Une bibliographie Zotero en Médecine
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Support pour une formation de 2h sur Zotero à destination des internes de Médecine de Brest. mise à jour juillet 2012
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Une bibliographie Zotero en Médecine
- 1. Votre bibliographie facile avec Zotero Formation – internes de médecine Brest SCD UBO – juillet 2012
- 2. Au programme Découvrir Installer Importer une référence Organiser Exporter une bibliographie Partager Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 2
- 3. 1. Découverte Démonstration en direct ou visionnage de la vidéo. Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 3
- 4. Comment ça marche? Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 4
- 5. Les logiciels pour éditer des bibliographies Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 5
- 6. En quoi Zotero peut m'être utile? Gestion de références Veille Sauvegarde de références Partage de références Édition de bibliographies Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 6
- 7. Présentation du logiciel Une extension de Firefox, gratuite Existe aussi en logiciel indépendant « Zotero StandAlone » (compatible avec les navigateurs Chrome et Safari) Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 7
- 8. Découvrir Installer Importer une référence Organiser Exporter une bibliographie Partager Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 8
- 9. Exercice Installer Zotero sur Firefox Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 9
- 10. Installer Zotero http://www.zotero.org Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 10
- 11. Installation terminée! Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 11
- 12. Exercice Affichez puis masquez Zotero dans votre navigateur. Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 12
- 13. Zotero affiché Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 13
- 14. Zotero masqué Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 14
- 15. Zotero en pleine page Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 15
- 16. Exercice Créez votre compte personnel sur http://www.zotero.org [clic sur « register »] Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 16
- 17. Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 17
- 18. Découvrir Installer Importer une référence Organiser Exporter une bibliographie Partager Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 18
- 19. Importation de références bibliographiques depuis le web Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 19
- 20. Exercice http://portail-scd.univ-brest.fr Trouvez dans le catalogue des BU de Brest la notice de l'ouvrage suivant Huas D, Rueff B. Abord clinique des malades de l'alcool en médecine générale. Paris: Springer; 2005. Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 20
- 21. Exercice Importez cette notice dans votre liste de références Zotero. Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 21
- 22. Correction Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 22
- 23. Correction (suite) Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 23
- 24. Exercice 3 Trouvez et importez depuis le catalogue dans Zotero trois références d'ouvrages sur le sevrage tabagique. Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 24
- 25. Correction (2) On peut importer dans sa bibliothèque Zotero une liste de plusieurs ouvrages à la fois. Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 25
- 26. Correction (3) Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 26
- 27. Correction (4) Cochez les trois ouvrages que vous souhaitez importer... Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 27
- 28. Correction (5) Remarque : dans cet exemple, une des références importées est une thèse Les thèses sont représentées par une icône spécifique Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 28
- 29. Exercice Trouvez puis importez depuis la base PubMed la référence suivante Dubar G. et al. « French Experience of 2009 A/H1N1v Influenza in Pregnant Women ». PLoS One [En ligne]. 2010, Vol. 5, n°10. . Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 29
- 30. Correction Quand on importe un article, l'icône à droite de la barre d'adresse est cette fois non pas un livre, mais une petite feuille. Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 30
- 31. Exercice : import d'une page web Importez dans votre bibliothèque Zotero l'article de blog suivant Flahaut, Antoine. « Grippe, la France Sentinelle de l'Europe? » in Le Blog d'Antoine Flahaut, 24 septembre 2009. Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 31
- 32. Correction Même sans icône dans la barre d'adresse, il est toujours possible de capturer une page web Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 32
- 33. Correction Ici, il faudra cependant corriger la notice importée pour indiquer qu'il s'agit d'un billet de blog et non pas d'une page web classique Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 33
- 34. Nota Bene Il est toujours possible dans Zotero de créer manuellement une notice. Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 34
- 35. Récapitulatif des icônes d'importation Importation d'une référence d'ouvrage Importation simultanée d'une liste de références d'ouvrages ou d'articles Importation d'une référence de thèse Importation d'une référence d'article Importation d'une page web Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 35
