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panorama des logiciels!
de gestion de références
bibliographiques
Urfist de Paris / mai 2016
frédérique cohen-adad
2
3	

✓ une terminologie multiple :
logiciels de gestion bibliographique,
logiciels de gestion de références bibliographiques,
logiciels bibliographiques, …
reference management software,
personal reference management software,
bibliographic management software,
bibliographic software,
citation management software,
PDF-manager software,
web based bibliography management system, …
4	

✓ en 2008, Carole Zweifel dans la Revue électronique suisse de science de
l'information (RESSI n°7 mai 2008)★ donne une première définition qui
précise les fonctionnalités de base attendues pour un LGRB :
"Le logiciel de gestion de références bibliographiques permet de gérer
des références bibliographiques au sein d’une base de données :
description de chaque référence (article, monographie, page web,
thèse,…) à l’aide d’une grille de catalogage,
importation des références depuis des bases bibliographiques en ligne
(Medline, ArXiv, INSPEC, Citeseer…),
recherches dans les références, regroupement selon plusieurs critères
puis création automatique d’une liste bibliographique selon les
exigences de présentation spécifiques aux diverses publications
scientifiques."
★ Zweifel, C. Logiciels de gestion de références bibliographiques : citons le libre !
RESSI, no 7, mai 2008 http://www.ressi.ch/num07/article_045
5	

✓ puis Nancy Glassman & Karen Sorensen en 2012★ reprennent les
fonctions de base attendues :
"Citation management software provides three primary functions:
gathering references,
storing and organizing them,
and citing and formatting bibliographies.
et notent une fonction supplémentaire :
Recently, a fourth function has been gaining in popularity:
sharing/collaborating and social bookmarking"
★ Glassman, N. R. & Sorensen, K. Citation management. Journal of
Electronic Resources in Medical Libraries, 9 (3): 223-231, 2012
✓ aujourd'hui, se sont ajoutées de nouvelles fonctionnalités telles que :
visualisation des données
gestion de projet
recommandations
catégorisation thématique automatique
✓ écrits à l'origine (début des années 80) pour la communauté
scientifique
✓ une histoire liée au développement du web et des accès aux sources
✓ rendus indispensables par l'essor de la production scientifique :
explosion du nombre de documents disponibles,
multiplicité des formats (texte, image, multimedia, …)
6	

★ et en conséquence, la multiplication de l'offre de LGRB au fil des ans
7	

1982
 1989
1983
 1988
1984
BDB en pleine croissance
accès en ligne/serveurs
ordinateurs personnels
1ères BD avec
texte intégral
8	

1991
 1998
1990
 2000
ArXiv essor des BD
avec texte intégral
PubMed Central
plateformes d'éditeurs
SpringerLink
ScienceDirect
mouvement
Open Access
téléchargement
automatique à partir
des BD couramment
utilisées (STM)
LGRB
interaction directe
avec le traitement
de texte
intégration des normes
bibliographiques
9	

2001
 2008
2004
 2006
2003
 2004
2001
 2006
 2007
 2008
 2009
croissance exponentielle
de l’information numérique
format XML,
généralisation des
métadonnées et ontologies
LGRB : multiplication de l'offre avec logiciels en ligne et open source
10	

2010
2010
 2011
 2013
développement de
l'informatique en nuage
ou cloud computing
Linked Data
données interopérables
langage RDF
mouvement
Open Data
gestion poussée
du texte intégral,
mind mapping,
recommandations,
gestion de projets, …
source : F. Cohen-Adad. Les logiciels bibliographiques des années 80 à nos jours : une chronologie
synthétique. Journée d'étude "Regard(s) sur les logiciels bibliographiques, au carrefour des usages et
des innovations", Urfist de Lyon, 17 novembre 2014
http://lgrb-urfist2014.sciencesconf.org/resource/page/id/6
2014
 2015
le minimum…
✓ les capacités de gestion et d’organisation des références bibliographiques
✓ les fonctions d’importation de ces références
✓ les fonctions d’exportation
Ÿ l’édition dans les traitements de texte
Ÿ l’échange de références entre logiciels bibliographiques
11	

… et les "plus"
✓ le logiciel en pratique
✓ les développements liés au web 2.0
✓ les nouvelles fonctions des logiciels récents
12	

GESTION
GESTION DES LIENS
FONCTIONS DE RECHERCHE
GESTION DES TERMES
ORGANISATION DES RÉFÉRENCES
CAPACITÉS
- recherche de doublons	

recherche de texte intégral - mises à jour automatique	

GESTION
GESTION DES LIENS
FONCTIONS DE RECHERCHE
GESTION DES TERMES
ORGANISATION DES RÉFÉRENCES
CAPACITÉS
13
14	

IMPORTATION
FORMATS
SYSTÈMES D'IMPORTATION
SOURCES
15	

IMPORTATION
FORMATS
SYSTÈMES D'IMPORTATION
SOURCES
références dans des pages web
✓ les formats de stockage sont propres à chaque logiciel
✓ les formats d'échange ou formats d'import/export de références utilisent un
système de correspondance entre les structures des formats natifs.
format d'échange format de stockage
Attention ! - cette conversion peut être la source de pertes de données
- un logiciel peut proposer plus de formats pour l'importation que
pour l'exportation (et vice-versa)
16	

✓ distinguer - les formats de stockage (et par extension de sauvegarde)
- les formats d'échange de références entre logiciels et entre
logiciels et bases de données, catalogues, …
- les formats d'édition (ou styles d'écriture de la bibliographie)
conversion
17	

TY - JOUR
AU - Bayer, L.
AU - Mairet-Coello, G.
AU - Risold, P. Y.
AU - Griffond, B.
PY - 2002
TI - Orexin/hypocretin neurons: chemical phenotype and
possible interactions with melanin-concentrating hormone
neurons
SP - 33-39
JF - Regulatory Peptides
VL - 104
IS - 1
N1 - Orexin/hypocretin neurons: chemical phenotype and
possible interactions with melanin-concentrating hormone
neurons
KW - Lateral hypothalamus; Dynorphin; Secretogranin II;
Immunocytochemistry; Slice cultures; Competitive RT-PCR
ID - 1084
ER -
RIS
@book{Ben62,
title = L'Oxydation des m'etaux,
author = J. B{'e}nard and J. Bardolle and F. Bouillon and M. Cagnet%
and J. Moreau and G. Valensi,
publisher = Gauthier-Villars,
year = 1962
}
BibTex
%0 Journal Article
%A Bayer, L.
%A Mairet-Coello, G.
%A Risold, P. Y.
%A Griffond, B.
%D 2002
%T Orexin/hypocretin neurons: chemical phenotype and
possible interactions with melanin-concentrating hormone
neurons
%J Regulatory Peptides
%V 104
%N 1
%P 33-39
%! Orexin/hypocretin neurons: chemical phenotype and
possible interactions with melanin-concentrating hormone
neurons
%K Lateral hypothalamus; Dynorphin; Secretogranin II;
Immunocytochemistry; Slice cultures; Competitive RT-PCR
EndNote (Refer/BibIX)
format de référence pour l'échange de données,
notamment de métadonnées (métalangage) :
voir la présentation de F. Kaplan,
Comprendre à quoi sert le XML (octobre 2011)
http://www.slideshare.net/frederickaplan/a-quoi-sert-xml
XML
★ voir la présentation de T. Colombéra. Les LGRB, quels formats ? Journée d'étude Regard(s) sur les
logiciels bibliographiques, au carrefour des usages et des innovations, Urfist de Lyon, 17 novembre 2014
http://lgrb-urfist2014.sciencesconf.org/resource/page/id/6
18	

