Ce diaporama a été construit dans le cadre du plan Ecoantibio2017; il est le fruit d’un partenariat entre plusieurs structures et de l’implication d’un noyau d’individus de bonne volonté, qu’ils soient ici remerciés.
Ce diaporama est libre de droit et de reproduction, il a vocation à être utilisé largement et à bon escient ; il peut être allégé selon les besoins et les contextes de présentation.
Merci de citer les structures ayant conçu ce diaporama lors de toute présentation ou reproduction, même partielle.
Les sources utilisées sont mentionnées dans les commentaires ou sur les diapositives.
STRUCTURE GENERALE DES IMMUNOGLOBULINES. NOMENCLATURE.DUALITÉ STRUCTURALE qui explique sa DUALITÉ FONCTIONNELLE. Propriétés de l’IgE. LES DIFFERENTS NIVEAUX D'HETEROGENEITE DES IMMUNOGLOBULINES. RELATIONS ENTRE STRUCTURE ET ACTIVITE BIOLOGIQUE.GENES DES IMMUNOGLOBULINES. MÉCANISME DU "SWITCH" LA DIFFÉRENCIATION DES LYMPHOCYTES B. SELECTION DES LYMPHOCYTES B
TOLÉRANCE. LA PRODUCTION DES ANTICORPS LA RÉPONSE AUX ANTIGÈNES THYMODÉPENDANTS. L'aide des lymphocytesT CD4+Th2. LES ANTIGÈNES THYMOINDÉPENDANTS.
Nous sommes régulièrement confrontés aux aliments génétiquement modifiés, que ce soit dans l'actualité ou dans nos assiettes.
En quoi les plantes génétiquement modifiées diffèrent-elles des plantes conventionelles?
Que sait-on des risques potentiels pour la santé humaine et pour l'environnement?
ce cours s'adresse aux étudiants graduant en médecine , en pharmacie et en médecine dentaire et apporte les lignes directrices en matière du pour quoi, quand et comment confirmer l'origine virale d'une infection.
n'oubliez pas d'aimer mes cours si vous trouvez qu'ils vous apportent un plus, soyez libre de laisser un commentaire , une question ou une remarque.
TECHNIQUES DE BIOLOGIE MOLECULAIRE EN PARASITOLOGIE ET MYCOLOGIE
EXTRACTION D'AN
TECHNIQUE PCR
SEQUENCAGE D'AN
GENOTYPAGE
APPORT DE LA BIOLOGIE MOLECULAIRE EN PARASITOLOGIE ET MYCOLOGIE MEDICALE
Ce diaporama a été construit dans le cadre du plan Ecoantibio2017; il est le fruit d’un partenariat entre plusieurs structures et de l’implication d’un noyau d’individus de bonne volonté, qu’ils soient ici remerciés.
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STRUCTURE GENERALE DES IMMUNOGLOBULINES. NOMENCLATURE.DUALITÉ STRUCTURALE qui explique sa DUALITÉ FONCTIONNELLE. Propriétés de l’IgE. LES DIFFERENTS NIVEAUX D'HETEROGENEITE DES IMMUNOGLOBULINES. RELATIONS ENTRE STRUCTURE ET ACTIVITE BIOLOGIQUE.GENES DES IMMUNOGLOBULINES. MÉCANISME DU "SWITCH" LA DIFFÉRENCIATION DES LYMPHOCYTES B. SELECTION DES LYMPHOCYTES B
TOLÉRANCE. LA PRODUCTION DES ANTICORPS LA RÉPONSE AUX ANTIGÈNES THYMODÉPENDANTS. L'aide des lymphocytesT CD4+Th2. LES ANTIGÈNES THYMOINDÉPENDANTS.
Nous sommes régulièrement confrontés aux aliments génétiquement modifiés, que ce soit dans l'actualité ou dans nos assiettes.
En quoi les plantes génétiquement modifiées diffèrent-elles des plantes conventionelles?
Que sait-on des risques potentiels pour la santé humaine et pour l'environnement?
ce cours s'adresse aux étudiants graduant en médecine , en pharmacie et en médecine dentaire et apporte les lignes directrices en matière du pour quoi, quand et comment confirmer l'origine virale d'une infection.
n'oubliez pas d'aimer mes cours si vous trouvez qu'ils vous apportent un plus, soyez libre de laisser un commentaire , une question ou une remarque.
