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N°2 - Déc. 200814
Méthodologie
Une bonne thèse est
le résultat d’un travail
original, intéressant,
murement réfléchit,
réalisé dans les
règles de l’art, bien
présenté, et publié.
Rien que ça !
Petit tour d’horizon
des droits et devoirs
du thésard…
1 - PRÉPARATION
a - Quand commencer ?
COMMENCEZ DÈS LA FIN DE LA
DEUXIÈME ANNÉE D’INTERNAT.
Un travail de thèse est une entreprise qui
nécessite de l’endurance. S’il est possi-
ble de passer sa thèse dès lors que l’ins-
cription en DES est effective (certains le
recommandent afin de se débarrasser
de ce travail au plus vite), la soutenance
intervient l’immense majorité du temps
dans les derniers mois qui précèdent la
fin de l’internat, voire, pour ceux qui ne
prennent pas de poste de CCA ou d’asis-
tant, au cours de l’année qui suit.
Ce n’est pas une raison pour se mettre au
travail en dernière année. Pourquoi ? Par-
ce que l’organisation de la thèse, surtout
s’il s’agit d’un travail de recherche pros-
pectif, prend déjà beaucoup de temps.
L’idéal serait d’être en mesure de pré-
senter un projet de thèse dès le 5ème
semestre, pour se donner le temps de la
réflexion, ne pas bâcler un protocole, et
pouvoir rebondir sur un autre sujet si le
projet échoue.
b - Choix du sujet
CHOISISSEZ UN SUJET QUI VOUS
INTÉRESSE.
Choisir un bon sujet de thèse n’est pas
facile lorsque l ‘on est interne en forma-
tion, sans beaucoup d’expérience. Par-
fois, c’est le sujet qui est proposé par
une équipe, parfois l’idée germe à partir
d’observations cliniques.
De façon générale, il est plus agréable de
travailler un sujet qui passionne que de
s’investir sur un travail laborieux et peu
attrayant.
Pensez aux heures que vous égrènerez
devant votre ordinateur, à la fierté que
vous ressentirez en parlant de vos tra-
vaux.
Une thèse, c’est d’abord de nombreux
articles à lire et résumer, de grandes dis-
cussions autour du sujet… autant choisir
un thème qui vous intéresse.
PRÉPARER SA THÈSE…
ET LA PASSER !
par Olivier VERAN
AVM-2 complet.indd 16 9/12/08 18:10:08
N°2 - Déc. 2008 15
Préparer sa thèse… et la passer !
CHOISISSEZ UN SUJET ORIGINAL
ET PENSEZ TÔT À LA PUBLICA-
TION.
De façon générale, il est plus facile de
publier un travail original qu’une Xème
redite. A partir d’un thème précis, regar-
dez ce qui a déjà été publié, lisez bien les
conclusions des études les plus récentes,
et déduisez en une étude qui apporterait
des données utiles d’un point de vue
scientifique.
Il n’est pas nécessaire que les résultats
de votre étude soient positifs. Parfois, des
résultats négatifs ont autant de poids, et
cela ne constitue pas un frein à la publi-
cation.
c - Encadrement
CHOISISSEZ BIEN VOTRE DIREC-
TEUR DE THÈSE.
Un sujet de thèse sera souvent proposé
par un médecin du service, qui souhaite
voir se concrétiser un projet de recherche,
ou qui a des idées et peu de temps pour
les développer lui même. Dans ce cas, le
directeur de thèse est tout trouvé.
Si la démarche vient de l’interne, le choix
du directeur s’avère alors primordial. Il
doit réunir plusieurs qualités : capacité
d’écoute, investissement dans la recher-
che, expérience des publications et des
travaux de recherche, intérêt pour le sujet
de la thèse.
C’est le directeur de thèse qui sera char-
gé d’encadrer l’ensemble des travaux, de
guider l’interne à travers les méandres de
l’administration, et c’est souvent lui qui
proposera la composition du jury.L’affectif
compte bien sûr, c’est traditionnellement
le directeur qui défend le jour J.