★Nadji F., Boudia D. Guide de rédaction des références bibliographiques [ en ligne ].
Villeurbanne : Doc'INSA, 2011. Disponible sur : http://referencesbibliographiques.insa-lyon.fr/
✓ les formats d'édition des références bibliographiques sont régis par des normes★
Ÿ norme ISO 690 (Afnor NF Z 44-005 de décembre 1987)
pour les publications imprimées, livres et publications en série, leurs parties
composantes (chapitres, articles) et les brevets
Ÿ norme ISO 690-2 (Afnor NF Z 44-005-2 de février 1988)
pour les documents électroniques, documents complets ou parties de documents
✓ par des recommandations spécifiques de domaines thématiques
Ÿ APA : American Psychological Association
Ÿ MLA : Modern Language Association (SHS)
Ÿ Vancouver (Médecine)
Ÿ Harvard (Science)
✓ par des recommandations spécifiques des éditeurs : Instructions to Authors,
Manuscript Format Policies, etc. propres à chaque périodique ou livre
19	

EXPORTATION
FORMATS D'ÉDITION
INTÉGRATION dans les
TRAITEMENTS de TEXTE
FORMATS D'EXPORTATION
20	

EXPORTATION
FORMATS D'ÉDITION
INTÉGRATION dans les
TRAITEMENTS de TEXTE
FORMATS D'EXPORTATION
21	

PRATIQUE DU LOGICIEL
MODULES EXTERNES et API
ANALYSES DES DONNÉES
L'USAGE
L'OUTIL
22	

PRATIQUE DU LOGICIEL
MODULES EXTERNES et API
ANALYSES DES DONNÉES
L'USAGE
L'OUTIL
23	

FONCTIONS WEB 2.0
PARTAGE de
RÉFÉRENCES :
le CLOUD
RÉSEAU SOCIAL
GESTION DES RÉFÉRENCES
24	

FONCTIONS WEB 2.0
PARTAGE de
RÉFÉRENCES :
le CLOUD
RÉSEAU SOCIAL
GESTION DES RÉFÉRENCES
25
Perkel, J. M. (05 November 2015)
Eight ways to clean a digital library.
Nature 527, 123–124
doi:10.1038/527123a
http://www.nature.com/news/eight-ways-to-
clean-a-digital-library-1.18695
26	

✓ propriétaire ou libre ?
Ÿ logiciel libre ≠ logiciel gratuit
Ÿ je choisis le logiciel libre (open source) et je suis prêt(e) à investir
un peu de temps pour comprendre le code source et le modifier
selon mes propres besoins
Ÿ je rentre dans une communauté (développeurs et utilisateurs) :
pérennité★, mises à jour ?
Ÿ je choisis le logiciel gratuit en tenant compte qu'il peut avoir
des fonctionnalités limitées (choix temporaire : version d'appel
vers le logiciel propriétaire payant)
★ 2collab (gratuit, web, produit par Elsevier), apparu en novembre 2007 et fermé en avril 2011
connotea (gratuit, web, produit par Nature Publishing Group), décembre 2004 et fermé en mars 2013
27	

✓ disponibilité des références ?
Ÿ je souhaite avoir mes références accessibles en permanence :
accès mobiles, web, cloud
Ÿ je travaille avec des personnes dans le monde entier, nous
souhaitons partager des références dans un espace commun :
logiciel avec intégration web et gestion des droits d'accès
(public, privé)
Ÿ je travaille sur un poste géré par un administrateur, difficultés
pour les téléchargements et installation/configuration : logiciel en
ligne, web, cloud
Ÿ je suis conscient(e) qu'il peut y avoir :
Ÿ des difficultés d'accès aux documents déposés sur un serveur :
maintenance, débits de connexion, spams, …
Ÿ des problèmes de sécurité des données : possibilité ou non
d'installation sur un serveur personnel
28	

open source	

propriétaire	

gratuit	

propriétaire	

payant	

local 	

(client)	

dépendant de l’OS	

BibdeskM 	

Bibus 	

Docear 2009	

JabRef	

CitaviW 	

EndNote	

SciRefW 	

SenteM 	

en ligne	

(serveur,
cloud)	

indépendant de l’OS	

Aigaion 	

RefbaseL 	

WikIndxL 	

Bibsonomy 	

CiteULike	

EndNote basic	

Flow★ 2013	

RefME★ 2014	

Wizfolio★	

F1000Workspace 2015	

Paperpile 2013	

Refworks	

local et en ligne	

 Zotero★	

Colwiz 2010	

Mendeley★ 	

Qiqqa★W 2010 	

ReadCube★ 2011	

BiblioscapeW 	

Papers 	

Reference Manager★W	

★payant au-delà de 300 Mo
★version payante pour ↑↑ les capacités	

★n’est plus mis à jour depuis 2010
L OPAC sur serveur local que l’on peut installer soi-même
WWindows uniquement
M MacOS uniquement
29	

	

	

✓ choix de logiciels représentatifs
Ÿ un ancien : EndNote (1988)
Ÿ uniquement sur serveur : RefWorks (2001), EndNote basic (2005) et RefME (2014)
Ÿ uniquement réseau social : CiteULike (2004)
Ÿ hybrides : Zotero (2006), Papers (2007), Mendeley (2008) et Colwiz (2011)
✓ critères de comparaison
Ÿ la recherche de documents
Ÿ la gestion des références
Ÿ le partage des documents
Ÿ l'édition
✓ synthèse de lectures parmi lesquelles★
Ÿ Wikipedia. Comparison of reference management software, 11 avril 2016
Ÿ Comparaison de logiciels de gestion de références bibliographiques.
Universitätsbibliothek, Technische Universität München, juin 2015
Ÿ Documents de la veille partagée sur les groupes publics de Mendeley et Zotero
et de tests personnels
★références complètes dias 43-44
30	

✓ recherche documentaire
Ÿ j’utilise beaucoup de sources différentes et je veux intégrer facilement
tous les documents trouvés :
logiciel avec des formats d'importation en grand nombre,
logiciel avec un plugin de type web importer
Ÿ je veux interroger les catalogues de bibliothèques et importer les
références automatiquement :
logiciel capable d'établir une connexion de type z39.50,
logiciel avec collecte automatique depuis des sites compatibles
Ÿ je veux être à jour dans mes thématiques en permanence :
logiciel avec des systèmes de veille automatique (fils RSS, alertes, …)
31	

EndNote
EndNote
basic
RefWorks	

Zotero
Mendeley	

Papers	

Colwiz	

RefME	

CiteULike	

import depuis
les BD
★★(★) ★★ ★★(★) ★★★ ★★★ ★★★ ★★(★) ★★(★) ★★
plugin
navigateur
(web importer)
+
(EN basic)
+ +
RefGrab-it
intégré
avec le
navigateur
+
import to
+
open in
+
import to
+
Web
Clipper★
+
post to
connexions
Z39-50
+ + + - - - - - -
modification/
création filtres
et connexions
+ - - - - - - - /
capture de
pages web - - - + - - - - -
import PDF
(➝ notices)
+ - - + + + + - -
import DOI,
ISBN, URL
+ -
+
RefGrab-it
+ - - - +
+
post URL
fils RSS - - +
+
web - - - - +
★ le navigateur compatible avec le WebClipper de RefME dépend du poste de travail :
ordinateur ➝ Chrome
iPad, iPhone ➝ Safari
32	