TECHNIQUES DE BIOLOGIE MOLECULAIRE EN PARASITOLOGIE ET MYCOLOGIE
EXTRACTION D'AN
TECHNIQUE PCR
SEQUENCAGE D'AN
GENOTYPAGE
APPORT DE LA BIOLOGIE MOLECULAIRE EN PARASITOLOGIE ET MYCOLOGIE MEDICALE
Resistance aux antimicrobiens aux origines de l'emergence et de la propagatio...Dr Taoufik Djerboua
Cette slide a été présentée lors de la journée de sensibilisation a la résistance bactérienne aux antimicrobiens. l'objectif principal est de remettre les informations de l'audience en matière de résistance aux antibiotiques dans le contexte actuel du pays et de démontrer la complexité du processus de lutte qui ne se limite pas seulement a l'exes de prescription des antibiotiques.
This slide was presented during the antimicrobial resistance awarness day held in Nedir mohammed university hospital in 2018. my aim through this presentation was to update and most importantly o reorganise the audience's knowledge on this opic and to put in the country's contexte. also to demonstrate that fighting this global threat is more complexe then limiting antibiotic prescription.
Les organismes génétiquement modifiés (OGM) sont des organismes vivants dont le patrimoine génétique a été manipulé afin de leur conférer certaines propriétés.
Petit exercice de vulgarisation sur les tenants et aboutissants du séquençage de l'ADN, de ses applications et de l'écosystème entrepreneurial qui l'entoure.
Le séquençage haut débit: NGS, une révolution de la biologie moléculaire au s...Pasteur_Tunis
Présentation de MALLEK Ramdane
rmallek@lab-cerba.com
Biologie Moléculaire et génomique, Laboratoire Cerba, Saint-Ouen l'Aumône, France
Institut Pasteur de Tunis 6 Avril 2019
La bactériologie médicale est une branche de la Biologie médicale qui consiste en l'analyse de divers liquides biologiques (parfois de tissus) dans le but d'isoler et/ou de caractériser une ou des bactéries pouvant être responsables de la pathologie suspectée à l'aide de techniques directes ou indirectes.
Les maladies génétiques en Tunisie: entre réalités et défisPasteur_Tunis
Par le Dr Lilia Romdhane
Maladies rares: Définition
Situation des maladies génétiques en Tunisie:
Bref rappel historique, propriété démographique et structure familiale, consanguinité et endogamie
Méta-analyse des données de la littérature:
Particularités phénotypiques des maladies génétiques en Tunisie
Particularités épidémiologiques des maladies génétiques en Tunisie
Spectre mutationnel des maladies génétiques en Tunisie
Vivre avec une maladie rare
Toute situation clinique nécessitant de l’INVESTIGATION immunobiologique et/ou de
l’INTERVENTION thérapeutique sur le système immunitaire
Anticorps Cytotoxiques
Anticorps Non Cytotoxiques: Bloqueur ou Stimulateur
ANEMIE INDUITE DE MÉDICAMENTS
LE REJET HUMORALE
SYNDROME DE GOODPASTURE
MYASTHENIE GRAVIS
MALADIE DE GRAVES
NÉMIE PERNICIEUSE
TROUBLE DE LA FERTILITÉ
Test de Coombs
Alvéolite AAllergiquellergique EExogènexogène::
1. Le poumon de fermier
2. Les éleveurs d’oiseaux
MECHANISMES de l’HYPERSENSIBILITE TYPE III
Reaction Jarisch-Herxheimer
LUPUS ERYTHEMATOSUS SYSTEMIQUE (LES)
LA POLYARTHRITE RHUMATOÏDE
EXPLORATION de l’HYPERSENSIBILITE TYPE III
TRANSAMINASES Ces enzymes catalysent le passage des groupes aminés des acides aminés vers les acides cétoniques, processus très général de dégradation et de synthèse des acides aminés. Ce sont l’aspartate aminotransférase (ASAT) ou transaminase glutamo-oxaloacétique (GOT), et l’alanine aminotransférase (ALAT) ou transaminase glutamo- pyruvique (GPT). Elles sont normalement présentes en faible quantité dans le plasma ou le sérum. Leur activité est élevée dans certains tissus, en particulier le foie (GPT, ou GOT à un degré moindre), le cœur et le muscle (principalement GOT). En cas de nécrose de ces tissus, les enzymes sont libérées dans la circulation et leur activité sérique augmente.
