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Medline 2.0
     Les alternatives à PubMed
Journée d’étude ADBS « Santé 2.0 » à Lyon, le 29 mars 2012


                 François Boutin
  Enseignant d’informatique à l’Université Montpellier 1

       Concepteur et réalisateur du site BibliMed :
       www.biblimed.fr       contact@biblimed.fr
2
Medline : Base de données bibliographique
    19 millions de références d’articles
                        en sciences de la vie et biomédecine
                  700 000 nouvelles références chaque année




 5 600 revues indexées par les descripteurs MeSH + qualificatifs
                                                     Medical Subject Headings
              Revues sélectionnées par la NLM
3
PubMed : Interface de recherche experte

                      1 milliard de
                   recherches par an


       Accès gratuit, offert par la NLM


Richesse des fonctionnalités
   – Descripteurs MeSH + qualificatifs
   – Filtres, historique, liens éditeurs…


 Mais interface trop complexe
    pour des non spécialistes
                                            Arborescence MeSH
4
Google Scholar : La « fausse » alternative




  Points forts                    Points faibles
  Recherche simple           Pas de MeSH – filtres limités
  « à la Google »       Critères flous d’affichage des résultats
  Liens « entrant »   Liste des ressources? Qualité hétérogène…


Très populaire, bien que fonctionnalités limitées
5
             PubMed




                                 Quelles alternatives ?
Richesse des fonctionnalités 




                                                 Pour quoi faire ?



                                                                Google Scholar
                                  Simplicité de l’interface 
6
Tout est affaire d’usage… et d’attentes

             Les attentes des utilisateurs 2.0


                « un outil facile à prendre en main »
                   « un accès direct aux articles »

              « les mots clés et experts du domaine »
       « une réponse directe à la demande d’info médicale »

                      « une aide à la recherche »
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7
PubGet : Recherche rapide
       Téléchargement direct des PDF
         – Gestion des droits d’accès
         – 1 million d’utilisateurs, 400 institutions

       Par contre…
         – Peu d’outils pour affiner la recherche
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8
              HubMed : Recherche simple
FullText
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9
             PubMed




                                 Compromis entre…
Richesse des fonctionnalités 




                                       richesse et simplicité


                                                HubMed


                                                            PubGet

                                                                     Google Scholar
                                    Simplicité de l’interface 
10




Doit-on nécessairement choisir entre
richesse d’interface et simplicité ?

            Présentation de solutions innovantes


                     Voir aussi le blog d’Hervé Basset :
http://scienceintelligence.wordpress.com/2011/04/27/how-many-medline-platforms-on-the-web/
11
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Interface agréable
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       Mais…
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12
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 Interface riche, mais impossible d’affiner la recherche avec des qualificatifs

D’autres outils
13
    GoPubMed : Une interface très riche




Interface pour   experts
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 Exploration fastidieuse     Ontologie : Arbre   Statistiques
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14
          BibliMed : Simplicité et efficacité
                                     Suggestions pour le terme « carie »
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15
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Richesse des fonctionnalités 




                                                                  BibliMed

                                                   NextBio

                                                        Quertle




                                             HubMed


                                                             PubGet

                                                                      Google Scholar
                                 Simplicité de l’interface 
16
 Qu’est-ce que le Web 2.0 a changé ?
                         Simplicité d’utilisation
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répondant aux attentes        fortes des usagers 2.0
            François Boutin, contact@biblimed.fr

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Medline 2.0 : les alternatives à PubMed

  • 1. Medline 2.0 Les alternatives à PubMed Journée d’étude ADBS « Santé 2.0 » à Lyon, le 29 mars 2012 François Boutin Enseignant d’informatique à l’Université Montpellier 1 Concepteur et réalisateur du site BibliMed : www.biblimed.fr contact@biblimed.fr
  • 2. 2 Medline : Base de données bibliographique 19 millions de références d’articles en sciences de la vie et biomédecine 700 000 nouvelles références chaque année 5 600 revues indexées par les descripteurs MeSH + qualificatifs Medical Subject Headings Revues sélectionnées par la NLM
  • 3. 3 PubMed : Interface de recherche experte 1 milliard de recherches par an Accès gratuit, offert par la NLM Richesse des fonctionnalités – Descripteurs MeSH + qualificatifs – Filtres, historique, liens éditeurs…  Mais interface trop complexe pour des non spécialistes Arborescence MeSH
  • 4. 4 Google Scholar : La « fausse » alternative Points forts Points faibles Recherche simple Pas de MeSH – filtres limités « à la Google » Critères flous d’affichage des résultats Liens « entrant » Liste des ressources? Qualité hétérogène… Très populaire, bien que fonctionnalités limitées
  • 5. 5 PubMed Quelles alternatives ? Richesse des fonctionnalités  Pour quoi faire ? Google Scholar Simplicité de l’interface 
  • 6. 6 Tout est affaire d’usage… et d’attentes Les attentes des utilisateurs 2.0 « un outil facile à prendre en main » « un accès direct aux articles » « les mots clés et experts du domaine » « une réponse directe à la demande d’info médicale » « une aide à la recherche » « une interface riche et conviviale »
  • 7. 7 PubGet : Recherche rapide Téléchargement direct des PDF – Gestion des droits d’accès – 1 million d’utilisateurs, 400 institutions Par contre… – Peu d’outils pour affiner la recherche – Faible utilisation des méta données
  • 8. 8 HubMed : Recherche simple FullText Clipboard Export Fonctionnalités de base – Full Text, Related – Export, Clipboard Related Graph Tag
  • 9. 9 PubMed Compromis entre… Richesse des fonctionnalités  richesse et simplicité HubMed PubGet Google Scholar Simplicité de l’interface 
  • 10. 10 Doit-on nécessairement choisir entre richesse d’interface et simplicité ? Présentation de solutions innovantes Voir aussi le blog d’Hervé Basset : http://scienceintelligence.wordpress.com/2011/04/27/how-many-medline-platforms-on-the-web/
  • 11. 11 Quertle : Relations entre concepts Interface agréable Recherche sémantique Mais… Pas de suggestions MeSH … ni de recherche itérative
  • 12. 12 NextBio : Recherche itérative Liste de filtres Nuage de tags contextuels  Interface riche, mais impossible d’affiner la recherche avec des qualificatifs D’autres outils
  • 13. 13 GoPubMed : Une interface très riche Interface pour experts Outil puissant de veille Mais… Qualificatifs non gérés Exploration fastidieuse Ontologie : Arbre Statistiques de l’ontologie de connaissances
  • 14. 14 BibliMed : Simplicité et efficacité Suggestions pour le terme « carie » Articles + Livres Suggestions : français / anglais Descripteurs MeSH + qualificatifs Filtres contextuels cliniques, génétiques, type de publication … puis résultats associés Historique pratique Zotero, Mendeley… Tout en 1 clic
  • 15. 15 PubMed GoPubMed Richesse des fonctionnalités  BibliMed NextBio Quertle HubMed PubGet Google Scholar Simplicité de l’interface 
  • 16. 16 Qu’est-ce que le Web 2.0 a changé ? Simplicité d’utilisation Richesse des fonctionnalités Affichage de contenus contextuels Recherche itérative facilitée Usager au cœur du processus de recherche Contenu enrichi  Nécessité de nouvelles interfaces Medline répondant aux attentes fortes des usagers 2.0 François Boutin, contact@biblimed.fr