RÉUNISSEZ AU MOINS 4 MEM-
BRES DONT 3 PUPH :
Il faut réunir au moins 4 membres dont
3 PUPH (pas forcément de la discipline)
parmi lesquels un président du jury.
Il est apprécié d’inviter un PUPH d’une
autre ville, spécialiste dans le sujet traité.
Le choix du jury s’anticipe tant les sollici-
tations peuvent être nombreuses.
d - Changer de cap,
c’est possible.
PRÉVOYEZ UN PLAN B AU CAS
OÙ.
Les raisons sont multiples qui peuvent dé-
courager un thésard en cours de route.
Protocole mal ficelé, résultats catastro-
phiques, publication récente d’une étude
identique, abandon par le directeur de
thèse, manque d’intérêt pour le sujet…
il vaut mieux changer que s’entêter, sur-
tout si l’on a pris le soin de garder une
étude tout prête sous le coude.
e - Bibliographie
COMMENCEZ PAR LE PLUS
LONG.
Une recherche rigoureuse des articles
publiés et des connaissances actuali-
sées ayant trait à un sujet de thèse prend
beaucoup de temps.
Dans l’idéal, une bibliographie se fait
avant l’écriture du protocole, pour cibler
les points intéressants. Sélectionnez des
mots clefs cohérents dans Pubmed, puis
triez les articles par centre d’intérêt. Il est
inutile (voire impossible) d’être exhaustif
dans un domaine donné, mais vous ne
devez pas passer à côté des articles fai-
sant référence.
Un truc : sélectionnez un article publié
dans une grande revue, centré sur votre
sujet, et commencez par lire les articles
référencés dans la bibliographie.
N’oubliez pas les articles fondateurs,
ceux publiés avant les années Pubmed et
souvent non référencés.
Utilisez Endnote (voir plus bas) pour clas-
ser et enregistrer votre travail, et résumez
les données importantes des articles que
vous citerez. Une thèse n’est pas une
revue de littérature, inutile donc de citer
200 références et de détailler ce qui n’est
pas en rapport avec votre étude.
Une thèse article contraint généralement
à limiter le nombre de références, selon
les instructions de la revue ciblée.
f - Endnote
LOGICIEL ULTRA PRATIQUE
Endnote (v.10) permet d’effec-
tuer des recherches de bibliogra-
phie par mot clef directement sur
Pubmed, de sélectionner les
références utiles, de les classer
par date, auteur, thème, revue.
Mais la vraie magie s’opère lors-
que dans Word apparait la pe-
tite fenêtre Endnote, qui permet
d’insérer en un clic une référence
là où vous le souhaitez, et établit
la liste des références en queue
d’article.
Selon ce qui est demandé par la
fac ou la revue, il suffit de para-
métrer le logiciel pour mettre votre
article au bon format.
g - Thèse article !
SOYEZ PRAGMATIQUE.
Une récente étude a montré que
plus de 90% des internes et en-
seignants sont favorables à une
thèse sous forme d’article.
Finis les pavés de 100 pages que
personne (ou presque) ne lit, sou-
vent inutilisables une fois la thèse
soutenue.
En accord avec votre président
de jury et votre directeur de thèse,
prévoyez donc de rédiger directe-
ment un article (en anglais le plus
souvent) au format imposé par
la revue à laquelle vous destinez
votre travail.
AVM-2 complet.indd 17 9/12/08 18:10:09
N°2 - Déc. 200816
Préparer sa thèse… et la passer !
2 - CONDUITE
D’UNE ÉTUDE
a - Faites vous aider !
PENSEZ AU CIC.
Conduire une étude, quelle qu’elle soit,
n’est pas intuitif, et il n’existe pas de
guide de « la recherche clinique pour les
nuls ». De plus, la législation change fré-
quemment, et même votre directeur de
thèse peut être un peu perdu.
Pour ne pas commettre d’erreurs, il faut
vous assurer de faire les choses dans les
règles, auprès par exemple du Centre
d’Investigations Cliniques de votre CHU.
Des médecins et statisticiens peuvent
vous conseiller, vous orienter, voire orga-
niser avec vous un protocole de recher-
che, ce qui est un atout non négligeable.
b - Etude rétrospective
L’exploitation de données rétrospectives
nécessite peu de démarches préparatoi-
res. Toutefois, une demande auprès de
la CNIL est le plus souvent nécessaire,
qui dispose d’un délai raisonnable pour
répondre à votre requête.