- 36. Quelques sites Zotero-compatibles http://www.zotero.org/translators Sites compatibles Partiellement compatibles Catalogue UBO Ubodoc Catalogue BIUM Sudoc Medline Cochrane Library EbscoHost (Pascal) HAL (archives ouvertes CNRS) Science Direct Incompatible CisMef Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 36
- 37. Découvrir Installer Importer une référence Organiser Exporter une bibliographie 6. Partager Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 37
- 38. Interface : les trois panneaux 1 : L a bibliothèque (possibilité d’organiser en dossiers et sous-dossier, 2 : Liste des notices du dossier sélectionné, 3 : La fiche de l’élément (article, ouvrage, page Internet etc.) sélectionné. Source : Mathieu Poujol Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 38
- 39. La barre d'outils Saisir manuellement une notice dossier ou un sous-dossier Joindre un Faire une recherche dans les éléments d fichier à une référence er une bibliothèque, réglage des préférences etc... Créer une Annoter votre bibliothèque ou vos dossiers ou sous-dossiers notice à partir de la page web en cours Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 39
- 40. Organiser sa bibliothèque Par dossiers Par marqueurs/mots-clefs Source : Mathieu Poujol Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 40
- 41. Exercice Enregistrez vos références sur le sevrage tabagique dans - un sous-dossier intitulé « sevrage tabagique » - qui se trouvera lui-même dans un nouveau dossier de la bibliothèque intitulé : « Tabacologie ». Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 41
- 42. Correction Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 42
- 43. Correction (2) Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 43
- 44. Correction (3) Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 44
- 45. Exercice A l'ouvrage « Abord clinique des malades de l'alcool en médecine générale » (déjà dans votre bibliothèque Zotero) … ajoutez le mot-clef « thèse2012 » Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 45
- 46. Exercice - Ajoutez le mot-clef « thèse 2012 » à 3 références de votre bibliothèque Zotero - Affichez ensuite tous les documents qui contiennent le mot- clef « thèse 2012 » Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 46
- 47. Correction Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 47
- 48. Associer un fichier à une référence On peut joindre un lien ou une copie d'un fichier en ligne On peut joindre un lien ou une copie d'un fichier qui se trouve sur l'ordinateur Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 48
- 49. Exercice http://hal.archives-ouvertes.fr Dans l'archive ouverte HAL, trouvez et importez dans Zotero la référence de la thèse suivante Abtey, Catherine. La confiance chez les femmes primipares de la grossesse au post-partum. [Thèse] Université de Nantes, 2008. Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 49
- 50. Exercice (suite) Associez à la référence importée le fichier PDF du document (texte intégral de la thèse – version 1). Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 50
- 51. Correction Afficher le pdf dans Firefox Sélectionner la référence du document dans Zotero Cliquer sur « capture de la page » (menu Zotero > trombone) Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 51
- 52. Correction 2. On enregistre le pdf qui 1. On est affiché sélectionne dans la référence Firefox d'abord Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 52
- 53. Correction Il sera possible, même sans connexion internet, de retrouver et de lire ce fichier. Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 53
- 54. Découvrir Installer Importer une référence Organiser Exporter une bibliographie Partager Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 54
- 55. Exportation d'une bibliographie dans un document texte Bibliographie simple Bibliographie intégrée (dans le traitement de texte) Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 55
- 56. Exercice Exportez l'ensemble de vos références traitant du sevrage tabagique sous forme de bibliographie dans un document texte avec le style « Vancouver » Bibliographie simple Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 56
- 57. Correction Bibliographie simple Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 57
- 58. Correction (2) Bibliographie simple Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 58
- 59. Correction (3) Coller le presse-papier dans un document texte. 1. Tanguy C. Addiction et sevrage tabagique. 2008 ;1 vol. (125 f.-X-10l.en coul. 2. Metzger-Flock A. Particularités de l'aide au sevrage tabagique en médecine générale : à propos d'une enquête réalisée auprès des médecins généralistes de la région mulhousienne. 2005 ;89 f. 3. Perriot J., Llorca P., Boussiron D, Schwan R. Tabacologie et sevrage tabagique. Montrouge: J. Libbey Eurotext; 2003. Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 59
- 60. Exercice Installer le plug-in Zotero pour Word depuis le site Zotero.org Bibliographie intégrée Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 60
- 61. Correction Zotero.org > Support > Word Processor Integration > Installation > Word pour Windows plug-in Bibliographie intégrée Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 61
- 62. L'outil de citation (avec Word ou Open Office) Bibliographie intégrée Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 62 Source : Daniel Bourrion
- 63. Bibliographie intégrée : 2 étapes Insérer des citations – références Insérer la bibliographie complète Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 63
- 64. Exercice Dans un nouveau document Word, insérez trois références de votre bibliothèque Zotero sous forme de citations avec le style « Vancouver » Insérer des citations – références Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 64
