Effet de l'urbanisation sur la variabilité phénotypique d'une espèce de fourm...Silvère Jarrosson
Silvère Jarrosson, Rapport de recherche pour l'IEES de Paris et l'Université Pierre et Marie Curie (Paris). Mai 2015. Cette étude entend déterminer l'impact que l'urbanisation peut avoir sur le phénotype de Temnothorax nylanderi, une espèce de fourmi commune connue pour avoir une forte plasticité phénotypique. La taille des organismes ectothermes étant très sensible aux facteurs météorologiques, nous avons mesuré ces paramètres dans des environnements urbains et ruraux, pour déterminer l'impact qu'ils ont sur les fourmis dans ces deux types de milieu. Plus de 2400 fourmis ont été collectées sur six sites de la région parisienne (trois urbains et trois ruraux) et le climat de ces sites de récolte a été caractérisé par des données de Météo France et par des capteurs micro-climatiques laissés sur place pendant deux semaines. La taille des fourmis a été estimée indirectement en mesurant la largeur de leur tête, qui est connue pour être un bon estimateur. Nos résultats montrent que les fourmis urbaines sont effectivement légèrement plus petites que les fourmis rurales , mais cette différence est grandement masquée par une variance très élevée, liée au site de récolte et que nous n'expliquons pas. Cette variance est apparue comme nettement plus élevée en milieu urbain, tandis que l'étude des reines a permis de montrer le compromis qu'elles opèrent entre adaptation et dispersion. Enfin, cette étude a permis de prouver que les sondes micro-climatiques sont indispensables pour caractériser de façon pertinente le micro-climat dans lequel évoluent les hexapodes. Ces résultats encore incomplets mériteraient une investigation plus profonde, avec notamment un relevé des données météorologiques plus long et sur un plus grand nombre de sites.
Présentation des résultats de mon stage de master 2 (diaporama revu pour la FRB) sur l'impact des herbiers de jussie sur les communautés de phytoplancton et de zooplancton.
Impact de la gestion par arrachage de la jussie sur le zooplancton et le phyt...AugustinSoulard
Oral de stage de master 2 de Augustin Soulard. Stage mené à l'UMR ECOBIO, financé par la FRB et co-encadré par Gabrielle Thiébaut et Alexandrine Pannard.
La biodiversité joue un rôle prépondérant dans le bien-être humain, notamment à travers son impact sur la santé et la fourniture de matières premières.
Or, les activités humaines entraînent bien souvent des pertes irréversibles en termes de diversité de vie sur Terre, pertes qui ont été plus rapides au cours de ces 50 dernières années qu’à n’importe quelle autre période de l’histoire humaine.
Quels sont les facteurs responsables de cette perte rapide de biodiversité? Comment ralentir cette tendance?
Restauration de Scorzonera humilis au LuxembourgCélia Stutz
réhabilitation : restauration totale mais dont l’objectif final va être de remettre l’écosystème sur une trajectoire proche de l’écosystème de référence pour qu’il puisse lui-même retrouver la trajectoire vers l’écosystème de référence.
But : réparer les processus, rétablir la productivité chez les populations de scorsonères
Utiliser des plantes locales pour la restauration ?
Notion de localité : si une plante pousse dans différents habitats au sein d’une même région, la provenance locale n’est pas forcément le bon choix.
Avantage : génotypes des plantes réintroduites adaptés au site de réintroduction.
Inconvénient : peut nuire à la diversité génétique des populations.
ici c’est plutôt une gestion du milieu, des populations existantes, on a peu de possibilité de créer de nouvelles populations par manque de terrain disponible.
Transfert de foin : appliqué sur les écosystèmes prairiaux, prélèvement des inflorescences à maturité. Transfert de communautés. Transfert de graines, de matière organique et surtout des conditions abiotiques : Le foin sur le sol apporte de la matière qui produit un ombrage, conserve l’humidité.
inbreeding depression = perte de diversité génétique est telle que la population se collapse.
Outbreeding depression :
apport très important de gènes adaptés à une localité dans une autre population d’une autre localité. Les gènes adaptés de la population vont être remplacés par ces nouveaux gènes, ce qui va provoquer un déclin de la population par perte de l’adaptation qu’elle avait acquise.
Ce phénomène peut aussi être causé par une panne de compatibilité biochimique ou physiologique entre les gènes dans les différentes populations.