D’autres démarches peuvent être obli-
gatoires, selon le type d’étude que vous
préparez.
c - Etude prospective
NE COMMENCEZ PAS TROP VITE !
Un conseil : avant de débuter une étude
prospective, il vous faut un dossier en
béton,sinon vous prenez le risque de voir
votre travail inexploitable, voire illégal et
attaquable.
LES ÉTAPES.
Une demande de promoteur peut être
utile si l’étude à un coût, là aussi le CIC
peut s’avérer utile tant dans la démar-
che de préparation que d’exécution de
l’étude.
Un accord du Comité de protection des
Personnes est indispensable avant de
recruter des volontaires. La aussi, une
demande auprès de la CNIL doit être
faite. Il faudra dans la plupart des cas un
formulaire de consentement validé, ainsi
qu’un conseil éthique labellisé IRB…
bref ! Les démarches sont nombreuses
et plutôt longues, même si leur nature
dépend du type de recherche que vous
souhaitez conduire (avec ou sans essai
pharmaceutique…).
Rien n’est instinctif, aussi vous devez
prendre conseil auprès d’un profession-
nel de la recherche clinique avant de dé-
buter quoi que ce soit.
FINANCEZ VOTRE
PROJET D’ÉTUDE
Pensez à demander une bourse de re-
cherche, les organismes sont nombreux
qui récompensent des projets sérieux et
coûteux.
3 - PRÉPARATION
DE LA SOUTENANCE
a - Aspects pratiques
FIXEZ TÔT VOTRE DATE DE
SOUTENANCE.
Réunir plusieurs enseignants le même
jour, ça s’anticipe de plusieurs mois,
d’autant que selon les facs, la réserva-
tion d’une salle de thèse, voire d’une
salle des fêtes peut nécessiter de s’y
prendre presqu’un an à l’avance.
Validez le permis d’imprimer. Il est dispo-
nible à la fac, et doit être rendu complété
au moins un mois avant la soutenance.
Il faudra ensuite demander un numéro
d’enregistrement, et fournir un certain
nombre de documents à la fac, dont la
liste vous sera fournie par leurs soins.
b - Le jour J
PRÉPAREZ VOTRE
PRÉSENTATION.
N’oubliez pas un vidéoprojecteur, un or-
dinateur, vos livrets de thèse… venez en
avance pour accueillir votre jury et vos
invités.
DÉFENDEZ VOTRE TRAVAIL.
Il est d’usage dans la plupart des facs
de présenter un résumé de son travail,
après quoi chaque membre du jury in-
terpelle le thésard, en attente parfois de
réponses. N’hésitez pas à répondre aux
questions et remarques, tout en ména-
geant la susceptibilité du jury. A la fin, le
jury délibère puis annonce sa décision,
après quoi il ne reste plus qu’à prêter le
serment d’Hippocrate (non obligatoire,
fortement conseillé).
REMERCIEZ CEUX QUI
VOUS ONT SOUTENU.
Un pot de thèse est bienvenu pour
échanger avec votre jury et remercier vos
proches de s’être déplacés.
FINALISEZ LES DÉMARCHES
ADMINISTRATIVES.
Vous devrez déposer votre thèse à la fac,
qui vous remettra un diplôme provisoire,
dans l’attente de la validation du DES.
PUBLIEZ, SI CE N’EST PAS
DÉJÀ FAIT
Une thèse sous forme d’article n’a plus
qu’à être envoyée à une revue, ce qui
évite de se replonger dans un travail que
l’on a souvent du mal à retoucher…
4 - LIENS UTILES
- Le guide pratique du thésard, d’Hervé
Maisonneuve.Vachement bien !
- Le guide du ministère de l’enseigne-
ment supérieur : www.sup.adc.educa-
tion.fr/bib/Acti/These/guidoct.rtf
- Pubmed (medline) : temple des revues
et articles de médecine www.ncbi.nhm.
nih.gov/pubmed/
- Traducteur online Français/Anglais :
bien pour le vocabulaire, pas top pour la
syntaxe, en tous cas le meilleur acces-
sible online www.google.fr/language_
tools?
