Dans le cadre d’un accompagnement pour la création des dérivations de cours d’eau, afin d’effectuer un griffage des berges, dans le but de sauvegarder les amphibiens, les reptiles et les micromammifères qui pourraient être présents, des individus de Sonneur à ventre jaune ont été découverts sur deux sites du Sud Charente en 2013.
Toutefois cette espèce n’avait pas été identifiée comme espèce impactée lors de l’état initial, sa présence n’ayant pas été détectée sur ces sites à l’époque des arrêtés inter-préfectoraux. Le Sonneur à ventre jaune est une espèce assez discrète, qui présente une biologie et une écologie assez particulière pour un amphibien, préférant des habitats aquatiques de type pionniers et ayant une capacité de dispersion très limitée.
Ce suivi s’inscrit dans ce contexte règlementaire et vise plusieurs objectifs :
- Définir les stations potentielles et leur fonctionnalité ;
- Evaluer les effectifs présents et la connexion entre les différentes populations ;
- Proposer des actions d'ajustement en cas de dysfonctionnement ;
- Evaluer ainsi l'efficacité des mesures de réduction d'impact et de compensation mises en oeuvre ;
- Evaluer l'incidence de la LGV SEA sur une éventuelle fragmentation des noyaux de population.
Afin de répondre à ces objectifs, un protocole d’inventaire du Sonneur à ventre jaune est mis en oeuvre, basé sur les différentes études précédemment effectuées en Charente et dans diverses régions.
Ce rapport retrace les résultats de la troisième année de suivi de cette espèce sur les deux sites ciblés.
Suivi Transparence mammifères semi-aquatiques - 2017 - GREGE
Suivi Sonneur à ventre jaune - 2017 - PCN
1. 14 rue Jean Moulin
86240 Fontaine-le-Comte
05 49 88 99 23
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Rapport réalisé pour le compte de :
LGV SEA TOURS-BORDEAUX
Suivi 2017 des stations de
Sonneurs à ventre jaune dans le
cadre de la LGV SEA
Résultats 2017 (3ème
année de suivi) – Cressac-Saint-
Genis et Poullignac (16)
2.
3. CR Suivi 2017 – Suivi des stations de Sonneurs à ventre jaune – Avril 2018
Poitou-Charentes Nature 1
Suivi 2017 des stations de Sonneurs à
ventre jaune dans le cadre de la LGV SEA
Résultats 2017 (3ème
année de suivi) – Cressac-Saint-
Genis et Poullignac (16)
Type de rapport :
Compte-rendu 2017
Associations intervenantes Experts intervenants Autres intervenants
Charente Nature
Tiphanie HERCÉ
Elodie BOUSSIQUAULT
Anthony LE NOZAHIC
Sylvain DOUSSINE
Coordinateur PCN Version du document
Moea LARTIGAU V3
Destinataires Date d’envoi
Marion Gouraud (LISEA)
Thierry CHARLEMAGNE (LISEA)
V1 le 22/03/2018
V2 le 06/04/2018
V3 le 10/04/2018
4. CR Suivi 2017 – Suivi des stations de Sonneurs à ventre jaune – Avril 2018
2 Poitou-Charentes Nature
Sommaire
1. Contexte de l’étude ............................................................................................. 4
2. Sonneur à ventre jaune (Bombina variegata)...................................................... 5
2.1. Description générale..................................................................................................... 5
2.2. Répartition................................................................................................................... 6
2.3. Habitats....................................................................................................................... 8
2.3.1. Habitat aquatique .........................................................................................................8
2.3.2. Habitat terrestre ...........................................................................................................8
2.4. Biologie - Écologie ........................................................................................................ 9
2.5. Statut de protection.................................................................................................... 10
3. Stations............................................................................................................. 11
3.1. Secteur de la Grande Eau à Cressac-Saint-Genis ........................................................... 13
3.2. Secteur de la Gorre à Poullignac .................................................................................. 16
4. Matériel et méthode .......................................................................................... 20
4.1. Rappel des objectifs ................................................................................................... 20
4.2. Questionnements abordés........................................................................................... 20
4.3. Suivi de populations ................................................................................................... 20
4.4. Etude de la dynamique des populations........................................................................ 21
5. Résultats et interprétation ................................................................................ 22
5.1. Caractérisation des stations......................................................................................... 22
5.1.1. Secteur de Cressac-Saint-Genis ....................................................................................22
5.1.2. Secteur de Poullignac ..................................................................................................25
5.2. Capture Marquage Recapture (CMR) de Cressac-St-Genis .............................................. 28
5.3. Prospections sur Poullignac ......................................................................................... 33
6. Menaces et préconisations ................................................................................ 34
7. Synthèse générale............................................................................................. 40
Bibliographie ............................................................................................................ 42
5. CR Suivi 2017 – Suivi des stations de Sonneurs à ventre jaune – Avril 2018
Poitou-Charentes Nature 3
Annexes.................................................................................................................... 43
6. CR Suivi 2017 – Suivi des stations de Sonneurs à ventre jaune – Avril 2018
4 Poitou-Charentes Nature
Suivi 2017 des stations de Sonneurs à
ventre jaune dans le cadre de la LGV SEA
Résultats 2017 (3ème année) – Cressac-Saint-Genis et Poullignac (16)
1. Contexte de l’étude
Dans le cadre d’un accompagnement pour la création des dérivations de cours d’eau (article 11 de l’arrêté inter-
préfectoral complémentaire du 21 décembre 2012), afin d’effectuer un griffage des berges, dans le but de
sauvegarder les amphibiens, les reptiles et les micromammifères qui pourraient être présents, des individus de
Sonneur à ventre jaune ont été découverts sur deux sites du Sud Charente en 2013 (cf. Annexe 2).
Toutefois cette espèce n’avait pas été identifiée comme espèce impactée lors de l’état initial, sa présence
n’ayant pas été détectée sur ces sites à l’époque des arrêtés inter-préfectoraux. Le Sonneur à ventre jaune est
une espèce assez discrète, qui présente une biologie et une écologie assez particulière pour un amphibien,
préférant des habitats aquatiques de type pionniers et ayant une capacité de dispersion très limitée (entre 200
m et 3 km).