✓ organisation - gestion des références
Ÿ j’ai un grand nombre de documents et je veux les retrouver et les
trier facilement : logiciel offrant la possibilité d'avoir plusieurs
collections (bibliothèques), des groupes de références, des systèmes de
tri et de visualisation spécifiques, une interface de recherche avancée
Ÿ j'ai des documents de formats variés à intégrer dans ma
bibliothèque : logiciel avec suffisamment de grilles de description de
référence, logiciel acceptant tout type de fichiers attachés
Ÿ je dois intégrer des données diverses dans les références : logiciel
avec des notices dont les champs sont facilement modifiables,
possibilités de modifications en lot
33	

EndNote
EndNote
basic
RefWorks	

Zotero
Mendeley	

Papers	

Colwiz	

RefME	

CiteULike	

nombre de
bibliothèques
ouverture/travail
simultanés
illimité 1 1 1 1 1 1 1 1
nombre max
de documents
illimité
10 000/
50 000
illimité
300 Mo
web gratuit
2 Go
web gratuit
?
5000
+ 2 à 30 Go
web gratuit
? ?
modification/
création
champs des
notices / types de
documents
+ - - - - - - - -
groupes + + + + + + + + +
groupes
dynamiques
(smart folders)
+ - - + - + + - -
chercher/
remplacer
modifications
en lot
+ - + - - ? - - -
34	

EndNote
EndNote
basic
RefWorks	

Zotero
Mendeley	

Papers	

Colwiz	

RefME	

CiteULike	

recherche
avancée
+
tous les
champs
-
+
tous les
champs
+
en local
tous les
champs
+
en local
5 champs
- - -
+
syntaxe à
connaître
recherche
automatique de
texte intégral
(PDF)
+ - +
+
à l'import
+
à l'import
+
à l'import
+ - -
recherche de
doublons
+ + + + + + +
+
à l'import
+
à l'import
annotations
PDF, capture web
+ - - +
page web
+
≠ couleurs
+ + - -
affichages / tri
particuliers
rating
lu/non lu - -
chrono-
logies
favoris
lu/non lu
rating
favoris
lu/non lu
- -
rating
(partagé)
quelques fonctions particulières pour la gestion des références
EndNote : mises à jour automatique des références /
listes thématiques / liens entre références
Zotero : connexions entre références / notes indépendantes
Papers : navigateur intégré
35	

✓ disponibilité	

	

Ÿ je voyage beaucoup et souhaite avoir mes références
accessibles en permanence : logiciel avec intégration web et
synchronisation des données, accès mobiles et tablettes	

✓ partage de références	

Ÿ je travaille avec des personnes dans le monde entier, nous 	

souhaitons partager des références dans un espace commun :
logiciel orienté réseau social, logiciel avec intégration web,
possibilité de gestion des droits d’accès et d’écriture	

Ÿ je gère les publications d’un centre de recherche et les publie
sur le web : logiciel avec un format d’export html, interface web
avec la gestion des droits d’accès (public, privé)	

✓ compatibilité	

	

Ÿ je travaille avec de nombreux collaborateurs qui utilisent
différents logiciels clients (sur poste), nous voulons échanger
facilement nos données : logiciel avec des formats d’importation/
exportation en grand nombre
★sur la notion de lecture augmentée, voir la présentation de E. Broudoux. Outils de lecture augmentée
sur le web. Journée d'étude Regard(s) sur les logiciels bibliographiques, au carrefour des usages et
des innovations, Urfist de Lyon, 17 novembre 2014.
http://lgrb-urfist2014.sciencesconf.org/resource/page/id/6
36	

EndNote
EndNote
basic
RefWorks	

Zotero
Mendeley	

Papers	

Colwiz	

RefME	

CiteULike	

formats d'import/export
BibTeX, XML, RIS,MODS, …
★★★
(1)
★★(★)
(1)
★★(★)
(1)
★★★
(2)
★★(★)
(3)
★★(★)
★★(★)
(3)
★★
(4)
★★(★)
groupes de références
partagées sur le web - + + + +
+
Dropbox
+ + +
gestion des droits
lecture/écriture
/ + + + + + + - -
applications mobiles
+
(9 €) iPad - +
Ref Mobile
+
iOS
Android
+
iOS
+
(9 €) iOS
+
iOS
Android
+
iOS
Android
-
partage twitter, facebook - - - - - + - + +
synchronisation + + / + + + + + /
communauté d'usagers
forum thématique, liste de diffusion
+ - - + + + + + +
(1) + format tabulé
(2) + formats d'export : Evernote, Bibliontology, Wikipédia Citation Templates, Unqualified Dublin Core RDF, …
(3) pas d'export possible depuis l'interface web
(4) import RIS uniquement / + export Evernote
37	

✓ écriture – citations et listes bibliographiques
Ÿ j'utilise LaTeX, mes références doivent être au format BibTeX :
logiciel capable de traiter ce format (importation/exportation des
références)
Ÿ je souhaite utiliser des styles qui me sont propres : un logiciel
ayant des formats d'édition sur lesquels on peut intervenir (création/
modification)
Ÿ je veux un logiciel compatible avec mon traitement de texte
pour insérer facilement les citations dans le texte et créer les listes
bibliographiques automatiquement : logiciel avec plugins pour
Microsoft Word, OpenOffice.org Writer, Pages '09, …
38	

EndNote
EndNote
basic
RefWorks	

Zotero
Mendeley	

Papers	

Colwiz	

RefME	

CiteULike	

nombre de styles ★★★ ★★ ★★ ★★ ★★ ★★ ★★ ★★ ★
création/modification ✪
de styles
++ - +
+
(csl)
+
(csl)
+
(csl) - - -
plugin intégré
dans le traitement de texte Word
★ + + + + + + +
+
16€/an
Win-iOS
-
OpenOffice
★ + - - + + - + - -
LibreOffice - - - + - - + - -
Pages '09
★ + - - - - + - - -
LaTeX/BibTeX
★ export
BibTeX
export
BibTeX
export
BibTeX
export
BibTeX
+
plugin
intégré
export
BibTeX
export
BibTeX
export
BibTeX
export
BibTeX
✪également modification/création de styles : Bibus, Citavi, Qiqqa, Refbase, Sente
également :
★plugin Word : Citavi, Colwiz, Docear, F1000Workspace, Qiqqa, ReadCube, Sente, WizFolio
★OpenOffice : Bibus, Citavi, Colwiz, JabRef, Sente, WizFolio
★Pages '09 : Sente
★LaTeX/BibTeX : Bibdesk, Citavi, JabRef, Qiqqa, Refbase
★Google Docs : F1000Workspace, Paperpile, WizFolio
également : EndNote : Mathematica, Power Point
Zotero : WordPress avec Zotpress, Spip avec Zotspip
✓ des API pour échanger les données avec des logiciels tiers
Ÿ Mendeley : Papercritic, Altmetric, rOpenSci, …
Ÿ Zotero : Paper Machines, phpZoteroWebDAV, Zotfile, Zotpad, BibBase, …
Ÿ API de EndNote proposée aux développeurs
(http://endnote.com/product-details/integration)
✓ des LGRB intégrés dans des plateformes (contenus + outils logiciels)
Ÿ Thomson Reuters (Web of Science ) avec EndNote
Ÿ Springer (NPG), Wiley, SciELO, PeerJ, … pour ReadCube
Ÿ Elsevier (Scopus et ScienceDirect) avec Mendeley
Ÿ Proquest avec Flow (new RefWorks)
Ÿ F1000 avec F1000Workspace
★ voir la présentation de F. Clavert. Le futur des logiciels bibliographiques. Journée d'étude Regard(s) sur les
logiciels bibliographiques, au carrefour des usages et des innovations, Urfist de Lyon, 17 novembre 2014.
http://lgrb-urfist2014.sciencesconf.org/resource/page/id/6 39
40	

