Présentation des programmes de sélection génétique de la filière brebis laitière

1. La sélection des brebis laitières, une organisation
collective pour répondre aux enjeux actuels
et futurs de la filière
C N B L
Comité National
Brebis Laitières

2. 5 races locales de brebis laitières élevées dans
des territoires de montagnes
Race Lacaune
Races Manech
Tête Noire
Tête Rousse
Basco –Béarnaise
Race Corse

3. Lacaune
Corse
Basco-Béarnaise
Manech tête rousse
Manech tête noire
224 l.
[148 j.]
251 l.
[164 j.]
184 l.
[149 j.]
346 litres
[176 jours]
153 litres
[188 jours]
Sources : IDELE, CNBL, INRA
Crédits photo : Confédération de Roquefort - B. Tauran, IDELE, GIS iD 64
339
231
149
0
50
100
150
200
250
300
350
400
2000 2005 2010 2015 2020
Corse, + 1,5%/an [+2,0 litres/an]
Pyrénées, + 3,0%/an
[+5,1 litres/an]
Lacaune, + 1,3%/an [+ 3,8 litres/an]
Production laitière au contrôle laitier officiel (2021)
et évolution au cours des 20 dernières années

4. Petit retour en arrière....
0
50
100
150
200
250
300
1965
1970
1975
1980
1985
1990
1995
2000
Lait
(litres)
Campagne
BB MTN MTR Lacaune Corse
Une évolution permise
grâce à la mise en place
de schémas de sélection
collectifs des races
locales dans leurs milieux
d’élevage respectifs

5. Organisation pyramidale des schémas : une optimisation
technique et financière
Noyau
de sélection
(20-25 %
de la population
Elevages utilisateurs
Concentration des outils de la sélection :
contrôle de performance officiel, généalogies,
accouplements raisonnés, évaluation
génomique...
Système d’information
Création du progrès
génétique
Diffusion du progrès génétique

6. Les clés du progrès génétique
Intensité de sélection
(choix des meilleurs reproducteurs à
l’échelle du noyau de sélection)
Précision de la mesure
du caractère
(respect du protocole de CL, qualité
pointage, qualité du phénotypage...)
Variabilité génétique du
caractère
(plus le caractère est variable et mieux
c’est)
Intervalle de génération
(plus il est long et moins vite se fait le
remplacement de génération)

7. Illustration de l’efficacité au travers de la sélection pour
les taux en race Lacaune
Situation des années 1995 dans le Rayon de Roquefort des TP inférieurs à 52 g/l
=> mise en œuvre de la sélection sur les taux
-1,00
-0,50
0,00
0,50
1,00
1,50
2,00
2,50
3,00
49
50
51
52
53
54
55
56
57
TP Rayon
(g/l)
Index TP
cohorte
béliers
(g/l)
Campagne de production
Temps nécessaire
pour pouvoir mesurer
la diffusion

8. La génétique : un levier technique très efficace, ...
Evolution « lente » (échelle de temps : 5-10 ans) mais collective, pérenne
et cumulative
Objectifs de sélection => pilotage collectif de l’orientation de la race
Prise en compte des caractères de production (lait, taux), fonctionnel (mamelle), résistance
(tremblante, mammites/cellules, parasitisme)...
Pilotage via les pondérations techniques ou économiques des caractères constitutifs de
l’index de synthèse Lacaune
Lait
MAM
CELL
TP
TB
MTR
Lait
MAM
CELL
TP
TB

9. C N B L
Comité National
Brebis Laitières
La génétique : ...,
s’inscrivant dans
le cadre d’un
service global, ...

10. La génétique : ... et d’organisations collectives raciales et
nationale.
Noyau de sélection :
700 élevages
330 000 brebis en CLO
++
4 000 génotypages/an
Centre d’IA
~ 2 000 béliers
Béliers génomiques
500 béliers retenus/an
++ IA diffusion
Béliers et agnelles
CREATION
Evaluation
génétique
Organismes techniques
Organismes de sélection
Entreprises de sélection
Innovation,
R&D
C N B L
Comité National
Brebis Laitières
DIFFUSION

11. Avec la génomique, ...
Gain en matière de progrès génétique => possibilité d’intégrer de
nouveaux caractères pour répondre aux enjeux de demain
Importance de la population de référence mutualisée à l’échelle du
schéma de sélection les béliers génotypés avec les
performances (phénotypes) de leurs filles
Un index génomique ne « fonctionne » que si le reproducteur indexé
est proche/connecté à la population de référence

12. Sélectionner la brebis adaptée aux systèmes d’élevage de
demain
Plus économe et autonome : améliorer l’efficience notamment l’efficacité
alimentaire, la mobilisation/dépôt des réserves corporelles...
Plus résistance : améliorer la résilience des animaux, longévité
fonctionnelle, résistance aux maladies (ex. parasitisme...), maladies
métaboliques...
Adaptée à une diversité de systèmes : améliorer l’efficacité de production à
l’échelle de l’animal et du système
Produisant un lait de qualité : qualité nutritionnelle du lait, spectres MIR du
lait, concept de santé globale...
Adaptée au changement climatique : améliorer la thermo-tolérance, limiter
les émissions de CH4...