La PCR est une technique qui a révolutionné la biologie moléculaire et qui a pris rapidement sa place dans les laboratoires. Son énorme succès apparait par le nombre d’articles publiés sur le site PubMed : 438134 articles depuis sa découverte (pubMed, mars 2018) ce qui donne une idée assez claire de l’importance de celle-ci dans le monde scientifique
Génétique médicale en tunisie situation et perspectivesPasteur_Tunis
Présentation de Ridha M'rad réalisée durant le cours du réseau international des instituts Pasteur de "Médecine Génomique: du diagnostic à la thérapie " (17-21 octobre 2016)
Les techniques de culture in vitro cherchent à contrôler les facteurs de l’environnement (température, lumière, composition du milieu…) du fragment de plante mis en culture afin de l’orienter vers un programme d’évolution déterminé.
Face aux enjeux multiples associés aux avortements (limitation de l’impact économique, gestion efficace du risque zoonotique, renforcement des bonnes pratiques de maîtrise tant sur le plan vaccinal que thérapeutique), l’amélioration du diagnostic étiologique de troupeau constitue l’un des tous premiers buts à atteindre. Elle passe en particulier par une optimisation des procédures de prélèvement et par une plus large utilisation d’analyses conventionnelles et innovantes. C'est dans ce cadre qu'un nouvel outil de diagnostic direct a été proposé fin 2022 par l’ENVT et AVEYRON LABO. Il associe une recherche très large d’agents infectieux avérés ou potentiels, et une technologie innovante. Dominique Bergonier présente les enjeux, les principes de cet outil et en illustre l'utilisation sur des exemples concrets. Son intervention est réalisée dans le cadre du Webinaire de l'UMT PSR du 26 Avril 2023
2015 marque une nouvelle étape dans l’amélioration des méthodes d’indexation des bovins laitiers. L’évaluation génomique gagne en maturité en intégrant les femelles et leurs performances et en considérant l’ascendance à partir d’éléments génomiques. Il s’ensuit un gain de précision notable des évaluations, et parfois de écarts sensibles par rapport aux index précédents. Globalement les cohérences entre index et performance ou entre évaluations françaises et étrangères sont renforcées.
Pour faciliter la diffusion des informations autour de la nouvelle méthode d'évaluation génomique en 2015, l'UMT 3G propose un diaporama qui présente les principaux changements intervenus, accompagné d'un livret d'explications et de précisions.
Resistance aux antimicrobiens aux origines de l'emergence et de la propagatio...Dr Taoufik Djerboua
Cette slide a été présentée lors de la journée de sensibilisation a la résistance bactérienne aux antimicrobiens. l'objectif principal est de remettre les informations de l'audience en matière de résistance aux antibiotiques dans le contexte actuel du pays et de démontrer la complexité du processus de lutte qui ne se limite pas seulement a l'exes de prescription des antibiotiques.
This slide was presented during the antimicrobial resistance awarness day held in Nedir mohammed university hospital in 2018. my aim through this presentation was to update and most importantly o reorganise the audience's knowledge on this opic and to put in the country's contexte. also to demonstrate that fighting this global threat is more complexe then limiting antibiotic prescription.
Les organismes génétiquement modifiés (OGM) sont des organismes vivants dont le patrimoine génétique a été manipulé afin de leur conférer certaines propriétés.
Petit exercice de vulgarisation sur les tenants et aboutissants du séquençage de l'ADN, de ses applications et de l'écosystème entrepreneurial qui l'entoure.
Le séquençage haut débit: NGS, une révolution de la biologie moléculaire au s...Pasteur_Tunis
Présentation de MALLEK Ramdane
rmallek@lab-cerba.com
Biologie Moléculaire et génomique, Laboratoire Cerba, Saint-Ouen l'Aumône, France
Institut Pasteur de Tunis 6 Avril 2019
La bactériologie médicale est une branche de la Biologie médicale qui consiste en l'analyse de divers liquides biologiques (parfois de tissus) dans le but d'isoler et/ou de caractériser une ou des bactéries pouvant être responsables de la pathologie suspectée à l'aide de techniques directes ou indirectes.