Ce phénomène se remarque malheureusement dans certains cas de réintroduction.
Effet de l'urbanisation sur la variabilité phénotypique d'une espèce de fourm...Silvère Jarrosson
Silvère Jarrosson, Rapport de recherche pour l'IEES de Paris et l'Université Pierre et Marie Curie (Paris). Mai 2015. Cette étude entend déterminer l'impact que l'urbanisation peut avoir sur le phénotype de Temnothorax nylanderi, une espèce de fourmi commune connue pour avoir une forte plasticité phénotypique. La taille des organismes ectothermes étant très sensible aux facteurs météorologiques, nous avons mesuré ces paramètres dans des environnements urbains et ruraux, pour déterminer l'impact qu'ils ont sur les fourmis dans ces deux types de milieu. Plus de 2400 fourmis ont été collectées sur six sites de la région parisienne (trois urbains et trois ruraux) et le climat de ces sites de récolte a été caractérisé par des données de Météo France et par des capteurs micro-climatiques laissés sur place pendant deux semaines. La taille des fourmis a été estimée indirectement en mesurant la largeur de leur tête, qui est connue pour être un bon estimateur. Nos résultats montrent que les fourmis urbaines sont effectivement légèrement plus petites que les fourmis rurales , mais cette différence est grandement masquée par une variance très élevée, liée au site de récolte et que nous n'expliquons pas. Cette variance est apparue comme nettement plus élevée en milieu urbain, tandis que l'étude des reines a permis de montrer le compromis qu'elles opèrent entre adaptation et dispersion. Enfin, cette étude a permis de prouver que les sondes micro-climatiques sont indispensables pour caractériser de façon pertinente le micro-climat dans lequel évoluent les hexapodes. Ces résultats encore incomplets mériteraient une investigation plus profonde, avec notamment un relevé des données météorologiques plus long et sur un plus grand nombre de sites.
Présentation des résultats de mon stage de master 2 (diaporama revu pour la FRB) sur l'impact des herbiers de jussie sur les communautés de phytoplancton et de zooplancton.
Impact de la gestion par arrachage de la jussie sur le zooplancton et le phyt...AugustinSoulard
Oral de stage de master 2 de Augustin Soulard. Stage mené à l'UMR ECOBIO, financé par la FRB et co-encadré par Gabrielle Thiébaut et Alexandrine Pannard.
La biodiversité joue un rôle prépondérant dans le bien-être humain, notamment à travers son impact sur la santé et la fourniture de matières premières.
Or, les activités humaines entraînent bien souvent des pertes irréversibles en termes de diversité de vie sur Terre, pertes qui ont été plus rapides au cours de ces 50 dernières années qu’à n’importe quelle autre période de l’histoire humaine.
Quels sont les facteurs responsables de cette perte rapide de biodiversité? Comment ralentir cette tendance?
Restauration de Scorzonera humilis au LuxembourgCélia Stutz
réhabilitation : restauration totale mais dont l’objectif final va être de remettre l’écosystème sur une trajectoire proche de l’écosystème de référence pour qu’il puisse lui-même retrouver la trajectoire vers l’écosystème de référence.
But : réparer les processus, rétablir la productivité chez les populations de scorsonères
Utiliser des plantes locales pour la restauration ?
Notion de localité : si une plante pousse dans différents habitats au sein d’une même région, la provenance locale n’est pas forcément le bon choix.
Avantage : génotypes des plantes réintroduites adaptés au site de réintroduction.
Inconvénient : peut nuire à la diversité génétique des populations.
ici c’est plutôt une gestion du milieu, des populations existantes, on a peu de possibilité de créer de nouvelles populations par manque de terrain disponible.
Transfert de foin : appliqué sur les écosystèmes prairiaux, prélèvement des inflorescences à maturité. Transfert de communautés. Transfert de graines, de matière organique et surtout des conditions abiotiques : Le foin sur le sol apporte de la matière qui produit un ombrage, conserve l’humidité.
inbreeding depression = perte de diversité génétique est telle que la population se collapse.
Outbreeding depression :
apport très important de gènes adaptés à une localité dans une autre population d’une autre localité. Les gènes adaptés de la population vont être remplacés par ces nouveaux gènes, ce qui va provoquer un déclin de la population par perte de l’adaptation qu’elle avait acquise.
