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DIAGNOSTIC ANTENATAL ET FOETAL ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]
l’organisation du génome humain   Le génome  =  3 milliard de pb Nombre de gènes : environ 30 000 ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]
les stratégies d’analyse en génétique ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]
Les techniques de cytogénétique dans le DPN : le caryotype ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]
1.Définition du caryotype ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]
 
2. Rappel sur les chromosomes   Les différents stades de condensation de l’ADN   ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],télomère télomère centromère
 
[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]
2. Rappel sur la mitose :   place de la mitose dans le cycle cellulaire
3. Réalisation d’un caryotype :  prélèvement et recueil des cellules amniotiques Centrifugeuse -> recueil des cellules
3. Réalisation d’un caryotype :  étape de culture cellulaire Hotte à flux laminaire milieu stérile nutritif Incubation à 37°C et 5% CO2  étuve
3. Réalisation d’un caryotype :  obtention de mitoses en métaphase ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]
2.Rappel sur la mitose : Les quatre phases de la mitose 1 4 2 3
[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]
[object Object]
3. Réalisation d’un caryotype :  Vérification de la richesse des mitoses mitose
3. Réalisation d’un caryotype :  dénaturation et coloration des chromosomes ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]
3. Réalisation d’un caryotype :   analyse des mitoses au microscope à contraste de phase
3. Réalisation d’un caryotype  :  classement des chromosomes ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]
3. Réalisation d’un caryotype  :   classement des chromosomes après  giemsa grands à centromères presque médian grands à centromère distaux Chromosomes de taille moyenne grands acrocentriques petits à centromères médian petits acrocentriques Chomosomes sexuels
3. Réalisation d’un caryotype :  banding des chromosomes: 400-550 bandes
4. Les différents prélèvements   caryotype à partir de l’amniocentèse ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]
4. Les différents prélèvements   caryotype à partir de l’amniocentèse ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]
Dans le LA Après culture  clones issus de cellules différentes Culture A Culture B Pseudo-mosaïcisme Mosaïcisme vrai Caryotype du liquide amniotique   avec une mosaïque
4. Les différents prélèvements ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]
4. Les différents prélèvements  4.1.caryotype à partir du sang du cordon   ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]
5. les prélèvements prénataux :  caryotype à partir des villosités choriales ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],1  mésoblaste extra-embryonnaire 2  cytotrophoblaste 3  syncytiotrophoblaste
4. Caryotype  direct  à partir des villosités choriales ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]
4. Caryotype  après culture  des villosités choriales ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]
Origine des VC Cytotrophoblaste = direct Tissu extra-embryonnaire = culture caryotype de  2 tissus d’origine différente
Problème des mosaiques sur VC   mosaïque retrouvée aussi chez le fœtus   mosaïque confinée au placenta = non retrouvée dans le LA  ou le sang foetal : 1 à 2% des VC
5. Anomalies du caryotype  =  anomalie des chromosomes ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]
5.1. Anomalies de nombre du caryotype : triploidie 69,XXXou XXY ou XYY 69,XXX ou XYY 69,XXX ou XXY
5.2. Anomalies de nombre du caryotype : trisomie
5.3. Anomalies de nombre du caryotype : marqueur surnuméraire : 47, XY,+mar ,[object Object],[object Object],[object Object]
5.4 .  Anomalies de structure du caryotype Les anomalies de structure équilibrées les plus fréquentes  : les translocations Translocation réciproque Translocation Robertsonienne
5.5 .  Anomalies de structure du caryotype 45,XX,t(13;14)(q10;q10)
5.6 .  Anomalies de structure du caryotype Des anomalies de structure équilibrées moins fréquentes  : les inversions et les insertions Inversion paracentrique insertion Inversion péricentrique
5.7. Anomalies du caryotype :  Les anomalies de structure déséquilibrées   délétion duplication chromosome en anneau isochromosome
5.6 .  Anomalies de structure du caryotype RCIU post natal + CIA  : 46,XX,del(13)(q21.1)
5.8 .  Anomalies de structure du caryotype 46,XX,r(14)(p11.2q32)
6. Conseil génétique devant une anomalie du caryotype : ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],Méiose   Population à risque : parent porteur d ’une anomalie chromosomique équilibrée
trisomie 13 45,XX,t(13;14) méïose trisomie 14 fécondation Gamete normal Der(13;14) Disomie 14 Disomie 13
Les techniques de cytogénétique moléculaire dans le DPN ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]
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1.  le principe de la FISH : Deux propriétés de la molécule d’ADN ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]
1. le principe de la FISH  =  Fluorescence In Situ Hybridation ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]
1. principe de la FISH :   Les principales étapes d’une FISH ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]
1. le principe de la FISH :  lecture  ,[object Object]