Les maladies génétiques en Tunisie: entre réalités et défisPasteur_Tunis
Par le Dr Lilia Romdhane
Maladies rares: Définition
Situation des maladies génétiques en Tunisie:
Bref rappel historique, propriété démographique et structure familiale, consanguinité et endogamie
Méta-analyse des données de la littérature:
Particularités phénotypiques des maladies génétiques en Tunisie
Particularités épidémiologiques des maladies génétiques en Tunisie
Spectre mutationnel des maladies génétiques en Tunisie
Vivre avec une maladie rare
Toute situation clinique nécessitant de l’INVESTIGATION immunobiologique et/ou de
l’INTERVENTION thérapeutique sur le système immunitaire
Anticorps Cytotoxiques
Anticorps Non Cytotoxiques: Bloqueur ou Stimulateur
ANEMIE INDUITE DE MÉDICAMENTS
LE REJET HUMORALE
SYNDROME DE GOODPASTURE
MYASTHENIE GRAVIS
MALADIE DE GRAVES
NÉMIE PERNICIEUSE
TROUBLE DE LA FERTILITÉ
Test de Coombs
Alvéolite AAllergiquellergique EExogènexogène::
1. Le poumon de fermier
2. Les éleveurs d’oiseaux
MECHANISMES de l’HYPERSENSIBILITE TYPE III
Reaction Jarisch-Herxheimer
LUPUS ERYTHEMATOSUS SYSTEMIQUE (LES)
LA POLYARTHRITE RHUMATOÏDE
EXPLORATION de l’HYPERSENSIBILITE TYPE III
TRANSAMINASES Ces enzymes catalysent le passage des groupes aminés des acides aminés vers les acides cétoniques, processus très général de dégradation et de synthèse des acides aminés. Ce sont l’aspartate aminotransférase (ASAT) ou transaminase glutamo-oxaloacétique (GOT), et l’alanine aminotransférase (ALAT) ou transaminase glutamo- pyruvique (GPT). Elles sont normalement présentes en faible quantité dans le plasma ou le sérum. Leur activité est élevée dans certains tissus, en particulier le foie (GPT, ou GOT à un degré moindre), le cœur et le muscle (principalement GOT). En cas de nécrose de ces tissus, les enzymes sont libérées dans la circulation et leur activité sérique augmente.
La PCR est une technique qui a révolutionné la biologie moléculaire et qui a pris rapidement sa place dans les laboratoires. Son énorme succès apparait par le nombre d’articles publiés sur le site PubMed : 438134 articles depuis sa découverte (pubMed, mars 2018) ce qui donne une idée assez claire de l’importance de celle-ci dans le monde scientifique
Génétique médicale en tunisie situation et perspectivesPasteur_Tunis
Présentation de Ridha M'rad réalisée durant le cours du réseau international des instituts Pasteur de "Médecine Génomique: du diagnostic à la thérapie " (17-21 octobre 2016)
Les techniques de culture in vitro cherchent à contrôler les facteurs de l’environnement (température, lumière, composition du milieu…) du fragment de plante mis en culture afin de l’orienter vers un programme d’évolution déterminé.
Face aux enjeux multiples associés aux avortements (limitation de l’impact économique, gestion efficace du risque zoonotique, renforcement des bonnes pratiques de maîtrise tant sur le plan vaccinal que thérapeutique), l’amélioration du diagnostic étiologique de troupeau constitue l’un des tous premiers buts à atteindre. Elle passe en particulier par une optimisation des procédures de prélèvement et par une plus large utilisation d’analyses conventionnelles et innovantes. C'est dans ce cadre qu'un nouvel outil de diagnostic direct a été proposé fin 2022 par l’ENVT et AVEYRON LABO. Il associe une recherche très large d’agents infectieux avérés ou potentiels, et une technologie innovante. Dominique Bergonier présente les enjeux, les principes de cet outil et en illustre l'utilisation sur des exemples concrets. Son intervention est réalisée dans le cadre du Webinaire de l'UMT PSR du 26 Avril 2023
2015 marque une nouvelle étape dans l’amélioration des méthodes d’indexation des bovins laitiers. L’évaluation génomique gagne en maturité en intégrant les femelles et leurs performances et en considérant l’ascendance à partir d’éléments génomiques. Il s’ensuit un gain de précision notable des évaluations, et parfois de écarts sensibles par rapport aux index précédents. Globalement les cohérences entre index et performance ou entre évaluations françaises et étrangères sont renforcées.
