Le projet vise à améliorer la compétitivité de la filière laitière par la sélection génomique et le conseil axé sur la santé animale. En mettant en place une évaluation génétique pour prévenir des pathologies telles que l'acétonémie, il promet de réduire les coûts de production et d'améliorer le bien-être animal. Ce programme innovant implique une collaboration entre différents acteurs de la filière laitière et prévoit des résultats à court et moyen terme pour dynamiser le secteur.

1. « Amélioration de la santé productive en
élevage par la sélection génomique et le
conseil »
Conférence de presse – 5 juillet 2016

2. Qu’est ce que ?
Améliorer la compétitivité de la filière laitière par la Santé animale
> Consommateurs :
• Plus d’aliments santé, « naturels »
• Bien-être animal de + en + important / acte d’achat
• Recherche d’une sécurité alimentaire sans faille
> Transformateurs :
• Mieux répondre aux consommateurs – fidéliser les débouchés
• Différencier la filière laitière française
> Eleveurs :
• Diminuer les coûts de production
• Améliorer le confort de travail et le besoin d’intervention
• Sécuriser la santé du troupeau
• Sélection et Prévention

3. Sélection des meilleurs animaux :
- Génétique (ES et indexeurs)
- Appui technique Conseil en Elevage (ECEL)
Marché (industriel laitier)
AMONT
Production de lait
AVAL
Vente de lait
1er projet réunissant des acteurs de l’ensemble
de la filière bovine laitière !
Une réalisation collective concrète

4. Partenaires professionnels
- Entreprises de sélection
- Entreprises de Conseil en
Elevage
- Industriel laitier
Collaboration scientifique
Unité mixte et technologique gestion
des populations génétique et
génomique (Jouy en Josas – 78)
Une réalisation collective concrète

5. Le Projet
• Projet labellisé par le pôle de Compétitivité
• Obtention d’un financement par le Fonds Unique Interministériel
(Etat et Collectivités territoriales)
Montant total du projet : 4,97 M€ / Aide sollicitée : 1,75 M€

6. Les travaux d’indexation

7. Etude d’association génotypes / phénotypes
1- Identification des animaux
2- Collecte de données 2- Prélèvement de matériel
biologique – extraction ADN
- génotypage
3- Constitution d’une base
de données de phénotypes
3- Constitution d’une base
de données de génotypes
POPULATION DE REFERENCE
GENOTYPES / PHENOTYPES
« Etude d’association
génotypes/phénotypes » = équations
décrivant les relations statistiques entre
génotypes et phénotypes »
INDEXATION GENOMIQUE: estimation du
potentiel génétique d’animaux sans performances

8. Les phénotypes d’intérêt
Races concernées: Holstein, Normande et Pie Rouge.
Phénotypes ayant des répercussions importantes sur le sanitaire, la
santé des troupeaux et leur bien-être, la rentabilité économique des
élevages:
 Note acétonémie
 Données d’observations des lésions des pieds
 Données évènements « santé » (mortalité, métrites, pb
pulmonaires, caillette, fièvre vitulaire,...)

9. 1er caractère : ACETONEMIE

10. Qu’est ce que l’Acétonémie?
 Pathologie métabolique principale des vaches laitières en début de
lactation
 Quels impacts ?
 Diminution de la production laitière (-300 à -500 kg/lact)
 Impact sur la reproduction (retard cyclicité et baisse réussite IA1 jusqu’à
20%)
 Augmentation du risque : rétention placentaire et déplacement de
caillette (x4 à 8)
 Augmentation des mammites cliniques (x3)
 Quelle fréquence ?
• Acétonémie clinique : 3 à 4 % des vaches
• Acétonémie sub-clinique : 12 à 20 % des vaches

11. Acétonémie et GENOSANTE
Objectif: Prévenir et réduire le risque d’acétonémie en élevage
laitier
L’existant:
 Production en routine de dosages des corps cétoniques
 Modèle de calcul d’un indicateur pour les éleveurs (CETODETECT®)
 Valorisation en élevage par un conseil technico-économique adapté déjà
effective et appréciée par les éleveurs
Le projet:
 Mettre en place une évaluation génétique
 Estimer le potentiel d’amélioration par la sélection et le conseil

12. Une évaluation génétique ACETONEMIE fiable
Nombre
d’enregistrements
Nombre de vaches
Normande 451 808 140 015
Holstein/Pie Rouge 2 688 583 806 039
En 2016
Héritabilité :
Population Holstein/Pie Rouge Population Normande
0,10 0,14
 Héritabilité équivalente à celle des cellules
 L’acétonémie est corrélée positivement aux taux et à la fertilité 
l’index acétonémie n’induira pas de contre sélection.

