Etude de la diversité génétique des schistosomes

1. Etude de la diversité génétique
des schistosomes
Présenté par: TCHAKOUNTE WILLIAM
Sous la supervision de: ANGORA K. Etienne, PharmD, PhD
Maître de Conférences Agrégé
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2. Plan
• Généralités
• Cycle de vie de la shistosomiase
• Diversité génétique de schistosomes
• Méthode de typage moléculaire des
schistosomes
• Conclusion
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3. Généralités
Les schistosomes sont des parasites hématophages
appartenant à la famille des Schistosomatidae.
Ils sont responsables de la schistosomiase, une maladie
parasitaire qui affecte des millions de personnes dans le
monde entier.
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4. Généralités
• Il existe 5 espèces de Schistosoma
pathogènes pour l’Homme :
– S. haematobium,
– S. mansoni,
– S. japonicum,
– S. intercalatum/guineensis
– S. mekongi.
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5. Généralités
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Plus de 90% des quelque 200 millions de cas de bilharziose ont
lieu en Afrique dont environ les deux tiers sont causés par
Schistosoma haematobium.

6. Cycle de vie de la shistosomiase
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7. Diversité génétique de schistosomes
• La diversité génétique se réfère à la variation de
l'information génétique au sein d'une population
d'organismes.
• Elle peut se manifester par des différences dans les
gènes, les allèles, les chromosomes, les génomes, ou
même les phénotypes.
• L'étude de la diversité génétique des schistosomes est
importante pour comprendre la biologie et
l'épidémiologie de ces parasites, ainsi que pour
développer des stratégies de lutte efficaces
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8. Méthode de typage moléculaire des
schistosomes (2)
• Plusieurs méthodes peuvent être utilisées pour
étudier la diversité génétique des schistosomes:
– SNP (Single Nucleotide Polymorphism)
– ITS (Internal transcribed spacer)
– Gènes ribosomial: Cox1, Cox2 (cytochrome oxidase
sub-unit 1 and 2),
– Les microsatellites
– RFLP (restriction fragment length polymorphism):
– AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism) et
RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA).
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9. Méthode de typage moléculaire des
schistosomes (3)
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- Les SNP sont utilisés pour
étudier la diversité génétique des
schistosomes en comparant les
variations dans un seul
nucléotide entre différentes
souches.
-Les SNP peuvent être génotypés
à l'aide de différentes
techniques, notamment la PCR
multiplexe, le séquençage haut
débit (NGS) et l'hybridation sur
puce (SNP array).

10. Méthode de typage moléculaire des
schistosomes (4)
• L'ITS est une région de l'ADN présent entre les gènes
ribosomiques qui est transcrit en ARN ribosomique.
• Les régions ITS1 et ITS2 sont les plus couramment utilisées,
mais certaines études ont également utilisé la région ITS3.
– La région ITS1 est située entre l'ARNr 18S et l'ARNr 5.8S
– ITS2 est située l'ARNr5.8S l'ARNr 28S.
• Les deux régions sont hautement variables entre les
espèces de schistosomes et entre les individus, ce qui les
rend utiles pour l'analyse de la diversité génétique.
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11. Méthode de typage moléculaire des
schistosomes (5)
• Parmi les gènes mitochondriaux utilisés pour le typage
des schistosomes, on peut citer:
– Le cytochrome oxydase subunit 1 (Cox1) et le cytochrome
oxydase subunit 2 (Cox2) : ces deux gènes sont des sous-
unités de la chaîne de transport d'électrons de la
mitochondrie.
– Le gène nad4 : ce gène code pour une sous-unité de la
NADH déshydrogénase, une enzyme impliquée dans la
chaîne de transport d'électrons de la mitochondrie.
– Les gènes codant pour les ARNr ribosomiques : le
ribosome mitochondrial des schistosomes est constitué de
deux sous-unités, une petite (rrnS) et une grande (rrnL),
qui sont codées par des gènes mitochondriaux.
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12. Méthode de typage moléculaire des
schistosomes (6)
• des techniques de PCR et de
séquençage.
• limitée par la présence de
polymorphismes neutres ou de
séquences d'ADN non
fonctionnelles dans certaines
régions des gènes
• ce qui peut réduire la capacité
de différenciation entre les
populations de schistosomes.
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13. Méthode de typage moléculaire des
schistosomes (7)
• microsatellites sont des séquences d'ADN
courtes et répétées en tandem, généralement
de deux à six nucléotides de longueur, qui
peuvent varier en nombre de répétitions dans
différentes souches de schistosomes.
• Les différences dans le nombre de répétitions
de ces microsatellites sont utilisées pour
distinguer les souches de schistosomes.
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14. Méthode de typage moléculaire des
schistosomes (8)
• Il existe plusieurs microsatellites qui ont été
utilisés pour le typage des schistosomes:
– SH1, SmLE2, SjMS1, Sh112, Sm21.8
• typage des microsatellites est effectué par:
– PCR, séparés par électrophorèse sur gel d'agarose
– l'hybridation de sondes,
– le séquençage direct,
– le séquençage de nouvelle génération (NGS)
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15. Méthode de typage moléculaire des
schistosomes (9)
• restriction fragment length polymorphism (RFLP): utilise
des enzymes de restriction pour cliver l'ADN en fragments
de tailles différentes.
• fragments obtenus sont séparés par électrophorèse et les
profils obtenus sont comparés pour déterminer les
variations génétiques.
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16. Méthode de typage moléculaire des
schistosomes (10)
• Les marqueurs AFLP et RAPD sont des marqueurs
moléculaires basés sur la PCR (Polymerase Chain Reaction)
qui permettent d'amplifier des fragments d'ADN aléatoires.
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17. Conclusion
• l'étude de la diversité génétique des schistosomes est un domaine
de recherche important pour comprendre leurs épidémiologie et la
biologie.
• Les techniques moléculaires, telles que les marqueurs
microsatellites, SNP, ITS, gènes mitochondriaux et AFLP/RAPD, ont
permis de décrire une grande variabilité génétique dans les
populations de ces parasites.
• L'utilisation de ces techniques moléculaires permette de mieux
comprendre la répartition géographique des différents génotypes,
d'identifier les schistosomes hybrides, de retracer l'origine
géographique des souches de schistosomes et d'évaluer les
migrations passées de ces parasites.
• Ses recherche contribuent à la compréhension des mécanismes de
transmission et d'infection des schistosomes, ce qui est essentiel
pour lutter contre la schistosomiase et protéger la santé publique.
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18. Je vous remercie
pour votre
attention
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