Pour faciliter la diffusion des informations autour de la nouvelle méthode d'évaluation génomique en 2015, l'UMT 3G propose un diaporama qui présente les principaux changements intervenus, accompagné d'un livret d'explications et de précisions.
This document discusses changes in reproduction choices in French dairy herds due to new tools in genomics and sexed semen. Genomic evaluations are now available for young bulls and females, allowing for increased genetic progress especially for functional traits. The use of sexed semen has increased to over 35% of dairy heifers, allowing farmers to select females on their farms. Combining genomics and sexed semen allows farmers to better match bulls and females to their selection objectives at the herd level. These new tools are being widely adopted by French farmers and breeders to improve herd management and breeding strategies.
EAAP 2015 - Pascale Le Mézec (1) Marion Benoit (2) Sophie Moureaux (1, 4) Clotilde Patry (2, 3)
(1) Institut de l’Elevage, 149, rue de Bercy, 75595 PARIS cedex 12
(2) Allice, 149, rue de Bercy, 75595 PARIS cedex 12
(3) EuroGenomics, 149, rue de Bercy, 75595 PARIS cedex 12
(4) INRA‐GABI, Domaine de Vilvert, 78352 JOUY‐EN‐JOSAS cedex
Le croisement laitier en France : repères et impacts technico-économiques
Conférence organisée par l'Institut de l'Elevage, en partenariat avec PASS’ et la Chambre d’agriculture du Finistère, et présidée par Michel Pivard,
éleveur laitier dans l’Ain pratiquant le croisement
Satisfaction & Engagement des professionnels RHDavid BERNARD
Résultats de l'enquête de satisfaction et d'engagement réalisée par AssessFirst (www.assessfirst.com) auprès de 946 professionnels des Ressources Humaines au cours du premier trimestre 2010
Bioinformatics emerged from the marriage of computer science and molecular biology to analyze massive amounts of biological data, like that produced by the Human Genome Project. It uses algorithms and techniques from computer science to solve problems in molecular biology, like comparing genomic sequences to understand evolution. As genomic data exploded publicly, bioinformatics was needed to efficiently store, analyze, and make sense of this information, which has applications in molecular medicine, drug development, agriculture, and more.
les organes lymphoïde centraux, périphériques
maturation de LT, répertoire antigénique, éducation thymique, activation de lymphocyte T, la sélection clonale, la mémoire immunologique, le TCR, le homing, station de filtration lymphoïde, macrophage et phagocytose
Parcours des insecticides : de la découverte à l’utilisation sur terrain - Présentation de la 8e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - ANDRIANARANJAKA Voahangy Hanitriniaina - Madagascar - fararanontsoa@gmail.com
Résistance aux insecticides : intérêt des marqueurs moléculaires - Présentation de la 8e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - NOROMALALA Noelisoa - Madagascar - noromalalanoelisoa@yahoo.fr
Conséquences des résistances aux insecticides dans l’histoire de la lutte contre le paludisme - Présentation de la 8e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - AÏSSAN Codjovi Julien - Benin - codjo3aj2000@yahoo.fr
An Introduction to Bioinformatics
Drexel University INFO648-900-200915
A Presentation of Health Informatics Group 5
Cecilia Vernes
Joel Abueg
Kadodjomon Yeo
Sharon McDowell Hall
Terrence Hughes
Revue des recommandations éthiques dans le contexte des études génomiquesGeneviève David
La bioéthique se défini comme l’application des théories éthiques à des dilemmes
émergeant de la pratique de la médecine moderne comme les nouvelles technologies [1]. Il y
a eu une révolution technologique dans le domaine médical au cours des dernières décennies
et plus particulièrement dans la sphère de la génomique. Les nouvelles technologies de la
génomique, comme le séquençage, permettent une analyse efficace de l’acide
déoxyribonucléique (ADN) et de son mode d’expression. Cette étude approfondie du génome
humain a un impact aussi bien au niveau de la recherche en laboratoire que des services
cliniques et médicaux. L’interprétation de ces résultats de séquençage, souvent complexe,
présente un défi pour les généticiens clinique et de recherche.