Ce phénomène peut aussi être causé par une panne de compatibilité biochimique ou physiologique entre les gènes dans les différentes populations.
Ce phénomène se remarque malheureusement dans certains cas de réintroduction.
Cette présentation sur la "qualité microbiologique des sols : bilan et intérêt pour les productions agricoles" a été réalisée par Lionel Ranjard (INRA Dijon) à l'occasion d'un séminaire sur la thématique "sol et biodiversité microbienne" organisé par Vegenov le 29 juin 2017.
La Convention sur la diversité biologique (CDB) s’est donné en 2002 l’objectif ambitieux de réduire le rythme de perte de biodiversité d’ici 2010.
Des indicateurs de diversité biologique ont été créés pour évaluer les progrès accomplis vers la réalisation de cet objectif.
Pourquoi est-il important de réduire la perte de biodiversité ?
L’objectif 2010 peut-il être atteint ? Quelles actions faut-il mener pour y arriver ?
Cette présentation sur les interactions entre les plantes et les microbiotes du sol a été réalisée par Christophe Mougel (INRA Rennes) à l'occasion d'un séminaire sur la thématique "sol et biodiversité microbienne" organisé par Vegenov le 29 juin 2017.
El documento habla sobre Dios como el Creador del universo y de Lucifer. Describe a Lucifer como un ser hermoso y sabio creado por Dios que se enorgulleció de su belleza y sabiduría y se rebeló contra Dios. Su rebelión tuvo consecuencias no solo en el cielo sino también en la tierra, dando inicio al conflicto entre el bien y el mal. Advierte que debemos depender solo de Dios y no enorgullecernos de nuestras propias cualidades para no caer como Lucifer.
Los computadores necesitan de la inteligencia humana para su creación y uso. Sin humanos, los computadores no tendrían un propósito y el mundo sería triste y estaría sumido en tinieblas. La humanidad es necesaria para darle significado a la tecnología.
El documento resume la producción entre iguales y Wikipedia como un ejemplo de este modelo. También describe cómo IBM adoptó el software libre Apache y Linux para mejorar su posición competitiva frente a empresas como Microsoft y Sun que usaban modelos cerrados. IBM contribuyó al desarrollo de estas comunidades de código abierto y se benefició de una plataforma más barata y de la experiencia en un nuevo modelo de creación de valor basado en la colaboración.
El documento describe los pasos para configurar el hardware en STEP 7, incluyendo representar los bastidores y módulos en una tabla de configuración donde STEP 7 asigna direcciones de forma automática. La configuración se puede copiar a otros proyectos y cargar en instalaciones existentes, y durante el arranque el sistema compara la configuración teórica con la física para detectar errores. El software STEP 7 permite estructurar programas de usuario dividiéndolos en secciones individuales para facilitar la organización, modificación, prueba y puesta en serv
La guía didáctica describe una acción formativa de 3 horas sobre el uso de ayudas técnicas TIC para el acceso a la sociedad de la información. La formación consta de 3 bloques: 1) introducción a la sociedad de la información, 2) tipos de discapacidad y productos de apoyo, y 3) recursos adicionales. Se impartirá de forma presencial y participativa en centros de formación de Andalucía, utilizando presentaciones, vídeos y debates. El objetivo es fomentar el acceso a la sociedad de
Pasion Por El Talento Innovador CreacióN De Negocios Innovadores Ivan Ver...guest193d22a
Innovar no es crear tecnología. Innovar es crear valor único y de muy alto impacto. Cuando innovas debes buscar cambiar favorablemente la vida a millones de personas.¡Toda empresa, de cualquier industria, de cualquier tamaño, puede innovar a escala global. Pero, no logras una innovación extraordinaria sin un emprendedor extraordinario. Buenas noticias: El talento extraordinario se construye, no se hereda.
Los alumnos de 2o ciclo del CEIP Monseivane desean felicidad, cariño, ilusión y paz para todos: para ti, tu familia, tus amigos y tus profesores, y sobre todo, siempre paz.
El documento contiene una serie de chistes y bromas de diferentes temas como tecnología, animales, relaciones interpersonales y atentados. Algunos de los chistes incluyen bromas sobre mascotas, baños, conquistar parejas y atentados. El documento parece una recopilación desordenada de bromas gráficas de diferentes temas sin una estructura clara.