- Endnote : l’essayer, c’est l’adopter.
N’existe qu’en Anglais, se trouve un peu
partout en cherchant… un peu.
฀
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Préparer sa thèse et la passer !

  • 1. N°2 - Déc. 200814 Méthodologie Une bonne thèse est le résultat d’un travail original, intéressant, murement réfléchit, réalisé dans les règles de l’art, bien présenté, et publié. Rien que ça ! Petit tour d’horizon des droits et devoirs du thésard… 1 - PRÉPARATION a - Quand commencer ? COMMENCEZ DÈS LA FIN DE LA DEUXIÈME ANNÉE D’INTERNAT. Un travail de thèse est une entreprise qui nécessite de l’endurance. S’il est possi- ble de passer sa thèse dès lors que l’ins- cription en DES est effective (certains le recommandent afin de se débarrasser de ce travail au plus vite), la soutenance intervient l’immense majorité du temps dans les derniers mois qui précèdent la fin de l’internat, voire, pour ceux qui ne prennent pas de poste de CCA ou d’asis- tant, au cours de l’année qui suit. Ce n’est pas une raison pour se mettre au travail en dernière année. Pourquoi ? Par- ce que l’organisation de la thèse, surtout s’il s’agit d’un travail de recherche pros- pectif, prend déjà beaucoup de temps. L’idéal serait d’être en mesure de pré- senter un projet de thèse dès le 5ème semestre, pour se donner le temps de la réflexion, ne pas bâcler un protocole, et pouvoir rebondir sur un autre sujet si le projet échoue. b - Choix du sujet CHOISISSEZ UN SUJET QUI VOUS INTÉRESSE. Choisir un bon sujet de thèse n’est pas facile lorsque l ‘on est interne en forma- tion, sans beaucoup d’expérience. Par- fois, c’est le sujet qui est proposé par une équipe, parfois l’idée germe à partir d’observations cliniques. De façon générale, il est plus agréable de travailler un sujet qui passionne que de s’investir sur un travail laborieux et peu attrayant. Pensez aux heures que vous égrènerez devant votre ordinateur, à la fierté que vous ressentirez en parlant de vos tra- vaux. Une thèse, c’est d’abord de nombreux articles à lire et résumer, de grandes dis- cussions autour du sujet… autant choisir un thème qui vous intéresse. PRÉPARER SA THÈSE… ET LA PASSER ! par Olivier VERAN AVM-2 complet.indd 16 9/12/08 18:10:08
  • 2. N°2 - Déc. 2008 15 Préparer sa thèse… et la passer ! CHOISISSEZ UN SUJET ORIGINAL ET PENSEZ TÔT À LA PUBLICA- TION. De façon générale, il est plus facile de publier un travail original qu’une Xème redite. A partir d’un thème précis, regar- dez ce qui a déjà été publié, lisez bien les conclusions des études les plus récentes, et déduisez en une étude qui apporterait des données utiles d’un point de vue scientifique. Il n’est pas nécessaire que les résultats de votre étude soient positifs. Parfois, des résultats négatifs ont autant de poids, et cela ne constitue pas un frein à la publi- cation. c - Encadrement CHOISISSEZ BIEN VOTRE DIREC- TEUR DE THÈSE. Un sujet de thèse sera souvent proposé par un médecin du service, qui souhaite voir se concrétiser un projet de recherche, ou qui a des idées et peu de temps pour les développer lui même. Dans ce cas, le directeur de thèse est tout trouvé. Si la démarche vient de l’interne, le choix du directeur s’avère alors primordial. Il doit réunir plusieurs qualités : capacité d’écoute, investissement dans la recher- che, expérience des publications et des travaux de recherche, intérêt pour le sujet de la thèse. C’est le directeur de thèse qui sera char- gé d’encadrer l’ensemble des travaux, de guider l’interne à travers les méandres de l’administration, et c’est souvent lui qui proposera la composition du jury.L’affectif compte bien sûr, c’est traditionnellement le directeur qui défend le jour J. RÉUNISSEZ AU MOINS 4 MEM- BRES DONT 3 PUPH : Il faut réunir au