Le terrain. L'approche individualisée de la santé. Des notions fondamentales en Naturopathie. Et si le terrain se trouvait dans nos gênes ?
Le séquençage du génome humain a ouvert de nouvelles perspectives en matière de santé notamment en raison d'une meilleure compréhension des interactions entre notre alimentation et notre génome. La Nutrigénomique est cette science nouvelle qui étudie l'influence de notre alimentation sur l'expression de nos gênes (ou leur réagencement = Epigénétique) provoquant ainsi résistance ou fragilité de notre organisme.
Si la Nutrigénomique en est encore à ses balbutiements, cette conférence a pour objectif de présenter au travers de quelques exemples (Vitamine D, antioxydants) une nouvelle vision de la nutrition et de nouveaux mécanismes d'actions des nutriments.
Evaluation de l’activité anti mutagène - anti-génotoxique - des huiles essent...Abdesselam Zhiri
Evaluation de l’activité anti-mutagène / anti-génotoxique des huiles essentielles et leur potentiel anti-carcinogène
Conférence au :
12e Symposium international d'aromathérapie"La plante entre matière et lumière". Grasse 26, 27 et 28 mars 2010
Dr Abdesselam Zhiri, PhD
Directeur de R&D
Pranarôm International S.A
Cycle biologique de Plasmodium: du gamétocyte au zygote - Présentation de la 6e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - MANDOKO NKOLI Alain Serge - Médecin - République Democratique du Congo - drpmandoko@yahoo.fr
2. Définition
Sciences des génomes. La génomique regroupe un ensemble de sciences et d'analyses qui vont de
l'établissement de cartes du génome (cartographie) à l'identification de nouveaux gènes, à l'étude de leurs
fonctions et expressions ainsi qu’au séquençage des acides nucléiques (ADN).
Ces sciences «-omiques » portent potentiellement sur l’ensemble des organismes vivant renfermant dans leurs
cellules l’information génétique indispensable à la pérennité de leur espèce et à l’adaptation aux milieux.
La « génomique », une science des « grandes perspectives ». Les connaissances à propos des micro-organismes
sont importants, mais la génomique vise principalement à comprendre la complexité des interactions des gènes
entre eux et avec leur environnement pour que les organismes vivants fassent ce qu’ils font.
Utilité
Connaitre la séquence nucléotidique permet entre autres :
Explorer et identifier les fonctions associées aux gènes, aux variations alléliques et au polymorphisme
génétique ;
Reconstruire les arbres phylogénétiques d'espèces vivantes ;
Analyser l'histoire évolutive des êtres vivants en lien avec leur écosystème
Comprendre et détecter les maladies liées aux gènes
3. Définition
Génomique structurale Génomique fonctionnelle
=> Toutes les analyses de la structure des génomes, au => L’identification de la fonction des séquences
sens « organisation des génomes » informatives identifiées
Les méthodes concernées sont donc le séquençage des La génomique fonctionnelle peut être considérée comme
génomes, l'identification des gènes, des séquences de la génétique à « haut débit ». Les techniques utilisées
régulatrices, des séquences répétées, seront comparables mais généralement appliqués à un
Après le séquençage, l'annotation des génomes (l’analyse grand nombre de gènes en parallèles, cela peut par
informatique des séquences obtenues lors du exemple être la création de mutants et l'analyse de leurs
séquençage) permet d'identifier les séquences phénotypes pour toute une famille de gènes, ou l'analyse
informatives des génomes. Les gènes ne sont pas les de l'expression tous les gènes d'un organisme entier.
seules cibles de l'annotation des génomes, il existe de
nombreux autres types de séquences importantes dans
les génomes (les séquences régulatrices, les éléments
transposables, etc.).
Parallèlement, les recherches sur les nouvelles technologies génomiques sont indispensables à l’avancement des
connaissances en recherche fondamentale: c’est l’ensemble des technologies et techniques de détection, d'évaluation
et de contrôle génomique.
