Le manuel de 2013 traite des procédures et principes de compensation des zones humides, soulignant la nécessité de restaurer ces milieux face à la diminution de leur surface due à des aménagements. Destiné aux maîtres d'ouvrage et services de l'État, il offre des fiches pratiques étayant les démarches administratives et les principes écologiques de compensation. Il propose également des études de cas et une analyse des dispositifs existants pour guider la mise en œuvre de ces compensations.