Cette présentation sur la "qualité microbiologique des sols : bilan et intérêt pour les productions agricoles" a été réalisée par Lionel Ranjard (INRA Dijon) à l'occasion d'un séminaire sur la thématique "sol et biodiversité microbienne" organisé par Vegenov le 29 juin 2017.
La Convention sur la diversité biologique (CDB) s’est donné en 2002 l’objectif ambitieux de réduire le rythme de perte de biodiversité d’ici 2010.
Des indicateurs de diversité biologique ont été créés pour évaluer les progrès accomplis vers la réalisation de cet objectif.
Pourquoi est-il important de réduire la perte de biodiversité ?
L’objectif 2010 peut-il être atteint ? Quelles actions faut-il mener pour y arriver ?
Cette présentation sur les interactions entre les plantes et les microbiotes du sol a été réalisée par Christophe Mougel (INRA Rennes) à l'occasion d'un séminaire sur la thématique "sol et biodiversité microbienne" organisé par Vegenov le 29 juin 2017.
El documento habla sobre Dios como el Creador del universo y de Lucifer. Describe a Lucifer como un ser hermoso y sabio creado por Dios que se enorgulleció de su belleza y sabiduría y se rebeló contra Dios. Su rebelión tuvo consecuencias no solo en el cielo sino también en la tierra, dando inicio al conflicto entre el bien y el mal. Advierte que debemos depender solo de Dios y no enorgullecernos de nuestras propias cualidades para no caer como Lucifer.
Los computadores necesitan de la inteligencia humana para su creación y uso. Sin humanos, los computadores no tendrían un propósito y el mundo sería triste y estaría sumido en tinieblas. La humanidad es necesaria para darle significado a la tecnología.
El documento resume la producción entre iguales y Wikipedia como un ejemplo de este modelo. También describe cómo IBM adoptó el software libre Apache y Linux para mejorar su posición competitiva frente a empresas como Microsoft y Sun que usaban modelos cerrados. IBM contribuyó al desarrollo de estas comunidades de código abierto y se benefició de una plataforma más barata y de la experiencia en un nuevo modelo de creación de valor basado en la colaboración.
El documento describe los pasos para configurar el hardware en STEP 7, incluyendo representar los bastidores y módulos en una tabla de configuración donde STEP 7 asigna direcciones de forma automática. La configuración se puede copiar a otros proyectos y cargar en instalaciones existentes, y durante el arranque el sistema compara la configuración teórica con la física para detectar errores. El software STEP 7 permite estructurar programas de usuario dividiéndolos en secciones individuales para facilitar la organización, modificación, prueba y puesta en serv
La guía didáctica describe una acción formativa de 3 horas sobre el uso de ayudas técnicas TIC para el acceso a la sociedad de la información. La formación consta de 3 bloques: 1) introducción a la sociedad de la información, 2) tipos de discapacidad y productos de apoyo, y 3) recursos adicionales. Se impartirá de forma presencial y participativa en centros de formación de Andalucía, utilizando presentaciones, vídeos y debates. El objetivo es fomentar el acceso a la sociedad de
Pasion Por El Talento Innovador CreacióN De Negocios Innovadores Ivan Ver...guest193d22a
Innovar no es crear tecnología. Innovar es crear valor único y de muy alto impacto. Cuando innovas debes buscar cambiar favorablemente la vida a millones de personas.¡Toda empresa, de cualquier industria, de cualquier tamaño, puede innovar a escala global. Pero, no logras una innovación extraordinaria sin un emprendedor extraordinario. Buenas noticias: El talento extraordinario se construye, no se hereda.
Los alumnos de 2o ciclo del CEIP Monseivane desean felicidad, cariño, ilusión y paz para todos: para ti, tu familia, tus amigos y tus profesores, y sobre todo, siempre paz.
El documento contiene una serie de chistes y bromas de diferentes temas como tecnología, animales, relaciones interpersonales y atentados. Algunos de los chistes incluyen bromas sobre mascotas, baños, conquistar parejas y atentados. El documento parece una recopilación desordenada de bromas gráficas de diferentes temas sin una estructura clara.
