Le document présente un guide sur l'utilisation de la base de données Medline via l'interface PubMed, visant à enseigner comment constituer des recherches pertinentes et à mettre en place des alertes. Il couvre des aspects cruciaux tels que la distinction entre Medline et PubMed, l'utilisation d'un thésaurus, et des exemples pratiques de recherche d'articles scientifiques. Enfin, il souligne l'importance d'une approche systématique pour la recherche bibliographique, en utilisant des mots-clés et des descripteurs appropriés.

1. 1
Perrine Helly - Service Commun de Documentation - UBO
BU Santé
Medline via l’interface
Pubmed
SMa4 – septembre 2014

2. Objectifs de la séance
 Connaître les principes de constitution de la
base Medline
 Se repérer dans Pubmed
 Savoir effectuer une requête pertinente dans
la base
 Savoir mettre en place des alertes sur un
thème

3. Medline, quelques principes
Spots – Loop_oh Flickr CC-BY-SA

4. Ne pas confondre
Medline ≠ Pubmed
Le contenu
(la base de données)
L'interface
d'interrogation

5. Bases de données
 Un éditeur privé ou un
organisme institutionnel
 Un référencement humain
 Un thésaurus organisé
 Une interface d'interrogation

6. Medline
 Qui?
 Quoi?
National Library of Medicine
Etats-Unis)
20 M de références
d'articles biomédicaux,
issues de 5200
périodiques
depuis 1948
 Thésaurus MESH
 Interface PUBMED
(il en existe d'autres)

7. Pubmed, quelques repères
(interface web)
Compass Study – Calsidyrose – Flickr CC-BY

8. Vos premiers pas dans
Pubmed
 Recherche libre sur la grippe H1N1
chez les femmes enceintes
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed

9. Présentation de la liste des
résultats

10. Quelques filtres
 Triez vos résultats pour n'afficher que
les articles écrits en anglais ou en
français
 Précisez votre recherche en ne
sélectionnant que les revues de la
littérature

11. Types d'articles : rappel
 Case report / étude de cas
 Clinical Trial / essai clinique
 Randomized Controlled Trial / essai clinique
en aveugle avec groupe contrôle
 Practice guideline / recommandation de
bonne pratique
 Review / revue de la littérature
 Systematic Review / revue systématique
 Meta-analysis / méta-analyse (Cochrane)

12. Pour des recherches fines : le Mesh
Needle and Thread – Incurable Hippie – Flickr CC-BY-NC

13. S'il te plaît, dessine-moi...
...un thésaurus
Vocabulaire normalisé
Descripteurs
Hiérarchie

14. Plusieurs synonymes, un seul
descripteur officiel
Syndrome, Down
Down's Syndrome
Downs Syndrome
Syndrome, Down's
Mongolism
Trisomy 21
Trisomy 21, Meiotic Nondisjunction
Trisomy 21, Mitotic Nondisjunction
Down Syndrome, Partial Trisomy 21
Partial Trisomy 21 Down Syndrome
Down Syndrome

15. Le thésaurus de Medline :
le MeSH
Medical Subject Headings (uniquement en anglais)

16. Les mots-clefs Medline
peuvent être enrichis par
des « sous-mot-clefs »
Heading/Subheading
= Descripteur/Qualificatif
= Mot-clef/Sous-mot-clef

17. Les opérateurs booléens
.
A/B
A du
point de
vue de B
Sur
Pubmed
seulement

18. Le MESH
 Descripteurs (>25 000)
 Qualificatifs (83)
 « L'affiliation Descripteur / Qualificatif est la clé
de l'interrogation de Medline »*
*(citation de Philippe Eveillard dans « Comment faire ses premiers pas sur
Pubmed » La Revue du praticien. Médecine générale A. 2007, n° 766-67,
pp. 411-412)

19. Recherche libre vs. Équation de recherche
Les facteurs environnementaux
de la sclérose en plaques
multiple
sclerosis
environmental
factors
1320 résultats – pas
tous pertinents
Multiple
Sclerosis/etiology"[Mesh]
AND
environment[Mesh]
387 résultats pertinents

