probabilité • Que la maladie soit introduite dans la population concernée • Conséquences • De l’introduction de la maladie dans cette population • Par rapport aux autres populations • Risque de dissémination rapide • Risque d'impact sur la commerce • Faiblesse de la surveillance (risque de ne pas détecter)
  • 24. Optimisation de la surveillance • Sensibilité globale basée sur le risque • Calculer sensibilité de chaque groupe de risque • Calculer la moyenne pondérée par le risque • Optimisation • Un investissement pour améliorer la surveillance est plus rentable dans les zones • À haut risque • À faible couverture • À faible sensibilité de détection
  • 25. Exercices • Calculer la sensibilité de la surveillance (détection précoce): • Définir les standards souhaités pour la détection précoce de la fièvre aphteuse • Unité de détection • Délai de détection • Sensibilité souhaitée • Surveillance clinique par les éleveurs ciblant la fièvre aphteuse • situation actuelle • après amélioration (sensibilisation des éleveurs) • Surveillance sérologique • Enquête annuelle