El documento ofrece varios consejos para apreciar más lo que se tiene y ser menos quejoso. Recuerda al lector que hay personas que tienen menos y sufren más, por lo que deberíamos sentirnos agradecidos por nuestra situación actual en lugar de quejarnos. Finalmente, anima a compartir el mensaje para crear más conciencia sobre quienes tienen menos suerte y necesitan ayuda.
El documento presenta el balance del primer año de aplicación del Plan Integral de Lucha contra la Trata de Seres Humanos con fines de explotación sexual en España. Se identificaron 1.301 víctimas en 2009, un 41% más que en 2008. Las fuerzas de seguridad detuvieron a 726 personas y actuaron contra 158 grupos criminales. El plan constituye el primer instrumento estratégico integral en España para combatir la explotación sexual.
El documento describe la profesión de educador social, la cual sigue siendo poco conocida a pesar de su importancia. Un educador social trabaja en educación no formal, educación de adultos e inserción social de personas con dificultades. Sus objetivos incluyen prevenir problemas, fomentar la autonomía personal y desarrollar habilidades a través de actividades educativas y culturales. Los educadores sociales intervienen en ámbitos como la infancia, juventud, personas mayores y salud mental.
El documento resume la vida y obra del escritor español Miguel Delibes durante el periodo de la posguerra española y la dictadura franquista. Explica que Delibes nació en 1920, se unió al ejército republicano en 1938 durante la guerra civil y más tarde se dedicó a la literatura, publicando obras importantes como "El Camino" en 1950 que describían la vida bajo el franquismo. Delibes fue miembro de la Real Academia Española y murió en 2010 a causa de cáncer.
Este documento describe el diseño de una pasarela genérica para permitir que clientes de videoconferencia típicos se comuniquen con sistemas de videoconferencia propietarios existentes. El objetivo es permitir la interoperabilidad sin afectar al funcionamiento interno del sistema propietario. Se proponen dos arquitecturas posibles para la pasarela, siendo la segunda basada en Asterisk una mejor opción al permitir mayor reusabilidad del código. La pasarela se ha implementado para permitir el acceso al sistema Isabel de la UPM desde
El documento resume los conceptos clave de la adoración en el antiguo santuario israelita, incluyendo que la adoración era un relacionamiento con Dios mediante sacrificios diarios, que prometía seguridad y guía, y que involucraba el gozo y la generosidad a través de ofrendas y diezmos.
Surveillance entomologique dans la lutte contre le paludisme - Présentation de la 6e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - LABOUDI Majda et KOFFI Amanan Alphonsine
Facteurs affectant la diversité génétique de Anopheles sp - Présentation de la 7e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Ravelojaona Alain Mamy et Badzi Nkoua Cynthia
Comment l’étude d’une bactérie du parc de Yellowstone bouleversa la biologie.
Peu connue du grand public, la génomique constitue pourtant une réelle révolution dans l’histoire de la biologie, nous permettant aujourd’hui d’avoir une vision totalement différente des organismes. Non seulement la génomique a modifié notre vision de l’organisation du vivant, mais elle montre également qu’un organisme constitue un écosystème à lui tout seul, un monde dans lequel cohabitent des millions de micro-organismes.
DYNAMIQUE DE POPULATION DANS DES HABITATS CONTRASTANTS : DISTRIBUTION ET FACTEURS LIMITANTS POUR LA MOULE MYTILUS SPP. AUX MÉDIOLITTORAL ET INFRALITTORAL DANS L’ESTUAIRE DU SAINT-LAURENT
1. The document discusses how dispersal evolves in heterogeneous and uncertain environments, considering factors like kin competition, inbreeding avoidance, catastrophes, temporal variability, environmental heterogeneity, and the cost of dispersal.
2. It examines how dispersal patterns are influenced by these direct processes and how dispersal strategies evolve to an evolutionarily stable strategy. Dispersal polymorphisms may also arise.
3. The larger context of how dispersal relates to other ecological patterns and traits is explored, such as its association with diversity, gene flow, and other organismal traits.
François Rousset - présentation MEE2013Seminaire MEE
This document discusses methods for understanding social evolution, particularly in spatially structured populations. It focuses on relatedness concepts under localized dispersal, stability of kin recognition polymorphisms, and the relationship between inclusive fitness and evolutionary stability. The document seeks to reduce these problems to more basic elements in order to build an understanding of social evolution forces. It presents concepts and methods for analyzing frequency-dependent selection and population structure, including the effects of fitness costs and benefits among relatives.