Dans le cadre de la construction de la LGV SEA Tours-Bordeaux, et en application des arrêtés ministériels et
inter-préfectoraux des 24 février et 21 décembre 2012, portant dérogation à l’interdiction de destruction
d’espèces et d’habitats d’espèces animales protégées et de destruction d’espèces végétales protégées, le maître
d’ouvrage est tenu d’assurer le suivi de mesures environnementales mises en œuvre, ainsi que le suivi des
populations et des habitats d’espèces protégées impactées.
Ce suivi s’inscrit dans ce contexte règlementaire et vise plusieurs objectifs :
- Définir les stations potentielles et leur fonctionnalité ;
- Evaluer les effectifs présents et la connexion entre les différentes populations ;
- Proposer des actions d'ajustement en cas de dysfonctionnement ;
- Evaluer ainsi l'efficacité des mesures de réduction d'impact et de compensation mises en œuvre ;
- Evaluer l'incidence de la LGV SEA sur une éventuelle fragmentation des noyaux de population.
Afin de répondre à ces objectifs, un protocole d’inventaire du Sonneur à ventre jaune est mis en œuvre, basé
sur les différentes études précédemment effectuées en Charente et dans diverses régions.
Ce rapport retrace les résultats de la troisième année de suivi de cette espèce sur les deux sites ciblés.
8. CR Suivi 2017 – Suivi des stations de Sonneurs à ventre jaune – Avril 2018
6 Poitou-Charentes Nature
2.2. Répartition
En Europe, il est représenté par 3 sous-espèces : B.v. scabra (sud des Balkans), B.v. kolombatovici (Dalmatie)
et la sous-espèce nominale B.v. variegata (de la France aux Carpates), ce qui représente l’aire de répartition la
plus étendue des trois sous-espèces. Seule cette dernière est présente en France. B.v. pachypus (sud de l'Italie,
Sicile) a été élevée au rang d’espèce par Lanza et Vanni (1991). Toutefois, des études génétiques plus récentes
montrent que B. v. pachypus est finalement très proche de B. v. variegata et qu’il n’est peut-être pas justifié de
l’élever au rang d’espèce (Hofman et al., 2007).
Dans notre pays, l'espèce trouve sa limite de répartition septentrionale en Argonne ardennaise (Grangé, 1989),
elle est assez répandue dans l’Est et dans le Limousin. Partout ailleurs, les populations sont plus dispersées et
plus particulièrement en limite d’aire de répartition (Pichenot, 2008 et Chemin, 2010)). Rare en Poitou-
Charentes, ce petit crapaud se trouve ici à la limite Ouest de son aire de répartition (Carte 1).
Depuis le début des années 1990, de nombreuses stations de Sonneur à ventre jaune ont été découvertes en
Charente. La majorité d'entre-elles sont constituées de petites populations, souvent de moins de 10 individus.
Néanmoins, certaines peuvent atteindre plus de 40 individus (Précigout, com. pers.). La répartition de l'espèce
était localisée il y a encore quelques années sur la moitié Est du département, limitée à l'Ouest par une ligne
Confolens - Barbezieux. De nouvelles découvertes de stations ont fait évaluer la répartition de l’espèce sur le
département, avec une présence plus importante dans le Sud-Ouest de la Charente. Le bocage du Confolentais
et du Montbronais hébergent la majorité des stations connues, les autres étant réparties dans les massifs boisés
du Sud Charente (massif forestier de Saint-Romain notamment).
Carte 1 : Répartition nationale du Sonneur à ventre à jaune (source : SHF & SPN)
9. CR Suivi 2017 – Suivi des stations de Sonneurs à ventre jaune – Avril 2018
Poitou-Charentes Nature 7
Carte 2 : Carte de chaleur des données charentaises du Sonneur à ventre jaune
14. CR Suivi 2017 – Suivi des stations de Sonneurs à ventre jaune – Avril 2018
12 Poitou-Charentes Nature
Carte 3 : Localisation des stations impactées par la ligne et des données de sonneurs
Station de Cressac
Station de Poullignac
Station du Bois de la
Croix
15. CR Suivi 2017 – Suivi des stations de Sonneurs à ventre jaune – Avril 2018
Poitou-Charentes Nature 13
3.1. Secteur de la Grande Eau à Cressac-Saint-Genis
Carte 4 : Secteur de la Grande Eau à Cressac-Saint-Genis
16. CR Suivi 2017 – Suivi des stations de Sonneurs à ventre jaune – Avril 2018
14 Poitou-Charentes Nature
Carte 5 : Habitats recensés sur le secteur de Cresssac-St-Genis
18. CR Suivi 2017 – Suivi des stations de Sonneurs à ventre jaune – Avril 2018
16 Poitou-Charentes Nature
3.2. Secteur de la Gorre à Poullignac
Carte 6 : Périmètre d’étude rapproché de la Gorre à Poullignac de 2015
19. CR Suivi 2017 – Suivi des stations de Sonneurs à ventre jaune – Avril 2018
Poitou-Charentes Nature 17
Carte 7 : Habitats recensés sur le secteur de Poullignac
21. CR Suivi 2017 – Suivi des stations de Sonneurs à ventre jaune – Avril 2018
Poitou-Charentes Nature 19
Carte 8 : Secteur de la Gorre à Poullignac en 2016 et 2017
22. CR Suivi 2017 – Suivi des stations de Sonneurs à ventre jaune – Avril 2018
20 Poitou-Charentes Nature
4. Matériel et méthode
4.1. Rappel des objectifs
Les objectifs du présent suivi sont les suivants :
- Identifier les sites occupés par l'espèce (domaines vitaux) ;
- Mesurer l'évolution des populations des sites concernés (quantification des effectifs) ;
- Evaluer si possible l'efficacité des mesures de réduction d'impact et de compensation mises en œuvre ;
- Evaluer l'incidence de la LGV SEA sur une éventuelle fragmentation des noyaux de population.
