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Perrine Helly - Service Commun de Documentation - UBO 
BU Santé 
Medline via l’interface 
Pubmed 
SMa4 – septembre 2014
Objectifs de la séance 
 Connaître les principes de constitution de la 
base Medline 
 Se repérer dans Pubmed 
 Savoir effectuer une requête pertinente dans 
la base 
 Savoir mettre en place des alertes sur un 
thème
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français 
 Précisez votre recherche en ne 
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littérature
Types d'articles : rappel 
 Case report / étude de cas 
 Clinical Trial / essai clinique 
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Exercices 
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descripteurs/qualificatifs correspondant : 
 le diagnostic de la prééclampsie 
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1- Rechercher les affiliations 
descripteurs/qualificatifs correspondant : 
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Pubmed sma4-sept14

  • 1. 1 Perrine Helly - Service Commun de Documentation - UBO BU Santé Medline via l’interface Pubmed SMa4 – septembre 2014
  • 2. Objectifs de la séance  Connaître les principes de constitution de la base Medline  Se repérer dans Pubmed  Savoir effectuer une requête pertinente dans la base  Savoir mettre en place des alertes sur un thème
  • 3. Medline, quelques principes Spots – Loop_oh Flickr CC-BY-SA
  • 4. Ne pas confondre Medline ≠ Pubmed Le contenu (la base de données) L'interface d'interrogation
  • 5. Bases de données  Un éditeur privé ou un organisme institutionnel  Un référencement humain  Un thésaurus organisé  Une interface d'interrogation
  • 6. Medline  Qui?  Quoi? National Library of Medicine Etats-Unis) 20 M de références d'articles biomédicaux, issues de 5200 périodiques depuis 1948  Thésaurus MESH  Interface PUBMED (il en existe d'autres)
  • 7. Pubmed, quelques repères (interface web) Compass Study – Calsidyrose – Flickr CC-BY
  • 8. Vos premiers pas dans Pubmed  Recherche libre sur la grippe H1N1 chez les femmes enceintes http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed
  • 9. Présentation de la liste des résultats
  • 10. Quelques filtres  Triez vos résultats pour n'afficher que les articles écrits en anglais ou en français  Précisez votre recherche en ne sélectionnant que les revues de la littérature
  • 11. Types d'articles : rappel  Case report / étude de cas  Clinical Trial / essai clinique  Randomized Controlled Trial / essai clinique en aveugle avec groupe contrôle  Practice guideline / recommandation de bonne pratique  Review / revue de la littérature  Systematic Review / revue systématique  Meta-analysis / méta-analyse (Cochrane)
  • 12. Pour des recherches fines : le Mesh Needle and Thread – Incurable Hippie – Flickr CC-BY-NC
  • 13. S'il te plaît, dessine-moi... ...un thésaurus Vocabulaire normalisé Descripteurs Hiérarchie
  • 14. Plusieurs synonymes, un seul descripteur officiel Syndrome, Down Down's Syndrome Downs Syndrome Syndrome, Down's Mongolism Trisomy 21 Trisomy 21, Meiotic Nondisjunction Trisomy 21, Mitotic Nondisjunction Down Syndrome, Partial Trisomy 21 Partial Trisomy 21 Down Syndrome Down Syndrome
  • 15. Le thésaurus de Medline : le MeSH Medical Subject Headings (uniquement en anglais)
  • 16. Les mots-clefs Medline peuvent être enrichis par des « sous-mot-clefs » Heading/Subheading = Descripteur/Qualificatif = Mot-clef/Sous-mot-clef
  • 17. Les opérateurs booléens . A/B A du point de vue de B Sur Pubmed seulement
  • 18. Le MESH  Descripteurs (>25 000)  Qualificatifs (83)  « L'affiliation Descripteur / Qualificatif est la clé de l'interrogation de Medline »* *(citation de Philippe Eveillard dans « Comment faire ses premiers pas sur Pubmed » La Revue du praticien. Médecine générale A. 2007, n° 766-67, pp. 411-412)