Nicolas Loeuille - présentation MEE2013Seminaire MEE
This document summarizes a model exploring how local negative feedbacks can influence the evolution of species diversity within metacommunities. The model shows three possible outcomes: 1) permanent generalism with one widespread species, 2) permanent specialization with many specialist species, or 3) taxon cycles where specialist species periodically go extinct and are replaced. For diversity to emerge, parameters like colonization rate and negative feedback strength must be high, while extinction rate and environmental contamination must be low. The model reproduces classical macroecological patterns like species-area relationships and species abundance distributions. This framework provides insights into how local interactions can maintain biodiversity at larger scales.
Thomas Bataillon - présentation MEE 2013Seminaire MEE
The document discusses using patterns of phenotypic and molecular evolution to infer properties of fitness landscapes and the dynamics of adaptation. It summarizes different models that aim to predict the distribution of fitness effects of beneficial mutations, including heuristics based on extreme value theory and explicit fitness landscape models. Experimental evolution data on the fitness effects of mutations, fitness trajectories over time, and genomic diversity can help distinguish between these models. The author examines using such data from an experimental evolution study in E. coli to infer properties of Fisher's geometric fitness landscape model, including the distribution of fitness effects and genome-wide mutation rate.
Thomas Lenormand - Génétique des populationsSeminaire MEE
This document summarizes a population genetics model for studying the evolution of recombination rates. The model considers three loci, including a modifier locus that can alter the recombination rates between two selected loci. Using recursion equations and assumptions like weak epistasis and separation of timescales, the model analyzes when and why the frequency of a recombination-increasing allele at the modifier locus may increase over time through indirect selection. The key results are that more recombination evolves if epistasis between the selected loci is weakly negative and their association is negative.
François Blanquart - Evolution of migration in a fluctuating environmentSeminaire MEE
The document discusses how local adaptation and migration evolve in populations living in environments where selection fluctuates over time and space. It presents a model where migration is shown to increase local adaptation by reducing the lag time for adaptation, though more individuals are temporarily maladapted. The model finds an intermediate migration rate maximizes local adaptation across different environment shapes. It also shows migration can be selected for due to linkage disequilibrium dynamics, with the evolutionarily stable migration rate depending on the selection parameters. The document concludes migration may be an adaptive strategy for fluctuating environments.
Virginie Ravigné - Dynamique adaptativeSeminaire MEE
Adaptive dynamics is a framework for modeling frequency-dependent selection and its effects on evolution. It models the invasion and potential success of rare mutations in a resident population using mathematical tools. Key assumptions include clonal reproduction, rare mutations of small effect, and population dynamics determining invasion fitness. The framework can identify singular strategies and classify them based on their stability and potential to lead to evolutionary branching. While useful for qualitative insights, adaptive dynamics has limitations and may not accurately predict evolution in all cases.
Hannes Svardal - The role of environmental variance as adaptive response to f...Seminaire MEE
The document discusses whether fluctuating selection favors an increase in environmental or genetic variance in quantitative traits. It presents a model where the optimal phenotype varies temporally. The model finds that environmental variance (noise) will evolve to its optimal level, while additional genetic polymorphisms are only selected if the distribution of optimal phenotypes is sufficiently asymmetric or has fatter tails than a Gaussian. Simulation results support that genetic polymorphisms are often unstable, while divergence in both the genetic component and environmental variance can occur if conditions allow genetic branching. In conclusion, fluctuating selection more easily favors increased environmental rather than genetic variance, unless the optimal phenotype distribution meets certain criteria.
Nils Poulicard - Relations entre histoire évolutive et capacité d'adaptation ...Seminaire MEE
The document discusses how ancient host adaptation of Rice yellow mottle virus (RYMV) to different rice species modulated its current ability to break plant resistance. RYMV adapted to infect Oryza glaberrima rice around 500,000 years ago. This is evidenced by a threonine residue at codon 49 of the viral genome that enhances infection of O. glaberrima but limits resistance breaking in O. sativa rice. Directed mutations showed codon 49 influences the virus's ability to overcome two major resistance genes in its hosts. Ancient adaptation to a rice species continues to impact RYMV's resistance-breaking potential today.
