Retrouver les caractéristiques de la molécule d'ADN

1. TD – TP Retrouver les caractéristiques de la molécule d’ADN.
Objectifs : Votre mission est d’utiliser les fonctionnalités du logiciel RASTOP afin de mettre en évidence l’organisation spatiale de la molécule d’ADN (acide désoxyribonucléique) et de se remémorer ses principales caractéristiques.
Après avoir ouvert le logiciel, charger la molécule ADN.pdb à partir du chemin d’accès : Poste de travail/communsur 'Serv/SVT/Chouzier.
Ouvrir à partir de ce même chemin la fiche technique du logiciel FT_Rastop.pdf.
A. Activité guidée : colorier la chaîne A en rouge.
- positionner la souris sur un atome quelconque et cliquer : les informations concernant l’atome apparaissent en bas de l’écran ; dans l’exemple ci-dessous l’atome sélectionné est l’oxygène en position 291 dans le groupe T15 de la chaîne B
- repérer la chaîne A, puis cliquer sur l’icône
positionner le curseur sur la chaîne A, cliquer puis choisir la couleur rouge à partir de l’icône
- pour revenir à la situation initiale (la chaîne étant sélectionnée) cliquer sur
Remarques : par le même procédé on peut sélectionner un unique atome par , ou un groupe par . On peut aussi représenter la molécule, une chaîne, un groupe ou un atome

2. sous différentes formes grâce à (la sélection de l’icône la plus à droite permet de masquer l’élément sélectionné)
B. Activités autonomes.
1. Colorier la chaîne A en bleu et la chaîne B en jaune (faire vérifier votre résultat).
2. Faire disparaître la chaîne A (faire vérifier votre résultat).
3. Revenir à la situation initiale
4. Colorier le nucléotide 18 de la chaîne B en vert et ne conserver que ce seul élément ; identifier la base azotée de ce nucléotide (faire vérifier votre résultat) .
5. Revenir à la situation initiale puis colorier les quatre types de nucléotides avec des couleurs différentes, à votre choix, (faire vérifier votre résultat); établir à partir de là la règle de complémentarité des bases.
6. Mettre en évidence les liaisons hydrogènes entre les deux chaînes (faire vérifier votre résultat) et expliquer l’origine de la complémentarité.
7. Indiquer la séquence de nucléotides de la chaîne A
8. En quoi la molécule d’ADN est-elle une molécule informative ?