moins 4 membres dont 3 PUPH (pas forcément de la discipline) parmi lesquels un président du jury. Il est apprécié d’inviter un PUPH d’une autre ville, spécialiste dans le sujet traité. Le choix du jury s’anticipe tant les sollici- tations peuvent être nombreuses. d - Changer de cap, c’est possible. PRÉVOYEZ UN PLAN B AU CAS OÙ. Les raisons sont multiples qui peuvent dé- courager un thésard en cours de route. Protocole mal ficelé, résultats catastro- phiques, publication récente d’une étude identique, abandon par le directeur de thèse, manque d’intérêt pour le sujet… il vaut mieux changer que s’entêter, sur- tout si l’on a pris le soin de garder une étude tout prête sous le coude. e - Bibliographie COMMENCEZ PAR LE PLUS LONG. Une recherche rigoureuse des articles publiés et des connaissances actuali- sées ayant trait à un sujet de thèse prend beaucoup de temps. Dans l’idéal, une bibliographie se fait avant l’écriture du protocole, pour cibler les points intéressants. Sélectionnez des mots clefs cohérents dans Pubmed, puis triez les articles par centre d’intérêt. Il est inutile (voire impossible) d’être exhaustif dans un domaine donné, mais vous ne devez pas passer à côté des articles fai- sant référence. Un truc : sélectionnez un article publié dans une grande revue, centré sur votre sujet, et commencez par lire les articles référencés dans la bibliographie. N’oubliez pas les articles fondateurs, ceux publiés avant les années Pubmed et souvent non référencés. Utilisez Endnote (voir plus bas) pour clas- ser et enregistrer votre travail, et résumez les données importantes des articles que vous citerez. Une thèse n’est pas une revue de littérature, inutile donc de citer 200 références et de détailler ce qui n’est pas en rapport avec votre étude. Une thèse article contraint généralement à limiter le nombre de références, selon les instructions de la revue ciblée. f - Endnote LOGICIEL ULTRA PRATIQUE Endnote (v.10) permet d’effec- tuer des recherches de bibliogra- phie par mot clef directement sur Pubmed, de sélectionner les références utiles, de les classer par date, auteur, thème, revue. Mais la vraie magie s’opère lors- que dans Word apparait la pe- tite fenêtre Endnote, qui permet d’insérer en un clic une référence là où vous le souhaitez, et établit la liste des références en queue d’article. Selon ce qui est demandé par la fac ou la revue, il suffit de para- métrer le logiciel pour mettre votre article au bon format. g - Thèse article ! SOYEZ PRAGMATIQUE. Une récente étude a montré que plus de 90% des internes et en- seignants sont favorables à une thèse sous forme d’article. Finis les pavés de 100 pages que personne (ou presque) ne lit, sou- vent inutilisables une fois la thèse soutenue. En accord avec votre président de jury et votre directeur de thèse, prévoyez donc de rédiger directe- ment un article (en anglais le plus souvent) au format imposé par la revue à laquelle vous destinez votre travail. AVM-2 complet.indd 17 9/12/08 18:10:09
  • 3. N°2 - Déc. 200816 Préparer sa thèse… et la passer ! 2 - CONDUITE D’UNE ÉTUDE a - Faites vous aider ! PENSEZ AU CIC. Conduire une étude, quelle qu’elle soit, n’est pas intuitif, et il n’existe pas de guide de « la recherche clinique pour les nuls ». De plus, la législation change fré- quemment, et même votre directeur de thèse peut être un peu perdu. Pour ne pas commettre d’erreurs, il faut vous assurer de faire les choses dans les règles, auprès par exemple du Centre d’Investigations Cliniques de votre CHU. Des médecins et statisticiens peuvent vous conseiller, vous orienter, voire orga- niser avec vous un protocole de recher- che, ce qui est un atout non négligeable. b - Etude rétrospective L’exploitation de données rétrospectives