Marco Andrello - Incongruency between model-based and genetic-based estimates...Seminaire MEE
This document discusses inconsistencies between estimates of effective population size (Ne) from demographic and genetic methods. Demographic methods use population census data while genetic methods use allele frequency changes. The document analyzes Ne estimates from both approaches in a plant species and finds they differ, possibly due to biases in demographic estimates from uncertain parameters and an oversimplified model. It recommends further assessing genetic methods like ONeSAMP with simulations to evaluate reliability across conditions and using multiple estimation methods when feasible to estimate Ne.
Laurent Lehmann - The evolution of long lasting behaviours
Betty Courquin - Etude des adaptations locales chez une espèce menacée
1. 2 juin 2010 Séminaire étudiant :Modélisation en Ecologie Evolutive session : Écologie évolutive dans l’espace et évolution de la dispersion Etude des adaptations locales chez une espèce menacée : dépression hybride et correspondances entre différences phénologiques et distances géographiques, génétiques et écologiques étude expérimentale Par Betty Courquin, 1e année de Thèse en biologie de la conservation Sous la direction de Yves Piquot, Nina Hautekeete, Xavier Vekemans
2.
3. Renforcement Transfert d’individus Non prise en compte de l’adaptation locale Vortex d’extinction au sein d’une petite population (Lacy & Lindenmayer 1995)
4.
5. Ellefavorise les traits qui apportent un avantage sous les conditions environnementales locales.
6. Le résultat de ces adaptations serait un patron tel que les génotypes résidant dans un habitat donné présenteraient en moyenne une valeur sélective supérieure dans leur habitat local que les génotypes non natifs de ce site ou une valeur sélective supérieure que dans un autre habitat.Contraintes écologiques différentielles / environnement hétérogène + fitness relative des génotypes locaux supérieure par rapport aux non-natifs à un site donné ou que dans un autre site Adaptations locales/différences génétiques adaptatives Sélection naturelle Potentiel évolutif/ diversité génétique + Isolement par la distance ou par des obstacles naturels à la dispersion
18. 1-Distribution de la diversité génétique 1- Etudier les patrons des différences phénotypiques entre populations en serre et populations naturelles a Identifier les différences phénotypiques des populations b Distinguer les différences liées à la plasticité phénotypique et les différences d’ordre génétique c Tester la corrélation entre les différences phénotypiques et distances géographiques, génétiques et écologiques Etudes des traits d’histoires de vie en conditions contrôlées et en pop nat: phénologie de la germination phénologie de la floraison taille rosette
19. 1-a) Étude des différences phénotypiques entre populations, en milieux naturels Phénologie de la floraison Estimations de dates des premières floraisons Chaque point représente un individu In situ
20. 1-b)Étude des différences phénotypiques entre populations, en milieux contrôlés Phénologie de la floraison Comparaison des temps de floraison et de montaison par population dates de début de floraison chez B. neustriaca En serre
21. 1-b)Étude des différences phénotypiques entre populations, en milieux contrôlés Taille de la rosette individus de 1e année diamètre de la rosette mesurée en conditions environnementales contrôlées chez B. neustriaca Effet de la population sur les tailles de rosette des individus ((F=6.32 ; p<0.001) ;Les barres dont les lettres diffèrent ont une durée entre montaison et floraison sont significativement différentes (test de tuckey),
22. 1-b)Étude des différences phénotypiques entre populations, en milieux contrôlés Phénologie de la germination a
23. 1-b)Étude des différences phénotypiques entre populations, en milieux contrôlés Phénologie de la germination Temps de germination (j) a Histogramme des temps de germination Les niveaux connectés par une barre +étoile sont significativement différents ; a serre (H=13.13, p=0.069) ; b bailleul en automne (F=3.79 ; p=0.002) Envconon discriminant Envco discriminant genotype1 phénotype genotype2 Environnement
24.
25.
26.
27. 1-c) corrélations entre les différences phénotypiques et distances géographiques, génétiques et écologiques distance "habitat" distance "communauté"
28. 1-c) corrélations entre les différences phénotypiques et distances géographiques, génétiques et écologiques Matrice de corrélation de Pearson Les niveaux de significativité sont basés sur N=n! permutations, (max 10000) *p<0,05 (n)=nombre de populations
29. 1-c) corrélations entre les différences phénotypiques et distances géographiques, génétiques et écologiques Matrice de corrélation de Pearson Caractère Adaptatif ? Paramètre écologique manquant? Dérive? Les niveaux de significativité sont basés sur N=n! permutations, (max 10000) *p<0,05 (n)=nombre de populations
30.