- 65. Correction Insérer des citations – références Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 65
- 66. L'outil de citation (avec Word ou Open Office) Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 66 Source : Daniel Bourrion
- 67. Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 67
- 68. Exercice Insérer la bibliographie complète des références déjà ajoutées en citation. Insérer la bibliographie complète Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 68
- 69. Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 69
- 70. Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 70
- 71. Exercice Ajouter à cette bibliographie une référence qui ne fait pas partie des citations du document. Insérer la bibliographie complète Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 71
- 72. Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 72
- 73. Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 73
- 74. Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 74
- 75. De nombreux styles sur Zotero.org http://www.zotero.org/styles Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 75
- 76. Découvrir Installer Importer une référence Organiser Exporter une bibliographie Partager Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 76
- 77. Sauvegarde de données On peut sauvegarder manuellement sa bibliothèque Zotero sur un disque dur Pour l'utiliser plus tard sur un autre ordinateur avec Zotero Pour l'importer dans un autre logiciel de gestion bibliographique si on décide d'en changer : EndNote, Mendeley etc Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 77
- 78. Sauvegarde de données (2) Il est aussi possible de sauvegarder sa bibliothèque Zotero automatiquement par synchronisation avec son compte Zotero en ligne. Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 78
- 79. Exercice Depuis votre boîte mail, activez votre compte personnel Zotero en ligne (créé en début de séance) Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 79
- 80. Exercice (suite) Dans les préférences de Zotero, entrez les paramètres de votre compte Zotero pour la synchronisation de vos références avec votre compte en ligne Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 80
- 81. Correction Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 81
- 82. Correction Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 82
- 83. Exercice Synchronisez votre Zotero local avec votre profil Zotero en ligne Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 83
- 84. Correction Vous avez dorénavant 2 bibliothèques Zotero Une bibliothèque locale Une bibliothèque « en ligne » Ces 2 bibliothèques sont synchronisées. Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 84
- 85. Ma bibliothèque Zotero (Library) en ligne Synchronisation Ma bibliothèque Zotero locale Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 85
- 86. Exercice - Connectez vous sur le site de Zotero (« login ») afin de pouvoir visualiser et gérer votre bibliothèque Zotero en ligne. - Modifiez les paramètres de visibilité de votre page selon votre convenance Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 86
- 87. Paramètres de confidentialité : un exemple Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 87
- 88. De votre bibliographie personnelle à la veille collaborative... Retrouvez d'autres chercheurs en ligne! Zotero People Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 88
- 89. Merci de votre attention! Ce diaporama est visible et téléchargeable sur http://slideshare.com/phelly Avant de partir : pensez à nettoyer votre session Zotero Et en particulier à effacer les informations de synchronisation! Pour toute question sur Zotero Pour aller plus loin perrine.hellyATuniv-brest.fr http://delicious.com/phelly/zotero Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 89
- 90. Crédits photographiques Nasa Images Pdimension.net Boris sur Flickr Xtof sur Flickr Pascal Lemaire sur Picasa Caroline & Laurent sur Picasa Màj juillet 2012Université de Bretagne Occidentale – Service Commun de documentation 90
Notes de l'éditeur
- Avant toute formation, - vérifier que tous les postes de la salle de formation sont équipés de la dernière version de Firefox (3.5) et d'Open Office (3.1) - vérifier que le module d'import Zotero dans Open Office est bien installé sur tous les postes - vérifier que Zotero est bien désinstallé sur tous les postes, sauf celui du formateur.
- Le principe est d'abord de montrer rapidement l'avantage du logiciel et son intérêt, avant de le faire installer puis de faire travailler les stagiaires sur une série d'exercices. Les compétences à acquérir sont les suivantes : - comprendre l'intérêt du logiciel Zotero - savoir l'installer sur son propre poste - savoir importer une référence - savoir ajouter une note à une référence - savoir gérer ses références dans des dossiers ou avec des mots-clefs - savoir exporter une ou plusieurs références sous forme de bibliographie dans un document texte - savoir sauvegarder sa bibliothèque Zotero pour la réimporter éventuellement plus tard.
- En fonction du temps disponible, choisir de montrer soi-même un exemple d'importation puis d'exportation de référence ou bien montrer la vidéo (3 minutes). Problème : si le son ne marche pas, il faudra commenter soi-même la vidéo. La démonstration peut se faire en deux temps : - import d'une référence d'ouvrage depuis le sudoc - depuis un document Open Office texte, écrire « citation » et montrer un ajout de note de bas de page avec lien vers l'ouvrage précédemment importé.