20. Exemple de
résultat non-pertinent
: la
requête a porté
indifféremment
sur toutes les
parties de la
notice
Source : Georges
Beuzet, BU Santé
Brest

21. Un exemple de recherche
Articles en français et en anglais sur le
toucher dans la relation soignant-soigné
publiés les 10 dernières années

22. Un exemple de recherche
Articles en français et en anglais sur le
toucher dans la relation soignant-soigné
publiés les 10 dernières années
"Touch"[Mesh] AND "Professional-Patient
Relations"[Mesh]
+ Filters : English, French, published in the
last 10 years

23. Exemple de
résultat
pertinent: la
requête a porté
exclusivement
sur la partie
« mots MESH »
de la notice

24. Correspondances Mesh français –
Mesh anglais
=> « Portail terminologique de santé »
(CISMEF)
http://pts.chu-rouen.fr/
Ou
=> « Mesh bilingue de l’INSERM » :
http://mesh.inserm.fr/mesh/

25. Bref
« Une recherche
bibliographique ne se fait
pas dans les couloirs de
l’hôpital ou entre 2 stations
de métro avec son
smartphone ou sa tablette. »
Philippe Eveillard
Love & Mathematics – Lost Archetype – CC BY-NC-SA sur Flickr

26. Exercices
1- Rechercher les affiliations
descripteurs/qualificatifs correspondant :
 le diagnostic de la prééclampsie
 les effets indésirables de la
césarienne

27. Réponses
1- Rechercher les affiliations
descripteurs/qualificatifs correspondant :
 au diagnostic de la prééclampsie
"pre-eclampsia/diagnosis"[Mesh]
 aux effets indésirables de la césarienne
"Cesarean section/adverse effects"[Mesh]

28. 3 façons d'entrer une
requête dans Pubmed
1)À partir d'un mots-clef MESH ( boîte
d'équation de recherche et rebond)

29. 3 façons d'entrer une
requête dans Pubmed
2) À partir du moteur de recherche
avancée (« Advanced »)

30. 3 façons d'entrer une
requête dans Pubmed
3) Directement dans la barre de
recherche simple

31. La veille dans Pubmed : services
personnalisés
Low-flying harrier – Wolfpix – CC-BY-SA flickr

32. My NCBI : votre Pubmed
personnalisé
 Ouvrir un compte sur My NCBI
 « Sign in »
 « Register for an account »

33. Paramétrer dans votre
compte les filtres suivants
 Anglais
 Français
 Texte intégral gratuit
 BU Santé Brest

34. Filtre « BU Santé Brest »

35. Icône UBO pour l'accès
direct au texte intégral

36. Exercice
2 - Les troubles des comportements
alimentaires chez la femme enceinte
Limiter aux 5 dernières années de parution

37. Exercice
3. Les effets indésirables du déclenchement du
travail obstétrical
Limiter aux essais cliniques

38. Exercice
4 - Le traitement du diabète gestationnel. Exclure les
traitements médicamenteux .
Limiter aux recommandations de bonne pratique
publiées ces deux dernières années

39. Du problème de la veille
équation de recherche ≠ équation de veille

40. Des mots MESH ?
.
Ne contient pas de
mots MESH
Contient des mots MESH

41. Exercice
4 - Trouvez les articles les plus récents
sur le diagnostic de la
mucoviscidose
(sans utiliser les mots Mesh)

42. Solution : le champ
Title/abstract ou [tiab]
« cystic
fibrosis/diagnosis »[Mesh]
Équation de recherche
(pour des résultats les plus
pertinents possibles)
(« cystic fibrosis »[tiab] OR
« mucoviscidosis »[tiab]OR
« fibrocystic disease »[tiab])
AND diagnos*[tiab]
Équation de veille
(pour des articles récents / pas
forcément aussi pertinents)

43. Créer une alerte dans MyNCBI

45. Retrouvez le support en
ligne sur
http://petitlien.fr/sma4