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« Le cahier de laboratoire
électronique à l’Inserm :
changement de pratique
changement de paradigme »
Hélène Chambefort
Fanny Brizzi
Paul-Guy Dupré
2
L’Inserm
• Créé en 1964, l'Institut national de la santé et de la recherche médicale est un établissement
public à caractère scientifique et technologique, placé sous la double tutelle du ministère de
la Santé et du ministère de la Recherche.
• L'Inserm, seul organisme public de recherche français entièrement dédié à la santé
humaine, s’est vu confier, en 2008, la responsabilité d’assurer la coordination stratégique,
scientifique et opérationnelle de la recherche biomédicale.
• L’expertise et la veille scientifiques sont désormais inscrites comme missions officielles de
l’Institut. (décret mars 2009)
• 289 unités de recherche en 2015
3
Le service des archives
Création service archives, 1991
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Archives électroniques,
- AMOA, 2009-2010
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Myopathie de Duchenne
© Inserm/UMR147/Inserm
4
Le Département du Système
d’Information (DSI)
• DSI service Soutien aux laboratoires.
• Chefs de projet : Fanny Brizzi et Paul-Guy Dupré
• Le projet de CLE s’inscrit dans cette réflexion sur la prise
en compte de la gestion des données de la recherche et de
l’archivage électronique.
5
Le cahier de laboratoire
• Outil scientifique : élément de mémoire et de transfert de connaissance
en interne, preuve du savoir-faire du laboratoire (patrimoine de l’INSERM)
permettant d’établir sa compétence ;
• Outil de traçabilité : reproductibilité des données, démarche qualité,
preuve du professionnalisme du chercheur au sein de la communauté
scientifique, permettant de répondre à des exigences réglementaires;
• Outil juridique : c’est un élément de protection intellectuelle, preuve du
savoir-faire du laboratoire à une date précise permettant la signature de
contrat, le dépôt de brevets ou la résolution de litige. Valorisation;
collaborations externes (européennes ou industrielles)
• Outil de justification lors d’audit pour les subventions
Européennes par exemple.
6
Histoire du cahier de laboratoire
- 1941-1964 : INH,
- 1952 : 1ers cahiers archivés,
U.10
- 1998 : Formalisation par la
création de la mission de
réflexion sur l’intégrité
scientifique
- 1999 : Guide des DU
- 2015 : Etude des cahiers de
laboratoire électroniques
- 2016 : Second guide des DU
Propriété de l’INH/Inserm
Archivage lors des fermetures d’unités
(relation DR et service Archives)
Responsabilité du directeur du
laboratoire :
– Bonne tenue des cahiers
– Obligation aux personnels du
laboratoire
– Mise à disposition (accords de
confidentialité)
7
Les limites du cahier papier
Recherche
fastidieuse
Quantité
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données
trop lourde
Relecture
difficile
LIMITES DU PAPIER
Sécurité de
conservation
au laboratoire
variable
Problèmes
de
traçabilité
Données
numériques
non consignées
Dégradable
8
Intérêt de la version électronique
Consultation à
distance
Recherche
facilité
9
– 2014 :
• Demande des chercheurs
• DSI se penche sur la question pour des préoccupation de sécurité
des données
• Veille technologique
• Test de 4 cahiers par 5 équipes
– 2015 :
• Annonce du projet dans le plan stratégique de l’Inserm
• Mise en place d’une expérimentation à plus large échelle (logiciel :
Labguru)
Historique du projet CLE
10
Expérimentation du CLE
Expérimentation
L’Inserm a choisi d’évaluer le logiciel
« Labguru » et sa mise en œuvre dans 31
équipes et plateformes de recherches
volontaires.
Au total, 280 scientifiques travaillant
dans des disciplines variées
expérimentent actuellement la solution.