✓ gestion poussée des PDF
Ÿ visualisation des données + annotations : cartes heuristiques
Ÿ interfaçage avec les éditeurs et les portails de producteurs
Ÿ liens vers les articles cités
✓ gestion de tâches
Ÿ organiseur
Ÿ calendrier
Ÿ messagerie
✓ partage
Ÿ recommandations
Ÿ partage direct sur réseaux sociaux
Ÿ annotations collaboratives
✓ application mobile avec fonction scanner
pour les codes barre des ouvrages
41	

✓ des limites de plus en plus floues entre les logiciels : différences ou
complémentarité ?
ainsi au sens strict, CiteULike (comme Bibsonomy) ne peut pas être
considéré pleinement comme un logiciel de gestion de références
bibliographiques en raison de ses fonctionnalités limitées, en particulier pour
l'édition : absence de système d'intégration de références dans un traitement de
texte (même s'il peut générer une liste bibliographique). Cependant il a une
vraie place dans le contexte de communautés fondées sur les échanges de
bibliographies et est utilisé dans les mesures d'impact alternatives (altmetrics).
✓ de nouveaux outils intégrés dans les plateformes d'éditeurs qui
ajoutent une couche communautaire aux fonctions traditionnelles de
recherche de documents, liant l'utilisateur au contenu de la plateforme
✓ ne pas oublier que ce sont des outils en perpétuel développement,
qui évoluent en permanence, très rapidement
42	

✓ dualité entre
Ÿ un logiciel simple d'utilisation, tout en un, mais de ce fait aux
fonctionnalités figées et non modulables
Ÿ un logiciel plus complexe au premier abord et nécessitant un temps
d'apprentissage, mais beaucoup plus configurable et d'une grande
souplesse d'utilisation, en particulier pour l'organisation des données et
l'édition bibliographique
✓ être attentif à
Ÿ intervenir le moins possible manuellement dans les notices
Ÿ un logiciel avec une grille de description de notices correcte pour
tous les types de documents que l'on utilise
Ÿ un logiciel avec les capacités d'import correctes pour toutes ses
propres sources d'intérêt
Ÿ un logiciel proposant des styles dans son domaine d'intérêt
Ÿ tenir compte des usages de sa communauté
Ÿ pas de données sensibles sur un serveur et sauvegardes régulières
43	

✓ proposition
Ÿ choisir le logiciel avec les capacités d'importation les meilleures en
fonction de ses sources de documents d'intérêt (BD, catalogues, pages
web, sites d'éditeurs,…)
Ÿ utiliser les fonctions d'échanges de références (formats d'export/import)
entre logiciels pour transférer les bibliothèques dans un logiciel ayant les
meilleures capacités d'édition des références
Ÿ avoir une bibliothèque principale contenant toutes les références dans
un logiciel puissant en terme de gestion/organisation
Ÿ créer un groupe ouvert dans un logiciel en ligne pour partager ses
thèmes d'intérêt et échanger sa bibliographie avec d'autres utilisateurs
✓ ou accepter un compromis !
44	

Journée d'étude Regard(s) sur les logiciels bibliographiques, au carrefour des usages et des innovations, Urfist de
Lyon, 17 novembre 2014
http://lgrb-urfist2014.sciencesconf.org/
Pour une veille sur le sujet, suivre au choix :
Groupe public logiciels bibliographiques sur Mendeley
http://www.mendeley.com/groups/2006433/logiciels-bibliographiques/papers/
Groupe public LGRB journée URFIST 2014 sur Zotero
https://www.zotero.org/groups/lgrb_journe_urfist_2014
Comparison of reference management software. Wikipedia, 11 avril 2016
http://en.wikipedia.org/wiki/Comparison_of_reference_management_software
Panorama et évolution des logiciels de gestion de références bibliographiques
ML Malingre, Urfist de Rennes, 7 novembre 2015
http://www.sites.univ-rennes2.fr/urfist/ressources/panorama-et-evolution-des-logiciels-de-gestion-de-references-
bibliographiques?destination=ressources
Se former aux logiciels de bibliographies
E Ruiz, La boîte à outils des historiens, 15 mars 2015
http://www.boiteaoutils.info/2015/03/formations-bibliographie
Eight ways to clean a digital library [Online].
Perkel JM, Nature 527: 123–124, 2015.
http://www.nature.com/news/eight-ways-to-clean-a-digital-library-1.18695
45	

Oxford LibGuides, Bodleian Libraries, University of Oxford, avril 2016
http://libguides.bodleian.ox.ac.uk/reference-management
comparison table: RefWorks, EndNote, EndNote online, Zotero, Mendeley, Colwiz, Papers
Choosing a Citation Manager. Penn State University Libraries, février 2016
https://www.libraries.psu.edu/psul/lls/choose_citation_mgr.html
comparaison de 5 logiciels : Zotero, Mendeley, EndNote, EndNote basic, RefWorks
Comparaison de logiciels de gestion de références bibliographiques. Universitätsbibliothek, Technische Universität
München, juin 2015
https://mediatum.ub.tum.de/doc/1272837/1272837.pdf
comparaison de 8 logiciels : Citavi, Colwiz, Docear, EndNote, JabRef, Mendeley, RefWorks, Zotero
Citation Managers: Comparison of Features. Libraries of the University of Wisconsin-Madison, 2015
http://www.library.wisc.edu/citation-managers/comparison.html
comparaison de 4 logiciels : EndNote, EndNote basic, Zotero et Mendeley
Overview of citation software at MIT: Managing your references: Which program is right for you? MIT Libraries, 2015
http://libguides.mit.edu/references
comparaison de 3 logiciels : EndNote, Zotero et Mendeley
Tools for managing bibliographic data / information (Carte interactive d'outils de gestion bibliographique), janv 2015
http://cmapspublic3.ihmc.us/rid=1JWZ0NQ3P-VN3B44-C729/Bibliographic%20tools.cmap
PLUME. Zoom sur la gestion de références bibliographiques dans PLUME, fiches logiciels mises à jour 2013
http://www.projet-plume.org/fr/ressource/zoom-sur-la-gestion-de-references-bibliographiques-dans-plume
accès aux fiches logiciels à jour de BibTeX, Bibus , JabRef, Wikindx, Zotero
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Aigaion http://www.aigaion.de/
BibDesk http://bibdesk.sourceforge.net/
Biblioscape http://www.biblioscape.com/
BibTeX http://www.bibtex.org/
Bibus http://bibus-biblio.sourceforge.net/
Citavi http://www.citavi.com/
CiteULike http://www.citeulike.org/
Colwiz http://www.colwiz.com/
Docear http://www.docear.org/
EndNote http://www.endnote.com/
EndNote basic http://www.myendnoteweb.com/
F1000Workspace http://f1000.com/work/
Flow https://flow.proquest.com/
JabRef http://jabref.sourceforge.net/
Mendeley http://www.mendeley.com/
Paperpile https://paperpile.com/
Papers http://www.papersapp.com/
Qiqqa http://www.qiqqa.com/
ReadCube https://www.readcube.com/
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Reference Manager http://www.refman.com/
RefME https://www.refme.com
RefWorks http://www.refworks.com/
SciRef http://sci-progs.com/
Sente http: www.thirdstreetsoftware.com/
Wikindx http://wikindx.sourceforge.net/
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Zotero http://www.zotero.org/