4.2. Questionnements abordés
Pour évaluer la présence de cette espèce, il est prévu d’effectuer une recherche des zones de reproduction
fréquentées par le sonneur et de suivre les populations identifiées.
Le suivi annuel proposé sur ces deux stations, couplé à l’étude de la dynamique des populations, devrait
permettre d’apporter des éléments de réponse aux questions suivantes :
→ Où sont localisées les stations de Sonneur à ventre jaune sur les sites ?
→ Quels sont les effectifs de Sonneur à ventre jaune sur les sites ?
→ Quels sont les milieux fréquentés par cette espèce sur les sites ?
→ Comment les individus (mâles, femelles et jeunes) occupent les différentes structures spatiales des
sites (mares, fossés, ornières…) ?
→ Comment les individus exploitent les connectivités du site (dynamique de déplacement entre les
différentes structures spatiales) ?
→ Les mesures de réduction d'impact et de compensation mises en œuvre sont-elles efficaces ?
→ Suite à la création de la LGV SEA sur ces sites à sonneurs, est-il constaté une fragmentation des
noyaux de population ?
Un suivi des populations et une étude sur la dynamique des populations permettront, à moyen terme, d’établir
des relations au cours des ans, et de conclure sur l’évolution des populations, notamment sur la capacité
dispersive de l’espèce, le taux de survie, le sex-ratio et, si possible, dans le cadre des mesures compensatoires
par exemple, de prévoir des aménagements en fonction des menaces qui pèsent sur les populations ciblées.
4.3. Suivi de populations
Le Sonneur à ventre jaune a la particularité de posséder des ornementations ventrales qui sont propres à
chaque individu. Pour cette raison, la méthode de CMR (Capture Marquage Recapture) permet la
reconnaissance individuelle et le suivi dans le temps grâce à la photographie des faces ventrales. Cette
méthode présente l’avantage indiscutable d’éviter aux individus capturés tout stress lié à des techniques de
marquage (amputation locale, injection de puce électronique…) et de réaliser une véritable carte d’identité
individuelle.
Méthode
→ Photographie des faces ventrales de chaque sonneur afin de réaliser un catalogue répertoriant tous les
individus capturés sur le site ;
→ Période : dès le début de la période de reproduction (avril) jusqu’au mois d’août ;
23. CR Suivi 2017 – Suivi des stations de Sonneurs à ventre jaune – Avril 2018
Poitou-Charentes Nature 21
→ Fréquence : Prospections régulières en fonction des conditions météorologiques et donc de l’activité de
l’espèce. Mais l’idéal serait 2 passages par mois.
Matériel
→ 3 récipients : 1 type panier pour y déposer tous les individus capturés, 1 pour l’individu en cours
d’identification, 1 dernier pour mettre tous les individus identifiés avant de les relâcher ;
→ 1 filet pour attraper les individus situés au niveau des mares et des étangs ;
→ 1 fiche de terrain pour consigner les renseignements récoltés nécessaires : (identification des individus,
lieu et conditions météorologiques) ;
→ le catalogue (référentiel des individus) ;
→ 1 appareil photo avec objectif macro.
Réalisation d’un catalogue référentiel
La face ventrale de chaque individu capturé est photographiée, tenu manuellement par les pattes postérieures
tendue ou à plat dans la main. Les photos sont incorporées au fur et à mesure au catalogue. Les individus
capturés sont déterminés sexuellement, localisés et classés en fonction de leur date et lieu de capture. Un tel
catalogue permettra à l’avenir de suivre l’évolution des populations et de mesurer les déplacements éventuels
des individus, renseignant ainsi sur les capacités dispersives de l’espèce.
Identification des individus :
Une formule est associée à chaque individu, selon les critères suivants :
→ 1er
critère : mâle (M), femelle (F), jeune (J), indéterminé (I).
→ 2ème
critère : attribution d’un chiffre correspondant au nombre de tâches foncées incluses en
intégralité dans les marbrures jaunes de la face ventrale (sans prendre en compte les taches de
la gorge et des pattes).
→ 3ème
critère : préciser si les marbrures jaunes du ventre ont un lien ininterrompu avec le dessous des
cuisses et si elles forment un ensemble distinct. Dans ce cas la lettre « L » est attribuée. Si ce n’est pas
le cas les lettres « PL » sont attribuées. Exemple : M12L.
→ 4ème
critère : nombre de tâches jaunes de la partie thoracique de l’individu. Exemple : 2J.
→ 5ème
critère : nombre de tâches noires sur la gorge de l’individu. Exemple : 3G.
Toutes les captures ont été réalisées par des personnes détenant une autorisation préfectorale de
capture d’espèces protégées.
4.4. Etude de la dynamique des populations
L’objectif est d’étudier la dynamique de déplacements des sonneurs entre les différentes structures spatiales du
site, de déterminer lesquelles sont utilisées préférentiellement et de démontrer l’importance des connectivités.
Cette étude permettra également de chercher à comprendre si les individus d’une population « A »
interagissent uniquement avec les congénères de cette population, ou s’ils entretiennent des relations avec une
population « B » de proximité (Bronique, 2000).
Méthode
→ Cartographie de la répartition des structures spatiales du site (mares, fossés, ornières…).
→ Réalisation d’une matrice de flux « migratoire » entre les structures spatiales.
Cette méthode s’appuie sur les résultats obtenus précédemment (voir protocole de suivi de populations).
