CoViD19: un éclairage sur les coronavirus et les fondements de la RT-PCRYvon Gervaise
Publication de Yvon Gervaise dans les annales de la SECF (Societe des Experts Chimistes de France ) N° 992 juin 2020 cette communication a pour propos un éclairage sur les Coronavirus et en particulier sur l’un d’eux le SRAS-CoV 2 responsable de la pandémie actuelle CoViD-19. Cet éclairage est celui d’un expert-chimiste et homme de laboratoire.
Je me suis donc attaché à montrer la genèse des techniques de biologie moléculaire, discipline dans laquelle des chimistes ont joué un rôle de premier plan.
Au-delà d’un regard émerveillé sur les mécanismes moléculaires à l’oeuvre dans le vivant, j’ai aussi essayé de vous faire entrevoir les bases technico-scientifiques de la technique d’analyse RT-PCR à l’oeuvre dans les laboratoires pour détecter le Coronavirus
ce cours de systématique virale s'adresse aux étudiants de graduation de médecine et de pharmacie et s'intéresse a la famille des coronaviridae , famille importante notamment en matières de virus émergeant
Candidats vaccins, leurs anticorps et la protection contre le paludisme - Présentation de la 5e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Abdou Razack SAFIOU - Médecin - Ministère de la Santé / PNLP - Libreville, Gabon - safiouabdourazack@yahoo.fr
Interaction entre espèces dans les infections mixtes - Présentation de la 3e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - RAHARIMANGA Rakotoson - Service de Lutte contre le Paludisme - Madagascar - Direction des Urgences et de la Lutte contre les Maladies Transmissibles MinSanPF IHS Analakely B.P. 460 - Chef de la Section Entomologie - raharimangar@caramail.com
Mobilité humaine et transfert de plasmodies - Présentation de la 7e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Ngamada François - Tchad - ngama_franc@yahoo.fr
CoViD19: un éclairage sur les coronavirus et les fondements de la RT-PCRYvon Gervaise
Publication de Yvon Gervaise dans les annales de la SECF (Societe des Experts Chimistes de France ) N° 992 juin 2020 cette communication a pour propos un éclairage sur les Coronavirus et en particulier sur l’un d’eux le SRAS-CoV 2 responsable de la pandémie actuelle CoViD-19. Cet éclairage est celui d’un expert-chimiste et homme de laboratoire.
Je me suis donc attaché à montrer la genèse des techniques de biologie moléculaire, discipline dans laquelle des chimistes ont joué un rôle de premier plan.
Au-delà d’un regard émerveillé sur les mécanismes moléculaires à l’oeuvre dans le vivant, j’ai aussi essayé de vous faire entrevoir les bases technico-scientifiques de la technique d’analyse RT-PCR à l’oeuvre dans les laboratoires pour détecter le Coronavirus
ce cours de systématique virale s'adresse aux étudiants de graduation de médecine et de pharmacie et s'intéresse a la famille des coronaviridae , famille importante notamment en matières de virus émergeant
Candidats vaccins, leurs anticorps et la protection contre le paludisme - Présentation de la 5e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Abdou Razack SAFIOU - Médecin - Ministère de la Santé / PNLP - Libreville, Gabon - safiouabdourazack@yahoo.fr
Interaction entre espèces dans les infections mixtes - Présentation de la 3e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - RAHARIMANGA Rakotoson - Service de Lutte contre le Paludisme - Madagascar - Direction des Urgences et de la Lutte contre les Maladies Transmissibles MinSanPF IHS Analakely B.P. 460 - Chef de la Section Entomologie - raharimangar@caramail.com
Mobilité humaine et transfert de plasmodies - Présentation de la 7e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Ngamada François - Tchad - ngama_franc@yahoo.fr
Cycles des Plasmodium : Phase sexuée chez l'anophèle - Présentation du 4e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Germaine RETOFA - Médecin - Ministère de la Santé et du Planning Familial - Service de Lutte Contre le Paludisme, Madagascar
l'alimentation et transmission de Sars-Cov 2malikafettouch
Les enjeux de transmission et la propagation des maladies
, l'alimentation et transmission des coronavirus , Mauvaises habitudes alimentaires et propagation de virus
Vaccin contre le paludisme: pour une recherche de " vaccin anti-maladie" - Présentation de la 7e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Andrianasolo Rado et Ngamada François
Le S.I.D.A - Des Sciences fondamentales à la clinique Abdelatif KAHLOULA
Cette présentation, 1ère d'une série de deux, Aborde la question du Syndrome d'ImmunoDéficience Humaine sur les deux volets l'immunologie et de la virologie. Destinée aux étudiant de médecine en cycle clinique, elle a pour objectif de reprendre les aspects fondamentaux de cette thématique à savoir l'étude du HIV, agent responsable de ce syndrome, ainsi que le mécanisme d'installation et d'entretien de cette infection.
