Soutenir les Arbres pour Soutenir la Forêt : l’importance des ressources génétiques
1. Soutenir les Arbres pour Soutenir la Forêt :
l’importance des ressources génétiques
Dr. Laura Snook, Programme Leader
Yaounde, Cameroon May 23, 2013
CIFOR photo
2. • Bois
• Produits forestiers
non ligneux
• La faune
(services écologiques,
nourriture & tourisme)
Biens et Services rendus par la forêt du Bassin du
Congo
J.G. Collomb, World
Resources
Institute, 2001
Pluie : les arbres pompent l’eau
LUIZ E. O. C.ARAGÃO. 2012. Effect of deforestation on
rainfall in the tropics. (diagram). In: Environmental science:
The rainforest’s water pump. Nature.
doi:10.1038/nature11485
L. Snook
Bioversity
Duncan Noakes
3. La gestion pour un bénéfice durable
“Le secteur forestier est basé sur le développement d’un matériel
brut qui se régénére, garantissant ainsi des revenus durables et ce
aussi longtemps que cette ressource est gérée de façon adéquate.”
(Bayol et al. 2012: Forest Management and the Timber Sector in Central Africa in The Forests of the Congo Basin: State of the
Forest 2010)
wwf.panda.org/about_our_earth/ecoregions/centralcongo_moist_forests.cfm
5. Production annuelle dans les concessions
du Bassin du Congo, pour l’exportation
OFAC Observatoire des Forets d’Afrique Centrale 2010
6. • 9 Million m3 de grumes en 2007
• Combien d’arbres? ca. 1,800,000
• Production informelle pour le marché local
probablement plus importante
• > 4,000,000 arbres/an: : quel est leur
statut aujourd’hui – et demain?
Les arbres peuvent être une ressource
renouvelable
L Snook Bioversity photo
7. Classification IUCN des principales esssences
Nom
commun
Nom
scientifique
Catégorie
liste rouge
IUCN
Menaces Liste CITES?
Okoumé Aucoumea
klaineana
Vulnérable Coupes répétées; pools
génétiques réduits
Bi. Largement exploitée, critères
rencontrés pour l’ appendice II
Sapelli Entandophragma
cylindricum
Vulnérable Largement exploitée; érosion
génétique due au prélèvement
des individus matures
Inventaire nécessaire pour
quelques populations, manque
d’informations
Ayous Triplochiton
scleroxylon
Risque plus
faible
Exploitation non durable pour
l’utilisation locale et le
commerce international
Listé, pas dans l’appendice I ou II;
Genre monospécifique
Azobe Lophira alata Vulnérable Bi. Largement exploitée
Critères rencontrés pour l’ app. II
Iroko Milicia excelsa Presque
menacée
Largement exploitée Bi. Largement exploitée mais
large distribution. Critères
rencontrés pour l’ appendice II
Sipo
mahogany
Entandophragma
utile
Vulnérable Largement exploitée; érosion
génétique due au prélèvement
des individus matures,
croissance lente
Inventaire nécessaire pour
quelques populations, manque
d’informations
8. Classification IUCN des principales esssences
Nom
commun
Nom
scientifique
Catégorie
liste rouge
IUCN
Menaces Liste CITES?
Kosipo Entandophragma
candollei
Vulnérable Inventaire nécessaire pour quelques
populations, manque d’informations
Limba Terminalia
superba
Vulnérable Faible régénération;
problèmes de germination
Manque d’informations
Bossé Guarea cedrata Vulnérable Similarité avec E. angolense
induit une large exploitation
Bi. Largement exploitée.
Bii. Perte d’habitat; critères rencontrés
pour l’ appendice II
Moabi Baillonella
toxisperma
Vulnérable Surexploitée, fort déclin;
exploitation suspendue au
Gabon
Genre monospécifique
Bi. Largement exploitée
Bii. Perte d’habitat, maturité tardive;
régénération limitée. Critères
rencontrés pour l’ appendice II.
Wenge Millettia laurentii En danger Fortement exploitée, en
danger
Bi. Largement exploitée.
Bii Manque d’informations, critères
rencontrés pour l’ appendice II
Assaméla Pericopsis elata En danger Exploitation non durable;
déclin de l’habitat;
régéneration insuffisante.