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Panorama des logiciels de gestion de références bibliographiques

  • 1. 1 panorama des logiciels! de gestion de références bibliographiques Urfist de Paris / mai 2016 frédérique cohen-adad
  • 2. 2
  • 3. 3 ✓ une terminologie multiple : logiciels de gestion bibliographique, logiciels de gestion de références bibliographiques, logiciels bibliographiques, … reference management software, personal reference management software, bibliographic management software, bibliographic software, citation management software, PDF-manager software, web based bibliography management system, …
  • 4. 4 ✓ en 2008, Carole Zweifel dans la Revue électronique suisse de science de l'information (RESSI n°7 mai 2008)★ donne une première définition qui précise les fonctionnalités de base attendues pour un LGRB : "Le logiciel de gestion de références bibliographiques permet de gérer des références bibliographiques au sein d’une base de données : description de chaque référence (article, monographie, page web, thèse,…) à l’aide d’une grille de catalogage, importation des références depuis des bases bibliographiques en ligne (Medline, ArXiv, INSPEC, Citeseer…), recherches dans les références, regroupement selon plusieurs critères puis création automatique d’une liste bibliographique selon les exigences de présentation spécifiques aux diverses publications scientifiques." ★ Zweifel, C. Logiciels de gestion de références bibliographiques : citons le libre ! RESSI, no 7, mai 2008 http://www.ressi.ch/num07/article_045
  • 5. 5 ✓ puis Nancy Glassman & Karen Sorensen en 2012★ reprennent les fonctions de base attendues : "Citation management software provides three primary functions: gathering references, storing and organizing them, and citing and formatting bibliographies. et notent une fonction supplémentaire : Recently, a fourth function has been gaining in popularity: sharing/collaborating and social bookmarking" ★ Glassman, N. R. & Sorensen, K. Citation management. Journal of Electronic Resources in Medical Libraries, 9 (3): 223-231, 2012 ✓ aujourd'hui, se sont ajoutées de nouvelles fonctionnalités telles que : visualisation des données gestion de projet recommandations catégorisation thématique automatique
  • 6. ✓ écrits à l'origine (début des années 80) pour la communauté scientifique ✓ une histoire liée au développement du web et des accès aux sources ✓ rendus indispensables par l'essor de la production scientifique : explosion du nombre de documents disponibles, multiplicité des formats (texte, image, multimedia, …) 6 ★ et en conséquence, la multiplication de l'offre de LGRB au fil des ans
  • 7. 7 1982 1989 1983 1988 1984 BDB en pleine croissance accès en ligne/serveurs ordinateurs personnels 1ères BD avec texte intégral
  • 8. 8 1991 1998 1990 2000 ArXiv essor des BD avec texte intégral PubMed Central plateformes d'éditeurs SpringerLink ScienceDirect mouvement Open Access téléchargement automatique à partir des BD couramment utilisées (STM) LGRB interaction directe avec le traitement de texte intégration des normes bibliographiques
  • 9. 9 2001 2008 2004 2006 2003 2004 2001 2006 2007 2008 2009 croissance exponentielle de l’information numérique format XML, généralisation des métadonnées et ontologies LGRB : multiplication de l'offre avec logiciels en ligne et open source
  • 10. 10 2010 2010 2011 2013 développement de l'informatique en nuage ou cloud computing Linked Data données interopérables langage RDF mouvement Open Data gestion poussée du texte intégral, mind mapping, recommandations, gestion de projets, … source : F. Cohen-Adad. Les logiciels bibliographiques des années 80 à nos jours : une chronologie synthétique. Journée d'étude "Regard(s) sur les logiciels bibliographiques, au carrefour des usages et des innovations", Urfist de Lyon, 17 novembre 2014 http://lgrb-urfist2014.sciencesconf.org/resource/page/id/6 2014 2015
  • 11. le minimum… ✓ les capacités de gestion et d’organisation des références bibliographiques ✓ les fonctions d’importation de ces références ✓ les fonctions d’exportation Ÿ l’édition dans les traitements de texte Ÿ l’échange de références entre logiciels bibliographiques 11 … et les "plus" ✓ le logiciel en pratique ✓ les développements liés au web 2.0 ✓ les nouvelles fonctions des logiciels récents
  • 12. 12 GESTION GESTION DES LIENS FONCTIONS DE RECHERCHE GESTION DES TERMES ORGANISATION DES RÉFÉRENCES CAPACITÉS
  • 13. - recherche de doublons recherche de texte intégral - mises à jour automatique GESTION GESTION DES LIENS FONCTIONS DE RECHERCHE GESTION DES TERMES ORGANISATION DES RÉFÉRENCES CAPACITÉS 13
  • 16. ✓ les formats de stockage sont propres à chaque logiciel ✓ les formats d'échange ou formats d'import/export de références utilisent un système de correspondance entre les structures des formats natifs. format d'échange format de stockage Attention ! - cette conversion peut être la source de pertes de données - un logiciel peut proposer plus de formats pour l'importation que pour l'exportation (et vice-versa) 16 ✓ distinguer - les formats de stockage (et par extension de sauvegarde) - les formats d'échange de références entre logiciels et entre logiciels et bases de données, catalogues, … - les formats d'édition (ou styles d'écriture de la bibliographie) conversion
  • 17. 17 TY - JOUR AU - Bayer, L. AU - Mairet-Coello, G. AU - Risold, P. Y. AU - Griffond, B. PY - 2002 TI - Orexin/hypocretin neurons: chemical phenotype and possible interactions with melanin-concentrating hormone neurons SP - 33-39 JF - Regulatory Peptides VL - 104 IS - 1 N1 - Orexin/hypocretin neurons: chemical phenotype and possible interactions with melanin-concentrating hormone neurons KW - Lateral hypothalamus; Dynorphin; Secretogranin II; Immunocytochemistry; Slice cultures; Competitive RT-PCR ID - 1084 ER - RIS @book{Ben62, title = L'Oxydation des m'etaux, author = J. B{'e}nard and J. Bardolle and F. Bouillon and M. Cagnet% and J. Moreau and G. Valensi, publisher = Gauthier-Villars, year = 1962 } BibTex %0 Journal Article %A Bayer, L. %A Mairet-Coello, G. %A Risold, P. Y. %A Griffond, B. %D 2002 %T Orexin/hypocretin neurons: chemical phenotype and possible interactions with melanin-concentrating hormone neurons %J Regulatory Peptides %V 104 %N 1 %P 33-39 %! Orexin/hypocretin neurons: chemical phenotype and possible interactions with melanin-concentrating hormone neurons %K Lateral hypothalamus; Dynorphin; Secretogranin II; Immunocytochemistry; Slice cultures; Competitive RT-PCR EndNote (Refer/BibIX) format de référence pour l'échange de données, notamment de métadonnées (métalangage) : voir la présentation de F. Kaplan, Comprendre à quoi sert le XML (octobre 2011) http://www.slideshare.net/frederickaplan/a-quoi-sert-xml XML ★ voir la présentation de T. Colombéra. Les LGRB, quels formats ? Journée d'étude Regard(s) sur les logiciels bibliographiques, au carrefour des usages et des innovations, Urfist de Lyon, 17 novembre 2014 http://lgrb-urfist2014.sciencesconf.org/resource/page/id/6