24. CR Suivi 2017 – Suivi des stations de Sonneurs à ventre jaune – Avril 2018
22 Poitou-Charentes Nature
5. Résultats et interprétation
5.1. Caractérisation des stations
5.1.1. Secteur de Cressac-Saint-Genis
Carte 9 : Localisation des sites à Sonneurs sur la station de Cressac-St-Genis
27. CR Suivi 2017 – Suivi des stations de Sonneurs à ventre jaune – Avril 2018
Poitou-Charentes Nature 25
5.1.2. Secteur de Poullignac
Carte 11 : Habitats humides prospectés sur le secteur de Poullignac
30. CR Suivi 2017 – Suivi des stations de Sonneurs à ventre jaune – Avril 2018
28 Poitou-Charentes Nature
5.2. Capture Marquage Recapture (CMR) de Cressac-St-Genis
Entre mai et début août 2017, 7 sorties de terrain (5 diurnes + 2 nocturnes) ont été réalisées sur la station de
Cressac-Saint-Genis avec un nombre varié d’individus capturés d’une sortie à une autre. Le nombre d’individus
capturés diffère en fonction des captures diurnes et nocturnes et des conditions climatiques. Les passages
terrain ont été adaptés aux périodes d’activités de l’espèce (jours suivant des précipitations), ce qui explique les
modifications des périodes de terrain.
Tableau 1 : Synthèse des observations de terrain 2017
En 2017, 17 captures de sonneurs ont été effectuées pour 11 individus distincts (7 femelles, 3 mâles et 1
immatures) dont 5 nouveaux individus (Tableau 2) ont été identifiés sur les prairies de Cressac, sur 3 sites
différents (S1, S3 et S4). 11 individus recensés en 2015 et 2016 n’ont pas été recapturés en 2017. Des preuves
de reproduction ont encore été observées lors de cette troisième année de suivi (2 pontes, des têtards et 1
immature). La variabilité de la capture est fonction de la météo ; comme l’année dernière, il y a eu une
importante sécheresse. Cela peut expliquer le peu d’individu capturé au mois de juin. Quelques épisodes
pluvieux ont eu lieu début juillet, ainsi un nombre plus important de sonneur a été observé. En effet, l’activité
reproductrice est synchronisée en fonction des précipitations (Pichenot, 2008). Mais aussi de la gestion de
parcelles accueillants les sites de reproduction. Comme la prairie pâturée n’est pas fauchée à des dates
adaptées, la végétation est haute et rend la capture très compliqué sur le site 3.
Figure 2 : Effectif sur la station de Cressac ces trois années de suivi
1
Individu vu mais non capturé
29/05/17 16/06/17 26/06/17 03/07/17 10/07/17 22/07/17 10/08/17
La Grande
Eau – Cressac
2M 1M 2F
2 pontes + 1J +
1F + 1
accouplement
1J + 5F +
1M
7 têtards +
1 ponte +
6F + 1M +
1 ?1
1F
31. CR Suivi 2017 – Suivi des stations de Sonneurs à ventre jaune – Avril 2018
Poitou-Charentes Nature 29
On note une variation du sex-ratio sur Cressac avec en première année, une proportion plus importante de
mâles que de femelles. Mais celui-ci semble s’inverser pour arriver en 2017 avec une dominance des captures
de femelles. Il est important de noter la présence chaque année de juvéniles capturés.
Figure 3 : Proportion de la classe d’âge/sexe sur les trois années de suivi
Figure 4 : Proportion de la classe d’âge/sexe globale
32. CR Suivi 2017 – Suivi des stations de Sonneurs à ventre jaune – Avril 2018
30 Poitou-Charentes Nature
Le site 2 n’existant plus depuis 2015, comme le site 5 qui était une zone de replis, ils ont ainsi été supprimés du
tableau de synthèse de la CMR (Tableau 2). Aucun individu n’a été recapturé dans le site 6. Les captures les
plus importantes ont donc eu lieu sur les sites 1 et 4.
Tableau 2 : Synthèse de la CMR sur la station de Cressac – 2017
Identifiant site /
Code identification individus
Site1 Site 3 Site 4 Site 6
F1L1J1G
F4PL0J2G X
F8L1J6G
J6L0J5G
M4L2J3G
M6PL1J3G
M4L2J3G-1 X
F1PL0J2G X X
M4PL0J5G X
F4L0J4G
M2L0J2G
M4L0J3G
F6PL1J4G
J3L0J2G
F3L0J4G X
J1PL1J2G
J5PL0J2G/ F5PL0J2G2
X
J4L0J0G X
F2PL0J5G X
F3L0J1G X
F4L0J1G X
M6L1J1G X
En noir : individus recensés durant ces trois années de suivies ; en bleu : nouveaux individus ; en rouge : individus recensés en
2015 et 2016 mais non recapturés en 2017.
Tout comme l’année dernière, les individus se sont peu déplacés. Les déplacements se sont seulement
cantonnés entre les sites 1 et 4 (ornières situées dans la prairie à l’Est de la LGV), qui sont très proches l’une
de l’autre. Ainsi, cette année, il n’a pas été constaté d’échange de part et d’autre de la LGV.
Toutefois, il est très intéressant de noter que sur les 8 individus capturés en 2015, 2016 et 2017 (Tableau 3), 6
sonneurs ont utilisés à minima deux sites différents depuis le début du suivi (au maximum 4 sites différents
entre 2015 et 2016). Il n’a pas été constaté de passage d’individus dans l’ouvrage d’art PRA2270 cette année.
Un individu (un mâle M4PL0J5G) capturé en 2015 mais non recontacté en 2016, a été retrouvé lors de cette
troisième session. Il reste toutefois cantonné sur les sites à l’Est de la ligne LGV.
2
Individu capturé en 2016 en tant que juvénile et recapturé en 2017 et identifié comme femelle. Donc modification de son code.
33. CR Suivi 2017 – Suivi des stations de Sonneurs à ventre jaune – Avril 2018
Poitou-Charentes Nature 31
Et comme les années précédentes, il a également été constaté, la présence d’autres espèces d’amphibiens au
sein de l’ouvrage d’art tel que le Crapaud commun et le complexe des Grenouilles vertes sp.