31.
32. Même test des corrélationsdernière étape dans la démonstration de l’adaptation locale on montre que les différences génétiques observées précédemment confèrent une meilleure fitness des individus dans des conditions environnementales proches de leur habitat
37. Critères testés : - « Local vs. Foreign »- « Home vs. Away » Site 7 d’introduction Exposition Sud (Les Andelys) Site 1 d’introduction Exposition Nord (Romilly/Andelle)
38.
39.
40.
41. 3-Mix or match: genetic rescue vsoutbreeding depression Dépression hybride Dépression de consanguinité Hypothèse : la taille des fruits est corrélée à la valeur sélective A AB B Taille des fruits à 7 jours (mm) Hypothèse à tester avec le suivi des germinations
51. 1-b)Étude des différences phénotypiques entre populations, en milieux contrôlés stade de floraison8-fruits 7-fl fan. + fruits 6-fl fan. + fruits 5-flouv. + fl fan. + fruits 4-boutons + flouv + fl fan + 1e fr 3-boutons + flouv+ fl fan 2-boutons et 1eflouv 1-montaison Phénologie de la floraison Stade de floraison moyen pour chaque population ( ; Kruskal Wallis H=85.12; p<0.001 et résultats du test de comparaison 2à 2Les étiquettes de données indiquent l’effectif des individus pour chaque population. In situ
52. 1-b)Étude des différences phénotypiques entre populations, en milieux contrôlés Taille de la rosette individus de 1e année individus de 2e année diamètre de la rosette mesurée en conditions environnementales contrôlées chez B. neustriaca Effet de la population sur les tailles de rosette des individus (a) individus de 1année (F=6.32 ; p<0.001) ; b) individus de 2e année(F=2.54 ; p=0.037)Les barres dont les lettres diffèrent ont une durée entre montaison et floraison sont significativement différentes (test de tuckey),
53. 1-c) corrélations entre les différences phénotypiques et distances géographiques, génétiques et écologiques Matrice de corrélation de Pearson Les niveaux de significativité sont basés sur N=n! permutations, (max 10000) *p<0,05 (n)=nombre de populations
54. 1-c) corrélations entre les différences phénotypiques et distances géographiques, génétiques et écologiques Matrice de corrélation de Pearson Les niveaux de significativité sont basés sur N=n! permutations, (max 10000) *p<0,05 (n)=nombre de populations Gradient écologique? Les communautés végétales intègre les facteurs à priori discriminants Isolement par la distance?
55. 3-Mix or match: genetic rescue vsoutbreeding depression Dépression hybride Dépression hybride Dépression de consanguinité Dépression de consanguinité Hypothèse 1: la taille des fruits est corrélée à la valeur sélective A B AB Nombre de graines A AB B Taille des fruits à 7 jours (mm) Tableau récapitulatif des ANOVAS réalisées pour la largeur du fruit à 7 jours et le nombre moyen de graines.
56. 3-Mix or match: genetic rescue vsoutbreeding depression Hypothèse 1: la taille des fruits est corrélée à la valeur sélective Taille des fruits à 7 jours (mm) Hypothèse à tester avec le suivi des germinations
57. 3-Mix or match: genetic rescue vsoutbreeding depression Hypothèse 1: la taille des fruits est corrélée à la valeur sélective Hypothèse 2: la taille des fruits est corrélée à la taille de la mère Taille des fruits à 7 jours (mm) 6a6a>1a1a Fruits plus grand dans le pool Sud 6a1a>1a6a La taille de la graine est liée principalement à la mère
58. 3-Mix or match: genetic rescue vsoutbreeding depression Exemples de résultats Test des corrélations de la taille des graines avec les distances écologiques génétiques et géographiques. * p<0,05; ** p<0.01; *** p<0.001 N N Sens de pollinisation + Bn1a o Bn1a Bn2a Bn2a + Bn3 o Bn3
59.
60.
61. Augmentation de la densité par auto renforcement augmentation du succès reproducteur des individus natifs de la zone renforcée
62. Néanmoins taux de mis à fruit inférieur à la capacité de l’espèce(figure 2), ce qui suggère un problème de dépression de consanguinité