4. Interrelations entre les sciences – omiques, les sciences de
la vie et les secteurs d’activités
Les sciences -omiques
Au service de …
Trouvant une application en…
5. Intérêts de la génomique par
secteurs d’activités
Santé humaine Foresterie
Améliorer les diagnostics Mettre au point de nouvelles sources d'énergie
(biocarburants)
Identifier des prédispositions génétiques d'une Concevoir des outils de contrôle des polluants dans
personne par rapport à une maladie l'environnement
Mettre au point des traitements selon l'information Décontaminer les terrains pollués
génétique de chaque individu et, par conséquent, de
permettre l'avancement de la médecine
personnalisée
Connaître les effets et interactions de nos modes de
vie et de notre environnement sur notre génome et
notre santé
6. Intérêts par secteurs d’activités
Environnement Agriculture Aquaculture
Développement durable des forêts Création de cultures résistantes Augmenter la productivité et la
aux maladies, aux insectes, au croissance en ciblant et en
froid, à la sécheresse, etc. sélectionnant les meilleurs
poissons pour la reproduction
Proposer des solutions biologiques Mise au point de biopesticides Intégrer des caractéristiques
permettant aux entreprises de spécifiques aux programmes futurs
produire des produits davantage de reproduction de façon à obtenir
écologiques des poissons à croissance rapide,
sains et de grande qualité
Aider à faire face aux exigences Culture d'aliments plus nutritifs
qu'impose le réchauffement de la
planète
Élevage d'animaux destinés à
l'alimentation plus résistants et
plus nutritifs
7. Les technologies en génomique
Les technologies «omiques» permettent de générer des quantités énormes de données à des niveaux
biologiques multiples: du séquençage des gènes à l’expression des protéines et des structures métaboliques, ces
données peuvent couvrir tous les mécanismes impliqués dans les variations qui se produisent dans les réseaux
cellulaires et qui influencent le fonctionnement des systèmes organiques dans leur totalité. Cela a d’ailleurs
récemment conduit à une surabondance de données dans le cadre des recherches biomédicales.
Les technologies «omiques» ont fondamentalement modifié les procédures de recherche. Habituellement, les
scientifiques se basent sur des hypothèses de recherche dans lesquelles une question/hypothèse est clairement
articulée. Ils obtiennent ensuite des données qui viendront confirmer ou infirmer cette hypothèse. Or, avec
l’avènement des technologies «omiques», il n’est plus nécessaire de poser une question précise pour débuter
une recherche. En effet, les scientifiques peuvent rassembler de nombreuses données dans leurs études sans se
baser sur une hypothèse initiale et attendre la production de ces données avant de formuler et de tester
différentes hypothèses biologiques. Cette inversion du modèle de recherche ouvre de manière inédite la porte à
de nombreuses découvertes sur les mécanismes ainsi que sur la compréhension des facteurs moléculaires qui
influencent les interactions métaboliques.
8. Glossaire 1
-Omique Définition
Chimiogénomique ⇒ L'étude de la réponse du génome à un composé chimique.
Cependant, les avancées technologiques simultanées dans les domaines de la biologie
(Séquençage des génomes) et de la chimie (Microplaques de composés chimiques)
modifient les processus de recherche. En effet, l'automatisation des tâches permet
d'étudier les réponses biologiques d'une large gamme de composés chimiques
(ligands) sur une multitude de cibles. La chimiogénomique peut alors être définie
comme la science ayant pour objectif l'étude des réponses génomiques à des
composés chimiques.
Ex: En pharmaceutique, une de ses applications est l'identification rapide de nouveaux
candidats-médicaments et de leurs cibles dans les premières phases de recherche et de
développement (R&D), en allant de l'identification de la cible et à sa validation, en
passant par la conception du composé avec ses voies synthèses et ses tests biologiques
et son profil ADME.
Épigénomique ⇒ L'étude de l'ensemble des modifications épigénétiques d'une cellule.
L'épigénétique étudie comment l'environnement et l'histoire individuelle influent sur
l'expression des gènes, et plus précisément l'ensemble des modifications
transmissibles d'une génération à l'autre et réversibles de l'expression génique sans
altération des séquences nucléotidiques.