L'infection palustre est fonction de l'âge et du niveau de transmission; quel est le rôle de l'immunité? - Présentation de la 2e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - AHMED Haoudhoit - MINISTERE de la SANTE de l'UNION des COMORES - Chargée du laboratoire au CSK de Mvouni - haoumed@hotmail.com
ce cours est destiné aux étudiants graduant en médecine et en pharmacie. il résume les aspects épidémiologiques, cliniques, diagnostic et thérapeutiques relatifs a l'infection par le virus de l'immunodéficience humaine
les manifestaions cliniques sont polymorphes bien au delà de la sphère respiratoire comme on le pensait au début de la pandémie.
cet présentation est état des lieux sur le sujet
(Draft) Bacterial Zoonoses and Brucellosis / (brouillon)Zoonoses bacteriennes...Dr Taoufik Djerboua
DONT FORGET ! you can translate this document to your own language with online whole document translation tools! like and share the knowledge , let me know about your thoughts and ask any questions i'll be happy to answer them
This document is destined to graduation students in medical sciences. it adresses a very important topic : Zoonoses.
this document is a ctually a draft, yet it explains most aspects related to diseases inter-transmitted between humans and animals , also are explained the main lines on bio-terrorism and emerging disease. an example or a major zoonose is presented : Brucellosis with its epidemiology , diagnonsis and treatment.
ce document s'adresse aux étudiants graduant en sciences médicales et biologiques et est une ébauche sur les zoonoses et leurs impact majeur sur la santé humaine et environnementale.. il définit aussi lignes majeurs en matière de maladies émergentes et de bioterrorisme. enfin un exemple est étudié en détail qui n'est nul autre au la Brucellose.
Cet article vise à présenter les vraies causes des pandémies en se basant sur l'opinion d'experts et à montrer comment les prévenir à l'avenir. L'opinion dominante de ces experts est que l'humanité devra opérer de profonds changements dans sa relation avec la nature pour empêcher de nouvelles pandémies qui menacent son existence même.
Eclairage sur la variole du singe : mode de transmission, symptômes et prise ...Khadija Moussayer
La variole du singe est due à un virus relevant de
la même famille que celui de la variole humaine,
éradiquée depuis 40 ans grâce à une campagne
de vaccination mondiale. Le virus est endémique
dans certains pays d’Afrique : des cas sont observés
sporadiquement chez l’Homme dans des régions
d’Afrique centrale et occidentale, près des forêts
tropicales humides où les contacts entre l’Homme et
les animaux infectés sont fréquents. La présentation
clinique de la maladie est semblable à celle observée
chez les patients atteints autrefois de la variole. A partir de divers animaux sauvages, l’infection
humaine est provoquée par un contact direct avec
du sang, des liquides biologiques ou des lésions
cutanées ou muqueuses d’animaux infectés. Elle
peut être également contractée suite à une morsure
ou une griffure. L’ingestion de viande d’animaux
infectés insuffi samment cuite paraît également être
un facteur de risque.
