Télécharger en tant que PDF, PPTX
Téléchargé parAlphorm
Alphorm.com Formation Data science avec R - Prise en main des IDE
La formation se concentre sur la prise en main du logiciel R et de son environnement de développement intégré (IDE) pour des analystes statistiques dans divers domaines. Elle couvre des aspects tels que l'installation de R, la configuration, les packages, ainsi que des normes et bonnes pratiques en matière de statistiques. Le document souligne également l'importance de R dans la data science et son adoption croissante parmi les professionnels et établissements académiques.
Contenu connexe
Similaire à Alphorm.com Formation Data science avec R - Prise en main des IDE
Alphorm.com Formation Data science avec R - Prise en main des IDE
- 1. Une formation Vincent ISOZ R Priseen main des IDE
- 2. Une formation Plan Introduction 1. Installations 2.Configuration de l'environnement 3. Fichiers R 4. Packages 5. Aide Conclusion
- 3. Une formation Objectifs Découvrir lelogiciel R, sa philosophie, sa console d'exécution Découvrir certains IDE Découvrir le prototypage en Data Science et plus spécifiquement pour un de ses sous-domaine qu'est la Data Analysis
- 4. Une formation Prérequis Bonnes connaissancesde l'environnement Microsoft Windows (gestion des fichiers) et maîtrise du clavier et de la souris
- 5. Une formation Public concerné Analystestatistique numérique ou visuel dans tous les domaines possibles et imaginables (biostatistique, pharmaceutique, banque, assurance, data science, data mining, machine learning, industrie, ingénierie, chimie, text mining, science de l'information géographique, etc.).
- 6.
- 7. A vous dejouer !
- 8. Utiliser les fichiersexercices Une formation Vincent ISOZ
- 9. Une formation Plan Explications quantà l’utilisation des fichiers d’exercices et de la reproductibilité des exemples de la formation sur le long terme
- 10.
- 11.
- 12. Une formation Objectifs Découvrir lelogiciel R, sa philosophie, sa console d'exécution Découvrir certains IDE Découvrir le prototypage en Data Science et plus spécifiquement pour un de ses sous-domaine qu'est la Data Analysis
- 13. Une formation Raisons Gratuit Multiplateforme (MicrosoftWindows, Linux, Mac, iPad, iPhone) Open Source (licence GPL-2 | GPL-3 ou MIT et autres…) Langage plus intuitif que celui de SPSS et SAS 12’000 packages et d’autant plus de fonctions Excellent outil pour le prototypage Excellent pour les applications à faible volumétrie Utilisé de plus en plus dans le domaine académique Documentation standardisée Beaucoup de livres gratuits
- 14. Une formation À proposde MRO Entreprises font confiance à Microsoft Multithreaded Se place dans le cursus de certification Data Science de Microsoft Est le point d’accès de Microsoft R Server “Checkpoint” intégrés
- 15. Une formation Historique deR Créé en 1993 par Ross Ihaka et Robert Gentleman en C et Fortran à l’université d’Auckland en Nouvelle Zélande Depuis 1997, une vingtaine de développeurs forment l'équipe de développement de R (R Development Core team). Les membres de cette équipe ont les droits d'écriture sur le code source
- 16. Une formation Historique deR - suite En 2003, l'équipe de développement crée la R Foundation for Statistical Computing pour soutenir le projet R et devenir un point de contact de référence pour ceux qui veulent prendre contact avec la communauté R2,5. A ce moment, le langage compte plus de 200 bibliothèques développées par la communauté scientifique qui utilise R En 2015, plusieurs acteurs économiques importants comme IBM, Microsoft ou encore la société RStudio créent le R Consortium pour soutenir la communauté R et financer des projets autour de ce langage
- 17. Une formation Autres applications Ingénieriefinancière Biostatistique/Bioinformatique Calcul actuariel Statistiques Industrielles Analyse sensorielle Ingénierie de la qualité Management Quantitatif Business Process Analysis Logistique Etc.
- 18.