- Zotero récupère les données bibliographiques sur internet et les enregistre dans un format de description bibliographique (Zotero RDF). Il peut ensuite les réexporter en format texte en respectant plusieurs styles de présentation préparamétrés.
- La question de la gratuité conduit tout droit aux avantages et inconvénients de Zotero.
- L'installation de Zotero correspond à une installation classique de module complémentaire sur Firefox. Ceux qui connaissent déjà cet outil iront très vite pour l'installer, tandis que d'autres peuvent être un peu déboussolés par cette interface qu'il ne connaissent pas du tout (surtout s'ils ont l'habitude de travailler avec Explorer).
- Cette étape permet de vérifier que les stagiaires connaissent le Sudoc et sinon, de le leur faire découvrir. Ne pas hésiter si le catalogue leur est totalement inconnu à faire un petit apparté sur le rebond « localisation » qui permet de savoir si l'ouvrage est disponible dans les bilbiothèques de l'enseignement supérieur de France... Et rappeler que depuis une requête Google Books, on peut rebondir dans Amazon mais aussi dans le Sudoc.
- Astuce : pour que vos références aillent directement dans votre dossier « Sevrage tabagique », il vous suffit de créer le dossier d'abord et de le séléctionner avant d'importer vos références. Les références sont alors automatiquement importées dans le dossier qui est déjà « ouvert » par Zotero.
- C'est la première option qui est la plus intéressante, à condition d'avoir la place sur son disque dur ou sa clef USB de stocker une copie de ces fichiers;
- Rappel : si aucune icône n'apparaît, il faut alors entrer manuellement la notice ou bien importer la page web en se servant de la barre d'outil. ___________________________________ Dans le cas d'un titre de chapitre , il faut télécharger la référence du livre, puis changer ensuite le type de notice dans le menu déroulant de l'onglet « info » pour choisir « chapitre de livre ». Puis il faudra corriger pour ajouter le titre et l'auteur du chapitre.
- Rappeler aux stagiaires qu'il faut dans tous les cas vérifier que la référence importée est bien complète (auteur, titre, date, au minimum).> sinon, la modifier.
- Présenter successivement les 3 colonnes 1) colonne de classement Classer les références dans des collections facilite le travail. Il est possible de renommer les collections, les déplacer (pour les transformer en sous-dossier). Attention, les sous-collections ne sont pas prise en compte lors de la création de bibliographie à partir du dossier parent. Ma bibliothèque contient l’ensemble des références réparties dans les collections ainsi que les références non classées. 2) Colonne de liste des références On voit dans cette colonne, en fonction du dossier sélectionné, la liste des références avec leur titre et une icône qui précise le type de référence. 3) Colonne de description d'une référence La colonne de droite propose plusieurs onglets délivrant des détails sur l’élément sélectionné dans la colonne du milieu et permettant d’y associer des informations complémentaires.
- Présentation de la barre d'outil qui se trouve au-dessus des trois colonnes.
- Il y a deux façons possibles d'organiser sa bibliothèque - par dossiers et sous-dossiers (conseillé) - par mots-clefs (marqueurs ou tags) : attention, sur de nombreux sites des mots-clefs sont importés en même temps que la notice.
- Les médecins auront normalement abordé HAL durant le cours précédent avec Catherine Bertignac.
- Astuce : cette thèse n'est pas encore référencée dans le Sudoc (elle n'a sans doute pas encore été soutenue et corrigée). Dans le cas où la thèse est présente dans le Sudoc, il vaut mieux importer la référence depuis le sudoc avant d'y ajouter le fichier pdf téléchargé dans HAL Le bouton « afficer le fichier » de gauche permet de lire le fichier dans son navigateur Firefox. Le bouton « afficher le fichier » de droite permet de voir le fichier dans son contexte / emplacement sur l'ordinateur.
- Il faudra trouver une adresse plus courte pour que l'import du document soit plus facile.
- Dans le cas du style Vancouver, l'insertion d'une référence dans un texte en cours de rédaction se fait en deux étapes 1) insertion du numéro de la référence 2) insertion, à la fin du document, de la bibliographie complète. L'étudiant est dans ce cas invité à éditer sa bibliographie seulement à la toute fin de son travail.