La propagation secondaire interhumaine est limitée,
se produisant principalement par les particules des
gouttelettes respiratoires et nécessitant un contact
face à face prolongé.La variole du singe est une maladie à tropisme
cutané. Les manifestations cliniques sont analogues
à celles de la variole, mais plus légères avec un risque
de mortalité très faible. Rappelons que la variole
humaine pouvait tuer jusqu’à 1/3 des personnes !
Les symptômes apparaissent après une phase de
latence moyenne de 6 à 16 jours après l’infection,
mais pouvant se prolonger jusqu’à 21 jours. Dans
les 5 premiers jours, l’infection provoque plusieurs
symptômes commençant par une fi èvre, souvent
forte, accompagnée de maux de tête, de douleurs
musculaires et de courbatures. Par la suite, après
environ 1 à 3 jours suivant l’apparition de la fi èvre,
survient une éruption cutanée sous forme de rash
débutant souvent sur le visage puis s’étendant à
d’autres parties du corps, dont les paumes des mains,
les plantes des pieds et les muqueuses (bouche et
région génitale). Les bulles se concentrent plutôt sur
le visage, les paumes des mains et les plantes des
pieds. Les personnes infectées doivent rester isolées jusqu’à
la guérison complète de leur éruption cutanée, en
évitant notamment tout contact avec des personnes
immunodéprimées et des animaux domestiques.
Il faut s’abstenir de toute activité sexuelle et de
tout contact physique étroit jusqu’à la guérison de
l’éruption cutanée.
Le traitement de la maladie est notamment
symptomatique : désinfection des lésions, administration
d’antibiothérapie en cas de surinfection, réhydratation.
Aucun traitement ou vaccin spécifi que à la variole du
singe n’a été encore développé, quoique certaines
molécules antivirales, notamment le tecovirimat,
soient actuellement en cours d’évaluation. On utilise
pour le moment le même vaccin que celui contre la
variole humaine.
L’épidémie actuelle causée par la variole n’est pas
inquiétante : aucun cas grave n’a été recensé pour le
moment
Cycles des Plasmodium : Phase sexuée chez l'anophèle - Présentation du 4e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Germaine RETOFA - Médecin - Ministère de la Santé et du Planning Familial - Service de Lutte Contre le Paludisme, Madagascar
l'alimentation et transmission de Sars-Cov 2malikafettouch
Les enjeux de transmission et la propagation des maladies
, l'alimentation et transmission des coronavirus , Mauvaises habitudes alimentaires et propagation de virus
Vaccin contre le paludisme: pour une recherche de " vaccin anti-maladie" - Présentation de la 7e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Andrianasolo Rado et Ngamada François
Le S.I.D.A - Des Sciences fondamentales à la clinique Abdelatif KAHLOULA
Cette présentation, 1ère d'une série de deux, Aborde la question du Syndrome d'ImmunoDéficience Humaine sur les deux volets l'immunologie et de la virologie. Destinée aux étudiant de médecine en cycle clinique, elle a pour objectif de reprendre les aspects fondamentaux de cette thématique à savoir l'étude du HIV, agent responsable de ce syndrome, ainsi que le mécanisme d'installation et d'entretien de cette infection.
L'infection palustre est fonction de l'âge et du niveau de transmission; quel est le rôle de l'immunité? - Présentation de la 2e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - AHMED Haoudhoit - MINISTERE de la SANTE de l'UNION des COMORES - Chargée du laboratoire au CSK de Mvouni - haoumed@hotmail.com
ce cours est destiné aux étudiants graduant en médecine et en pharmacie. il résume les aspects épidémiologiques, cliniques, diagnostic et thérapeutiques relatifs a l'infection par le virus de l'immunodéficience humaine
les manifestaions cliniques sont polymorphes bien au delà de la sphère respiratoire comme on le pensait au début de la pandémie.