2. Applications de la FISH :  différentes sondes ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]
2.1.  Applications de la FISH  aneuvysion   à partir du liquide amniotique ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],Diagnostic fiable et rapide des principales aneuploidies
2.1. indication de la FISH  aneuvysion   à partir du liquide amniotique   ,[object Object],[object Object],[object Object],18
2.2. application de la FISH :  diagnostic   d’un syndrome microdélétionnel ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]
2.3. application de la FISH     Identification d’un petit marqueur surnuméraire
2.3. application de la FISH : Identification d’un petit marqueur surnuméraire par   FISH centromérique
4. application de la FISH  Identification d’un petit chromosome 15 surnuméraire
2.3. application de la FISH  Identification d’un petit chromosome 15 surnuméraire   FISH spécifique de la région Willy-Prader-Angelman
2.3. application de la FISH : identification d’un isodicentrique du chromosome 15 CEP 15 CEP 15 SNRPN, D15S10 SNRPN, D15S10 47,XX,+idic(15;15)(q13;q13).ish15q11-q13 (SNRPN++,D15S10++)
2.4. application de la FISH  délétion
2.4. application de la FISH  délétion  délétion du gène du rétinoblastome RB1
2.4. application de la FISH  délétion interstitielle  une délétion interstitielle du chromosome 13
Techniques de biologie moléculaire dans le  DPN ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]
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  ( 1) Les techniques de base de la biologie   moléculaire  la PCR : amplification exponentielle   Anomalie ciblée pour le choix des amorces
(1) Les techniques de base de la biologie   moléculaire  électrophorèse sur gel après PCR Séparation selon la taille visualisation des bandes avec le bromure d'éthidium sous UV but : séparer l’ADN chargé négativement au travers d'un gel sous l'effet d'un champ électrique
(1) Les techniques de base de la biologie   moléculaire  électrophorèse sur capillaire après PCR Le nombre de paires de bases (pb)
( 2) Les  applications  de la biologie moléculaire  diagnostic direct   / screening des exons ,[object Object],Myopathie de Duchenne
(2) Les applications de la biologie moléculaire  diagnostic direct   /recherche d’une petite délétion  ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],PCR fluorescente Migration sur un séquenceur automatique
(2) Les applications de la biologie moléculaire  diagnostic direct   / recherche d’une mutation ponctuelle Enzyme de restriction 1.Hétérozygote (noir) : site de restriction 2.Homozygote normal (noir) Amorce en bleue d’un témoin de digestion hétérozygote
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(2) Les applications de base de la biologie moléculaire  diagnostic direct   / séquençage   ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]
( 2) Les  applications  de base de la biologie moléculaire  diagnostic direct   / séquençage Mutation de la CF Mise en évidence directe de la mutation Mutation unique Mutation localisées Mutation familiale déjà identifiée
[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],(2) Les applications  de la biologie moléculaire  amplification de microsatellites : principe
(2)  Les applications de la biologie moléculaire  amplification de microsatellites : principe
(1) Les techniques de base de la biologie   moléculaire  amplification de microsatellites : principe Migration selon la taille   des microsatellites amplifiés Migration sur gel Migration dans un capillaire
(2) Les applications de la biologie   moléculaire  amplification de microsatellites :  application au diagnostic indirect ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],Fille atteinte d’une MAR
(2) Les applications de la biologie   moléculaire  amplification de microsatellites :  diagnostic de disomie uniparentale ,[object Object],Invisible sur le caryotype
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FCS due à la trisomie 14 correction de la trisomie 14 après fécondation DUP14 mat 45,XX,t(13;14) 23,Y méïose fécondation Disomie 14 45,XY,t(13;14) 45,XY,t(13;14) Trisomie 14
(2) application de la biologie moléculaire :   amplification de microsatellites :  anomalies du nombre de chromosomes PCR fluorescente multiplexe quantitative sur   des  microsatellites sur les chromosomes 21
( 2) Les applications de la biologie moléculaire  diagnostic direct / sexe foetal ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]
( 2) Les applications de la biologie moléculaire  diagnostic direct / sexe foetal ,[object Object]
( 3) Les puces à ADN     principe ADN cible et ADN  de référence  Marquage direct des ADN par deux fluorochromes différents(cyanines) cohybridation compétitive   Sur une lame de verre ADN cible ADN  de référence
( 3) Les puces à ADN     principe Lecture des signaux d’hybridation  par un scanner de fluorescence Analyse des signaux par logiciel - gain d’ADN : spot rouge - perte d’ADN : spot vert
Anomalies de nombre du caryotype : marqueur surnuméraire : 47, XY,+mar ,[object Object],[object Object],[object Object]
( 3) Les puces à ADN   identification d’un marqueur
[object Object],[object Object]
( 3) Les puces à ADN intérêts - pangénomique -anomalie non connue - Invisible au caryotype
Techniques de biologie moléculaire dans le  DPN ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]

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Alloimmunisation 2011 sf
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Diagnostic antenatal et foetal 2ème version

  • 1.