Tableau 3 : Suivi des individus capturés entre 2015 et 2017
Station 1 Station 2 Station 3 Station 4 Station 5 Station 6
F1L1J1G 2015
F4PL0J2G 2015 2015 2016-2017 2015
F8L1J6G 2015 2015
J6L0J5G3
M4L2J3G 2015 2015-2016
M6PL1J3G 2015-2016 2015-2016
M4L2J3G-1 2015-2016-2017 2015
F1PL0J2G 2017 2015 2016-2017
M4PL0J5G 2015 2017
F4L0J4G 2015 2015
M2L0J2G 2015-2016
M4L0J3G 2015
F6PL1J4G 2016
J3L0J2G 2016
F3L0J4G 2016-2017
J1PL1J2G 2016
F5PL0J2G 2016 2017
J4L0J0G 2017
F2PL0J5G 2017
F3L0J1G 2017
F4L0J1G 2017
M6L1J1G 2017
Le développement complet des têtards n’a pu être observé l’année dernière. Toutefois il a été recensé un
juvénile de moins de 3 cm cette année, cela pourrait laisser supposer du succès de reproduction de 2016.
Une reproduction certaine de Sonneur à ventre jaune a été observée sur le site 4 comme les années
précédentes. Des pontes et têtards ont également été observés au mois de juillet. Les reproductions tardives de
cette année n’ont pas pu permettre de suivre le développement larvaire des sonneurs car les sessions de
capture étaient terminées.
Le faible nombre de captures et recaptures ne permet pas d’aller très loin pour l’heure dans l’analyse des
données et d’estimer une taille de population ou encore un taux de capture/recapture. La poursuite du suivi les
années suivantes permettra de disposer d’un jeu de données plus important et de pouvoir ainsi répondre plus
précisément à l’ensemble des problématiques précédemment évoquées comme la réalisation d’une matrice de
3
Observation ponctuelle sur un pierrier donc hors site de reproduction
34. CR Suivi 2017 – Suivi des stations de Sonneurs à ventre jaune – Avril 2018
32 Poitou-Charentes Nature
flux « migratoire » entre les structures spatiales, la caractérisation du dynamisme de déplacement ou encore la
confirmation de la fonctionnalité de la transparence des ouvrages d’art.
Il semble toutefois que la station de Cressac présente une population de taille moyenne voire importante pour
la Charente si on la compare à d’autres stations suivies, avec des preuves de reproduction certaine (sites 1, 3 et
4). En Charente, les stations connues sont estimés entre 2-3 individus pour les plus petites et plus de 30
individus différents capturés (estimation à environ 60 individus) pour les plus importantes.
Plusieurs individus immatures ont été recensés sur la station de Cressac au cours de ces trois ans ; cela
démontre la bonne santé de la population. D’autant plus que les étés 2016 et 2017 ont été très secs, ce qui
peut avoir impacté la reproduction. En effet, les sonneurs ne se reproduisent pas systématiquement tous les
ans, notamment lorsque les pièces d’eau s’assèchent trop longtemps. De plus, lors de la pêche de sauvegarde
en 2013 sur ce même site, 6 immatures et 1 mâle adulte avaient été capturés (cf. Annexe 2).
35. CR Suivi 2017 – Suivi des stations de Sonneurs à ventre jaune – Avril 2018
Poitou-Charentes Nature 33
5.3. Prospections sur Poullignac
En juillet et août 2017, 3 sorties de terrain diurnes et 1 sortie nocturne ont été réalisées. Aucun individu de
Sonneur à ventre jaune n’a été découvert sur le secteur de Poullignac, les milieux étaient très secs du fait de la
sécheresse. Les petites stations sont d’autant plus compliquées à trouver dans ces conditions.
La station de Poullignac abritait à priori une plus petite population au départ. L’impact de la LGV SEA peut avoir
eu des conséquences sur la survie de celle-ci, puisqu’à ce jour aucun individu de sonneur n’a été contacté, sur
ces trois dernières années. L’absence de donnée lors de l’état initial LGV SEA, avant les travaux, ne peut pas
permettre de préciser la taille de la population concernée. Toutefois cette station ne ferait pas l’objet
d’exception en considérant qu’elle est a priori plus petite, car plusieurs stations en Charente abritent seulement
2-3 individus adultes, qui perdurent dans le temps et où des preuves de reproduction sont constatées chaque
année (ex : suivi des sonneurs sur la vallée de la Tardoire - Dorfiac, 2016). La zone de Poullignac a de ce fait
été élargie afin de rechercher de nouveaux sites de présence de l’espèce, à proximité des données initiales.
D’après la bibliographie, le Sonneur à ventre jaune a une capacité de déplacement limitée à 2-3 km (Thirion,
2006) ; les prospections ont donc été élargies dans un nouveau rayon de 2 km, sachant que ces ‘grands
déplacements’ sont plutôt liés à l’émancipation des jeunes. Toutefois, la capacité de déplacement des adultes,
dans un contexte perturbé, peut évoluer jusqu’à atteindre ces distances d’émancipation/colonisation (ACEMAV,
2003).
Toutes les zones humides répertoriées ont été prospectées. Des zones composées de sources, mares et prairies
sont très favorables à l’espèce. La rencontre de différents locaux lors des prospections a pu confirmer la
présence de l’espèce il y a quelques années. L’espèce n’a sans doute pas complétement disparu du secteur.
Comme cité ci-dessus, le Sonneur à ventre jaune n’avait jamais été contacté avant les travaux, cela peut
s’expliquer par une sous prospection sur ce secteur mais aussi par la discrétion de l’espèce et ces faibles
effectifs. Les populations potentiellement présentes sont sans doute très morcelées et fragiles de par les
modifications des milieux, les changements d’agricultures et les perturbations humaines.
36. CR Suivi 2017 – Suivi des stations de Sonneurs à ventre jaune – Avril 2018
34 Poitou-Charentes Nature
6. Menaces et préconisations
Les deux secteurs abritant potentiellement le Sonneur à ventre jaune n’étaient pas connus avant les travaux de
la LGV SEA (cf. Annexe 3 : Vue des secteurs suivis avant les travaux de la LGV SEA). Celle-ci a créé un effet
barrière important, qui a toutefois été limité par la présence d’ouvrages d’art permettant la circulation des
espèces (cartes 4 et 6) :
→ un ouvrage hydraulique avec aménagement de deux banquettes (PRA2270) sur la station 1 (Cressac
Saint-Genis) et 2 PPF (passage petite faune) à proximité ;
→ un ouvrage hydraulique avec aménagement de deux banquettes (PRA 2340) et 2 OHR sur la station 2
(Poullignac) ainsi qu’un PPF à proximité.