  • 19. Recherche libre vs. Équation de recherche Les facteurs environnementaux de la sclérose en plaques multiple sclerosis environmental factors 1320 résultats – pas tous pertinents Multiple Sclerosis/etiology"[Mesh] AND environment[Mesh] 387 résultats pertinents
  • 20. Exemple de résultat non-pertinent : la requête a porté indifféremment sur toutes les parties de la notice Source : Georges Beuzet, BU Santé Brest
  • 21. Un exemple de recherche Articles en français et en anglais sur le toucher dans la relation soignant-soigné publiés les 10 dernières années
  • 22. Un exemple de recherche Articles en français et en anglais sur le toucher dans la relation soignant-soigné publiés les 10 dernières années "Touch"[Mesh] AND "Professional-Patient Relations"[Mesh] + Filters : English, French, published in the last 10 years
  • 23. Exemple de résultat pertinent: la requête a porté exclusivement sur la partie « mots MESH » de la notice
  • 24. Correspondances Mesh français – Mesh anglais => « Portail terminologique de santé » (CISMEF) http://pts.chu-rouen.fr/ Ou => « Mesh bilingue de l’INSERM » : http://mesh.inserm.fr/mesh/
  • 25. Bref « Une recherche bibliographique ne se fait pas dans les couloirs de l’hôpital ou entre 2 stations de métro avec son smartphone ou sa tablette. » Philippe Eveillard Love & Mathematics – Lost Archetype – CC BY-NC-SA sur Flickr
  • 26. Exercices 1- Rechercher les affiliations descripteurs/qualificatifs correspondant :  le diagnostic de la prééclampsie  les effets indésirables de la césarienne
  • 27. Réponses 1- Rechercher les affiliations descripteurs/qualificatifs correspondant :  au diagnostic de la prééclampsie "pre-eclampsia/diagnosis"[Mesh]  aux effets indésirables de la césarienne "Cesarean section/adverse effects"[Mesh]
  • 28. 3 façons d'entrer une requête dans Pubmed 1)À partir d'un mots-clef MESH ( boîte d'équation de recherche et rebond)
  • 29. 3 façons d'entrer une requête dans Pubmed 2) À partir du moteur de recherche avancée (« Advanced »)
  • 30. 3 façons d'entrer une requête dans Pubmed 3) Directement dans la barre de recherche simple
  • 31. La veille dans Pubmed : services personnalisés Low-flying harrier – Wolfpix – CC-BY-SA flickr
  • 32. My NCBI : votre Pubmed personnalisé  Ouvrir un compte sur My NCBI  « Sign in »  « Register for an account »
  • 33. Paramétrer dans votre compte les filtres suivants  Anglais  Français  Texte intégral gratuit  BU Santé Brest
  • 34. Filtre « BU Santé Brest »
  • 35. Icône UBO pour l'accès direct au texte intégral
  • 36. Exercice 2 - Les troubles des comportements alimentaires chez la femme enceinte Limiter aux 5 dernières années de parution
  • 37. Exercice 3. Les effets indésirables du déclenchement du travail obstétrical Limiter aux essais cliniques
  • 38. Exercice 4 - Le traitement du diabète gestationnel. Exclure les traitements médicamenteux . Limiter aux recommandations de bonne pratique publiées ces deux dernières années
  • 39. Du problème de la veille équation de recherche ≠ équation de veille
  • 40. Des mots MESH ? . Ne contient pas de mots MESH Contient des mots MESH
  • 41. Exercice 4 - Trouvez les articles les plus récents sur le diagnostic de la mucoviscidose (sans utiliser les mots Mesh)
  • 42. Solution : le champ Title/abstract ou [tiab] « cystic fibrosis/diagnosis »[Mesh] Équation de recherche (pour des résultats les plus pertinents possibles) (« cystic fibrosis »[tiab] OR « mucoviscidosis »[tiab]OR « fibrocystic disease »[tiab]) AND diagnos*[tiab] Équation de veille (pour des articles récents / pas forcément aussi pertinents)
  • 43. Créer une alerte dans MyNCBI
  • 44.
  • 45. Retrouvez le support en ligne sur http://petitlien.fr/sma4