13. Des travaux de R&D déjà lancés...
Plusieurs programmes de recherche sont en cours (d’autres en cours de
construction) dans le cadre de l’UMT GPR en lien avec les organismes
techniques, les organismes/entreprises de sélection, les interprofessions
régionales, France Brebis Laitière et coordonnés dans le cadre du CNBL.
En matière d’efficience/résilience en petits ruminants :
un projet européen phare
Projet H2020 [2018 – 2023]
26 partenaires
13 pays dont 10 européens
5 000 éleveurs
1 500 000 brebis/chèvres
7 000 000 € de budget
Des premiers résultats intéressants

14. Une illustration avec la dynamique des réserves
corporelles
Capacité de mobilisation/
dépôt des réserves corporelles :
héritabilité entre 10 et 20 %
Travaux conduits sur le troupeau Romane de l’INRAE de La
Fage conduit en plein air intégral sur le Causse du Larzac
Mating
Mating
Mating
BCS
Days
Simulation
Observation
Mobilisation
Dépôt
Note
Etat
Corporel
Jours
Sources : INRAE, T. Macé, D. Harzard

15. Autre illustration avec l’efficience alimentaire
Principe de l’estimation de l’efficience alimentaire en brebis laitière
alimentée collectivement :
Comparaison (par ratio ou par différence) entre :
- les besoins en énergie estimés compte tenu de la production
- les apports de la ration + var. NEC (– croissance et entretien)
APPORTS BESOINS APPORTS BESOINS
NON EFFICIENTE EFFICIENTE

16. Un phénotypage relativement simple
MISE-BAS SEVRAGE LUTTE
NEC
30 jours
avant MB
NEC
Fin
d’allaitement
NEC
PL1 PL2
NEC NEC
30 jours
avant lutte
30 jours
après lutte
EA1 EA2 EA3 EA4 EA5 EA6
RATION +
DAC
RATION +
DAC
RATION +
DAC
RATION +
DAC
RATION +
DAC
RATION +
DAC
Enquêtes alimentation
au CLO1
PL3 PL4 PL5 PL6
Protocole de
phénotypage
SMARTER
et 1ers paramètres
génétiques
Héritabilités de l’efficience alimentaire en Lacaune :
de l’ordre de 10-15%
15 élevages
8 race Lacaune
7 races ovines laitières des Pyrénées
2 campagnes 2020 et 2021
ENREGISTREMENT de l’ALIMENTATION
A CHAQUE CONTRÔLE LAITIER
(Sources : Coralie Machefert et al. 2022)

17. Résistance au parasitisme : plus de 10 ans de travaux
collectifs entre la recherche et le CDEO
En amont (dès les années 2000) : travaux de recherche (INRAE – ENV Toulouse) pour
démontrer la faisabilité d’une sélection génétique pour la résistance
Grace à des programmes de recherche collectifs (PARALUT, GIEE, ANTHERIM…) associant
OS, ES, INRAE, IDELE, ENVT... :
• Travaux de recherche appliquée pour mettre au point un protocole adapté aux races
ovines laitières :
• Qui ne perturbe pas les béliers
• Qui fonctionne
• Qui donne des différences entre les béliers
• Permettant une évaluation génétique pour comparer les béliers les uns avec les autres
• En ayant vérifié que leurs fils (ou filles) présentent les mêmes tendances de résistance ou
de sensibilité aux parasites
• Et le tout avec un nombre suffisant de béliers et de descendants mesurés dans des
conditions identiques

18. Pour arriver à un protocole standardisé en ovin laitier
• Males n’ayant jamais connu le parasite (Haemonchus Contorsus)
• Élevés dans les mêmes conditions et d'âge identique
• Répliqué à chaque nouvelle génération pour cumuler et sécuriser les données
• Valorisation génétique de données standardisées
jours Copro
contrôle
Copro
comptage
Hémato
sang
infestation Traitement
anthelminthique
J - 15 oui oui
J 0 infest 1 oui oui 3500 L3 d’H.
contortus
J +28 oui oui oui
J +43 infest 2 oui oui 5000 L3 d’H.
contortus
J +71 oui oui oui
Protocole phénotypage
Une indexation
• Résistance au parasite
• Résilience à l’infestation
• Un index combinant les 2
Un travail collectif
Béliers protocoles…

19. Gérer les cas urgents…
Index Index
Résistant +++ Sensible---
Actuellement : élimination des animaux
les plus sensibles sur le plan génétique
du
Demain : intégration dans l’objectif de
sélection
Le schéma collectif au service de
tous les éleveurs utilisateurs
Utilisation spécifique de béliers
résistants en complément de la gestion
des autres pratiques sur l’exploitation
(gestion intégrée de la santé)
Le schéma collectif au service des
cas d’urgence
A l’échelle du programme de
sélection
Avec un gain collectif …
Cas d’urgence : élevages
n’ayant plus d’antiparasitaires
assez efficaces

20. La génétique : un levier collectif efficace
pour une gestion intégrée du parasitisme
Chaque nouvelle génération de bélier est un peu
résistante que la précédente
Développement en cours d’une indexation génomique
Intégration à venir dans ISOL

21. En synthèse, le cercle vertueux d’une organisation
génétique collective
R&D,
innovation
Création
Diffusion
Accompag
nement
technique
Mutualisa
tion des
coûts