Bi. Largement exploitée
critères rencontrés pour l’ appendice II
9. Même si une espèce n’est pas menacée, les populations
de celles-ci peuvent l’être
•Il présente une zonation en lien
avec l’hétérogénéité climatique
actuelle et l’impact différent d’une
zone à une autre de l’évolution du
climat passé
•Chaque zone présente un
endémisme spécifique
(mammifères, oiseaux, reptiles,
amphibiens et plantes)
•Probablement, pour les espèces
répandues, il y a une sous-
structuration en populations
différenciées, en lien avec des
caractéristiques climatiques et
édaphiques différentes
Equatorial
West
Equatorial
East
Austral
East
Austral
West
Central
basin
From Kingdon, 1990; Island Africa
Le bassin du Congo n’est pas uniforme.
10. Ressources Génétiques Forestières :
la variation génétique entre les arbres
•Les arbres sont parmi les organismes les plus diversifiés
génétiquement; cette caractéristique contribue à leur longévité
•Il y a la variation génétique entre populations d’arbres, et entre
individus au sein d’une même population
•Les différences génétiques entre graines d’un arbre constituent
une assurance de survie aux conditions locales pour au moins
une partie;
•Une espèce d’arbre pourra aussi croitre dans un large spectre
d’environnements différents; les différentes populations sont
adaptées à les conditions locales
•Cette diversité permet l’adaptatation aux changements
globaux
•La qualité et la quantité d’un produit (bois, fruits) peuvent
varier d’un arbre à l’autre d’une même espèce.
•Une sélection peut-être effectuée sur cette base génétique
pour des traits d’intérêt (rectitude du tronc, etc)
Deux arbres de Parkia
biglobosa, même âge, graines
provenant de deux
populations différentes
11. Projections changements climatiques :
sécheresse
L’Afrique Centrale a connu des périodes de sécherésse dans le passé ; il est prédit qu’une
nouvelle période de sécheresse est à venir, pendant la période de vie des arbres actuels
Les arbres qui naissent actuellement devront pouvoir s’adapter aux futures conditions de
sécheresse
Il est nécessaire de caractériser les différences de tolérance à la sécheresse de populations
différentes, conserver les graines correspondantes, et être préparer aux partages de
ressources génétiques
Dai, 2012.
NCAR Drought
Projections
based on
Palmer Drought
Severity Index
14. Présenté en 2013 : premiere évaluation sur
l’état de la connaissance, de la gestion, de
l’utilisation et de la conservation des
ressources génétiques forestières du monde
Apports:
Rapports nationaux
Etudes thématiques et contextuelles
Groupes de travail par région
Synthèses régionales
15. Priorités globales pour la conservation, l’utilisation durable et le
développement des Ressources Génétiques Forestières (RGF)
NIVEAU Améliorer l’accès
et la disponibilité de
l’information
Conservation
in situ et ex situ
Utilisation durable,
développement et
gestion
Politique, institutions
et développement des
capacités
National
Etablir et renforcer:
inventaires,
caractérisation et
systèmes de monitoring
des RGF
Renforcer la contribution
des forêts primaires et
des zones protégées à la
conservation in situ
Développer et
renforcer les
programmes de
production de graines
génétiquement
appropriées
Développer des
stratégies pour la
conservation in situ et ex
situ, et utilisation durable
Soutenir l’évaluation, la
gestion et la conservation
des populations
forestières en marge des
aires de distribution
Soutenir l’adaptation
et l’atténuation aux
changements
climatiques à travers
une gestion raisonnée
Etablir et renforcer les
structures d’éducation et
de recherche
Identifier des espèces
prioritaires
Regional Développer des
protocoles standardisés
pour inventorier,
caractériser et contrôler
tendances et risques
Développer, appliquer
des stratégies de
conservation in situ et
promouvoir la mise en
réseau et la collaboration
Soutenir le
développement et le
renforcement des
réseaux et du partage
des données
17. 17
Conservation de Prunus africana: largement distribué,
menacé par la sur-exploitation de son écorce
Action de prioritisation sur base de données
génétiques géoréférencées
Données microsatellites chloroplastiques (cpSSRs)
et nucleaires (nSSRs) géoréférencées (6