A l’issue de cette troisième année de suivi, il n’y a pas eu de nouveaux noyaux de populations découverts lors
de ce suivi. Une station a par ailleurs été découverte lors d’autres inventaires à moins de 2 km de celle de
Cressac.
La population de Cressac-Saint-Genis est toujours existante, 22 individus différents ont été capturés depuis le
début du suivi en 2015, dont 5 nouveaux individus capturés en 2017. Actuellement, cette station présente un
bon fonctionnement avec le constat de reproductions avérées depuis plus de 2 ans. Lors des deux premières
années de suivi, il était mentionné des échanges d’individus entre les stations de part et d’autre de la LGV SEA.
Cette année, a eu lieu la mise en service de la LGV SEA mais aucune perturbation directe sur les prairies n’a été
observée. Toutefois aucun échange d’individus n’a été constaté. Cela ne prouve pas qu’il n’y ait pas eu
d’échange de part et d’autre de la LGV SEA, mais il n’en demeure pas moins que ceux-ci sont de moins en
moins nombreux d’une année à l’autre. Ils étaient déjà peu observés initialement. Il est décrit dans la
bibliographie que cette espèce à une faible capacité de déplacement pendant la période de reproduction pour
changer d’un site de reproduction à un autre ; on parle de 300m au maximum, ce qui est très réduit et peut
rapidement limiter les interactions entre individus. La distance entre les sites 1-4 et 3, les plus fréquentés, est
de plus de 400m. La présence de la ligne LGV et cette distance importante peut être un frein important et
entrainera possiblement à terme à une fragmentation de la population. La station 2 (qui n’est plus existante
actuellement) présentait un fort attrait pour l’espèce, qui a très fortement répondu car colonisée rapidement ;
elle permettait de diminuer les distances de déplacement entre chaque site de reproduction. Plus récemment,
Charente Nature a pu le constater également sur un site de carrière qui a fait l’objet de mesures
d’accompagnement pour cette espèce (Inventaire communal du Sonneur à ventre jaune, Dorfiac, 2017), avec la
création de nombreux sites de reproduction dont certains ont répondus rapidement (ponte observée dès la
première année de création).
L’objectif pour améliorer les échanges génétiques et éviter le morcellement de la population, serait donc de
créer de nouveaux sites de reproduction. Cette opération semble indispensable afin de relier les deux zones
déjà utilisées pour pallier le manque d’échange et ainsi éviter le cloisonnement des individus d’un côté de la
ligne mais aussi de retrouver et/ou de se rapprocher du fonctionnement initiale de cette station. La zone
d’emprise de la LGV SEA sur ce secteur inclut des zones de prairies et d’un bras mort du cours d’eau (carte 12)
pouvant faire l’objet de mesures de restauration et gestion favorables à l’espèce. Cela a fait l’objet de
discussions avec COSEA afin d’envisager la mise en place de mesure compensatoire sur cette station ; dette
compensatoire à 2,30ha (source COSEA). Il y a de fortes potentialités sur les parcelles déjà maîtrisées mais
aussi sur celles attenantes accueillant les sites de reproduction de sonneurs comme les prairies pâturées et
fauchées (sites 1, 3 et 4). Les dates de fauche et le chargement des bovins pourraient être améliorés pour
favoriser le développement de cette station via la mise en œuvre de cahiers des charges environnementales.
Les stations 1 et 4 ne présentent pas de menace particulière, la présence des bovins étant indispensable sur ces
zones. Ce sont les piétinements de ces derniers qui créent des dépressions humides très prisées par l’espèce.
37. CR Suivi 2017 – Suivi des stations de Sonneurs à ventre jaune – Avril 2018
Poitou-Charentes Nature 35
Cette zone a donc été incluse au diagnostic écologique du site Vallée de l’Arce – site acquisition LGV SEA
(carte 11) à la demande de Charente Nature (demande validée par COSEA). Une partie des surfaces (celles
dans l’emprise) ont ainsi été officiellement ajoutées à ce site de compensation acquisition avec un objectif
prioritaire Sonneur.
D’autre part, la présence d’une station à moins de 2km est très intéressante et nécessiterait de faire des
prospections complémentaires entre et sur ce site afin d’étudier la dynamique de populations de ce secteur et
voir si des échanges existent entre ces deux stations à minima ou plus si découvertes de nouvelles stations
(nouveaux individus trouvés sur la station de Cressac, d’où viennent –ils ?, où les juvéniles partent ?).
38. CR Suivi 2017 – Suivi des stations de Sonneurs à ventre jaune – Avril 2018
36 Poitou-Charentes Nature
Carte 12 : Diagnostic écologique Vallée de l’Arce – site acquisition
Station du Bois de la
Croix trouvé en 2017
Station de Cressac
39. CR Suivi 2017 – Suivi des stations de Sonneurs à ventre jaune – Avril 2018
Poitou-Charentes Nature 37
Carte 13 : Parcelles complémentaires ajoutées au diagnostic écologique Vallée de l’Arce
40. CR Suivi 2017 – Suivi des stations de Sonneurs à ventre jaune – Avril 2018
38 Poitou-Charentes Nature
Conformément aux comptes rendus des interventions de sauvetage (Annexe 2), le site de Poullignac a bien
accueilli le Sonneur à ventre jaune à minima jusqu’en 2013. Aucun individu de Sonneur à ventre jaune n’a été
retrouvé sur le site ces trois premières années de suivi. Le site de Poullignac abritait à priori et à minima une
plus petite population que le site de Cressac. Bien que l’absence de donnée lors de l’état initial LGV SEA, avant
les travaux, ne puisse pas permettre de préciser la taille de la population concernée, cette station ne ferait pas
l’objet d’exception en considérant que plusieurs stations en Charente abritent seulement 2-3 individus adultes,
qui perdurent dans le temps et où des preuves de reproduction sont constatées chaque année (ex : suivi des
sonneurs sur la vallée de la Tardoire, Dorfiac, 2016). De nombreuses petites stations ont été identifiées sur ce
département lors de prospections antérieures. Ces stations, si petites soient-elles, sont importantes pour la
dynamique de population. Elles peuvent se développer et constituer un site réservoir pour ce secteur par le
biais de certaines actions naturelles. Rappelons toutefois que la biologie très particulière de l’espèce entraine
des fluctuations rapides, positives ou négatives, des effectifs au sein d’une station.