cet présentation est état des lieux sur le sujet
(Draft) Bacterial Zoonoses and Brucellosis / (brouillon)Zoonoses bacteriennes...Dr Taoufik Djerboua
DONT FORGET ! you can translate this document to your own language with online whole document translation tools! like and share the knowledge , let me know about your thoughts and ask any questions i'll be happy to answer them
This document is destined to graduation students in medical sciences. it adresses a very important topic : Zoonoses.
this document is a ctually a draft, yet it explains most aspects related to diseases inter-transmitted between humans and animals , also are explained the main lines on bio-terrorism and emerging disease. an example or a major zoonose is presented : Brucellosis with its epidemiology , diagnonsis and treatment.
ce document s'adresse aux étudiants graduant en sciences médicales et biologiques et est une ébauche sur les zoonoses et leurs impact majeur sur la santé humaine et environnementale.. il définit aussi lignes majeurs en matière de maladies émergentes et de bioterrorisme. enfin un exemple est étudié en détail qui n'est nul autre au la Brucellose.
Cet article vise à présenter les vraies causes des pandémies en se basant sur l'opinion d'experts et à montrer comment les prévenir à l'avenir. L'opinion dominante de ces experts est que l'humanité devra opérer de profonds changements dans sa relation avec la nature pour empêcher de nouvelles pandémies qui menacent son existence même.
Eclairage sur la variole du singe : mode de transmission, symptômes et prise ...Khadija Moussayer
La variole du singe est due à un virus relevant de
la même famille que celui de la variole humaine,
éradiquée depuis 40 ans grâce à une campagne
de vaccination mondiale. Le virus est endémique
dans certains pays d’Afrique : des cas sont observés
sporadiquement chez l’Homme dans des régions
d’Afrique centrale et occidentale, près des forêts
tropicales humides où les contacts entre l’Homme et
les animaux infectés sont fréquents. La présentation
clinique de la maladie est semblable à celle observée
chez les patients atteints autrefois de la variole. A partir de divers animaux sauvages, l’infection
humaine est provoquée par un contact direct avec
du sang, des liquides biologiques ou des lésions
cutanées ou muqueuses d’animaux infectés. Elle
peut être également contractée suite à une morsure
ou une griffure. L’ingestion de viande d’animaux
infectés insuffi samment cuite paraît également être
un facteur de risque.
La propagation secondaire interhumaine est limitée,
se produisant principalement par les particules des
gouttelettes respiratoires et nécessitant un contact
face à face prolongé.La variole du singe est une maladie à tropisme
cutané. Les manifestations cliniques sont analogues
à celles de la variole, mais plus légères avec un risque
de mortalité très faible. Rappelons que la variole
humaine pouvait tuer jusqu’à 1/3 des personnes !
Les symptômes apparaissent après une phase de
latence moyenne de 6 à 16 jours après l’infection,
mais pouvant se prolonger jusqu’à 21 jours. Dans
les 5 premiers jours, l’infection provoque plusieurs
symptômes commençant par une fi èvre, souvent
forte, accompagnée de maux de tête, de douleurs
musculaires et de courbatures. Par la suite, après
environ 1 à 3 jours suivant l’apparition de la fi èvre,
survient une éruption cutanée sous forme de rash
débutant souvent sur le visage puis s’étendant à
d’autres parties du corps, dont les paumes des mains,
les plantes des pieds et les muqueuses (bouche et
région génitale). Les bulles se concentrent plutôt sur
le visage, les paumes des mains et les plantes des
pieds. Les personnes infectées doivent rester isolées jusqu’à
la guérison complète de leur éruption cutanée, en
évitant notamment tout contact avec des personnes
immunodéprimées et des animaux domestiques.
Il faut s’abstenir de toute activité sexuelle et de
tout contact physique étroit jusqu’à la guérison de
l’éruption cutanée.