  • 2.
  • 3.
  • 4.
  • 5.
  • 6.  
  • 7.
  • 8.  
  • 9.
  • 10. 2. Rappel sur la mitose : place de la mitose dans le cycle cellulaire
  • 11. 3. Réalisation d’un caryotype : prélèvement et recueil des cellules amniotiques Centrifugeuse -> recueil des cellules
  • 12. 3. Réalisation d’un caryotype : étape de culture cellulaire Hotte à flux laminaire milieu stérile nutritif Incubation à 37°C et 5% CO2 étuve
  • 13.
  • 14. 2.Rappel sur la mitose : Les quatre phases de la mitose 1 4 2 3
  • 15.
  • 16.
  • 17. 3. Réalisation d’un caryotype : Vérification de la richesse des mitoses mitose
  • 18.
  • 19. 3. Réalisation d’un caryotype : analyse des mitoses au microscope à contraste de phase
  • 20.
  • 21. 3. Réalisation d’un caryotype : classement des chromosomes après giemsa grands à centromères presque médian grands à centromère distaux Chromosomes de taille moyenne grands acrocentriques petits à centromères médian petits acrocentriques Chomosomes sexuels
  • 22. 3. Réalisation d’un caryotype : banding des chromosomes: 400-550 bandes
  • 23.
  • 24.
  • 25. Dans le LA Après culture clones issus de cellules différentes Culture A Culture B Pseudo-mosaïcisme Mosaïcisme vrai Caryotype du liquide amniotique avec une mosaïque
  • 26.
  • 27.
  • 28.
  • 29.
  • 30.
  • 31. Origine des VC Cytotrophoblaste = direct Tissu extra-embryonnaire = culture caryotype de 2 tissus d’origine différente
  • 32. Problème des mosaiques sur VC  mosaïque retrouvée aussi chez le fœtus  mosaïque confinée au placenta = non retrouvée dans le LA ou le sang foetal : 1 à 2% des VC
  • 33.
  • 34. 5.1. Anomalies de nombre du caryotype : triploidie 69,XXXou XXY ou XYY 69,XXX ou XYY 69,XXX ou XXY
  • 35. 5.2. Anomalies de nombre du caryotype : trisomie
  • 36.
  • 37. 5.4 . Anomalies de structure du caryotype Les anomalies de structure équilibrées les plus fréquentes : les translocations Translocation réciproque Translocation Robertsonienne
  • 38. 5.5 . Anomalies de structure du caryotype 45,XX,t(13;14)(q10;q10)
  • 39. 5.6 . Anomalies de structure du caryotype Des anomalies de structure équilibrées moins fréquentes : les inversions et les insertions Inversion paracentrique insertion Inversion péricentrique
  • 40. 5.7. Anomalies du caryotype : Les anomalies de structure déséquilibrées délétion duplication chromosome en anneau isochromosome
  • 41. 5.6 . Anomalies de structure du caryotype RCIU post natal + CIA : 46,XX,del(13)(q21.1)
  • 42. 5.8 . Anomalies de structure du caryotype 46,XX,r(14)(p11.2q32)
  • 43.
