L'association est dirigée par un conseil d'administration de 14 membres, dont 12 élus et 2 membres de droit, avec un bureau exécutif composé de 7 personnes. La direction opérationnelle comprend un directeur général et 4 directeurs d'établissement, assistés par une équipe administrative de 3 comptables. Un contrat pluriannuel d'objectifs et de moyens a été établi avec la DDCS pour une durée de cinq ans.