Il est important de permettre au Sonneur à ventre jaune de recoloniser ce site et voire même d’en améliorer les
disponibilités en habitats aquatiques. Un site potentiel de mesure compensatoire à moins de 500m du lieu de
découverte (propriété de M. BONNEAU) n’a malheureusement pas abouti (cité dans le précédent rapport de
2016, opportunité de site en conventionnement). Il avait fait l’objet d’un diagnostic où le principal enjeu était
celui du sonneur, avec proposition de création d’un réseau d’une dizaine de mares, vasques et ornières afin
d’avoir une zone potentielle favorable pour cette espèce.
Cependant, même si cette opportunité n’a pas abouti, il y a d’autres possibilités qui ont déjà été évoquées dans
les précédentes conclusions de ce suivi comme la création d’ornières, mares peu profondes à proximité
immédiate du lieu de découverte. Des aménagements sur la zone d’emprise faciliteraient leur création et
gestion. Ci-dessous la carte 13 qui montre les zones potentiellement propices à ces éléments ; les conditions
pédologiques sont favorables, il a été observé des dépressions humides (flaques, mégaphorbiaies …) sur ces
zones. Le cours d’eau, corridor de déplacement, longe ces zones. Un réseau de 5-6 sites de reproduction serait
suffisant pour répondre au besoin du Sonneur à ventre jaune de cette station.
Pour conclure, le suivi tel qu’il est proposé sur cette zone ne semble pas nécessaire annuellement. Néanmoins
des prospections à intervalle régulier de 3 ans, permettrait de poursuivre un suivi sur cette zone et ainsi
réévaluer le potentiel des zones potentiellement favorables et d’en rechercher d’autres. Si toutefois des
aménagements sont créés pour cette espèce, ceux-ci devront faire l’objet d’un suivi plus régulier.
41. CR Suivi 2017 – Suivi des stations de Sonneurs à ventre jaune – Avril 2018
Poitou-Charentes Nature 39
Carte 14 : Zones potentiellement favorables pour des aménagements pour le Sonneur sur la zone d’emprise de la LGV SEA
42. CR Suivi 2017 – Suivi des stations de Sonneurs à ventre jaune – Avril 2018
40 Poitou-Charentes Nature
7. Synthèse générale
L’estimation de l’effectif d’une population de Sonneur à ventre jaune par CMR est une méthode très utilisée
pour le suivi de population à marquage individuel et s’effectue par simple photographie (Chemin, 2010 et
Bronique, 2000). Pour le Sonneur à ventre jaune, les adultes sont assez fidèles à leur site (ACEMAV coll., 2003),
seuls les jeunes font des déplacements importants afin de trouver de nouveaux sites de reproduction. Grâce à
un suivi pluriannuel, il est possible de connaître les effectifs et surtout la dynamique de population, notamment
les échanges et l’utilisation de l’espace.
Grâce à la CMR, 22 individus de Sonneurs à ventre jaune ont été capturés et identifiés sur le secteur de
Cressac-Saint-Genis, ce qui permet d’alimenter le catalogue de photos ventrales pour ces trois premières
années de suivi (Annexe 1). Etant au commencement de ce suivi, même si nous sommes à la troisième année,
il est possible que l’on ne connaisse pas toutes les stations/sites de ce secteur à l’heure actuelle.
Pour autant, nous pouvons conclure, à ce stade que la station de Cressac présente une assez bonne dynamique
avec des signes de reproduction avérés chaque année. Les périodes de sécheresses ont une influence sur la
détectabilité des individus mais aussi sur le taux de survie des têtards. Néanmoins le nombre de dépressions
humides sur la station semble permettre à une partie de terminer leur cycle de développement. La diminution
des échanges d’individus entre les divers sites peut toutefois nuire à sa bonne fonctionnalité à terme. La
poursuite de ce suivi vise à améliorer les connaissances sur le fonctionnement de cette population afin d’estimer
sa taille, d’étudier les échanges entre sites et de part et d’autre de la LGV SEA, de rechercher de nouveaux sites
et de définir leurs connexions. Une recherche plus poussée serait donc intéressante entre la station de Cressac
et celle du Bois de la Croix afin de vérifier le potentiel d’accueil de ce secteur et d’évaluer les possibles
échanges d’individus, les dispersions… La présence d’une station dans un boisement à moins de 2 km est un
élément très intéressant, qui nécessiterait un suivi car d’éventuels échanges sont possibles entre ces deux
stations.
Les prospections effectuées sur Poullignac doivent être maintenues afin d’assurer une veille sur le secteur et de
confirmer ou non la présence du Sonneur mais à intervalle plus espacé. Les conditions météorologiques de l’été
2016 et 2017 n’ont en effet pas permis une évaluation pertinente des sites potentiels (fort assèchement entre
juin et août). Le périmètre de prospection semble toutefois adapté et a permis de recenser un grand nombre de
points d’eau dont certaines peuvent constituer des zones potentielles de reproduction, même si aucune
observation de Sonneur à ventre jaune n’a été effectuée pour le moment.