Le traitement de la maladie est notamment
symptomatique : désinfection des lésions, administration
d’antibiothérapie en cas de surinfection, réhydratation.
Aucun traitement ou vaccin spécifi que à la variole du
singe n’a été encore développé, quoique certaines
molécules antivirales, notamment le tecovirimat,
soient actuellement en cours d’évaluation. On utilise
pour le moment le même vaccin que celui contre la
variole humaine.
L’épidémie actuelle causée par la variole n’est pas
inquiétante : aucun cas grave n’a été recensé pour le
moment
Apports respectifs des mesures de taux d'incidence et de la prévalence: illustration dans divers faciès épidémiologiques - Présentation de la 5e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Eugène MANZINGO - Médecin - Ministère de la Santé / Inspection de la Santé - Mbandaka, RDC - eumanzi@yahoo.fr
Intérêt des mesures de la morbidité liée au paludisme - Présentation de la 6e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - LABOUDI Majda - Biologiste - Maroc - majdouline4@hotmail.com
Cet atlas de poche couvre en 320 pages et 500 photos, tout ce qu’un étudiant doit savoir en microbiologie. Il explique clairement tout ce qu’il faut comprendre sur les agents pathogènes pour l’homme et les moyens d’identifier les bactéries, virus, champignons et parasites qu’il convient de connaître en médecine humaine.
Similaire à Coronavirus sur des surfaces inertes : temps de présence et méthodes d'élimination (20)
The COVID-19 situation in France and Normandy is worsening, with a 17% increase in cases nationally and 15% in Normandy over a recent one-week period. Hospitalizations increased by 55% nationally and 53% in Normandy for those over 20 years old. Intensive care admissions also rose substantially. The Delta variant now represents over 90% of cases. With more infections come greater risks of further virus mutations, highlighting the importance of vaccination to limit opportunities for the virus to spread and mutate.
L'incertitude sur l'efficacité de la chloroquine dans le traitement du covid et ses risques arythmogène est-elle levée par l'étude publiée dans le Lancet ?
L'invagination intestinale aiguë se présente souvent sous des formes incomplètes ou intégrée à d'autres tableaux cliniques. Connaitre les formes inhabituelles permet d'accélérer la prise en charge.
Coronavirus sur des surfaces inertes : temps de présence et méthodes d'élimination
1. Source :
Kampf G,Todt D, Pfaender S, Steinmann E. Persistence of coronaviruses on
inanimate surfaces and their inactivation with biocidal agents. Journal of
Hospital Infection. mars 2020;104(3):246-51.
PERSISTANCE DU CORONAVIRUS
SUR DES SURFACES INERTES ET
INACTIVATION PAR LESAGENTS
DÉSINFECTANTS
Image par iXimus de Pixabay
Dr Pascal Boulet. 2020
2. SARS-CoV-2
■ Coronavirus : 3000 espèces référencés dans GenBank en 2007
■ Epidémie mondiale depuis décembre 2019 , par le COVID-19 = SARS-CoV-2
■ Virus connus depuis 1930 avec capacité
– de mutations.Concordance génétique avec le :
■ SARS-CoV : 79%
■ MERS-CoV : 50%
– de transmissions inter–espèces. Réservoir : identification de 2 espèces de serpents mais pas de
preuve cohérente de réservoirs autres que des mammifères et des oiseaux avec le pangolin comme
hôte intermédiaire
■ Identification chez l’homme dans les années 60
■ 5 coronavirus infectent l’homme en 2009 :Transmission inter-humaine
Vabret A, Dina J, Brison E, Brouard J, Freymuth F. Coronavirus humains (HCoV). Pathologie Biologie.
mars 2009;57(2):149-60.
Kin N, Vabret A. Les infections à coronavirus humains. Revue Francophone des Laboratoires. déc
2016;2016(487):25-33
Tang X, Wu C, Li X, Song Y, Yao X, Wu X, et al. On the origin and continuing evolution of SARS-CoV-2.