- 19. Une formation Prérequis Bonnes connaissancesde l'environnement Microsoft Windows (gestion des fichiers) et maîtrise du clavier et de la souris
- 20. Une formation Plan Découvrir quelquesnormes statistiques majeures que tout chercheur, scientifique ou ingénieur se doit de respecter
- 21. Une formation Normes 1/6 ISO31:2006 Système international d'unités ISO 3534-1:1999 Vocabulaire et symboles des statistiques ISO 2602:1980 Interprétation statistique de résultats d'essais - Estimation de la moyenne - Intervalle de confiance ISO 3301:1975 Interprétation statistique des données - Comparaison de deux moyennes dans le cas d'observations appariées
- 22. Une formation Normes 2/6 ISO5479:1997 Interprétation statistique des données - Tests pour les écarts à la distribution normale ISO 3494:1976 Interprétation statistique des données - Efficacité des tests portant sur des moyennes et des variances ISO 11453:1996 Interprétation statistique des données - Tests et intervalles de confiance portant sur les proportions
- 23. Une formation Normes 3/6 ISO16269-4:2010 Interprétation statistique des données - Détection et traitement des valeurs aberrantes ISO 16269-6:2005 Interprétation statistique des données - Détermination des intervalles statistiques de tolérance ISO 16269-8:2004 Interprétation statistique des données - Détermination des intervalles de prédiction
- 24. Une formation Normes 4/6 ISO/TR18532:2009 Lignes directrices pour l'application des méthodes statistiques à la qualité et à la normalisation industrielle ISO 3534-3:1999 Plans d'expérience (ou AFNOR NF X 06-080 + NF X 06- 081) ISO 8285:1991 Cartes de contrôle de Shewhart
- 25. Une formation Normes 5/6 ISO17025:2005 Exigences générales concernant la compétence des laboratoires d'étalonnages et d'essais ISO 10017:2003 Lignes directrices pour les techniques statistiques relatives à l'ISO 9001:2000 ISO 13300:2006 Guide général à l'attention du personnel des laboratoires d'analyse sensorielle ISO 31010:2009 Techniques d'évaluations des risques
- 26. Une formation Public concerné Analystestatistique numérique ou visuel dans tous les domaines possibles et imaginables (biostatistique, pharmaceutique, banque, assurance, data science, data mining, machine learning, industrie, ingénierie, chimie, text mining, science de l'information géographique, etc.).
- 27. Une formation Final Guidancefor Industry and FDA Staff, January 11, 2002: “The device manufacturer is responsible for ensuring that the product development methodologies used by the off-the-shelf (OTS) software developer are appropriate and sufficient for the device manufacturer's intended use of that OTS software. For OTS software and equipment, the device manufacturer may or may not have access to the vendor's software validation documentation. If the vendor can provide information about their system requirements, software requirements, validation process, and the results of their validation, the medical device manufacturer can use that information as a beginning point for their required validation documentation.” FDA
- 28.
- 29. Installation de Rsur Microsoft Windows Une formation Vincent ISOZ
- 30. Une formation Plan Étape parétape, télécharger R pour Microsoft Windows de CRAN (Comprehensive R Archive Network) et MRAN l’installer (en comprenant les étapes!) et l’ouvrir
- 31. Une formation Remarque :R i386 vs R x64
- 32. Une formation Remarque :Anglais Toute la documentation technique est en anglais, il en est de même des articles mathématiques et scientifiques. Les personnes ne pouvant pas lire l’anglais seront alors fortement pénalisées sur le marché de l’emploi de la Data Science.
- 33. Une formation Mises àjour N’oubliez pas de lire le change log à chaque mise à jour (idem pour les packages critiques) surtout si vous travaillez dans des domaines sensibles (nucléaire, pharma, banque, etc.) https://cran.r-project.org/doc/manuals/r- release/NEWS.html
- 34.
- 35. Installation de R surScientific Linux Une formation Vincent ISOZ
- 36. Une formation Plan Étape parétape, télécharger R et MRO pour Scientific Linux, l’installer (en comprenant les étapes!) et l’ouvrir
- 37.
- 38.
- 39. Une formation Plan Étape parétape, télécharger R Studio pour Microsoft Windows et Scientific Linux, l’installer (en comprenant les étapes!) et l’ouvrir
- 40.
- 41. Installation de Microsoft VisualStudio Community sur Microsoft Windows Une formation Vincent ISOZ
- 42. Une formation Plan Étape parétape, télécharger Visual Studio Community pour Microsoft Windows, l’installer (en comprenant les étapes!), le configurer pour R.
- 43.
- 44. Installation de Ret R Studio pour Mac OS Une formation Vincent ISOZ
- 45. Une formation Plan Étape parétape, télécharger R et R Studio pour Mac OS, l’installer (en comprenant les étapes!) et le tester
- 46.
- 47. IDE en ligne(sur Internet) Une formation Vincent ISOZ
- 48. Une formation Plan Découvrir quelquesIDE en ligne (sur Internet) au cas où R ne peut être installé et que les analyses à exécuter sont simples.
- 49.
- 50.
- 51. A vous dejouer !
- 52. Une formation Plan Nous allonsvoir différentes façons d’ouvrir R et de fermer ce dernier dans le cadre uniquement de l’environnement Microsoft Windows (et de sa console de base)
- 53.
- 54. Changer la langue del’interface Une formation Vincent ISOZ
- 55. Une formation Plan Nous allonsvoir comment changer la langue de l’interface de l’IDE native de R, ce qui s’avère souvent utile dans les multinationales
- 56.
- 57. Arrangement des fenêtres Uneformation Vincent ISOZ
- 58. Utiliser les fichiersexercices Une formation Vincent ISOZ
- 59.