9. Glossaire 2
-Omique Définition
Métagénomique ⇒ Procédé méthodologique qui vise à étudier le contenu génétique d'un échantillon issu
d'un environnement complexe (intestin, océan, sols, etc.) trouvé dans la nature (par
opposition à des échantillons cultivés en laboratoire).
Le but de cette approche est d'avoir non seulement une description génomique du contenu
de l'échantillon mais aussi un aperçu du potentiel fonctionnel d'un environnement.
L'utilisation du préfixe « méta » fait référence à « ce qui vient après ». Ici, la
metagénomique vient après la génomique en étudiant les organismes microbiens par
exemple directement dans leur environnement sans passer par une étape de culture en
laboratoire. Les tailles des échantillons métagénomiques sont beaucoup plus importantes
que celles d'échantillons cultivés en laboratoire.
Pour connaître leur contenu, les biologistes ont recours aux technologies de séquençage haut-
débit. Les séquences d'ADN obtenues sont alors analysées par bioinformatique afin de
décrire la composition structurelle et fonctionnelle de l’échantillon environnemental.
Nutrigénomique ⇒ L’étude de la façon dont les gènes et les nutriments interagissent.
Cette science recherche les raisons pour lesquelles les personnes réagissent différemment
aux nutriments en fonction des variations génétiques. Les nutriments contribuent à
l’allumage ou au contraire à l’extinction d’un ou de plusieurs gènes dans différents tissus
Pharmacogénomique ⇒ L’étude des effets des médicaments sur le génome humain.
À l’inverse de la pharmacogénétique qui étudie l’influence du patrimoine génétique sur le sort
des médicaments. Il est cependant fréquent que les deux termes soient utilisés
indistinctement.
10. Glossaire 3
-Omique Définition
Phylogénomique ⇒ La rencontre de deux champs de recherche : la phylogénie et la génomique.
Ce terme est employé dans plusieurs contextes différents mais désigne toujours une
catégorie d'analyse impliquant des données génomique et de l'inférence évolutive, en
particulier la reconstruction phylogénétique.
La phylogénomique sert la prédiction des fonctions de gènes basée sur leur histoire
évolutive dans l'arbre phylogénétique. Elle conjecture la reconstruction
phylogénétique par combinaison d'un grand nombre de gènes ou de génomes
complets et opère la fusion des données issues de l'analyse des génomes et de la
reconstruction phylogénétique.
Interactomique ⇒ L'étude des interactions entre les différentes molécules biochimiques.
Cette discipline présente un grand intérêt pour la compréhension des réseaux
d'interactions protéiques.
Métabolomique ⇒ La science très récente qui étudie l'ensemble des métabolites (sucres, acides aminés,
acides gras, etc.) présents dans une cellule, un organe, un organisme.
C'est l'équivalent de la génomique pour l'ADN. Elle utilise la spectrométrie de masse et la
résonance magnétique nucléaire.
11. Glossaire 4
-Omique Définition
Protéomique ⇒ L’étude des protéomes, c'est-à-dire l'ensemble des protéines d'une cellule, d'un
organite, d'un tissu, d'un organe ou d'un organisme à un moment donné et sous
des conditions données.
Dans la pratique, la protéomique s'attache à identifier de manière globale les protéines
extraites d'une culture cellulaire, d'un tissu ou d'un fluide biologique, leur localisation
dans les compartiments cellulaires, leurs éventuelles modifications post-
traductionnelles ainsi que leur quantité. Elle permet de quantifier les variations de
leur taux d'expression en fonction du temps, de leur environnement, de leur état de
développement, de leur état physiologique et pathologique, de l'espèce d'origine.
Elle étudie aussi les interactions que les protéines ont avec d'autres protéines, avec
l'ADN ou l'ARN, ou d'autres substances.
Transcriptomique ⇒ L'étude de l'ensemble des ARN messagers produits lors du processus de
transcription d'un génome.
Elle repose sur la quantification systématique de ces ARNm, ce qui permet d'avoir une
indication relative du taux de transcription de différents gènes dans des conditions
données. Plusieurs techniques permettent d'avoir accès à cette information, en
particulier celle des puces à ADN, celle de la PCR quantitative ou encore celle du
séquençage systématique d'ADN complémentaires.