National Science Review. 3 mars 2020;nwaa036.
4. Survie du virus sur différentes surfaces
■ Rappel : 1 ml de sécrétions contient environ 108 copies virales.
■ Si la transmission aérienne entre 1 et 3 m et sa suspension prolongée dans l’air ambiant sont
connues, sa propagation est possible à partir de surfaces inertes contenant des sécrétions
nasales, oculaires et buccales.
■ Le transfert d’une charge virale entre la surface contaminée et la main dépend du type de
virus et du temps de contact: 5 secondes de contact suffisent pour transférer 31,6% de la
charge virale du virus InfluenzaeA sur une main posée sur une surface contaminée.
■ La durée de contagiosité du Covid-19 déposé sur des surfaces inertes est inconnue.
■ Une estimation est produite à partir des coronavirus connus tels le SARS-CoV apparu en
2002 et le MERS-CoV en 2012 qui persiste dans la péninsule arabe et surtout la souche
endémique de coronavirus humain ( HCoV-229E).
■ La durée de survie est variable selon le support et la souche virale étudiée
Kampf G. Potential role of inanimate surfaces for the spread of coronaviruses and their inactivation with disinfectant agents. Infection Prevention in Practice. juin 2020;2(2):100044.
Bean B, Moore BM, Sterner B, Peterson LR, Gerding DN, Balfour HH. Survival of Influenza Viruses on Environmental Surfaces. Journal of Infectious Diseases. 1 juill 1982;146(1):47-51.
6. Survie du coronavirus selon les conditions
■ Les supports contaminés par une personne atteinte du Covid-19 sont multiples. Une étude a
mis en évidence la présence de Covid-19 :
– dans les cuvettes des toilettes laissant penser à une possible excrétion virale dans les selles;
– Sur les grilles d’aération dans un espace ventilé
■ Selon le support : survie moyenne de 5 J à 21 °C avec un inoculum entre 103 et 107
■ La durée de survie augmente avec une concentration plus importante.
■ Une température plus élevée de l’ordre de 30 ou 40° réduit la survie de différents coronavirus
comme le MERS-CoV à quelques heures. A contrario, une température inférieure à 20°
favorise son maintien jusqu’à 9 J.
■ La persistance du HCoV-229Eest plus importante pour un taux d’humidité de 50% par rapport
à un taux de 30%.
Ong SWX, Tan YK, Chia PY, Lee TH, Ng OT, Wong MSY, et al. Air, Surface Environmental, and Personal Protective Equipment
Contamination by Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) From a Symptomatic Patient. JAMA [Internet]. 4
mars 2020 [cité 8 mars 2020]; Disponible sur: https://jamanetwork.com/journals/jama/fullarticle/2762692
7. Inactivation du coronavirus
■ Les agents désinfectants les plus utilisés sont :
– le perxoyde d’hydrogène (H2O2) ou eau oxygénée,
– l’alcool (éthanol) à 70%
– l’hypochlorite de sodium (NaClO) : eau deJavel à la dilution de 1/50
– le chlorure de benzalkonium, antiseptique mais à risque d’allergie
Agent Concentration Virus Temps
d’exposition
Réduction du potentiel
infectieux (log10)
Ethanol 70% HCoV 229E 1mn > 3
Chlorure de
benzalkonium
0,04%
HCoV 229E 1mn
<3
Hypochlorite de
sodium
0,1% HCoV 229E 1mn >3
0,01% HCoV 229E 1mn <3
Peroxyde
d’hydrogène
Sous forme de
vapeur
TEGV 2-3 h 4,9-5,3
8. Conclusion
• Persistance prolongée du virus jusqu’à 5 j en moyenne voire 9 J sur
diverses surfaces
• Survie prolongée
à basse température
Avec un fort taux d‘humidité
• Désinfection :
Alcool à 70%
Eau de Javel dilution 1/50