marqueurs par génome) pour 32 populations
(484 individus) correspondant à 9 pays
• Bioversity
InternationalF. de la
Cruz
Disitribution de Prunus africana dans 22 pays
africains (points noirs) et modélisation de sa
distribution potentielle (marron foncé : présence
très probable; jaune : présence peu probable)
Bioversity photo ICRAF photo
18. • You can add bullets here
– Level 2 bullet
• Level 3 bullet
Outils de prioritisation des populations à conserver
• You can add bullets here
– Level 2 bullet
• Level 3 bullet
Richesse allélique (nSSRs) dans 32 populations Populations de Prunus africana qui présentent des allèles
communs localement (cpSSRs and nSSRs), ce qui indiquerait
une isolation génétique et/ou une adaptation locale
Richesse allélique Allèles communs localement
19. 1500 individus de Prunus africana géoréférencés
Regroupements effectués sur base de 19 variables bioclimatiques
Démonstration potentielle d’adaptations climatiques
Similarité de la composition en nSSR regroupés
sur un sous ensemble des 32 populations
Regroupements alléliques Enveloppes bioclimatiques
Outils de prioritisation des populations à conserver
20. Impact des changements climatiques futurs
(scénario) sur l’habitat de Prunus africana
• 2050 projections sous le scénario “A2 emission”
(scénario de haute émission avec augmentation
constante du taux d’émission) résultant de la
moyenne de trois Modèles de Circulation Globale
• 53% de la distribution actuelle modélisée ne
devrait plus être appropriée d’ici a 2050 (rouge)
• La distribution de présence potentielle de Prunus
africana correspondant à des zones protégées
devrait être réduite de 46%
Modèle de distribution potentielle de
Prunus africana au Kenya, Tanzanie et
Ouganda (plus forts niveaux de
richesse allélique) et localisation des
zones protégées (WDPA)
22. Gestion durable des essences forestières et fruitières
Une étude au Gabon, Cameroun et RDC
Quel est l’impact de l’exploitation sur la
capacité reproductive et la diversité
génétique des essences?
• Moabi (bois, fruits et huile)
• Sapelli et Tali (bois et chenilles
comestibles)
• J.Tieguhong;
Bioversity
photo
• L.Snook
Bioversity
photo
23. Quel est l’impact de l’exploitation sur la pollinisation?
La pollinisation pourrait dépendre de
la densité en arbres
Une réduction de la densité en
arbres pourrait entrainer :
• Une augmentation de la
consanguinité, une réduction de la
viabilité des graines et du succès de
régénétration
• Une rupture des flux de gènes par
voie de pollen, une impossibilité de
se reproduire
25. Traçabilité du bois et exploitation illégale
Les outils de traçabilité peuvent soutenir
le plan d’action FLEGT 2003 dans la
prévention de l’entrée en Europe de bois
illégalement exploité
Accord de Partenariat Volontaire (APVs)
• République du Congo, Cameroun, République
Centrafricaine
• Demande ou en cours pour la RDC et le Gabon
•Basé sur des traits faisant partie
intégrante du bois (pas de
manipulations possibles)
• Appliquable aussi sur du bois
transformé
•Rapide Bioversity
26. Dirigé par Bioversity international, le réseau facilite
l’application pratique des technologies ADN et des
isotopes stables pour plusieurs essences forestières
prioritaires via l’établissement :
1.De réseaux fonctionnels d’experts et d’instituts
2.De standards internationalement reconnus quant à
l’empreinte génétique et isotopique des essences
forestières
3.D’une base de données géo-référencées sur la structure
génétique et des isotopes stables des essences
forestières prioritaires
www.globaltimbertrackingnetwork.org
27. Résolution obtenue avec l’ADN
& les isotopes stables
Niveau de vérification ADN Isotopes
stables
1. Espèce déclarée
Contrôle de l’identité de l’espèce
X -
2. Pays d’origine déclaré
Échelle large de contrôle de l’origine géographique
X X
3. Région/concession d’origine déclarée
Échelle fine de contrôle de l’origine géographique
X X
4. Traçabilité de la grume
Contrôle de la chaine de traçabilité
X -
28. Méthode
Recherche de différences génétiques entre
espèces
=> Séquence d’ADN d’un même gène
Développement d’outils robustes pour
l’amplification des différences génétiques entre
espèces
=> Marqueurs génétiques / barcodes ADN
Identification des espèces en utilisant l’ADN
Swietenia sp.