nécessite peu de démarches préparatoi- res. Toutefois, une demande auprès de la CNIL est le plus souvent nécessaire, qui dispose d’un délai raisonnable pour répondre à votre requête. D’autres démarches peuvent être obli- gatoires, selon le type d’étude que vous préparez. c - Etude prospective NE COMMENCEZ PAS TROP VITE ! Un conseil : avant de débuter une étude prospective, il vous faut un dossier en béton,sinon vous prenez le risque de voir votre travail inexploitable, voire illégal et attaquable. LES ÉTAPES. Une demande de promoteur peut être utile si l’étude à un coût, là aussi le CIC peut s’avérer utile tant dans la démar- che de préparation que d’exécution de l’étude. Un accord du Comité de protection des Personnes est indispensable avant de recruter des volontaires. La aussi, une demande auprès de la CNIL doit être faite. Il faudra dans la plupart des cas un formulaire de consentement validé, ainsi qu’un conseil éthique labellisé IRB… bref ! Les démarches sont nombreuses et plutôt longues, même si leur nature dépend du type de recherche que vous souhaitez conduire (avec ou sans essai pharmaceutique…). Rien n’est instinctif, aussi vous devez prendre conseil auprès d’un profession- nel de la recherche clinique avant de dé- buter quoi que ce soit. FINANCEZ VOTRE PROJET D’ÉTUDE Pensez à demander une bourse de re- cherche, les organismes sont nombreux qui récompensent des projets sérieux et coûteux. 3 - PRÉPARATION DE LA SOUTENANCE a - Aspects pratiques FIXEZ TÔT VOTRE DATE DE SOUTENANCE. Réunir plusieurs enseignants le même jour, ça s’anticipe de plusieurs mois, d’autant que selon les facs, la réserva- tion d’une salle de thèse, voire d’une salle des fêtes peut nécessiter de s’y prendre presqu’un an à l’avance. Validez le permis d’imprimer. Il est dispo- nible à la fac, et doit être rendu complété au moins un mois avant la soutenance. Il faudra ensuite demander un numéro d’enregistrement, et fournir un certain nombre de documents à la fac, dont la liste vous sera fournie par leurs soins. b - Le jour J PRÉPAREZ VOTRE PRÉSENTATION. N’oubliez pas un vidéoprojecteur, un or- dinateur, vos livrets de thèse… venez en avance pour accueillir votre jury et vos invités. DÉFENDEZ VOTRE TRAVAIL. Il est d’usage dans la plupart des facs de présenter un résumé de son travail, après quoi chaque membre du jury in- terpelle le thésard, en attente parfois de réponses. N’hésitez pas à répondre aux questions et remarques, tout en ména- geant la susceptibilité du jury. A la fin, le jury délibère puis annonce sa décision, après quoi il ne reste plus qu’à prêter le serment d’Hippocrate (non obligatoire, fortement conseillé). REMERCIEZ CEUX QUI VOUS ONT SOUTENU. Un pot de thèse est bienvenu pour échanger avec votre jury et remercier vos proches de s’être déplacés. FINALISEZ LES DÉMARCHES ADMINISTRATIVES. Vous devrez déposer votre thèse à la fac, qui vous remettra un diplôme provisoire, dans l’attente de la validation du DES. PUBLIEZ, SI CE N’EST PAS DÉJÀ FAIT Une thèse sous forme d’article n’a plus qu’à être envoyée à une revue, ce qui évite de se replonger dans un travail que l’on a souvent du mal à retoucher… 4 - LIENS UTILES - Le guide pratique du thésard, d’Hervé Maisonneuve.Vachement bien ! - Le guide du ministère de l’enseigne- ment supérieur : www.sup.adc.educa- tion.fr/bib/Acti/These/guidoct.rtf - Pubmed (medline) : temple des revues et articles de médecine www.ncbi.nhm. nih.gov/pubmed/ - Traducteur online Français/Anglais : bien pour le vocabulaire, pas top pour la syntaxe, en tous cas le meilleur acces- sible online www.google.fr/language_ tools? - Endnote : l’essayer, c’est l’adopter. N’existe qu’en Anglais, se trouve un peu partout en cherchant… un peu. ฀ AVM-2 complet.indd 18 9/12/08 18:10:11