- 60.
- 61. Une formation Plan Changer lapolice de la console R et de script Cela intéressera surtout les professeurs ou formateurs en entreprise qui doivent afficher R sur une rétroprojecteur
- 62.
- 63. Changer le dossierde travail par défaut Une formation Vincent ISOZ
- 64. Une formation Plan Changer temporairementou définitivement le dossier de travail par défaut de R, ce qui est utile aussi bien pour exécuter des scripts plus facilement que d’importer des données plus rapidement!
- 65. Une formation Plan Explications quantà l’utilisation des fichiers d’exercices et de la reproductibilité des exemples de la formation sur le long terme
- 66. Obtenir des informations système Uneformation Vincent ISOZ
- 67. Une formation Plan Obtenir desinformations système comme la version de R, le système d’exploitation, la langue du système, la date et l’heure, la mémoire vive, etc. Ceci étant très utile lors du développement d’applications commercialisées ou déployées au sein de certaines entreprises
- 68.
- 69. Définir le nombre dedécimales Une formation Vincent ISOZ
- 70. Une formation Plan Nous allonsvoir ici comment définir le nombre de décimales que nous voudrons lors de l’affichage des résultats de calculs et statistiques de la majorité des packages
- 71. Une formation Remarque :p-value
- 72.
- 73. Largeur des outputde la console Une formation Vincent ISOZ
- 74.
- 75.
- 76. Ajouter des commentaires Uneformation Vincent ISOZ
- 77. Une formation Plan Nous allonsvoir ici comment utiliser les commentaires seuls sur une ligne ou en fin de ligne de commande
- 78.
- 79. Écrire des commandessur une ou plusieurs lignes Une formation Vincent ISOZ
- 80. Une formation Plan Ecrire plusieurspetites commandes sur une seule ligne Ecrire des commandes R relativement longues sur plusieurs lignes Comprendre les règles y relatives
- 81.
- 82. Utiliser l’historique des commandes Uneformation Vincent ISOZ
- 83. Une formation Plan Utiliser simplementl’historique des commandes de R
- 84.
- 85. Techniques de Copier/Coller Uneformation Vincent ISOZ
- 86. Une formation Plan Utiliser lecopier/coller dans la console R tout en découvrant une méthode très utile dans de nombreuses situations
- 87.
- 88. Sauvegarder le contenude la console dans un fichier *.txt Une formation Vincent ISOZ
- 89. Une formation Plan Sauvegarder lecontenu de la console R dans un fichier texte pour usage ultérieur dans un logiciel de traitement de texte ou pour transmette à une personne ne possédant pas R
- 90.
- 91. Une formation Plan Explications quantau choix d’utiliser R pour cette formation
- 92. Une formation Plan Sauvegarder unscript, le rouvrir et voir s’il est éditable avec un bloc-notes A quoi sert l’option « Sourcer du code R »
- 93.
- 94. Fichiers de données*.Rdata ou *.rda Une formation Vincent ISOZ
- 95. Une formation Plan Sauvegarder desvariables ou jeux de données dans des fichiers spécifiques à R et qui sont les formats binaires et compressés (Gzip) *.Rdata (ou *.rda)
- 96.
- 97. Fichiers de configuration .Rprofileet Rconsole Une formation Vincent ISOZ
- 98. Une formation Plan Utiliser unfichier .Rprofile et Rconsole pour changer un certain nombre de paramètres de R à chaque démarrage de ce dernier. Changer le chemin du fichier .Rprofile avec la commande SETX R_PROFILE_USER "C:/.../.Rprofile" et vérifier avec Sys.getenv("R_PROFILE_USER")
- 99.
- 100. Imprimer la console,un script ou un graphique Une formation Vincent ISOZ
- 101. Une formation Raisons Gratuit Multiplateforme (MicrosoftWindows, Linux, Mac, iPad, iPhone) Open Source (licence GPL-2 | GPL-3 ou MIT et autres…) Langage plus intuitif que celui de SPSS et SAS 12’000 packages et d’autant plus de fonctions Excellent outil pour le prototypage Excellent pour les applications à faible volumétrie Utilisé de plus en plus dans le domaine académique Documentation standardisée Beaucoup de livres gratuits
- 102. Une formation Raisons Gratuit Multiplateforme (MicrosoftWindows, Linux, Mac, iPad, iPhone) Open Source (licence GPL-2 | GPL-3 ou MIT et autres…) Langage plus intuitif que celui de SPSS et SAS 12’000 packages et d’autant plus de fonctions Excellent outil pour le prototypage Excellent pour les applications à faible volumétrie Utilisé de plus en plus dans le domaine académique Documentation standardisée Beaucoup de livres gratuits
- 103.