  • 18. 18 ★Nadji F., Boudia D. Guide de rédaction des références bibliographiques [ en ligne ]. Villeurbanne : Doc'INSA, 2011. Disponible sur : http://referencesbibliographiques.insa-lyon.fr/ ✓ les formats d'édition des références bibliographiques sont régis par des normes★ Ÿ norme ISO 690 (Afnor NF Z 44-005 de décembre 1987) pour les publications imprimées, livres et publications en série, leurs parties composantes (chapitres, articles) et les brevets Ÿ norme ISO 690-2 (Afnor NF Z 44-005-2 de février 1988) pour les documents électroniques, documents complets ou parties de documents ✓ par des recommandations spécifiques de domaines thématiques Ÿ APA : American Psychological Association Ÿ MLA : Modern Language Association (SHS) Ÿ Vancouver (Médecine) Ÿ Harvard (Science) ✓ par des recommandations spécifiques des éditeurs : Instructions to Authors, Manuscript Format Policies, etc. propres à chaque périodique ou livre
  • 19. 19 EXPORTATION FORMATS D'ÉDITION INTÉGRATION dans les TRAITEMENTS de TEXTE FORMATS D'EXPORTATION
  • 20. 20 EXPORTATION FORMATS D'ÉDITION INTÉGRATION dans les TRAITEMENTS de TEXTE FORMATS D'EXPORTATION
  • 21. 21 PRATIQUE DU LOGICIEL MODULES EXTERNES et API ANALYSES DES DONNÉES L'USAGE L'OUTIL
  • 22. 22 PRATIQUE DU LOGICIEL MODULES EXTERNES et API ANALYSES DES DONNÉES L'USAGE L'OUTIL
  • 23. 23 FONCTIONS WEB 2.0 PARTAGE de RÉFÉRENCES : le CLOUD RÉSEAU SOCIAL GESTION DES RÉFÉRENCES
  • 24. 24 FONCTIONS WEB 2.0 PARTAGE de RÉFÉRENCES : le CLOUD RÉSEAU SOCIAL GESTION DES RÉFÉRENCES
  • 25. 25 Perkel, J. M. (05 November 2015) Eight ways to clean a digital library. Nature 527, 123–124 doi:10.1038/527123a http://www.nature.com/news/eight-ways-to- clean-a-digital-library-1.18695
  • 26. 26 ✓ propriétaire ou libre ? Ÿ logiciel libre ≠ logiciel gratuit Ÿ je choisis le logiciel libre (open source) et je suis prêt(e) à investir un peu de temps pour comprendre le code source et le modifier selon mes propres besoins Ÿ je rentre dans une communauté (développeurs et utilisateurs) : pérennité★, mises à jour ? Ÿ je choisis le logiciel gratuit en tenant compte qu'il peut avoir des fonctionnalités limitées (choix temporaire : version d'appel vers le logiciel propriétaire payant) ★ 2collab (gratuit, web, produit par Elsevier), apparu en novembre 2007 et fermé en avril 2011 connotea (gratuit, web, produit par Nature Publishing Group), décembre 2004 et fermé en mars 2013
  • 27. 27 ✓ disponibilité des références ? Ÿ je souhaite avoir mes références accessibles en permanence : accès mobiles, web, cloud Ÿ je travaille avec des personnes dans le monde entier, nous souhaitons partager des références dans un espace commun : logiciel avec intégration web et gestion des droits d'accès (public, privé) Ÿ je travaille sur un poste géré par un administrateur, difficultés pour les téléchargements et installation/configuration : logiciel en ligne, web, cloud Ÿ je suis conscient(e) qu'il peut y avoir : Ÿ des difficultés d'accès aux documents déposés sur un serveur : maintenance, débits de connexion, spams, … Ÿ des problèmes de sécurité des données : possibilité ou non d'installation sur un serveur personnel
  • 28. 28 open source propriétaire gratuit propriétaire payant local (client) dépendant de l’OS BibdeskM Bibus Docear 2009 JabRef CitaviW EndNote SciRefW SenteM en ligne (serveur, cloud) indépendant de l’OS Aigaion RefbaseL WikIndxL Bibsonomy CiteULike EndNote basic Flow★ 2013 RefME★ 2014 Wizfolio★ F1000Workspace 2015 Paperpile 2013 Refworks local et en ligne Zotero★ Colwiz 2010 Mendeley★ Qiqqa★W 2010 ReadCube★ 2011 BiblioscapeW Papers Reference Manager★W ★payant au-delà de 300 Mo ★version payante pour ↑↑ les capacités ★n’est plus mis à jour depuis 2010 L OPAC sur serveur local que l’on peut installer soi-même WWindows uniquement M MacOS uniquement
  • 29. 29 ✓ choix de logiciels représentatifs Ÿ un ancien : EndNote (1988) Ÿ uniquement sur serveur : RefWorks (2001), EndNote basic (2005) et RefME (2014) Ÿ uniquement réseau social : CiteULike (2004) Ÿ hybrides : Zotero (2006), Papers (2007), Mendeley (2008) et Colwiz (2011) ✓ critères de comparaison Ÿ la recherche de documents Ÿ la gestion des références Ÿ le partage des documents Ÿ l'édition ✓ synthèse de lectures parmi lesquelles★ Ÿ Wikipedia. Comparison of reference management software, 11 avril 2016 Ÿ Comparaison de logiciels de gestion de références bibliographiques. Universitätsbibliothek, Technische Universität München, juin 2015 Ÿ Documents de la veille partagée sur les groupes publics de Mendeley et Zotero et de tests personnels ★références complètes dias 43-44
  • 30. 30 ✓ recherche documentaire Ÿ j’utilise beaucoup de sources différentes et je veux intégrer facilement tous les documents trouvés : logiciel avec des formats d'importation en grand nombre, logiciel avec un plugin de type web importer Ÿ je veux interroger les catalogues de bibliothèques et importer les références automatiquement : logiciel capable d'établir une connexion de type z39.50, logiciel avec collecte automatique depuis des sites compatibles Ÿ je veux être à jour dans mes thématiques en permanence : logiciel avec des systèmes de veille automatique (fils RSS, alertes, …)
  • 31. 31 EndNote EndNote basic RefWorks Zotero Mendeley Papers Colwiz RefME CiteULike import depuis les BD ★★(★) ★★ ★★(★) ★★★ ★★★ ★★★ ★★(★) ★★(★) ★★ plugin navigateur (web importer) + (EN basic) + + RefGrab-it intégré avec le navigateur + import to + open in + import to + Web Clipper★ + post to connexions Z39-50 + + + - - - - - - modification/ création filtres et connexions + - - - - - - - / capture de pages web - - - + - - - - - import PDF (➝ notices) + - - + + + + - - import DOI, ISBN, URL + - + RefGrab-it + - - - + + post URL fils RSS - - + + web - - - - + ★ le navigateur compatible avec le WebClipper de RefME dépend du poste de travail : ordinateur ➝ Chrome iPad, iPhone ➝ Safari