La priorité est l’aménagement de sites de reproduction sur ces deux zones d’études que sont Cressac et
Poullignac. La forte diminution des échanges entre les sites de reproduction sur la station de Cressac (aucun
constaté en 2017) semblerait tendre vers une fragmentation de la population. Le Sonneur est une espèce très
réactive dans la colonisation de nouveaux habitats humides ; son écologie nécessite une forte adaptabilité car il
utilise des milieux temporaires, cela est largement décrit dans la bibliographie. On a pu l’observer sur le site 2
qui a été utilisé peu de temps après sa création. Il est donc préconisé de créer des sites de reproduction
prioritairement. L’emprise LGV sur chaque site d’étude laisse suffisamment de surfaces sur des milieux
favorables pour la création de mares et aux autres dépressions humides. Ces travaux seront d’autant plus
efficaces s’ils ont lieu sur sa zone de présence actuelle. La présence de l’ouvrage ne semble pas être un
élément bloquant, le ruisseau passant sous la ligne LGV est préservé avec un lit naturel, ce qui en fait un
corridor de déplacement approprié. La diversité des sites de reproduction et les faibles distances les séparant
favoriseraient le succès de reproduction de l’espèce mais surtout relierait les deux zones actuellement utilisées.
Ce réseau de mares devra se concentrer sur les parcelles attenantes à l’ouvrage hydraulique, ce qui incitera les
individus à le traverser et ainsi réduire ce phénomène de cloisonnement.
43. CR Suivi 2017 – Suivi des stations de Sonneurs à ventre jaune – Avril 2018
Poitou-Charentes Nature 41
Il sera d’autant plus important de suivre ces deux sites s’il y a la possibilité de réaliser des aménagements
pouvant augmenter le potentiel d’accueil sur ces secteurs. Dans le cas où des projets en mesures
compensatoires LGV SEA se confirment, il serait bien entendu nécessaire d’en tenir compte dans le cadre du
présent suivi.
44. CR Suivi 2017 – Suivi des stations de Sonneurs à ventre jaune – Avril 2018
42 Poitou-Charentes Nature
Bibliographie
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45. CR Suivi 2017 – Suivi des stations de Sonneurs à ventre jaune – Avril 2018
Poitou-Charentes Nature 43
Annexes
Annexe 1 : Catalogue des photos ventrales des 22 individus de Sonneurs à
ventre jaune sur le secteur de Cressac-Saint-Genis
F8L1J6G F1PL0J2G
J6L0J5G M4L2J3G-1
F4PL0J2G M4PL0J5G
F1L1J1G F4L0J4G
46. CR Suivi 2017 – Suivi des stations de Sonneurs à ventre jaune – Avril 2018
44 Poitou-Charentes Nature
M4L2J3G M4L0J3G
M6PL1J3G M2L0J2G
F6PL1J4G J3L0J2G
F3L0J4G J1PL1J2G
47. CR Suivi 2017 – Suivi des stations de Sonneurs à ventre jaune – Avril 2018
Poitou-Charentes Nature 45
J5PL0J2G J4L0J0G
F2PL0J5G F3L0J1G
F4L0J1G M6L1J1G
48. CR Suivi 2017 – Suivi des stations de Sonneurs à ventre jaune – Avril 2018
46 Poitou-Charentes Nature
Annexe 2 : Compte-rendu de pêches
CR rédigé par Charente Nature suite à l’opération de sauvetage de la petite faune
réalisée sur la Grande Eau le 23/08/2013 dans le cadre du chantier de la LGV SEA
pour COSEA – Partie Résultats
L’intervention de Charente Nature a été réalisée en deux temps :
- Capture manuelle et à l’aide d’épuisettes à l’intérieur du cours d’eau;
- Prospection minutieuse des abords et de la couche scalpée lors du griffage.
On compte la présence de 10 espèces sur ce ruisseau :
Grenouille verte sp. (Pelophylax sp.), Rainette méridionale (Hyla meridionalis) et Sonneur à
ventre jaune (Bombina variegata).
Lézard vert occidental (Lacerta bilineata) et Lézard des murailles (Podarcis muralis).
Campagnol roussâtre (Clethrionomys glareolus), Campagnol sp. (Microtus sp.), Musaraigne
aquatique (Neomys fodiens), Musaraigne sp. (Sorex sp.) et Mulot sp. (Apodemus sp.).
Tableau 4 : Carnet de captures
Nbre inds
capturés
Nbre inds vus mais
non capturés
Nbre inds morts lors
de l’intervention
Grenouille verte sp. 6
Rainette méridionale 1
Sonneur à ventre jaune 7
Lézard vert occidental 1
Lézard des murailles 1
Campagnol roussâtre 1
Campagnol sp. 3 2 3
Mulot sp. 3
Musaraigne aquatique 1
Musaraigne sp. 1
Total 18 6 6
Le griffage a mis à jour de nombreux micromammifères qui n’ont pas pu tous être capturés, principalement dû
à la difficulté d’en capturer plusieurs en même temps et de leur rapidité de fuite.
L’utilisation de la pelleteuse pour le griffage présente des inconvénients suivant le type de milieu rencontré. La
présence de pierriers sur la zone a rendu la tâche très compliquée et a entrainé la mort de certains individus.
L’ensemble des espèces capturées au cours de l’intervention a été relâché en aval de la Grande Eau, en dehors
de la zone d’emprise.
Le Sonneur à ventre jaune est une espèce protégée à forte valeur patrimoniale, qui n’a pas été
recensé lors de l’état initial sur le tracé de la LGV SEA. Il sera donc nécessaire de prendre en
compte la découverte de cette nouvelle espèce et de l’inclure dans les mesures
compensatoires pour la destruction d’espèce et de son habitat.
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Annexe 3 : Vue des secteurs suivis avant les travaux de la LGV SEA
Carte 15 : Station de Cressac-Saint-Genis avant les travaux de la LGV SEA
52. CR Suivi 2017 – Suivi des stations de Sonneurs à ventre jaune – Avril 2018
50 Poitou-Charentes Nature
Carte 16 : Station de Poullignac avant les travaux de la LGV SEA