- 104. Qu’est-ce qu’un package? Uneformation Vincent ISOZ
- 105. Une formation Plan L’utilité despackages, leurs avantages, désavantages, risques, maintenance, bonne pratiques, etc.
- 106.
- 107. Une formation Bonnes pratiqueset pièges Support Obsolescence (et reproductibilité) Compatibilité Bugs Garantie
- 108.
- 109. Définir le dossier d’installationdes packages Une formation Vincent ISOZ
- 110. Une formation À proposde MRO Entreprises font confiance à Microsoft Multithreaded Se place dans le cursus de certification Data Science de Microsoft Est le point d’accès de Microsoft R Server “Checkpoint” intégrés
- 111.
- 112. Installer, charger etciter un package d’un dépôt CRAN Une formation Vincent ISOZ
- 113. Une formation Plan Obtenir laliste des packages installés Installer un package d’un dépôt CRAN Installer plusieurs packages d’un coup Charger un package simplement ou en “silencieux” Charger plusieurs packages simultanément Comment citer un package
- 114.
- 115. Installer un packageen local Une formation Vincent ISOZ
- 116. Une formation Plan Installer etbien évidemment charger un package qui est en local ce qui est très utile pour certains packages qui ne sont plus disponibles sur CRAN mais stockés sur des sites universitaires ou autres (blogs, etc.).
- 117. Une formation Conseil Faites toujoursune copie en local d’un package se trouvant sur l’Internet car beaucoup de sites Internet/Blogs disparaissent après 4 à 10 ans
- 118.
- 119. Une formation Historique deR Créé en 1993 par Ross Ihaka et Robert Gentleman en C et Fortran à l’université d’Auckland en Nouvelle Zélande Depuis 1997, une vingtaine de développeurs forment l'équipe de développement de R (R Development Core team). Les membres de cette équipe ont les droits d'écriture sur le code source
- 120. Une formation Plan Installer depuisGitHub ce qui est un cas de plus en plus courant depuis 2015
- 121. Une formation Conseil Faites toujoursune copie en local d’un package se trouvant sur GitHub même si à ce jour je n’ai pas vu de package disparaître de ce site… on est jamais assez prudent!
- 122.
- 123. Désinstaller un package Uneformation Vincent ISOZ
- 124. Une formation Plan Désinstaller unpackage simplement en supprimant son dossier ou en utilisant une commande
- 125.
- 126. Backuper les packages Uneformation Vincent ISOZ
- 127. Une formation Plan Backuper ledossier contenant tous vos packages
- 128. Une formation Historique deR - suite En 2003, l'équipe de développement crée la R Foundation for Statistical Computing pour soutenir le projet R et devenir un point de contact de référence pour ceux qui veulent prendre contact avec la communauté R2,5. A ce moment, le langage compte plus de 200 bibliothèques développées par la communauté scientifique qui utilise R En 2015, plusieurs acteurs économiques importants comme IBM, Microsoft ou encore la société RStudio créent le R Consortium pour soutenir la communauté R et financer des projets autour de ce langage
- 129. Mettre à jourun ou tous les packages Une formation Vincent ISOZ
- 130. Une formation Plan Mettre àjour UN ou TOUS les packages
- 131. Une formation Remarque! Les misesà jour peuvent parfois rendre des packages incompatibles ou buggés. Effectuez donc toujours un backup de vos packages avant de faire une mise à jour (ou faites les mises à jour seulement si cela s’avère absolument indispensable!).
- 132.
- 133. Obtenir la versiond’un ou des packages Une formation Vincent ISOZ
- 134. Une formation Plan Obtenir lenuméro de version de tous les packages installés ou d’un package en particulier
- 135. Une formation Autres applications Ingénieriefinancière Biostatistique/Bioinformatique Calcul actuariel Statistiques Industrielles Analyse sensorielle Ingénierie de la qualité Management Quantitatif Business Process Analysis Logistique Etc.
- 136. Accès à l’aidegénérale Une formation Vincent ISOZ
- 137. Une formation Plan Consulter laliste des raccourcis claviers (question récurrente dans les formations), l’aide générale (manuels, aide de fonction, etc.), les pages web connexes, etc.
- 138.
- 139. Obtenir l’aide d’unpackage Une formation Vincent ISOZ
- 140. Une formation Plan Accéder àl’aide et à la fiche technique d’un package ainsi que la liste et le contact des auteurs
- 141.
- 142. Afficher l’aide d’unefonction Une formation Vincent ISOZ
- 143. Une formation Plan Accéder àl’aide d’une fonction particulière d’un package particulier!
- 144.
- 145.
- 146.
- 147.
- 148. Conclusion et perspectives Uneformation Vincent ISOZ
- 149. Une formation Bilan Prise enmain des éléments fondamentaux de l’outil de travail (son IDE) et quelques éléments de culture générale d’utilisation et relativement aux statistiques
- 150.
- 151.