Carapa, Khaya,
Entandrophragma,
Cedrela sp.
Standard de taille
bp
29. Méthode:
1. Développement de marqueurs génétiques
2. Création de bases génétiques de référence:
- Echantillonnage sur toute l’aire de répartition de
l’espèce
- Inventaire génétique
3. Echantillonnage et génotypage des individus douteux
4. Comparaison avec la base de référence
Identification de l’origine géographique en utilisant l’ADN
Iroko (Milicia excelsa + M. regia)
Daïnou et al. (2010), Mol Ecol 19:4462-4477
Berndt Degen 2013, Thunen
31. Un support flexible pour enseigner et apprendre
sur les Ressources Génétiques Forestières (RGF)
Contexte :
• Les RGF tendent à s’appauvrir
• Les RGF sont rarement prises en compte
dans la gestion et la conservation des forêts
• Les cursus actuels ne couvrent que très peu le
sujet, voire pas du tout
Les modules de formation :
• Couvrent des thèmes importants sur les RGF
• Portent sur une échelle géographique globale
• Utilisent des cas d’études inspirés d’articles de
recherche
Les cours peuvent être adaptés à des durées allant
d’un jour à un semestre
32. 32
Cinq modules… deux déjà disponibles en Anglais; en
Français et Espagnol pour Déc. 2013
33. Etudes de cas : module 1
Variation génétique et conservation chez :
1.1 Leucaena salvadorensis
1.2 Shorea lumutensis
1.3 Talbotiella gentii
Chaque étude de cas inclut :
• Une introduction
• Les points importants qui doivent être
notés et réfléchis par les étudiants
• Des éléments à prendre en compte par
les étudiants dans des stratégies ou des
plans d’action
• Une description de l’espèce, des
menaces, utilisations, données
génétiques, profil du pays, et autres
informations importantes
• Des références bibliographiques
34. Chacque etude de cas inclut notes pour
l’enseignant et power point
http://www.bioversityinternational.org/training/training_materials/forest_genetic_resources.html
36. Réseau SAFORGEN
(Ressources Génétiques Forestières
en Afrique sub-Saharienne)
Un instrument volontaire de coopération internationale en
recherche et développement
Promotion de collaborations et d’actions catalysantes entre
institutions nationales et régionales afin de permettre la
conservation et l’utilisation durable des RGF en Afrique sub-
Saharienne
Groupe d’experts africains en génétique forestière / biologie
moléculaire MAIS approches pluri-disciplinaires
37. 37
Objectifs:
•Evaluer les processus dynamiques sous-jacents à la
diversité génétique des espèces forestières, des
populations jusqu’aux paysages
•Elaborer des stratégies, méthodes et outils pour la
conservation et l’utilisation durable de la biodiversité
forestière, avec un focus particulier sur la diversité
génétique intra-spécifique
•Diffuser les connaissances et informations relatives à
la conservation et l’utilisation durable des RGF via des
forums nationaux et internationaux
Réseau SAFORGEN
38. Réseau SAFORGEN
Informations sur les espèces forestières exploitées
pour leur bois, pour l’alimentation, l’énergie …
• Distribution géographique
• Importance et utilisation
• Valeur socio-économique
• Ecologie et biologie
• Connaissances génétiques
• Pratiques locales
• Menaces
• Statut de conservation
• Gestion et amélioration
• Recommandations :
conservation /utilisation
• Besoins de recherche
39. Réseau SAFORGEN
Actuellement : 17 membres
Afrique Centrale et Australe sous-
représentées!
Candidatures des pays manquants en
cours d’évaluation
Coordinateur basé à Bioversity
International –Yaoundé :
Jérôme DUMINIL
(j.duminil@cgiar.org)
40. Thanks to my Bioversity colleagues
Endemics of Cameroon’s Bight of Biafra
Fauna:
Satanic colobus monkey, Mona
monkey, drill, forest genet, Ogilby’s
duiker
Flora:
Canopy: Berlinia species;
Midstory:Cola species;
Understory :gingers
Painting by Jonathan Kingdon
Dr. Judy Loo
Dr. Jerome Duminil
Dr. Marius Ekue
Hannes Gaisberger
Dr. Barbara Vinceti
Dr. David Boshier