  • 32. 32 ✓ organisation - gestion des références Ÿ j’ai un grand nombre de documents et je veux les retrouver et les trier facilement : logiciel offrant la possibilité d'avoir plusieurs collections (bibliothèques), des groupes de références, des systèmes de tri et de visualisation spécifiques, une interface de recherche avancée Ÿ j'ai des documents de formats variés à intégrer dans ma bibliothèque : logiciel avec suffisamment de grilles de description de référence, logiciel acceptant tout type de fichiers attachés Ÿ je dois intégrer des données diverses dans les références : logiciel avec des notices dont les champs sont facilement modifiables, possibilités de modifications en lot
  • 33. 33 EndNote EndNote basic RefWorks Zotero Mendeley Papers Colwiz RefME CiteULike nombre de bibliothèques ouverture/travail simultanés illimité 1 1 1 1 1 1 1 1 nombre max de documents illimité 10 000/ 50 000 illimité 300 Mo web gratuit 2 Go web gratuit ? 5000 + 2 à 30 Go web gratuit ? ? modification/ création champs des notices / types de documents + - - - - - - - - groupes + + + + + + + + + groupes dynamiques (smart folders) + - - + - + + - - chercher/ remplacer modifications en lot + - + - - ? - - -
  • 34. 34 EndNote EndNote basic RefWorks Zotero Mendeley Papers Colwiz RefME CiteULike recherche avancée + tous les champs - + tous les champs + en local tous les champs + en local 5 champs - - - + syntaxe à connaître recherche automatique de texte intégral (PDF) + - + + à l'import + à l'import + à l'import + - - recherche de doublons + + + + + + + + à l'import + à l'import annotations PDF, capture web + - - + page web + ≠ couleurs + + - - affichages / tri particuliers rating lu/non lu - - chrono- logies favoris lu/non lu rating favoris lu/non lu - - rating (partagé) quelques fonctions particulières pour la gestion des références EndNote : mises à jour automatique des références / listes thématiques / liens entre références Zotero : connexions entre références / notes indépendantes Papers : navigateur intégré
  • 35. 35 ✓ disponibilité Ÿ je voyage beaucoup et souhaite avoir mes références accessibles en permanence : logiciel avec intégration web et synchronisation des données, accès mobiles et tablettes ✓ partage de références Ÿ je travaille avec des personnes dans le monde entier, nous souhaitons partager des références dans un espace commun : logiciel orienté réseau social, logiciel avec intégration web, possibilité de gestion des droits d’accès et d’écriture Ÿ je gère les publications d’un centre de recherche et les publie sur le web : logiciel avec un format d’export html, interface web avec la gestion des droits d’accès (public, privé) ✓ compatibilité Ÿ je travaille avec de nombreux collaborateurs qui utilisent différents logiciels clients (sur poste), nous voulons échanger facilement nos données : logiciel avec des formats d’importation/ exportation en grand nombre
  • 36. ★sur la notion de lecture augmentée, voir la présentation de E. Broudoux. Outils de lecture augmentée sur le web. Journée d'étude Regard(s) sur les logiciels bibliographiques, au carrefour des usages et des innovations, Urfist de Lyon, 17 novembre 2014. http://lgrb-urfist2014.sciencesconf.org/resource/page/id/6 36 EndNote EndNote basic RefWorks Zotero Mendeley Papers Colwiz RefME CiteULike formats d'import/export BibTeX, XML, RIS,MODS, … ★★★ (1) ★★(★) (1) ★★(★) (1) ★★★ (2) ★★(★) (3) ★★(★) ★★(★) (3) ★★ (4) ★★(★) groupes de références partagées sur le web - + + + + + Dropbox + + + gestion des droits lecture/écriture / + + + + + + - - applications mobiles + (9 €) iPad - + Ref Mobile + iOS Android + iOS + (9 €) iOS + iOS Android + iOS Android - partage twitter, facebook - - - - - + - + + synchronisation + + / + + + + + / communauté d'usagers forum thématique, liste de diffusion + - - + + + + + + (1) + format tabulé (2) + formats d'export : Evernote, Bibliontology, Wikipédia Citation Templates, Unqualified Dublin Core RDF, … (3) pas d'export possible depuis l'interface web (4) import RIS uniquement / + export Evernote
  • 37. 37 ✓ écriture – citations et listes bibliographiques Ÿ j'utilise LaTeX, mes références doivent être au format BibTeX : logiciel capable de traiter ce format (importation/exportation des références) Ÿ je souhaite utiliser des styles qui me sont propres : un logiciel ayant des formats d'édition sur lesquels on peut intervenir (création/ modification) Ÿ je veux un logiciel compatible avec mon traitement de texte pour insérer facilement les citations dans le texte et créer les listes bibliographiques automatiquement : logiciel avec plugins pour Microsoft Word, OpenOffice.org Writer, Pages '09, …
  • 38. 38 EndNote EndNote basic RefWorks Zotero Mendeley Papers Colwiz RefME CiteULike nombre de styles ★★★ ★★ ★★ ★★ ★★ ★★ ★★ ★★ ★ création/modification ✪ de styles ++ - + + (csl) + (csl) + (csl) - - - plugin intégré dans le traitement de texte Word ★ + + + + + + + + 16€/an Win-iOS - OpenOffice ★ + - - + + - + - - LibreOffice - - - + - - + - - Pages '09 ★ + - - - - + - - - LaTeX/BibTeX ★ export BibTeX export BibTeX export BibTeX export BibTeX + plugin intégré export BibTeX export BibTeX export BibTeX export BibTeX ✪également modification/création de styles : Bibus, Citavi, Qiqqa, Refbase, Sente également : ★plugin Word : Citavi, Colwiz, Docear, F1000Workspace, Qiqqa, ReadCube, Sente, WizFolio ★OpenOffice : Bibus, Citavi, Colwiz, JabRef, Sente, WizFolio ★Pages '09 : Sente ★LaTeX/BibTeX : Bibdesk, Citavi, JabRef, Qiqqa, Refbase ★Google Docs : F1000Workspace, Paperpile, WizFolio également : EndNote : Mathematica, Power Point Zotero : WordPress avec Zotpress, Spip avec Zotspip
  • 39. ✓ des API pour échanger les données avec des logiciels tiers Ÿ Mendeley : Papercritic, Altmetric, rOpenSci, … Ÿ Zotero : Paper Machines, phpZoteroWebDAV, Zotfile, Zotpad, BibBase, … Ÿ API de EndNote proposée aux développeurs (http://endnote.com/product-details/integration) ✓ des LGRB intégrés dans des plateformes (contenus + outils logiciels) Ÿ Thomson Reuters (Web of Science ) avec EndNote Ÿ Springer (NPG), Wiley, SciELO, PeerJ, … pour ReadCube Ÿ Elsevier (Scopus et ScienceDirect) avec Mendeley Ÿ Proquest avec Flow (new RefWorks) Ÿ F1000 avec F1000Workspace ★ voir la présentation de F. Clavert. Le futur des logiciels bibliographiques. Journée d'étude Regard(s) sur les logiciels bibliographiques, au carrefour des usages et des innovations, Urfist de Lyon, 17 novembre 2014. http://lgrb-urfist2014.sciencesconf.org/resource/page/id/6 39