13. Incidence d’acétonémie selon l’index acétonémie
femelle
14% des VL
Très sensibles
50% saines
22% des VL
Sensibles
70% saines
55% des VL
Normaux
83% saines
10% des VL
Résistants
90% saines

14. 0
5
10
15
20
25
30
35
40
45
-2 à -3 -1 à -2 -1 à - 0,5 0 à -0,5 0 à + 0,5 0,5 à 1 1 à 2 2 à 3
% Vaches en Acétonémie clinique
Incidence d’acétonémie clinique selon l’index
acétonémie femelle - génomique
Très sensibles
5,8% Sensibles
3,2% Normaux
1,9% Résistants
0,8%
 Plus de 15% des femelles avec un index génomique -2 et moins font une
acétonémie clinique contre moins de 1% pour les femelles indexées à +1 et plus
Toutes races

15. Impact économique de l’acétonémie
 Coût moyen de l’acétonémie :
250€/ vache touchée, clinique ou sub-clinique
 Pour un élevage de 100 VL :
24 femelles touchées (seulement 4 « malades »)
Impact : 6000€/an soit 60€/VL présente
= budget Repro/génétique ou Conseil
 Effet de sélection attendu grâce à GENOSANTE :
1ère génération : baisse de 21% : 1200€
2ème génération : baisse / situation initiale de 36% : 2100€ (21€/VL)

16. Fiabilité
- GENOMIQUE:
> Masse de données collectées et utilisées dans l’évaluation:
> CD équivalent à des caractères fonctionnels déjà évalués
(ex: fertilité)
- POLYGENIQUE :
> Ascendance 0,30 (CD actuel obtenu pour les CEL)
> Femelles avec lactation : de 0,50 à 0,60
> Taureaux : >0,90 avec 100 filles
Population
Holstein/Pie Rouge
Population
Normande
Animaux sans performances –
jeunes veaux
0,66 0,58

17. Les avantages
 Pour les Eleveurs:
Animaux sains = Gain économique et confort de travail (moins de pathologies à soigner)
 Pour les Conseillers:
Entreprises de Conseil en Elevage : un index
> qui renforce l’indicateur CETODETECT®
> consolide la valeur du conseil
Entreprises de Sélection : un index
> qui renforce la valeur génétique proposée dans un contexte concurrentiel
> qui renforce la valeur du conseil
 Pour la Filière:
Moins d’utilisation de médicaments, moins d’antibiorésistance, amélioration du bien-être animal
Renforcement potentiel de compétitivité hors prix vs concurrence sur les marchés

18. 2 index dès août 2016
SYNTHESE SANTE
Index de synthèse comme la Morpho.
Composition :
- 30% ACETONEMIE
- 30% REPRO
- 30% SANTE MAMELLE
- 10% LONGEVITE
> une vision globale sur la Santé
> intègrera les prochains critères de santé
ACETONEMIE
Index élémentaire comme la Mammite clinique
> : de Véritables Index
> des Index privés uniquement disponibles auprès des partenaires
Polygénique : adhérents CETODETECT® Génomique : EVOLUTION & partenaires

19. RDV le 11 août avec la diffusion de ces
nouveaux index !

20. Perspectives : 2017
SANTE DES PIEDS
Boiteries => 3ème maladie en élevage laitier par sa fréquence et son
impact économique
 Faible lien avec la morphologie des aplombs
 Prévalence en augmentation
En cours: Action de collecte de données de parage et de génotypage
conjointe EVOLUTION/ECEL
Objectif (/pop de référence)
Phénotypes Génotypes
Population Holstein/Pie Rouge 50 000 12 000
Population Normande 50 000 8 000

21. Conclusion
• Un programme ambitieux, ouvert et collectif, visant à dynamiser
la filière laitière française ainsi que les entreprises du territoire,
• Un projet innovant, cf pas de sélection génétique à ce jour sur les
critères de santé à l’exception des mammites,
• Une motivation et des intérêts communs et partagés entre les
différentes familles professionnelles (Entreprises de Sélection, de
Conseil en Elevage, Industriels,…),
• Une approche originale car globale
... De la collecte de données à une valorisation technico-
économique sur l’ensemble des maillons de la filière bovine laitière.

22. Conclusion
 A court terme:
Eté 2016: 1ers résultats
 A moyen terme:
Amélioration du cheptel et du conseil aux éleveurs,
raisonner les accouplements et sélectionner les ressources
génétiques les plus intéressantes
 Et à plus long terme :
Retombées pour la filière laitière :
o Rentabilité des élevages et renforcement du tissu des
producteurs
o Compétitivité des partenaires