  • 44. trisomie 13 45,XX,t(13;14) méïose trisomie 14 fécondation Gamete normal Der(13;14) Disomie 14 Disomie 13
  • 45.
  • 46.
  • 47.
  • 48.
  • 49.
  • 50.
  • 51.
  • 52.
  • 53.
  • 54.
  • 55. 2.3. application de la FISH Identification d’un petit marqueur surnuméraire
  • 56. 2.3. application de la FISH : Identification d’un petit marqueur surnuméraire par FISH centromérique
  • 57. 4. application de la FISH Identification d’un petit chromosome 15 surnuméraire
  • 58. 2.3. application de la FISH Identification d’un petit chromosome 15 surnuméraire FISH spécifique de la région Willy-Prader-Angelman
  • 59. 2.3. application de la FISH : identification d’un isodicentrique du chromosome 15 CEP 15 CEP 15 SNRPN, D15S10 SNRPN, D15S10 47,XX,+idic(15;15)(q13;q13).ish15q11-q13 (SNRPN++,D15S10++)
  • 60. 2.4. application de la FISH délétion
  • 61. 2.4. application de la FISH délétion délétion du gène du rétinoblastome RB1
  • 62. 2.4. application de la FISH délétion interstitielle une délétion interstitielle du chromosome 13
  • 63.
  • 64.
  • 65. ( 1) Les techniques de base de la biologie moléculaire la PCR : amplification exponentielle Anomalie ciblée pour le choix des amorces
  • 66. (1) Les techniques de base de la biologie moléculaire électrophorèse sur gel après PCR Séparation selon la taille visualisation des bandes avec le bromure d'éthidium sous UV but : séparer l’ADN chargé négativement au travers d'un gel sous l'effet d'un champ électrique
  • 67. (1) Les techniques de base de la biologie moléculaire électrophorèse sur capillaire après PCR Le nombre de paires de bases (pb)
  • 68.
  • 69.
  • 70. (2) Les applications de la biologie moléculaire diagnostic direct / recherche d’une mutation ponctuelle Enzyme de restriction 1.Hétérozygote (noir) : site de restriction 2.Homozygote normal (noir) Amorce en bleue d’un témoin de digestion hétérozygote
  • 71. ( 2) Les applications de la biologie moléculaire diagnostic direct / séquençage : principe H OH H liaison diester H di dNTP incorporé dans l’ADN -> arrêt de la PCR
  • 72.
  • 73. ( 2) Les applications de base de la biologie moléculaire diagnostic direct / séquençage Mutation de la CF Mise en évidence directe de la mutation Mutation unique Mutation localisées Mutation familiale déjà identifiée
  • 74.
  • 75. (2) Les applications de la biologie moléculaire amplification de microsatellites : principe
  • 76. (1) Les techniques de base de la biologie moléculaire amplification de microsatellites : principe Migration selon la taille des microsatellites amplifiés Migration sur gel Migration dans un capillaire
  • 77.
  • 78.
  • 79.
  • 80. FCS due à la trisomie 14 correction de la trisomie 14 après fécondation DUP14 mat 45,XX,t(13;14) 23,Y méïose fécondation Disomie 14 45,XY,t(13;14) 45,XY,t(13;14) Trisomie 14
  • 81. (2) application de la biologie moléculaire : amplification de microsatellites : anomalies du nombre de chromosomes PCR fluorescente multiplexe quantitative sur des microsatellites sur les chromosomes 21
  • 82.
  • 83.
  • 84. ( 3) Les puces à ADN principe ADN cible et ADN de référence Marquage direct des ADN par deux fluorochromes différents(cyanines) cohybridation compétitive Sur une lame de verre ADN cible ADN de référence
  • 85. ( 3) Les puces à ADN principe Lecture des signaux d’hybridation par un scanner de fluorescence Analyse des signaux par logiciel - gain d’ADN : spot rouge - perte d’ADN : spot vert
  • 86.
  • 87. ( 3) Les puces à ADN identification d’un marqueur
  • 88.
  • 89. ( 3) Les puces à ADN intérêts - pangénomique -anomalie non connue - Invisible au caryotype
  • 90.