  • 40. 40 ✓ gestion poussée des PDF Ÿ visualisation des données + annotations : cartes heuristiques Ÿ interfaçage avec les éditeurs et les portails de producteurs Ÿ liens vers les articles cités ✓ gestion de tâches Ÿ organiseur Ÿ calendrier Ÿ messagerie ✓ partage Ÿ recommandations Ÿ partage direct sur réseaux sociaux Ÿ annotations collaboratives ✓ application mobile avec fonction scanner pour les codes barre des ouvrages
  • 41. 41 ✓ des limites de plus en plus floues entre les logiciels : différences ou complémentarité ? ainsi au sens strict, CiteULike (comme Bibsonomy) ne peut pas être considéré pleinement comme un logiciel de gestion de références bibliographiques en raison de ses fonctionnalités limitées, en particulier pour l'édition : absence de système d'intégration de références dans un traitement de texte (même s'il peut générer une liste bibliographique). Cependant il a une vraie place dans le contexte de communautés fondées sur les échanges de bibliographies et est utilisé dans les mesures d'impact alternatives (altmetrics). ✓ de nouveaux outils intégrés dans les plateformes d'éditeurs qui ajoutent une couche communautaire aux fonctions traditionnelles de recherche de documents, liant l'utilisateur au contenu de la plateforme ✓ ne pas oublier que ce sont des outils en perpétuel développement, qui évoluent en permanence, très rapidement
  • 42. 42 ✓ dualité entre Ÿ un logiciel simple d'utilisation, tout en un, mais de ce fait aux fonctionnalités figées et non modulables Ÿ un logiciel plus complexe au premier abord et nécessitant un temps d'apprentissage, mais beaucoup plus configurable et d'une grande souplesse d'utilisation, en particulier pour l'organisation des données et l'édition bibliographique ✓ être attentif à Ÿ intervenir le moins possible manuellement dans les notices Ÿ un logiciel avec une grille de description de notices correcte pour tous les types de documents que l'on utilise Ÿ un logiciel avec les capacités d'import correctes pour toutes ses propres sources d'intérêt Ÿ un logiciel proposant des styles dans son domaine d'intérêt Ÿ tenir compte des usages de sa communauté Ÿ pas de données sensibles sur un serveur et sauvegardes régulières
  • 43. 43 ✓ proposition Ÿ choisir le logiciel avec les capacités d'importation les meilleures en fonction de ses sources de documents d'intérêt (BD, catalogues, pages web, sites d'éditeurs,…) Ÿ utiliser les fonctions d'échanges de références (formats d'export/import) entre logiciels pour transférer les bibliothèques dans un logiciel ayant les meilleures capacités d'édition des références Ÿ avoir une bibliothèque principale contenant toutes les références dans un logiciel puissant en terme de gestion/organisation Ÿ créer un groupe ouvert dans un logiciel en ligne pour partager ses thèmes d'intérêt et échanger sa bibliographie avec d'autres utilisateurs ✓ ou accepter un compromis !
  • 44. 44 Journée d'étude Regard(s) sur les logiciels bibliographiques, au carrefour des usages et des innovations, Urfist de Lyon, 17 novembre 2014 http://lgrb-urfist2014.sciencesconf.org/ Pour une veille sur le sujet, suivre au choix : Groupe public logiciels bibliographiques sur Mendeley http://www.mendeley.com/groups/2006433/logiciels-bibliographiques/papers/ Groupe public LGRB journée URFIST 2014 sur Zotero https://www.zotero.org/groups/lgrb_journe_urfist_2014 Comparison of reference management software. Wikipedia, 11 avril 2016 http://en.wikipedia.org/wiki/Comparison_of_reference_management_software Panorama et évolution des logiciels de gestion de références bibliographiques ML Malingre, Urfist de Rennes, 7 novembre 2015 http://www.sites.univ-rennes2.fr/urfist/ressources/panorama-et-evolution-des-logiciels-de-gestion-de-references- bibliographiques?destination=ressources Se former aux logiciels de bibliographies E Ruiz, La boîte à outils des historiens, 15 mars 2015 http://www.boiteaoutils.info/2015/03/formations-bibliographie Eight ways to clean a digital library [Online]. Perkel JM, Nature 527: 123–124, 2015. http://www.nature.com/news/eight-ways-to-clean-a-digital-library-1.18695
  • 45. 45 Oxford LibGuides, Bodleian Libraries, University of Oxford, avril 2016 http://libguides.bodleian.ox.ac.uk/reference-management comparison table: RefWorks, EndNote, EndNote online, Zotero, Mendeley, Colwiz, Papers Choosing a Citation Manager. Penn State University Libraries, février 2016 https://www.libraries.psu.edu/psul/lls/choose_citation_mgr.html comparaison de 5 logiciels : Zotero, Mendeley, EndNote, EndNote basic, RefWorks Comparaison de logiciels de gestion de références bibliographiques. Universitätsbibliothek, Technische Universität München, juin 2015 https://mediatum.ub.tum.de/doc/1272837/1272837.pdf comparaison de 8 logiciels : Citavi, Colwiz, Docear, EndNote, JabRef, Mendeley, RefWorks, Zotero Citation Managers: Comparison of Features. Libraries of the University of Wisconsin-Madison, 2015 http://www.library.wisc.edu/citation-managers/comparison.html comparaison de 4 logiciels : EndNote, EndNote basic, Zotero et Mendeley Overview of citation software at MIT: Managing your references: Which program is right for you? MIT Libraries, 2015 http://libguides.mit.edu/references comparaison de 3 logiciels : EndNote, Zotero et Mendeley Tools for managing bibliographic data / information (Carte interactive d'outils de gestion bibliographique), janv 2015 http://cmapspublic3.ihmc.us/rid=1JWZ0NQ3P-VN3B44-C729/Bibliographic%20tools.cmap PLUME. Zoom sur la gestion de références bibliographiques dans PLUME, fiches logiciels mises à jour 2013 http://www.projet-plume.org/fr/ressource/zoom-sur-la-gestion-de-references-bibliographiques-dans-plume accès aux fiches logiciels à jour de BibTeX, Bibus , JabRef, Wikindx, Zotero
  • 46. 46 Aigaion http://www.aigaion.de/ BibDesk http://bibdesk.sourceforge.net/ Biblioscape http://www.biblioscape.com/ BibTeX http://www.bibtex.org/ Bibus http://bibus-biblio.sourceforge.net/ Citavi http://www.citavi.com/ CiteULike http://www.citeulike.org/ Colwiz http://www.colwiz.com/ Docear http://www.docear.org/ EndNote http://www.endnote.com/ EndNote basic http://www.myendnoteweb.com/ F1000Workspace http://f1000.com/work/ Flow https://flow.proquest.com/ JabRef http://jabref.sourceforge.net/ Mendeley http://www.mendeley.com/ Paperpile https://paperpile.com/ Papers http://www.papersapp.com/ Qiqqa http://www.qiqqa.com/ ReadCube https://www.readcube.com/ refbase http://www.refbase.net/ Reference Manager http://www.refman.com/ RefME https://www.refme.com RefWorks http://www.refworks.com/ SciRef http://sci-progs.com/ Sente http: www.thirdstreetsoftware.com/ Wikindx http://wikindx.sourceforge.net/ WizFolio http://wizfolio.com/ Zotero http://www.zotero.org/