11
Préoccupations communes archivage
et CLE
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Recherche
Grosse
volumétrie
de données
PRÉOCCUPATIONS
COMMUNES
Sécurité de
conservation
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12
Intérêt et limites du CLE dans une
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Utilisation du cahier de laboratoire par projet et non plus par personne ou par manips
 Regroupe les données et permet une conservation de beaucoup plus de données
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d’archivage
 Le CLE n’a pas vocation à gérer les big-data et grosses volumétries de données (Tri
des informations pertinentes déjà effectué par le chercheur)
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13
Conclusion
• Convention avec le CINES permet de verser les CLE en archives
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Le cahier de laboratoire électronique à l’Inserm : changement de pratiques, changement de paradigme

  • 1. « Le cahier de laboratoire électronique à l’Inserm : changement de pratique changement de paradigme » Hélène Chambefort Fanny Brizzi Paul-Guy Dupré
  • 2. 2 L’Inserm • Créé en 1964, l'Institut national de la santé et de la recherche médicale est un établissement public à caractère scientifique et technologique, placé sous la double tutelle du ministère de la Santé et du ministère de la Recherche. • L'Inserm, seul organisme public de recherche français entièrement dédié à la santé humaine, s’est vu confier, en 2008, la responsabilité d’assurer la coordination stratégique, scientifique et opérationnelle de la recherche biomédicale. • L’expertise et la veille scientifiques sont désormais inscrites comme missions officielles de l’Institut. (décret mars 2009) • 289 unités de recherche en 2015
  • 3. 3 Le service des archives Création service archives, 1991 Archives des laboratoires, Archives électroniques, - AMOA, 2009-2010 - Premiers projets et partenariats Archives/DSI, 2012 Myopathie de Duchenne © Inserm/UMR147/Inserm
  • 4. 4 Le Département du Système d’Information (DSI) • DSI service Soutien aux laboratoires. • Chefs de projet : Fanny Brizzi et Paul-Guy Dupré • Le projet de CLE s’inscrit dans cette réflexion sur la prise en compte de la gestion des données de la recherche et de l’archivage électronique.
  • 5. 5 Le cahier de laboratoire • Outil scientifique : élément de mémoire et de transfert de connaissance en interne, preuve du savoir-faire du laboratoire (patrimoine de l’INSERM) permettant d’établir sa compétence ; • Outil de traçabilité : reproductibilité des données, démarche qualité, preuve du professionnalisme du chercheur au sein de la communauté scientifique, permettant de répondre à des exigences réglementaires; • Outil juridique : c’est un élément de protection intellectuelle, preuve du savoir-faire du laboratoire à une date précise permettant la signature de contrat, le dépôt de brevets ou la résolution de litige. Valorisation; collaborations externes (européennes ou industrielles) • Outil de justification lors d’audit pour les subventions Européennes par exemple.
  • 6. 6 Histoire du cahier de laboratoire - 1941-1964 : INH, - 1952 : 1ers cahiers archivés, U.10 - 1998 : Formalisation par la création de la mission de réflexion sur l’intégrité scientifique - 1999 : Guide des DU - 2015 : Etude des cahiers de laboratoire électroniques - 2016 : Second guide des DU Propriété de l’INH/Inserm Archivage lors des fermetures d’unités (relation DR et service Archives) Responsabilité du directeur du laboratoire : – Bonne tenue des cahiers – Obligation aux personnels du laboratoire – Mise à disposition (accords de confidentialité)
  • 7. 7 Les limites du cahier papier Recherche fastidieuse Quantité de données trop lourde Relecture difficile LIMITES DU PAPIER Sécurité de conservation au laboratoire variable Problèmes de traçabilité Données numériques non consignées Dégradable
  • 8. 8 Intérêt de la version électronique Consultation à distance Recherche facilité
  • 9. 9 – 2014 : • Demande des chercheurs • DSI se penche sur la question pour des préoccupation de sécurité des données • Veille technologique • Test de 4 cahiers par 5 équipes – 2015 : • Annonce du projet dans le plan stratégique de l’Inserm • Mise en place d’une expérimentation à plus large échelle (logiciel : Labguru) Historique du projet CLE
  • 10. 10 Expérimentation du CLE Expérimentation L’Inserm a choisi d’évaluer le logiciel « Labguru » et sa mise en œuvre dans 31 équipes et plateformes de recherches volontaires. Au total, 280 scientifiques travaillant dans des disciplines variées expérimentent actuellement la solution.
  • 11. 11 Préoccupations communes archivage et CLE Confidentialité Indexation et Recherche Grosse volumétrie de données PRÉOCCUPATIONS COMMUNES Sécurité de conservation (intégrité des données) Traçabilité des données (Qui et quand) Enregistrement de données brutes
  • 12. 12 Intérêt et limites du CLE dans une vision patrimoniale Intérêt du CLE pour l’archiviste : Utilisation du cahier de laboratoire par projet et non plus par personne ou par manips  Regroupe les données et permet une conservation de beaucoup plus de données  Déroulé de l’histoire d’un projet  Indexation facilitera le passage aux métadonnées et automatisation du processus d’archivage  Le CLE n’a pas vocation à gérer les big-data et grosses volumétries de données (Tri des informations pertinentes déjà effectué par le chercheur) Limites de l’archivage du CLE :  Difficultés à gérer et archiver les formats de données spécifiques  Réflexion sur les formats archivés, quelles restrictions?
  • 13. 13 Conclusion • Convention avec le CINES permet de verser les CLE en archives • Acquisition d’un logiciel de gestion d’archives hybrides • Intégration de la gestion des CLE pour l’archivage